2QB0B

Structure of the 2tel crystallization module fused to t4 lysozyme with an ala-gly-pro linker.
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILKQAGPNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords E80-TELSAM domain
molecule tags Hydrolase regulator
source organism Escherichia coli
total genus 75
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 Transcription Factor, Ets-1 2qb0B01
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2qb0B02
3DMXA 1Z1VA 102LA 261LA 4YX7C 1L60A 146LA 1L56A 4W53A 1L94A 128LA 1CUPA 2IGCA 3HH4A 1L00A 1L74A 5JU5A 167LA 4LZMA 4EJ4A 3VW7A 3BS5B 1PQKA 4W59A 1C6BA 2RBSA 2ESEA 1L31A 1L64A 1LYJA 2RBOA 1G1WA 211LA 1C6FA 2YTUA 4ARQB 3GUIA 1B4FA 162LA 4I7QA 2OU9A 2JV3A 1L89A 247LA 3QAKA 3OE6A 1G07A 1L62A 1PQMA 2B70A 1D3NA 3G3VA 142LA 145LA 1L30A 218LA 3SB8A 1L53A 4K5YA 1OW5A 4NL9A 190LA 107LA 2KSOB 3HUAA 238LA 3HDEA 1L38A 3DN4A 1LYGA 3JR6A 1L87A 1WTHA 1L25A 2CUUA 1L26A 1P64A 5J8YA 166LA 1CV1A 1I6SA 1SSWA 120LA 3HTDA 1L12A 232LA 103LA 3K2RA 1LKYA 3OE0A 233LA 1L01A 1LYFA 1C6HA 2FE9A 1L24A 1WWVA 2ANXA 2Q9EA 1SV0C 1D2WA 3HU8A 1PQDA 150LA 1P56A 1QT4A 1L09A 1X9XA 137LA 249LA 127LA 4EKSA 2LCBA 1LYHA 2EAPA 2E8PA 2F3NA 143LA 4EKRA 243LA 3TACB 2OU8A 2EANA 1KY0A 4ARJA 2GLEA 1QT7A 259LA 182LA 2B75A 1SXDA 1LYDA 3HTGA 1L35A 1OXJA 1QUGA 1SX2A 240LA 3SN6R 3DMZA 123LA 2ES6A 1L82A 3HT8A 3F9LA 171LA 1P36A 1L49A 1QUDA 2QARA 5JRTA 1WWUA 160LA 1C6NA 1L08A 1C6MA 1L27A 4I7PA 3BQ7A 115LA 220LA 1C67A 1OV7A 1L0JA 1L42A 1DYFA 1L06A 244LA 1G1VA 2NTHA 1L02A 3UONA 239LA 2EAMA 1G0MA 1P6YA 1ZURA 3C8SA 1L19A 1L88A 3SB9A 3LZMA 1C60A 1C6IA 122LA 1L71A 245LA 3D4SA 1CV0A 1L37A 130LA 2RB2X 3HILA 1D2YA 1JTMA 1D3MA 2QB0A 187LA 1OVJA 1L61A 2OE4X 104LA 4YXAC 3F8VA 2O79A 1JI7A 2B73A 4LDLA 1L15A 229LA 1B6IA 1L90A 4ZPUA 1L16A 1P3NA 2F32A 1L59A 4PZOA 3GUKA 1QTVA 210LA 216LA 260LA 2F47A 1CV3A 4I7RA 4MHVA 2B6TA 1PK1B 2B72A 1D3JA 1C6LA 200LA 3BS5A 2D8CA 1OVKA 1SV4A 1QT3A 254LA 1QTCA 2OTZX 1L55A 3KKAA 2Y9TA 4ARQA 1T8FA 1L17A 242LA 219LA 1EPYA 1L98A 4E97A 1L52A 1L0KA 3FA0A 4GBRB 183LA 1QTHA 2RBQA 6LZMA 1C6DA 1L85A 4ARLA 4AQNA 206LA 196LA 1QT8A 180LA 3HU9A 224LA 1LI6A 2KSOA 1T97A 191LA 1CV5A 2LC9A 3GUNA 3NY9A 1C6KA 4EKPA 1SGGA 2B6WA 4W58A 126LA 1L40A 1D9WA 4IS7A 168LA 125LA 1L36A 1L99A 1LWKA 4PJZA 181LA 3SB6A 3GUOA 1DYCA 3HUQA 1LW9A 1L10A 1OWZA 1ZYTA 3HUKA 4NL9C 1LGUA 3EMLA 1C68A 2A4TA 173LA 1L70A 4EPFA 1V38A 177LA 3C80A 184LA 1QTDA 2F44A 4I7MA 1CV4A 1QS9A 1XJTA 5J8YC 1L51A 175LA 111LA 2L5YA 1C64A 1L69A 1L83A 1CU6A 1L57A 1LWGA 2DL0A 1OWYA 1G06A 4ARPA 1L48A 209LA 1L66A 1L33A 4GRVA 165LA 3HH5A 1QT6A 2KIVA 157LA 3CDVA 2DKXA 237LA 4I7KA 1X40A 2D3DA 1G0PA 1LYEA 3HT7A 3RUNA 4NJ8A 221LA 2Y9UA 4I7SA 2B7XA 1DYBA 1XJUA 2K4PA 1LPYA 1C6CA 1L21A 148LE 252LA 2O4WA 3SBAA 2Q9DA 262LA 1L81A 1CX6A 4I7TA 1L28A 4I7JA 163LA 159LA 1SWZA 1QSQA 3C7WA 1L97A 1COKA 178LA 1P7SA 3GUJA 138LA 1CU2A 3H8MA 1KY1A 212LA 2OE7X 1CV6A 2F2QA 109LA 1DYEA 246LA 1L20A 139LA 3SBBC 199LA 222LA 236LA 2NTGA 1L14A 1UCVA 174LA 3SB5A 3G3XA 1T8AA 2B6ZA 4IAPA 228LA 4I7LA 1NHBA 4ARMB 3TADA 251LA 2RBPA 4W51A 2QARC 3DN3A 2E8OA 3K1RB 5I14A 1P2RA 3G3WA 1C6EA 241LA 3HTFA 198LA 2B74A 2B6XA 1G0QA 192LA 2KE7A 1L80A 4PK0A 1L03A 113LA 2OTYX 1C6JA 5KNIA 1P37A 2OEAX 1ZWNA 186LA 155LA 1L65A 3GUMA 1LI3A 1L63A 189LA 3DN6A 152LA 2RBRA 2E8NA 5F3XB 3C83A 4S0WA 4RQNA 3HH6A 3L64A 1L86A 2LPEA 188LA 1PK3A 1PQOA 4DKLA 1L67A 1C62A 185LA 1QUHA 1KW7A 4W52A 1L04A 3DMVA 3HTBA 1C6TA 1PK1A 140LA 5JTIA 4EXMA 1KS3A 1KW4A 1KW5A 231LA 3GULA 234LA 1SXEA 3HH3A 119LA 2L78A 3FADA 1SX7A 3OE9A 1XEPA 1QS5A 1L95A 2F8KA 1P46A 3PBLA 4EKQA 2LZMA 2HULA 3C8RA 3DN0A 1C6GA 1LGXA 3ODUA 1PQJA 3HDFA 235LA 3KKAC 1L68A 1KNIA 2RAYX 225LA 108LA 1P5CA 205LA 1D3FA 1CTWA 151LA 217LA 258LA 3SB7A 114LA 230LA 1DXSA 164LA 1G0GA 2HUKA 1L79A 161LA 3CDQA 1QSBA 3DN1A 1P2LA 1CU3A 1G0JA 1L58A 1L44A 4RQMA 1B0XA 1RG6A 3FI5A 1LI2A 3DNAA 3CDRA 3C81A 2LMRA 1L23A 112LA 3SENA 4YXCA 1L45A 2DKZA 2ANVA 5LZMA 3HT6A 1C6AA 227LA 250LA 2Z6BA 1DYAA 3RZEA 2O7AA 1L47A 2B6GA 1L32A 3GUPA 1V85A 1SV0A 1LLHA 2QKQA 1L73A 4EPIA 1QTZA 2OE9X 1PQIA 1LKYB 4DJHA 223LA 1L72A 1JQUA 3OE8A 2KMDA 149LA 1CUQA 1DYDA 1G0LA 1JTNA 3HWLA 3NY8A 1L93A 1L43A 1L22A 1C65A 3IDWA 1X66A 1L76A 1C63A 1OYUA 1SSYA 1L07A 3DKEX 169LA 4PZNA 1QTBA 4ARMA 1CVKA 2K60A 110LA 1QUOA 3CDOA 4W54A 213LA 1OV5A 1L39A 3C7ZA 1K28A 4LDEA 4I7OA 1CX7A 215LA 176LA 1QT5A 1TLAA 3TADC 170LA 1C69A 4LDOA 118LA 1L50A 3BS7A 2QARB 141LA 1DYGA 1CU5A 3C7YA 1L11A 129LA 1C6PA 3V2YA 4DAJA 7LZMA 1L41A 1CU0A 3L2XA 4W56A 1L75A 3DN2A 1L84A 158LA 2RBNA 2B6YA 5L1MA 3PDSA 3SEIA 1T8GA 2RB0X 1L29A 3HT9A 2RB1X 255LA 3C82A 2EAOA 4W57A 1LGWA 4W55A 1L46A 197LA 195LA 4OO9A 156LA 3NYAA 1L96A 3C8QA 4I7NA 131LA 253LA 214LA 2RAZX 2QB0B 2HUMA 1G0KA 1L77A 1L54A 257LA 2RH1A 256LA 2QB1A 201LA 1C66A 172LA 1L18A 1OVHA 3V2WA 1C6QA 248LA 2E8MA 3DN8A 1L91A 1SWYA 1L34A 147LA 2OU0X 3CDTA 1L92A 1LYIA 1F0MA 226LA 2KG5A 1L05A 1T6HA 1L13A 1C61A 1UQVA 144LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HFYA 102LA 3B0XA 2W9BB 1LZ1A 1L60A 1LSCA 3LVWA 3QUQA 5J2HA 9ICPA 2JHDA 1IP5A 1CUPA 4IJ4A 4C4TA 3HH4A 4W53A 5C6LA 5FCPA 1L74A 167LA 2ZIXB 1PQKA 3A91A 2JEIA 2ESEA 1L64A 1HF4A 1G1WA 2MEFA 4R64A 1L3VA 2ALZA 2YTUA 4JWMA 2F4GA 5AIAA 1DKKA 1WTNA 4GC6A 3ZD8A 2D4KA 5L1JA 3QAKA 1PQMA 3ZVQA 5KT3A 1B7SA 4I2EA 2B70A 2PI5A 4MSTA 3IG5A 9ICQA 2W11A 1NK5A 5DLAA 5DGBA 3NGDA 1LSAA 5KFZA 2WF8A 1L53A 4ETBA 2F8LA 1GFVA 4A8EA 1V7SA 1L3UA 238LA 1B7QA 2KP7A 1UUZC 2BCVA 3GIIA 5HR6A 3JR6A 2W55A 4GCEA 4F5PA 5IIOA 2HBLA 1SSWA 166LA 4XN6A 2LM4A 4LT2A 4GXJA 5E9RA 3HTDA 3PW2A 4QZDA 1DRGA 1GFJA 3V7LA 2MEHA 5F9UA 1UIDA 1FIQA 3WW5A 233LA 3ZI4A 1K1SA 8ICZA 3H0RB 4PHPA 2ZQ3A 1C6HA 1YL0X 2C8OA 3JPSA 3A6BY 1GF7A 3SD7A 1L24A 4Z41A 2FMSA 3HU8A 2BLYA 150LA 1P56A 1L09A 1GDWA 8ICAA 137LA 3GILA 1H87A 5HMJA 208LA 2IMWP 3JPRA 1LHLA 2EAPA 4EKRA 4H8ZA 4P4PA 1NJYA 1KY0A 4ARJA 2GLEA 2MEBA 5AKYA 4H90A 1SXDA 1FO4A 3PO5A 3HTGA 4H9FA 2OEHA 1L35A 1OXJA 2I6XA 1SWVA 3QNMA 1SX2A 240LA 2RDIA 4KXIA 2HEEA 4F4YA 1JMSA 3DMZA 4FZMA 123LA 3AZ5A 3HT8A 5J2IA 5J2DA 5KFAA 1L49A 2XQOA 1SIJA 1J1PY 2QARA 4WLDA 4O3RA 5KG2A 1BQLY 4B0DA 9ICBA 1Q8KA 2KICA 4F4WA 7ICJA 1HNLA 1C6MA 1JPOA 4ECQA 4I7PA 115LA 3N9AA 1VDSA 2IA6A 3C2MA 4LJXA 1DOQA 3AU2A 4QJFB 1RXVA 8ICKA 1L42A 2LZTA 4WMGA 2XY6A 5KT7A 4WO9A 5J0UA 4UWUA 3PMLA 1REZA 3P66A 5AI8A 2ZYCA 239LA 3EWAA 1P6YA 3C8SA 1L7OA 5JENB 1AT5A 4I2IA 1JHLA 1LHHA 1C6IA 2OHFA 2ZUCA 1L71A 3QUCA 1WTMA 3A95A 5KFTA 7ICUA 1ZXIA 1AZFA 5AM0A 2RB2X 4C8KA 4B9LA 2G4QA 2WF7A 1JTMA 3B9JA 4JV1A 2M0NA 1XGPC 3C23A 3UMCA 1L61A 4GC7A 5AHXA 4ZIXA 4YXAC 2MEGA 3F8VA 4Z6EA 1B6IA 1BGXT 4B9NA 1ZV5L 4DQIA 5TZVA 2BQAA 4TUSA 4M6WA 1ZQMA 1ZQBA 3GUKA 1ZQQA 2I25L 4EX7A 3N9CA 3D2QA 4QWDA 1YZ6A 4DSLA 1JRPA 1UIBA 4BXOA 1CNSA 4I7RA 2B72A 4NWEA 9ICAA 4OWAA 1BNOA 5G5GA 1D3JA 2IBKA 4F91B 4P0PA 5LVKA 4WL7A 3BS5A 4H93A 4O9MA 1Q3VA 1RFPA 2R8HA 4EYHB 4NY5A 1QT3A 5KG6A 2Y9TA 3BQTA 4Y2UA 2YBHA 4NG8A 1GB3A 3W6CA 3M1YA 219LA 1HMLA 4BS7A 4F92B 1L0KA 2RHFA 3FA0A 2AGOA 3RF9A 2R8IA 3THVA 2W54A 1D0KA 1UACY 1B7RA 1C6DA 4C8LA 1YQVY 2EDUA 2IOFK 5K4LA 3C2KA 5H2FU 1LI6A 4NGZA 1T97A 2G5IB 1UIGA 8ICJA 2RDJA 3MDCA 1C6KA 4YENA 3AM9A 4EKPA 2B6WA 4F2RA 2E1EA 1XWLA 3V6KA 1XSFA 1L40A 3SZ2A 168LA 1NZBA 2HU1A 2FPKA 4OOTA 4PJZA 2VIXA 3F5EA 2BHNA 1BPBA 4F5OA 7ICKA 7ICRA 181LA 1QQ7A 3KD3A 1KIPC 4FFDA 4ELTA 4HTNA 3RT5X 1B22A 4EPFA 1EQ5A 1QSAA 4F93B 3KOOA 1E8LA 3QE8A 4C0ZA 4M9LA 2CN1A 1ZRNA 1CJ7A 3H7IA 2G0AA 4QNLA 3NVZA 5IILA 1ZQFA 1QS9A 2YBMA 2BCUA 4J1BA 4DFMA 1ECWA 1B5WA 111LA 2EIZC 1C64A 4ARPA 1J1XY 1ZQTA 2FPLA 4ETAA 3AUOA 4WJ3B 165LA 2MA1A 4LYMA 4P4MA 3HBDA 1IC5Y 2FLLA 2W9AA 4NHQA 5B1GA 1G0PA 1LYEA 4XADA 4YFKA 4DT3A 221LA 2Y9UA 4QDNA 4I7SA 2B7XA 1A77A 1DYBA 2K4PA 3SBAA 4ET9A 1D0LA 148LE 4M2YA 2Q9DA 1L81A 1CX6A 4I7JA 3LHMA 4WG1A 5AK5A 5EWEA 1FN5A 1SWZA 1QUTA 2HHWA 2YMMA 2K4EA 4LZDA 3C7WA 2WB1C 3SV4A 4HAIA 2NRVA 4EEYA 212LA 1CV6A 1HC0A 1TK0A 3EYZA 3GQCA 2CGIA 4U3XB 5LAGA 236LA 2NTGA 1L3SA 174LA 3PR5B 2OH2A 1T8AA 5AKEA 2B6ZA 3L3FX 5AKZA 2PFOA 1NHBA 4I7LA 5E4PA 1VDVA 5KT2A 4W51A 3TAPA 4ZFPA 3GDXA 2E8OA 3K1RB 5T14A 4B9UA 3EPGA 2YVBA 1HEMA 2F77X 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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