The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
GENSAPVGAAIANFLEPQALERLSRVALVRRDRAQAVETYLKKLIATNNVTHKITEAEIVSILNGIAKQQNSQNNSKIIFE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Unknown function
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| publication title |
Solution Structure of Saccharomyces cerevisiae Protein Ymr074cp
rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical 16.0 kDa protein in ABF2-CHL12 intergenic regio
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| total genus |
18
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-12-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helicase, Ruva Protein; domain 3 | PDCD5-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K6B A; 2CRU A; 2JXN A; 2FH0 A; 1EIJ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5EP4 A; 1WXQ A; 3CGW A; 5EXP A; 2DI0 A; 2XFT A; 1VG5 A; 3GLI B; 2LWX A; 3FYD A; 2FS1 A; 2BWB A; 3B7N A; 5C18 A; 1TDZ A; 4IBD A; 3KS8 A; 2LVO C; 4XBO A; 5ITR A; 4JI2 M; 1VDD A; 4LFC M; 1NHW C; 2QHO B; 1VEJ A; 3B9P A; 3TL4 X; 4D80 A; 3L25 A; 2WSC F; 4JXJ A; 4LJ8 A; 4DUZ M; 1L1Z A; 1JR3 A; 2UXC M; 2L6O A; 2G8L A; 3AJI B; 3GRR A; 1IXS B; 3AOE A; 1Y8G A; 4F2L A; 2KDL A; 4KT0 F; 1W5T A; 3MHV C; 4GEW A; 4AW4 A; 3ZH9 B; 3C58 A; 4F1I A; 3W0L B; 4FCW A; 1IN5 A; 2ZAO A; 1V33 A; 3NBX X; 4RKU F; 1XB2 B; 1EE8 A; 2FOI C; 4NRW A; 2DVW B; 3VKH A; 2RGH A; 4B3T M; 2X4A A; 2F5Q A; 2LHC A; 2XSZ A; 4Q7J A; 3QYE A; 1IN8 A; 4NL4 H; 3H4J A; 2E5L M; 2HL7 A; 4MGH A; 3DA1 A; 3SAV A; 3A45 A; 3GPP A; 3RGS A; 4G4R A; 2Z7J A; 3GRY A; 4MH0 E; 3KFU G; 3NWL A; 1HJP A; 2WZJ A; 1WIV A; 3ILK A; 1IY1 A; 3KP0 E; 1N77 A; 5C1B A; 1Z5C A; 1JR3 E; 2C9O A; 2CRU A; 3D8L A; 4GC9 A; 4L6V 6; 2VQF M; 3GP1 A; 2CV1 A; 2QBY B; 4DR4 M; 1S3S A; 1DV0 A; 4G4O A; 4B7F A; 3K8Z A; 3K2L A; 3U61 B; 2X8A A; 2R6F A; 2WSF F; 2EJS A; 3WHL A; 4A3V B; 1QVR A; 2KEB A; 1SXJ C; 2DZN B; 2OO9 A; 3HY5 A; 4DV7 M; 4HL4 A; 1G41 A; 1QUS A; 3AKZ A; 1HT1 E; 1WGL A; 5ITU A; 1DGB A; 4AKI A; 5EP1 A; 4DV2 M; 2QP9 X; 4MGZ E; 2HAK A; 3U60 B; 1UM8 A; 2CHQ A; 2FH0 A; 2BJW A; 3EIE A; 3FUW A; 2ZAM A; 3KVW A; 3C3D A; 1EIJ A; 3U6D A; 1YE9 A; 3I01 M; 4FWG A; 3OTO M; 1ZMU A; 2L09 A; 2MRO B; 1WGN A; 1NSF A; 3UJN A; 2C9C A; 3LQQ A; 2UXB M; 4JI0 M; 3IG8 A; 3MK6 A; 2JWS A; 3HU2 A; 3L28 A; 1ZV1 A; 2KRK A; 1NVM A; 2W82 A; 4P16 A; 3VFD A; 3FRH A; 1IXR C; 4REZ A; 2DHR A; 3FYC A; 4YY3 M; 1JB0 F; 2Y20 A; 4GRI A; 5JI3 E; 3SBJ A; 4GC5 A; 2LVP C; 4MGI E; 1FNN A; 2DAM A; 4II7 A; 2JUJ A; 3T1Y M; 3M6A A; 3BOS A; 2EKF A; 3PXG A; 2L7I A; 1KYI A; 1SXJ B; 2JY8 A; 4BLC A; 3E4R A; 1KSF X; 3K1J A; 4GH9 A; 1D2N A; 1Z6T A; 2BJV A; 1G3I A; 4IBJ A; 4DR6 M; 1GJS A; 4PT5 A; 4DR7 M; 3HHZ A; 5EP2 A; 2ERC A; 2QNJ A; 3I51 A; 2K6B A; 4FWD A; 1HR0 M; 3B74 A; 4GIP A; 5FTK A; 1QDT A; 3ZCB B; 2O25 A; 3HKP A; 2KNV A; 3U6O A; 4LF7 M; 3AOG A; 3WHK A; 1HNZ M; 2DZL A; 1Q3B A; 2Y0T A; 3J27 B; 1XXH B; 3GLH A; 3J7B A; 4JI3 M; 1QAN A; 2Q2E B; 3HHX A; 4DV1 M; 4L78 A; 1LTM A; 1TR8 A; 3JR5 A; 4X62 M; 1ZMW A; 3SFZ A; 1C1K A; 3SYK A; 2QCU A; 1AUA A; 3E21 A; 2JZ0 A; 2LXE A; 4LF6 M; 4AI6 A; 4MGY E; 3KOW E; 4OW0 A; 2KA6 B; 4HLQ A; 2F5N A; 3IG5 A; 4YHH M; 3AFH A; 1GVN A; 2R4E A; 1GJT A; 4M9X A; 3EIH A; 1V92 A; 4ITQ A; 1DGF A; 4GHL A; 1IN4 A; 2ZBK B; 1GLN A; 2CWB A; 3FE3 A; 2C96 A; 2OOA A; 4LF8 M; 2YR0 A; 3I04 M; 4LFB M; 2CUZ A; 3I4Y A; 1LV7 A; 1GL6 A; 3U5Z B; 2KXE A; 3HZJ A; 3GLH E; 1NY6 A; 1OQY A; 3HJQ A; 2YQZ A; 2Z4R A; 3U6E A; 1TDH A; 3THG A; 4KO8 A; 1R2Z A; 2CEA A; 3GQ5 A; 4LFA M; 3HJ8 A; 4X66 M; 4L15 A; 3TQS A; 1J7K A; 1Z59 A; 3LCU A; 4QNR A; 4CHT B; 1OIZ A; 2EA0 A; 1T3T A; 3GLG B; 3FTE A; 4LGY A; 1XNR M; 3KSX A; 4L4U A; 4CIZ A; 3A42 A; 1DGH B; 5FSW A; 3JAM S; 2JA2 A; 2DEN A; 4R71 A; 3JR4 A; 4LF5 M; 1E9R A; 2LVN C; 3AL0 C; 3A46 A; 1NV9 A; 4M9S A; 2C99 A; 3VK7 A; 2A5Y B; 1NJF A; 3U6M A; 2XH9 A; 3J81 S; 4IBG A; 4NRV A; 2HHH M; 2AHM A; 4B7H A; 1PRB A; 3KS4 A; 3FUV A; 3FUX A; 4CJ6 A; 5FTJ A; 1T6O A; 2UU9 M; 2XLJ A; 4DV0 M; 3KSJ A; 1YSY A; 4JI6 M; 3F92 A; 4LRS A; 4LZZ A; 4QOS A; 3T38 A; 3M0E A; 3DOA A; 2XZU A; 1TH2 A; 3GRV A; 3SAR A; 2KRU A; 4XK8 F; 3SHG B; 4Z8X A; 2QSF X; 1IY0 A; 2R46 A; 3AV0 A; 3T15 A; 5KO3 A; 1L1T A; 4IBK A; 1F4I A; 1IFY A; 3CF6 E; 3FKE A; 2N35 A; 2CP8 A; 4IBC A; 3QYB A; 4RNA A; 2CV0 A; 1OAI A; 4IBI A; 5KQD A; 4G4N A; 1SXJ D; 4JI7 M; 1G71 A; 1D0L A; 2LVQ D; 2DWM A; 4IBE A; 1NNJ A; 1QQW A; 2LHG A; 3GLF A; 3U5Z A; 2O5R A; 4FCT A; 2RKO A; 5KQ8 A; 4HEO A; 5ITQ A; 1MU5 A; 1XXH E; 3LCV B; 3FD9 A; 3GLI A; 3L29 A; 2H1R A; 1K82 A; 4W5W A; 1Q02 A; 3HJS A; 4QHT A; 3HU1 A; 3Q8X A; 2D7E A; 2KZU A; 1QYR A; 3MMP A; 1Q3C A; 3IHP A; 5EXX A; 1DGG A; 2MGW A; 2UUA M; 5JI2 E; 1P3Q Q; 1NNU C; 4B3R M; 1RU3 A; 2KZS A; 3CF2 A; 1IXS A; 2L2D A; 2XF3 A; 3KOZ E; 3M7G A; 4X64 M; 3SAS A; 4MGK E; 1OFH A; 1G4A E; 2ZTC A; 3DFZ A; 1QAM A; 4M9Z A; 4MB7 A; 2ZM6 M; 2DKL A; 1IN6 A; 1QAQ A; 1IXZ A; 1MX0 A; 4B7G A; 3R9X B; 4RF1 A; 2OQ4 A; 3LVV A; 3AOE C; 3FTF A; 1VDL A; 3GLF E; 2I7N A; 2R45 A; 4K0K M; 2DAI A; 2KNZ A; 2XEP A; 2GNO A; 2Y21 A; 1IM2 A; 1TGU A; 1UFZ A; 1K3X A; 1R4G A; 3GLI E; 4KLN A; 2Y0Q A; 2Z3X A; 1GKI A; 1MN3 A; 4LF9 M; 2EUC A; 1QUT A; 3BXW A; 5EJC A; 5EXT A; 3HHY A; 3VLF B; 2JP7 A; 1VEG A; 3W68 A; 5A2Q S; 1NY5 A; 4R3D A; 4LF4 M; 2LTU A; 2UXD M; 2OOB A; 2DWN A; 2QBY A; 3GLG E; 1N75 A; 2FNA A; 2JZ1 A; 1TTE A; 1IY2 A; 4S12 A; 4DR2 M; 3TPZ A; 3DZD A; 3U61 A; 5KPZ A; 5BPV A; 3ZC7 B; 2KHH A; 2V6Z M; 1TH4 A; 2YFQ A; 2RRU A; 2VDB B; 3BBZ A; 3K9O A; 2R62 A; 1PM5 A; 1PJI A; 2J7O A; 2R44 A; 4FW9 A; 1K3W A; 1VQ1 A; 3TWL A; 2KW0 A; 1I4W A; 1D0K A; 2LH0 A; 3KP1 E; 3GQ3 A; 3U60 A; 2M60 A; 1XHB A; 3FTC A; 4I4L A; 5BR8 M; 4I81 A; 5L8R F; 3W0F A; 3NBI A; 3U6Q A; 4EIW A; 3PNY A; 3HU3 A; 4G3O A; 1R5L A; 4JV5 M; 3VKG A; 1JQJ C; 1KFV A; 3L26 A; 2CV2 A; 2XZF A; 3W67 A; 5FTN A; 4GKK M; 2APL A; 1QZE A; 2LVA A; 1G8P A; 4QHS A; 4AQY M; 5KPR A; 4L8R C; 3CF0 A; 1HQC A; 1PJT A; 1E32 A; 2DXI A; 1IN7 A; 3QAU A; 4ZPX A; 8CAT A; 4QOZ C; 4DV5 M; 3J80 S; 2UUB M; 3B7Z A; 3UGJ A; 2F5P A; 4JYA M; 1MJG M; 2MJ5 B; 1ORY B; 5E26 A; 4LJ4 A; 3E9S A; 3IEC A; 1HT2 E; 1ZMV A; 2V1U A; 5KPT A; 2MH8 A; 3KDS E; 1SXJ A; 3C9P A; 4PDI A; 3FTD A; 1XWI A; 2NQ8 C; 4NOO B; 1WR1 B; 4WUR A; 4LJ6 A; 1IBM M; 4XGI A; 5EQT A; 2J7N A; 4OVZ B; 2DAK A; 3GO8 A; 2JY5 A; 4GHA A; 3U6S A; 4CIS A; 3PVS A; 4CGY B; 3K92 A; 4JI8 M; 4LCB A; 1QDR A; 1V34 A; 2G5G X; 2KNA A; 3FUU A; 4RF0 A; 5FTM A; 4UN2 B; 4B08 A; 4NXM M; 4AKG A; 2YNM D; 4PD2 A; 2CHG A; 5EP3 A; 4AG5 A; 1XNQ M; 4LJ5 A; 5LMU M; 1XXH A; 3TWM A; 5ITT A; 5ITX E; 5LMN M; 1W5S A; 1N78 A; 1N34 M; 1OKS A; 2VF7 A; 4B3S M; 2VII A; 2Z4S A; 1YLA A; 4IJE A; 1DO0 A; 3GPY A; 2F5S A; 3FRI A; 3HWS A; 1PJS A; 4B3M M; 1SXJ E; 3SYL A; 2DAG A; 3A98 B; 2B3T A; 4NC6 A; 2M5Z A; 1L2C A; 2X49 A; 2GQF A; 4WW0 A; 3LQR A; 4BBA A; 3SHF A; 5IZ7 D; 4Z6Y A; 2F5O A; 4R7G A; 1J09 A; 2C98 A; 2L4F A; 2L4E A; 5F3W A; 2JY6 B; 1OTR A; 5DYG A; 1C7Y A; 4OX9 M; 3TWK A; 3KW6 A; 4FWH A; 1GO5 A; 3PNV A; 2J5Y A; 1ZQ9 A; 3SAU A; 4AZF A; 4Y28 F; 5DFL A; 3LW5 F; 4LJA A; 5IRE B; 5EXS A; 1XC8 A; 2CHV A; 1E94 E; 1R6B X; 1L2D A; 4I8O A; 4LZJ A; 1N33 M; 2JXN A; 4G6Z A; 2L7H A; 5ITY A; 1IBL M; 3KOX E; 5IWA M; 4DV4 M; 3HHW A; 3Q8G A; 3B89 A; 4JI4 M; 2VQE M; 3B7Q A; 2LNH C; 3QWL A; 3GLG A; 3GPU A; 4NSR A; 3U6C A; 4OVZ A; 2QZ4 A; 3SMS A; 4DR5 M; 2QPA A; 1OAO C; 1OFI A; 1DGH A; 2I7P A; 3KXE C; 1R2Y A; 3UMM A; 1TH3 A; 3J7A S; 3GLH B; 4DR1 M; 1CUK A; 1L8Q A; 4PCZ A; 1T43 A; 4IBB A; 5E6J A; 1JR3 D; 2K47 A; 4JN6 A; 4M0W A; 4BB9 A; 4GIT A; 2DWZ B; 4LJ7 A; 2BWE A; 1WJ7 A; 2DNA A; 3HX3 A; 2JNH A; 2CFO A; 2OPF A; 3SAT A; 3MJ5 A; 2EO2 A; 1OJL A; 1A5T A; 1QZM A; 1R7R A; 1YUB A; 2V1C A; 3KOY E; 3R8F A; 1HQY E; 4DV6 M; 2VF8 A; 3H4M A; 4DR3 M; 2MR9 A; 4JI1 M; 4GKJ M; 1I94 M; 2G3Q A; 4NXN M; 1J5E M; 1QAO A; 2HCB A; 4D82 A; 1VEK A; 4QNM A; 1GL7 A; 2XSZ D; 1XMO M; 3LVW A; 5FLX S; 4TUW A; 2R4J A; 3VDU A; 3L27 A; 3TE6 A; 4LY6 A; 2K0B X; 2C5R A; 2H5X A; 2FE8 A; 3UK6 A; 3ZQJ A; 3LMM A; 2DZO B; 3SC3 A; 3FUT A; 2XGN A; 5GKN A; 3U6L A; 3L2A A; 4X65 M; 4I5S A; 2Z8Y M; 3RFW A; 3J2P B; 5IT9 S; 2ZAN A; 2FFJ A; 3GPX A; 4AKH A; 3E46 A; 2WSE F; 4L16 A; 1NJG A; 5FTL A; 4DV3 M; 3U6P A; 1NV8 A; 1Z5A A; 4IJF A; 1N36 M; 2D7G A; 2QEN A; 1SG9 A; 1FJG M; 1NHG C; 7CAT A; 1XMQ M; 2DHY A; 4LRT A; 4AG6 A; 1PJQ A; 2R0I A; 1EFU B; 1E9S A; 4IIW A; 2QQ8 A; 1D0M A; 2EKK A; 3SAW A; 4KHP M; 2XFS A; 3K9P A; 4MM3 B; 5DNY A; 1TF0 B; 2RGO A; 3RGP A; 2DWL A; 3T1H M; 3GQ4 A; 2HWJ A; 2O01 F; 3GRU A; 3PFI A; 4PDG A; 1N32 M; 1ZAE A; 2R18 A; 4D81 A; 5ITX A; 1Z5B A; 3UZU A; 2ZTD A; 4M0D A; 1NO1 A; 2LBC A; 4ANR A; 3C3E A; 1DO2 A; 1HNW M; 5H37 D; 4FCV A; 4IBF A; 4DBG B; 1X37 A; 1GAB A; 2DAE A; 3D8B A; 2HKJ A; 4KOD A; 3CTW B; 4LGM A; 3V76 A; 4G4Q A; 2UUC M; 2JY7 A; 1WHC A; 2D7H A; 2BNK A; 4WP2 A; 3HGI A; 1IQP A; 1Q39 A; 1PJJ A; 1PGY A; 2CE7 A; 3VK8 A; 4JI5 M; 4LJ9 A; 4FD2 A; 4OU7 A; 1OIP A; 2K9D A; 4GMQ A; 3RE8 A; 1IBK M; 2P5T A; 1L2B A; 2F4V M; 1AIP C; 3T6P A; 4NSO B; 3SMP A; 1BVS A; 3GLF B; 1H6U A; 4LG2 A; 2R65 A; 3I4V A; 4P17 A; 1HNX M; 1G59 A; 4DUY M; 3VDP A; 4FVM A; 5DYI A; #chains in the Genus database with same CATH homology 2K6B A; 2CRU A; 2JXN A; 2FH0 A; 1EIJ A;
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait... #similar chains, but unknotted ...loading similar chains, please wait... #similar chains in the pdb database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait...
