The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
68
|
structure length |
68
|
Chain Sequence |
YHADPSLVSFLTGLGCPNCIEYFTSQGLQSIYHLQNLTIEDLGALKIPEQYRMTIWRGLQDLKQGHDY
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of a conserved C-terminal domain of p73 with structural homology to the SAM domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PROTEIN (SECOND SPLICE VARIANT P73)
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| molecule tags |
Gene regulation
|
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
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| structure length |
68
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| sequence length |
68
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1999-05-28 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1JI7 A; 1SV0 A; 5JRT A; 1RG6 A; 4IS7 A; 1V85 A; 2ES6 A; 2QB0 A; 3TAD C; 1WWV A; 2F44 A; 2DKZ A; 3TAC B; 2QKQ A; 2E8M A; 2QB1 A; 1SV0 C; 4PZN A; 2E8P A; 1X66 A; 3K1R B; 2K60 A; 4RQM A; 2KSO A; 5J8Y C; 5JTI A; 3SEN A; 3BS5 A; 2QAR B; 1OW5 A; 1PK3 A; 1PK1 A; 4NL9 A; 2DKX A; 2DL0 A; 3HIL A; 3KKA A; 2QB0 B; 1SXE A; 2FE9 A; 2GLE A; 3IDW A; 1SV4 A; 4NL9 C; 1LKY A; 1DXS A; 1LKY B; 5L1M A; 2F3N A; 2KSO B; 1SXD A; 1B4F A; 2KIV A; 2E8N A; 3BS5 B; 1COK A; 2KG5 A; 4MHV A; 1PK1 B; 2B6G A; 2LMR A; 2ESE A; 2F8K A; 4NJ8 A; 2EAM A; 1UCV A; 2EAP A; 2EAN A; 2KE7 A; 3TAD A; 1OXJ A; 1SGG A; 3KKA C; 2EAO A; 2JV3 A; 2LPE A; 3H8M A; 2D8C A; 5KNI A; 2YTU A; 1Z1V A; 5J8Y A; 2L5Y A; 3BQ7 A; 2K4P A; 4RQN A; 2Y9U A; 1UQV A; 2E8O A; 1F0M A; 2KMD A; 1X9X A; 4PZO A; 1KW4 A; 1WWU A; 5F3X B; 1X40 A; 3SEI A; 5JU5 A; 2Y9T A; 3BS7 A; 2QAR A; 1V38 A; 2D3D A; 1B0X A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3RJG A; 2PFN A; 4IRK A; 3IG5 A; 4CE6 A; 5J2J A; 2FLL A; 2ES6 A; 3N4M B; 4NM1 A; 3BZC A; 2BZF A; 2H3V A; 2DKZ A; 5EWF A; 2WF9 A; 1A6S A; 2G5I B; 2K8B B; 3PW2 A; 5DB7 A; 2E8P A; 1BPZ A; 3PVX A; 1TAU A; 1K1Q A; 2G06 A; 3M1Y A; 3KTQ A; 1WUD A; 4JWN A; 4Z6F A; 3ZI4 A; 4QNL A; 1TVA A; 2W43 A; 3QNM A; 4M47 A; 4US9 A; 4DOA A; 5HP4 A; 2R8G A; 5KFZ A; 3MFI A; 3V72 A; 8ICQ A; 3H0R B; 3BDP A; 3PO4 A; 1RQN A; 4F71 A; 2Z7J A; 2OH2 A; 1ZQI A; 4YN4 A; 2JH7 A; 2ZUC A; 1ZOL A; 1LKY A; 1LKY B; 5L1M A; 7ICS A; 2W8L A; 4F5R A; 1BPD A; 1QCK A; 5IIN A; 3WK4 A; 3SMV A; 5G5H A; 1Z00 B; 4DSF A; 4ZH4 A; 8ICT A; 4JV2 A; 1HEK A; 4UBC A; 1YZ7 A; 8ICB A; 4B9V A; 1PK1 B; 3H4B A; 2H3Z A; 2YX8 A; 2HBK A; 2LM1 A; 2OHF A; 2R8I A; 4KLQ A; 2KE7 A; 2XGQ A; 2UVU A; 2K8A A; 2YML A; 5ALF A; 4C0Z A; 4Z6C A; 4E0D A; 2EAO A; 1KN5 A; 2NRW A; 4DQP A; 3ED5 A; 3H0M B; 4DS4 A; 1ZQG A; 2KTQ A; 4UB8 U; 1ARO P; 4BUG A; 5CHG A; 5AI0 A; 4PJ0 U; 1F44 A; 2AGO A; 2HVI A; 2XY5 A; 1JI7 A; 5KT5 A; 5J0Y A; 2VIX A; 2ASL A; 3QUB A; 1SL0 A; 5AKL A; 1T4G A; 2WB1 F; 5DBB A; 1TK0 A; 4J9R A; 1N5X A; 2RLT A; 1DOQ A; 4M9J A; 2YMM A; 1MA7 A; 4UAW A; 4MEX A; 2GH1 A; 4QZG A; 2CPR A; 3VC8 A; 3RR8 A; 2AJQ A; 5AKI A; 2J6T A; 2VJ5 A; 2LKY A; 4KLI A; 3OPX A; 9ICB A; 3D6J A; 4DL4 A; 4MFC A; 5IIL A; 1SIJ A; 8ICA A; 5AKH A; 9ICP A; 4LVS A; 1WG8 A; 1A76 A; 4EBD A; 5KFK A; 1PVQ A; 5D4B A; 2LYA A; 2KZ3 A; 3T5K A; 3ETL A; 4Q8E A; 7ICJ A; 5DG8 A; 4QWD A; 3FC4 A; 4DQS A; 1B4F A; 4KLF A; 4UB4 A; 4QZ8 A; 5CA7 A; 2OM6 A; 1FFV A; 3ZDD A; 1L8O A; 4TUS A; 2ATL A; 3E58 A; 4KX3 A; 1SWW A; 1XC9 A; 4M6W A; 8ICY A; 3LDA A; 2W11 A; 1JIH A; 3J81 j; 1D9D A; 1XS9 D; 1MQ3 A; 3H8M A; 3RB4 A; 4KLL A; 5ALG A; 1L3V A; 5IIM A; 4C7Y A; 2K8C B; 4RQ7 A; 2KJ5 A; 4JB3 A; 3A0B U; 3H40 A; 4ELT A; 1BPB A; 4O3Q A; 3NVY A; 5HHI A; 3OSN A; 4F3O A; 1KW4 A; 1ZQP A; 3U26 A; 4RNO A; 1ZQK A; 2BCU A; 5DQH A; 1J2M A; 1KKX A; 2HMX A; 3UMG A; 2ZJ8 A; 2QB0 A; 3D2S A; 4UAS A; 4CF5 A; 5H2F U; 2HOI A; 2QKQ A; 4ED1 A; 4ECZ A; 4I28 A; 3C5G A; 3UMB A; 1NZB A; 5JTI A; 4MFA A; 2ZIU A; 3R9K A; 2F76 X; 2CXY A; 4M04 A; 2ZTE A; 3NAS A; 5ALV A; 4B9L A; 4F5O A; 1NI3 A; 1YZ6 A; 1B22 A; 3SV3 A; 2LYH A; 5L1K A; 2FMP A; 3C23 A; 4DOC A; 5L1J A; 5KAI U; 3RJF A; 2JMG A; 5AIA A; 3OGU A; 4BJQ A; 3AMZ A; 4Q8F A; 5III A; 2MAX A; 4R8U B; 2E1E A; 3WK6 A; 2I5H A; 2H3Q A; 1L7N A; 3F5E A; 4EX6 A; 5HML A; 3PMN A; 4LZD A; 8ICF A; 1MC8 A; 1MQ2 A; 3MGV A; 4DS5 A; 2FLN A; 3RBE A; 3RAQ A; 2HOF A; 2KV2 A; 5KFJ A; 8ICR A; 2NO5 A; 2K89 A; 2XGP A; 4FZN A; 3NRZ A; 4KLO A; 3OJS A; 1OXJ A; 4P0Q B; 4KLG A; 4YD2 A; 3GV5 B; 1JUD A; 3O0F A; 5KNI A; 2IA6 A; 1ZQH A; 4ED7 A; 2PFO A; 3DV9 A; 2KFZ A; 2KD1 A; 5DBA A; 5KT6 A; 1KFD A; 2AQ0 A; 5KT2 A; 5KFQ A; 2E1F A; 5KFP A; 1ZQE A; 2IOF A; 5KFH A; 3E2E A; 3C5F A; 5BOL A; 3QU7 A; 3CYM A; 4KLM A; 1ZD5 A; 2HHT A; 3QU2 A; 3MC1 A; 4F5Q A; 3WK8 A; 3QU4 A; 4ED3 A; 2AQ4 A; 5J2K A; 2KIW A; 1L8L A; 4U6P A; 5IIJ A; 1YT3 A; 1WCN A; 1Z4N A; 4PHA A; 5DB8 A; 1Q3U A; 5KFF A; 4PHP A; 7ICT A; 1COO A; 2VA3 A; 2PI5 A; 3DEE A; 3TI0 A; 1IG6 A; 1JXL A; 4XA5 A; 9ICO A; 4NXZ A; 2C2D A; 4ELV A; 4YVZ A; 2G09 A; 4YXJ A; 3KHH A; 2CRX A; 4RPY A; 3BQ1 A; 1PK3 A; 1NJZ A; 3RRH A; 1ZQX A; 3QU9 A; 4QIW F; 5EE9 A; 5AM4 A; 4DSI A; 4DLE A; 9ICS A; 4RQ0 A; 2XID A; 5J29 A; 3Q8S B; 4GLX A; 5AK6 A; 4PHE A; 2HBJ A; 3GIJ A; 1JX4 A; 1N60 A; 4C8L A; 4NV0 A; 4B9U A; 2WTF A; 4UB5 A; 2CN1 A; 3AM9 A; 4XQ8 A; 3C1Z A; 1FEZ A; 4M9G A; 1A77 A; 1UCV A; 2GO7 A; 4EYI B; 2NYV A; 2BKE A; 3HT3 A; 4PL1 A; 2ODG A; 3KKA C; 5FP0 A; 3HWT A; 3FM9 A; 4C8K A; 2PFQ A; 1X42 A; 4YCX A; 2F2A B; 3PW0 A; 1S0M A; 5ALU A; 3BQ7 A; 4Y2P A; 1Z19 A; 5G5G A; 5L9X A; 2A1J A; 4C8N A; 9ICF A; 3C1Y A; 3MGH A; 3RB6 A; 2MUT A; 2F77 X; 1U4B A; 8ICJ A; 4YR0 A; 4ECX A; 2KKP A; 5KFW A; 1ZQC A; 3RBD A; 5J2E A; 2D3D A; 4F93 B; 3GU3 A; 5GTH U; 1DRG A; 3TAD C; 2BQU A; 5EOZ A; 2JXJ A; 4KLD A; 9ICK A; 3HPO A; 1SZP A; 4ECU A; 2IMW P; 2QB1 A; 1SV0 C; 4YD1 A; 1ZRM A; 4QZ9 A; 4TUP A; 4ECV A; 4FBT A; 2KZM A; 4ICA A; 5AI8 A; 2YB1 A; 5KFS A; 1QSS A; 3WKE A; 2LHT A; 2KZZ A; 4FZM A; 4O0I A; 1SL1 A; 2B21 A; 4LJX A; 3V6J A; 1KBU A; 2V9W A; 3CNH A; 8ICU A; 4ECS A; 1N56 A; 3QEB Z; 4UQG A; 2DKX A; 3PO5 A; 1KLN A; 8ICL A; 1Z4O A; 4Y2U A; 2XY6 A; 3AU2 A; 3RJI A; 1S0V A; 1BGX T; 1CI4 A; 7ICV A; 4CF3 A; 2W7O A; 5ALZ A; 1EXN A; 5ALM A; 1JAL A; 2W9M A; 5KG7 A; 4G9B A; 3UXP A; 4I2J A; 1DXS A; 3NRW A; 1XSP A; 1SKW A; 4AYB C; 3AQF A; 2J6U A; 2E8N A; 2HW3 A; 1IV8 A; 1HUO A; 3D2Q A; 4ED8 A; 2BDU A; 4KIT B; 2BCQ A; 4RNM A; 4G3I A; 3ZDE A; 2EAN A; 7ICU A; 2PMZ C; 5ALE A; 5D46 A; 4DFJ A; 1UPH A; 1U47 A; 4GXI A; 4XRH A; 2KKV A; 2O6K A; 3V6K A; 4P0P A; 2YTU A; 4RQ8 A; 8ICG A; 3EPG A; 3Q8P B; 4QZD A; 2B0C A; 4P2H A; 2Q4T A; 2YN4 A; 3AU6 A; 4I2F A; 2ZXI A; 1BPE A; 3Q8K A; 5KT3 A; 1X9M A; 2ZIV B; 3RTV A; 2QLT A; 4R64 A; 2HDO A; 4Y2Q A; 1N2X A; 4UBB A; 3C29 A; 4YQW A; 4DL3 A; 3F2C A; 3H8J A; 2A19 A; 2K4I A; 2G0A A; 4DSJ A; 1U48 A; 2W8K A; 7ICG A; 4YFK A; 4O3P A; 2ZIX A; 4J9P A; 5DQI A; 4C4T A; 2OYY A; 4NL9 A; 2WAQ C; 3H8W A; 5J2I A; 3KKA A; 4BX9 C; 3RF9 A; 3OSP A; 4OJL A; 4ECY A; 5ALW A; 4KLH A; 3ZD8 A; 3C28 A; 4UAT A; 5ALJ A; 1NKE A; 1TE2 A; 1L7O A; 4I2I A; 3FDS A; 2H3F A; 3GV7 B; 1QQ7 A; 2F3N A; 1LVH A; 2HBL A; 4R66 A; 2W9B A; 4F8R A; 3ICX A; 5HR7 A; 3UQ2 A; 4WJ3 B; 3C2M A; 4DL7 A; 3LVV A; 3V7J A; 4P4M A; 2BPF A; 4F92 B; 2DGZ A; 4DSE A; 3GQC A; 3TAD A; 4ECR A; 4F50 A; 3SI8 A; 4QJF B; 3PML A; 4BGD A; 4J9S A; 1PZN A; 2OCE A; 1M6Y A; 1RZT A; 2VJ4 A; 1D8L A; 1GO3 F; 3SAG A; 3SYZ A; 1S5L U; 2W55 A; 4DFP A; 1CEZ A; 1JRO A; 2P35 A; 2BGW A; 3NUQ A; 1P7D A; 1BPX A; 4RUC A; 3T5L A; 2J6S A; 1L7M A; 1DGS A; 4RQ4 A; 1PUZ A; 4UAY A; 5AIB A; 3TAQ A; 1IXR A; 3IRU A; 1KL9 A; 2DWQ A; 3IG8 A; 4B9M A; 2ISO A; 2YQE A; 4BXO A; 2H3I A; 1UT5 A; 1J2N A; 3RB3 A; 4QW8 A; 2C28 A; 5ALN A; 4NLB A; 3BS5 A; 4EEL A; 3GIM A; 8ICS A; 1ZD2 P; 5CR0 A; 2R8J A; 4F5P A; 4RQ6 A; 3PSF A; 5EE3 A; 1T3Q A; 1KRP A; 4JV1 A; 1NK9 A; 5AKK A; 5DDM A; 5J0O A; 2HCF A; 4NLN A; 4EBE A; 5J2G A; 2DBY A; 4BWM A; 5CP2 A; 2YMP A; 1NKB A; 3SAH A; 1NK4 A; 4KLU A; 2IOH A; 9ICX A; 2WF5 A; 4CGZ A; 5J2A A; 5AKE A; 5CEH A; 4YP3 A; 3I28 A; 3KBB A; 1V9P A; 1ED1 A; 5KFM A; 5AK5 A; 5J2C A; 4KLE A; 2JGA A; 5KFN A; 2G5H B; 3F5A A; 5DLG A; 4JMU A; 4DCC A; 2AU0 A; 3MDC A; 3IP4 B; 4YMM A; 8ICZ A; 5F9N A; 3GZF A; 1TKD A; 4KMU A; 4IR9 A; 1XWL A; 3K75 D; 4DFM A; 4I2C A; 3NVW A; 5KFC A; 3WK7 A; 4NLZ A; 5C0Y A; 4NWI A; 5KFA A; 3AUO A; 4M6W B; 2RDJ A; 3L5K A; 4I2E A; 1N63 A; 2GWS A; 5DKW A; 4JV0 A; 1ZRN A; 3EUB 2; 3PST A; 4TQR A; 2W04 A; 5KFT A; 3JPO A; 1X9W A; 3E0F A; 4J9O A; 2FJ6 A; 1HJP A; 1UT8 A; 3Q8L A; 5ALT A; 3K1R B; 3ONN A; 2KSO A; 4M0A A; 4PHD A; 2W3S A; 2IHM A; 5ALO A; 2WF7 A; 3HKZ C; 9ICE A; 5DBC A; 5JUM A; 1VLB A; 1RYS A; 2QB0 B; 4RQ2 A; 2R8K A; 2Y1I A; 3TAR A; 1JN3 A; 2NO4 A; 2Y0S C; 8ICW A; 5EWE A; 2JEJ A; 2ZIU B; 2ASJ A; 3BZK A; 4GC6 A; 8ICX A; 7ICN A; 4JWM A; 4O3M A; 4I2D A; 3QZ7 A; 3LVW A; 5ALD A; 3PY8 A; 5K4L A; 3UQ0 A; 2JZB A; 2VKQ A; 1WYG A; 9ICJ A; 2KEY A; 4QZF A; 3PW4 A; 2ALZ A; 2G08 A; 1VJ5 A; 4BWJ A; 3CRX A; 7ICK A; 4I2B A; 2DFL A; 2JV3 A; 4PGQ A; 1NK8 A; 2Y1J A; 3BQT A; 3HP6 A; 3RR7 A; 5F9L A; 1RXW A; 3MR5 A; 3L4P A; 4RQN A; 2XO7 A; 5B66 U; 2E8O A; 7ICR A; 5J2F A; 1S0N A; 2HHV A; 5AK3 A; 4GC7 A; 1ZQV A; 4DQQ A; 2XY7 A; 1RQL A; 2XVT A; 2QAR A; 1F5S A; 5J0W A; 3UPQ A; 3RJJ A; 4I2A A; 1FFU A; 4RPZ A; 4RZR A; 2BCS A; 3T5H A; 2KOB A; 5KFE A; 4IS7 A; 4YMN A; 3PSP A; 1V85 A; 2RP5 A; 1S10 A; 4B9N A; 4DL6 A; 5DQG A; 4LZG A; 1QQ5 A; 5HMM A; 5AKG A; 1SKS A; 8ICE A; 3M8S A; 2K60 A; 4O3N A; 3HW8 A; 3QXG A; 5AM0 A; 4DL5 A; 3KFU F; 9ICM A; 2MU2 A; 2ZTC A; 3M6K A; 1S97 A; 3QX7 A; 3QEA Z; 4RU9 A; 4C8O A; 2HHX A; 4EBC A; 1C7Y A; 8ICC A; 1AQ6 A; 2AH5 A; 1BPY A; 3F2B A; 3PSI A; 1ZQL A; 7ICO A; 2BPG A; 3EPI A; 8ICV A; 2ZIW A; 4B6J A; 5AI6 A; 4FE3 A; 5ALS A; 2DQN B; 4J9N A; 2NRV A; 4KTQ A; 3ISC A; 2HBM A; 3M8R A; 3T3F A; 2PI4 A; 3CP8 A; 3AN1 A; 5EWG A; 3MDA A; 5KT4 A; 3TAP A; 1UA1 A; 1DK2 A; 2EAP A; 5CRX A; 4TUQ A; 2KNJ A; 1K5O A; 3WKA A; 3IM1 A; 3UM9 A; 4K4H A; 1SWV A; 3GIL A; 4O5E A; 2RDI A; 4TUR A; 4RT3 A; 2FI1 A; 5GTI U; 5ALQ A; 1D9F A; 4I29 A; 4RT2 A; 2C2E A; 1QTM A; 3SAF A; 4EEK A; 4DEZ A; 3GII A; 5L1I A; 3GV8 B; 4AP9 A; 1JXE A; 2KMD A; 4OJO A; 4QZE A; 5DB6 A; 4CRX A; 3N7S C; 2HVH A; 5ALY A; 3FYH A; 4PL2 A; 2HI0 A; 3C2K A; 1HUZ A; 1KTQ A; 2JHD A; 2I1Q A; 1PVR A; 1L3T A; 4QW9 A; 1IIP A; 1Q46 A; 3WKB A; 4MEY A; 3JPS A; 5IIK A; 1ZQR A; 7ICL A; 1BVS A; 5AHX A; 3WK5 A; 3JPT A; 4CDG A; 5KFV A; 4O3R A; 3CW2 C; 4J03 A; 2WFA A; 2WF6 A; 2HSZ A; 3ZDA A; 2A1J B; 2LM4 A; 3IV6 A; 4HYK A; 3MFH A; 2MUT B; 4Y2J A; 2RQ5 A; 5KG2 A; 4K4I A; 4I2H A; 4A8E A; 4PGY A; 5KG6 A; 1OW5 A; 4F2R A; 2FPL A; 2EZY A; 2EZX A; 4EZ9 A; 5KFR A; 4QZC A; 4GXK A; 1QH9 A; 2JR5 A; 1NJY A; 3QUC A; 3UXN A; 4Y2Y A; 3RJK A; 3RB0 A; 1SXE A; 9ICN A; 4CF4 A; 5AKJ A; 4CCH A; 4DO9 A; 5D49 A; 5J0P A; 1ZQM A; 1XSN A; 4IQU A; 3JPN A; 2V4R A; 1KFT A; 2E3T A; 5ALK A; 5HNK A; 2BDP A; 2ESE A; 4F4Z A; 1S0O A; 2KJ9 A; 1S76 D; 2A1A A; 4IQW A; 4Z6E A; 3MR3 A; 4KN4 A; 3RJE A; 2HHQ A; 2M0N A; 9ICU A; 4DF8 A; 4C4S A; 5AKZ A; 1IM4 A; 2MRL A; 4DOB A; 4F2S A; 1B43 A; 3C21 A; 3ZD9 A; 4RQ1 A; 3N97 B; 1ZQF A; 1UQV A; 3PX6 A; 4KX5 A; 5ALH A; 3DDH A; 5KFL A; 2K4E A; 5AM3 A; 3RH6 A; 1MSW D; 3N28 A; 4FZL A; 4UAU A; 4UAV A; 3QZ8 A; 3BQ2 A; 2ZJ5 A; 2IHN A; 3JPP A; 1L3S A; 3EYZ A; 5EE1 A; 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