3E4RA

Crystal structure of the alkanesulfonate binding protein (ssua) from the phytopathogenic bacteria xanthomonas axonopodis pv. citri bound to hepes
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
AAEPAQLRIGYQKAVSSLVLAKQHRLLEQRFPRTKITWVEFPAGPQLLEALNVGSIDLGGAGDIPPLFAQAAGADLLYVGWVPPTPKAETILVPSKSALRTVADLKGKRIAFQKGSSAHNLLLRVLAKSGLSMRDITPLYLSPANARAAFAAGQVDAWAIWDPWYSALTLDGSARLLANGEGLGLTGGFFLSSRRYATAWGPFVQQVMGTLNQADGLLERDRAGSIKTLAQVSGLPPAVVERTLAHRPPASVQPLSAQVIKAQQATADLFYAQRLLPKRVLVAPAVWRAPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
publication title Crystal structure of the alkanesulfonate binding protein (SsuA) from the phytopathogenic bacteria Xanthomonas axonopodis pv. citri bound to HEPES
rcsb
molecule keywords Nitrate transport protein
total genus 98
structure length 291
sequence length 291
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF09084 NMT1 NMT1/THI5 like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.450 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Helicase, Ruva Protein; domain 3 3e4rA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e4rA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e4rA02
1AMFA 4EQ7A 4N13A 3TTNA 3L6GA 2XXWA 1FTKA 4YZZA 5IAIA 3R7XA 3EPEA 1NNFA 2LAOA 1IXIA 3B6QA 1OQGA 3LSLA 2Z23A 1VFDA 1SVXB 4O3BA 4R72A 4GOTA 3ILTB 1NH8A 4PFUA 3RQTA 3TYHA 5BUUA 1PC3A 5TU0A 5I2KA 5AE4A 1FQEA 3DP6A 1FTJA 2QJEA 4NEDA 1YPNA 3K6XA 3OEMA 5AA2A 1Y3PA 3OENA 5JK4A 3K1PA 4LZ5A 1B5JA 1SI0A 2WKYA 3FJMA 5I58A 2XXUA 1POTA 3M3LA 3EF7A 5M2VA 4AB6A 1BP5A 2GHBA 3VVDA 5IKBA 1P1WA 3RNNA 4EUOA 3L6HA 4XKNA 3FIRA 2V3UA 3K1NA 3CFXA 3OO9A 3HHFA 1QUIA 1URSA 2ZNSA 1LFGA 1II5A 3TCGA 3IB0A 4IB2A 1I6QA 5CC2A 1MY4A 1AOVA 2GHAA 3KEIA 3PPRA 4I9DA 5B7DA 1LAHE 1VR5A 4R9FA 2I4BA 3BFTA 3IORA 4P0GA 3MW0A 4WKMA 5AA1A 4R6HA 1MXXA 4KCDA 4IGTA 1CB6A 2DP8A 2XXIA 5HPQA 4DXUA 1B46A 2XX9A 2OZZA 1ZJLA 3N26A 3G7WA 3IK6B 3VXBA 1LSTA 4O3AA 3C4MA 5DYHA 4Q0CA 2RKMA 1TXFA 1Y20A 2H25A 2OK2A 1NFTA 3K6UA 1B6HA 2UYFA 1O64A 1GTKA 3GXAA 3UA8A 2AL4A 1QULA 1N7WA 4ECFA 3MZ9A 3MQ9A 4NMYA 4BDOA 1D9VA 2V3TA 3LUYA 3IO4A 4QF9A 5BWJA 2RC7A 2ZXTA 1LBBA 4G8HA 3KJ7A 2RCAA 3QYTA 3DELB 4RNSA 1IXGA 3R26A 1MDP1 4U4XA 2UVGA 4EF2A 4F2OA 4OFJA 3B6TA 3T9VA 4R74A 1QKBA 1I69A 5KDTB 4YB7A 3MP6A 3IOVA 1NNKA 3QSLA 1NNTA 3IJOB 5KCJA 5H8HB 1B4ZA 3MVZA 3RT8A 4YKJA 2QS2A 3U94A 5EHSA 2HZLA 2QRYA 2Y84A 1DOTA 3TODA 5CMMA 4IO5A 5H8QB 5CM6A 3PV0E 3GBAA 3VXCA 1DSNA 4IO7A 5I56B 3VVEA 3Q28A 3SERA 4QRZA 1IXHA 4ELRA 4XTCQ 1Y4CA 4YICA 4H5FA 1MXZA 1OVBA 3GBBA 1MXUA 4ZEKA 4F1UA 1GV8A 2DYXA 3KN8A 5H8FB 1A40A 5JTYA 1R6ZA 4F19A 5ITOA 3OSQA 3C9HA 4DXBA 3U92A 2NVUB 4ZEBA 2QS4A 3KOTA 1B52A 2VD2A 4Q8RA 3U8QA 3KZGA 4FE8A 1EZOA 1A55A 1LAFE 3QAXA 4DCYA 1JEUA 4M4GA 1SW4A 3EQ1A 5JEIA 3T22A 1QUJA 3PMWA 4U4SA 2F7AA 3O28A 3H3GA 3FXRA 4P11A 1M5DA 4H67A 4PFYA 5I56A 3RLFE 1AL3A 1SD3A 5I59A 3H6WA 1MH4A 4OQOA 4H8IA 2G29A 2QSXA 3K00A 4YB5A 2P1SA 4R75A 2XXQA 2F35A 1GVCA 5L8DA 4HTGA 1Z7ME 3Q27A 1P1QA 2H5YA 3FGSA 3H4ZA 3S9NC 1USYE 4KQPA 1M5BA 3RY3A 1B3LA 2ZYNA 3E4RA 2NOOA 1D3KA 3PUWE 1LAGE 2F6GA 4KYDA 1Y4TA 3CG1A 1JETA 3CFLA 4Q30B 3OMBA 2Z8FA 1O7TA 4G8NA 2ZNTA 5K2XA 4R2BA 1SQYA 1B40A 1UTBB 4QFNA 4MF3A 3F11A 4ISUA 3V89B 1DMBA 3CR9A 4OEUA 1BTJA 1SI1A 2PVUA 5EYFA 1FTMA 4OWDA 1XOCA 1POY1 5FHMA 3RPWA 3KGCA 4EQ9A 1BIYA 1N3WA 2O1MA 3GLBA 1GR2A 2HCAA 2QPQA 3G3GA 3DP8A 3E9XA 3TTMA 2A5SA 4THIA 4LA9A 4ZZEA 5LOMA 1B05A 2Y7KA 4RJZA 1BLFA 3TPAA 1IZ1A 3H6TA 4OESA 3HN0A 1ZBMA 2CMOA 3O66A 3HO7A 4BDRA 2W7YA 1R9LA 4HS7A 3IAZA 2YJPA 1A99A 1PBQA 1MS7A 2DXYA 3MPLA 3D4CA 4E0WA 1UTBA 3CFZA 4OXVA 5I2KB 3E3KA 4GF8A 5I2NA 1S7YA 3RUMA 2V3QA 2ZYKA 4ESWA 1Y3NA 1HSJA 4IO6A 4FAJA 2I4CA 4PFTA 2REJA 3FXQA 5AA2D 4FJPA 4KR5A 1RKMA 5I58B 3PMVA 1MY2A 4Z0IA 1S50A 3HSTA 1P1NA 1PBPA 2DQVA 1XC1A 2Q88A 4GXAA 4JWXA 4YKIA 3SEUA 2R71A 5ICQA 3BFUA 1PB9A 2VOZA 2GH9A 4FIMA 1MQJA 4G8MA 4MFIA 2O68A 3G3KA 5L9OA 2M8CA 2VGQA 4PE5B 4F18A 1DPPA 2A5TA 3PPNA 2Y7IA 3JYRA 1SW1A 2RC9A 4LVQA 4QFPA 1N7XA 4WXJA 5CMBA 2XXPA 3LC8A 3PUZE 5L9MA 4YKKA 5AA4A 1URGA 3S9LC 2F78A 3G3FA 2QS3A 4ZECA 2AL5A 3FV2A 4P0IA 4OENA 4JDFA 2Q89A 4RYAA 4TLLB 3KFMA 1UIVA 2H9BA 1XS5A 5ICTA 1VFEA 3K0VA 2Q2AA 2XXVA 3T9XB 2Z8EA 1XVXA 2ONRA 4POXA 3ZKKA 4ZE8A 1B58A 2UVHA 3CSBA 1LBCA 2HEUA 2X7PA 3Q29A 2ONSA 4MLVA 1JNFA 5FTHA 2YPNA 3TQWA 1MY3A 3KG2A 4XKPA 3VLVA 1D4NA 4XKQA 2DVCA 3A09A 5TP9A 4HCWA 2H98A 4KYSA 1I6AA 4AB5A 1SW2A 3PPQA 2PT1A 4G2ZA 1MY0A 1B0LA 1FTLA 3B7DA 1UIUA 4G68B 5CBSA 5J1DA 4RK2A 4RA1A 1A7LA 4IY6A 3SESA 3MUQA 3U72A 1FQFA 4NWDA 4F3GA 1IQ7A 4EQBA 1JW1A 3OO7A 2HQ0A 2GRVA 3PGFA 1TWYA 2ZYMA 4EXLA 2I48A 3EHUA 3RTWB 3KOSA 3S2VA 4HW8A 3TEPA 5ISUA 4C0RA 4FATA 1AH5A 2XXXA 2XXTA 3TMGA 2B3FA 1KWHA 3JZJA 5KCJB 1B7UA 3CVGA 4GWOA 2F5XA 4WEPA 2GFEA 1FW0A 2DOJA 4NF8B 4NWCA 2BJJX 5CRYA 2RF1A 2THIA 1PB8A 2F34A 1JW5A 2RC8A 5ITPA 2DS9A 2DWIA 4MBPA 2OJTA 2AYSA 2PBWA 4LZ8A 4XKRA 2HZKA 4NF4A 2Q8JA 1OLCA 2B65A 2FYIA 3C33A 4GL8A 4GRKA 3UGWA 4C1TA 4DZ1A 2OLBA 1LLSA 4ZE9A 3I5OA 4G68A 4ONYA 2XHDA 2DWHA 5CMKA 1IXCA 3MPKA 4DCXA 5JTYB 4QHQA 4N6PA 2FNCA 1PDAA 4RPOA 4YU0A 1TFDA 1Y1MA 3KJTA 5DVIA 1EH3A 1GGGA 4PETA 2DWJA 3TUSA 3MP1A 4ZS9A 4U2RA 1MQGA 1B3HA 2DWAA 4NF8A 1PEBA 1YCJA 3W9VA 3C34A 1LB8A 1MQIA 2V25A 2ANJA 3S9EA 1Y3QA 3MVYA 2PYYA 4KFQA 4PFWA 2QMXA 4L17A 4KPTA 5I59B 1LFHA 1MH3A 2QL3A 2XX8A 2V93A 1P1OA 1AIVA 2X7QA 3A3UA 3FVGA 1OIBA 2O51A 1DPEA 3TTKA 3VE1B 1SYIA 2YLNA 3FVKA 1BKAA 3SETA 3EHTA 4FECA 3UIFA 1A54A 3OEKA 3G3HA 2XD2A 1B3GA 3H03A 1R9QA 3VV5A 3TAJA 1US5A 2H99A 4IY5A 1LAXA 2Y7WA 5DVJA 1FQDA 4YAHX 2I3WA 3N6TA 4KI0E 3QUFA 4JSOA 3RGYA 1SDXA 4R6YA 3W9WA 1LGBC 2OBGA 3H06B 3K6WA 4F39A 1F9BA 2UYEA 2P2AA 4QSDA 4OMBA 1WDNA 2UXAA 1ELJA 3OOAA 4LP2B 3FJGA 2DE2A 3TKDA 1ATGA 3QK6A 2Y7RA 3V83A 4I1DA 1MY1A 4NTLA 4ZEDA 5DT6A 1SW5A 1ZMGA 4XIGQ 3P7IA 1URDA 4RPNA 3CI8A 1TFAA 1M5EA 3RN8A 5F7VA 1RYOA 4F1VA 3E13X 3O6GA 5EHMA 3O9PA 5B70A 3IJXB 3HV1A 3DM0A 3UK4A 1MXWA 4H65A 1S9TA 4I62A 4TOZA 4OZ9A 2IA4A 1OQHA 3FVOA 5H8NB 4ELOA 4OTEA 5I2NB 3EHSA 1O63A 5DVFA 3CRBA 3I6VA 2AIXA 3VDFA 5FTIA 4F3BA 1MXVA 2KLFA 3PPOA 1JVYA 2F8DA 2DE4A 3OO8A 3R6UA 4OETA 2NXOA 1QUKA 4XXUA 3MP8A 4ZDMA 4IO4A 1UTHA 1UQWA 3VVFA 4GIZA 5CBRA 1N04A 1M5CA 2DE3A 1RYXA 1PB7A 3FUZA 1H76A 2I6EA 4F3SA 3SKPA 3TQLA 1NNPA 3MJNA 2ONKE 3VFJA 1HSEA 5HM4B 4EXKA 2A5TB 2VHAA 4ELPA 1QVSA 5H8NA 3MWBA 4POWA 2E0SA 2D3IA 3IB1A 2QS1A 5AA4B 2DVZA 4NF5A 2O7UA 4JWOA 5L9SA 4QFOA 3T66A 1JQFA 4BDQA 1ZIUA 1J1NA 4DDDA 3N6UA 4JWYA 4ND9A 5ELVA 3M3FA 3IOUA 3IR1A 2I0CA 2UVJA 1B32A 1HSLA 1MXYA 4ESXA 4F1YA 5AA3A 2ZNUA 2I0BA 2NWJA 3BKIB 1B51A 3C32A 2VD3A 3TCHA 3H7MA 3IB2A 3ECRA 4IGRA 4DIGA 4BLAA 3LR1A 3LSXA 5A5XB 2XXHA 2PMSA 3G3IA 5TP9B 4FORA 3IOWA 3KSXA 2OWSA 4H6DA 3N5LA 4KHZE 1B4HA 4JBZA 1OLAA 4R6KA 3PUYE 5KZTA 3T9UA 3UP9A 2VP1A 1A8EA 1JVXA 5F1QA 3SDFA 3ZS6A 4EF1A 5I57A 2HAVA 3EN3A 1Z7NE 1QJMA 3K1MA 3FXUA 4F3PA 4QFLA 3PUVE 3IL1B 4OHNA 3IO6A 5I84A 2ALUA 2OWTA 1R1NA 1H45A 2OCUA 1SYHA 3I3VA 3QUJA 5CI5A 4Q5TA 4GFRA 4OVJA 1LCTA 3FJ7A 4LONB 4F31B 4UACA 1H43A 1MDQA 2I3VA 4GQOA 4NE4A 3LBSA 2ZMBA 4ZEFA 5A5XA 3T9HB 5K2YA 4F2QA 5FHOA 1P99A 2IEEA 1VE4A 1Y1ZA 2Q2CA 1D9YA 3TCFA 4GLIA 4NF4B 4YMBA 4RK9A 3USDA 5TPAB 1B3EA 4HCYA 1TT1A 4R2FA 2RINA 3TFLA 1YAEA 2I49A 4RXLA 4LZ7A 4U23A 1B3FA 1XT8A 1FQBA 3MZ1A 1ZU0A 1B1HA 1IIWA 3OO6A 4QSEA 2R9JA 3C35A 1LB9A 5HBCA 3OXNA 3TTLA 1B1XA 4H1XA 4C1UA 3KBRA 2REGA 3O6HA 1B9JA 3TZAA 2X26A 1N76A 1Q35A 1IEJA 3OELA 2PX1A 2F7BA 2UVIA 3MVXA 1B5IA 3PPPA 4U22A 1DTGA 1CE2A 5CMCA 3H6VA 3B6WA 1JW4A 1IITA 2XXRA 2DXRA 2DSFA 3TELA 4G4PA 4ZZAA 2G93A 1EZ9A 4E0XA 4BDNA 4H8JA 5TPAA 4GL0A 4TQUQ 3HCQA 2F97A 2E1SA 1N0TA 1B7ZA 1ZLQA 3RT6B 3CIJA 4ZEIA 4U21A 2O7IA 4FEDA 3K4UA 3RTFB 2I58A 3C31A 3WAEA 3FD3A 3K01A 4ELQA 3THIA 3D4GA 2Z8DA 1WVJA 3O2AA 4LQ2A 2H4IA 2O84X 4LUBA 2Q9TA 2HXWA 2O1LA 3S4UA 3FZVA 1MPDA 3SEYA 3U1OA 3Q26A 5H8SA 3T93B 4DLDA 2F36A 5DTBA 3UN6A 2O6AA 3VLUA 1OVTA 4DXCA 2ABHA 1FQCA 4H0WA 4QSCA 3M3KA 2PT2A 1ZKBA 3K02A 3KN7A 3MVWA 4KYEA 3T96B 4GXSB 3BBRA 4GVOA 3PU5A 3S9MC 3O97A 4UA8A 3SEVA 2NUVA 1NMUA 4OEVA 4I8CA 5DEXB 3KSJA 1EZPA 3GZGA 3MZBA 3SEWA 3MC2A 1T0KA 2O69A 4H5GA 2D5WA 1N84A 4X1BA 4YKPA 4Z7EA 2HAUA 1LFIA 5KDTA 2B3BA 1OMPA 5H8HA 3N94A 2Y7PA 1WODA 3QXMA 4JB7A 4TLMB 1ZTYA 3U93A 4PQJA 3VLWA 3MBPA 1NKXA 3DLNA 4LATA 4BDLA 2R6GE 2HFBA 5H8QA 3PD8A 4G77A 3H6UA 4LQ5A 1M5FA 2ZYOA 4N07A 1B5HA 4OFLA 4WEDA 5FHNA 1N3XA 3QIMA 3K6VA 4U1OA 1IUDA 1UTHB 4IO2A 3C36A 1L5TA 1XHYA 1DTZA 1QW0A 1Y9UA 5DEXA 3PD9A 3IOTA 1H44A 4IO3A 4YB6A 2F6PA 4EDPA 5H8FA 1NL5A 3LSFB 3HHGA 4DE8A 1Q1KA 3O6IA 1YTVA 1I6BA 4G68C 2F7CA 3M8UA 1XVYA 1MPCA 1MPBA 4BDMA 2XXYA 3CG3A 1FCKA 1JEVA 1SBPA 1MQDA 1MRPA 4U1ZA 1FQAA 4JXIA 4OYVA 2D21A 3SEXA 3ILUB 4NF5B 3W15C 3O29A 4KCCA 4JSDA 3PMXA 3ZKLA 4OERA 2V84A 3ONMA 1QKAA 3HPIA 3Q25A 2QMWA 3A3CA 3V5AA 1MM6A 4NF6B 3PUXE 3AXFA 1P1UA 3G3JA 4K3FA 1MG1A 4YMAA 3FASA 4KD5A 3WAFA 2FA7A 3LSWA 4X9TA 1LCFA 1FTOA 4FEBA 2P0SA 2RCBA 3ZSFA 2XD3A 3TTRA 1B7HA 4F29A 4RY1A 4R9GA 1MM7A 1B2HA 4M1VA 3OD7A 4PP0A 1ANFA 4GD5A 4QFKA 1EU8A 4MLQA 3DP4A 1NH7A 4AQ4A 3FATA 3ODBA 3CSGA 1US4A 2XX7A 4OFOA 4X48A 3V8XB 5I57B 3KN3A 3JV9A 3FV1A 2ESNA 3OSRA 4R73A 4O3CA 1MQHA 1USYH 5AA2B 4NF6A 1A8FA 3FVNA 4X1DA 2Z22A 3K2DA 3MAMA 4MH5A 3UORA 4F22A 1VSOA 3TDJA 1B0HA 1H3DA 2CZLA 3IX1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2C9OA 5IZ7D 1XNQM 1AMFA 1D9QA 4I3EA 4EQ7A 4I5SA 4DUYM 4N13A 4MJOA 3TTNA 3A29A 4MGHA 3L6GA 2XXWA 1FTKA 3LVVA 4MMPA 3FUVA 3THGA 4YZZA 4NQ8A 2CZHA 5IAIA 1VEKA 2K47A 3EPEA 3R7XA 4R7GA 4IBJA 1NNFA 2LAOA 3T0JA 1IXIA 3HZJA 2QHOB 3M6AA 5ITUA 3B6QA 1OQGA 3LSLA 2Z23A 4PGPA 4NAPA 1VFDA 1NV6A 1SVXB 4ZPXA 4OW0A 4O3BA 4R72A 4GOTA 2X8AA 2R62A 4LJ6A 3ILTB 4CJ6A 5EQTA 1NH8A 1YSYA 4PFUA 3RQTA 3TYHA 2XH9A 1FPLA 5BUUA 1PC3A 5TU0A 2FFJA 5I2KA 4OA4A 5AE4A 1FQEA 5L8RF 3DP6A 1FTJA 2QJEA 5FTNA 4KO8A 2UXBM 4NEDA 1YPNA 4L8RC 3K6XA 3OEMA 4MAGA 5AA2A 2R44A 1AWBA 1Y3PA 3OENA 4IBBA 5JK4A 3K1PA 4LZ5A 1B5JA 3RGPA 1SI0A 2WKYA 2G5GX 3FJMA 1OIZA 1HJPA 1QQWA 5I58A 3Q8XA 2XXUA 4PDGA 1KA1A 1POTA 3M3LA 3EF7A 1NV1A 5M2VA 4AB6A 4LFCM 2DKLA 4K0KM 3GLHA 1TR8A 1BP5A 2A5YB 2GHBA 3H4MA 3VVDA 2DWMA 5IKBA 2KEBA 1P1WA 3RNNA 4EUOA 3L6HA 2QVUA 4XKNA 4N4UA 2OWZA 3FIRA 3VK8A 2LWXA 4GMQA 2V3UA 1D0KA 4L6V6 3J81S 3K1NA 3CFXA 2W82A 2J7OA 4AW4A 4MIJA 4FD2A 3OO9A 3HHFA 4O7IA 4LRTA 1QUIA 1URSA 4H45A 2ZNSA 4JVCA 1RDZA 2DZOB 1LFGA 4LF4M 2J7NA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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