The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
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sequence length |
80
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structure length |
80
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Chain Sequence |
RPLPVCPNPLFVRWLTEWRDEAASRGRHTRFVFQKALRSLQRYPLPLRSGKEAKILQHFGDRLCRMLDEKLKQHLASGGD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Crossover junction endonuclease MUS81
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| publication title |
Solution NMR structure and DNA binding mode of the Mus81 n-terminal helix-hairpin-helix domain
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| molecule tags |
Hydrolase
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| total genus |
25
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| structure length |
80
|
| sequence length |
80
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| ec nomenclature |
ec
3.1.22.-: |
| pdb deposition date | 2009-10-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase beta, N-terminal domain-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZQI A; 4RQ0 A; 8ICC A; 3MGI A; 4YMN A; 3JPR A; 4X5V A; 7ICU A; 1BPY A; 4UB2 A; 3LK9 A; 3UQ0 A; 5IIN A; 9ICE A; 3RJI A; 4IQU A; 9ICA A; 9ICW A; 8ICQ A; 2FMP A; 5J0O A; 4QZI A; 4M9J A; 4RQ2 A; 4UBB A; 7ICR A; 5J0T A; 3MDA A; 4QZ9 A; 5DB8 A; 4F5N A; 8ICL A; 4NXZ A; 5CWR A; 3PML A; 4KLO A; 1DK2 A; 8ICI A; 5EOZ A; 5J29 A; 4UB1 A; 4PHP A; 3GDX A; 5J0U A; 3HWT A; 4I2I A; 4O5C A; 4RQ5 A; 7ICV A; 4Z6F A; 4PPX A; 1BPZ A; 4M9G A; 3UQ2 A; 4F5P A; 4Z6E A; 3JPS A; 3TFR A; 4XA5 A; 4Z6C A; 8ICX A; 3MGH A; 4QZC A; 5J2F A; 3UPQ A; 8ICN A; 5IIJ A; 1ZQR A; 8ICZ A; 3PNC A; 1XSL A; 4TUS A; 4MFF A; 5J0Q A; 4RQ3 A; 4LVS A; 4UB3 A; 4JWM A; 8ICJ A; 3ISC A; 4TUP A; 1ZQC A; 1DK3 A; 4MFA A; 3TFS A; 3RH4 A; 4LZD A; 2ISO A; 3V7K A; 9ICX A; 3UXN A; 3MDC A; 1ZQH A; 1BPE A; 1XSP A; 5BOL A; 4TUQ A; 3JPO A; 4GXI A; 2BPF A; 7ICT A; 4KLH A; 2BCR A; 4KLS A; 4RPY A; 2PFQ A; 3RJE A; 4MF2 A; 9ICK A; 5D46 A; 7ICS A; 4RPZ A; 4YN4 A; 4GXK A; 7ICL A; 3UXO A; 2FMS A; 4KLJ A; 4QZA A; 3B0X A; 1ZQB A; 1ZJN A; 5DDY A; 2BCV A; 4NM1 A; 4M9H A; 1HUO A; 2GWS A; 8ICY A; 7ICP A; 1BPX A; 4MFC A; 4RQ7 A; 4F5R A; 4JWN A; 8ICB A; 9ICH A; 3OGU A; 1ZQO A; 9ICG A; 1ZQA A; 3V7J A; 4RQ6 A; 5J2D A; 4RQ4 A; 4IQV A; 3ISD A; 4M04 A; 4R66 A; 4O5E A; 7ICI A; 4M2Y A; 7ICM A; 9ICJ A; 5J2G A; 4YD2 A; 3JPQ A; 1ZQJ A; 2FMQ A; 4KLE A; 4F5Q A; 4I2A A; 3RJK A; 3HW8 A; 8ICM A; 5J2C A; 4PGX A; 4NLZ A; 4GXJ A; 3RJH A; 8ICU A; 2P66 A; 4KLD A; 4YMM A; 2BPG A; 4PHA A; 3C2M A; 9ICR A; 3C5G A; 1ZQD A; 3V72 A; 4DO9 A; 1KDH A; 4KLI A; 4UBC A; 4UAY A; 2I9G A; 7ICH A; 4I2B A; 8ICS A; 9ICB A; 3C2L A; 4DOA A; 7ICG A; 9ICC A; 4IQT A; 5J2E A; 4NY8 A; 1ZQL A; 5BOM A; 4I2H A; 1HUZ A; 4QZB A; 3UXP A; 5HHI A; 9ICS A; 7ICF A; 4KLU A; 4M47 A; 1RZT A; 4K4G A; 4KLG A; 3RJF A; 5D4B A; 8ICV A; 4R63 A; 4I29 A; 8ICT A; 9ICT A; 1ZQS A; 8ICG A; 3JPT A; 5D49 A; 4R65 A; 5DBA A; 5IIK A; 4DOC A; 5J2A A; 4YCX A; 1MQ2 A; 4NLN A; 5J0S A; 4I27 A; 5IIO A; 7ICE A; 5J2J A; 3RJJ A; 1ZQG A; 4QZG A; 1XSN A; 5BPC A; 9ICO A; 4KLM A; 4K4I A; 5IIM A; 9ICL A; 5CB1 A; 3ISB A; 5J0Y A; 5TZV A; 4NLK A; 8ICO A; 4TUR A; 5IIL A; 4R64 A; 4YMO A; 3AU6 A; 7ICQ A; 1ZQT A; 2BCU A; 2W9M A; 3B0Y A; 7ICK A; 5J2I A; 4F5O A; 5III A; 4QZE A; 4RT2 A; 5DB6 A; 4PHE A; 5J0W A; 1MQ3 A; 8ICW A; 5DB7 A; 9ICV A; 3V7L A; 4UAZ A; 3RJG A; 9ICM A; 4QZD A; 3AUO A; 1TV9 A; 8ICF A; 5DB9 A; 2KP7 A; 4I2F A; 4UB5 A; 5DKW A; 4I28 A; 7ICO A; 7ICJ A; 4MF8 A; 7ICN A; 1ZQK A; 3C2K A; 4O9M A; 2PFP A; 2PFN A; 5DBB A; 4PH5 A; 5J2K A; 4YD1 A; 8ICR A; 4NM2 A; 1ZQF A; 1ZQN A; 1BNP A; 1BNO A; 1ZQQ A; 4QZ8 A; 9ICU A; 4UB4 A; 4XUS A; 5DBC A; 3RH5 A; 9ICF A; 2IHM A; 4M9L A; 4RQ1 A; 8ICK A; 4P2H A; 9ICQ A; 9ICI A; 4PHD A; 4RQ8 A; 2PXI A; 4I2D A; 1BPD A; 5J0P A; 2ISP A; 1ZQP A; 4KLT A; 8ICP A; 4M0A A; 4LZG A; 4UAW A; 4I2G A; 5J2H A; 4I2J A; 1TVA A; 1JMS A; 5J0X A; 4RPX A; 5HHH A; 4KLF A; 1ZJM A; 4PGY A; 8ICE A; 4QZF A; 1KEJ A; 3JPN A; 4KLL A; 9ICN A; 4PGQ A; 1ZQM A; 3MBY A; 1NZP A; 5J0R A; 3JPP A; 1ZQE A; 3AU2 A; 3PMN A; 2BCS A; 8ICA A; 4O5K A; 3RH6 A; 4I2C A; 4IQW A; 2BCQ A; 2PFO A; 9ICP A; 3C5F A; 8ICH A; 4M9N A; 5J2B A; 4RT3 A; 4KLQ A; 4FO6 A; 4DOB A; 3HX0 A; 4QZH A; 4K4H A; 4Z6D A; 4I2E A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1ZQI A; 4QWD A; 5HP4 A; 8ICC A; 2I5H A; 4YMN A; 4Y2T A; 4X5V A; 2BDP A; 1BPY A; 2F77 X; 3AQF A; 2G5I B; 3LK9 A; 3UQ0 A; 1NJW A; 4YP3 A; 3N7R C; 1PUZ A; 1LKY A; 1B22 A; 5AI6 A; 1SZP A; 9ICA A; 9ICW A; 4BJQ A; 5KT6 A; 3RRG A; 2YMQ A; 4UB6 U; 4R8U B; 5J0O A; 3LVW A; 4EX7 A; 5CA7 A; 3PVX A; 4DFK A; 2KIV A; 1SZH A; 2H3Q A; 2WF7 A; 2PI5 A; 4C7Y A; 2ZUB A; 2H3Z A; 5KG6 A; 5J29 A; 3RB0 A; 1V9P A; 5ALM A; 3GDX A; 4DQR A; 3HWT A; 4I2I A; 4RQ5 A; 2OYY A; 1KBU A; 4FS2 A; 5ALE A; 2WAQ C; 1Q8K A; 3PO4 A; 2LYA A; 3AM9 A; 1SL1 A; 1QQ5 A; 1BPZ A; 2C28 A; 2R18 A; 1V38 A; 4QZC A; 2W04 A; 5J2F A; 1RDF A; 3UPQ A; 8ICN A; 5DG9 A; 1NK7 A; 1ZQR A; 4TUS A; 2ODG A; 3OSN A; 1JRO A; 4DSI A; 3VC8 A; 3SEI A; 4DL6 A; 4DCC A; 1U4B A; 4P0P B; 4TUP A; 2C2R A; 1DK3 A; 2WHE A; 4MFA A; 2WAQ F; 2VIX A; 3RFA A; 2E5S A; 3ETL A; 2LI6 A; 1F0M A; 5C0Y A; 2XY7 A; 1ZD5 A; 1WUD A; 2K4P A; 1QSY A; 5KFY A; 1ECW A; 3ONN A; 5EWF A; 5DGA A; 4ED7 A; 1C7Y A; 2XGQ A; 4TUQ A; 4LJX A; 4F3O A; 2JEJ A; 4KLH A; 4RPY A; 3IG5 A; 3Q8R B; 3VCB A; 1L3V A; 4C8N A; 4MF2 A; 2HCF A; 9ICK A; 3PX6 A; 4IL6 U; 1Q3U A; 2WF8 A; 4US9 A; 7ICS A; 3J81 j; 1BPB A; 1KL9 A; 5G5H A; 4R8U A; 2NV3 A; 2EDU A; 4GXK A; 3PY8 A; 3ZD9 A; 3UXO A; 5KFB A; 2FMS A; 1ZYQ A; 1ZQB A; 3H4D A; 3RB6 A; 2BCV A; 2MA1 A; 1HUO A; 8ICY A; 7ICP A; 5B66 U; 2W54 A; 1L8L A; 8ICB A; 9ICG A; 2QB0 B; 4J9L A; 2KVS A; 3V7J A; 5KG5 A; 3BQ0 A; 4RQ6 A; 2L5Y A; 4IQV A; 3PZP A; 4UB8 U; 4QWB A; 5ALF A; 4KN7 A; 2W3S A; 2B6G A; 2LHT A; 3SD7 A; 3OSP A; 1HJP A; 2DL0 A; 1D9F A; 4M2Y A; 5KFX A; 7ICM A; 5CR0 A; 5J2G A; 2KJ9 A; 3Q8M A; 4OCZ A; 4TQS A; 1ZQJ A; 4F5Q A; 1NKC A; 5J2C A; 1Y88 A; 5AKK A; 4WJ3 B; 2LPE A; 2HBK A; 4NLZ A; 2FDR A; 3M9O B; 8ICU A; 3NAS A; 5ALU A; 2KHV A; 2NO5 A; 4P0P A; 3QEB Z; 1UA1 A; 2ES6 A; 5ALZ A; 4F92 B; 5KFG A; 4NL9 C; 4O3M A; 4BX9 C; 2CRX A; 5DG7 A; 3LYS A; 4UAY A; 3AEV A; 2F1J A; 7ICH A; 2QLT A; 2OWO A; 2HOI A; 5L1J A; 4DOA A; 4YR3 A; 9ICC A; 4IQT A; 5J2E A; 1YZ7 A; 2D6F C; 5KFL A; 1KFD A; 4EBD A; 2VJ5 A; 2W9C B; 1SL2 A; 4UW9 A; 3Q8K A; 1S77 D; 1FFV A; 3WKC A; 3BS7 A; 5T14 A; 3M9N B; 1JAL A; 2HSZ A; 3PR5 B; 2ZJA A; 8ICG A; 5KFO A; 2XVT A; 4R65 A; 5DBA A; 3V6H A; 1Z4N A; 5IIK A; 2KHQ A; 3F5E A; 3FDS A; 2K8C B; 3U26 A; 2QB0 A; 4O3R A; 4Q44 A; 4PZO A; 3F2C A; 1N60 A; 2GH1 A; 5DLG A; 1DGS A; 4Y2X A; 4I27 A; 5IIO A; 7ICE A; 3PW5 A; 5ALW A; 4F4W A; 2E8N A; 4QZG A; 3V6J A; 1RQL A; 2ATL A; 3D2N A; 4F4Y A; 4KLM A; 2K4H A; 5CB1 A; 2HMX A; 5J0Y A; 2HHW A; 1DGJ A; 2KSO A; 4TUR A; 4IR1 A; 5IIL A; 4R64 A; 5AKJ A; 2KV2 A; 5B5E U; 2YTU A; 5JTI A; 1PK3 A; 5KNI A; 2R8G A; 1D8B A; 4C8M A; 2YQE A; 4EZ9 A; 3EYZ A; 5KAI U; 2PI4 A; 4F5O A; 5III A; 2KOB A; 2NRV A; 4QZE A; 4F93 B; 5HNK A; 2QAR B; 2BR0 A; 4Y2V A; 5AM0 A; 2ZTE A; 4O3P A; 9ICV A; 1FIQ A; 2AHO B; 3ORY A; 2JR5 A; 4UAZ A; 3H7I A; 5J8Y C; 2AU0 A; 5CP2 A; 2BQ3 A; 1NKB A; 3RJG A; 1ZD2 P; 3OJS A; 1TV9 A; 1SV0 A; 3ED5 A; 8ICF A; 1A76 A; 3H0R B; 4I2F A; 4Q45 A; 1NJY A; 4I28 A; 4MF8 A; 7ICN A; 1TAM A; 5DBB A; 4YD1 A; 2JEF A; 1MN8 A; 4PL2 A; 1XO0 A; 4QWC A; 3MR6 A; 4NM2 A; 3FAH A; 1NK6 A; 1L7M A; 4Y2J A; 1ZQQ A; 9ICU A; 5ALQ A; 3KFU F; 4UB4 A; 4GLX A; 5ALG A; 4YR0 A; 2AH5 A; 1COK A; 4ECZ A; 1OXJ A; 2FI1 A; 4G3I A; 2AGP A; 9ICF A; 8ICK A; 4NJ8 A; 3OJU A; 5AKL A; 1TAQ A; 3OTQ A; 4O3Q A; 9ICI A; 3M1Y A; 5CHG A; 2JEG A; 1JXL A; 3PSF A; 4DQI A; 5AI4 A; 2PXI A; 4IRD A; 2MSN A; 4I2D A; 1BPD A; 4C4T A; 2DKZ A; 5KG4 A; 4A8E A; 4UAW A; 5AKG A; 2OHF A; 1KSP A; 2DPJ A; 3TAD C; 1T3Q A; 5J2H A; 4I2J A; 5J0X A; 1ZJM A; 4DL2 A; 2K4E A; 5AIB A; 4UQG A; 4ECR A; 2Q0Z X; 2V4Q A; 1ZQY A; 5DG8 A; 2BZF A; 1ZQU A; 5KG7 A; 3IRU A; 1SKS A; 3EZ5 A; 4RUA A; 1ZQM A; 2AGQ A; 1D8L A; 1GO3 F; 2XY5 A; 4ELT A; 2LYB A; 3GII A; 3QUT A; 2QAR A; 1ZD4 A; 1PK1 B; 2D8C A; 1NZP A; 3H8J A; 5ALH A; 2VKQ A; 2ZIX B; 2PFO A; 2Y9T A; 2QB1 A; 5AM2 A; 4MEX A; 4ACO A; 8ICH A; 1P7D A; 2ZIV B; 1QLN A; 3QX7 A; 5J2B A; 4ED6 A; 5L1K A; 2YB1 A; 1X42 A; 2HI0 A; 5ALN A; 2KD1 A; 1XNS A; 5G5G A; 4DOB A; 5AM5 A; 4EEY A; 4YXJ A; 1SKR A; 3KTQ A; 2HOQ A; 4Z6D A; 2LKY A; 4EYI B; 4I2E A; 3M9M B; 1NK9 A; 5AI0 A; 4J9Q A; 2KNJ A; 4RQ0 A; 1WCN A; 1WYG A; 5KT5 A; 4DSL A; 1J2N A; 9ICE A; 2KZZ A; 2BKE A; 1DRG A; 1DXS A; 2AXT U; 4IQU A; 1XWL A; 2MAX A; 5F3X B; 3M8S A; 2YN4 A; 2ZTC A; 3HIL A; 1IM4 A; 2JRZ A; 3RBE A; 4OJ6 A; 5ALY A; 5KG2 A; 1RXV A; 4C8L A; 4Q43 A; 1QTM A; 3H8M A; 4UBB A; 5J0T A; 2F8L A; 4QZ9 A; 2ZTD A; 4F5N A; 1SXD A; 4ED3 A; 3PML A; 3BQT A; 1JX4 A; 5HML A; 3L4P A; 2ESE A; 4DF4 A; 4O5C A; 3I28 A; 3IG8 A; 5ALT A; 2M9N A; 4F5P A; 4DFM A; 3M8R A; 3TFR A; 2FLN A; 4Z6C A; 1RYU A; 3BJY A; 1KFT A; 5AK5 A; 1NI3 A; 3C21 A; 2E8P A; 2JZB B; 5IIJ A; 4OO1 J; 3PNC A; 1XSL A; 3T5J A; 1PK1 A; 2VA3 A; 4RQ3 A; 4LVS A; 3T79 A; 4IR9 A; 1S5L U; 2ZIX A; 5DDM A; 4YVZ A; 5KG1 A; 1ZQC A; 3TFS A; 2AQ0 A; 2MUT B; 2W11 A; 3RH4 A; 1L3U A; 5AK4 A; 2ZIV A; 3QU2 A; 3UMB A; 4RZR A; 3RAQ A; 4P0Q A; 4DSF A; 5AKI A; 1C20 A; 2W7O A; 1L7P A; 1O03 A; 3SR6 A; 3FM9 A; 2ZIU B; 3KKA A; 1ZQH A; 4HAI A; 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2QKQ A; 4KIT B; 3PV8 A; 2WF6 A; 2Y1J A; 4AYB C; 2OEH A; 5KT7 A; 1SGG A; 3T5H A; 4EEN A; 3CP8 A; 2B0C A; 2VJ4 A; 1ZQG A; 1SB3 C; 2IBK A; 3H40 A; 2FLP A; 3SAH A; 2CN1 A; 3M7D A; 4DFP A; 5TZV A; 4F71 A; 2XID A; 2LM4 A; 2W55 A; 4JMU A; 4AYB F; 1Z00 B; 3WK7 A; 4YMO A; 3H4B A; 1Z19 A; 2DKX A; 3WK6 A; 7ICQ A; 5HR7 A; 3SMV A; 2K4I A; 1L7O A; 2KKV A; 3DV9 A; 3H8W A; 2W8L A; 5ALV A; 5DB6 A; 2H3F A; 3RR8 A; 2MRL A; 2R8I A; 5DB7 A; 1ZQV A; 3F2B A; 3HJE A; 4TQR A; 5L1M A; 3HP6 A; 5DB9 A; 2YMP A; 2KP7 A; 1OW5 A; 3PW0 A; 2JHD A; 1B4F A; 5DKW A; 2HOF A; 3KZX A; 1QCK A; 3MR5 A; 1NNL A; 3AQE A; 3BS5 B; 1U47 A; 2PFN A; 4MEY A; 4PH5 A; 5H2F U; 2XCA A; 1L3T A; 3NVV A; 2WB1 C; 8ICR A; 2BDU A; 3KHH A; 1BNP A; 5L1I A; 4F72 A; 1BNO A; 3HRD D; 4XUS A; 2GO7 A; 2N1R A; 3RH5 A; 4UAU A; 1ZQX A; 3QU9 A; 5AM4 A; 4M9L A; 4F91 B; 4EBE A; 4F4X A; 3QZ8 A; 3GIJ A; 4B9S A; 4P2H A; 2FJ6 A; 3NVZ A; 2R8J A; 1NK5 A; 4Y2Y A; 4OJO A; 1RG6 A; 2WB1 F; 4ICA A; 3QZ7 A; 3RB4 A; 1MA7 A; 5KFV A; 2EH9 A; 1ZQP A; 4KLT A; 1KW4 A; 5AK3 A; 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