The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
85
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structure length |
85
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Chain Sequence |
GSHMNNEDFSQWSVDDVITWCISTLEVEETDPLCQRLRENDIVGDLLPELCLQDCQDLCDGDLNKAIKFKILINKMRDSKLEWKD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of the Sterile {Alpha} Motif (Sam) Domain of the Saccharomyces Cerevisiae Mitogen-Activated Protein Kinase Pathway-Modulating Protein Ste50 and Analysis of its Interaction with the Ste11 Sam
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
STE50 PROTEIN
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
20
|
| structure length |
85
|
| sequence length |
85
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-10-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF09235 | SAM_Ste50p | Ste50p, sterile alpha motif |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JV3 A; 2ES6 A; 1SV4 A; 3SEN A; 2F44 A; 1X66 A; 2Y9U A; 3TAC B; 3BS5 A; 5JU5 A; 3H8M A; 4RQN A; 2YTU A; 5JTI A; 1COK A; 2QB1 A; 1V85 A; 2QKQ A; 4MHV A; 3K1R B; 3BS7 A; 4PZO A; 1OW5 A; 2KIV A; 2EAM A; 3IDW A; 1X9X A; 5F3X B; 5JRT A; 1RG6 A; 3SEI A; 2ESE A; 4PZN A; 1PK1 B; 2E8O A; 2KSO B; 2QB0 A; 2QAR B; 1SV0 C; 1UQV A; 1OXJ A; 1JI7 A; 2F3N A; 1LKY B; 2D3D A; 4NL9 C; 2E8M A; 2DL0 A; 2Y9T A; 1KW4 A; 2FE9 A; 1SV0 A; 1SGG A; 1WWU A; 1SXE A; 3HIL A; 1X40 A; 2LPE A; 3TAD C; 5KNI A; 2DKX A; 4NL9 A; 2D8C A; 1F0M A; 2KMD A; 2GLE A; 2EAP A; 3KKA C; 4IS7 A; 4NJ8 A; 2KG5 A; 1Z1V A; 3TAD A; 2K4P A; 4RQM A; 5J8Y C; 2E8P A; 2EAO A; 1PK1 A; 1SXD A; 2KE7 A; 5L1M A; 2KSO A; 2F8K A; 2L5Y A; 1WWV A; 2QAR A; 3KKA A; 2EAN A; 2K60 A; 3BS5 B; 1DXS A; 1UCV A; 1LKY A; 1PK3 A; 2DKZ A; 3BQ7 A; 5J8Y A; 2QB0 B; 2LMR A; 2B6G A; 1V38 A; 1B0X A; 2E8N A; 1B4F A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4IR1 A; 4WJ3 B; 1WUD A; 4QZG A; 4ACO A; 1KFT A; 4JWM A; 5ALF A; 5DGB A; 3QUT A; 2R8G A; 1NK5 A; 2C28 A; 4CDG A; 1VLB A; 1TFR A; 3R9K A; 1TVA A; 2A1J A; 3M9M B; 4PGQ A; 9ICX A; 4ELV A; 4EYI B; 1ZQV A; 3PNC A; 4F92 B; 5DQH A; 7ICP A; 2KKP A; 9ICU A; 1X6J A; 2VAN A; 2A3V A; 5L1J A; 2JEF A; 2I1Q A; 3SEI A; 1Q3U A; 1Z4N A; 2ZIV B; 1ZRM A; 2ZIX B; 2PKE A; 2Y1I A; 3SAF A; 1D9F A; 3OGU A; 5DBB A; 1SB3 C; 2F3N A; 5CWR A; 3ZDA A; 2W8K A; 3GV7 B; 1SV0 A; 3I28 A; 1D8Y A; 4NL9 A; 3UMG A; 3I76 A; 5IIM A; 2W3R A; 1ZET A; 2FI1 A; 2PMZ F; 1KN5 A; 3D6J A; 3TFR A; 5HNK A; 1KRP A; 9ICO A; 2XCA A; 2ZTD A; 4F5R A; 1ZQL A; 4F50 A; 3KKA A; 5B5E U; 2H3Z A; 3QUC A; 5DQG A; 2FMS A; 3RJE A; 3H7I A; 4MEY A; 3ZD9 A; 2DKZ A; 5J8Y A; 4ECZ A; 2ATL A; 4PHP A; 4F4X A; 4DFK A; 3A0H U; 2NYV A; 3C2K A; 3V6H A; 1XU4 A; 1RXV A; 4Z6F A; 4Y2Y A; 5KFR A; 1D9D A; 5J2G A; 4ED8 A; 5JTI A; 1KKX A; 2LI6 A; 3G6V A; 4X5V A; 3K1R B; 1T7P A; 4KLH A; 1X6I A; 4YR0 A; 4R65 A; 4UB6 U; 2LM1 A; 1RYU A; 3IHQ B; 2EAM A; 1URJ A; 1T94 A; 3FAH A; 2R8I A; 3KHL A; 3FM9 A; 1L7P A; 4RZR A; 1S0V A; 2ESE A; 2Y0S F; 2R18 A; 1BPD A; 4MF2 A; 7ICS A; 4FBT A; 4MFC A; 1QSS A; 2UVR A; 2FPK A; 4U6P A; 2GOL A; 4JV0 A; 4KLE A; 2DL0 A; 3VCB A; 1KW4 A; 4Y2R A; 1RPL A; 2F1I A; 4Y2T A; 4BUG A; 4I2J A; 2IOF K; 3NVW A; 3SYZ A; 3BQ2 A; 3OHB A; 5AM0 A; 1L3S A; 3HWT A; 4F2S A; 2GLE A; 4ED6 A; 7ICG A; 4DQS A; 1B22 A; 2W3S A; 4B9M A; 2B21 A; 2EZZ A; 2J6S A; 2MRL A; 4F5Q A; 3CYM A; 1NK8 A; 4DQP A; 3SAG A; 2K4E A; 2WF8 A; 5KFT A; 3TAP A; 1VDV A; 5J29 A; 1RQL A; 2BCV A; 4R8U B; 1SIJ A; 3L5K A; 5KFW A; 4DCC A; 4DSF A; 1GO3 F; 1BPZ A; 1ZJN A; 2KP7 A; 2NRW A; 5DB8 A; 1B4F A; 7ICE A; 3M1Y A; 4I2I A; 2ES6 A; 1ZOL A; 5KFF A; 8ICH A; 1BGX T; 1NNL A; 3HW8 A; 2KNJ A; 3C21 A; 2YTU A; 5AM2 A; 2K8B B; 4KLD A; 1XS9 D; 1V97 A; 1RYR A; 3BQ0 A; 3GIJ A; 2OH2 A; 4DEZ A; 4ELT A; 3AL0 B; 5KFZ A; 4F93 B; 4ECV A; 2FPM A; 2DF4 B; 5J2A A; 1X9X A; 4KTQ A; 2G0A A; 3TAR A; 2Y0S C; 4JUZ A; 3SZ2 A; 2KD1 A; 1NKE A; 1KTQ A; 3TKA A; 4DOA A; 3F2B A; 1K1S A; 3V7L A; 4UB5 A; 1ZQF A; 5ALV A; 1C7Y A; 1QH9 A; 2MSN A; 5IIN A; 3WKE A; 2J6U A; 9ICA A; 1SKR A; 4FS1 A; 1ARO P; 2AQ0 A; 5ALO A; 1SGG A; 3ZDD A; 4I2F A; 5ALH A; 1ZQS A; 3D2Q A; 1Z00 A; 5J0W A; 2KMD A; 2KEY A; 4EEL A; 3QEA Z; 4UB2 A; 4RNM A; 2BKE A; 4Z6E A; 2XY5 A; 3RBE A; 1QQ6 A; 4G9B A; 3TAD A; 9ICL A; 5J0U A; 3RBD A; 2YMP A; 5ALJ A; 4M6W A; 4EEY A; 4UAS A; 3T5H A; 4BWM A; 1X42 A; 4Q43 A; 1ZQB A; 5HR7 A; 4XA5 A; 1KDH A; 2L5Y A; 5F9L A; 2Q4T A; 4QWE A; 4K4H A; 3T3F A; 2I5H A; 2C2R A; 2W43 A; 5AI4 A; 4CE6 A; 1RYS A; 2HSZ A; 5KFA A; 3PO4 A; 1UT8 A; 3EWA A; 1B0X A; 4TUR A; 4I28 A; 2GO7 A; 4EX6 A; 4QZI A; 1IIP A; 1ZQH A; 2KOB A; 3AQE A; 4I2G A; 1MC8 A; 2F8L A; 3PR5 B; 5KFI A; 3HPO A; 1UA1 A; 4OCZ A; 2F44 A; 5HP4 A; 4DQR A; 3EYZ A; 1KQQ A; 1FFU A; 2XGP A; 1ZQJ A; 3AU6 A; 3DDH A; 3GZF A; 9ICJ A; 2KIV A; 3UPQ A; 3MFH A; 3C1Y A; 3Q8R B; 1T4G A; 1KFS A; 1JRO A; 4RUA A; 3OHA A; 4OJP A; 1PVP A; 3IV6 A; 2F76 X; 1SV0 C; 3RJK A; 3PX4 A; 3GU3 A; 2ISP A; 1TKD A; 1SWV A; 2ZJ5 A; 4C0Z A; 4NL9 C; 2K89 A; 5DG9 A; 4KLF A; 4R64 A; 2RLT A; 2YB4 A; 2D6F C; 3MFI A; 4BWJ A; 2XC9 A; 4B9T A; 1Z4O A; 9ICM A; 1QSY A; 2HHV A; 5DQI A; 4JMU A; 3QU2 A; 3OSP A; 2HHS A; 7ICV A; 2W7O A; 4UAZ A; 4EBE A; 3M8S A; 3KKA C; 4XQ8 A; 4USA A; 1U9L A; 4ECY A; 4MFA A; 2JXJ A; 4JB3 A; 1ZQM A; 5J8Y C; 3BQ1 A; 4KLO A; 3CNH A; 2AU0 A; 2BZF A; 8ICB A; 4TQR A; 8ICC A; 4QW8 A; 4LVS A; 4RQ7 A; 2DBY A; 3BS5 B; 4EBC A; 4C8M A; 1NZP A; 3HX0 A; 1ZQD A; 1ZQP A; 1XWL A; 5AM5 A; 4QZD A; 3RJJ A; 3WKD A; 5KT3 A; 2WB1 F; 7ICU A; 4DO9 A; 4UW9 A; 1TK5 A; 4RQN A; 4KN4 A; 5EWE A; 2RP5 A; 1DGJ A; 2W9B A; 1D8L A; 2AH5 A; 2E3T A; 2HOF A; 4UB3 A; 3ZDB A; 1ZQK A; 5ALW A; 4O3S A; 1UA0 A; 2HCF A; 5KFP A; 5AKL A; 3ONN A; 3E58 A; 4DOC A; 8ICJ A; 3QU5 A; 5KG0 A; 1V9P A; 3NUQ A; 2G5I B; 2VJ4 A; 3NRZ A; 5ALX A; 3NS1 A; 3Q8M A; 3C28 A; 1IXR A; 4P0P A; 3MC1 A; 1S76 D; 2EZX A; 5J0Y A; 3PW7 A; 1SL0 A; 3KOO A; 3RH6 A; 5A0L A; 2YMQ A; 4Z6C A; 1X9W A; 3KBB A; 2BHN A; 1ZQU A; 1RXW A; 7ICK A; 1CUK A; 5L1L A; 1ZD2 P; 2LKY A; 4FZL A; 4ECQ A; 1ED1 A; 4BXO A; 4KLU A; 4KLM A; 4DL3 A; 3T5K A; 8ICN A; 4NWI A; 2WF7 A; 4F91 B; 4RT2 A; 2LPE A; 1NK9 A; 3JPQ A; 4CF3 A; 3OJS A; 2P6U A; 1N63 A; 4J9N A; 1TAM A; 3FDS A; 3TQ1 A; 1ECW A; 3TAN A; 5BPC A; 5AM4 A; 3GDX A; 5DLG A; 4NJ8 A; 2KG5 A; 5AI5 A; 4QW9 A; 2BCR A; 3BDP A; 4I2D A; 3Q8Q B; 3UQ2 A; 8ICM A; 5EE3 A; 7ICJ A; 2P6R A; 1QQ5 A; 2MAX A; 4PJ0 U; 3N97 B; 2A19 A; 1BNP A; 1DOQ A; 3F2C A; 4PL2 A; 4Y2P A; 3WK6 A; 5C5J A; 3V7K A; 1N5X A; 4MFF A; 2KHQ A; 2WB1 C; 4LZD A; 5EWF A; 1SV4 A; 1F44 A; 5AI0 A; 1L7M A; 3TAC B; 4QWC A; 8ICP A; 4QJF B; 2DFL A; 5TIS U; 1NKC A; 5J2B A; 4J9P A; 2WTF A; 5AKZ A; 3T5J A; 2QKQ A; 3RJG A; 4RQ8 A; 3ALR A; 4ED3 A; 1BNO A; 2G08 A; 3MGH A; 2XO7 A; 5ALD A; 2HVI A; 2IOF A; 2JH7 A; 9ICK A; 2AQ4 A; 8ICA A; 4IQU A; 2P35 A; 4QWA A; 4PHE A; 4B9L A; 3M9N B; 2E8O A; 1YT3 A; 1X9S A; 7ICR A; 2QB0 A; 5ALY A; 4A8E A; 5KG6 A; 1ZQQ A; 5FP0 A; 2D3D A; 5AKX A; 3N7R C; 2JMG A; 2W9A A; 1PUZ A; 3MR3 A; 4C7Y A; 2ASD A; 1BVS A; 4US8 A; 4UAW A; 4J9Q A; 4Q44 A; 4IC9 A; 3TAD C; 3RR8 A; 4QZ8 A; 2DPI A; 2O6K A; 5KFU A; 4NLC A; 5ALR A; 3TI0 A; 4IR9 A; 3LWL A; 3A0B U; 4DFP A; 1ZXI A; 1BPE A; 2G07 A; 1DGS A; 4RU9 A; 1PK1 A; 4TUQ A; 3LYS A; 3JPS A; 5B66 U; 1NKB A; 1WWV A; 3ZDC A; 5CEH A; 4CGZ A; 4O5C A; 4JK1 A; 4RQ5 A; 1UCV A; 3F5E A; 2M0N A; 3H8W A; 2JEG A; 5DB9 A; 3H4D A; 1WG8 A; 4GIB A; 7ICI A; 1V38 A; 5KFB A; 2J6T A; 3ISD A; 4QWD A; 2DQN B; 3DV9 A; 2KKV A; 2KJ9 A; 2WHE A; 5HML A; 3K1Z A; 4B9N A; 3LVV A; 4Q8F A; 4R66 A; 2YQE A; 2IHM A; 1QLN A; 2UVW A; 1LVH A; 1HUO A; 2JZB A; 2KZ3 A; 4F5N A; 4NM1 A; 2WF9 A; 1WYG A; 4NY8 A; 4GFJ A; 1TK0 A; 2C2E A; 5EWG A; 2AGQ A; 2BDU A; 2VJ5 A; 3JPT A; 3ZDE A; 2W9M A; 4UAV A; 4M6W B; 5CHG A; 4DF8 A; 2RRD A; 2I6X A; 3PZP A; 2PFP A; 3Q8K A; 1UQV A; 3T79 A; 2E1F A; 2Y9T A; 4M04 A; 3V72 A; 2Q0Z X; 2NV3 A; 5JUM A; 4RUC A; 2XI9 A; 5DGA A; 3CRX A; 1VJ5 A; 2ZUC A; 5AI6 A; 4P4O A; 2K4I A; 2MA1 A; 5KFQ A; 2ZG6 A; 2HMX A; 4NLZ A; 4KN7 A; 2VIX A; 1T3Q A; 9ICN A; 3ZI4 A; 4HAI A; 5DBA A; 7ICN A; 3PW5 A; 1RQN A; 4F4K A; 3BZC A; 4PGY A; 4RQM A; 1IV8 A; 3EPI A; 3J81 j; 2EAO A; 2KE7 A; 5J0S A; 2W03 A; 3QZ8 A; 2KSO A; 3N7S C; 2F8K A; 3HJE A; 8ICG A; 5KFN A; 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