2QB0B

Structure of the 2tel crystallization module fused to t4 lysozyme with an ala-gly-pro linker.
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILKQAGPNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase regulator
source organism Escherichia coli
molecule keywords E80-TELSAM domain
total genus 75
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 Transcription Factor, Ets-1 2qb0B01
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2qb0B02
1DYCA 4GRVA 1OV5A 2OTYX 239LA 172LA 1C6LA 1UQVA 1OWZA 3DKEX 167LA 104LA 145LA 2EANA 1KW4A 3FI5A 163LA 1JI7A 215LA 4I7SA 1PK1B 2L78A 1SSWA 111LA 2EAPA 4EXMA 3GUNA 1L66A 3QAKA 238LA 131LA 1L35A 1L29A 1L80A 1L32A 4ARJA 1C6CA 1LYIA 128LA 1WWVA 3HTBA 1L08A 1KNIA 1CU2A 210LA 3K2RA 1L24A 1CV0A 1B0XA 1L68A 1WTHA 246LA 2O79A 4I7TA 1CVKA 1L0JA 257LA 1KS3A 2B74A 2B73A 4IAPA 243LA 155LA 213LA 3SEIA 1L16A 1C63A 2B7XA 2ANVA 1LKYA 2ES6A 140LA 209LA 3DN6A 2DKZA 1L47A 1OV7A 1KW5A 1G0JA 1XJUA 2NTHA 1L43A 1L51A 2F2QA 1L28A 2Q9DA 177LA 1LW9A 1L77A 229LA 1L20A 1C67A 1L38A 1C6KA 3HILA 3C80A 148LE 1L54A 1DYGA 1OXJA 3SENA 185LA 225LA 1L79A 226LA 1D3JA 1L39A 2QKQA 127LA 248LA 3HWLA 4I7NA 3LZMA 1DXSA 1P6YA 1B4FA 1G07A 1G1VA 1T97A 1T8FA 4DAJA 1OWYA 1CUQA 3HT8A 4K5YA 4EJ4A 103LA 3HUQA 1L59A 3CDQA 1UCVA 1L49A 2DKXA 2QB0B 1L06A 1QUGA 2Z6BA 4W52A 3F8VA 102LA 2F3NA 4W55A 3SBAA 1P2LA 221LA 1TLAA 4RQMA 1SWYA 1L56A 1G1WA 2RBRA 3C7YA 3DNAA 4YXAC 2O7AA 3HU9A 1LGWA 1L55A 262LA 1X9XA 162LA 1D3MA 4W59A 1CUPA 235LA 253LA 1L31A 1D2YA 3BQ7A 1G0PA 220LA 1CX6A 122LA 158LA 189LA 1XEPA 178LA 2RAYX 3L64A 1CU6A 3SB6A 1L83A 3OE8A 181LA 1L94A 1QTCA 1L18A 3GULA 217LA 1NHBA 2F8KA 4ZPUA 1L85A 230LA 1C6BA 2KSOB 3HH4A 4RQNA 1C6HA 151LA 1SWZA 3CDRA 4ARQB 1D2WA 1L82A 1JTNA 3HH6A 3SBBC 1K28A 1SV0A 3SB9A 170LA 2HULA 2OE7X 3NY9A 1L81A 3DN8A 2RB2X 1L63A 1ZWNA 4OO9A 4EKPA 192LA 3BS5A 1LGUA 5JU5A 2OE4X 2B75A 2A4TA 1L25A 2QARA 1QTVA 196LA 3HH5A 4YX7C 3HU8A 5F3XB 5J8YC 1L48A 4S0WA 1LKYB 1L92A 1OYUA 3TACB 1L34A 1CV3A 164LA 3KKAC 1CTWA 1L26A 118LA 1L23A 1L46A 182LA 187LA 3HH3A 1C6MA 4ARLA 236LA 1L30A 115LA 1CU0A 4LDLA 1L36A 1L40A 5JRTA 1L67A 1P56A 129LA 249LA 3HT7A 2DL0A 1G06A 4W53A 241LA 1SSYA 4W57A 1L84A 3L2XA 223LA 3K1RB 1P36A 1CU3A 1L19A 231LA 1L42A 1SXEA 147LA 222LA 3HDFA 1RG6A 1G0GA 1L65A 3HUAA 4PK0A 1LYGA 3G3VA 3TADC 3OE0A 228LA 2RH1A 250LA 3DMXA 2F32A 1C68A 174LA 1QT8A 1L86A 1Z1VA 2OU0X 1PQKA 2NTGA 4NL9C 2K4PA 1QTBA 1L72A 1OVJA 1DYAA 212LA 4PZNA 206LA 142LA 1L14A 1P7SA 1COKA 4W54A 1OVHA 3D4SA 4NJ8A 3GUPA 2Y9UA 3CDTA 1L10A 168LA 2HUMA 1LYFA 1F0MA 130LA 171LA 1JTMA 1QS5A 3NYAA 4I7LA 3C8RA 1L76A 1L17A 4IS7A 150LA 1I6SA 1SXDA 2Q9EA 197LA 1PQDA 1SX7A 200LA 2E8OA 3IDWA 1PK1A 2D8CA 1L33A 1L53A 2B70A 2OU8A 1ZURA 1LYDA 4W51A 3ODUA 1DYDA 1L71A 3DN0A 4DKLA 4ARMB 1QS9A 4GBRB 5JTIA 3HT6A 2QARC 1QTDA 166LA 214LA 113LA 4EPIA 1LLHA 1X66A 2OEAX 1L41A 219LA 2ESEA 1L61A 1L97A 1L04A 216LA 1L87A 2B6XA 1LWKA 3VW7A 1G0KA 3CDVA 4AQNA 1L07A 1WWUA 211LA 2HUKA 2D3DA 180LA 1X40A 237LA 2LC9A 3DN1A 1PQOA 261LA 1KY1A 5LZMA 4I7KA 1CV6A 234LA 2B6TA 1LI6A 1P3NA 1L57A 1C6IA 2RB1X 3BS7A 3PDSA 3GUMA 3SB8A 1P64A 4PJZA 1L05A 2F44A 4EKQA 3G3WA 137LA 1LI3A 258LA 3UONA 3C82A 1CV4A 1C61A 1L69A 245LA 4EKSA 6LZMA 3GUOA 1OVKA 7LZMA 1L13A 1L50A 255LA 2LCBA 1PQIA 2RBQA 4W56A 1L64A 205LA 1QT4A 232LA 3GUIA 4LDOA 2B72A 3DN2A 176LA 5J8YA 1D3NA 3PBLA 1DYEA 1L98A 1L22A 2QB0A 169LA 3HT9A 191LA 1L03A 143LA 3C81A 1C6NA 1L01A 159LA 3KKAA 1QT6A 2Y9TA 1LGXA 251LA 259LA 252LA 3HTFA 4PZOA 3FA0A 1L0KA 109LA 1SX2A 1QUDA 2OU9A 108LA 4DJHA 195LA 1CU5A 2KIVA 3EMLA 2JV3A 1L90A 1L00A 3HTDA 3HUKA 3JR6A 3C8SA 2GLEA 1C66A 4ARPA 2KG5A 2OE9X 165LA 126LA 2LMRA 3V2WA 1C64A 3OE9A 1QTHA 4I7OA 201LA 1KY0A 1C6TA 3FADA 3C7WA 1L52A 149LA 2KSOA 1C65A 3F9LA 1V85A 184LA 2F47A 3TADA 1V38A 183LA 242LA 3SB5A 240LA 2CUUA 4ARQA 112LA 3RUNA 218LA 146LA 186LA 4LZMA 1QSQA 1C6EA 4W58A 4NL9A 1SV4A 1L93A 1LYJA 2LZMA 1EPYA 1LI2A 1T6HA 190LA 3V2YA 1C6DA 2KMDA 260LA 2RBSA 3C8QA 4YXCA 224LA 2EAOA 1CV5A 1C6QA 141LA 2RBNA 1L02A 2ANXA 1D3FA 1L95A 1QUOA 1P2RA 1P5CA 3C83A 1OW5A 1B6IA 1SGGA 1L88A 1PQMA 1JQUA 233LA 3HDEA 1L44A 1C6AA 1QT3A 256LA 2L5YA 2YTUA 2RB0X 1G0LA 152LA 110LA 1QUHA 1LYHA 4I7PA 2QB1A 3DMVA 3GUKA 1L11A 2LPEA 1L74A 1PQJA 1L15A 3CDOA 3RZEA 123LA 173LA 2B6GA 125LA 161LA 3NY8A 1P37A 244LA 3SN6R 2E8PA 3BS5B 1C60A 1PK3A 2FE9A 2QARB 2RBPA 1G0QA 3SB7A 1QT5A 1T8AA 5KNIA 247LA 175LA 2OTZX 1L70A 138LA 1L45A 2B6YA 4I7QA 1L62A 1C6FA 188LA 1L91A 1LWGA 157LA 2B6ZA 1L58A 5I14A 1L99A 3C7ZA 254LA 1DYBA 1CX7A 2O4WA 3DN4A 5L1MA 4MHVA 1L09A 4LDEA 4EPFA 2RAZX 1G0MA 2E8MA 2B6WA 3DN3A 119LA 199LA 120LA 1ZYTA 2IGCA 4I7JA 4EKRA 114LA 1CV1A 3OE6A 1L37A 3G3XA 156LA 1D9WA 3H8MA 1L96A 1LYEA 1L75A 1L73A 3HTGA 1P46A 1L27A 1T8GA 4I7MA 198LA 4E97A 1C6GA 2EAMA 1C6JA 1L60A 2KE7A 1XJTA 1L12A 1SV0C 1C69A 139LA 1DYFA 144LA 1L21A 1QSBA 227LA 3GUJA 4ARMA 2RBOA 4I7RA 2E8NA 107LA 160LA 1QTZA 1L89A 1C6PA 1LPYA 3DMZA 2K60A 1QT7A 1C62A 1KW7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KFYA 2W8KA 2R8IA 1ZQPA 1OV5A 3JPQA 1OUCA 3C23A 239LA 1C6LA 3BDPA 2RSCA 4RLMA 133LA 1OWZA 3ISBA 3JPPA 3PW0A 1N61A 2M9NA 5ALDA 4RQ7A 4CFPA 4PPXA 3PY8A 3N7RC 5CRXA 1TAMA 2XQOA 3FI5A 4DSJA 1MSWD 4EOFA 4P2HA 3GUNA 4QIWC 5T14A 3ETLA 1VAUA 3WUNA 2W3RA 4UB8U 4DFDA 8ICAA 2OCEA 4HTKA 3QAKA 238LA 1W6ZA 5AKYA 3MFHA 2BKEA 1TBYA 5CP2A 3RW8A 5FEKA 5E4PA 1IWYA 4PHDA 2DBYA 4LFXA 4LYBA 1L7OA 1QCKA 1C6CA 1LYYA 4UB3A 3PR5B 1KNIA 2WTFA 1CV0A 7ICLA 1GB6A 1B0XA 1WTHA 1YKXX 1WCLA 3SZ2A 4DDAA 1JKAA 1TAUA 3N7SC 4F3OA 257LA 4GCFA 4HAIA 2B73A 4IRCA 3RJKA 213LA 3SEIA 5DL9A 1L16A 1TAYA 1GB0A 5KFXA 3MR3A 1S8OA 5AK4A 5E79U 5GTIU 4FS1A 4EX6A 1MELL 1QSAA 1OUFA 3PNCA 5AIBA 2I9GA 3ZD9A 2C2RA 2EQYA 3Q8PB 3C1ZA 1L47A 4ML7A 1KW5A 2YBHA 1JXEA 2K4HA 5DQIA 2W3SA 1XJUA 1L43A 4LYTA 8ICVA 1LW9A 1SLYA 2NRWA 4JWNA 4K4HA 5I4YA 2WAQF 1RYUA 3HILA 3C80A 148LE 1L54A 2YBNA 2MA1A 4ELTA 3RT5X 2FLLA 2KJ8A 4JV0A 2QKQA 3HWLA 2RDIA 4E3UA 5AM2A 2BQEA 1GD6A 4DD9A 1QQ6A 1B4FA 3KBBA 1G07A 1T97A 1LZAA 5GTHU 1CUQA 5LAGA 4GLXA 4K5YA 1ZQZA 3HUQA 3BZCA 4LFPA 1L06A 1WUDA 4ELUA 4W55A 4NSGA 1KIQC 1DGSA 1GBOA 2H9JA 4QZAA 221LA 4US8A 5IELA 3BQ2A 4U3XB 1ZQBA 5II3A 1X9XA 5J2JA 3RBDA 1ZD5A 3EUB2 5G5GA 4CF4A 253LA 3EWAA 4R64A 1L31A 1T6VL 2E1FA 1G0PA 5I4XA 3B6LA 2BQ3A 4KLLA 1XEPA 3TAQA 1G7HC 5J29A 2ZYPA 5KFSA 2JGAA 181LA 4OWEA 1P7DA 1NJYA 1FDLY 4IQVA 2ZXHA 4KITB 4KLDA 1L18A 3GULA 4H8YA 1NHBA 3OHAA 1T8EA 4CCHA 1L85A 3WW6A 3C2KA 2CN1A 2LYHA 2FJ6A 2ZG6A 3RH5A 1SKWA 1UBZA 4HYKA 4BXOA 4RW1A 2ZUBA 194LA 4Y2PA 1WTNA 1JKCA 4X3BA 4ARQB 3GV5B 4TSCA 3QNGA 1KXXA 2DPJA 1A77A 3TMVA 4ECVA 2MEFA 4F2RA 3UQ2A 5KG1A 3I76A 3TMWA 1IP7A 5LYMA 3WKDA 4HJZA 5AI0A 3JPRA 1NDMC 3NY9A 4M47A 1V97A 3NRZA 2RB2X 1ZWNA 4OO9A 1LSNA 3ZDCA 7ICIA 1T94A 3BS5A 3GV7B 1FKVA 3WUAA 4FBUA 1QTVA 2QARA 1HIWA 1BPYA 135LA 4UATA 5J8YC 4E0DA 1L92A 1OYUA 1QUTA 3CYMA 2HBJA 1GO3F 3TXJA 5BPCA 2G5IB 1ZQEA 1S77D 5B66U 4NV0A 5DLFA 3KKAC 1CTWA 4LYOA 4NGOA 3RB0A 1L46A 4B9TA 4XJHA 2BQNA 4OCZA 5KXWA 5C5JA 4C7ZA 3FI7A 4YP3A 2I1QA 5FELA 2P6RA 5KG4A 8ICEA 1PVPA 4DL7A 1CKGA 5HHHA 115LA 4IQTA 3QXGA 4RNMA 4CFOA 2BCQA 3OTQA 1AZFA 4LDLA 2OEHA 1L67A 4YD2A 4EEYA 4RT2A 4EBDA 249LA 3B9JA 3HT3A 2DL0A 4W53A 2ZUCA 4PHAA 2XY7A 4W57A 3R9KA 1S0OA 1DI3A 4GN3A 1GEVA 2FBDA 3K1RB 1JXLA 1P36A 1B5WA 1UT8A 1CU3A 2F1IA 4Y2SA 4QZ9A 231LA 2KP7A 4C0ZA 2K4IA 4RT3A 4CJ2A 2IOFA 4N1CC 1LZDA 3HUAA 4RLNA 1K1QA 1RI8B 1RYSA 8ICOA 4NGYA 2MAXA 1HUZA 4N0JA 2JRZA 4PL1A 3P4ZA 5AI4A 4CGEA 3WYHA 4TUPA 1L72A 1HC0A 4HP0A 2MRLA 4EELA 1L14A 1P7SA 4PRQA 1KXYA 1VLBA 1JJ1A 4XRHA 2DBTA 2Y9UA 3CDTA 3UXPA 2I25L 1L10A 3AJNA 3WU7A 1N60A 4LJXA 5AM1A 2HUMA 3MBYA 9ICPA 4ETBA 5FCPA 3SR6A 4I7LA 2FPKA 1JTOL 4EX7A 1L76A 4MFAA 4IS7A 1XC9A 1I6SA 1ZQJA 4Y2JA 1IWVA 2DQEY 1GPQC 4KL7A 4XN6A 5KFZA 4R66A 3EPGA 4F2SA 4YD1A 3OSNA 9ICQA 1TVAA 1GB2A 1DYDA 2VIXA 2ZNXY 4EBEA 4DKLA 3CRXA 4YR0A 2BQFA 4ARMB 3AQEA 5KXRA 1DI4A 2W55A 2HHQA 1DPXA 5KT3A 1OQMA 1QS9A 5J2EA 1KBUA 1ZQCA 1ZMYL 4ETCA 3WVYA 4U6PA 214LA 2JH1A 2HOIA 1QTMA 1LLHA 1X66A 2YB4A 3RB4A 2YBJA 5A3EA 2ESEA 2LZ2A 4I2GA 1AKIA 2IHMA 4NG1A 4NHSA 9ICFA 1KLNA 2HDOA 1LSMA 2UVWA 237LA 1KKXA 1DK3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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