2QB0B

Structure of the 2tel crystallization module fused to t4 lysozyme with an ala-gly-pro linker.
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILKQAGPNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords E80-TELSAM domain
molecule tags Hydrolase regulator
source organism Escherichia coli
total genus 75
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 Transcription Factor, Ets-1 2qb0B01
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2qb0B02
1CV5A 1L84A 3BS5A 1OV5A 250LA 2OU9A 3GULA 2OE4X 3UONA 1CV6A 1L66A 111LA 234LA 2LC9A 3CDQA 1KY1A 1ZYTA 137LA 249LA 1OWZA 113LA 3CDRA 210LA 4LDLA 2F2QA 130LA 1KY0A 151LA 168LA 1SXEA 1KNIA 2Q9DA 1T6HA 4PZOA 1L56A 248LA 1C6LA 1D9WA 4ARQB 1SV0C 2ANXA 1C68A 3SBAA 181LA 261LA 1C6FA 176LA 1LYGA 1L0KA 175LA 1L11A 1L87A 223LA 1X66A 188LA 3CDOA 1LI3A 1LWKA 1PQJA 3HH6A 1L36A 2F3NA 1L59A 6LZMA 2ESEA 3DN1A 1CU2A 1L91A 3DN3A 1L44A 3DN6A 1QUOA 1L08A 4ARJA 1DYBA 4I7NA 2O4WA 1L28A 1V85A 2K60A 4NL9A 1QTDA 3GUNA 1L54A 1P56A 1L17A 118LA 238LA 3FI5A 1SXDA 1L03A 2Y9TA 119LA 2KMDA 3G3XA 5JU5A 246LA 138LA 158LA 1C60A 255LA 3PDSA 1SV4A 191LA 1P7SA 3V2WA 4OO9A 1L14A 1DYAA 171LA 3TACB 3C7YA 1QSBA 2B7XA 2F47A 4EPFA 1C6AA 3HWLA 4W55A 1DYDA 257LA 1C6EA 3DMZA 3HU8A 1L85A 4EKQA 192LA 1CU5A 1G07A 1B0XA 4NL9C 187LA 4W52A 3GUJA 1P6YA 148LE 1C66A 3NY9A 3DN8A 131LA 3BQ7A 1L33A 1QS5A 242LA 1D2WA 1L48A 1CV0A 166LA 1COKA 4NJ8A 3RZEA 3OE0A 2L78A 1D3MA 1L79A 128LA 1XJUA 3KKAA 3V2YA 1T8FA 104LA 3HTBA 1RG6A 1L19A 1SX2A 1C6TA 1OV7A 1CX6A 1G0MA 3DN0A 1L38A 1OYUA 4I7KA 1LGUA 1LGXA 2JV3A 1KW4A 1L83A 120LA 1WWVA 1L72A 4YXCA 1P3NA 1C6HA 2B72A 1QTCA 236LA 1G0KA 2RB1X 143LA 1LGWA 1B6IA 1L80A 4W59A 110LA 3HTFA 235LA 1DXSA 3GUOA 4GBRB 3FA0A 2D3DA 4EXMA 3NYAA 254LA 125LA 1G0LA 258LA 3KKAC 5KNIA 1L60A 1QUDA 2E8NA 1LKYB 1G1WA 1C6BA 1LYIA 4IAPA 4W53A 212LA 1L43A 1C6PA 3CDTA 3GUPA 3SEIA 1WWUA 1QT6A 1DYGA 2QKQA 3C82A 229LA 1I6SA 1DYFA 211LA 2RH1A 2QB0A 1QTZA 2ES6A 1L0JA 5JTIA 107LA 2EAPA 1G0GA 149LA 1P64A 1L41A 1L31A 1OVHA 215LA 1T97A 1UQVA 1L89A 3H8MA 1L09A 1OWYA 253LA 218LA 198LA 102LA 3SB7A 3HUAA 1L26A 213LA 2B73A 2OU8A 1CX7A 180LA 1CU6A 2OE9X 4I7QA 1CTWA 4I7JA 1L58A 2OTZX 1L77A 2KE7A 1KW5A 1L10A 259LA 4EPIA 1D3NA 1L46A 3HDFA 1X9XA 3HT9A 1C63A 1PK3A 146LA 3DMXA 2EAOA 2NTHA 1C6GA 2Q9EA 3F9LA 4E97A 1SWYA 1L88A 219LA 1L23A 3TADA 240LA 1L65A 1L29A 1P2RA 1L00A 2E8OA 1L57A 162LA 1L76A 147LA 4EKRA 3C8QA 3SBBC 1KW7A 2LMRA 7LZMA 1L05A 221LA 159LA 3HH5A 3HT6A 2QB1A 1ZURA 1CVKA 1CV3A 1V38A 1L90A 1L92A 227LA 1LKYA 4DKLA 165LA 3VW7A 256LA 1CU3A 244LA 1KS3A 170LA 2O7AA 163LA 2B6YA 2B6GA 1QT7A 209LA 1UCVA 214LA 3TADC 156LA 186LA 190LA 2K4PA 1PQKA 1QSQA 1C6DA 5LZMA 2RAZX 1LLHA 2KSOB 220LA 1C65A 2NTGA 2GLEA 152LA 2OE7X 232LA 4EKSA 1P5CA 3DNAA 4ARQA 1D3FA 1TLAA 251LA 2F8KA 1PQOA 173LA 4I7LA 1L20A 1C6JA 3HTDA 231LA 2KG5A 2KIVA 1P37A 2Z6BA 3GUMA 3BS5B 183LA 1T8GA 2FE9A 1SSWA 3QAKA 199LA 1L02A 1SWZA 1OXJA 123LA 3HH4A 1L51A 2RBNA 1CUPA 1C67A 1LYDA 4LZMA 1C61A 150LA 164LA 1L61A 2A4TA 141LA 3FADA 1QUGA 1L55A 2HUMA 1P36A 1QTVA 122LA 2B6TA 1LI2A 126LA 2B6ZA 1L18A 2RBPA 4I7SA 1L69A 2DKXA 127LA 200LA 2RBQA 184LA 142LA 4ARMB 1K28A 1L64A 3ODUA 4W54A 3HT8A 1L27A 4W57A 230LA 1D3JA 3SB5A 4I7RA 157LA 2HULA 4EJ4A 3HDEA 2RBOA 1QT8A 3C7WA 1WTHA 2B70A 1L70A 5F3XB 1OVJA 189LA 1L62A 5L1MA 2QARB 3CDVA 205LA 1PK1B 1PQDA 1JI7A 182LA 167LA 1L49A 2OTYX 1L25A 3GUKA 3OE6A 2KSOA 1L30A 1F0MA 3RUNA 1L81A 1C6MA 2O79A 1C6QA 3DN2A 3PBLA 1LI6A 4I7OA 226LA 3DMVA 1L74A 2RBSA 1PQIA 1L04A 1ZWNA 4ARPA 172LA 4MHVA 247LA 3G3VA 144LA 3DKEX 1L95A 1P46A 4AQNA 3GUIA 2LZMA 115LA 3LZMA 1C64A 177LA 1L73A 3C8SA 3K1RB 239LA 3G3WA 2LCBA 4DJHA 1L96A 1L94A 140LA 1QS9A 3JR6A 4YX7C 1SSYA 2E8PA 260LA 201LA 3BS7A 4W51A 1G0PA 3HH3A 262LA 245LA 1DYCA 1LYFA 4PK0A 1C62A 3EMLA 1T8AA 3HT7A 4LDOA 1G0JA 1G0QA 2RBRA 3SB6A 4W56A 4ARMA 112LA 2B6XA 1QT4A 1L34A 1SGGA 1XJTA 1LYJA 1LPYA 3C81A 1L52A 2B6WA 1C6NA 5I14A 4W58A 1QTBA 4EKPA 2B74A 2OEAX 228LA 2E8MA 1Z1VA 1EPYA 1NHBA 155LA 1L93A 2CUUA 3SB8A 5JRTA 1L21A 3SB9A 2B75A 1L32A 3SENA 2L5YA 2QARA 1L50A 1QT3A 3C80A 3C7ZA 1PK1A 1C69A 2ANVA 3HU9A 237LA 4PZNA 1L45A 1SX7A 108LA 1OVKA 2Y9UA 2EAMA 225LA 2F44A 3IDWA 1L15A 3D4SA 3K2RA 160LA 1OW5A 3HILA 3C8RA 4GRVA 1JTMA 103LA 145LA 241LA 1L37A 1L01A 1CU0A 1L40A 4S0WA 2OU0X 174LA 4DAJA 224LA 1PQMA 1L35A 1G1VA 2RB0X 4K5YA 2RAYX 1L47A 1L22A 1G06A 195LA 139LA 1LYEA 2QB0B 185LA 196LA 3SN6R 1P2LA 1X40A 2QARC 4LDEA 4I7TA 169LA 1JTNA 252LA 2DL0A 1D2YA 1QT5A 243LA 3F8VA 3HTGA 2F32A 1L53A 216LA 1QUHA 2RB2X 109LA 1CUQA 3HUQA 4I7MA 5J8YA 2YTUA 178LA 1DYEA 1L42A 1C6IA 1L13A 217LA 4IS7A 1L71A 129LA 1LW9A 3OE9A 4YXAC 2IGCA 1L97A 4ZPUA 4RQMA 1L07A 2LPEA 4RQNA 1L16A 4I7PA 4PJZA 1CV1A 4ARLA 1CV4A 2HUKA 1L06A 1LWGA 1L24A 1C6CA 3OE8A 1L68A 1L12A 1L75A 2DKZA 1JQUA 2EANA 1L86A 233LA 3DN4A 1L82A 1L99A 3NY8A 5J8YC 1L67A 222LA 1L63A 1QTHA 1SV0A 1B4FA 206LA 1XEPA 3L2XA 1L98A 1L39A 161LA 3C83A 197LA 2D8CA 1LYHA 3HUKA 1C6KA 3L64A 114LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
133LA 4B9MA 4ETBA 2AQ0A 2H5XA 3EO5A 3H0MB 3BS5A 9ICOA 2G06A 1OV5A 3D6JA 2BQRA 1DI5A 4PHDA 1ZJMA 4O3OA 9ICTA 1GFAA 1LSEA 3OSNA 1UIDA 4GN5C 1L66A 111LA 1GF4A 3G6YA 3TAQA 2YBNA 3JPTA 2HMXA 1VLBA 3MC1A 2F2QA 5TISU 3D2QA 1KY0A 4P4OA 151LA 3EPIA 4KLGA 3ATNA 3LYSA 4Y2YA 2Q9DA 1ZVHL 1RDFA 1JKAA 1D9WA 2ZWBA 4QZFA 1C68A 4ACOA 5L1KA 3QNMA 4GCDA 4HTNA 2G4QA 2JEFA 181LA 4LYCA 1WQMA 4DSIA 4GLVA 1ALCA 1D9FA 3CT1A 1TAUA 2HUBA 1FIQA 2NRTA 1X66A 1KRPA 2HHTA 1DI4A 4XN6A 3NVVA 4KLQA 1S77D 1B5ZA 3A92A 3IG8A 3UXOA 3CQLA 2ESEA 3DN1A 5ILFA 1F0WA 1HSWA 4NV0A 4DOBA 4QZ8A 1XWLA 4GLXA 1VDPA 3QU5A 4HPEA 1TK5A 3A8ZA 3DN6A 5A0LA 1QUOA 9ICFA 3THVA 5AI4A 1DYBA 1HEOA 4I7NA 5IELA 5T3FA 1TK0A 4I2GA 1L7OA 2K60A 4NL9A 1QQYA 1QTDA 4GCEA 4AXTA 2AGPA 3FI5A 4I2AA 1L03A 3WPLA 2EQYA 4FZLA 1MSWD 1L3TA 1YAOA 4IQUA 2AH5A 3EYZA 3SAGA 3PW7A 5JU5A 1LMNA 1S76D 2F4AA 3NTUA 138LA 4FE3A 1C60A 2H3ZA 5L9JA 4B49A 3GZFA 4L41A 2RDJA 5KXYA 1ZXIA 5LVHA 1T4GA 1KFSA 4JWNA 9ICPA 1GDWA 2B7XA 3RB3A 4EPFA 5J2CA 2XO7A 1C6AA 3HWLA 2VANA 4EBDA 3ETLA 4W55A 1DYDA 1WTMA 5F9LA 5AKKA 2HHVA 2D91A 1L85A 1C08C 1QSSA 4G3IA 1FN5A 5J0SA 4RLNA 2LYBA 2XCPA 1ZYQA 3J4GA 2BQOA 4UWNA 3ISBA 4NGKA 5ALZA 3MR2A 7ICMA 3J6KA 1CUKA 4DQ5A 1AROP 1YQVY 2BQAA 3NY9A 3BQ0A 4DL2A 3FM9A 1YL0X 5FCPA 2LHTA 1L48A 5HHIA 5DN4A 4IC9A 2BQFA 1NNLA 3RZEA 2L78A 2LYHA 2WTFA 1XJUA 2Z37A 2OYYA 4R64A 3FDSA 1ZQUA 2YQEA 1L19A 4US9A 3QY4A 1UACY 2BKEA 2JXJA 3L4PA 5ALUA 3A96A 3E58A 1XEIA 2W3RA 1GE1A 3T6UA 1S10A 1OYUA 1RE2A 1TBYA 2EQLA 3EXDA 5HNLA 1ZQFA 2JV3A 1NF5A 1T3NA 1L83A 2KNJA 2FBBA 120LA 1C6HA 1CRXA 1ZQPA 5AK3A 1GDXA 236LA 2RB1X 143LA 1LGWA 1L80A 2B5ZA 3HTFA 3ZDCA 3WYHA 4NG1A 4OJPA 3B9JA 2FLLA 4GBRB 2BQ3A 1L7NA 1B5WA 1D8YA 4LZGA 3FA0A 4EXMA 3TXJA 1ZQYA 5ALGA 3NYAA 4C4RA 5E4PA 1LSCA 1U49A 4G4BA 1QUDA 4N1CC 3H4BA 5LYZA 4W53A 6LYZA 7ICVA 212LA 3M7DA 4K4GA 1OUDA 2PMZC 3CDTA 2EIZC 3C82A 211LA 3QYPA 5B5EU 1QTZA 4ETCA 4IRCA 8ICKA 1KN5A 1YROA 4W96A 3A94A 1ZQSA 1LSNA 5KXZA 1T97A 1RM6C 1S0VA 5AKXA 4YF2A 4EEKA 4O0IA 3RJGA 1OWYA 4H93A 2ZYPA 2EKSC 3DEEA 1L26A 3F5AA 2IA6A 3CSQA 4Z46A 1CX7A 3PO4A 180LA 3K4GA 3L5KA 1T7PA 5F14A 1XNSA 8ICXA 3GV8B 2HEEA 4F4WA 1LSAA 2EH9A 3LDAA 4H92A 3IHQB 1L77A 259LA 1LSZA 3HDFA 3AGHA 1JITA 3OHAA 3N4MB 1UUZC 1PK3A 1HEQA 1I20A 4R0FA 3WPKA 2EAOA 2Q9EA 5AM1A 4I2CA 3V7LA 1JSEA 3RFAA 1IV8A 4P0PB 4NSHA 5C6IA 2UVVA 1NK0A 1P2RA 1HHLA 1CJ8A 1L76A 1KQQA 1RZTA 3CRXA 147LA 4MFFA 3WVYA 1I56A 4MF8A 1HENA 3WKAA 5IIIA 2LMRA 3TFSA 2IHMA 3MGHA 2C8OA 4NWEA 2XC9A 159LA 3HH5A 3HT6A 1X6JA 5KFAA 1V38A 1L92A 4OO1J 227LA 1HSXA 1CKGA 1UPHA 2F1IA 2HHQA 2HEAA 3AZ5A 1CU3A 4C5FA 3LN2A 1WQNA 5LA5A 2XTHA 5ALEA 3TADC 3TQ1A 3ZD8A 5DQGA 1LKSA 3QEBZ 1IOCA 4CGEA 2WHEA 3RJHA 4OWHA 2IHLA 3V7JA 2QLTA 1RI8B 5HR7A 2RAZX 3W3EA 4H9AA 3EW9A 3GIKA 2KSOB 4YENA 1XSLA 4Y2RA 2ZJ8A 4I29A 2NTGA 4LFXA 2FMQA 4M4OA 2WF5A 1LKRA 4H9BA 2P35A 4P2EA 1UT5A 4XQ8A 4NLNA 1C10A 1WQQA 4UB1A 3WW5A 5LA8A 3WKEA 1MA7A 2VA3A 2F8KA 1PQOA 1KLNA 1C20A 2A7DA 3IJUA 3WW6A 3LK9A 1LSMA 2MEHA 2KG5A 1GF9A 4C80A 3RB6A 1LJHA 2K89A 5HR6A 4Y2SA 199LA 4C7YA 4WM5A 1BPYA 4IQWA 1YZ6A 3WPJA 3V72A 8ICZA 5HNKA 4BDPA 1JROA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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