The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
80
|
structure length |
80
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Chain Sequence |
MAGDPMTFYNFIMGFQNDNTPFGILAEHVSEDKAFPRLEERHQVIRAYVMSNYTDHQLIETTNRAISLYMANLEHHHHHH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Uncharacterized protein MW0776
|
| publication title |
NMR Solution Structure of Q7A1E8 protein from Staphylococcus aureus: Northeast Structural Genomics Consortium target: ZR215
rcsb |
| source organism |
Staphylococcus aureus
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| total genus |
21
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| structure length |
80
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| sequence length |
80
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-03-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF06855 | YozE_SAM_like | YozE SAM-like fold |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | YozE SAM-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KVS A; 2O6K A; 2FJ6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5KL8 B; 4FBT A; 2AQ0 A; 3MAB A; 1LB2 B; 2IMW P; 5AK4 A; 3VC8 A; 3OJU A; 2HVI A; 5EE9 A; 3OJS A; 2NRZ A; 1X9X A; 3M6K A; 2KK0 A; 4KLO A; 4P0Q A; 4JB3 A; 4Y2P A; 4AYB F; 2F8L A; 4DLE A; 5AIB A; 3UQ2 A; 1BNO A; 1MN8 A; 2M9N A; 1NI3 A; 1T7P A; 1WG8 A; 3WK4 A; 3WKD A; 5KFC A; 5J0O A; 2JV3 A; 2E3T A; 2H3Z A; 3C2M A; 2K4E A; 5B5E U; 5AKX A; 3V7J A; 1D9D A; 5ALJ A; 5FP0 A; 3BZK A; 4UB3 A; 4F92 B; 5KT7 A; 4NLG A; 2KZZ A; 2KG5 A; 4YFK A; 3ETR A; 3TQ1 A; 4RNM A; 4DO9 A; 1Y88 A; 4I2F A; 7ICP A; 2FPM A; 3PZP A; 1SWW A; 4DSF A; 5KFN A; 3SYZ A; 2W8L A; 3N97 B; 2HHS A; 4RQN A; 8ICP A; 5E79 U; 5C5J A; 1ZQW A; 5KFI A; 1N2X A; 3C1Y A; 4DFK A; 2I1Q A; 4EEY A; 3JPQ A; 8ICB A; 4J9S A; 5JU5 A; 1Z00 A; 9ICM A; 3TAD C; 1RXV A; 4DFM A; 2EZX A; 1OUQ A; 4J9N A; 4KLH A; 2CXY A; 3H0R B; 2ASD A; 4I2G A; 2ZIX B; 4P4O A; 5D4B A; 4IS7 A; 4LZG A; 4PZN A; 4YP3 A; 4QWE A; 2KZ3 A; 5C0Y A; 4B9U A; 4NLN A; 1CUK A; 4RZR A; 1JX4 A; 2DPJ A; 5ALS A; 2BDP A; 4EZ9 A; 5AM1 A; 5J2B A; 4PGQ A; 4CE6 A; 1TAM A; 2BQ3 A; 4KLF A; 2W7P A; 4B9N A; 3NUQ A; 2ISO A; 4C4S A; 4RQ2 A; 2ZJ5 A; 2G09 A; 1LV5 A; 5KFM A; 3QX7 A; 5DG9 A; 1PK1 B; 4R8U B; 5IIM A; 5ALW A; 2B0C A; 5EE0 A; 3EZ5 A; 5J2H A; 5DB6 A; 1FO4 A; 1ZQR A; 2A1J B; 4EX6 A; 8ICK A; 3M1Y A; 1X6I A; 4Y2T A; 2KJ5 A; 3KHR A; 3RAQ A; 5EWF A; 4FO6 A; 4RQM A; 3L5K A; 2AQ4 A; 1ZQM A; 2FMS A; 2R8I A; 3LDA A; 4US9 A; 4DF4 A; 3SAF A; 2VAN A; 2E8N A; 5KFZ A; 4O5K A; 4J9M A; 1JIH A; 3RJH A; 5DB7 A; 7ICH A; 3WU2 U; 1A0P A; 2W3S A; 3KKA A; 4GC6 A; 2BHN A; 1RQN A; 2ODG A; 2BQR A; 5IIL A; 1NZP A; 4F4W A; 4Y2R A; 2VJ4 A; 4B9M A; 2JGA A; 5J2A A; 3QZ7 A; 8ICG A; 4NM1 A; 2F2A B; 4O3O A; 2UVR A; 1XWL A; 3EUB 2; 4YMN A; 4RQ1 A; 3QUT A; 2K60 A; 1KSP A; 1SWV A; 4FZL A; 4DFJ A; 4NLZ A; 4O3R A; 3JPS A; 1JRP A; 1ZJN A; 3SR6 A; 4OJP A; 3HT3 A; 4Z6C A; 3MDC A; 1ZD5 A; 4DQQ A; 4F3O A; 1SKW A; 1HEK A; 4EBC A; 2DQN B; 5ALO A; 5CB1 A; 5KG4 A; 5AKJ A; 3PX4 A; 1TK8 A; 4DS5 A; 3F2C A; 4PL1 A; 9ICX A; 1LKY A; 1JXE A; 1RDF A; 2NRW A; 2H3V A; 3RRG A; 2JEI A; 1TFR A; 1ZQ1 C; 5CR0 A; 5CEH A; 4TUP A; 2E1E A; 4J9O A; 2H3I A; 3HWT A; 2V4R A; 5AI8 A; 1ZQL A; 4Q8E A; 2LI6 A; 1RYR A; 1FFV A; 5KG0 A; 4FFD A; 4QWB A; 3UMC A; 8ICY A; 2NO4 A; 9ICQ A; 3H8W A; 4R65 A; 3SD7 A; 5AM0 A; 3WKA A; 3NGD A; 5HNK A; 1F0M A; 2EZY A; 1ZQZ A; 4HAI A; 3FAH A; 2M0N A; 1AQ6 A; 1M6Y A; 2MRL A; 2BCV A; 4R63 A; 1L3V A; 1N48 A; 7ICR A; 1NK4 A; 1DGJ A; 4YN4 A; 2FPL A; 4F8R A; 1ZET A; 2KP7 A; 3ZDC A; 4J9P A; 2YX8 A; 3GU3 A; 1BNP A; 1S9F A; 2VA8 A; 4QZH A; 5KFO A; 2IOF K; 2WF8 A; 5D49 A; 4M6W A; 3WK5 A; 5DDM A; 3T3F A; 4EZ6 A; 8ICV A; 1KFD A; 8ICS A; 1ZQS A; 2VIX A; 1MSW D; 7ICN A; 1NJW A; 3A0B U; 4DCC A; 1QQ6 A; 3IP4 B; 5JTI A; 1ZRN A; 2GLE A; 3FM9 A; 5B66 U; 2BKE A; 4UAU A; 1NK0 A; 5KFG A; 4UAT A; 1X9S A; 2PFQ A; 4I27 A; 3ZI4 A; 2ISP A; 2WHE A; 1PZN A; 2Q4T A; 2ZXI A; 4RPY A; 4ECU A; 1VLB A; 4OCZ A; 2BCS A; 4PZO A; 2ASL A; 2W11 A; 3K1Z A; 2I6X A; 2KHQ A; 5KG2 A; 2K8B B; 4QJF B; 4ACO A; 4R66 A; 3QEA Z; 2AGO A; 4Y2X A; 7ICL A; 5ALN A; 2YQE A; 2AHO B; 1IIP A; 3Q8K A; 1PVP A; 3PML A; 2K4P A; 3TAC B; 3R9K A; 2KJ9 A; 4GXJ A; 2KE7 A; 3E58 A; 2R18 A; 3GZF A; 1XSP A; 2F76 X; 1Q46 A; 5EWE A; 3LVW A; 1UA0 A; 4JMU A; 5L1I A; 4ECZ A; 3HKZ C; 1UCV A; 4QW9 A; 5KFV A; 4DLG A; 3M9O B; 3RB3 A; 5AK3 A; 4O3S A; 5ALK A; 4BWJ A; 2ES6 A; 4PHE A; 2XY7 A; 2PI4 A; 1LKY B; 2RDI A; 4PHP A; 4DFP A; 5F9N A; 4YG2 A; 1PK3 A; 9ICU A; 3EYZ A; 3F2D A; 1IXR A; 4UB4 A; 1N56 A; 5L1M A; 3NVW A; 3U26 A; 4B6J A; 3PX6 A; 5D46 A; 1WYG A; 3CNH A; 1QH9 A; 4I2C A; 5KFL A; 4IL6 U; 2JEG A; 1CI4 A; 5AKG A; 4YMO A; 3EPG A; 2KSO B; 1ARO P; 1JXL A; 2WFA A; 4FZM A; 2NRV A; 5J0W A; 3QU5 A; 8ICE A; 4IRD A; 8ICI A; 4EEL A; 2RQ5 A; 3MGH A; 2E1F A; 2P66 A; 4NLB A; 1ZQG A; 1S10 A; 4XA5 A; 1ZQB A; 3AN1 A; 5J0R A; 1B43 A; 1UHU A; 4TUR A; 2YB1 A; 1NK9 A; 2KTQ A; 4BX9 C; 5TIS U; 4US8 A; 3QE9 Y; 5J2C A; 3T5H A; 2QLT A; 3PW4 A; 3V6J A; 5TZV A; 5KFD A; 1KFT A; 4FE3 A; 2JRZ A; 3AQE A; 1RPL A; 5AKH A; 4AYB C; 5KG7 A; 5KFT A; 3NTU A; 1QTM A; 2ATL A; 8ICZ A; 5IIN A; 2PI5 A; 2LKY A; 4OJ5 A; 4KX3 A; 1NK6 A; 2JMG A; 2ZUC A; 4C8M A; 1XO1 A; 3PV8 A; 2Y1I A; 4M9N A; 3ZDD A; 1N62 A; 3IM1 A; 1L3T A; 2JH7 A; 2W7O A; 4P0P A; 5AI6 A; 8ICJ A; 2ZTC A; 1N5W A; 2Y9T A; 5ALH A; 4U6P A; 4IRC A; 3KOO A; 4BJQ A; 4M9H A; 1DRG A; 2NRX A; 4Y2Q A; 3FYH A; 2G0A A; 4GXI A; 3BZC A; 3IV6 A; 4Y2J A; 3H40 A; 2KZM A; 1XO0 A; 4QZF A; 2ESE A; 2ZJ8 A; 4MF8 A; 4QWC A; 2KHV A; 3PSI A; 4O5E A; 3CYM A; 2HSZ A; 3SZ2 A; 4M9L A; 4NLC A; 5DLF A; 3RH4 A; 4PJ0 U; 1ZQH A; 2W9B A; 1KRP A; 1H38 A; 2AU0 A; 2JH1 A; 3E0F A; 5HP4 A; 1DOQ A; 3C28 A; 8ICR A; 2E8M A; 3QNM A; 4DSI A; 3WKE A; 3QU4 A; 2V4Q A; 3OHA A; 4O5C A; 1T3Q A; 2VA2 A; 4DSL A; 1ZJM A; 2W9A A; 4YMM A; 1Z4N A; 3BDP A; 4IC9 A; 4O9M A; 1KEJ A; 5DB8 A; 4ELT A; 3EW9 A; 1HIW A; 2OXO A; 1S0O A; 3TI0 A; 2W03 A; 1L8L A; 4PGX A; 4ZH4 A; 2D8C A; 2JZB A; 5HMM A; 3HRD D; 2OWO A; 5J0T A; 4KLL A; 1MQ2 A; 5A0L A; 3RB4 A; 3OPX A; 4CDG A; 5DGB A; 9ICN A; 2YMP A; 1ECW A; 3MFH A; 1S8O A; 3BQ0 A; 9ICT A; 2BPG A; 1RYS A; 1WCL A; 1KFS A; 3LWL A; 1L7M A; 3GV7 B; 1XU4 A; 4RT2 A; 2Y9U A; 5KFX A; 5L1L A; 3ED5 A; 1UPH A; 4ECQ A; 9ICO A; 2KKP A; 3I1Y A; 4JWN A; 4I2D A; 2QB0 A; 5ALE A; 1U47 A; 3IG8 A; 4Y2V A; 1SL0 A; 5KG1 A; 3BQ7 A; 4UW9 A; 5J2K A; 1IV8 A; 3F53 A; 3QU7 A; 4QZ8 A; 4IQU A; 1BPZ A; 3RTV A; 2ZTE A; 5ALF A; 5DB9 A; 4F5N A; 3SEI A; 4IR9 A; 3LYS A; 3SQI A; 5J0Y A; 3H4D A; 4M9J A; 4ED7 A; 3V7L A; 4F5O A; 2AJQ A; 4F71 A; 1Z19 A; 3J81 j; 5IIO A; 4UQG A; 3KHL A; 2H3Q A; 1N61 A; 7ICJ A; 4QW8 A; 3IG5 A; 5EE3 A; 4KIT B; 5BOL A; 4ED6 A; 3UMG A; 3AM9 A; 5DBC A; 4B9V A; 5KFJ A; 1L8O A; 3MDA A; 2HHX A; 2KVS A; 5KT5 A; 1O08 A; 1NNL A; 5KAI U; 4F72 A; 3RFA A; 3BS7 A; 1L5U A; 1U4B A; 3KBB A; 3ORY A; 2W04 A; 5DG8 A; 2KD1 A; 3Q8Q B; 9ICW A; 5J2J A; 4NJ8 A; 7ICK A; 2GO7 A; 4USA A; 2JEF A; 4KLJ A; 2XVT A; 3M6Z A; 3JPP A; 4XRH A; 1ZYQ A; 4PPX A; 4C0Z A; 4NM2 A; 4B9S A; 1F44 A; 4KN7 A; 2P6U A; 2P35 A; 3THV A; 2ZUD A; 1U9L A; 1KL9 A; 4Q43 A; 3GFK B; 1SV0 C; 2R8K A; 3T5J A; 3GIJ A; 2HHW A; 5ALV A; 3SI8 A; 3F2B A; 4DEZ A; 1DK2 A; 3AU6 A; 2ZIV A; 1NKB A; 2R8J A; 2WTF A; 4DF8 A; 1XC9 A; 2W9C A; 2HCF A; 3BQ1 A; 4OD0 A; 9ICH A; 2OM6 A; 1KQQ A; 4I2E A; 2FMQ A; 4RQ8 A; 5KFU A; 4ED2 A; 1URJ A; 4KLM A; 4QZB A; 7ICU A; 1JRO A; 4F5R A; 5CJ7 A; 2K4H A; 1N63 A; 5J0X A; 3RJJ A; 4CNQ A; 4YD2 A; 3MR6 A; 4UB8 U; 4KLQ A; 4ZOH C; 5CRX A; 2W43 A; 7ICF A; 4IQW A; 5DG7 A; 4KLT A; 2IHM A; 1KDH A; 5KG6 A; 4JV1 A; 5AI9 A; 5AK5 A; 3H0L B; 2H5X A; 4P0Q B; 3C5F A; 3C1Z A; 1ZQF A; 4DSJ A; 2IA6 A; 1SXD A; 3PR4 A; 2HBM A; 4QZC A; 1L7O A; 5KFW A; 4MFF A; 5AIC A; 4B9L A; 3MBY A; 2ZTD A; 1ZQA A; 4DWI A; 3AQF A; 4EBE A; 1MQ3 A; 5AKK A; 8ICA A; 4C80 A; 4UAZ A; 4MFA A; 2NYV A; 3ISD A; 1S97 A; 2BQU A; 2WF5 A; 4E0D A; 2LHT A; 7ICV A; 4CF5 A; 3WKC A; 4UBB A; 4EBD A; 4RU9 A; 2JR5 A; 8ICN A; 5KFS A; 3CW2 C; 1LVH A; 4UBC A; 2NV3 A; 3ZD8 A; 4RQ7 A; 3B9J A; 8ICU A; 1BPD A; 3TAN A; 2F1I A; 1Z00 B; 5HML A; 3BQT A; 4KLG A; 5L9X A; 5DQG A; 7ICM A; 5AKL A; 4I2H A; 1S5L U; 3C21 A; 3D6J A; 1L7P A; 2Y1J A; 3H8S A; 2AGP A; 8ICX A; 3SV3 A; 4OO1 J; 1X66 A; 4DQI A; 1GO3 F; 3Q8M A; 2PFP A; 1SZP A; 4EYI B; 4YQW A; 2WF7 A; 3GII A; 2A1A A; 3Q8P B; 3RF9 A; 1V85 A; 3RB0 A; 2GH1 A; 1J2N A; 4OJ6 A; 2XGQ A; 1RXW A; 1HUZ A; 3KFU F; 3Q8R B; 1FIQ A; 4KMU A; 4YCX A; 5H2F U; 2EZZ A; 2W9C B; 2J6U A; 4UAV A; 5KFF A; 3EWA A; 5ALQ A; 3GIK A; 3KKA C; 4BDP A; 4BXO A; 5ALL A; 1ZXI A; 3L3F X; 3QUB A; 5J2D A; 4IQV A; 1PVR A; 2CN1 A; 2VJ5 A; 4ED3 A; 1KW4 A; 3WKB A; 2E8O A; 4RPZ A; 2WF9 A; 1ZQI A; 1D8B A; 2KKV A; 4Z6D A; 2H3F A; 5KT4 A; 2NRT A; 3PO5 A; 4NY8 A; 3K75 D; 1JUD A; 3HW8 A; 3ZDA A; 3QU2 A; 5AM4 A; 4PHD A; 1S76 D; 9ICL A; 2QKQ A; 5L1K A; 2JEJ A; 3M8R A; 2PKE A; 9ICK A; 8ICH A; 1UQV A; 4M04 A; 1JMS A; 4KMO B; 2BPF A; 1V97 A; 4F4X A; 2F1J A; 4PL2 A; 3SEN A; 1KLN A; 4CRX A; 2BCU A; 3B0X A; 3LVV A; 1T8E A; 1IM4 A; 1ZRM A; 4ECR A; 4JK1 A; 2I9G A; 1SV4 A; 3NVY A; 1QSL A; 5F3X B; 8ICO A; 5AIA A; 1WCN A; 5G5G A; 4QWD A; 4YR3 A; 5EWG A; 5F9L A; 4J9R A; 2EAN A; 2IOF A; 4CGZ A; 4P4P A; 2IBK A; 5DGA A; 4NLK A; 1IG6 A; 2HHT A; 2KIV A; 3BQ2 A; 4HYK A; 3UQ0 A; 3KD3 A; 4EEN A; 3NS1 A; 3RJK A; 5KAF U; 4RQ5 A; 3H0M B; 5DLG A; 1V9P A; 2KIC A; 5AKY A; 5KNI A; 3IHQ B; 2QAR A; 1N60 A; 1ZQD A; 3Q8L A; 3AU2 A; 3WK7 A; 4F2R A; 3C2K A; 5KT3 A; 4BUG A; 4BGD A; 2XID A; 5ALI A; 1J97 A; 2XGP A; 3KZI U; 4GC7 A; 1X2I A; 2HHV A; 4JUZ A; 3PNC A; 4QZ9 A; 1XSN A; 3I76 A; 1A6S A; 3BJY A; 1YZ7 A; 1A77 A; 2UVV A; 3GV8 B; 2OEH A; 3OSP A; 5J8Y A; 8ICQ A; 7ICS A; 3N7P D; 3TAP A; 4QZA A; 3ETL A; 1NK7 A; 2ZXH A; 3D2N A; 1D8L A; 5KG3 A; 4KTQ A; 4TQR A; 3NRZ A; 3N7R C; 4BXO B; 2K4I A; 2KN7 A; 1PUZ A; 4Q44 A; 4M6W B; 2YN4 A; 3NVZ A; 4QZE A; 1EXN A; 4DQR A; 3IN5 A; 5J0P A; 4QIW C; 3OSN A; 4RQ0 A; 2MA1 A; 2XI9 A; 2E8P A; 3O0F A; 4M2Y A; 1KN5 A; 4DL7 A; 2EH9 A; 5AM2 A; 2ALZ A; 4YD1 A; 1B0X A; 1YT3 A; 2KV2 A; 4F4Z A; 5J2E A; 2A3V A; 1L3U A; 2DPI A; 1O03 A; 1QQ5 A; 2IOH A; 4NL9 C; 3H8M A; 3RBE A; 2FMP A; 5KFR A; 1X6J A; 5KFB A; 3PX0 A; 5AKE A; 5KFK A; 3RR7 A; 3RJG A; 1TV9 A; 2D3D A; 1WWU A; 1Q3U A; 2WB1 C; 3EPI A; 4R64 A; 3AUO A; 4DQS A; 2A19 A; 1X40 A; 4DQP A; 5KFQ A; 4F2S A; 3D2Q A; 4YR0 A; 2N1R A; 3SAH A; 3I28 A; 5ALG A; 1UT5 A; 2Y0S C; 2ZIU A; 1KBU A; 1TVA A; 4ELU A; 2B6G A; 2UVU A; 3S6J A; 2O6K A; 2BDU A; 1SGG A; 1ZQQ A; 4NXZ A; 2HOF A; 4C8O A; 4ECX A; 2QAR B; 5JRT A; 5KTQ A; 4UB5 A; 4MEX A; 1FEZ A; 2KNJ A; 2PFO A; 3C23 A; 9ICF A; 3C5G A; 1Z3E B; 3H4B A; 9ICP A; 4LJX A; 8ICC A; 1RQL A; 3KTQ A; 4RUC A; 5ALM A; 1YZ6 A; 4ECY A; 1D9F A; 4ECV A; 4FS2 A; 4ECW A; 4WJ3 B; 1NOM A; 4F4K A; 4JV0 A; 1SB3 C; 1ZD4 A; 2KMD A; 3HJE A; 1SXE A; 1L3S A; 1WUD A; 3MGV A; 5DQI A; 2YTU A; 3JPO A; 2OYY A; 2KEY A; 5DKW A; 2C2D A; 4C4T A; 3TAD A; 1WWV A; 3T5L A; 3K4G A; 2P6R A; 5CHG A; 5HHI A; 4IRK A; 4QNL A; 2AXT U; 1PK1 A; 1VDV A; 4R8U A; 5DQH A; 4J9Q A; 2HBJ A; 1DXS A; 1ZQC A; 2A1J A; 4JV2 A; 4XQ8 A; 2C28 A; 4IR1 A; 2YMM A; 5CWR A; 4C8L A; 4DFD A; 2C22 A; 2WAQ C; 8ICT A; 4QIW F; 1Z4O A; 4KLE A; 4P0P B; 5EOZ A; 4ED8 A; 4UB6 U; 2LMR A; 3BS5 A; 2MSN A; 3TAQ A; 3DDH A; 2BZF A; 1SL1 A; 5J2F A; 4MEY A; 5KL1 B; 1RZT A; 7ICO A; 1TAQ A; 4DOA A; 5ALR A; 2FLL A; 1BPB A; 1B4F A; 4I2J A; 3NVV A; 5IIJ A; 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