2FFVA

Human ppgalnact-2 complexed with manganese and udp
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
499
structure length
489
Chain Sequence
DALKVRWPDFNQEAYVGGPYARNKFNQVESDKLRMDRAIPDTRHDQCQRKQWRVDLPATSVVITFHNEARSALLRTVVSVLKKSPPHLIKEIILVDDYSNDPEDGALLGKIEKVRVLRNDRREGLMRSRVRGADAAQAKVLTFLDSHCECNEHWLEPLLERVAEDRTRVVSPIIDVINMDNFQYVGASADLKGGFDWNLVFKWDYMTPEQRRSRQGNPVAPIKTPMIAGGLFVMDKFYFEELGKYDMMMDVWGGENLEISFRVWQCGGSLEIIPCSRVGHVFRKQHPYTFPGGSGTVFARNTRRAAEVWMDEYKNFYYAAVPSARNVPYGNIQSRLELRKKLSCKPFKWYLENVYPELRVPDHQDIAFGALQQGTNCLDTLGHFADGVVGVYECHNGNQEWALTKEKSVKHMDLCLTVVDRAPGSLIKLQGCRENDSRQKWEQIEGNSKLRHVGSNLCLDSRTAKSGGLSVEVCGPALSQQWKFTLNLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Dynamic Association between the Catalytic and Lectin Domains of Human UDP-GalNAc:Polypeptide {alpha}-N-Acetylgalactosaminyltransferase-2
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2
total genus 158
structure length 489
sequence length 499
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.1.41: Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase.
pdb deposition date 2005-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00535 Glycos_transf_2 Glycosyl transferase family 2
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2ffvA02
3.90.550.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A 2ffvA01
2RJ4A 5C8RA 2RJ6A 3D8VA 1AFCA 1OMZA 5EHAA 1S0DA 4EFRA 3V0OA 5CMGX 1WBCA 1G9BA 4KXOA 3AH1A 41BIA 4XWIA 1W3AA 1E0OA 5C4EA 4EKXB 4KC2A 4M2BA 4B2WA 5AJNA 1GGPB 2XOAA 1V6VA 2D0JA 2ICXA 5FZZA 1RZOB 3Q7WA 5BP5C 1J0SA 5FV9A 1TWMA 1G8OA 3K8EA 5C1LA 4QC4A 3A23A 3CA1A 2VSIA 1WT1A 4FCUA 3I2AA 1WBAA 4LO2A 3E26A 5FYEA 2ZQOA 1LL0A 1XZ6A 1Z2VA 3SNVA 2E4MC 2BEAA 4FVVA 3O5WB 1DQOA 1YBIA 2WBCA 4IY8A 2X60A 1ZJ0A 3ZLKA 1ZI1A 2FFUA 4M28A 5C36A 1HWPB 5DDTA 5FNWA 4KBBA 1FWVA 1ZIZA 3WA1A 4AAWA 3IOHA 3A07A 1R8OA 2XMHA 3BRKX 5DDVA 4P0LA 3DJ4A 2Y4JA 2FDBM 5FTVA 2LIEA 3HOMA 1PZZA 3VUOA 2MLLB 3SX3A 1QWJA 2RJ0A 1RG8A 3I0CA 1GA8A 4JKQA 1EVTA 1K5VA 1JLXA 4G3SA 3VT1A 4HO6A 2GGOA 2WGZA 2YESA 4P02A 5DVHA 1E5KA 3P6IA 1KNMA 4B4MA 4IY9A 1EZIA 3BAGA 4J2KA 1HM8A 1R8NA 1ZJ1A 1R7XA 4XFSA 2RJ5A 3WMUA 2AM4A 4JISA 1H5SC 3TC2A 1INJA 2AESA 4EVWA 3SX7A 2WEEA 4GAFA 4HO5A 2VLCA 3BADA 3U0YA 4NAIA 5C3BA 5F8WA 2Q9XA 3RMXA 4D8HA 3R4SA 2IHOA 3V0AB 3OJ2A 4HO3A 5L6SA 2K4AB 3BRDA 1V6WA 3EE5A 4ISQA 1ISVA 4AYJA 1BA7A 4LO7C 1ZDFA 5C4DA 2YUGA 3AKFA 3AKHA 1D0HA 4XFTA 1QXMA 1FG5N 2RJ1A 4ZGRB 3AZVA 4BMAA 5C3AA 1BASA 4IZEA 31BIA 1R7TA 1G9DA 2AECA 4HO2A 4Y9XA 3RTJB 3F62B 2LIQA 1VZTA 1UPSA 2FYCB 3O3PA 4YS8A 4LO8B 1H5SB 1K5UA 3N7JA 2VXTI 5C48A 3E8LC 4DEPA 1TP0A 1HM0A 1INIA 1NMMB 1G9RA 1V83A 3TQDA 4KQLA 2Y4LA 3S8JA 4P6AA 6I1BA 1G9CA 1H5SD 1MP3A 1CE7B 4CJMA 1OQMB 4J2SA 3OGZA 3T7OA 1ZCUA 2D44A 4G6MA 4LO7B 4ASJA 1Z4SA 4A7KA 1EV2A 4B5BA 1VICA 2O1FA 2NZ9A 3PMEA 3BB2A 3VEQA 1FXJA 3AKIA 1YP3A 2Q4JA 3JUJA 2JCLA 1BFBA 3D7WB 4KNRA 2ICYA 3BX1C 3MPPG 5CQPA 1W55A 3HBWA 2M49A 1TTUA 1GQCA 2X65A 1NHEB 2Y7AA 3I0HA 3OKRA 3RMVA 4KC3A 2VD4A 4G3PA 3QVBA 1HWOB 1ITBA 1ISYA 4LO3C 3PUBA 4I0YA 3VT2A 3V79C 1HJJA 3I0DA 4AC3A 5C3DA 4ECMA 1EPWA 2QN4A 4ENDA 4EEOA 4A7YA 1AXMA 1LL2A 3LLPA 2X2TA 2RG9B 2DREA 4QKRA 4FREA 3EF2A 4KPZA 2HWAA 5BXRA 4R7PA 3BA7A 1YP4A 2X5ZA 1TWEA 3CA4A 1ZI4A 1TOOA 3CA6A 4EB2B 3P6JA 1Q1UA 2PGVA 3CGXA 4UEGA 4D48A 3KMVA 1AVAC 2FYDB 5IDTA 1YYNA 1PWAA 3CU1B 1DFQA 3BA5A 4B4GA 4HCQA 5C47A 1W3FA 5BQUA 3JUTA 3Q80A 4LW6A 4CJCA 3V0BA 1JYKA 4LO1C 4I1BA 2MZBA 2AAIB 4I4SA 3UD9A 2YQSA 2ZU8A 2YQJA 5GAQA 4Y64A 3C9ZA 3BTAA 1LZ7A 3CKVA 3CRIA 2A8WA 4QKSA 1HWMB 1OQLB 2Y9GA 3R4UA 4EFQA 4ZFUB 2VS4A 4Y7VA 3O4BA 2OI5A 4P0KA 4Z8SB 3U0XA 1BARA 4J2XA 4Y7UA 5J49A 3SPTA 3TZTA 4NAKA 1IHKA 2XWNA 1JT3A 2I5EA 5G00A 1YP2A 2NXVA 3QYDA 3BAVA 1G95A 3WO3A 3UJ4A 2AQZA 1I1EA 3RMYA 3O3QA 1JV3A 4C2SA 3FJ9A 5CQMX 2KH2A 2PA4A 1WT0A 4FRMA 3B9UA 4X39A 3T8SA 2ESUA 3FJDA 3PKPA 3CQAA 3D5NA 3S8KA 3RSJA 3O4CA 3FUOA 2KI6B 4Y6UA 3BAOA 1IRAX 2ERMA 3NBEA 2KLLA 3BCVA 3FFZA 3WO2A 1G9AA 2CU2A 4IYBA 2VXRA 1H7FA 1JYLA 3D98A 3E25A 4FRAA 4FRQA 1ZJPA 4GP3A 1GX4A 2L5XA 3FUQA 1Q03A 1N4KA 2J3PA 4KEKA 1FMMS 4OEEA 5IFYA 5CMFX 3SXBA 4D11C 1JTCA 1O7OA 3FJJA 3HSMA 2F2FA 1VCLA 1G3LA 4QO3A 1LZIA 3ZF8A 3N7MA 3VT0A 3BRFA 1GWWA 3A21A 4ZFYB 3CA3A 3PKQA 4HOCA 1FGAA 1ZJ3A 4PC4A 3FJBA 3IOIA 5C4BA 1SR4C 4G9NA 2RIXA 3H6QA 2HZ9A 1V6XA 3H6SE 1VM8A 2O1GA 4ZBVB 4GAIA 1BFFA 1K4VA 1S4NA 1EYLA 2VXMA 2V0LA 5DUYA 4KT7A 1H4CA 5D61A 1ISXA 3Q7XA 2QKXA 1IRPA 3CA5A 1II4A 3F1YA 1WD3A 3WINC 1H5RB 4KC4A 5FZUA 1HCEA 4D0TA 3SXEA 1R7UA 3VSZA 5HPZA 2UUSA 5BVPI 9ILBA 1QGSA 3WMVA 4USPA 5C1GA 1RMLA 2P39A 1JLYA 1PC8B 4XKIA 3IM5A 1DQGA 4G9MA 4X38A 2V0IA 3V0MA 1ZDGA 4FGFA 2DS0A 2VSAA 4OWKA 1O7QA 1MC9A 2Q3NB 2QGIA 5F90A 3FWWA 4I4OA 2BFHA 4I37A 2ZR1B 5EG6C 1WSZA 3V0NA 5C49A 2Z86A 2AM3A 3VWCA 2OI6A 3O4AA 4NANA 3OGFA 5BP5A 1S0CA 4FCEA 5DSSB 1H7LA 3AZWA 1QG8A 1S4OA 1W77A 4NALA 4H9WA 4B3UA 2Y4KA 4GBPA 4I4XA 2Z87A 2GZBA 1LZ0A 3POLA 3NGWA 2Y9FA 3U2XA 1IILA 4QD2C 1HM9A 4K6RA 1ZCTA 4JD0A 2E4MA 2I7BA 1VZXA 5CMHA 2HWMA 4OUJA 1ONKB 4LW3A 3K8DA 3O49A 1P63A 5EC5A 1V84A 1G2VA 3IOJA 1KWSA 3V0AA 2X5SA 4G3QA 1BFCA 1LL3A 3F1CA 1NZKA 1V82A 3KIAA 1ISWA 3AH2A 3ZGFA 1HV9A 1ZI5A 3SXAA 5EIYA 2FY7A 4CJ8A 5DZUA 4ZLBB 4P0JA 1DLLA 4H04A 2WE9A 1TVYA 2R9KB 1NQIB 3PNNA 1H7GA 1JT4A 5BXCA 2RITA 5E24E 1YROB 1IT0A 4OW4A 1NKHB 1G1LA 1T9FA 1O0RA 4M2AA 1V6UA 4QD2B 1H5SA 1MD6A 3ZC8A 1JV1A 1G0RA 1S0GA 3OBTA 2OEFA 3I29B 2NM1A 3I0JA 4DECA 4JRAA 5D62A 1ZHJA 4I96A 5I1FA 2NTDA 3I0EA 3ZGGA 4KNXA 4EEGA 2I5KA 1VZUA 2RIYA 2D22A 3I0KA 4GP0A 1H5TB 2YC3A 4QBCA 1AVXB 3V0LA 1BLAA 1YTOA 4I7IA 4R6UB 4AN6A 1MC3A 1GQ9A 3V8YA 5IDSA 2P23A 5F8YA 1FQ9A 3SXCA 3SXDA 5AJPA 2DRZA 2KKIA 3FJFA 3SX8A 2PGYA 3K1XA 3HL3A 2XWLA 1ZJ2A 1GWVA 5FUHA 1ZCVA 2ZU9A 1XZZA 3H6RA 4IZXA 3FJEA 1Z90A 1G93A 5C4FA 1Q04A 2MC2A 1L2HA 5JQQA 1MP4A 2IWTB 3CAHA 1DZDA 1FOAA 1VH3A 4HO8A 1JQZA 1YF8B 1H7HA 3I0GA 2OEGA 1R7VA 3OAMA 2QH5A 1TW1A 3DK5A 3QR5A 4BQHA 3HALA 2Z48A 4LO2C 1BLDA 1R80A 3LW6A 4M4KA 3V90A 4FRDA 3O4OA 1H7EA 2ET2A 2HW9A 1F31A 3IIRA 4G87A 4Q9PA 4I6IA 1FRWA 2Y6PA 4ZDQA 5L6VA 4I2SA 4Y7GA 3OGGA 1H7QA 2RJ7A 1FGGA 5CQLX 3UJ0A 1ABRB 2E3DA 1ON8A 4JP0A 3GUEA 3SX5A 1FV3A 3I0FA 1DIWA 4LO3A 1IINA 2Y4MA 3CU0A 2D24A 4ASYA 1FR9A 2VFZA 1QQLA 1W3GA 5C38A 4USOA 3CRGA 4I4RA 4JPZA 2FFVA 2Z49A 4YOLA 2DRYA 3NBNA 5CMJA 1H3MA 1NWGB 4KEJA 2XWMA 4IQPA 4DDZA 3BAUA 2BEBA 5F8SA 2WAWA 2XMEA 3CKJA 1YXWA 1ISZA 4ARWA 3JTJA 1SZ6B 3I2XA 4HJJA 2BO7A 4G1RA 2FGFA 1A8DA 4X37A 1FO9A 4FRBA 3LTQA 4I4QA 1LZJA 2BO6A 4OWJA 4LO1A 5JMCA 4HR6C 1NF5B 3U2VA 4DCKC 4QBVA 2GGQA 2F8XC 4J18A 3UDAA 4EFPA 3RMWA 1TFMB 1XYFA 3FJHA 2WVKA 3CKQA 2D43A 3N9WA 2D23A 1FN0A 3AKGA 3BAHA 3OH2A 1GX0A 4L4HA 2X2SA 1HJLA 3OC9A 1BFGA 1HKNA 1DJSB 3V0PA 3OH1A 1S0EA 1S0LA 3V8ZA 1Z0HA 4HO9A 5AJOA 2OI7A 5HS2A 2NP0A 3BRGC 3O44A 1AVWB 1S0BA 4ZOTA 4I1EA 1FR8A 5B2HA 3R3IA 4IRPA 1HCDA 4AYLA 1WT3A 3BAQA 4I3NA 5CMIA 3OH4A 4JKXB 2ZU7A 2VXLA 1SS9A 1IOBA 3AJ5A 4IHZA 2W0WA 3CKOA 1VGTA 5FTSA 4I4UA 1QGQA 1PUUB 2WRYA 5JLVA 3V0QA 4OWLA 3O4DA 3FOQA 4Y62A 1H4DA 3I0LA 2NVHA 2MIBA 3AH4A 4J23B 3FJ8A 3IM7A 2UX8A 3ZLLA 1WT2A 4TLPA 2P6WA 2WVMA 3RTIB 2VSEA 1ZCYA 3Q4SA 4KRVA 3W9TA 3ZXGA 2PX7A 2AXMA 2VSHA 3T7MA 4B4BA 3U2TA 4CVHA 1FXOA 4IONA 1LVWA 5FU0A 3I0IX 4Y7FA 4IRQA 4EE4A 1I1BA 2K8RA 4OEGA 1DZCA 4Y7TA 4ZKTB 3N7LA 4F83A 5CQOA 4D11A 2DPWA 1AVUA 1H5RA 1I52A 3OH3A 5EJ1A 3Q7YA 3A22A 1W57A 4AN7B 3CRHA 4KC1A 3FGMA 1S4PA 4Y63A 2YQHA 8I1BA 1FWUA 3FJIA 1SR4A 2A8UA 2AFGA 3ZXDA 2AM5A 3U2WA 4HG6A 2O1HA 2RJ9A 4L41C 4OEFA 2D7IA 3NBCA 1H4EA 2V0JA 2RQ9A 4HA2A 5FZYA 2JCOA 5D63A 2W0VA 4MNDA 3ST8A 4B42A 5BQUC 1IIMA 1WD4A 2AH9A 4EE3A 1HWNB 3U2UA 2ZQNA 2JCJA 1JT5A 1TZFA 4CJBA 3V91A 1ILR1 4WBCA 5BXPA 3OJVA 1G82A 3JRRA 4FQWA 2K43A 2KI4A 4EEMA 3VSFA 2D7RA 3UD8A 4Q9GA 4LO0C 1TW5A 2E8BA 3DUVA 4ZA3B 3WINA 1O23B 4JAWA 4D0ZA 3NJ5A 2BO8A 1RY7A 1VPAA 1MP5A 4XFUA 4DENA 1HIBA 4E1KA 5CQNX 1QQKA 1H7TA 4L4IA 5C4CA 4P00A 2VS5A 2P73A 4EEEB 4A7ZA 2FYAA 2VU9A 1FMZA 21BIA 5FNXA 1AF9A 1JY0A 1S0FA 3UD7A 2NYYA 1T4QA 4GOVA 4I4VA 7I1BA 2FO1A 1VH1A 4B2XA 4HO0A 1PZTA 5FU8A 1VGZA 4F34A 3V0BB 4Q91A 4II0A 3F1RA 3USQA 2YC5A 1R82A 4FRHA 3NBDA 2JCKA 1TIEA 3HN1A 1FWYA 1M16A 4KEIA 5I1BA 3N7KA 3OBRA 3H6RB 2D1ZA 3HMYA 1XG6A 4HO4A 4I4YA 2RJ8A 4I4PA 1FO8A 1FZWA 3ZC9A 1FGXA 3PG0A 4I8MA 3MALA 4Z9WB 5BXSA 1G97A 2D20A 1VGUA 3SXGA 3P53A 1DFCA 1OMXA 4KPXA 2AGDA 3USRA 1JT7A 3N0KA 2F2FC 2Y9XE 1VGWA 1ZI3A 4MYBA 2RSTA 3OJMA 3IAGC 2V0HA 3JUKA 3BA4A 1CVSA 2I1BA 1H5TA 4FRPA 1ON6A 3AJ6A 4X3AA 1G23A 1NUNA 4JQ0A 1ZJOA 4G6JA 2Y9WC 1JVDA 3ZX7A 4DE7A 1JVGA 4EE5A 2P72A 2VUAA 2QYIB 2BO4A 3ILAA 4LO0A 4Y6NA 4ISRA 1PUMB 3R2WA 3Q7UA 3OH0A 2YQCA 2VS3A 4GOYA 2YCMA 5BOWA 4FROA 4J2YA 3FJAA 3FJCA 5BXTA 1IJTA 1XHBA 4QALA 2GO2A 1WVCA 2AE7A 2WVLA 3CKNA 5C1HA 2V0KA 3RSBA 1FV2A 1R7YA 1M2TB 4ZFWB 3FJKA 4FRLA 4EEAA 3WO4A 1PZYB 1R81A 1EYRA 3T7NA 2FYBA 3POKA 3IM6A 2APCA 3PHZA 3CA0A 5EJZA 2RIZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RJ4A 5C8RA 2RJ6A 3D8VA 1AFCA 1OMZA 5EHAA 1S0DA 4EFRA 3V0OA 5CMGX 1WBCA 1G9BA 2C0NA 3AH1A 41BIA 4KXOA 4XWIA 1W3AA 1E0OA 5C4EA 4EKXB 4KC2A 4M2BA 4B2WA 5AJNA 1GGPB 2XOAA 1V6VA 2D0JA 2ICXA 5FZZA 1RZOB 3Q7WA 5BP5C 1J0SA 5FV9A 1TWMA 1G8OA 3K8EA 5C1LA 4QC4A 3A23A 3CA1A 5D91A 2VSIA 1WT1A 4FCUA 3I2AA 1WBAA 4LO2A 3E26A 5FYEA 2ZQOA 1LL0A 1XZ6A 1Z2VA 3SNVA 2E4MC 2BEAA 4FVVA 3O5WB 1DQOA 1YBIA 2WBCA 4IY8A 2X60A 1ZJ0A 3ZLKA 1ZI1A 2FFUA 4M28A 5C36A 1HWPB 5DDTA 5FNWA 4KBBA 1FWVA 1ZIZA 3WA1A 4AAWA 3IOHA 3A07A 1R8OA 2XMHA 3BRKX 5DDVA 4P0LA 3DJ4A 2Y4JA 2FDBM 5FTVA 2LIEA 3HOMA 1PZZA 3VUOA 2MLLB 3SX3A 1QWJA 2RJ0A 1RG8A 3I0CA 1GA8A 4JKQA 1EVTA 1K5VA 1JLXA 4G3SA 3VT1A 4HO6A 2GGOA 2WGZA 2YESA 4P02A 5DVHA 1E5KA 3P6IA 1KNMA 4B4MA 4IY9A 1EZIA 3BAGA 4J2KA 1HM8A 1R8NA 1ZJ1A 1R7XA 4XFSA 2RJ5A 3WMUA 2AM4A 4JISA 1H5SC 3TC2A 1INJA 2AESA 4EVWA 3SX7A 2WEEA 4GAFA 4HO5A 2VLCA 3BADA 3U0YA 4NAIA 5C3BA 5F8WA 2Q9XA 3RMXA 4D8HA 3R4SA 2IHOA 3V0AB 3OJ2A 4HO3A 5L6SA 2K4AB 3BRDA 1V6WA 3EE5A 4ISQA 1ISVA 4AYJA 1BA7A 4LO7C 1ZDFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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