The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
85
|
structure length |
85
|
Chain Sequence |
RVTVKYDRRELQRRLDVEKWIDGRLEELYRGREADMPDEVNIDELLELESEEERSRKIQGLLKSCTNPTENFVQELLVKLRGLHK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution NMR Structure of the Myosin Phosphatase Inhibitor Protein CPI-17 Shows Phosphorylation-induced Conformational Changes Responsible for Activation
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CPI-17
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Sus scrofa
|
| total genus |
20
|
| structure length |
85
|
| sequence length |
85
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | CPI-17 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1K5O A; 1J2M A; 2RLT A; 1J2N A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3K4G A; 4EEY A; 3F53 A; 3HX0 A; 2YMM A; 4UAW A; 3HPO A; 5BPC A; 5J2I A; 3JPQ A; 4NLC A; 1NK8 A; 2XVT A; 3PW5 A; 4RU9 A; 1TK5 A; 2Y1I A; 2YX8 A; 4MFA A; 5AI8 A; 2NRV A; 3M9N B; 4I29 A; 4Y2J A; 2FLP A; 3D6J A; 5D46 A; 2HHV A; 2LPE A; 3ZDA A; 3TFS A; 4J9R A; 4CF4 A; 3HKZ F; 3RH6 A; 2KFN A; 2GWS A; 5DLG A; 1GO3 F; 1J2N A; 5J0W A; 1YZ6 A; 2QLT A; 3C5F A; 2JRZ A; 2G5H B; 4RT3 A; 2V4R A; 4O5C A; 3QU7 A; 4O3P A; 2MU2 A; 1QSL A; 1T8E A; 2A1J B; 4UW9 A; 3TAQ A; 2HHT A; 3CRX A; 7ICS A; 1V85 A; 1NJY A; 4DL4 A; 2FLN A; 5GTI U; 2K4E A; 3QUQ A; 4DWI A; 2B6G A; 2W03 A; 3UMB A; 4EZ9 A; 4JV1 A; 4CNQ A; 4DSI A; 3ALR A; 4BX9 C; 2W9M A; 4C4R A; 3H0L B; 3Q8M A; 4P0Q A; 2FPL A; 4CF3 A; 4KX3 A; 4RT2 A; 3RR8 A; 3FDS A; 3GV5 B; 1KRP A; 5AI4 A; 4DSE A; 4DFK A; 1QCK A; 3UM9 A; 4EEK A; 4ECV A; 3EZ5 A; 1UQV A; 4M9G A; 3QUB A; 1P7D A; 2EAO A; 4DOC A; 9ICB A; 4M04 A; 2M0N A; 1SWW A; 1ZQA A; 2PMZ C; 4DL2 A; 1KEJ A; 3PVX A; 4J9N A; 2ZUD A; 5J2D A; 4KLF A; 4X5V A; 1TK8 A; 4J9O A; 8ICB A; 4I2B A; 1KN5 A; 3RAQ A; 1ZQV A; 2Y9U A; 4MEY A; 3TFR A; 1KW4 A; 2R8G A; 4PGX A; 3PV8 A; 4P0P A; 2BQR A; 2K89 A; 1T4G A; 1T3N A; 1C20 A; 5HR7 A; 5J2A A; 5GTH U; 3QE9 Y; 4UBB A; 2VA3 A; 1ZQY A; 4TUR A; 2DGZ A; 1U47 A; 3N7R C; 4HAI A; 3FC4 A; 3GDX A; 1ZXI A; 3WKD A; 3LWM A; 1ZQF A; 4TUS A; 2OWO A; 9ICV A; 2F2A B; 2BDU A; 2KN7 A; 4NM1 A; 2I6X A; 1DOQ A; 4J9Q A; 4EBC A; 5AKX A; 5ALY A; 2ZIX B; 5ALO A; 2FI1 A; 1TE2 A; 1RM6 C; 5ALF A; 2ALZ A; 1FFV A; 4Z6D A; 4R63 A; 3RBD A; 1JRO A; 4ACO A; 3MFH A; 7ICO A; 3RJK A; 3F2B A; 4M9H A; 3PMN A; 5J2B A; 4BWM A; 5J0R A; 2NRT A; 3K75 D; 3RRG A; 4C8O A; 1Y88 A; 2CXY A; 1RYS A; 5J2J A; 4BXO B; 3KKA C; 4F5O A; 3MBY A; 4K4H A; 5AI9 A; 3PW4 A; 2KTQ A; 1ECW A; 4ECT A; 2ZIW A; 2AGQ A; 2WAQ F; 1X9W A; 4F2S A; 4M9L A; 8ICO A; 2KOB A; 3KTQ A; 3SAF A; 3SAH A; 5AKY A; 3AQE A; 3M1Y A; 5AI5 A; 3MFI A; 4NLG A; 4DFD A; 4KN4 A; 4RQ4 A; 5EE9 A; 3N7S C; 2AU0 A; 2G07 A; 2EAM A; 2KIW A; 2W7O A; 3HRD D; 4M6W B; 1WCL A; 1WYG A; 1JUD A; 1MQ3 A; 3QX7 A; 4LZD A; 3S6J A; 3SMV A; 3MGH A; 1L7M A; 4Y2V A; 3RJJ A; 9ICS A; 2AHO B; 4RQ7 A; 1ZOL A; 4FBU A; 2HBL A; 4PL2 A; 2N1R A; 4K4G A; 5F3X B; 1X6I A; 7ICH A; 4BGD A; 5AI0 A; 3M8R A; 1S9F A; 2D6F C; 2NO5 A; 2E8O A; 2K60 A; 3IDW A; 2KSO B; 2L5Y A; 2MSN A; 5KT3 A; 4RQ5 A; 1TV9 A; 4F91 B; 4IR9 A; 3V7J A; 4YFK A; 3SEN A; 1V38 A; 3ZDD A; 2RLT A; 2WF9 A; 2J6U A; 1B4F A; 3NRZ A; 4CF5 A; 3PW0 A; 2JMG A; 3LYS A; 3UQ0 A; 5KFS A; 4TQR A; 1L5U A; 2YTU A; 4ELU A; 1L3V A; 2KVS A; 2B21 A; 2LYB A; 1ZQL A; 3CP8 A; 3EW9 A; 3QU5 A; 1U48 A; 3RJH A; 3OHB A; 1LKY B; 5KFG A; 4BDP A; 7ICT A; 2KG5 A; 5EE0 A; 2M9N A; 4BWJ A; 3H8J A; 3ZD8 A; 1KQQ A; 1PK3 A; 4EEN A; 2EDU A; 4PJ0 U; 1ZJM A; 1ZD2 P; 4C4T A; 4KLG A; 3TI0 A; 4Q45 A; 2J6T A; 5KT7 A; 4RQN A; 1ZD4 A; 4UB3 A; 4DF8 A; 2XO7 A; 2FPK A; 1ZQP A; 3BQ7 A; 2LM1 A; 2LMR A; 5KT5 A; 3GU3 A; 1SWV A; 3TAC B; 2HOQ A; 3PSF A; 1IXR A; 4YMM A; 3Q8R B; 4QIW F; 5KL1 B; 3BQ2 A; 2KKP A; 1ZQZ A; 2ZG6 A; 4CCH A; 4OJ6 A; 4KX5 A; 3C1Z A; 8ICH A; 2K4I A; 2NRX A; 3GIK A; 9ICC A; 4RNN A; 4R64 A; 3T5J A; 3MDA A; 4M47 A; 4B9T A; 2LHT A; 4UB2 A; 5AK6 A; 1D9D A; 1S0V A; 4USA A; 2W9C A; 2NRZ A; 2K4P A; 4Y2R A; 2EQY A; 4UAZ A; 2C28 A; 9ICO A; 5DB9 A; 1BNP A; 2F8K A; 1Z00 A; 4GIB A; 1SL0 A; 2XGP A; 4EBE A; 1SV0 C; 3OHA A; 1XNS A; 3AUO A; 1JXE A; 1X2I A; 2QB1 A; 4B6J A; 8ICG A; 2GOL A; 2BPC A; 4C7Y A; 2YY6 A; 1RG6 A; 9ICI A; 4QW8 A; 4M2Y A; 5DG7 A; 2LKY A; 2A1A A; 2OYY A; 5L9X A; 4QZB A; 4RPX A; 4IQT A; 2JHD A; 3KHL A; 5AKH A; 2I1Q A; 3KD3 A; 4U6P A; 4F4W A; 4I2E A; 4F92 B; 3D2S A; 1RQN A; 2FPM A; 3RH5 A; 5AM3 A; 1U45 A; 3NAS A; 1U9L A; 9ICW A; 2P6U A; 5CA7 A; 3NS1 A; 5EWF A; 1A6S A; 1L8L A; 2WF7 A; 5KFH A; 3HT3 A; 2KIC A; 4YXM A; 2VIX A; 5J0Y A; 3PSP A; 5DKW A; 3QU4 A; 8ICI A; 4FO6 A; 2JV3 A; 5KFA A; 3THV A; 5ALN A; 3C2K A; 2WFA A; 8ICN A; 4DOA A; 1SXD A; 2HW3 A; 2Y9T A; 2KNJ A; 5IIL A; 2ISO A; 1ZJN A; 4DO9 A; 4YG2 A; 3SD7 A; 5J0S A; 5AHX A; 5CB1 A; 4ECZ A; 3RFA A; 5AM5 A; 3QZ8 A; 1RXW A; 4IR1 A; 5CEH A; 5L1K A; 1JRP A; 2WHE A; 2CPR A; 2LI6 A; 2W04 A; 8ICL A; 4DFP A; 2BR0 A; 2ASD A; 5J2G A; 4JWN A; 4US9 A; 4I2C A; 2ZJ5 A; 4UAR A; 1F5S A; 5J0Q A; 2ZIU A; 2IHM A; 4DL6 A; 5IIN A; 1L7P A; 2HHQ A; 3C2M A; 3JPT A; 1NOM A; 4I2F A; 2H3V A; 4R65 A; 2GO7 A; 5J0O A; 5KNI A; 2EZY A; 3MC1 A; 2I9G A; 4C8M A; 8ICQ A; 5JRT A; 4ECR A; 2CRX A; 2W9B B; 1UT5 A; 5F9N A; 1S10 A; 3L5K A; 2ZJA A; 4Q8E A; 3ZDC A; 2IOF A; 3M6Z A; 4NJ8 A; 5B5E U; 4G3I A; 4C4S A; 1Z3E B; 1Z19 A; 4U7C A; 1ZQU A; 2WAQ C; 5L1M A; 3VC8 A; 5AKL A; 1ZYQ A; 5KFK A; 1BPX A; 1MN8 A; 1T3Q A; 2HHX A; 1NJX A; 3UXN A; 5AIC A; 3A0H U; 3EUB 2; 2OHF A; 4EYI B; 4IRC A; 4EEL A; 4KLM A; 7ICF A; 2KMD A; 3ONN A; 5ALW A; 1ZQJ A; 2WB1 C; 2O6K A; 4ED3 A; 1JI7 A; 8ICX A; 4KLS A; 4I2J A; 4OJ5 A; 2ZUB A; 2MUT B; 4FZL A; 3ZI4 A; 3QZ7 A; 2XY6 A; 2KK0 A; 1J2M A; 3T3F A; 2XCA A; 8ICT A; 4GXJ A; 3GV7 B; 4F2R A; 4UAY A; 4Z6F A; 2E5S A; 4QNL A; 1ZQO A; 5EOZ A; 4NLN A; 1K1S A; 5ALH A; 3NVV A; 5AM0 A; 4UAV A; 4ED0 A; 5DGB A; 5KTQ A; 4UB5 A; 1ZET A; 1HUZ A; 2PFP A; 3BQT A; 3E58 A; 2DPI A; 1SKR A; 1X40 A; 2BKE A; 5KFQ A; 2HVH A; 4PHE A; 4DLG A; 1L7N A; 2GH1 A; 2FMP A; 5L1I A; 3IV6 A; 1PUZ A; 3O0F A; 2OH2 A; 3RH4 A; 3KHG A; 2JZB A; 2JXJ A; 3OJS A; 5III A; 3AU2 A; 2HDO A; 3PX6 A; 1NNL A; 3PR5 B; 1S0O A; 4GXI A; 5KT2 A; 3IG8 A; 4NV0 A; 1KFD A; 3H7I A; 5HML A; 5B66 U; 2K8C B; 9ICJ A; 2ATL A; 1NZP A; 4I2D A; 3ISC A; 2P66 A; 2BQU A; 2E8N A; 2ZUC A; 4KLL A; 4EX6 A; 8ICY A; 2PI4 A; 2AGO A; 1ZQQ A; 2Y0S F; 1BPB A; 1ZQM A; 3J81 j; 3NVW A; 1Z4N A; 2ZIV B; 5DBC A; 3K1Z A; 4OO1 J; 2G08 A; 2P6R A; 4IQV A; 1JXL A; 1IG6 A; 2UVR A; 2ZJ8 A; 2FMS A; 3SV3 A; 3ZDB A; 2BCS A; 3PY8 A; 4QZD A; 4B9V A; 5AKZ A; 2QAR B; 3C21 A; 1NK7 A; 8ICC A; 3QUT A; 9ICF A; 5J8Y A; 4E0D A; 1D8Y A; 3WK8 A; 4NM2 A; 4M9J A; 4Y2P A; 2PXI A; 4ICA A; 5D49 A; 1SV0 A; 2C22 A; 4K4I A; 3ETR A; 4IRK A; 5IIM A; 3Q8P B; 3BJY A; 2UVU A; 2E1F A; 4OCZ A; 3NTU A; 4QZ9 A; 2G06 A; 4Q44 A; 2H3Z A; 1ZQW A; 4JUZ A; 3WK9 A; 5L1L A; 1SGG A; 5KT6 A; 1K5O A; 4QW9 A; 1LB2 B; 4M6W A; 1RYR A; 1BPD A; 2NYV A; 1SZH A; 1UPH A; 4DS5 A; 5KFR A; 4IQU A; 4DFJ A; 3LVW A; 4J9L A; 3BS5 B; 4I2I A; 3CW2 C; 3DV9 A; 1N5W A; 4DSF A; 1TAM A; 4MFC A; 5EE1 A; 4ECX A; 4IQW A; 2BCR A; 5E79 U; 5J2K A; 3M9M B; 4Y2Y A; 3OJU A; 5DBB A; 4F5R A; 4FS2 A; 4F4Y A; 4DF4 A; 1ZRM A; 4RZR A; 3PNC A; 1URJ A; 5D4B A; 1QSY A; 3IM1 A; 2XIC A; 3N97 B; 3F2D A; 8ICA A; 1T7P A; 1NKC A; 1ARO P; 2VAN A; 7ICL A; 1FIQ A; 2ASJ A; 3I28 A; 1DK2 A; 4B9M A; 8ICS A; 1ZQG A; 3DDH A; 2FLL A; 2QB0 B; 4JV2 A; 5AK5 A; 5IIO A; 5DG9 A; 4YQW A; 2KFZ A; 2W55 A; 2GLE A; 8ICJ A; 1V9P A; 4PPX A; 5DBA A; 2W54 A; 3PSI A; 1NK5 A; 4RPZ A; 1PVR A; 1FO4 A; 9ICR A; 7ICU A; 5KFU A; 2B0C A; 5J2E A; 4PL1 A; 2PKE A; 2RDJ A; 4KIT B; 4P0Q B; 3WKA A; 2F76 X; 1D9F A; 2DFL A; 1S5L U; 1QQ5 A; 3M7D A; 1HIW A; 2OEH A; 4RNO A; 5CRX A; 4OJP A; 1DGJ A; 3OSN A; 1ZD3 A; 1WWV A; 1XWL A; 5DDY A; 3NRW A; 4I2H A; 5HHI A; 2ZXH A; 5KFE A; 3V7K A; 2RQ5 A; 1S97 A; 5BOM A; 5AKE A; 4C8L A; 4NL9 A; 2VJ5 A; 2G0A A; 4ZH4 A; 5ALP A; 5TZV A; 4QZI A; 1C7Y A; 4G9B A; 1ZQ1 C; 1NJW A; 4XRH A; 4ECS A; 3QEB Z; 2HCF A; 3HW8 A; 1S0M A; 4I2G A; 3AEV A; 5AKJ A; 1DRG A; 1U4B A; 9ICA A; 3G6Y A; 4NWI A; 4O3R A; 3SQI A; 3T5H A; 4KLI A; 2BPF A; 3HIL A; 1ZQE A; 4P0P B; 4F93 B; 4YR0 A; 2EZX A; 2XY7 A; 4O3M A; 2BQ3 A; 2RHF A; 3WKE A; 5ALU A; 4PZN A; 4M0A A; 4A8E A; 1S77 D; 2A3V A; 4Y2U A; 2DWQ A; 5DB7 A; 4XA5 A; 5J2F A; 1SB3 C; 1Z4O A; 3PO5 A; 1KDH A; 4DFM A; 3PW2 A; 4B9N A; 3GIJ A; 5KFD A; 2EAP A; 1SZP A; 5KFF A; 3NVZ A; 1NK0 A; 4KLT A; 1COK A; 2KZ3 A; 3VCB A; 9ICH A; 2VA8 A; 2ZTC A; 3V6J A; 2AQ0 A; 2C2E A; 4P2H A; 2KHV A; 5TIS U; 2XY5 A; 3UXP A; 2DQN B; 4YMN A; 3M9O B; 5KG7 A; 2JR5 A; 4UB4 A; 4ECQ A; 3HKZ C; 2E8P A; 5AKG A; 1JAL A; 1ZQX A; 3D2Q A; 5DQH A; 2ES6 A; 5HNK A; 3H8M A; 4QWA A; 3Q8S B; 3MGV A; 5AIB A; 4R8U A; 2FMQ A; 1ED1 A; 2KD1 A; 3HJE A; 3JPN A; 2W7P A; 3WK5 A; 4RNM A; 1IV8 A; 2W11 A; 4PHD A; 3R9K A; 3CYM A; 3RJI A; 2HBK A; 4RQ8 A; 3IN5 A; 1L6N A; 1NK4 A; 1TAQ A; 5C5J A; 4AYB F; 4KLO A; 2JH1 A; 4DOB A; 3JPS A; 2YQE A; 4NXZ A; 2HOI A; 3RJE A; 2JEI A; 3MR5 A; 1BNO A; 1L8O A; 2V9W A; 4CE6 A; 4I27 A; 4QWD A; 1CRX A; 2ZIW B; 3PST A; 8ICR A; 4P4O A; 1TKD A; 5J8Y C; 1QLN A; 1N62 A; 5FP0 A; 3QNM A; 7ICK A; 5J2H A; 1QQ6 A; 3SI8 A; 3OSP A; 2Y0S C; 5ALM A; 3NUQ A; 3IP4 B; 4RQ1 A; 2W9A A; 5T14 A; 4CRX A; 2YB4 A; 4QZC A; 3L3F X; 4OJL A; 4NY8 A; 3RBE A; 1PK1 A; 5ALI A; 3KBB A; 4BUG A; 4DSK A; 2PMZ F; 2ZTD A; 1L7O A; 3ISB A; 2K8B B; 2MRL A; 2F1J A; 5IIK A; 4DL5 A; 4P4M A; 2KHQ A; 1RPL A; 3LDA A; 4RUA A; 3CNH A; 4QJF B; 3RJF A; 1DGS A; 1MC8 A; 1TAU A; 5ALG A; 1UT8 A; 1KFS A; 5JUM A; 4XQ8 A; 2F44 A; 4DS4 A; 3WK7 A; 4CGZ A; 5ALT A; 4KLJ A; 5KFC A; 1PVQ A; 4KLQ A; 4ECW A; 2KKV A; 5F9L A; 2DUY A; 5KG0 A; 1OUQ A; 3KHH A; 3QEA Z; 9ICM A; 7ICV A; 3KOO A; 1NKE A; 4C8K A; 2IBK A; 1D8B A; 3AN1 A; 5H2F U; 3EPI A; 1AQ6 A; 3OPX A; 3TKA A; 4RQ0 A; 9ICU A; 4QZA A; 4RQ3 A; 3TAR A; 4ELT A; 7ICG A; 1Q3V A; 4OD0 A; 1PVP A; 5KFB A; 2HI0 A; 3WU2 U; 4UB8 U; 5ALV A; 5KFV A; 4GXK A; 5KG2 A; 3FM9 A; 1VDV A; 4OJO A; 1S8O A; 5DQI A; 2H3I A; 1HEK A; 4I28 A; 4O3S A; 2A19 A; 4YD1 A; 3C28 A; 2RDI A; 1RDF A; 4QWC A; 3IRU A; 3QU2 A; 3T5L A; 1ZQB A; 2HBM A; 3UXO A; 1SKS A; 4R66 A; 3EWA A; 5AM2 A; 5ALE A; 2IOF K; 1UA0 A; 4FFD A; 1RQL A; 3QYP A; 1QQ7 A; 5BOL A; 2HSZ A; 5KFI A; 4UB6 U; 4EYH B; 2IMW P; 4EZ6 A; 5ALK A; 1NK9 A; 3KFU F; 5AK3 A; 2A1J A; 4ED1 A; 3RB3 A; 1NK6 A; 3EYZ A; 3A0B U; 2JEJ A; 2LYA A; 5ALJ A; 2DF4 B; 1ZD5 A; 3JPO A; 1ZQN A; 1BVS A; 1JIH A; 4YCX A; 4KLE A; 3ISD A; 1XS9 D; 2W8L A; 3MR2 A; 2BDP A; 2W3R A; 3FAH A; 5DB6 A; 5CP2 A; 4KLU A; 3BZK A; 4KLD A; 1DXS A; 4NLB A; 3PZP A; 1KBU A; 1Q3U A; 2W9C B; 7ICM A; 4ELV A; 4NL9 C; 5KFY A; 1L3S A; 3SR6 A; 2HVI A; 2IHN A; 3NVY A; 2BPG A; 2D3D A; 3C2L A; 1Z00 B; 4KN7 A; 2XCP A; 1N5X A; 3M6K A; 1X66 A; 4MHV A; 4ED2 A; 3C1Y A; 7ICJ A; 2R8I A; 3I76 A; 2BZF A; 4F4Z A; 3QXG A; 2C2R A; 1X9X A; 5DDM A; 4YD2 A; 4MEX A; 1B0X A; 4Y2Q A; 2HHS A; 5EWE A; 3AMZ A; 1D8L A; 3RJG A; 1QSS A; 2JEG A; 3HP6 A; 4C8N A; 3MR3 A; 1TK0 A; 5KFL A; 3PO4 A; 2LYH A; 5AK4 A; 2AQ4 A; 5J0X A; 2YMQ A; 3GQC A; 3Q8K A; 7ICP A; 3V6K A; 1RYU A; 5CR0 A; 5KFX A; 2E3T A; 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