The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
85
|
structure length |
85
|
Chain Sequence |
RVTVKYDRRELQRRLDVEKWIDGRLEELYRGREADMPDEVNIDELLELESEEERSRKIQGLLKSCTNPTENFVQELLVKLRGLHK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Sus scrofa
|
| publication title |
Solution NMR Structure of the Myosin Phosphatase Inhibitor Protein CPI-17 Shows Phosphorylation-induced Conformational Changes Responsible for Activation
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CPI-17
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| total genus |
20
|
| structure length |
85
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| sequence length |
85
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | CPI-17 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1K5O A; 1J2N A; 1J2M A; 2RLT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4F4Z A; 4PHA A; 1S8O A; 1S97 A; 4DQP A; 2IHN A; 2EAN A; 2E1E A; 1F44 A; 4OO1 J; 1NK6 A; 3HT3 A; 2ZIX A; 2EQY A; 1T4G A; 3MC1 A; 4UB6 U; 4QZF A; 4RQ5 A; 5TIS U; 4Y2T A; 1CUK A; 4QZI A; 5ALJ A; 3MFH A; 1SIJ A; 5KL1 B; 4NLG A; 2KVC A; 9ICX A; 1X42 A; 2YN4 A; 3UMC A; 4MEY A; 4LZD A; 3GV7 B; 4F4K A; 1RG6 A; 4JK1 A; 1LVH A; 2K4E A; 4IR1 A; 4F4Y A; 1L7P A; 4PZN A; 1L8L A; 5BOM A; 3NVZ A; 2GWS A; 1N5X A; 7ICF A; 3Q8Q B; 5G5G A; 3ZDD A; 5J2H A; 2EDU A; 4UAV A; 2YB1 A; 1N56 A; 4I2A A; 2LPE A; 3GDX A; 2AGP A; 2G0A A; 1Q46 A; 3HW8 A; 4R8U B; 1KEJ A; 3ZDE A; 3UMB A; 5KFY A; 1H38 A; 1RXW A; 1WG8 A; 5KNI A; 5CB1 A; 1ZQB A; 2LKY A; 4M6W B; 4R65 A; 3QZ7 A; 3UQ0 A; 5AI0 A; 4BX9 C; 3QX7 A; 4QWA A; 2BQR A; 3QUQ A; 3TAN A; 3G6V A; 1DRG A; 3BZC A; 1ZD5 A; 3TAC B; 5GTI U; 2RDJ A; 1UHU A; 8ICR A; 9ICO A; 2JEI A; 4JB3 A; 3GU3 A; 5DKW A; 3M9O B; 4DEZ A; 4B9T A; 1WYG A; 1NK7 A; 4M0A A; 2D8C A; 3KTQ A; 7ICK A; 2KVS A; 3E58 A; 3RAQ A; 1PK1 B; 4NJ8 A; 4ED2 A; 2OXO A; 2K8C B; 3RB6 A; 2ASJ A; 3PW2 A; 4DL6 A; 5AK5 A; 3T79 A; 3D6J A; 4JV0 A; 3MR2 A; 4DSL A; 3AU2 A; 4J9S A; 5ALS A; 1SL2 A; 9ICF A; 5KFW A; 2BPC A; 2FPK A; 3NVW A; 1XSL A; 5DB8 A; 3JPT A; 1MSW D; 4M9G A; 1NK4 A; 1X9M A; 2F8L A; 5IIM A; 2KP7 A; 3OTQ A; 4YD1 A; 3QZ8 A; 4DLE A; 1WUD A; 3ZDB A; 7ICS A; 3JPR A; 4C8L A; 4C8O A; 3IM1 A; 4RQ8 A; 2G08 A; 3KBB A; 1ARO P; 1ZQR A; 3RJG A; 5J0P A; 3H7I A; 1ZQA A; 2LI6 A; 4JV1 A; 5DGB A; 2F76 X; 2F44 A; 2FE9 A; 4ECR A; 3PY8 A; 4OD0 A; 8ICG A; 4MFA A; 1BVS A; 3JPQ A; 2WAQ F; 2V4Q A; 2H3Z A; 3GV5 B; 4F91 B; 4FE3 A; 5KG4 A; 4ECQ A; 5CJ7 A; 1X9X A; 1ZQW A; 2DUY A; 7ICJ A; 5J0O A; 1UA0 A; 4USA A; 2KSO B; 2HMX A; 3GFK B; 2NO4 A; 4X5V A; 4J03 A; 1OW5 A; 4DL4 A; 9ICQ A; 5DG7 A; 5J2E A; 7ICP A; 1SWW A; 2WF8 A; 5CR0 A; 4O3S A; 2KZ3 A; 1YZ6 A; 2XY6 A; 1ZQY A; 2E8M A; 2YMQ A; 4U6P A; 1X6J A; 3F5E A; 2VIX A; 2EAM A; 1LB2 B; 2R8H A; 4EEL A; 5J29 A; 5KG7 A; 2R8J A; 1JIH A; 4B9U A; 5AK6 A; 1RM6 C; 2HVI A; 2HOQ A; 1Z4O A; 3TFS A; 7ICI A; 2FDR A; 2HOI A; 1SWV A; 1NZB A; 2HVH A; 2KKP A; 3KOO A; 5ALI A; 8ICB A; 3RRG A; 1ZQV A; 2DKZ A; 2KFZ A; 3MDC A; 1ZQK A; 2AQ4 A; 1Y88 A; 3EZ5 A; 4FZM A; 2BCV A; 5EE1 A; 4ICA A; 5L1M A; 3GIM A; 3ISC A; 5DQH A; 4Q8F A; 8ICC A; 1Z4N A; 4DS4 A; 2G09 A; 5F3X B; 1YZ7 A; 4F3O A; 3JPS A; 2I1Q A; 4Y2U A; 1N62 A; 4QZ8 A; 4C8K A; 2KHV A; 1V85 A; 4GXK A; 5DB9 A; 3QUT A; 2EZX A; 3WK4 A; 2AJQ A; 1MA7 A; 2MA1 A; 4IL6 U; 5KFT A; 1ZQC A; 4OJP A; 1HEK A; 2DBY A; 1DXS A; 3KZX A; 1V9P A; 1KKX A; 2H3I A; 4UW9 A; 4P4M A; 1S10 A; 3JPN A; 2ZIU B; 3C5G A; 4M04 A; 2HBK A; 2GOL A; 2ESE A; 4KN4 A; 5G5H A; 2Y1J A; 5KFZ A; 1JUD A; 2E8N A; 4O5C A; 1MQ2 A; 1SZH A; 2KG5 A; 3F2C A; 5EE9 A; 2KE7 A; 4QJF B; 8ICO A; 1ECW A; 2DWQ A; 3QUB A; 1JRP A; 5JRT A; 5KFA A; 5KFB A; 1ZJN A; 2QB0 B; 4I2I A; 8ICT A; 3PNC A; 3AM9 A; 2HHQ A; 1ZQT A; 3S6J A; 4YD2 A; 3AU6 A; 4ED8 A; 2XIC A; 4PZO A; 2Y0S C; 2OEH A; 4IQT A; 2BQU A; 3SAF A; 3AQE A; 4YP3 A; 4I2F A; 5KFV A; 5EWE A; 2G5I B; 4CCH A; 1L3U A; 3GZF A; 4Z6F A; 4Z6D A; 3AQF A; 3RJI A; 4I2H A; 3QU2 A; 2OCE A; 4U7C A; 4ELU A; 3E2E A; 4O3O A; 5D4B A; 5J2B A; 4ECS A; 4I2G A; 2KN7 A; 4KLD A; 5KFS A; 3BQ0 A; 3D2Q A; 2BZF A; 3PX4 A; 3QU4 A; 2KTQ A; 4RNM A; 3ZDA A; 4MFC A; 3RRH A; 2E3T A; 3SI8 A; 3M1Y A; 4AYB C; 5KFX A; 5KG6 A; 3SAG A; 9ICL A; 1B0X A; 4FZN A; 8ICZ A; 3PVX A; 5DG9 A; 4B9V A; 4RQ1 A; 2GO7 A; 2W3S A; 3WK9 A; 9ICK A; 4KLS A; 2ZTC A; 4EYH B; 2QAR A; 1TAQ A; 5J0W A; 2ZIX B; 2F1J A; 4HAI A; 1A77 A; 3IG8 A; 1KFT A; 7ICG A; 2V4R A; 4BDP A; 3RBE A; 4EBE A; 1OUQ A; 1GO3 F; 3PST A; 4QWD A; 1T3N A; 4QWE A; 2KJ9 A; 1D8B A; 1ZD3 A; 3RB0 A; 4EBD A; 3IN5 A; 3OJU A; 4Y2R A; 4Y2V A; 4DFP A; 7ICR A; 4NLB A; 3SZ2 A; 2YQE A; 1NK0 A; 1FFU A; 4ECX A; 5ALH A; 2XID A; 7ICE A; 9ICM A; 8ICV A; 2HDO A; 2PMZ C; 3ETR A; 9ICG A; 1QLN A; 3NVV A; 1WCN A; 3KD3 A; 1L3T A; 4YR3 A; 4ECV A; 2NYV A; 4M2Y A; 4QZA A; 1SXE A; 1TAU A; 4YCX A; 4YN4 A; 4DOB A; 2JMG A; 5ALQ A; 5ALF A; 1EXN A; 5DBB A; 4MF8 A; 1UT5 A; 4QW8 A; 4KLH A; 5AKX A; 1NJX A; 4PGQ A; 2DKX A; 5AIB A; 9ICR A; 2ZG6 A; 2W7O A; 3LYS A; 3I28 A; 5KFL A; 4Y2Y A; 3M8R A; 3IP4 B; 1Z00 B; 2DF4 B; 4RQ6 A; 9ICN A; 2WB1 F; 2EAO A; 1DK2 A; 2HOF A; 3H0L B; 2AH5 A; 4J9L A; 3PR5 B; 2NO5 A; 4Y2J A; 2PI4 A; 9ICV A; 2DFL A; 2WF7 A; 1KLN A; 2F8K A; 4KTQ A; 3QXG A; 5JUM A; 2ASD A; 3BS7 A; 5ALW A; 3N97 B; 7ICO A; 1XO1 A; 2JH1 A; 1JRO A; 3K1R B; 4F2S A; 2ZXH A; 8ICS A; 2VA3 A; 3WKC A; 1S5L U; 2WTF A; 1U48 A; 2WHE A; 4EX7 A; 4GFJ A; 4ECZ A; 1UPH A; 1BPD A; 5KTQ A; 4C7Y A; 1LV5 A; 5KFQ A; 2AGO A; 3FM9 A; 5HML A; 1ZXI A; 4I2J A; 4DF8 A; 1SKR A; 1LKY B; 2DL0 A; 3H8S A; 1WWU A; 1SKW A; 3KHH A; 2D6F C; 1Q3V A; 1A76 A; 4O3P A; 5AM0 A; 1JI7 A; 5E79 U; 3TAR A; 4IRK A; 4F5R A; 5F9N A; 3RJK A; 1JX4 A; 2NRW A; 1Z3E B; 4DOA A; 4RU9 A; 5F9L A; 2MUT A; 2JEF A; 1ZQH A; 5CWR A; 3VCB A; 4F50 A; 4EEY A; 5IIK A; 4B6J A; 4K4G A; 3OSN A; 2BDP A; 5KFD A; 3QNM A; 8ICQ A; 4TQR A; 7ICM A; 4C80 A; 4MFF A; 3K75 D; 4KX5 A; 4CGZ A; 3V6K A; 4NLN A; 3PX6 A; 4NXZ A; 2JZB A; 2ASL A; 2K89 A; 3CNH A; 1L3V A; 4J9K A; 4J9Q A; 1ZQG A; 2W9A A; 5EE3 A; 5HHI A; 4TUQ A; 4KLF A; 3QEB Z; 4IRC A; 5ALT A; 1XU4 A; 4BXO A; 3TAP A; 4NM1 A; 1S77 D; 4IRD A; 1IV8 A; 1F5S A; 8ICH A; 3T5K A; 1M6Y A; 4UAT A; 1JXE A; 4DCC A; 1T3Q A; 2MU2 A; 1HUO A; 2B0C A; 1SXD A; 2C2D A; 3PZP A; 2CRX A; 2W8K A; 4B9S A; 9ICP A; 1J2N A; 4DQR A; 1QSL A; 4CF3 A; 3LDA A; 5CHG A; 1PUZ A; 4QZB A; 2ZIW A; 1L5U A; 4JWN A; 3JPP A; 5DQG A; 4C4T A; 5KG3 A; 2OWO A; 4DSK A; 4F4X A; 3HIL A; 4PL1 A; 3WKB A; 2ISO A; 5AI4 A; 4CE6 A; 2XO7 A; 3LVW A; 5J2D A; 4ACO A; 3PO4 A; 1DGS A; 3TAD C; 5D49 A; 5HR6 A; 4KX3 A; 5AIC A; 3GQC A; 3KKA C; 5KFM A; 2KZZ A; 1RQL A; 2F3N A; 5AIA A; 2YML A; 4JUZ A; 4RZR A; 4G9B A; 5KT7 A; 2PFQ A; 1BPY A; 2K60 A; 4QZC A; 4RQ4 A; 1BNO A; 2YB4 A; 1SKS A; 1SL0 A; 4IS7 A; 4RQ2 A; 2RLT A; 3BDP A; 1ZRM A; 4KMU A; 2BCR A; 4O3R A; 3ORY A; 5C5J A; 3C1Y A; 8ICA A; 1D9F A; 2I9G A; 2A19 A; 1ZQE A; 3BQ2 A; 5DBC A; 3N7S C; 5DB7 A; 1ZQN A; 2QB1 A; 3HKZ C; 1WWV A; 3PO5 A; 4DSE A; 1TK0 A; 1RYU A; 1VLB A; 4KN7 A; 2BPF A; 1TAM A; 3PR4 A; 3WKD A; 4QZE A; 4M47 A; 2VA2 A; 2BQ3 A; 1Z1V A; 4DL3 A; 2FJ6 A; 3HRD D; 2R8I A; 1S0O A; 5FP0 A; 4DLG A; 3H8J A; 2XY5 A; 2P66 A; 3QU7 A; 3PV8 A; 4C8M A; 1QTM A; 5H2F U; 3WK5 A; 2WF9 A; 1ZYQ A; 1ZET A; 3QUC A; 2P6R A; 1NK5 A; 4B9M A; 4DQS A; 4R63 A; 1UCV A; 3LK9 A; 3ALR A; 1ZRN A; 4EEN A; 1RXV A; 4ZOH C; 1CI4 A; 2W8L A; 4DFJ A; 2JXJ A; 5ALG A; 3FAH A; 4AP9 A; 3OSP A; 2Z7J A; 4P0P A; 2WF6 A; 2UVW A; 1DK3 A; 3MR6 A; 4KLU A; 4DS5 A; 4K4H A; 4KLL A; 1ZD2 P; 5AK4 A; 1PVP A; 2QKQ A; 3H0M B; 1XNS A; 2RP5 A; 4ZH4 A; 3SEI A; 5DLF A; 2IOF K; 4NM2 A; 3EW9 A; 4NL9 C; 4DL2 A; 2QAR B; 4EZ9 A; 3M6K A; 4BUG A; 2A1J A; 5AI6 A; 2IOF A; 3NS1 A; 5KT5 A; 8ICP A; 2A3V A; 3ISD A; 4P4P A; 4O5E A; 4KLQ A; 4QIW C; 4TQS A; 1J2M A; 3HX0 A; 4TUR A; 2XVT A; 2C2R A; 3B9J A; 3OHA A; 1XS9 D; 3LWM A; 1V38 A; 4JWM A; 1SZP A; 5CA7 A; 1S0V A; 1X40 A; 4O3M A; 1UA1 A; 2ZXI A; 8ICE A; 2NRX A; 3UM9 A; 4DWI A; 2KD1 A; 4RQN A; 4NY8 A; 2XCP A; 2FI1 A; 1XSP A; 4F93 B; 1COO A; 1F0M A; 3RB4 A; 1NKB A; 5KFJ A; 4CF4 A; 2D3D A; 1N2X A; 4ECW A; 4QWB A; 2BCQ A; 3U26 A; 2LYB A; 4I2B A; 3L5K A; 2IA6 A; 2FPL A; 2XGQ A; 2JEJ A; 4ECU A; 5III A; 4J9P A; 1NK8 A; 7ICT A; 2JRZ A; 4QW9 A; 5IIN A; 1NJY A; 7ICV A; 4RQ3 A; 2RHF A; 5AKE A; 3HJE A; 5ALX A; 1UQV A; 4C4R A; 5ALD A; 4F71 A; 1ZQJ A; 1QCK A; 2Y0S F; 3ZD9 A; 2KV2 A; 2MAX A; 1NNL A; 4ELV A; 2C28 A; 1N5W A; 3KHR A; 5BPC A; 3B0Y A; 3ISB A; 1NZP A; 3C23 A; 4TUS A; 4F72 A; 4I28 A; 1URJ A; 5ALM A; 3CRX A; 4EYI B; 1NI3 A; 3BQ7 A; 4M6W A; 5J0X A; 4B9N A; 1B22 A; 3TAD A; 3I1Y A; 4RNO A; 2HW3 A; 5KFK A; 3DV9 A; 4EZ6 A; 4Z6C A; 2LYH A; 3KKA A; 2W9B A; 2AHO B; 1MN8 A; 4ELT A; 3T3F A; 4AYB F; 2KNJ A; 5KG5 A; 5DDY A; 5K4L A; 3RJJ A; 1TE2 A; 1JAL A; 3PSI A; 4DFM A; 4P2H A; 2W43 A; 4UB5 A; 2R8K A; 3UPQ A; 2P35 A; 5AKG A; 1TK5 A; 3RR8 A; 1Q3U A; 5DG8 A; 5TZV A; 2LM4 A; 2CPR A; 5J0S A; 1ZQM A; 2H3V A; 4NLK A; 2RQ5 A; 3Q8S B; 1U47 A; 2Q4T A; 2J6U A; 4PHE A; 5J2J A; 4LJX A; 4RT2 A; 2OHF A; 1ZQD A; 1U49 A; 1SV0 C; 2ZIV A; 3MDA A; 1TV9 A; 2KIC A; 2VKQ A; 4Y2P A; 5EE0 A; 5EWF A; 2HBM A; 3OJS A; 5KG1 A; 2YMP A; 3IDW A; 5HR7 A; 3MR5 A; 4E0D A; 4XA5 A; 1FO4 A; 1PVR A; 3C2L A; 3RF9 A; 4R66 A; 3UQ2 A; 4YQW A; 2UVU A; 1X9S A; 1DOQ A; 1IG6 A; 1IXR A; 3CW2 C; 2PMZ F; 3SQI A; 3V72 A; 8ICU A; 2H5X A; 3BS5 A; 4O0I A; 4IC9 A; 3GIL A; 1QSY A; 2L5Y A; 4UAR A; 7ICU A; 3RJH A; 2HHV A; 2JZB B; 3FDS A; 4QZH A; 3NRZ A; 4OJO A; 5J8Y C; 2FMP A; 4YFK A; 5ALY A; 2FPM A; 5J2G A; 4BXO B; 2KOB A; 4EEK A; 1L8O A; 4F2R A; 1L3S A; 3G6X A; 3IHQ B; 5J0Q A; 2KSO A; 1NOM A; 3WK6 A; 1ZOL A; 2N1R A; 4M9L A; 1A6S A; 4QWC A; 2JH7 A; 4OJL A; 5AM1 A; 3NRW A; 4MEX A; 2ZJ5 A; 4KMO B; 4FS2 A; 4DO9 A; 2F2A B; 4KIT B; 4DL7 A; 3Q8P B; 5J0Y A; 3SD7 A; 4KLE A; 1RPL A; 1XO0 A; 2ZIW B; 2HHU A; 3PW4 A; 4UB4 A; 1O08 A; 3N4M B; 4DQI A; 4I29 A; 3M8S A; 5ALO A; 3TQ1 A; 1D8Y A; 2XGP A; 4P0Q A; 1KW4 A; 1B43 A; 5J2C A; 4F5P A; 1HIW A; 1S0N A; 4R64 A; 1YT3 A; 2BCS A; 2PFP A; 5A0L A; 2MRL A; 8ICN A; 1Q8K A; 5HP4 A; 2PI5 A; 3PMN A; 1ZQZ A; 3BQ1 A; 3TKA A; 4RPZ A; 1T7P A; 2W04 A; 2AU0 A; 3MGV A; 4FS1 A; 4NLC A; 3Q8M A; 2W03 A; 4RQM A; 1D8L A; 4UAW A; 4DL5 A; 2G5H B; 4NV0 A; 1XSN A; 3R9K A; 2KJ8 A; 1KN5 A; 5AM2 A; 1S0M A; 3BJY A; 1L7O A; 4LZG A; 3SAH A; 5AKH A; 4KLG A; 5AI5 A; 2GH1 A; 3Q8K A; 2KFN A; 1BPB A; 5L1J A; 1S76 D; 4GIB A; 2H3F A; 2ZTD A; 2ATL A; 3IRU A; 1N63 A; 3OHB A; 9ICU A; 3RBD A; 3M7D A; 1X9W A; 5L1K A; 3H4D A; 3SV3 A; 4P4O A; 3WKA A; 4Q8E A; 3CP8 A; 1C20 A; 4F5Q A; 2IHM A; 1A0P A; 3ZI4 A; 1U9L A; 4Y2X A; 1IM4 A; 4UAS A; 3H40 A; 3SMV A; 4BWJ A; 4XUS A; 4Q44 A; 1K5O A; 2FLP A; 4J9M A; 2H3Q A; 1ZQO A; 2HCF A; 2QB0 A; 5KFU A; 1X6I A; 2CXY A; 3H4B A; 2KMD A; 9ICB A; 2XI9 A; 4IQV A; 4UB8 U; 3KFU F; 2HHW A; 2OM6 A; 4I2D A; 4FO6 A; 1BPX A; 1SV0 A; 8ICJ A; 2HBL A; 1ZQI A; 2ODG A; 1KTQ A; 3KHL A; 2CN1 A; 4C8N A; 1ZD4 A; 2I6X A; 2W54 A; 5AKY A; 1SV4 A; 3RFA A; 5KL8 B; 3M9N B; 2LBO A; 4YG2 A; 3RH4 A; 5JTI A; 4ECY A; 8ICM A; 2MSN A; 5DGA A; 2EZZ A; 2UVV A; 4C7Z A; 3SEN A; 2Q0Z X; 4XQ8 A; 2BDU A; 3D2S A; 3A0H U; 3EWA A; 3RTV A; 2EZY A; 2VJ5 A; 1KFS A; 4QZD A; 4PGX A; 2YMM A; 4US9 A; 3EUB 2; 1ZQF A; 1N48 A; 2FMQ A; 3DEE A; 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