2FFUA

Crystal structure of human ppgalnact-2 complexed with udp and ea2
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
494
structure length
494
Chain Sequence
KVRWPDFNQEAYVGGTMVRSGQDPYARNKFNQVESDKLRMDRAIPDTRHDQCQRKQWRVDLPATSVVITFHNEARSALLRTVVSVLKKSPPHLIKEIILVDDYSNDPEDGALLGKIEKVRVLRNDRREGLMRSRVRGADAAQAKVLTFLDSHCECNEHWLEPLLERVAEDRTRVVSPIIDVINMDNFQYVGASADLKGGFDWNLVFKWDYMTPEQRRSRQGNPVAPIKTPMIAGGLFVMDKFYFEELGKYDMMMDVWGGENLEISFRVWQCGGSLEIIPCSRVGHVFRKQHPYTFPGGSGTVFARNTRRAAEVWMDEYKNFYYAAVPSARNVPYGNIQSRLELRKKLSCKPFKWYLENVYPELRVPDHQDIAFGALQQGTNCLDTLGHFADGVVGVYECHNAGGNQEWALTKEKSVKHMDLCLTVVDRAPGSLIKLQGCRENDSRQKWEQIEGNSKLRHVGSNLCLDSRTAKSGGLSVEVCGPALSQQWKFTLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Dynamic Association between the Catalytic and Lectin Domains of Human UDP-GalNAc:Polypeptide {alpha}-N-Acetylgalactosaminyltransferase-2
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2
total genus 171
structure length 494
sequence length 494
ec nomenclature ec 2.4.1.41: Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase.
pdb deposition date 2005-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00535 Glycos_transf_2 Glycosyl transferase family 2
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2ffuA02
3.90.550.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A 2ffuA01
3FJFA 4G9MA 2D7IA 1Q04A 1FGAA 4Z8SB 3FJAA 2X2TA 4Q91A 5IDSA 1WT2A 5C4BA 2OEFA 2YQCA 5B2HA 3Q7UA 4KQLA 3AZVA 4CJ8A 1W77A 1LL0A 3CKQA 1XYFA 4Y6NA 1T9FA 4BMAA 1VH1A 4OWJA 2E4MC 3P6JA 1ZJ2A 2JCOA 3HN1A 1NWGB 4KC2A 5CMGX 1NF5B 2NTDA 1ON8A 5JQQA 4IY8A 4Y6UA 1W3AA 2WVKA 4JKQA 3C9ZA 1E0OA 4HO6A 1JYLA 1Z4SA 3FJJA 1H5SC 2FYDB 4NALA 4FRHA 3SXGA 3CU1B 3BRGC 1JVGA 1O7QA 3FUQA 2AESA 4DENA 2O1FA 4A7YA 1VM8A 1G93A 1ZCVA 2NP0A 2X60A 1BFCA 2NXVA 2K4AB 1HM0A 2RJ1A 3WMUA 4KEJA 4J23B 1DQGA 1TFMB 2DRYA 2RJ5A 1LZJA 1BARA 4I1EA 2BO4A 2XMEA 1HIBA 2DRZA 3PMEA 4OEGA 1YP2A 1Z2VA 1AVUA 2J3PA 4P6AA 1G9CA 3BCVA 5C3BA 4P02A 3SX3A 4J2SA 2AXMA 1PUMB 1XHBA 3H6RB 4KRVA 1FXOA 2QGIA 4KXOA 4XKIA 1IRPA 4ZFWB 1YP4A 1ZCTA 4MNDA 1K5VA 3BAHA 3FFZA 5BP5A 2NVHA 7I1BA 4EEGA 1S0GA 1P63A 4OWLA 3ILAA 3WMVA 4DE7A 2D24A 2V0JA 3I0HA 4EFPA 1R7VA 4ZLBB 2WVMA 3FJKA 1HV9A 3TC2A 1H5SB 3U2UA 4IQPA 9ILBA 4KNRA 4ENDA 4ASJA 2RJ0A 1ZCUA 4YOLA 1H5TA 3CGXA 5AJPA 1QQLA 1RG8A 4L4HA 5C4FA 1OQLB 3N7JA 1V84A 2YUGA 4FGFA 1Q03A 4FREA 1BLAA 4HO5A 3V0QA 3O44A 4ARWA 3U2VA 1G97A 1BFFA 4II0A 1LVWA 4I37A 1HM8A 3P53A 1ZI5A 2RJ7A 3POKA 3F1RA 1ZI3A 4AC3A 1IRAX 3OJ2A 1YBIA 2D0JA 1TZFA 4IRPA 5BP5C 4Y62A 2VUAA 1T4QA 1L2HA 2VSAA 4XFUA 3SPTA 3WINC 5C4EA 3TZTA 4LO3A 3CKNA 4CJBA 3V91A 1FZWA 1D0HA 1GWVA 1NZKA 3EF2A 3D8VA 4Y9XA 2XOAA 2GO2A 3BA4A 4WBCA 2Z48A 3ZF8A 1QQKA 4I3NA 1H7GA 2E8BA 2FGFA 4G3QA 3HALA 1ZDFA 4D8HA 2L5XA 5CQLX 4X39A 3V0PA 4FRMA 2A8UA 3E26A 3U2XA 2IHOA 3FWWA 41BIA 2Y4LA 3POLA 5L6VA 2M49A 2APCA 2XWNA 4Y7FA 5DDTA 3PHZA 4NAKA 1QWJA 3CKVA 3VSFA 3BB2A 2PGVA 4QC4A 3GUEA 3CRGA 3OGFA 3V0BA 1GX4A 2Y4JA 1GGPB 2Y4KA 1G9BA 1H7LA 1ZI1A 4M4KA 4H04A 4J2KA 5BXRA 1FGXA 3ZX7A 3NGWA 4LW6A 1LZ7A 1J0SA 3OGGA 4JISA 3U2TA 3CA1A 3U0XA 4ZBVB 1O7OA 2P23A 1H7QA 3I0KA 1G82A 1VZXA 2YQJA 4NANA 1O23B 3F1YA 1PZTA 2QYIB 4P0KA 4KEKA 1OMXA 4GP3A 2VSHA 3OH3A 2VXRA 4Y7GA 2QN4A 1FWUA 1W3FA 2X5SA 4HOCA 3V90A 4AYLA 3JUJA 1MD6A 2JCKA 1YXWA 3T7NA 2I1BA 4IYBA 1VPAA 1RY7A 2VD4A 1H7HA 4KPXA 3KMVA 1CE7B 4E1KA 5CQMX 5FTSA 3CRIA 4Y7TA 1HCEA 2RJ9A 2ET2A 5IDTA 2YQHA 3A21A 5D61A 1ZJ3A 2WGZA 5FU0A 2ZR1B 1WD4A 3D7WB 3SXDA 3I2XA 2RJ6A 1VZTA 3ZLKA 3BAUA 3ST8A 3PG0A 1FXJA 4M2AA 4D0TA 1ISZA 4ZFUB 4KBBA 3OH1A 3CA0A 4Y7VA 4ZA3B 3CKOA 1FR9A 3RSBA 1H4CA 3FJ9A 3ZC9A 4F34A 1H7FA 1IILA 4HO2A 1EYLA 1AVAC 3V79C 2DS0A 1JQZA 3O4BA 1QGQA 5FU8A 3OH0A 5DSSB 1H3MA 4B4GA 3U2WA 3BAQA 5I1BA 2D23A 5D62A 1SS9A 1G2VA 3O49A 3V0MA 1S0CA 3N7KA 2D20A 2RG9B 3MALA 3UD7A 1G9AA 2Y9FA 3BRKX 2W0WA 1YTOA 4QBCA 5CMHA 5FNWA 4FCEA 2FYBA 3OBTA 5DDVA 5C3AA 3V0BB 2AM3A 4CVHA 3I2AA 1PC8B 2BEAA 4ISRA 1G23A 3EE5A 4DEPA 3V8YA 1ILR1 5C1HA 3K1XA 3SX5A 1K5UA 3T7OA 2HW9A 3BAOA 3LLPA 1FRWA 2AM5A 3AKGA 5G00A 1HWPB 1HKNA 1GX0A 1CVSA 3V0LA 4I4OA 5GAQA 4R6UB 3ZXDA 1I52A 3I0LA 1EPWA 4FRPA 4JAWA 1YROB 3IM5A 3SXBA 2VXMA 3ZLLA 1INJA 4AAWA 2AH9A 4QKRA 4QALA 1FO9A 5I1FA 3FJHA 3VT1A 3CA5A 1ISWA 2RQ9A 1RZOB 5FNXA 4KC4A 4EEAA 2Q3NB 3VUOA 31BIA 4I4XA 4D0ZA 3WINA 1VGTA 5BOWA 2QKXA 3E25A 3IOIA 4KC3A 1KWSA 3JTJA 4G87A 4K6RA 3T8SA 2R9KB 3O3QA 1V83A 5BXPA 2E3DA 1WT3A 3T7MA 4D48A 5JMCA 1JY0A 3BADA 4OWKA 1JYKA 1ZHJA 3PKQA 4NAIA 3HSMA 1ZDGA 3ZXGA 1WD3A 1NKHB 3I0CA 1S0FA 4I0YA 3F1CA 2ZQNA 1DFCA 3F62B 2OI7A 3OH2A 5HS2A 3CU0A 5AJOA 4FCUA 4KEIA 5EG6C 1TTUA 1GWWA 2RIZA 5C36A 1VH3A 1FWVA 4J2XA 2V0KA 1A8DA 1FGGA 4P0LA 1VGZA 1TOOA 4H9WA 2RJ4A 1EYRA 4KPZA 1JT5A 3SNVA 4ZGRB 2AE7A 4LO1A 4R7PA 5CMFX 2K8RA 1WBCA 5C48A 3WO2A 4DCKC 1TP0A 2O1HA 1H4EA 2XMHA 4USPA 2KI6B 2WAWA 1FMMS 4LO0A 1ZJ0A 1JV3A 4EE4A 4USOA 2AM4A 1MC3A 1UPSA 2NYYA 5EHAA 2F2FA 4J2YA 4G9NA 3AKFA 4OEFA 1LZ0A 4B4MA 2Y4MA 3I0JA 1I1EA 4EE3A 2VSIA 4X37A 1HWMB 4G1RA 1S0LA 4HA2A 2MC2A 3UD8A 1H5RA 2PGYA 2PX7A 2VS5A 1DFQA 4B4BA 3VT0A 2P39A 4GAFA 3NBCA 2YQSA 3Q80A 5FTVA 4UEGA 1IHKA 6I1BA 2YC3A 4AYJA 3N7MA 4LO1C 4EFRA 4ASYA 1FMZA 5FZUA 4A7ZA 2GGQA 2NM1A 5J49A 2UX8A 5BXSA 4GAIA 2F8XC 2BO7A 2P73A 3SXEA 1QXMA 3V0NA 2Y9XE 3FJDA 2O1GA 1R7YA 4EEMA 3AJ5A 3IM6A 2FFVA 3UJ0A 5EIYA 4LO0C 4FRAA 3VEQA 4HJJA 1G95A 1S4OA 4LO8B 2F2FC 4HO3A 1N4KA 3WA1A 4A7KA 3PNNA 2HWAA 4FRBA 5DZUA 3QR5A 1E5KA 4GOVA 1GQ9A 2MZBA 2BEBA 5CMJA 3CA6A 1ZI4A 3O4AA 4AN7B 3VSZA 4I96A 4FQWA 4ZOTA 4JP0A 2WBCA 1FOAA 4B2WA 4Q9GA 5EC5A 2DPWA 3IOHA 4JRAA 2Q9XA 3TQDA 2VSEA 3D98A 3LTQA 3H6SE 1FWYA 1ONKB 4B2XA 5C47A 1JLYA 1XZZA 1IJTA 3D5NA 1JT7A 4I4UA 4G6JA 1H7EA 1DJSB 4PC4A 2V0HA 3AH2A 2Y6PA 3I0EA 2FY7A 3ZC8A 3PKPA 3E8LC 3A22A 3FGMA 2ZU8A 4I1BA 4TLPA 2Y9GA 3CQAA 5E24E 1TW1A 2ICXA 2YC5A 4I4QA 2YESA 4B5BA 1NUNA 2HWMA 1TIEA 2VXTI 4OEEA 3R4UA 1V6XA 3BTAA 1JT3A 1G8OA 1HCDA 1NHEB 1FV3A 1R7TA 2WEEA 3R3IA 1BFBA 2YCMA 4D11C 5IFYA 5CQPA 1NQIB 1S4PA 3V0OA 4G3PA 2Z49A 4HR6C 4HO0A 1FV2A 1JTCA 1R8OA 2RSTA 3NJ5A 5FZYA 4Y64A 1LL3A 1S4NA 3OJMA 4IY9A 4I4RA 1JVDA 1BA7A 2RIXA 1H5RB 1FQ9A 3N0KA 1VGUA 1HJJA 1W57A 3RTIB 1F31A 3OH4A 3CAHA 2K43A 2BO6A 8I1BA 3N9WA 4KT7A 1G1LA 3W9TA 3AH4A 3V8ZA 3DJ4A 1W3GA 2MIBA 1W55A 2WRYA 1OQMB 1DQOA 2VXLA 3I0FA 3K8EA 4JQ0A 2CU2A 2FFUA 1Q1UA 5HPZA 3V0AA 3K8DA 1G0RA 3KIAA 4I6IA 4ZDQA 2RITA 5C4DA 4ZKTB 4Y63A 3AKHA 2ESUA 5C38A 1H5SD 3UD9A 1R8NA 5CQNX 5C1GA 4ECMA 2JCLA 3CA3A 3BX1C 2WE9A 1AF9A 4KNXA 3CKJA 4IRQA 1EZIA 2ZU9A 1O0RA 5DUYA 3HOMA 4P00A 1VGWA 3SXCA 2AFGA 3LW6A 1MP3A 2VFZA 2I5KA 4IZEA 5F90A 1SZ6B 2XWLA 1TVYA 3HBWA 2AAIB 3I0IX 2X5ZA 2ERMA 1R80A 4M28A 2X2SA 1NMMB 3USRA 5FV9A 2FYAA 1IOBA 3PUBA 5C8RA 4EB2B 2OI6A 2IWTB 4OW4A 1IT0A 1V82A 4QKSA 1YF8B 3QVBA 5EJZA 3O4CA 3UJ4A 2A8WA 3A07A 3O4OA 1VICA 3RMXA 1S0BA 1AXMA 3VWCA 3JUTA 4P0JA 4EEOA 2DREA 3FJCA 3WO4A 1JV1A 1BFGA 3SXAA 5BQUA 4I4VA 2KI4A 1TWEA 4LO7C 1ISYA 1OMZA 5F8WA 1WSZA 4G3SA 1S0EA 21BIA 1ZCYA 3OGZA 1DZCA 4X3AA 1DIWA 2FDBM 3AJ6A 4QD2C 4FROA 5CQOA 2MLLB 4Q9PA 4ZFYB 2I7BA 4I4PA 3O3PA 3OKRA 3BAVA 4I4YA 4GP0A 4HO4A 5FUHA 3DUVA 3MPPG 2I5EA 5C3DA 1FR8A 4HG6A 3AKIA 3O4DA 4G6MA 1M2TB 3JUKA 1EVTA 3AZWA 4ISQA 3R2WA 5BXTA 3U0YA 3Q4SA 1VCLA 1Z0HA 4DDZA 4FRLA 4EEEB 3BAGA 4C2SA 3BA7A 2UUSA 1DZDA 3V0AB 2BO8A 5BVPI 5C4CA 3NBDA 4CJCA 4XFTA 1LL2A 2V0IA 3VT2A 1KNMA 3R4SA 5C49A 1WVCA 2X65A 2NZ9A 1AVXB 3RTJB 1YP3A 2AECA 5BXCA 5EJ1A 3FJBA 3I29B 1M16A 2RJ8A 3S8JA 2VS4A 1WT0A 5BQUC 2W0VA 2QH5A 4FRDA 4B42A 2D22A 4GBPA 3SX8A 3A23A 2OI5A 3Q7WA 3ZGGA 1HWNB 5DVHA 5JLVA 4LO7B 1YYNA 1G3LA 1SR4A 1S0DA 1H7TA 1QG8A 2RIYA 2ZU7A 3N7LA 1ISVA 3OAMA 3AH1A 1JT4A 3OJVA 3JRRA 4QD2B 4AN6A 1V6UA 2FYCB 1AFCA 3BRFA 1HJLA 1VZUA 4XWIA 2FO1A 2P6WA 3B9UA 4M2BA 3SX7A 1BASA 3O5WB 4EVWA 4QO3A 2PA4A 2XWMA 1HWOB 2Z87A 3P6IA 1ON6A 4DECA 1R82A 3IOJA 1FN0A 5C1LA 1TW5A 4IZXA 1R7XA 1G9RA 2AGDA 3OC9A 4MYBA 4BQHA 3CA4A 3HMYA 4I8MA 1DLLA 3RMYA 5F8SA 1GQCA 1PZYB 4LO2A 4J18A 1PWAA 3ZGFA 3IIRA 4QBVA 2VLCA 1R81A 4Z9WB 4EFQA 1MC9A 4D11A 5L6SA 1ISXA 1ZJPA 3BRDA 2GGOA 1V6WA 1HM9A 1PZZA 2Q4JA 4JPZA 1BLDA 2KKIA 3FOQA 4HO8A 2D1ZA 1K4VA 2VS3A 4Y7UA 1SR4C 3QYDA 2ICYA 3RMWA 3DK5A 3HL3A 1WT1A 5AJNA 4EE5A 4I2SA 4OUJA 4FRQA 4L4IA 4IHZA 3I0DA 1WBAA 4LO3C 4F83A 1XG6A 3IAGC 3UDAA 2OEGA 2AQZA 5FYEA 3S8KA 1LZIA 3RMVA 1MP4A 2VU9A 2HZ9A 1INIA 4XFSA 1V6VA 1MP5A 4JD0A 4LW3A 2Y7AA 1H5TB 3OBRA 2LIEA 4CJMA 4HO9A 1TWMA 5F8YA 4GOYA 1ITBA 2KH2A 3H6RA 1ABRB 2ZQOA 4LO2C 3Q7XA 1G9DA 3NBNA 1Z90A 3BA5A 2JCJA 4X38A 2E4MA 2WVLA 2GZBA 3NBEA 1QGSA 2D44A 1XZ6A 2V0LA 3FUOA 2D43A 3I0GA 4B3UA 1AVWB 4JKXB 3CRHA 1RMLA 1ZJ1A 1I1BA 2BFHA 4KC1A 2LIQA 1GA8A 1EV2A 2KLLA 3FJ8A 1JLXA 3FJIA 3Q7YA 1FO8A 4HCQA 4YS8A 1H5SA 4IONA 1ZIZA 1IIMA 5FZZA 3IM7A 4EKXB 2D7RA 1ZJOA 1PUUB 3FJEA 2Z86A 3USQA 4FVVA 1II4A 1IINA 1FG5N 5CMIA 3H6QA 5D63A 2P72A 3WO3A 1R7UA 4I7IA 4L41C 3RSJA 2Y9WC 1H4DA 4I4SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FJFA 4G9MA 2D7IA 1Q04A 1FGAA 4Z8SB 3FJAA 2X2TA 4Q91A 5IDSA 1WT2A 5C4BA 2OEFA 2YQCA 5B2HA 3Q7UA 4KQLA 3AZVA 4UY4A 4CJ8A 1W77A 4MIXA 1LL0A 3CKQA 1XYFA 4Y6NA 1T9FA 4BMAA 1VH1A 4OWJA 2E4MC 3P6JA 1ZJ2A 2JCOA 3HN1A 1NWGB 4KC2A 5CMGX 1NF5B 2NTDA 1ON8A 5JQQA 4IY8A 4Y6UA 1W3AA 2WVKA 4JKQA 3C9ZA 1E0OA 4HO6A 1JYLA 1Z4SA 3FJJA 1H5SC 2FYDB 4NALA 4FRHA 3SXGA 3CU1B 3BRGC 1JVGA 1O7QA 3FUQA 2AESA 4DENA 2O1FA 4A7YA 1VM8A 1G93A 1ZCVA 2NP0A 2X60A 1BFCA 2NXVA 2K4AB 1HM0A 2RJ1A 3WMUA 4KEJA 4J23B 1DQGA 1TFMB 2DRYA 2RJ5A 1LZJA 1BARA 4I1EA 2BO4A 2XMEA 1HIBA 2DRZA 3PMEA 4OEGA 1YP2A 1Z2VA 1AVUA 2J3PA 4P6AA 1G9CA 3BCVA 5C3BA 4P02A 3SX3A 4J2SA 2AXMA 1PUMB 1XHBA 3H6RB 4KRVA 1FXOA 2QGIA 4KXOA 4XKIA 1IRPA 4ZFWB 1YP4A 1ZCTA 4MNDA 1K5VA 3BAHA 3FFZA 5BP5A 2NVHA 7I1BA 4EEGA 1S0GA 1P63A 4OWLA 3ILAA 3WMVA 4DE7A 2D24A 2V0JA 3I0HA 4EFPA 1R7VA 4ZLBB 2WVMA 3FJKA 1HV9A 3TC2A 1H5SB 3U2UA 4IQPA 9ILBA 4KNRA 4ENDA 4ASJA 2RJ0A 1ZCUA 4YOLA 1H5TA 3CGXA 5AJPA 1QQLA 1RG8A 4L4HA 5C4FA 1OQLB 3N7JA 1V84A 2YUGA 4FGFA 1Q03A 4FREA 1BLAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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