5I86A

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp bound to the benzodiazepinone g02778174
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
KKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Protein binding/inhibitor
molecule keywords CREB-binding protein
publication title Fragment-Based Discovery of a Selective and Cell-Active Benzodiazepinone CBP/EP300 Bromodomain Inhibitor (CPI-637).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 115
sequence length 115
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2016-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5i86A00
5FE7A 4LR6A 4QSWA 5A82A 5ENGA 4A9EA 4UYGA 5EWHA 5CFWA 2RNWA 5AMFA 5FE3A 3MULA 5A85A 4NR8A 2F6NA 5E9LA 5HQ7A 5EP7A 4CURA 5FE1A 4PS5A 5CP5A 5DYXA 4CUUA 3U5JA 4YY6A 5I7YA 4CUTA 5H1VA 5HLSA 3UVDA 2DVQA 4QB3A 4UIUA 4BW4A 4NUDA 3U5LA 5CRZA 4Z1QA 2OSSA 5A5SA 4BW1A 1JM4B 5HRVA 5HFRA 3QZSA 4KV4A 4MR4A 4YYNA 4QZSA 2RI7A 4NQNA 4A9KA 5LJ1A 5LKXA 5CQ3A 5CPEA 5E9VA 4J0SA 3UV2A 4UYFA 4UIWA 3IU6A 3D7CA 5AD3A 2R10A 1EQFA 2F6JA 5FH6A 4HXNA 5EWCA 5H1UA 5D3HA 4ZQLA 5CQAA 5E73A 3SVFA 2FSAA 4GPJA 4CL9A 5HRWA 4LZRA 5KTXA 4A9JA 5E9YA 5KO4A 5K29A 3ONIA 4MR3A 4PTBA 5A83A 3LQHA 4KCXA 3P1DA 4NR6A 3HMFA 3U5NA 5HEMA 5F2PA 5EISA 5DW1A 2YEKA 5FH8A 4LYIA 2YDWA 4O7EA 5HENA 4QSSA 4C67A 5L99A 4N4GA 4QEWA 4WHUA 3K2JA 3LQIA 4DONA 5ENEA 4O7AA 4J3IA 4TZ2A 4HXPA 4YYMA 5CRMA 5EGUA 4IR5A 4Z6IA 5COIA 4CUQA 4LRGA 5ENJA 5TB6A 2OUOA 5F1HA 4UIVA 4QSPA 3UVWA 5BT4A 5CQ4A 3DAIA 5ENHA 4XY8A 5DLXA 4ALHA 5DBMA 3MUKA 5E3GA 5IG6A 4WHWA 3O35A 5FH7A 4HXLA 5DFCA 3P5OA 4UYFB 5FE9A 4HXSA 5FE0A 5E7DA 5JWMA 4BW3A 5A5PA 5CZGA 5LJ0A 4HXOA 5HFQA 5CQ7A 5D25A 4QYDA 5LKZA 4O72A 5A7CA 4TT2A 3DWYA 4YYDA 4NR9A 4NYXA 5I80A 4HBXA 3U5OA 4A9LA 5LUUA 4QR4A 2YEMA 5CTLA 3U5KA 1E6IA 4O71A 3MB3A 3G0JA 4MENA 1JSPB 4NUCA 5D3PA 2DVSA 3G0LA 4NQMA 4O70A 3S92A 5IGKA 4QSQA 4UITA 3U5MA 4LZSA 2RNXA 4QC3A 5C85A 5JI8A 4YYHA 3Q2FA 4MEOA 4O7BA 4RVRA 5EI4A 4A9NA 5J0DA 5A5OA 2RO1A 5CQ5A 5L97A 5HRXA 2DVRA 4QEVA 5D3RA 5G4SA 5E3DA 5FE4A 4QR3A 5A81A 5CY9A 3IU5A 4NUEA 2R0VA 5IGLA 4YC9A 1X0JA 1WUMA 4O75A 5C89A 4TU6A 3JVKA 3P1CA 4TTEA 3AQAA 2G4AA 5KTUA 5ETDA 4PCIA 3ZYUA 5CQ8A 4IOOA 4ZC9A 4AKNA 5CUCA 5L8UA 4TS8A 5DY7A 5D3SA 1ZS5A 5FG4A 5AMEA 2L84A 4IR3A 5FFWA 4HBYA 4MR5A 5D3JA 5EK9A 5H1TA 4IR4A 5LKTA 4UYHA 4YYIA 5F62A 3FKMX 4NS5A 5DYAA 4TQNA 5I88A 4NRCA 3QZTA 4KV1A 5D3TA 5KHMA 5I1QA 5ETBA 2E7NA 5D3NA 2KTBB 4NR7A 4YABA 4YAXA 5FE2A 2DKWA 5ENIA 1WUGA 4MR6A 4F3IA 2DWWA 4YADA 5FE6A 5FE8A 5FFVA 5A5NA 5HELA 4O74A 4O77A 3O36A 3UV5A 4OGJA 5I40A 3HMHA 4PY6A 4LC2A 5F61A 5LVRA 5I29A 4HBWA 3HMEA 2I8NA 5ACYA 5FG6A 4MEPA 4TU4A 5D7XA 4CFKA 4LZ2A 4BW2A 5I83A 4QNSA 4O76A 5ENCA 4A9HA 4YY4A 3O34A 5II1A 2I7KA 4FLPA 5F60A 4QUTA 4Q0NA 5KU3A 2E3KA 3AADA 3O33A 4IORA 5I86A 4YH3A 4Q0OA 4QR5A 5F5ZA 4YBSA 5HQ6A 5DFBA 5IIDA 5LVQA 4HXMA 5FB1A 3SVGA 3UV4A 3U5PA 2D82A 4NR5A 4LYSA 5EWWA 4X2IA 3MQMA 5FBXA 5CQ6A 4ZW1A 2MJVB 4OUFA 4LDFA 5D3LA 3LJWA 4QEUA 5CUBA 5F3AA 4NXJA 5EPRA 4A9FA 4J1PA 3I3JA 2R0YA 4N4FA 4CFLA 4O7CA 5FFYA 4YH4A 5C8GA 5F36A 5C87A 4WIVA 4UYEA 5L98A 3MXFA 4BJXA 5DKCA 5EWDA 5FG5A 2RFJA 4LYWA 5HM0A 5FB0A 4CLBA 4YYKA 5C4QA 5DW2A 5BT3A 3MB4A 3O37A 2L85A 5DKDA 4PCEA 2L5EA 2RNYA 4N4HA 2RS9B 5DX4A 2D9EA 4HXKA 5D24A 2N9GA 4TT6A 5IGMA 2DVVA 4YK0A 3Q2EA 5E9KA 4A9MA 5EICA 4OGIA 4XUBA 5EU1A 4A9OA 5F1LA 4HXRA 3JVLA 3UW9A 5EV9A 4QY4A 5CUAA 3SVHA 4N3WA 1F68A 4TZ8A 5I7XA 4TYLA 4YYJA 5TCMA 4C66A 5LJ2A 4YBMA 4XYAA 5CUGA 4Z1SA 5ENBA 5DFDA 3NXBA 4NYWA 5G4RA 5F25A 3UVYA 2DATA 5KTWA 5D26A 4NYVA 5D0CA 5EPSA 5HCLA 5FDZA 5CS8A 4Y03A 4XY9A 5CQTA 4Z93A 3TLPA 4TT4A 4A9IA 2OO1A 4HBVA 5L8TA 4UIXA 5EA1A 5BT5A 5IBNA 4QSXA 4IOQA 4QSTA 5HQ5A 4QYLA 4QBMA 5EVAA 4Z6HA 2E7OA 4CUSA 4QSVA 2WP2A 5DYCA 2H60A 5E74A 2NXBA 4QSUA 5IGNA 5CUDA 3LXJA 3P1EA 5CGPA 3P1FA 5F63A 2YELA 5EM3A 4BHWA 4UIZA 5LKUA 5FE5A 2YQDA 5DLZA 3GG3A 3RCWA 4IR6A 3JVJA 5A5RA 3LQJA 5I89A 5A5QA 2LSPB 5CUEA 5H85A 5HJCA 4MEQA 4NR4A 4UIYA 5EQ1A 3S91A 5CU8A 4YATA 4NRBA 2YW5A 5II2A 4YYGA 4E96A 2R0SA 4QUUA 4O78A 5E0RA 5E9MA 5ENFA 5DKHA 4PKLA 4UYDA 2GRCA 5EPBA 5L96A 2YYNA 4QC1A 4ALGA 4XUAA 4N4IA 4J0RA 3UVXA 1N72A 3JVMA 5EWVA 5DYUA 4O7FA 3QZVA 2WP1A 4YBTA 4CUPA 4NRAA 5C7NA 5AD2A 5E9IA 4QSRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FE7A 4LR6A 4QSWA 5A82A 5ENGA 4A9EA 4UYGA 5EWHA 5CFWA 2RNWA 5AMFA 5FE3A 3MULA 5A85A 4NR8A 2F6NA 5E9LA 3VKHA 5HQ7A 5EP7A 4CURA 5FE1A 4PS5A 5CP5A 5DYXA 4CUUA 3U5JA 3VKGA 4YY6A 5I7YA 4CUTA 5H1VA 5HLSA 3UVDA 2DVQA 4QB3A 4UIUA 4BW4A 4NUDA 3U5LA 5CRZA 4Z1QA 2OSSA 5A5SA 4BW1A 1JM4B 5HRVA 5HFRA 3QZSA 4KV4A 4MR4A 4YYNA 4QZSA 2RI7A 4NQNA 4A9KA 5LJ1A 5LKXA 5CQ3A 5CPEA 5E9VA 4J0SA 3UV2A 4UYFA 4UIWA 3IU6A 3D7CA 5AD3A 2R10A 1EQFA 2F6JA 5FH6A 4HXNA 5EWCA 5H1UA 5D3HA 4ZQLA 5CQAA 5E73A 3SVFA 2FSAA 4GPJA 4CL9A 5HRWA 4LZRA 5KTXA 4A9JA 5E9YA 5KO4A 5K29A 3ONIA 4MR3A 1ZKRA 4PTBA 5A83A 3LQHA 4KCXA 3P1DA 4NR6A 3HMFA 3U5NA 5HEMA 5F2PA 5EISA 5DW1A 2YEKA 5FH8A 4LYIA 2YDWA 4O7EA 5HENA 4QSSA 4C67A 5L99A 4N4GA 4QEWA 4WHUA 3K2JA 3LQIA 4DONA 5ENEA 4O7AA 4J3IA 4TZ2A 4HXPA 4YYMA 5CRMA 5EGUA 4IR5A 4Z6IA 5COIA 4CUQA 4LRGA 5ENJA 5TB6A 2OUOA 5F1HA 4UIVA 4QSPA 3UVWA 5BT4A 5CQ4A 3DAIA 5ENHA 4XY8A 5DLXA 4ALHA 5DBMA 3MUKA 5E3GA 5IG6A 4WHWA 3O35A 5FH7A 4HXLA 5DFCA 3P5OA 4UYFB 5FE9A 4HXSA 5FE0A 5E7DA 5JWMA 4BW3A 5A5PA 5CZGA 5LJ0A 4HXOA 5HFQA 5CQ7A 5D25A 4QYDA 5LKZA 4O72A 5A7CA 4TT2A 3DWYA 4YYDA 4NR9A 4NYXA 5I80A 4HBXA 3U5OA 4A9LA 5LUUA 4QR4A 2YEMA 5CTLA 3U5KA 1E6IA 4O71A 3MB3A 3G0JA 4MENA 1JSPB 4NUCA 5D3PA 2DVSA 3G0LA 4NQMA 4O70A 3S92A 5IGKA 4QSQA 4UITA 3U5MA 4LZSA 2RNXA 4QC3A 5C85A 5JI8A 4YYHA 1PUOA 3Q2FA 4MEOA 4O7BA 4RVRA 5EI4A 4A9NA 5J0DA 5A5OA 2RO1A 5CQ5A 5L97A 5HRXA 2DVRA 4QEVA 5D3RA 5G4SA 5E3DA 5FE4A 4QR3A 5A81A 5CY9A 4NUEA 3IU5A 2R0VA 5IGLA 4YC9A 1X0JA 1WUMA 4O75A 5C89A 4TU6A 3JVKA 3P1CA 4TTEA 3AQAA 2G4AA 5KTUA 5ETDA 4PCIA 3ZYUA 5CQ8A 4IOOA 4ZC9A 4AKNA 5CUCA 5L8UA 4TS8A 5DY7A 5D3SA 1ZS5A 5FG4A 5AMEA 2L84A 4IR3A 5FFWA 4HBYA 4MR5A 5D3JA 5EK9A 5H1TA 4IR4A 5LKTA 4UYHA 4YYIA 5F62A 4AKHA 3FKMX 4NS5A 5DYAA 4TQNA 5I88A 4NRCA 3QZTA 4KV1A 5D3TA 5KHMA 5I1QA 5ETBA 2E7NA 5D3NA 2KTBB 4NR7A 4YABA 4YAXA 5FE2A 2DKWA 5ENIA 1WUGA 4MR6A 4F3IA 2DWWA 4YADA 5FE6A 5FE8A 5FFVA 5A5NA 5HELA 4O74A 4O77A 3O36A 4AKIA 3UV5A 4AI6A 4OGJA 5I40A 3HMHA 4PY6A 4LC2A 5F61A 5LVRA 5I29A 4HBWA 3HMEA 2I8NA 5ACYA 5FG6A 4MEPA 4TU4A 5D7XA 4CFKA 4LZ2A 4BW2A 5I83A 4QNSA 4O76A 5ENCA 4A9HA 4YY4A 3O34A 5II1A 2I7KA 3D1BA 4FLPA 5F60A 4QUTA 4Q0NA 5KU3A 2E3KA 3AADA 3O33A 4IORA 5I86A 4YH3A 4Q0OA 4QR5A 5F5ZA 4YBSA 5HQ6A 5DFBA 5IIDA 5LVQA 4HXMA 5FB1A 3SVGA 3UV4A 3U5PA 2D82A 4NR5A 4LYSA 5EWWA 4X2IA 3MQMA 5FBXA 5CQ6A 4ZW1A 2MJVB 4OUFA 4LDFA 5D3LA 3LJWA 4QEUA 5CUBA 5F3AA 4NXJA 5EPRA 4A9FA 4J1PA 3I3JA 2R0YA 4N4FA 4CFLA 4O7CA 5FFYA 4YH4A 5C8GA 5F36A 5C87A 4WIVA 4UYEA 5L98A 3MXFA 4BJXA 5DKCA 5EWDA 5FG5A 2RFJA 4LYWA 5HM0A 5FB0A 4CLBA 4YYKA 5C4QA 5DW2A 5BT3A 3MB4A 3O37A 2L85A 5DKDA 4PCEA 2L5EA 2RNYA 4N4HA 2RS9B 5DX4A 2D9EA 4HXKA 5D24A 2N9GA 4TT6A 5IGMA 2DVVA 4YK0A 3Q2EA 5E9KA 4A9MA 5EICA 4OGIA 4XUBA 5EU1A 4A9OA 5F1LA 4HXRA 3JVLA 3UW9A 5EV9A 4QY4A 5CUAA 3SVHA 4N3WA 1F68A 4TZ8A 5I7XA 4TYLA 4YYJA 5TCMA 4C66A 5LJ2A 4YBMA 4XYAA 5CUGA 4Z1SA 5ENBA 5DFDA 3NXBA 4NYWA 5G4RA 5F25A 3UVYA 2DATA 5KTWA 5D26A 4NYVA 5D0CA 5EPSA 5HCLA 5FDZA 5CS8A 4Y03A 4XY9A 5CQTA 4Z93A 3TLPA 4TT4A 4A9IA 4AKGA 2OO1A 4HBVA 5L8TA 4UIXA 5EA1A 5BT5A 5IBNA 4QSXA 4IOQA 4QSTA 5HQ5A 4QYLA 4QBMA 3D1DA 5EVAA 4Z6HA 2E7OA 4CUSA 4QSVA 2WP2A 5DYCA 2H60A 5E74A 2NXBA 4QSUA 5IGNA 5CUDA 3LXJA 3P1EA 5CGPA 3P1FA 5F63A 2YELA 5EM3A 2EJNA 4BHWA 4UIZA 5LKUA 5FE5A 2YQDA 5DLZA 3GG3A 3RCWA 4IR6A 3JVJA 5A5RA 3LQJA 5I89A 5A5QA 2LSPB 5CUEA 5H85A 5HJCA 4MEQA 3ERRA 4NR4A 4UIYA 5EQ1A 3S91A 5CU8A 4YATA 4NRBA 2YW5A 5II2A 4YYGA 4E96A 2R0SA 4QUUA 4O78A 5E0RA 5E9MA 5ENFA 5DKHA 4PKLA 4UYDA 2GRCA 5EPBA 5L96A 2YYNA 4QC1A 4ALGA 4XUAA 4N4IA 4J0RA 3UVXA 1N72A 3JVMA 5EWVA 5DYUA 4O7FA 3QZVA 2WP1A 4YBTA 4CUPA 4NRAA 5C7NA 5AD2A 5E9IA 4QSRA
chains in the Genus database with same CATH topology
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