2FFUA

Crystal structure of human ppgalnact-2 complexed with udp and ea2
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
494
structure length
494
Chain Sequence
KVRWPDFNQEAYVGGTMVRSGQDPYARNKFNQVESDKLRMDRAIPDTRHDQCQRKQWRVDLPATSVVITFHNEARSALLRTVVSVLKKSPPHLIKEIILVDDYSNDPEDGALLGKIEKVRVLRNDRREGLMRSRVRGADAAQAKVLTFLDSHCECNEHWLEPLLERVAEDRTRVVSPIIDVINMDNFQYVGASADLKGGFDWNLVFKWDYMTPEQRRSRQGNPVAPIKTPMIAGGLFVMDKFYFEELGKYDMMMDVWGGENLEISFRVWQCGGSLEIIPCSRVGHVFRKQHPYTFPGGSGTVFARNTRRAAEVWMDEYKNFYYAAVPSARNVPYGNIQSRLELRKKLSCKPFKWYLENVYPELRVPDHQDIAFGALQQGTNCLDTLGHFADGVVGVYECHNAGGNQEWALTKEKSVKHMDLCLTVVDRAPGSLIKLQGCRENDSRQKWEQIEGNSKLRHVGSNLCLDSRTAKSGGLSVEVCGPALSQQWKFTLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Dynamic Association between the Catalytic and Lectin Domains of Human UDP-GalNAc:Polypeptide {alpha}-N-Acetylgalactosaminyltransferase-2
pubmed doi rcsb
molecule keywords Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 171
structure length 494
sequence length 494
ec nomenclature ec 2.4.1.41: Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase.
pdb deposition date 2005-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00535 Glycos_transf_2 Glycosyl transferase family 2
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2ffuA02
3.90.550.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A 2ffuA01
5EIYA 2D20A 1K5UA 5JMCA 2RJ7A 3EE5A 2BEBA 2FYAA 1A8DA 3CU1B 3WINC 3CA6A 4OWLA 2V0LA 2VUAA 2OEGA 2HWMA 1OMZA 1AXMA 3AZVA 3H6QA 4KNRA 1HWPB 5EG6C 3IM6A 3W9TA 1TWEA 4Y7GA 4HO2A 4B4BA 1Z4SA 1RMLA 1FWUA 4P6AA 1NHEB 3FJ8A 2QH5A 3BA4A 3H6RA 1DZCA 2VXLA 1W57A 3U2UA 3A07A 1H5SD 1ZCYA 2WAWA 3FWWA 4JAWA 4EFQA 4ZOTA 1VCLA 1Q1UA 1BA7A 4QBVA 4LO0C 3V0LA 4X3AA 3CQAA 4B4GA 1EV2A 4XFUA 4EEAA 4EEMA 1JVGA 3E26A 3OGFA 4JQ0A 3FJJA 4TLPA 1TW1A 1O7QA 2YESA 1W3GA 4IRPA 1VGZA 4Y7VA 4E1KA 1AF9A 1RY7A 1GQCA 1PUMB 2YQHA 2X5SA 4P0LA 1PC8B 1V6WA 3C9ZA 1MP3A 3V90A 3I2XA 3H6SE 3CA3A 1SS9A 1CVSA 2AGDA 2AESA 5CMFX 3SX7A 5CQOA 1ZHJA 4AYLA 1IINA 1V6UA 3CRHA 1ZJ3A 5AJOA 1Z2VA 2O1HA 4XFSA 4ZA3B 1W3FA 1GQ9A 2BO8A 5C47A 4G9NA 1VZXA 2WRYA 3HL3A 2HW9A 2APCA 1JY0A 4G6MA 3D98A 1WT3A 3BAVA 3BTAA 4OEGA 2AM3A 1ZI5A 3SXBA 1KNMA 3PMEA 7I1BA 5C3AA 3Q7WA 4OWKA 1JYKA 1FZWA 2NZ9A 4ASJA 1NUNA 2UUSA 4CJMA 5C49A 4G87A 4F83A 1QQLA 2JCLA 2X60A 4KXOA 2PA4A 3PKQA 2KH2A 3R4SA 1H7TA 1ISYA 1PWAA 1EYRA 2NXVA 1GWVA 1S0GA 1AVXB 1TW5A 2KLLA 1R80A 4LW6A 4HO5A 1TZFA 1JT4A 4I4QA 4I8MA 1ZJPA 3BRFA 3S8KA 1R8OA 2D1ZA 2I7BA 4ZGRB 5BVPI 1S0LA 41BIA 3UD9A 2RIZA 3CKVA 3KIAA 1IILA 5E24E 3ZGFA 4G3QA 3T7OA 3ZLLA 3WO2A 2BFHA 4JP0A 4FGFA 1LL2A 3UJ4A 1VZTA 3AH2A 3BAUA 3FGMA 3I0IX 1G95A 4OWJA 5F8WA 2XWMA 2AFGA 2NTDA 1JYLA 4H04A 2GZBA 4JKQA 4JD0A 1ZI4A 4Y6UA 4C2SA 4EEGA 5IDSA 1MC3A 3T7NA 21BIA 3HOMA 1JT3A 3TZTA 5DZUA 4CVHA 4LO1C 4J18A 1LZIA 2M49A 2KKIA 4I4RA 3WO3A 5BOWA 2WEEA 1Z0HA 2I1BA 3FUQA 4X39A 2F8XC 1V6XA 1H5RB 2X2TA 2JCJA 4LW3A 1RG8A 2R9KB 3QYDA 2XOAA 4I2SA 1HIBA 3UD8A 4J2XA 2VSAA 3AJ6A 2RQ9A 1WT1A 3CKOA 3KMVA 4R7PA 4EFPA 1J0SA 2Q9XA 2AE7A 5BXSA 3SPTA 1TP0A 1Q04A 1VM8A 1W55A 1CE7B 3FJBA 3IAGC 1H5SB 1V84A 3D5NA 4F34A 3BRDA 4Y9XA 4EE5A 3I0FA 3BRKX 1IOBA 1VGUA 3TC2A 1YF8B 1WT2A 3HALA 3RMYA 4IY9A 1S4PA 2NVHA 4B42A 3FJDA 1XYFA 4D48A 4BMAA 3BRGC 1FXJA 2QKXA 3T8SA 1H5TA 3E25A 5CQNX 2GGQA 4YS8A 5L6VA 4G1RA 1W3AA 2AM5A 2ICXA 3V0AB 5I1BA 1FG5N 4IONA 3BAOA 9ILBA 2D0JA 2V0JA 2Y9GA 4G3SA 3N7KA 2NM1A 4HOCA 2PGYA 3BB2A 1HM0A 1HCEA 4IRQA 4FVVA 2D44A 4HO3A 1R7TA 1ON8A 2Q3NB 1PZZA 3FJHA 4KC3A 2O1GA 4L41C 4X38A 1L2HA 2FFUA 4A7ZA 2F2FA 1BLDA 4B2XA 1BFFA 2AH9A 3EF2A 1HWNB 3FJAA 3O4DA 2GO2A 3UJ0A 1PZYB 2YQCA 3U2XA 1ILR1 3HN1A 4P02A 1Z90A 4OEEA 1ZCTA 1HWMB 1YP3A 3O4OA 3V8YA 1ISWA 4P00A 5EC5A 1SR4A 5CMJA 2RJ4A 3O4CA 1KWSA 5C8RA 4A7YA 3POKA 1ZI3A 1O0RA 1M16A 4I1EA 4GOYA 4WBCA 3RMWA 4DE7A 1HJLA 3V8ZA 3MALA 5FYEA 4B5BA 4X37A 3IM5A 1H4EA 4HR6C 2RJ6A 3S8JA 3I0EA 2HZ9A 1E5KA 3JUTA 3LW6A 4KPXA 1YYNA 2X2SA 2OEFA 5EHAA 1IT0A 4M2AA 3AKIA 1IIMA 1N4KA 2Z49A 1FR8A 3N9WA 3R4UA 4FREA 5IDTA 3VUOA 1R7UA 1H4DA 2YC5A 3T7MA 5C38A 5I1FA 5J49A 2ZU9A 5DSSB 5C3DA 3Q7YA 5JLVA 4ZFYB 3PHZA 1ZJ1A 1BFCA 4HJJA 3V0PA 4GAIA 5BP5A 4PC4A 1JV1A 3AZWA 2YCMA 1D0HA 5DVHA 4J2YA 1HWOB 2AAIB 3FJKA 4EEEB 3CKNA 3Q80A 4AAWA 4AYJA 4B4MA 1R7XA 3PNNA 4MYBA 3SX8A 3AKGA 4II0A 4D0TA 4P0KA 3I0JA 3RSJA 1QQKA 2P23A 3DUVA 4JISA 1VH1A 4I96A 2JCOA 2NP0A 4IZEA 1K4VA 1WBAA 3CRGA 4I1BA 1WBCA 3RMXA 4R6UB 3I0LA 5C1LA 5C4DA 2VXRA 3OKRA 2LIEA 3VSFA 2Z87A 3WO4A 5FTVA 3FFZA 1S0EA 2E4MC 1VPAA 1YROB 2IWTB 3BADA 1PZTA 3VT1A 1I1BA 2DS0A 5EJZA 4LO2A 4FRPA 3R3IA 5CMIA 2ZQNA 1GX4A 2Z48A 1OQLB 3NJ5A 1BARA 1NQIB 1V83A 1BFBA 4I4OA 5FZUA 1G1LA 1WSZA 3ZC8A 4I4YA 2E8BA 2FO1A 2YC3A 3O3PA 2YUGA 1ON6A 1YP2A 1V6VA 4UEGA 4Y7FA 1DQGA 2WVMA 4NAIA 2K4AB 2D22A 4QBCA 1G8OA 3POLA 3VEQA 4KC1A 4NANA 4HG6A 4G3PA 3OGZA 5L6SA 1JT7A 1I52A 1ABRB 1WD3A 1ZDGA 3NBCA 1JTCA 3ILAA 3P6IA 5D62A 2Y4JA 3FJ9A 1G93A 3PUBA 31BIA 2DRZA 2FDBM 3OC9A 4FROA 3SX3A 1FWYA 3RSBA 4JKXB 3ZGGA 2O1FA 5FTSA 3OBTA 4Y7UA 4GP3A 1H7FA 2ZR1B 2FYDB 4EVWA 2QYIB 2ESUA 2P39A 2CU2A 2XMHA 2VD4A 3I29B 4ISQA 3SNVA 5BQUA 1YBIA 1G2VA 1GX0A 2QN4A 3V91A 5DDTA 3ZF8A 4I7IA 3PG0A 2P6WA 4HA2A 1W77A 1FGAA 1H7LA 1HM8A 2A8WA 4FRDA 1G9RA 1H4CA 1S0BA 4KC2A 3F1RA 2AQZA 3NBEA 3ZXDA 8I1BA 1FO8A 1ZCUA 3I2AA 4KEKA 3WA1A 3BA5A 1QGQA 2FY7A 2ICYA 2UX8A 4EB2B 2VSIA 4ZKTB 5D63A 2K8RA 1HV9A 3ZX7A 4QALA 2A8UA 3V0BB 4OEFA 5C4CA 3O4BA 3OH1A 3SX5A 4GP0A 2MZBA 4GBPA 2Z86A 1K5VA 3CU0A 4D11A 5FU0A 1DZDA 4KBBA 3OAMA 1ZJOA 1E0OA 1G82A 1G9CA 4EE4A 2AXMA 3LLPA 4I6IA 1BLAA 3SXGA 3JRRA 1T9FA 4LO3A 1ISZA 4IZXA 4J23B 4CJBA 3P53A 3Q7UA 2DREA 1G97A 2D24A 4KEJA 3VWCA 2MIBA 1YXWA 4IHZA 4L4HA 4JRAA 3JTJA 3U0YA 1O7OA 4B2WA 1H7HA 3VT2A 2PGVA 1NMMB 1VZUA 1V82A 3U0XA 2RJ9A 1XG6A 4QC4A 3RTIB 2I5EA 2RSTA 4XWIA 1JT5A 3O44A 5D61A 4KEIA 5FNWA 2W0WA 1HCDA 3K8DA 4I4SA 2VSEA 1XZZA 3OBRA 1QXMA 1R8NA 1H5RA 1TTUA 1G0RA 1H7EA 2V0IA 4FCEA 3AH4A 4Y7TA 4IY8A 1FV3A 5HPZA 4FRBA 2P73A 1FOAA 2RJ5A 1EYLA 1INJA 1ONKB 3I0DA 4EE3A 5BP5C 3SXDA 2RJ8A 1DLLA 4FRQA 1PUUB 3HMYA 3B9UA 1TIEA 4H9WA 2ERMA 3USRA 2OI7A 1H5SA 3FJFA 3H6RB 3Q7XA 4I0YA 3NGWA 2WVKA 3Q4SA 2E3DA 2FYCB 5JQQA 1YTOA 3GUEA 3I0HA 3DJ4A 1FWVA 2VSHA 2Y4MA 4I4PA 1ZCVA 2Y4LA 4Q9PA 3FUOA 3K8EA 5C1HA 4I37A 2I5KA 4HCQA 4NAKA 3WMVA 1ISXA 4DDZA 4ZDQA 2FFVA 1I1EA 4Y64A 1MP4A 1S4NA 5C1GA 1FO9A 4B3UA 4I4VA 3V0AA 1JV3A 3RMVA 3U2WA 4G9MA 4I4UA 2RIXA 2Y4KA 3CA5A 5F8YA 3NBNA 3BCVA 3OH0A 4M4KA 5CQMX 3CA0A 2RJ0A 3N7LA 4LO2C 1TOOA 1WVCA 1M2TB 1VGWA 4QO3A 1G3LA 4FRAA 3E8LC 4GAFA 1H7QA 1S4OA 4Y6NA 3V0OA 3BAQA 1EVTA 4Z9WB 4G6JA 1O23B 4USPA 1LVWA 3OGGA 4MNDA 1DJSB 1JQZA 5AJNA 5FU8A 5EJ1A 5FNXA 2KI6B 2BO7A 1NKHB 2ZU8A 3N7MA 3IOIA 1S0FA 4ECMA 4ZFUB 4Y63A 1RZOB 2BEAA 3CAHA 3O4AA 4DEPA 5C4EA 3USQA 3BA7A 5C4FA 3CA1A 2Q4JA 4Q9GA 2ET2A 2ZQOA 3IM7A 3BX1C 1QG8A 2RG9B 3RTJB 2YQSA 3FOQA 1S0DA 1BFGA 4D0ZA 1QGSA 4DECA 4KC4A 2XMEA 5BXCA 1GA8A 3I0GA 3N7JA 4HO6A 2MC2A 4DCKC 3I0CA 4GOVA 1UPSA 3CGXA 4HO0A 3AH1A 1AVUA 4XFTA 4ARWA 3R2WA 3FJIA 3WINA 5BQUC 3IIRA 5FZZA 3SXCA 1FMZA 2BO4A 3SXEA 4J2SA 1LZ0A 2P72A 3V0NA 5FZYA 5HS2A 1QWJA 2VU9A 2Y7AA 1XZ6A 1FGXA 4ZFWB 4HO4A 1FV2A 4XKIA 3OJ2A 1ZJ0A 3TQDA 1ZI1A 4DENA 3UDAA 2XWNA 3UD7A 1DQOA 5BXPA 1JLXA 2D43A 2WBCA 1DIWA 3HSMA 1FXOA 4LO0A 1ZJ2A 3JUJA 1FR9A 4AN7B 1GWWA 4QD2C 1R82A 4OW4A 1NWGB 4K6RA 1MP5A 4D11C 4P0JA 3IOHA 1JVDA 1HJJA 1R7YA 4M28A 3A23A 1AFCA 1T4QA 4LO3C 1II4A 5GAQA 4D8HA 2V0HA 4CJ8A 5F90A 1SZ6B 1H3MA 4FCUA 1NZKA 4QD2B 1FRWA 1FGGA 4FRHA 1WD4A 4Q91A 1BASA 4OUJA 3PKPA 2RJ1A 3JUKA 3A22A 4QKRA 1LL3A 3OJVA 1AVAC 3ZC9A 1FN0A 2GGOA 2VXMA 5CMHA 5DDVA 3V0QA 1H5TB 4M2BA 4IQPA 2E4MA 4ZLBB 4KNXA 2VLCA 1LL0A 3VSZA 5C4BA 1FMMS 4KT7A 1R81A 1MC9A 2NYYA 2D7IA 4EEOA 1S0CA 2F2FC 4L4IA 2BO6A 4KRVA 5IFYA 2JCKA 1DFCA 1AVWB 1HKNA 2VS5A 2VFZA 1F31A 4USOA 2OI5A 2V0KA 3OJMA 2XWLA 2OI6A 1TWMA 3F1CA 1ZIZA 4KQLA 3V0MA 2AM4A 2WGZA 2Y6PA 1G9BA 1SR4C 4IYBA 4Y62A 4CJCA 1WT0A 3I0KA 2QGIA 5BXRA 1XHBA 3U2TA 3V79C 2RIYA 1GGPB 1JLYA 2X5ZA 1H5SC 1R7VA 3OH2A 2W0VA 4AN6A 1HM9A 4EFRA 4FQWA 3D8VA 4J2KA 3OH4A 3K1XA 5C48A 2KI4A 3F1YA 3CRIA 1ISVA 4LO7C 5CMGX 4FRLA 3U2VA 4YOLA 5G00A 3ST8A 1EZIA 5C3BA 2J3PA 2Y9XE 2VS4A 3AJ5A 1MD6A 3F62B 4FRMA 2WE9A 4Z8SB 2AECA 4EKXB 1EPWA 4JPZA 2WVLA 4LO1A 1TFMB 2VXTI 5CQPA 4LO7B 3A21A 1IJTA 4LO8B 3MPPG 1H7GA 3BAHA 2Y9FA 2D7RA 3LTQA 3AKFA 3AKHA 1VH3A 5C36A 1IRAX 3FJEA 1DFQA 2K43A 1G9DA 1NF5B 2Y9WC 2VS3A 1P63A 1G9AA 4BQHA 3HBWA 2PX7A 2HWAA 5CQLX 1IHKA 3V0BA 1OQMB 4HO9A 3FJCA 4ASYA 2X65A 2LIQA 3IOJA 2FGFA 3P6JA 4ENDA 3ZXGA 1LZ7A 2YQJA 1FQ9A 2ZU7A 3N0KA 1ZDFA 3BAGA 2IHOA 4A7KA 5B2HA 1OMXA 3O3QA 1IRPA 1YP4A 1VICA 1Q03A 2DPWA 3CKQA 4NALA 3SXAA 4AC3A 3O49A 1INIA 3O5WB 2MLLB 3QVBA 5BXTA 6I1BA 3CA4A 1LZJA 2FYBA 3CKJA 4I3NA 4ISRA 4ZBVB 3D7WB 1TVYA 3QR5A 4I4XA 2DRYA 3VT0A 3ZLKA 5FV9A 4HO8A 5F8SA 4KPZA 2D23A 5AJPA 3OH3A 1G23A 1ITBA 1VGTA 3DK5A 5DUYA 2RITA 5FUHA 3NBDA 3WMUA 2L5XA 4QKSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EIYA 2D20A 1K5UA 5JMCA 2RJ7A 3EE5A 2BEBA 2FYAA 1A8DA 3CU1B 3WINC 3CA6A 4OWLA 4MZFB 2V0LA 2VUAA 2OEGA 2HWMA 1OMZA 1AXMA 3AZVA 3H6QA 4KNRA 1HWPB 5EG6C 3IM6A 3W9TA 1TWEA 4Y7GA 4HO2A 4B4BA 1Z4SA 1RMLA 1FWUA 4P6AA 1NHEB 3FJ8A 2QH5A 3BA4A 3H6RA 1DZCA 2VXLA 1W57A 3U2UA 3A07A 1H5SD 1ZCYA 2WAWA 3FWWA 4O6MA 4JAWA 4EFQA 4ZOTA 1VCLA 1Q1UA 1BA7A 4QBVA 4LO0C 3V0LA 4X3AA 3CQAA 4MIXA 4B4GA 1EV2A 4XFUA 4EEAA 4EEMA 1JVGA 3E26A 3OGFA 4JQ0A 3FJJA 4TLPA 1TW1A 1O7QA 2YESA 1W3GA 4IRPA 1VGZA 4Y7VA 4E1KA 1AF9A 1RY7A 1GQCA 1PUMB 2YQHA 2X5SA 4P0LA 1PC8B 1V6WA 3C9ZA 1MP3A 3V90A 3I2XA 3H6SE 3CA3A 4H75A 1CVSA 1SS9A 2AGDA 2AESA 5CMFX 5CQOA 1ZHJA 3SX7A 4AYLA 1IINA 1V6UA 3CRHA 1ZJ3A 5AJOA 1Z2VA 2O1HA 4XFSA 4ZA3B 1W3FA 1GQ9A 2BO8A 5C47A 4G9NA 1VZXA 2WRYA 3HL3A 2HW9A 2APCA 1JY0A 4G6MA 3D98A 1WT3A 3BAVA 3BTAA 4OEGA 2AM3A 1ZI5A 3SXBA 1KNMA 3PMEA 7I1BA 5C3AA 3Q7WA 4OWKA 1JYKA 1FZWA 2NZ9A 4ASJA 1NUNA 2UUSA 4CJMA 5C49A 4G87A 4F83A 1QQLA 4MZHA 2JCLA 2X60A 4KXOA 2PA4A 3PKQA 2KH2A 3R4SA 1H7TA 1ISYA 1PWAA 1EYRA 2NXVA 1GWVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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