The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
80
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structure length |
80
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Chain Sequence |
b'MAGDPMTFYNFIMGFQNDNTPFGILAEHVSEDKAFPRLEERHQVIRAYVMSNYTDHQLIETTNRAISLYMANLEHHHHHH'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Uncharacterized protein MW0776
|
| publication title |
NMR Solution Structure of Q7A1E8 protein from Staphylococcus aureus: Northeast Structural Genomics Consortium target: ZR215
rcsb |
| source organism |
Staphylococcus aureus
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| total genus |
21
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| structure length |
80
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| sequence length |
80
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-03-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF06855 | YozE_SAM_like | YozE SAM-like fold |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | YozE SAM-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2FJ6 A; 2KVS A; 2O6K A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2IOH A; 4BJQ A; 2EZZ A; 4YVZ A; 4EEY A; 2G5H B; 4MF8 A; 4OJO A; 4Q45 A; 8ICE A; 1UT5 A; 3N7R C; 2HDO A; 1RQN A; 4GXK A; 4DS4 A; 8ICY A; 3ZDA A; 3OTQ A; 2JRZ A; 1HIW A; 4UAV A; 3ONN A; 2WF8 A; 5C5J A; 1ZQK A; 2NRV A; 4QIW F; 3PSF A; 1L8O A; 4P4O A; 3V7J A; 1PVR A; 1OUQ A; 4Y2Q A; 5J0U A; 3LK9 A; 4PHE A; 3CNH A; 4ICA A; 1ZQA A; 1L8L A; 1ZQT A; 2YMP A; 3V7K A; 4FBT A; 3IV6 A; 3UPQ A; 5KFK A; 7ICE A; 1RQL A; 1DGS A; 4GFJ A; 3ISC A; 2WF6 A; 1UQV A; 3ORY A; 4UAT A; 2E1F A; 4KN4 A; 2BCR A; 5AKZ A; 2F3N A; 2KK0 A; 3GQC A; 2DPI A; 2AJQ A; 2LYA A; 2M0N A; 2C22 A; 2JR5 A; 2YMQ A; 1QTM A; 2KKP A; 1FIQ A; 2JEG A; 2AGO A; 3H8S A; 2HOF A; 4ELU A; 3EW9 A; 3ZI4 A; 2HVH A; 1S0V A; 3KKA C; 4J9Q A; 1ZD2 P; 2PMZ C; 5ALT A; 3M7D A; 1D8L A; 3PW5 A; 1BPD A; 2YQE A; 3QEA Z; 5KFW A; 3KHL A; 3B0Y A; 5C0Y A; 9ICM A; 3V6J A; 2KG5 A; 2ZIW B; 2HHQ A; 4M6W B; 4PZN A; 4ECX A; 5KG5 A; 3D2Q A; 4R8U A; 5AKX A; 5EWF A; 2W03 A; 3GU3 A; 5AI0 A; 1NNL A; 4R64 A; 5KFR A; 2OWO A; 4B9V A; 2FJ6 A; 1UCV A; 2LPE A; 3MR3 A; 2AGP A; 1PK1 A; 3O0F A; 4ELT A; 1JXE A; 3IHQ B; 4YXJ A; 2XCA A; 2C2D A; 3U26 A; 1D8B A; 2GWS A; 3HJE A; 2G5I B; 2BCU A; 4IR1 A; 2WAQ C; 3GIK A; 1ZQY A; 3A0B U; 5AM2 A; 5EE0 A; 2KOB A; 2J6U A; 3ZD9 A; 2PKE A; 2VAN A; 1MA7 A; 2LI6 A; 5J2F A; 1COK A; 1SV4 A; 4NLG A; 1OW5 A; 3NRZ A; 2KVC A; 4FO6 A; 2BQ3 A; 2DBY A; 2IOF A; 3OHA A; 4M9H A; 3H0M B; 3ISD A; 2PFP A; 4DL6 A; 1SGG A; 3M1Y A; 5J2E A; 8ICC A; 5KFM A; 4QWD A; 5AI6 A; 3G6X A; 4Q43 A; 2BPF A; 2Y9T A; 1NK4 A; 2NRT A; 4KLI A; 5AKG A; 2W9B A; 2M9N A; 4J9O A; 2KZ3 A; 3WK6 A; 4YP3 A; 5CWR A; 3UXP A; 2RDJ A; 5DDM A; 1RM6 C; 5BPC A; 2XY6 A; 2P6R A; 4CGZ A; 4OJL A; 5J0O A; 1T94 A; 5D46 A; 2ZJ8 A; 4M9G A; 2K8B B; 4K4G A; 3R9K A; 1PVQ A; 1U45 A; 3IP4 B; 2AGQ A; 4J9K A; 2J6T A; 2KIC A; 1KQQ A; 1ZQ1 C; 1MQ3 A; 3KKA A; 9ICI A; 4KX3 A; 8ICP A; 2MU2 A; 4UAW A; 5AKH A; 1N60 A; 1TAQ A; 4DSJ A; 3UMG A; 3PR5 B; 1X9M A; 4F93 B; 5K4L A; 4PGX A; 2G07 A; 5AM5 A; 3G6V A; 1Z1B A; 4RNN A; 2FMQ A; 3H7I A; 5DBC A; 3C1Z A; 4TQS A; 3RJH A; 1F44 A; 2K89 A; 3HT3 A; 3RR8 A; 4B6J A; 3H40 A; 3BZK A; 3I28 A; 4J9N A; 3KZX A; 2E8M A; 3BQT A; 4RQ8 A; 2ASJ A; 5ALP A; 2YX8 A; 4NLZ A; 3J81 j; 4Z6C A; 2BZF A; 1X6I A; 3JPO A; 4IQU A; 3GIM A; 4HYK A; 4YCX A; 7ICR A; 4BUG A; 2A1J B; 1C7Y A; 3RAQ A; 3CP8 A; 2GOL A; 3LVW A; 4M47 A; 3PNC A; 1LKY B; 4C4T A; 3IG5 A; 1S76 D; 5ALH A; 4DSK A; 5KFQ A; 1U48 A; 2W55 A; 4QWC A; 2HMX A; 4O9M A; 1NK0 A; 1TVA A; 2ZIU A; 4EEN A; 1TV9 A; 3RRG A; 8ICL A; 2ATL A; 4RU9 A; 5IIO A; 1ZQN A; 1IIP A; 2OXO A; 1TKD A; 2E3T A; 2G0A A; 1ZQV A; 1ZYQ A; 1ZQH A; 2IHM A; 5ALV A; 5AKE A; 2XGP A; 4YN4 A; 1JI7 A; 3A0H U; 1ZQX A; 3BJY A; 3C28 A; 4IRD A; 5ALK A; 1ZQG A; 5J2I A; 5J2J A; 1TK5 A; 2PFN A; 2ASL A; 4F2S A; 1L7P A; 3NS1 A; 2EAP A; 4NXZ A; 9ICP A; 2KSO A; 3M8R A; 1ZQC A; 4UAR A; 1AQ6 A; 2G06 A; 2BQU A; 4QWB A; 3H4B A; 3LWL A; 4MFC A; 2A19 A; 4PHA A; 4I28 A; 1SB3 C; 4ELV A; 2R18 A; 7ICF A; 3F5A A; 5KT6 A; 1KKX A; 1MSW D; 5ALS A; 4PL2 A; 1N5X A; 2CPR A; 2RLT A; 3HKZ F; 4OCZ A; 4F5N A; 1S97 A; 1XWL A; 4ED0 A; 1MQ2 A; 2NV3 A; 3PX6 A; 1QSS A; 2H3I A; 9ICT A; 4US9 A; 3AUO A; 3C2L A; 1MC8 A; 4YXM A; 1SL1 A; 5ALN A; 5EWG A; 4C7Z A; 1N63 A; 5KT2 A; 7ICT A; 3D6J A; 3OSP A; 4G9B A; 5KFO A; 2I5H A; 3QU5 A; 4ECZ A; 3PW4 A; 4RT3 A; 4RT2 A; 5J2D A; 4BDP A; 1XU4 A; 2HHT A; 3H8J A; 4RQ6 A; 4A8E A; 1BPX A; 2Q4T A; 4C8O A; 4ECY A; 2QB1 A; 2ISO A; 5E79 U; 2BGW A; 5KFN A; 3HP6 A; 2K4E A; 4YMM A; 5J0T A; 4DFK A; 4PZO A; 1Q3U A; 3SAG A; 4Z6D A; 4ECQ A; 2RRD A; 4UB4 A; 2W9C A; 4PGY A; 2JEI A; 4ED6 A; 5ALI A; 5ALR A; 8ICN A; 1SL2 A; 1TAM A; 2BDU A; 5AIA A; 4RQ2 A; 3NRW A; 1OXJ A; 2EDU A; 5A0L A; 5KNI A; 2ZIV A; 2G09 A; 5HR6 A; 3RJK A; 3RJJ A; 2ZUC A; 1Y88 A; 3RH5 A; 1WWU A; 4RQ7 A; 3HPO A; 1Z00 B; 2KIW A; 1NZP A; 3QU2 A; 2MUT A; 9ICL A; 3RJE A; 4B9S A; 2R8H A; 4M9N A; 2VJ4 A; 2ZUD A; 4QNL A; 4Y2J A; 3AL0 B; 1T3Q A; 2UVU A; 3M6Z A; 4NY8 A; 9ICC A; 3QUT A; 2KMD A; 2F8K A; 1ZQW A; 4X5V A; 4QZH A; 3PST A; 5HML A; 5KFF A; 5ALG A; 5KFJ A; 1ED1 A; 5AKK A; 4J03 A; 3AU2 A; 4RQ3 A; 3RAX A; 3RB0 A; 9ICF A; 1N62 A; 1S9F A; 1NKC A; 5BOM A; 4I2F A; 2N1R A; 4UAU A; 3ZD8 A; 4US8 A; 5AM4 A; 1ZQR A; 4KLD A; 4YR3 A; 1NK6 A; 3GV5 B; 4F91 B; 3UMC A; 3WKE A; 1NOM A; 3RB6 A; 3WK7 A; 3VCB A; 2DWQ A; 4KLE A; 8ICU A; 3WKA A; 2Q0Z X; 5J0S A; 4QZC A; 2WB1 F; 3GV7 B; 5HR7 A; 5KL1 B; 2AHO B; 3RB3 A; 3MFI A; 4B9U A; 5IIL A; 3WU2 U; 5J29 A; 3BS7 A; 2KIV A; 4BGD A; 2FMS A; 5L1K A; 3N7P D; 3N28 A; 1NKE A; 1NI3 A; 4FFD A; 4Q8E A; 1V85 A; 3TFS A; 4ED3 A; 4O0I A; 4QZG A; 2FI1 A; 3QNM A; 2B21 A; 2DF4 B; 2BCQ A; 3RJI A; 5KFT A; 5DBB A; 2HW3 A; 2NO4 A; 3T5L A; 2K60 A; 1TK0 A; 4MFF A; 3LWM A; 3CYM A; 1U47 A; 1J2M A; 3FDS A; 3GIJ A; 4F4K A; 3UXN A; 4P0P A; 5J8Y C; 1S0O A; 3EPI A; 5KG0 A; 4CF5 A; 1S0N A; 4C4S A; 1B22 A; 4RQM A; 1JMS A; 2ISP A; 3TAD C; 1SL0 A; 3BS5 B; 1ZQP A; 3TI0 A; 1KL9 A; 3ZDC A; 7ICG A; 3M9N B; 3RH4 A; 3V6K A; 2AQ4 A; 3HWT A; 1SZH A; 3JPT A; 3SYZ A; 1DXS A; 4ZH4 A; 4BXO A; 1SKW A; 4IL6 U; 4UAZ A; 2GO7 A; 4NWI A; 4FBU A; 4UB1 A; 4C4R A; 2ZIX A; 3E0F A; 1WYG A; 2YB1 A; 2IHN A; 3JPS A; 3FM9 A; 3OGU A; 4PH5 A; 5DKW A; 3QYP A; 5TZV A; 2CRX A; 1V9P A; 4UW9 A; 2WFA A; 3H8M A; 2C2R A; 1J97 A; 3G6Y A; 1CRX A; 2JHD A; 2ZTE A; 4ECT A; 9ICB A; 4KIT B; 3GDX A; 4O3S A; 4KLL A; 4UB2 A; 5KFE A; 1SXE A; 4J9L A; 2ZG6 A; 8ICA A; 3RF9 A; 1K1S A; 3UXO A; 1S10 A; 4GIB A; 4DL2 A; 1WUD A; 4F8R A; 5D4B A; 4UB3 A; 3JPR A; 7ICV A; 2B0C A; 5IIJ A; 3DDH A; 3QUB A; 2JV3 A; 1BPE A; 2QAR A; 5KG7 A; 3H0R B; 2W3R A; 4I2E A; 2K8C B; 3QX7 A; 1X42 A; 3M9O B; 1Z4O A; 3IG8 A; 5KFD A; 5J2B A; 1C20 A; 4NV0 A; 2DPJ A; 1DOQ A; 4R65 A; 4UBB A; 2BPC A; 3TAR A; 5TIS U; 2RP5 A; 2IA6 A; 4EEL A; 2PFQ A; 2GLE A; 4DF4 A; 1JN3 A; 1LV5 A; 1F0M A; 5H2F U; 1B43 A; 4K4I A; 8ICT A; 5J8Y A; 1FEZ A; 2VIX A; 4PGQ A; 1L7M A; 1BPZ A; 5AM1 A; 3SI8 A; 4Y2V A; 5DB8 A; 3WKD A; 1D9F A; 5L9X A; 3TAD A; 2HVI A; 3JPN A; 5HP4 A; 2C28 A; 5KT4 A; 4F5P A; 4KLS A; 3GIL A; 3NVW A; 9ICG A; 1JXL A; 3C1Y A; 4DFJ A; 3T5J A; 4DQR A; 4R8U B; 7ICM A; 7ICK A; 2JEF A; 5AI8 A; 2R8I A; 3C21 A; 4EYH B; 8ICO A; 2P35 A; 5KTQ A; 3WK9 A; 5B66 U; 4EBE A; 1T7P A; 1YZ7 A; 4F92 B; 5KFH A; 2JEJ A; 1B4F A; 9ICO A; 4EX7 A; 2F8L A; 7ICN A; 2WTF A; 3UM9 A; 3ZDD A; 2XY5 A; 1VDV A; 1PK1 B; 1JAL A; 2Y1I A; 4MEY A; 4O3N A; 1KTQ A; 1N56 A; 4TUQ A; 3WK8 A; 4UBC A; 4C8K A; 3PVX A; 9ICJ A; 5ALU A; 3F53 A; 1UA1 A; 2EZY A; 2HSZ A; 2WB1 C; 4TQR A; 2I9G A; 8ICS A; 4I29 A; 2Y0S C; 2WF9 A; 1ZXI A; 1SV0 C; 2K8A A; 4YR2 A; 5KFZ A; 3M8S A; 1KW4 A; 2KKV A; 1NJZ A; 4QWE A; 5DG7 A; 3C5F A; 4TUR A; 4UB5 A; 4NJ8 A; 3TKA A; 3C29 A; 5AM0 A; 8ICV A; 1PVP A; 4KLU A; 1XO0 A; 4GC6 A; 2KJ5 A; 4J9R A; 3ICX A; 3QEB Z; 2Z7J A; 4CF3 A; 2LYB A; 4JUZ A; 3GII A; 4GC7 A; 8ICM A; 3RB4 A; 2E1E A; 9ICA A; 3PV8 A; 2KD1 A; 2MAX A; 3MBY A; 1EXN A; 7ICQ A; 2K4P A; 4EZ9 A; 1WCL A; 2BQR A; 5J2K A; 4DCC A; 4AYB F; 8ICW A; 2LMR A; 3NVY A; 2HHV A; 4HAI A; 5HMM A; 2XC9 A; 4XA5 A; 4PJ0 U; 2FLN A; 1N5W A; 4DL5 A; 2QLT A; 1NK9 A; 1BNP A; 1QSY A; 3QU9 A; 5DQG A; 2W9M A; 3RJG A; 5IIN A; 3NVZ A; 2CN1 A; 2NRZ A; 4UB8 U; 3T3F A; 7ICU A; 4DSF A; 3KTQ A; 4QZD A; 3PZP A; 4XRH A; 5CA7 A; 4QZB A; 2LM1 A; 5KFP A; 3WK4 A; 4OJP A; 4F2R A; 2OYY A; 2RQ5 A; 3V7L A; 5ALM A; 4RNO A; 4C0Z A; 2JMG A; 1ZET A; 1YT3 A; 4MFA A; 4FE3 A; 1ZD3 A; 4DSL A; 3AQF A; 3LDA A; 4ECU A; 2QB0 A; 2BDP A; 3H0L B; 1PUZ A; 4F71 A; 2E5S A; 4QIW C; 1Z19 A; 4Q8F A; 1ZD5 A; 3KFU F; 5EE1 A; 1FO4 A; 1Z4N A; 2XGQ A; 4JV0 A; 2BCS A; 4DL4 A; 2AU0 A; 4I2C A; 5AK3 A; 1RPL A; 2F44 A; 4PHP A; 1SIJ A; 4ED7 A; 2VKQ A; 1SV0 A; 2KV2 A; 3MC1 A; 3SMV A; 4DFD A; 3IRU A; 2H3Q A; 4KLJ A; 4E0D A; 5DQI A; 4AP9 A; 4DOC A; 2KEY A; 4I2B A; 1CEZ A; 8ICZ A; 2MRL A; 7ICJ A; 4DS5 A; 3ETR A; 2CXY A; 2NYV A; 1S5L U; 2C2E A; 3DEE A; 4XQ8 A; 3QE9 Y; 3UQ2 A; 4P0Q A; 1ARO P; 4OD0 A; 5AM3 A; 3EUB 2; 4GLX A; 2HBK A; 5CB1 A; 3F2C A; 3PML A; 2WF7 A; 5AK6 A; 1Q46 A; 3MGV A; 5KFV A; 1ZRM A; 4Y2R A; 2W43 A; 1J2N A; 5DG8 A; 1BPY A; 2KSO B; 2FDR A; 3C23 A; 4RQ0 A; 4O3R A; 4IRK A; 2Y9U A; 5KFS A; 3MAB A; 4FZL A; 3JPP A; 4GXI A; 2RHF A; 5KG2 A; 4OJ6 A; 5J0Q A; 2FPK A; 4J9P A; 2DQN B; 4QZA A; 4I2J A; 5L1M A; 4I2H A; 4CNQ A; 3E58 A; 4ECR A; 3B9J A; 3NAS A; 3S6J A; 4YQW A; 3IDW A; 5CHG A; 1NK7 A; 3QXG A; 2A1A A; 4YMN A; 5AI4 A; 1T3N A; 4P4P A; 2JZB A; 1VJ5 A; 4O5C A; 2OM6 A; 3MDA A; 2HCF A; 3D2S A; 1SKS A; 4F3O A; 3H4D A; 1ZQE A; 2YML A; 3N7S C; 3Q8R B; 1TK8 A; 5EE3 A; 1NJX A; 5AKL A; 4DL3 A; 4B9M A; 4C8N A; 3MR5 A; 4RQN A; 5CR0 A; 5J0X A; 5DGB A; 3MFH A; 2LKY A; 1XSP A; 9ICU A; 4EBD A; 4EBC A; 3DV9 A; 3PX4 A; 2O6K A; 1U4B A; 3F5E A; 3FYH A; 2FLP A; 2DKX A; 3BZC A; 4ZOH C; 2JXJ A; 2W54 A; 3AQE A; 1ZQQ A; 1URJ A; 1X40 A; 1Q8K A; 3PO5 A; 2ZIV B; 1SKR A; 3LYS A; 3TAQ A; 3KD3 A; 1O03 A; 2KFZ A; 2EAM A; 3QZ7 A; 2KZM A; 4DOA A; 4KLT A; 1CI4 A; 2UVW A; 3D2N A; 2MUT B; 3RJF A; 2OEH A; 1UHU A; 2HOQ A; 2FE9 A; 3V6H A; 3AM9 A; 2OH2 A; 5DBA A; 3ED5 A; 2YY6 A; 1KSP A; 2BKE A; 4KMU A; 4QW9 A; 4I2G A; 2A3V A; 4IC9 A; 5BOL A; 5KT7 A; 2KNJ A; 1Z00 A; 1NK8 A; 3L4P A; 1ZQM A; 3RFA A; 3UMB A; 4MEX A; 1GO3 F; 4ED1 A; 2PMZ F; 1WG8 A; 3QU4 A; 2KVS A; 4M0A A; 4R63 A; 4DSI A; 4IQW A; 1KDH A; 3KHH A; 2NO5 A; 4ED8 A; 3SQI A; 3Q8L A; 5AKY A; 4KLM A; 3CRX A; 3RR7 A; 1WWV A; 4O3O A; 3SV4 A; 5J2H A; 1X9X A; 1X66 A; 1L3V A; 1DRG A; 3TAP A; 4O3M A; 2RDI A; 5J0Y A; 1TE2 A; 2KZZ A; 1ZD4 A; 1NJW A; 2W7P A; 2R8K A; 2HBL A; 4Z6F A; 4M04 A; 2WAQ F; 2KFN A; 5KAI U; 4NL9 C; 4NLK A; 5HHI A; 1A6S A; 5ALQ A; 3IM1 A; 4OJ5 A; 1COO A; 3AMZ A; 1X9W A; 2PFO A; 3AEV A; 1A0P A; 5JTI A; 4P0P B; 1DK2 A; 1KBU A; 5J2G A; 4G3I A; 5AHX A; 2EAN A; 3PY8 A; 3BQ7 A; 5J2C A; 4NM2 A; 4F4W A; 4WJ3 B; 2H3F A; 4F4Y A; 4IQT A; 5KFG A; 4DL7 A; 8ICI A; 8ICQ A; 4IR9 A; 2EQY A; 4F5R A; 4F50 A; 2F76 X; 4BXO B; 1ZQB A; 1RG6 A; 3BQ2 A; 3F2B A; 4F72 A; 4CDG A; 5F9L A; 3SEI A; 1NZB A; 3BQ1 A; 4U7C A; 9ICR A; 4QWA A; 2ZIX B; 3BS5 A; 2ES6 A; 3HKZ C; 3HRD D; 4IQV A; 3ZDB A; 4YG2 A; 1K1Q A; 5AK4 A; 1QQ7 A; 2YMM A; 1PK3 A; 3KHR A; 3SAH A; 4NLN A; 3E2E A; 1N48 A; 3WKC A; 2K4I A; 5ALJ A; 3EYZ A; 1L7N A; 3JPQ A; 2LHT A; 4DQI A; 4KN7 A; 9ICH A; 4QJF B; 3PMN A; 2AQ0 A; 1Q3V A; 2YB4 A; 4Q44 A; 5AIB A; 2VA3 A; 4QZ8 A; 1L3T A; 1RZT A; 8ICJ A; 5AKI A; 5G5H A; 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