The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
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sequence length |
80
|
structure length |
80
|
Chain Sequence |
RPLPVCPNPLFVRWLTEWRDEAASRGRHTRFVFQKALRSLQRYPLPLRSGKEAKILQHFGDRLCRMLDEKLKQHLASGGD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution NMR structure and DNA binding mode of the Mus81 n-terminal helix-hairpin-helix domain
rcsb |
| molecule keywords |
Crossover junction endonuclease MUS81
|
| molecule tags |
Hydrolase
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| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
25
|
| structure length |
80
|
| sequence length |
80
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| ec nomenclature |
ec
3.1.22.-: |
| pdb deposition date | 2009-10-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase beta, N-terminal domain-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3JPQ A; 2BPF A; 1DK3 A; 3V7L A; 4TUR A; 5D46 A; 1TV9 A; 1BNP A; 1ZQH A; 8ICA A; 5CWR A; 3B0Y A; 5J0Y A; 3GDX A; 4F5Q A; 1ZQL A; 4M0A A; 5J29 A; 3RJJ A; 3MBY A; 4DOA A; 9ICS A; 5DBB A; 3RH5 A; 9ICM A; 1ZQG A; 4I2E A; 5IIN A; 4UB5 A; 1BPX A; 4M04 A; 4I2F A; 4K4G A; 4IQT A; 1MQ2 A; 8ICH A; 1ZQQ A; 8ICL A; 7ICK A; 4NLZ A; 9ICB A; 5DBA A; 4QZG A; 3PMN A; 8ICN A; 1XSL A; 2W9M A; 4RQ7 A; 3MDA A; 4PH5 A; 4KLD A; 4M9N A; 7ICO A; 3JPS A; 8ICE A; 1ZQB A; 3RJK A; 3JPP A; 4NLK A; 8ICM A; 8ICT A; 3C2M A; 4QZI A; 3PNC A; 4RQ4 A; 4GXK A; 5IIK A; 8ICG A; 3TFR A; 5J2G A; 4K4H A; 1NZP A; 1BPZ A; 4KLU A; 5J2D A; 2PFP A; 5J0R A; 4KLT A; 8ICK A; 9ICI A; 4KLF A; 5IIO A; 3UXO A; 3AUO A; 2BCR A; 4UBB A; 2PFO A; 5DB7 A; 7ICU A; 1ZQE A; 4KLG A; 4MF2 A; 4PHD A; 5BPC A; 3OGU A; 5IIL A; 4Z6D A; 1ZQN A; 4XUS A; 3HX0 A; 4I2D A; 1JMS A; 7ICM A; 8ICY A; 4QZA A; 8ICQ A; 9ICN A; 3C5G A; 3C2L A; 8ICX A; 2FMP A; 4R65 A; 5J0W A; 4Z6C A; 4PGX A; 4F5R A; 5J2E A; 4UAY A; 1XSN A; 2BCV A; 5III A; 9ICK A; 4TUQ A; 4RQ6 A; 4M2Y A; 9ICF A; 1BPD A; 3UQ0 A; 3HWT A; 4UAW A; 1ZQK A; 3UXP A; 3MDC A; 4QZC A; 8ICO A; 5DDY A; 4PHE A; 3ISB A; 4M9L A; 1ZQA A; 9ICV A; 4XA5 A; 4PGY A; 4JWM A; 1KDH A; 1HUZ A; 2PFN A; 2PFQ A; 9ICH A; 3ISD A; 1ZQP A; 5DBC A; 1BPY A; 9ICA A; 5J0T A; 5J2H A; 4M9H A; 2BPG A; 4O5E A; 4F5N A; 4I2J A; 5J2A A; 1MQ3 A; 5J0S A; 4UB1 A; 4KLH A; 5IIM A; 8ICR A; 8ICU A; 1BNO A; 4JWN A; 4M47 A; 8ICJ A; 9ICW A; 5J2J A; 9ICT A; 1ZQT A; 5J2I A; 1ZQD A; 4LZD A; 4RT3 A; 3UPQ A; 4KLQ A; 1ZQR A; 1TVA A; 5J0X A; 5J0P A; 9ICU A; 4KLI A; 4RQ3 A; 2BCQ A; 2FMS A; 4RQ1 A; 3LK9 A; 4NM2 A; 4UB4 A; 4YCX A; 4IQU A; 5J0Q A; 4QZ9 A; 4MF8 A; 4O5C A; 1KEJ A; 5J2F A; 5D4B A; 4I2I A; 4NY8 A; 4QZH A; 4Z6E A; 4YMO A; 5DKW A; 4RQ5 A; 7ICL A; 4MFA A; 7ICJ A; 5J0O A; 5BOM A; 9ICR A; 3B0X A; 5IIJ A; 5TZV A; 3V7K A; 7ICV A; 4QZB A; 4RPY A; 4QZD A; 4I27 A; 3UQ2 A; 2ISP A; 4PPX A; 1ZQJ A; 4QZF A; 4Z6F A; 4I2A A; 9ICP A; 4MFF A; 3ISC A; 4IQV A; 4LVS A; 4X5V A; 9ICQ A; 4FO6 A; 1ZQC A; 5HHH A; 3MGI A; 4KLJ A; 5J0U A; 4O5K A; 9ICG A; 4I29 A; 8ICB A; 1ZJM A; 4RQ0 A; 9ICE A; 5EOZ A; 4I2H A; 7ICI A; 7ICT A; 2PXI A; 7ICQ A; 3AU2 A; 3RJG A; 4YMN A; 2IHM A; 4KLL A; 5J2K A; 4MFC A; 8ICZ A; 4NLN A; 4QZE A; 4K4I A; 1RZT A; 8ICS A; 4F5O A; 3RH4 A; 1HUO A; 4R64 A; 3V7J A; 4P2H A; 4YD1 A; 4F5P A; 2FMQ A; 2BCU A; 7ICG A; 8ICC A; 3TFS A; 3JPO A; 4PHP A; 4LZG A; 3UXN A; 3HW8 A; 7ICE A; 2GWS A; 4R66 A; 4I2B A; 5BOL A; 4TUP A; 3RH6 A; 1ZQI A; 1ZQS A; 7ICS A; 4PHA A; 4GXI A; 1XSP A; 8ICI A; 5DB9 A; 4QZ8 A; 1ZQO A; 9ICL A; 5J2B A; 2P66 A; 4RQ2 A; 1ZJN A; 8ICV A; 4NM1 A; 4KLM A; 4O9M A; 4YN4 A; 4RPX A; 4YMM A; 3JPT A; 4GXJ A; 3MGH A; 3RJI A; 4UB3 A; 4IQW A; 9ICO A; 5HHI A; 4NXZ A; 4DOB A; 4UB2 A; 2ISO A; 5DB6 A; 4M9J A; 4I2C A; 2BCS A; 4RPZ A; 4M9G A; 5J2C A; 8ICP A; 3C5F A; 5CB1 A; 7ICR A; 3JPR A; 3V72 A; 3AU6 A; 4I28 A; 8ICF A; 8ICW A; 9ICC A; 4RQ8 A; 7ICH A; 1ZQF A; 7ICF A; 3RJE A; 7ICN A; 4KLE A; 3RJF A; 4KLS A; 4YD2 A; 5DB8 A; 9ICX A; 4DOC A; 4UAZ A; 2KP7 A; 7ICP A; 4DO9 A; 4UBC A; 4R63 A; 1BPE A; 1ZQM A; 3C2K A; 1DK2 A; 4RT2 A; 3JPN A; 4PGQ A; 3RJH A; 3PML A; 2I9G A; 4I2G A; 9ICJ A; 4KLO A; 5D49 A; 4TUS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3WK5 A; 5KFM A; 5KFR A; 5CJ7 A; 2DGZ A; 4NLC A; 3SV3 A; 2KHV A; 2EAM A; 4DL4 A; 3PV8 A; 3NGD A; 1TV9 A; 2LM4 A; 2XID A; 4QIW F; 3B0Y A; 2AJQ A; 3H0R B; 4U7C A; 1H38 A; 4DSI A; 3A0B U; 3E0F A; 3IP4 B; 4EBD A; 5J29 A; 2Y0S C; 2RHF A; 9ICS A; 5KT3 A; 5DBB A; 3RH5 A; 3V6H A; 3ETR A; 2H3Q A; 2EZX A; 2VIX A; 2P6R A; 5AKG A; 3E58 A; 5AKH A; 3PX4 A; 1YZ7 A; 2OCE A; 2KG5 A; 1NJW A; 5KFD A; 2YB1 A; 5AM2 A; 2ZIX B; 1BVS A; 3H0L B; 2DF4 B; 3N97 B; 5KFK A; 2JGA A; 3NS1 A; 2BQR A; 3T3F A; 4QZI A; 3SEI A; 1TK5 A; 5DDM A; 4BGD A; 4GXK A; 8ICG A; 4Q8F A; 4KLU A; 1BPZ A; 4C8L A; 5J2D A; 5J0R A; 1JIH A; 4KLT A; 3IV6 A; 2DBY A; 3OPX A; 3BDP A; 1CI4 A; 1CUK A; 3AUO A; 5KFI A; 3F2D A; 5AHX A; 4UBB A; 1IXR A; 5DB7 A; 1KFS A; 1XU4 A; 2W9A A; 3QUQ A; 3RF9 A; 7ICU A; 2QB0 B; 5JTI A; 2MA1 A; 4DSJ A; 2RQ5 A; 2KVS A; 1SB3 C; 2XY7 A; 3ED5 A; 5EWG A; 3F2B A; 4IRK A; 3IRU A; 1RPL A; 2KTQ A; 1L7O A; 2EQY A; 2XVT A; 3GV7 B; 5L1L A; 4KN4 A; 2BQ3 A; 3CNH A; 2Q0Z X; 4FS1 A; 1XWL A; 2J6T A; 2FDR A; 4QWB A; 4QWD A; 8ICX A; 2R18 A; 4KMO B; 4TQS A; 3HT3 A; 3KHL A; 1S97 A; 4ED1 A; 3KZI U; 4CF5 A; 4Z6C A; 3OHB A; 5EWF A; 2W11 A; 4ED7 A; 4RQN A; 1Z19 A; 4UAU A; 2F8K A; 1X40 A; 2F1I A; 1X42 A; 1UHU A; 3I76 A; 2DFL A; 2KV2 A; 5KG7 A; 4NV0 A; 2CPR A; 4UAT A; 3BQ0 A; 8ICO A; 4M9L A; 2AU0 A; 4PGY A; 1SKW A; 2XI9 A; 3QUT A; 1Z3E B; 2JRZ A; 2PFQ A; 1ZQP A; 5KL8 B; 5DBC A; 4BXO A; 3M9N B; 1Q3U A; 9ICA A; 1T4G A; 4M9H A; 1TAM A; 2YTU A; 3HRD D; 4C8O A; 4I2J A; 4DSF A; 3NAS A; 4J9M A; 5J0S A; 4DCC A; 5ALM A; 5F9N A; 4PJ0 U; 1WCN A; 1X9W A; 4GC6 A; 1RG6 A; 2HBL A; 1DGS A; 8ICU A; 4YVZ A; 2C2R A; 1BNO A; 4Y2S A; 3EPG A; 5J2J A; 5J2I A; 5AK3 A; 1ZRN A; 2R8J A; 4RT3 A; 3D2S A; 1VLB A; 2KJ5 A; 2WF5 A; 1TVA A; 1NK8 A; 3AMZ A; 5J0P A; 4KLI A; 1T3Q A; 3G6Y A; 2BCQ A; 5L1M A; 3AEV A; 3K4G A; 4RQ1 A; 2K4I A; 3LK9 A; 2EH9 A; 4DFD A; 3QX7 A; 5F9L A; 4YCX A; 1NK4 A; 3RR7 A; 1RM6 C; 2HMX A; 2J6U A; 4I2I A; 2HHQ A; 4USA A; 3R9K A; 3KBB A; 4YMO A; 5KFB A; 4FZN A; 2QKQ A; 2KHQ A; 3N7S C; 3QNM A; 1NJZ A; 1S5L U; 1RXW A; 7ICL A; 1ZET A; 1Q46 A; 9ICR A; 3B0X A; 5ALE A; 1JRP A; 3ZDE A; 2HHW A; 2A3V A; 4J9N A; 3FYH A; 2ES6 A; 5KFV A; 4B9M A; 7ICV A; 3SV4 A; 4RPY A; 4I27 A; 2ISP A; 1JXL A; 2FLL A; 9ICP A; 2YN4 A; 3KKA C; 4IQV A; 2F1H A; 2LI6 A; 1PZN A; 1V97 A; 4OCZ A; 4EX6 A; 1SV0 A; 4P0P A; 2KVC A; 5J8Y A; 3HPO A; 1SV4 A; 3PZP A; 3SD7 A; 3WK8 A; 5C5J A; 3LWM A; 3MR2 A; 5EOZ A; 7ICI A; 7ICT A; 4YXJ A; 2ZTC A; 2IHM A; 3TAR A; 5J2K A; 2D8C A; 5HR6 A; 1U45 A; 8ICZ A; 2KNJ A; 4ED2 A; 2KEY A; 3BS5 B; 4QZE A; 4K4I A; 4F5O A; 1X9M A; 2A1J A; 3V7J A; 3D2N A; 5AKI A; 4F5P A; 3MR5 A; 2BCU A; 3IM1 A; 3T5J A; 3TAD A; 3MAB A; 4UQG A; 4PHP A; 5ALY A; 2AXT U; 1S0O A; 2ZJ5 A; 7ICE A; 2W9B A; 1HEK A; 1BGX T; 3BQ2 A; 4ECQ A; 4HAI A; 1X66 A; 5CA7 A; 1ZQI A; 2DWQ A; 4JUZ A; 1WWU A; 2MAX A; 2GLE A; 3FAH A; 2BQU A; 3PR4 A; 4GXI A; 4C7Y A; 4CNQ A; 1XSP A; 8ICI A; 9ICL A; 5J2B A; 1URJ A; 1RDF A; 2KOB A; 3M1Y A; 8ICV A; 3ZI4 A; 1A77 A; 4P4O A; 1Z00 B; 4YN4 A; 2W9C A; 3C1Y A; 3QU2 A; 4RPX A; 2I5H A; 4YMM A; 1PVP A; 4UB8 U; 4JV1 A; 3MGH A; 2PKE A; 4PL2 A; 4IQW A; 2UVV A; 1IV8 A; 2QAR A; 1BPB A; 2EDU A; 4ZOH C; 4O3O A; 1XO1 A; 4NLG A; 4M9J A; 2BCS A; 2OM6 A; 5KG1 A; 2OHF A; 1LV5 A; 1UCV A; 5J2C A; 3KFU F; 1KQQ A; 3JPR A; 4JV2 A; 4JK1 A; 4YG2 A; 7ICF A; 2V9W A; 3QU9 A; 2FPL A; 2FJ6 A; 4F93 B; 4EYH B; 3RJF A; 1ZRM A; 2KSO B; 5L1K A; 1QCK A; 3QEA Z; 1LKY B; 4GFJ A; 4UAZ A; 3DDH A; 2K60 A; 3PSP A; 2HBM A; 2CN1 A; 4QW9 A; 2HOF A; 3NVY A; 3GU3 A; 4DS4 A; 4F3O A; 1NK9 A; 5KFP A; 4DL5 A; 3RJH A; 5FP0 A; 3EYZ A; 1B4F A; 4GIB A; 2L5Y A; 3MC1 A; 4ZH4 A; 3SMV A; 2B21 A; 3JPQ A; 2MSN A; 4QWA A; 1DK3 A; 3TKA A; 1XS9 D; 5ALD A; 2XGQ A; 3QXG A; 2NRV A; 1PK3 A; 5DG7 A; 1ZQH A; 8ICA A; 3N28 A; 4DFK A; 2H5X A; 5KT6 A; 2Y9U A; 3QU4 A; 4EX7 A; 1NZB A; 2KIW A; 5AK4 A; 5G5G A; 3FM9 A; 4RNO A; 1ZQL A; 4LJX A; 4M0A A; 2P35 A; 2K4H A; 4DOA A; 2KFZ A; 9ICM A; 2BDU A; 2HHX A; 4DFM A; 1NKC A; 5AKY A; 5KFN A; 5AKX A; 2WB1 F; 1MQ2 A; 2E3T A; 2GO7 A; 2KJ9 A; 1X6J A; 4Y2R A; 2NYV A; 9ICB A; 5DBA A; 5F3X B; 4PZO A; 4QZG A; 3PMN A; 1XSL A; 4RQ7 A; 1J2N A; 4PH5 A; 4M9N A; 2UVR A; 1ZQB A; 1RYU A; 4NLK A; 5AIA A; 3PNC A; 2ZIV B; 2RDI A; 2F77 X; 3AQE A; 4DL2 A; 2HDO A; 1L3S A; 3F5E A; 4EZ9 A; 8ICK A; 3OTQ A; 4C8K A; 1PVQ A; 5KT4 A; 2BCR A; 4P4P A; 2PFO A; 3N7P D; 4RQM A; 4DFP A; 2WTF A; 4KLG A; 2ZXI A; 2K4P A; 4MF2 A; 1Z1B A; 2LBO A; 3HIL A; 5IIL A; 5G5H A; 2G06 A; 1ZQN A; 1UQV A; 4I2D A; 4ED6 A; 4ECV A; 2R8K A; 1MA7 A; 2W43 A; 2HBJ A; 8ICQ A; 4F4Z A; 2Y0S F; 4UAR A; 9ICN A; 3C5G A; 5EWE A; 4RZR A; 2JZB A; 5ALJ A; 4IR1 A; 4DL7 A; 3OSN A; 4DLG A; 3RRG A; 4C0Z A; 4F5R A; 4FZL A; 4UAY A; 1XSN A; 2Y1J A; 5KFC A; 1JN3 A; 9ICK A; 2WAQ C; 3ZDA A; 3RBD A; 3QE9 Y; 4OD0 A; 2RRD A; 9ICF A; 1U9L A; 3PW0 A; 3C29 A; 1HIW A; 2PMZ F; 3HWT A; 4IRD A; 1IM4 A; 1FIQ A; 4FZM A; 4ECU A; 1UPH A; 5HNK A; 3F2C A; 2HI0 A; 3RB6 A; 2BR0 A; 3T79 A; 3GFK B; 2CRX A; 4EBC A; 5DDY A; 1COK A; 3ISB A; 3FC4 A; 9ICV A; 1N60 A; 1WUD A; 5KT2 A; 4U6P A; 4JWM A; 4RNN A; 5AM3 A; 1ARO P; 4ACO A; 1KDH A; 3FDS A; 3MGV A; 1BPY A; 1L8L A; 2HVH A; 1ED1 A; 3UMB A; 2BPG A; 4OJL A; 2YQE A; 1MQ3 A; 4CRX A; 4KLH A; 4CF3 A; 2NRZ A; 2BKE A; 4JWN A; 4AP9 A; 2BHN A; 4DQQ A; 5KG4 A; 9ICW A; 3HKZ C; 4J9O A; 1UT8 A; 3RAQ A; 5CRX A; 3GII A; 4ED0 A; 2AHO B; 1ZQD A; 5CHG A; 1ZQR A; 5J0X A; 4YXM A; 3WKA A; 2W7O A; 5DG8 A; 2VA2 A; 3VC8 A; 2KKV A; 4OJP A; 5ALH A; 1V85 A; 4IQU A; 5J0Q A; 3WKB A; 1JXE A; 5J2F A; 5D4B A; 2JMG A; 3QZ7 A; 3RAX A; 1ZQZ A; 4F91 B; 4CDG A; 4Z6E A; 2KE7 A; 5KT7 A; 1WG8 A; 2VJ4 A; 4KTQ A; 1QSL A; 4DWI A; 2FE9 A; 2RLT A; 5BOM A; 4B9U A; 5IIJ A; 3WU2 U; 2DQN B; 3GIM A; 4UAV A; 2A1A A; 4DQP A; 2DPJ A; 4Q8E A; 1KW4 A; 1N62 A; 4QZB A; 1D9D A; 3M6K A; 2ALZ A; 4B6J A; 4PPX A; 3H4B A; 4QZF A; 4Z6F A; 3M6Z A; 3ISC A; 5HML A; 3LVW A; 1X9S A; 3MGI A; 2F2A B; 5KNI A; 9ICG A; 4I29 A; 1F0M A; 1QSS A; 3PO4 A; 8ICB A; 3ICX A; 1D8L A; 1F44 A; 1Q8K A; 4J9P A; 2W3S A; 4CGZ A; 4EBE A; 1XNS A; 3TAQ A; 9ICE A; 2C2D A; 2B0C A; 1CRX A; 4ECR A; 3RJG A; 2WFA A; 2MU2 A; 4OJO A; 2VKQ A; 5KAI U; 1V9P A; 5ALI A; 8ICS A; 3THV A; 1ZD4 A; 4R8U A; 4O0I A; 2ZIW A; 4DF8 A; 5AKL A; 2BDP A; 1K1Q A; 2FMQ A; 3S6J A; 3UMC A; 7ICG A; 2FLP A; 1J2M A; 3LVV A; 3OJU A; 1SL0 A; 4OO1 J; 8ICC A; 4JB3 A; 2W8K A; 3TFS A; 4M6W A; 2NRX A; 1ZD2 P; 1OUQ A; 2HHS A; 1ZQV A; 2WF6 A; 4R66 A; 3Q8L A; 5B5E U; 4I2B A; 4TUP A; 1KN5 A; 5B66 U; 1U47 A; 4YFK A; 3UMG A; 7ICS A; 1KFT A; 5ALX A; 4IC9 A; 1ZJN A; 1NJX A; 4P0Q A; 4DL6 A; 3QU5 A; 3H0M B; 1GO3 F; 2K8C B; 4O9M A; 3WKE A; 3H7I A; 4KX3 A; 2NO4 A; 2F3N A; 1NK0 A; 4NL9 A; 3RJI A; 3L3F X; 2A19 A; 2JR5 A; 4UAS A; 5AI9 A; 1VJ5 A; 4C8M A; 3QEB Z; 3NVW A; 4FBT A; 3ETL A; 4DOB A; 4DL3 A; 3M8S A; 4F4Y A; 4Y2X A; 2F1J A; 4I2C A; 3ZDB A; 1ZQ1 C; 2XCA A; 1MC8 A; 2AGO A; 1JX4 A; 1S10 A; 3D2Q A; 5DG9 A; 1SZH A; 4DQR A; 1TAU A; 8ICW A; 9ICC A; 2G5H B; 4MHV A; 1ZQF A; 2W3R A; 4F2R A; 4YD2 A; 5ALQ A; 2LYB A; 9ICX A; 5ALZ A; 1XO0 A; 2JEG A; 2ZUC A; 1TK8 A; 2HSZ A; 4UBC A; 2QLT A; 2KD1 A; 1BPE A; 3ZD9 A; 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