4D0TA

Galnac-t2 crystal soaked with udp-galnac, ea2 peptide and manganese
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
KVRWPDFNQEAYVGGTMVRSGQDPYARNKFNQVESDKLRMDRAIPDTRHDQCQRKQWRVDLPATSVVITFHNEARSALLRTVVSVLKKSPPHLIKEIILVDDYSNDPEDGALLGKIEKVRVLRNDRREGLMRSRVRGADAAQAKVLTFLDSHCECNEHWLEPLLERVAEDRTRVVSPIIDVINMDNFQYVGASADLKGGFDWNLVFKWDYMTPEQRRSRQGNPVAPIKTPMIAGGLFVMDKFYFEELGKYDMMMDVWGGENLEISFRVWQCGGSLEIIPCSRVGHVFRKQHPYTFPGGSGTVFARNTRRAAEVWMDEYKNFYYAAVPSARNVPYGNIQSRLELRKKLSCKPFKWYLENVYPELRVPDHQDIAFGALQQGTNCLDTLGHFADGVVGVYECHNAGGNQEWALTKEKSVKHMDLCLTVVDRAPGSLIKLQGCREDDSRQKWEQIEGNSKLRHVGSNLCLDSRTAKSGGLSVEVCGPALSQQWKFTLNLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Substrate-Guided Front-Face Reaction Revealed by Combined Structural Snapshots and Metadynamics for the Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords POLYPEPTIDE N-ACETYLGALACTOSAMINYLTRANSFERASE 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 167
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.4.1.41: Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase.
pdb deposition date 2014-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00535 Glycos_transf_2 Glycosyl transferase family 2
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4d0tA02
3.90.550.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A 4d0tA01
2F2FC 2HZ9A 3FJFA 1H7QA 4P0KA 5C38A 2KI4A 3I0EA 1VPAA 5IDTA 4HO6A 3V0QA 2XWLA 4AC3A 3VSFA 4Z8SB 3Q4SA 3AZWA 1CE7B 1V6XA 1VCLA 4Y7VA 1S0FA 2I7BA 3I0DA 5I1FA 3SX5A 3R2WA 1RZOB 4XWIA 4FRHA 5JLVA 4EE5A 4AN6A 3SXEA 4GP3A 1LZ0A 4G1RA 2K4AB 4HO5A 3PNNA 3GUEA 5BQUA 3QR5A 1TTUA 4Y63A 2WEEA 2O1HA 3I0HA 1TWMA 4L41C 1DJSB 4LW3A 3ZC8A 5C3AA 3BADA 2DPWA 4M28A 1TIEA 5EHAA 4I96A 3V0AA 5DZUA 2WE9A 4ZFWB 2E4MC 3V0AB 3O4BA 2VSEA 4LO3A 4FRMA 4B5BA 4II0A 3UDAA 4EEAA 2AH9A 1ZCUA 4GBPA 1JVDA 2FY7A 2I5KA 5CMIA 2AGDA 5CQLX 1NUNA 4A7YA 4KC1A 3PKQA 2A8WA 1DZCA 4GP0A 4QD2B 1LL2A 4JAWA 5D61A 1K4VA 1II4A 4FROA 2F8XC 3ZLLA 2YUGA 1FQ9A 1TFMB 3T7NA 4CVHA 1H4CA 4EFQA 5CQPA 3D5NA 1JLXA 1G9RA 3FJAA 4FRAA 4F34A 4DE7A 4Y6NA 1J0SA 1EVTA 3PUBA 4B3UA 3R4SA 1INJA 1FN0A 2KH2A 1WD4A 4I7IA 4D0ZA 3BRFA 1FR9A 2QKXA 3T7MA 4JKQA 1H4DA 1YP3A 1VM8A 1ZI3A 3FJEA 4M2BA 1INIA 1G9BA 2ERMA 2OI5A 2P6WA 4UEGA 3CA0A 1HV9A 3JUKA 5CQOA 3FOQA 2RIZA 2UX8A 3R3IA 4DEPA 3PMEA 4QALA 3FJHA 1DZDA 6I1BA 1ON6A 1VH3A 2HWAA 4ZBVB 2XOAA 2PX7A 2VSHA 2GZBA 3V0LA 3ZGGA 2MC2A 8I1BA 2LIEA 4FRDA 4I4RA 2FFVA 4ZLBB 2Y4JA 4QBCA 2E8BA 4L4HA 4MNDA 1ITBA 3RSBA 4EFPA 5C4EA 4EEOA 4JPZA 2YQCA 1FRWA 1PWAA 1G1LA 1FO9A 4ISQA 3OJMA 3ZX7A 4ZGRB 1MP4A 2FFUA 2FO1A 2KKIA 1QQKA 3O4OA 4OEFA 3A22A 2BO6A 1S0GA 1HCDA 3D98A 2VS3A 1ZJ3A 2VS5A 1P63A 5C4DA 3BA5A 5C4BA 2YQJA 1NZKA 3CGXA 3BAVA 5FTSA 4D0TA 2V0IA 1YP2A 2YQHA 4C2SA 4OUJA 3WA1A 4CJCA 3IM5A 4IY9A 1VGZA 3WO2A 4ASJA 2AE7A 3KIAA 2VSAA 3CA1A 4E1KA 2X65A 3HALA 3MALA 1AF9A 1Q03A 3CA5A 3FJCA 5EG6C 4DCKC 1H4EA 1R8NA 2QH5A 4BQHA 5AJPA 3OH2A 2Y9XE 5CQMX 3I0GA 2VUAA 4LO2C 4QD2C 3F1RA 1SR4A 3F62B 5FU8A 1R7VA 4ZFYB 4ZA3B 1ZJOA 2RJ6A 2E4MA 4CJ8A 2D7IA 1T4QA 1RG8A 1XYFA 4ZDQA 3O3QA 2E3DA 1RMLA 4IY8A 3IOJA 4P0LA 4FGFA 4D48A 3BRGC 2X2TA 2FYAA 5CMHA 1IIMA 1DFQA 3F1YA 4G3QA 3ZF8A 3OGFA 4QO3A 1IINA 1UPSA 3CKVA 1CVSA 3OH0A 2Q3NB 2AAIB 2RQ9A 3ZXDA 1JYKA 1VICA 1ZIZA 4FRQA 4EE3A 5IFYA 4EEMA 1QXMA 5E24E 1G3LA 2O1GA 2L5XA 1Z90A 1ZI1A 3CKOA 5BXCA 3VSZA 5BXRA 2ZU9A 1EV2A 1JY0A 1K5VA 3AH1A 4I4XA 2AM3A 3ZLKA 1G95A 4QKSA 1R7UA 3A23A 3BAGA 1JTCA 1NF5B 4FRPA 2NXVA 1S0LA 2NTDA 1VZTA 2LIQA 2RJ4A 5C48A 2DREA 1O23B 5C49A 1ZCVA 4HO3A 3OC9A 4HG6A 4ZFUB 3N0KA 5C1HA 2VFZA 1ONKB 2P73A 5DDTA 1FGAA 3RTJB 1H7LA 4H9WA 2IWTB 2JCLA 3OH1A 3VEQA 3BAUA 3TC2A 1WT1A 2PA4A 2VD4A 5FNWA 2V0HA 3OAMA 4OWJA 1N4KA 1EYLA 3WMUA 2DRZA 3S8KA 2P72A 1TOOA 5F8WA 3D7WB 5BOWA 4X37A 3U2XA 1Z4SA 1KNMA 1GWVA 4Q9PA 3E25A 3BTAA 3POLA 1TWEA 3ST8A 5FZZA 2RJ0A 1ZHJA 4HO0A 1W57A 3ILAA 4XFUA 3I2XA 2I5EA 1ZI4A 3BRKX 2D43A 3CA3A 1ZJ2A 4J2XA 1WT2A 2VXTI 5HPZA 4X3AA 1QGQA 3N7KA 4Y9XA 1XZZA 5GAQA 1FXOA 2APCA 3SPTA 1WD3A 1IT0A 5G00A 1WT0A 4KC4A 1H7FA 1S0CA 5FYEA 4JP0A 1LZ7A 3FWWA 2AECA 3DUVA 3CRGA 4I6IA 3O4DA 1SR4C 1YTOA 2Z87A 2AXMA 3LLPA 5BXPA 1H5SD 1QWJA 5BP5A 2R9KB 3PHZA 4HA2A 1LZIA 1OQMB 3N9WA 4Y7GA 2RJ9A 3FJIA 3IIRA 3O5WB 1RY7A 1HCEA 2OI6A 3K8EA 3NGWA 4FRBA 4Z9WB 3U2WA 5L6SA 1LZJA 4PC4A 5FTVA 4OW4A 2Y4KA 2D1ZA 4EB2B 2WVMA 3V0OA 5JMCA 1HM0A 3LW6A 1JT5A 2NZ9A 31BIA 1PZZA 3FUQA 4LO2A 2JCOA 4P0JA 5D63A 4J2SA 1HWOB 2VU9A 4AN7B 3O4CA 1YYNA 1ZJ0A 3DJ4A 2ZR1B 3P6IA 1R81A 1VH1A 4KPXA 3VT2A 2FGFA 3OJVA 5CMFX 3CA4A 1IRAX 3NBNA 1FV2A 1BASA 1FMMS 2WRYA 2AFGA 1O0RA 4HO4A 1V6VA 3MPPG 3I0JA 3Q7YA 4NAKA 3FJKA 1OMZA 4HO8A 1SS9A 1XZ6A 5CMJA 2BO7A 3POKA 3I2AA 2BFHA 2D7RA 3R4UA 1MP5A 4FCUA 1FO8A 5CMGX 1JVGA 1HWPB 3UJ0A 3JUJA 1AVAC 4LO7C 1QQLA 3HBWA 4K6RA 3SXGA 1G97A 5C1GA 5EJ1A 3E8LC 4YS8A 3RMYA 5C3BA 4I4SA 3QYDA 1S0BA 3Q80A 1FV3A 1ZJPA 4HO9A 1JT4A 4FREA 3VUOA 1XHBA 1WBAA 3B9UA 2Y9WC 4OWLA 1FZWA 3P53A 4I0YA 4CJBA 4I1EA 3H6RA 3HL3A 3AZVA 3H6QA 2YC3A 5DSSB 3H6RB 3TZTA 3BA7A 1EPWA 1BA7A 3NBDA 3KMVA 4G6MA 1AVUA 3FFZA 4Q9GA 1PC8B 5D62A 3VWCA 4HO2A 5FZUA 4KNXA 4Y7FA 5IDSA 2Y4LA 3OJ2A 1FWVA 1E0OA 1H5RA 3W9TA 4GAFA 1H5RB 1K5UA 1JV1A 2BEAA 1IOBA 2Z48A 1E5KA 4HOCA 3FJ9A 5EIYA 3HMYA 3F1CA 5BP5C 3OH4A 4ZKTB 1W3AA 3HOMA 1T9FA 4JRAA 21BIA 3WMVA 3U2VA 1JV3A 2PGYA 1A8DA 3S8JA 5B2HA 1DIWA 1AXMA 2K8RA 2XWMA 3U2UA 4J2KA 3OGGA 1HWMB 1FGXA 1WSZA 1NQIB 5BXSA 2GGQA 3FJ8A 2WVLA 1MP3A 5DDVA 1ZI5A 3CAHA 5FU0A 4USOA 2BEBA 2KLLA 1MD6A 1TP0A 5F90A 1YF8B 1HJLA 1VZXA 1S0DA 4I4UA 2Y9GA 4EFRA 1FOAA 4M4KA 1ILR1 5EC5A 2BO8A 4G87A 3N7LA 1PZTA 3H6SE 3V8YA 4KC3A 1MC3A 1QGSA 4XKIA 3VT0A 1H7TA 4FVVA 4HJJA 1S4OA 2D22A 4YOLA 4B4GA 3N7JA 3ZC9A 4KPZA 3CU0A 2QN4A 5F8SA 1FWUA 1TZFA 4AYJA 4KEIA 2RJ1A 3BB2A 1Q04A 2ZQOA 3EF2A 3NBEA 1I52A 1G0RA 3OGZA 5FV9A 1JYLA 1ISVA 2X2SA 3PG0A 3HSMA 2XMEA 3U0XA 4EEGA 4G9MA 4EEEB 1ZDFA 4QKRA 4B4MA 1IHKA 3UD9A 1HKNA 1FXJA 5BVPI 2PGVA 3BCVA 4NAIA 4GAIA 1TW5A 2VXLA 1NMMB 3LTQA 4KEKA 1ZJ1A 2MIBA 4I4OA 3Q7UA 1BLDA 1TVYA 1DFCA 1PUMB 5FNXA 4B42A 2AESA 3CKJA 2P23A 1YP4A 1ISXA 2V0JA 4QBVA 1BFCA 3SXAA 3UD7A 2VSIA 3CA6A 4LO7B 3SXCA 3I0FA 2V0KA 2D44A 1YXWA 2BO4A 3AKIA 2XWNA 3FJBA 1JT3A 3USRA 1OMXA 2AM5A 4X38A 1H5SC 4HCQA 3O4AA 4IQPA 1ISWA 4QC4A 4LO1C 2XMHA 4JISA 4LO0A 3VT1A 3AKHA 3TQDA 5HS2A 2DRYA 4XFSA 2WVKA 1BARA 1DQOA 4I8MA 4Y62A 3OH3A 2RJ8A 1BLAA 1F31A 4BMAA 4KEJA 1G93A 3V0MA 1HWNB 1AFCA 3NJ5A 1Z2VA 3WO4A 1H7GA 3PKPA 4KBBA 3USQA 3OKRA 2I1BA 1HIBA 4L4IA 1VZUA 1L2HA 1ABRB 2D0JA 2HW9A 4NANA 4I4QA 1S0EA 3I0CA 1MC9A 4FRLA 1BFGA 5C4CA 1I1BA 3U0YA 4DECA 4ENDA 1YROB 4P00A 2YESA 1S4PA 1ZDGA 3FUOA 3HN1A 1GGPB 1I1EA 3JUTA 1PUUB 2RITA 3K8DA 4P02A 4WBCA 3RMVA 3SXDA 4F83A 4I1BA 3BX1C 2RG9B 4HR6C 3UD8A 1G9CA 3I0KA 3SX3A 4USPA 3I0LA 4Y7TA 4AAWA 4I3NA 1R7XA 1G82A 2J3PA 3IOIA 4D8HA 4EVWA 4JQ0A 1R7YA 5DVHA 1IRPA 2GO2A 1JT7A 2KI6B 4IHZA 2D20A 3T8SA 4G3SA 3SX8A 3FJDA 4I37A 1LL0A 3IOHA 3WINA 5C3DA 1BFBA 3UJ4A 3ZGFA 2O1FA 3QVBA 4LO8B 5I1BA 4ARWA 3IAGC 2ICYA 5L6VA 5FUHA 1VGUA 3V0BA 4R7PA 1Z0HA 1G2VA 3NBCA 1W3GA 2Q9XA 4I2SA 3V0BB 4D11C 2VXMA 3P6JA 2YQSA 3O49A 1NHEB 3V91A 4ASYA 5F8YA 1PZYB 3V8ZA 4I4VA 1KWSA 4DDZA 2GGOA 2X60A 2JCJA 2W0VA 1GQ9A 2FYCB 1IILA 4Y64A 2FYBA 3BRDA 4JKXB 2NM1A 4DENA 1R80A 2WAWA 1V6UA 5DUYA 1M16A 1SZ6B 1FGGA 1V83A 3CKQA 1HJJA 2V0LA 1G23A 2Z86A 1DLLA 1M2TB 1G8OA 1XG6A 4LO0C 1GA8A 3OBTA 3RMWA 3SNVA 4JD0A 3BAHA 2YCMA 3FGMA 4M2AA 3CKNA 3N7MA 4LW6A 3ZXGA 1H3MA 3O44A 4X39A 2OEGA 3FJJA 3CU1B 3EE5A 4NALA 3AKFA 1GX4A 3SXBA 4I4YA 1G9AA 1H5TA 3V0NA 2D24A 4OEGA 1H5SA 4EE4A 2X5SA 3C9ZA 4TLPA 1DQGA 1H5TB 1V82A 2NP0A 1H5SB 1W77A 4J2YA 3AH4A 4LO1A 1VGTA 5C8RA 4IRPA 3RMXA 2Y7AA 3JRRA 3Q7WA 1TW1A 1NKHB 3Q7XA 2AM4A 3T7OA 1W55A 2K43A 4IYBA 2ZU8A 4G9NA 2YC5A 4IRQA 3RTIB 4KC2A 5CQNX 4Q91A 1LVWA 3OBRA 5C47A 4Y6UA 2VXRA 1GWWA 3K1XA 3BA4A 3CRHA 5JQQA 3WO3A 3BAQA 4OEEA 2QGIA 2F2FA 1AVWB 1O7OA 3AH2A 4IZXA 1D0HA 2RSTA 3JTJA 1V6WA 3AKGA 3O3PA 4KT7A 1FMZA 5AJOA 3E26A 1BFFA 3WINC 2JCKA 2Y6PA 5BQUC 4ECMA 4IONA 2ZQNA 3CRIA 4ISRA 2NVHA 4KNRA 2NYYA 2ZU7A 3V0PA 4B4BA 5EJZA 3SX7A 1VGWA 3AJ5A 1GQCA 1HM8A 3I0IX 5C4FA 1R8OA 4LO3C 3V79C 4A7ZA 1FWYA 2A8UA 4IZEA 3CQAA 2QYIB 1H7HA 7I1BA 4A7KA 2W0WA 2IHOA 2RIXA 4J18A 4FCEA 4KRVA 3BAOA 2AQZA 2FDBM 1JLYA 3IM7A 4GOYA 4B2XA 2MZBA 5C36A 4B2WA 1H7EA 2WBCA 1ISYA 2UUSA 1R7TA 1OQLB 1WVCA 1FG5N 2CU2A 1G9DA 1R82A 2X5ZA 4FQWA 4D11A 4EKXB 4XFTA 2RJ7A 3V90A 1O7QA 2Z49A 4ZOTA 1JQZA 1NWGB 5FZYA 1EZIA 1FR8A 1YBIA 2WGZA 1EYRA 2Y4MA 1ZCTA 2ICXA 2MLLB 3U2TA 1WT3A 2D23A 2DS0A 2ESUA 3D8VA 4AYLA 5C1LA 3IM6A 1GX0A 1WBCA 2HWMA 4I4PA 2OEFA 1LL3A 2VS4A 4Y7UA 2P39A 4GOVA 1IJTA 2FYDB 1QG8A 4OWKA 4MYBA 1HM9A 4CJMA 2ET2A 3RSJA 2RJ5A 2RIYA 3A21A 4G3PA 3A07A 1ISZA 1Q1UA 5BXTA 3DK5A 4KXOA 3I29B 9ILBA 1ON8A 2Q4JA 2VLCA 4G6JA 5J49A 4H04A 2OI7A 4P6AA 3AJ6A 1AVXB 4KQLA 1W3FA 1ZCYA 4J23B 41BIA 1S4NA 5AJNA 2M49A 1V84A 2Y9FA 4R6UB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4ZOT A;  1JQZ A;  1NWG B;  5FZY A;  1EZI A;  1FR8 A;  1YBI A;  2WGZ A;  1EYR A;  2Y4M A;  1ZCT A;  2ICX A;  2MLL B;  3U2T A;  1WT3 A;  2D23 A;  2DS0 A;  2ESU A;  3D8V A;  4AYL A;  5C1L A;  3IM6 A;  1GX0 A;  1WBC A;  2HWM A;  4I4P A;  2OEF A;  1LL3 A;  2VS4 A;  4Y7U A;  2P39 A;  4GOV A;  1IJT A;  2FYD B;  1QG8 A;  4OWK A;  4MYB A;  1HM9 A;  4CJM A;  2ET2 A;  3RSJ A;  2RJ5 A;  2RIY A;  3A21 A;  4G3P A;  3A07 A;  1ISZ A;  1Q1U A;  5BXT A;  3DK5 A;  4KXO A;  3I29 B;  9ILB A;  1ON8 A;  2Q4J A;  2VLC A;  4G6J A;  5J49 A;  4H04 A;  2OI7 A;  4P6A A;  3AJ6 A;  1AVX B;  4KQL A;  1W3F A;  1ZCY A;  4J23 B;  41BI A;  1S4N A;  5AJN A;  2M49 A;  1V84 A;  2Y9F A;  4R6U B; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2F2F C;  2HZ9 A;  3FJF A;  1H7Q A;  4P0K A;  5C38 A;  2KI4 A;  3I0E A;  1VPA A;  5IDT A;  4HO6 A;  3V0Q A;  2XWL A;  4AC3 A;  3VSF A;  4Z8S B;  3Q4S A;  3AZW A;  1CE7 B;  1V6X A;  1VCL A;  4Y7V A;  1S0F A;  2I7B A;  3I0D A;  5I1F A;  3SX5 A;  3R2W A;  1RZO B;  4XWI A;  4FRH A;  5JLV A;  4EE5 A;  4AN6 A;  3SXE A;  4GP3 A;  1LZ0 A;  4G1R A;  2K4A B;  4HO5 A;  3PNN A;  3GUE A;  5BQU A;  3QR5 A;  1TTU A;  4Y63 A;  2WEE A;  2O1H A;  3I0H A;  1TWM A;  4L41 C;  1DJS B;  4LW3 A;  3ZC8 A;  5C3A A;  3BAD A;  2DPW A;  4M28 A;  1TIE A;  5EHA A;  4I96 A;  3V0A A;  5DZU A;  2WE9 A;  4ZFW B;  2E4M C;  3V0A B;  3O4B A;  2VSE A;  4LO3 A;  4MZH A;  4FRM A;  4II0 A;  4B5B A;  3UDA A;  4EEA A;  2AH9 A;  1ZCU A;  4GBP A;  1JVD A;  2FY7 A;  2I5K A;  5CMI A;  2AGD A;  5CQL X;  1NUN A;  4A7Y A;  4KC1 A;  3PKQ A;  2A8W A;  1DZC A;  4GP0 A;  4QD2 B;  1LL2 A;  4JAW A;  5D61 A;  1K4V A;  1II4 A;  4FRO A;  2F8X C;  3ZLL A;  2YUG A;  1FQ9 A;  1TFM B;  3T7N A;  4CVH A;  1H4C A;  4EFQ A;  5CQP A;  3D5N A;  1JLX A;  1G9R A; 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