The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
45
|
structure length |
45
|
Chain Sequence |
GSHMSEVHPSRLQTTDNLLPMSPEEFDEVSRIVGSVEFDSMMNTV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis for recruitment of CBP/p300 coactivators by STAT1 and STAT2 transactivation domains.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CREB-binding protein
|
| molecule tags |
Transcription regulator
|
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
6
|
| structure length |
45
|
| sequence length |
45
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-10-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF12162 | STAT1_TAZ2bind | STAT1 TAZ2 binding domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helicase, Ruva Protein; domain 3 | Helicase, Ruva Protein; domain 3 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KA6 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4QNM A; 1VEG A; 1NHW C; 1T3T A; 1DGB A; 1ZQ9 A; 3HJS A; 1NJF A; 1PJT A; 4NSO B; 2DHR A; 3JAM S; 1R7R A; 2JY6 B; 4LFB M; 2DAE A; 3MJ5 A; 3NBI A; 3SC3 A; 1Z5B A; 1SXJ A; 1DO0 A; 1Q02 A; 4DR5 M; 3FUX A; 4QHT A; 3GLI E; 2DI0 A; 1DGH B; 4OX9 M; 3AV0 A; 1TDZ A; 2LVP C; 3KOZ E; 4JI6 M; 1QUS A; 4GIP A; 1Y8G A; 3TPZ A; 4L16 A; 2XFS A; 4PD2 A; 4YHH M; 3WHL A; 2WSE F; 2G5G X; 4NOO B; 3FTC A; 3GRV A; 4JI0 M; 2UXD M; 3L2A A; 3CF2 A; 1E9S A; 1G41 A; 3ZC7 B; 1GO5 A; 4GH9 A; 2JY7 A; 2C98 A; 4REZ A; 3A98 B; 1IN7 A; 3GPY A; 1NO1 A; 2M5Z A; 3E46 A; 4LF6 M; 4IJF A; 2C5R A; 1HNW M; 3UMM A; 4GC5 A; 4I8O A; 3Q8X A; 2O5R A; 2BWB A; 3T6P A; 1MU5 A; 4UN2 B; 4L8R C; 4DR4 M; 1WXQ A; 5EP1 A; 1ZAE A; 2X49 A; 2BJV A; 4LCB A; 3VDU A; 3FRH A; 4CIZ A; 2OOA A; 5BPV A; 4GMQ A; 2QCU A; 3SYK A; 1Z5A A; 4OW0 A; 1JR3 A; 1QAN A; 3GLH A; 5FTK A; 5A2Q S; 2JY8 A; 1KSF X; 3Q8G A; 1IM2 A; 3RE8 A; 2G8L A; 3LVV A; 2OQ4 A; 1KFV A; 2ERC A; 1IXS B; 1HT2 E; 3I4V A; 3SFZ A; 2R65 A; 3GLF E; 2V6Z M; 3HJ8 A; 4XK8 F; 3QAU A; 1KYI A; 3B74 A; 1XB2 B; 2C9O A; 3HGI A; 4LF4 M; 2JNH A; 3E9S A; 1EIJ A; 1UFZ A; 1OIP A; 3GRU A; 4XBO A; 1XXH E; 1L1Z A; 4OU7 A; 1JB0 F; 1D0L A; 1PGY A; 1TDH A; 3VK7 A; 1P3Q Q; 4KLN A; 4R3D A; 3ZH9 B; 4JI3 M; 2R44 A; 2XFT A; 3GLI B; 2XH9 A; 3BOS A; 4D81 A; 3U60 A; 3CGW A; 4JI8 M; 3I51 A; 3T15 A; 2JZ0 A; 1ZV1 A; 3JR5 A; 2R6F A; 4GHA A; 4DUZ M; 5ITT A; 2FNA A; 2Z7J A; 2F5O A; 4AI6 A; 1VG5 A; 3FTD A; 4LRS A; 4IBE A; 1YUB A; 3FD9 A; 4ZPX A; 2JWS A; 5EXX A; 1QDT A; 1IN6 A; 1XHB A; 2K0B X; 3GLG B; 5EXP A; 2KZU A; 3LVW A; 2Z8Y M; 4QOZ C; 4G4Q A; 1XMO M; 3LCV B; 1GL6 A; 2KHH A; 4Z6Y A; 1V33 A; 4GKJ M; 3I4Y A; 5FTJ A; 1N78 A; 1TF0 B; 3DOA A; 4F2L A; 4MB7 A; 1TH4 A; 2E5L M; 3KXE C; 2X4A A; 2CHV A; 1J5E M; 2XZU A; 2P5T A; 3LQQ A; 4QOS A; 4PDI A; 1SXJ C; 4GKK M; 3D8L A; 1QDR A; 3KP1 E; 5KPR A; 2L7H A; 4TUW A; 2KXE A; 4GRI A; 1HQY E; 2D7G A; 2ZTD A; 3HWS A; 1IBK M; 2Y21 A; 2Z4S A; 1F4I A; 1IY0 A; 3J7B A; 4DV0 M; 2BWE A; 4ANR A; 3GLG A; 2LHC A; 3VFD A; 1I94 M; 2QPA A; 2ZBK B; 3H4M A; 1SXJ D; 1D2N A; 4B3T M; 5DYG A; 1TR8 A; 1R5L A; 4DV6 M; 3VK8 A; 3GQ4 A; 3GO8 A; 2KNZ A; 5EP2 A; 2Z4R A; 5DNY A; 3GLF B; 3SHG B; 1Q3B A; 3R8F A; 4LZZ A; 3KOY E; 3WHK A; 1OFH A; 4HL4 A; 4II7 A; 4M0D A; 3GRY A; 1C1K A; 4W5W A; 3VLF B; 3K2L A; 5KPT A; 1HJP A; 2OOB A; 3FTF A; 3AKZ A; 3U5Z B; 2GNO A; 1VQ1 A; 4LJ5 A; 1TTE A; 1OTR A; 3KW6 A; 3AOE A; 5ITY A; 2HKJ A; 1G8P A; 2LVO C; 2OO9 A; 4MGZ E; 3K8Z A; 3LCU A; 4B3S M; 3M0E A; 4RF1 A; 1G71 A; 1QVR A; 3UZU A; 3MK6 A; 2KEB A; 4FCW A; 1XC8 A; 3RFW A; 4FCT A; 3L25 A; 2EUC A; 2XZF A; 4FVM A; 1WGL A; 5LMN M; 3FYD A; 4AQY M; 4L15 A; 2HAK A; 1WJ7 A; 2ZTC A; 3SAV A; 3SAS A; 1T43 A; 2KA6 B; 1D0K A; 3AJI B; 3HJQ A; 3U6Q A; 2L7I A; 3U5Z A; 2CHG A; 2K47 A; 1L1T A; 1OJL A; 3FUU A; 1Q3C A; 1WGN A; 2MRO B; 1ORY B; 3QYE A; 2CV0 A; 3HHZ A; 1JR3 D; 2EA0 A; 4Y28 F; 4BLC A; 3ZQJ A; 4Z8X A; 5KPZ A; 4AZF A; 5C18 A; 1AIP C; 4LJ9 A; 2DZO B; 1GKI A; 1HNX M; 2F5Q A; 2VQF M; 2CFO A; 2DAG A; 2QSF X; 4RNA A; 3L28 A; 2DVW B; 3FTE A; 1ZMW A; 1S3S A; 3FE3 A; 3PFI A; 3PNY A; 4EIW A; 3SAT A; 3KSJ A; 3SMS A; 4PT5 A; 4DBG B; 2FH0 A; 1D0M A; 3SYL A; 1IFY A; 1IBL M; 2LVA A; 1DGH A; 3FUW A; 3J81 S; 3FUT A; 5EP3 A; 4AKG A; 4JI1 M; 3AL0 C; 4R71 A; 2MGW A; 4DR1 M; 1EFU B; 3KOW E; 2R45 A; 3HHW A; 4XGI A; 1G59 A; 2EKF A; 1J7K A; 5KQD A; 2QNJ A; 1VEJ A; 1WR1 B; 2DEN A; 2FE8 A; 2N35 A; 4X62 M; 3KS4 A; 5FTM A; 1G4A E; 4CHT B; 3GPP A; 5IWA M; 3KS8 A; 3GRR A; 1A5T A; 1HQC A; 4OVZ B; 2MH8 A; 4AG6 A; 1PJS A; 4DV3 M; 4IBJ A; 4G4O A; 4LJ4 A; 4S12 A; 3J7A S; 1GLN A; 1MJG M; 1QZM A; 4RF0 A; 4NRW A; 3SAR A; 2ZAN A; 3UJN A; 3RGP A; 1HT1 E; 3QWL A; 2A5Y B; 3B89 A; 3IEC A; 3PNV A; 1NNU C; 5BR8 M; 1AUA A; 1Z6T A; 2KW0 A; 3T1H M; 5ITX A; 2CWB A; 2M60 A; 4KO8 A; 3HKP A; 3RGS A; 2F5P A; 4X64 M; 2HHH M; 4DR6 M; 3U6C A; 1IN4 A; 2WSC F; 2DAI A; 4ITQ A; 3HHY A; 2YQZ A; 2C96 A; 1XMQ M; 3NBX X; 1VEK A; 2FOI C; 3KFU G; 4LFA M; 4I4L A; 4RKU F; 3TQS A; 3AOG A; 3ZCB B; 3IG5 A; 3T38 A; 4FWD A; 4X66 M; 5JI2 E; 5E26 A; 3U6O A; 4YY3 M; 4MGH A; 5EXT A; 2YNM D; 4M9S A; 3CF6 E; 3U61 B; 1IXS A; 2LTU A; 2YFQ A; 8CAT A; 1WHC A; 3BBZ A; 3HZJ A; 2GQF A; 2HL7 A; 5KQ8 A; 1DV0 A; 2ZM6 M; 2CHQ A; 3TWK A; 5EP4 A; 2KRU A; 1DGF A; 1NY5 A; 3SMP A; 4DV5 M; 5IZ7 D; 4B3R M; 1L2C A; 1J09 A; 4CGY B; 4JYA M; 2MR9 A; 4X65 M; 4JI5 M; 1NJG A; 1SXJ E; 2K6B A; 3AOE C; 3U6P A; 2LXE A; 2LHG A; 3FRI A; 1IN5 A; 2R4J A; 3B9P A; 2QQ8 A; 2ZAM A; 3VDP A; 1IQP A; 2KNV A; 2LWX A; 2QZ4 A; 2VDB B; 1G3I A; 5IRE B; 3W68 A; 3GLI A; 5FTL A; 3K1J A; 3U61 A; 4LY6 A; 4LGM A; 2DWL A; 4IBI A; 1YLA A; 1E32 A; 2B3T A; 2YR0 A; 4A3V B; 3TL4 X; 3F92 A; 4AKI A; 4DV7 M; 3R9X B; 1EE8 A; 2VF8 A; 4M9X A; 5F3W A; 2QBY B; 2FS1 A; 1R2Z A; 3V76 A; 1T6O A; 1NY6 A; 5ITQ A; 2EKK A; 3DFZ A; 4IBK A; 2X8A A; 3EIE A; 1NHG C; 2HWJ A; 4PCZ A; 4G6Z A; 4WUR A; 4F1I A; 4G4N A; 2O01 F; 2R18 A; 3KSX A; 1PJI A; 1NNJ A; 3HY5 A; 1NSF A; 3BXW A; 4LJ6 A; 1ZMU A; 3M6A A; 2Z3X A; 3TE6 A; 5KO3 A; 2OPF A; 3A46 A; 1XXH B; 1JR3 E; 3GLH E; 4FW9 A; 1RU3 A; 4KT0 F; 1YSY A; 1DGG A; 3HU1 A; 1OAI A; 2LBC A; 1PJQ A; 2XSZ A; 2CRU A; 3D8B A; 2D7H A; 3LMM A; 4NSR A; 1ZMV A; 4NL4 H; 1NVM A; 4L6V 6; 1N32 M; 1V34 A; 3EIH A; 3DZD A; 4AG5 A; 2XEP A; 1QQW A; 1L8Q A; 4K0K M; 1DO2 A; 4QHS A; 5FTN A; 5ITU A; 4JI2 M; 4JI4 M; 5IT9 S; 2JA2 A; 2NQ8 C; 3KP0 E; 4AW4 A; 3GLF A; 4NC6 A; 2V1U A; 4FWG A; 2DAM A; 2MJ5 B; 2RRU A; 4CJ6 A; 5GKN A; 4M9Z A; 1JQJ C; 3U6E A; 1YE9 A; 3JR4 A; 2L09 A; 4WW0 A; 1XNR M; 1SXJ B; 1XXH A; 3KDS E; 3A45 A; 4NXN M; 5EJC A; 1LV7 A; 2C9C A; 4IBG A; 1HNZ M; 2LNH C; 2UU9 M; 3W0F A; 3C3D A; 2QEN A; 2CUZ A; 2JUJ A; 5EQT A; 4G4R A; 1OAO C; 2J7O A; 2UXC M; 1W5S A; 4LG2 A; 3KVW A; 1QZE A; 2UXB M; 2CE7 A; 4B08 A; 2O25 A; 1HR0 M; 1L2B A; 3MHV C; 1BVS A; 4B7G A; 4D82 A; 4DR7 M; 2APL A; 3GQ3 A; 1OIZ A; 3HX3 A; 2C99 A; 1GVN A; 3DA1 A; 5LMU M; 1K3X A; 3C3E A; 4LGY A; 1NV8 A; 4I81 A; 2I7P A; 2RGO A; 4R7G A; 2UUC M; 1V92 A; 2F5S A; 1I4W A; 3TWL A; 4MGY E; 5L8R F; 1VDD A; 3E21 A; 2W82 A; 2LVN C; 3NWL A; 2D7E A; 4M0W A; 2EO2 A; 2EJS A; 5DFL A; 2UUA M; 3L26 A; 3QYB A; 1OFI A; 5H37 D; 2KNA A; 4GHL A; 2L4F A; 2QHO B; 4B7H A; 3GLH B; 2DZN B; 3GLG E; 2BJW A; 1OQY A; 3T1Y M; 2JY5 A; 4D80 A; 3I04 M; 4KHP M; 4JI7 M; 4LZJ A; 2ZAO A; 2DZL A; 3SBJ A; 1PM5 A; 3KOX E; 4HEO A; 1X37 A; 2JXN A; 3FKE A; 2R0I A; 4G3O A; 1QYR A; 2F5N A; 2CEA A; 4GIT A; 2R4E A; 3PVS A; 1VDL A; 4FD2 A; 1IY1 A; 1GJT A; 5ITR A; 2DHY A; 3H4J A; 4IBF A; 3U6L A; 4LF7 M; 1FNN A; 2L4E A; 2XF3 A; 3CF0 A; 3B7Q A; 4FCV A; 4GEW A; 3B7N A; 3VKH A; 2H1R A; 4DV4 M; 2CV2 A; 1N75 A; 1N34 M; 2JP7 A; 2Q2E B; 4OVZ A; 3J80 S; 4LFC M; 4JV5 M; 3VKG A; 4MM3 B; 1NV9 A; 3U60 B; 3PXG A; 2WSF F; 5DYI A; 3IHP A; 3L29 A; 1E94 E; 2DKL A; 3K9P A; 4CIS A; 4DR3 M; 1SG9 A; 1Q39 A; 2DAK A; 1IXR C; 2DXI A; 2R46 A; 1E9R A; 2K9D A; 3B7Z A; 3CTW B; 4LJ8 A; 2RKO A; 2DWM A; 1XNQ M; 3FYC A; 4P16 A; 1QAQ A; 1XWI A; 1R4G A; 1Z59 A; 4LF9 M; 4KOD A; 3OTO M; 3LQR A; 4IIW A; 1W5T A; 1TH2 A; 3J27 B; 4GC9 A; 2V1C A; 1TGU A; 4DV2 M; 1CUK A; 2XSZ D; 4Q7J A; 3GP1 A; 1C7Y A; 4IBB A; 2KZS A; 4B3M M; 1R2Y A; 1IXZ A; 2J7N A; 3U6M A; 4JXJ A; 1GL7 A; 4HLQ A; 2XLJ A; 2DWN A; 3I01 M; 4LRT A; 7CAT A; 1WIV A; 2DNA A; 2KDL A; 4DUY M; 4B7F A; 3UGJ A; 2Y0Q A; 4IJE A; 3TWM A; 4WP2 A; 5EXS A; 2L6O A; 3THG A; 4FWH A; 3AFH A; 4NRV A; 4P17 A; 3GQ5 A; 3HHX A; 2VII A; 3FUV A; 4MH0 E; 3W0L B; 3GPU A; 1K82 A; 2CV1 A; 4BBA A; 3M7G A; 4L4U A; 3K92 A; 1H6U A; 1IN8 A; 1UM8 A; 2Y20 A; 3IG8 A; 2J5Y A; 3HU3 A; 3ILK A; 4JN6 A; 4MGI E; 5FSW A; 1QAM A; 3U6D A; 1R6B X; 2JZ1 A; 2CP8 A; 2LH0 A; 1MN3 A; 1QAO A; 2KRK A; 3GPX A; 1PJJ A; 4PDG A; 3J2P B; 4LJA A; 3C9P A; 2H5X A; 4DR2 M; 3U6S A; 2DWZ B; 3SHF A; 2LVQ D; 4I5S A; 4AKH A; 1PRB A; 1N33 M; 1FJG M; 2QBY A; 1IBM M; 1QUT A; 1IY2 A; 4MGK E; 2I7N A; 4L78 A; 1GJS A; 4LF8 M; 2BNK A; 2XGN A; 2FFJ A; 3A42 A; 4LF5 M; 5ITX E; 1N77 A; 1L2D A; 1LTM A; 2L2D A; 2QP9 X; 5E6J A; 2AHM A; 2Y0T A; 3UK6 A; 4DV1 M; 3SAW A; 4NXM M; 1GAB A; 3C58 A; 2RGH A; 2G3Q A; 3K9O A; 4IBC A; 4QNR A; 1Z5C A; 3W67 A; 5C1B A; 3L27 A; 3E4R A; 3LW5 F; 5FLX S; 2WZJ A; 2HCB A; 2UUB M; 3HU2 A; 3SAU A; 2VF7 A; 4BB9 A; 3MMP A; 1OKS A; 4LJ7 A; 1MX0 A; 1TH3 A; 2R62 A; 2F4V M; 2VQE M; 1K3W A; 5JI3 E; 1N36 M; 4IBD A; #chains in the Genus database with same CATH homology 4QNM A; 1NHW C; 1T3T A; 1DGB A; 1ZQ9 A; 3HJS A; 1NJF A; 4NSO B; 2DHR A; 3JAM S; 1R7R A; 4LFB M; 3MJ5 A; 3NBI A; 3SC3 A; 1Z5B A; 1SXJ A; 1DO0 A; 4DR5 M; 3FUX A; 4QHT A; 4OX9 M; 1DGH B; 3AV0 A; 1TDZ A; 3KOZ E; 4JI6 M; 4GIP A; 3TPZ A; 4L16 A; 2XFS A; 4PD2 A; 4YHH M; 3WHL A; 2G5G X; 4NOO B; 3FTC A; 3GRV A; 4JI0 M; 2UXD M; 3L2A A; 3CF2 A; 1E9S A; 1G41 A; 3ZC7 B; 4GH9 A; 4REZ A; 2C98 A; 3A98 B; 1IN7 A; 3GPY A; 2M5Z A; 4LF6 M; 4IJF A; 2C5R A; 1HNW M; 3UMM A; 4GC5 A; 4I8O A; 3Q8X A; 2O5R A; 1MU5 A; 4L8R C; 4DR4 M; 1WXQ A; 5EP1 A; 1ZAE A; 2X49 A; 2BJV A; 4LCB A; 3VDU A; 5BPV A; 4GMQ A; 2QCU A; 3SYK A; 1Z5A A; 4OW0 A; 1JR3 A; 1QAN A; 3GLH A; 5FTK A; 5A2Q S; 1KSF X; 1IM2 A; 3RE8 A; 2G8L A; 3LVV A; 2OQ4 A; 1KFV A; 2ERC A; 1IXS B; 1HT2 E; 3I4V A; 3SFZ A; 2R65 A; 2V6Z M; 3HJ8 A; 3QAU A; 1KYI A; 2C9O A; 4LF4 M; 3HGI A; 3E9S A; 3GRU A; 4XBO A; 1L1Z A; 4OU7 A; 1TDH A; 3VK7 A; 4KLN A; 4R3D A; 3ZH9 B; 4JI3 M; 2XFT A; 3GLI B; 2XH9 A; 3BOS A; 4D81 A; 3U60 A; 4JI8 M; 3I51 A; 3T15 A; 3JR5 A; 4GHA A; 4DUZ M; 5ITT A; 2FNA A; 2Z7J A; 2F5O A; 4AI6 A; 3FTD A; 4LRS A; 4IBE A; 1YUB A; 3FD9 A; 4ZPX A; 5EXX A; 1IN6 A; 1XHB A; 3GLG B; 5EXP A; 2KZU A; 3LVW A; 4QOZ C; 4G4Q A; 1XMO M; 1GL6 A; 4Z6Y A; 4GKJ M; 3I4Y A; 5FTJ A; 1N78 A; 3DOA A; 4MB7 A; 1TH4 A; 2E5L M; 3KXE C; 2X4A A; 2CHV A; 1J5E M; 2XZU A; 2P5T A; 3LQQ A; 4QOS A; 4PDI A; 1SXJ C; 4GKK M; 3D8L A; 3KP1 E; 5KPR A; 4TUW A; 2L7H A; 2KXE A; 4GRI A; 1HQY E; 2D7G A; 3HWS A; 1IBK M; 2Y21 A; 2Z4S A; 1IY0 A; 3J7B A; 4DV0 M; 3GLG A; 3VFD A; 1I94 M; 2QPA A; 2ZBK B; 3H4M A; 1SXJ D; 1D2N A; 4B3T M; 5DYG A; 3VK8 A; 4DV6 M; 3GQ4 A; 3GO8 A; 5EP2 A; 2Z4R A; 5DNY A; 3GLF B; 3SHG B; 1Q3B A; 3R8F A; 4LZZ A; 3KOY E; 3WHK A; 1OFH A; 4HL4 A; 4II7 A; 4M0D A; 3GRY A; 1C1K A; 4W5W A; 3VLF B; 3K2L A; 5KPT A; 3FTF A; 3AKZ A; 3U5Z B; 4LJ5 A; 3KW6 A; 3AOE A; 5ITY A; 2HKJ A; 1G8P A; 4B3S M; 4MGZ E; 3K8Z A; 3M0E A; 4RF1 A; 1QVR A; 3UZU A; 3MK6 A; 2KEB A; 4FCW A; 1XC8 A; 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