The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
63
|
structure length |
63
|
Chain Sequence |
GIPYRTVSEWLESIRMKRYILHFHSAGLDTMECVLELTAEDLTQMGITLPGHQKRILCSIQGF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Ephrin type-A receptor 1
|
| publication title |
SAM Domain of Human Ephrin Type-A Receptor 1 (EphA1).
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Transferase
|
| total genus |
19
|
| structure length |
63
|
| sequence length |
63
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-05-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1F0M A; 2L5Y A; 5JU5 A; 2KMD A; 2DKX A; 2KIV A; 1SV4 A; 2E8P A; 3TAC B; 1WWV A; 4RQM A; 1UCV A; 3TAD C; 5KNI A; 4NL9 C; 4NJ8 A; 1V85 A; 2DKZ A; 3BQ7 A; 1B4F A; 2EAO A; 2ESE A; 1OXJ A; 3H8M A; 2F44 A; 2Y9U A; 5JTI A; 1X9X A; 2QB1 A; 1WWU A; 2FE9 A; 2E8M A; 2K60 A; 2QB0 A; 2KG5 A; 1SGG A; 1SXE A; 5J8Y C; 1OW5 A; 1SV0 C; 1LKY A; 1COK A; 1PK1 B; 3HIL A; 4MHV A; 1X66 A; 5JRT A; 1X40 A; 2ES6 A; 2QAR B; 3TAD A; 2GLE A; 4NL9 A; 3BS5 A; 1B0X A; 4IS7 A; 2D8C A; 1Z1V A; 4PZO A; 1PK3 A; 3SEN A; 2E8O A; 2EAN A; 2KSO A; 3BS7 A; 2QKQ A; 1KW4 A; 5F3X B; 2LPE A; 1LKY B; 1JI7 A; 2EAM A; 4RQN A; 3KKA C; 1V38 A; 2LMR A; 2B6G A; 1SXD A; 5J8Y A; 2KE7 A; 1SV0 A; 1PK1 A; 2F8K A; 3K1R B; 2YTU A; 2D3D A; 3SEI A; 3IDW A; 2EAP A; 3KKA A; 3BS5 B; 4PZN A; 1DXS A; 2JV3 A; 1UQV A; 2Y9T A; 2QB0 B; 2F3N A; 2E8N A; 5L1M A; 2QAR A; 1RG6 A; 2KSO B; 2DL0 A; 2K4P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3WKD A; 4YD2 A; 4ELV A; 2XY7 A; 2KMD A; 3RB3 A; 4ECU A; 3JPO A; 4OJL A; 1N63 A; 4O0I A; 4KLI A; 1ZJM A; 2BPC A; 4CF3 A; 1B43 A; 4ECT A; 4NL9 C; 4GXJ A; 1TAQ A; 5ALK A; 4DL6 A; 3PSI A; 4ACO A; 1TAU A; 4TUQ A; 3M1Y A; 5CR0 A; 4J03 A; 1S77 D; 2OM6 A; 9ICT A; 4DQI A; 3TAP A; 4MF2 A; 2QB1 A; 1KKX A; 5K4L A; 3T5L A; 2E8M A; 1SGG A; 1RQL A; 4DQS A; 3RTV A; 3C2M A; 4CNQ A; 1RYR A; 3HWT A; 4QWB A; 1CEZ A; 1SWV A; 1B22 A; 5KTQ A; 1Z3E B; 1TK5 A; 1Z1V A; 2W7O A; 2PFN A; 4Y2P A; 3QUT A; 2BQU A; 4O3N A; 1RYU A; 4M9L A; 1KFT A; 4F91 B; 4PHA A; 4BUG A; 2A3V A; 4UW9 A; 4TUP A; 3OJU A; 4NM2 A; 1KDH A; 1V38 A; 4C80 A; 2WF6 A; 1HEK A; 2R8I A; 2BQR A; 2HVI A; 1WCN A; 3O0F A; 5KFV A; 4BJQ A; 4P0Q B; 3H40 A; 4YR2 A; 1RG6 A; 1ZQO A; 4RU9 A; 2KD1 A; 4EZ9 A; 2DUY A; 3GV7 B; 4J9R A; 2KIC A; 3T3F A; 5KT3 A; 2BCV A; 4ECS A; 1ZOL A; 1YZ6 A; 2ZUC A; 5AKG A; 1NJZ A; 4USA A; 3JPR A; 5FP0 A; 3H0L B; 1S0V A; 3PV8 A; 3BQ7 A; 3PX4 A; 4DSF A; 1NK8 A; 5AM3 A; 9ICL A; 2G08 A; 4PGX A; 5KFS A; 2JEF A; 1K5O A; 4F8R A; 9ICS A; 1KEJ A; 2JHD A; 4G3I A; 1ZQD A; 2A1J B; 4RQ4 A; 1KFS A; 3PST A; 4YMN A; 1L6N A; 9ICC A; 2JR5 A; 1NKB A; 3MR3 A; 3HJE A; 2AGP A; 2GOL A; 2KP7 A; 2BGW A; 1B0X A; 4I2B A; 4RNN A; 2KK0 A; 4YN4 A; 4TQR A; 2UVW A; 1U49 A; 4M04 A; 4O5C A; 4QZI A; 2BQ3 A; 1JX4 A; 2MA1 A; 4O3P A; 2VA2 A; 4DSI A; 1PVQ A; 2KJ5 A; 2BCQ A; 4ZOH C; 7ICQ A; 2XGP A; 1Q3V A; 2W9M A; 2KE7 A; 2W9B B; 1SV0 A; 2OH2 A; 1ZQQ A; 2E5S A; 5CA7 A; 4J9P A; 1DK2 A; 3N7S C; 9ICU A; 3RRG A; 2BR0 A; 4A8E A; 2PMZ C; 9ICX A; 1RDF A; 2KZM A; 4FS1 A; 1ZQC A; 7ICM A; 1S0M A; 4DSK A; 3T79 A; 5EWG A; 1DGJ A; 3EYZ A; 4I2G A; 1F0M A; 2L5Y A; 4UAY A; 2HHV A; 5AKK A; 2DPI A; 4QW9 A; 4JUZ A; 7ICJ A; 3L3F X; 5CRX A; 1U47 A; 4FZN A; 3QEB Z; 2WAQ F; 4UB3 A; 2OCE A; 3RH5 A; 4RUA A; 3JPS A; 3LWM A; 3PX6 A; 4NJ8 A; 1SKW A; 3AMZ A; 3M6K A; 3ZDD A; 4YP3 A; 4YMO A; 5J2A A; 5J29 A; 3AU2 A; 3GDX A; 4QWC A; 2JMG A; 3GII A; 3HW8 A; 5IIL A; 1S10 A; 3V6K A; 5JTI A; 2HHQ A; 5KFT A; 1ZYQ A; 3M8R A; 2FE9 A; 4J9S A; 4FZL A; 1BPY A; 3NVW A; 3GU3 A; 4JV0 A; 3F5A A; 1MQ3 A; 1SL0 A; 4MF8 A; 4RQ0 A; 4UAT A; 2IHN A; 4QZG A; 2Z7J A; 4DFD A; 4F4K A; 2YMQ A; 3RB6 A; 1MC8 A; 1X40 A; 3JPT A; 2YN4 A; 2XID A; 2QAR B; 5J2G A; 2PFO A; 3SV4 A; 4DF8 A; 2K89 A; 1J97 A; 2WB1 C; 4RQ8 A; 3R9K A; 2YY6 A; 3B0Y A; 4QZA A; 4KLQ A; 4QWA A; 3VC8 A; 1PK3 A; 4QZE A; 3PMN A; 2HOI A; 7ICH A; 3UXO A; 4KN4 A; 4DOB A; 3MR2 A; 1SIJ A; 4QZH A; 4FZM A; 3K75 D; 3NUQ A; 2VA8 A; 4KLO A; 3AEV A; 2ZIV A; 5CEH A; 4Q43 A; 8ICK A; 5ALR A; 1SZP A; 2V9W A; 4KLJ A; 3RJF A; 2F3N A; 5KFX A; 4ECW A; 2KSO B; 3AN1 A; 2MUT A; 1X9S A; 3E58 A; 2J6S A; 2KHQ A; 2XCA A; 3SAH A; 2IBK A; 5KG2 A; 3H0R B; 4R8U B; 3IRU A; 2R8H A; 1D8Y A; 1ZQY A; 1WWV A; 3A0B U; 3D6J A; 5EE3 A; 2HBK A; 3WK9 A; 8ICM A; 1Z4O A; 5AK5 A; 1F44 A; 3I1Y A; 4JB3 A; 5AM2 A; 3M9O B; 2FLL A; 1XWL A; 3AQF A; 4I2E A; 4UAV A; 3DV9 A; 3TQ1 A; 1JRP A; 4X5V A; 3C5F A; 3PO5 A; 1ZET A; 4P0P A; 4OO1 J; 2ODG A; 1TVA A; 1QCK A; 5AIA A; 4PGY A; 1ZQB A; 2P6R A; 4F2S A; 7ICN A; 5ALN A; 1LKY A; 1RPL A; 1PK1 B; 5HNK A; 4MHV A; 8ICB A; 5IIN A; 9ICP A; 3JPN A; 2W3S A; 2G0A A; 4C4S A; 2LYH A; 2PFP A; 3RH4 A; 3F53 A; 4QZC A; 3SQI A; 2HHX A; 1HUZ A; 4KIT B; 3RRH A; 8ICO A; 3V72 A; 4UAW A; 3D2S A; 1IXR A; 9ICQ A; 5CP2 A; 2EAN A; 3CNH A; 5DG8 A; 4DFK A; 1BVS A; 4ED6 A; 4YR0 A; 4BGD A; 3EUB 2; 4NV0 A; 3WK8 A; 1FEZ A; 4KLM A; 4IR9 A; 4YXM A; 5DBB A; 5ALG A; 4DFM A; 8ICI A; 2F1H A; 3GIL A; 2KIW A; 2PI4 A; 3GV8 B; 4DL3 A; 1VLB A; 1KSP A; 4ECY A; 2JEG A; 3IDW A; 4Y2J A; 4QWD A; 4R65 A; 3B9J A; 4GC6 A; 4KLH A; 2VIX A; 3HT3 A; 5J2B A; 1Z1B A; 3C2L A; 3TI0 A; 2BHN A; 2W43 A; 4EYH B; 5KG0 A; 5KFI A; 2LM1 A; 2OHF A; 4HAI A; 4US8 A; 2DKX A; 1VJ5 A; 4PL2 A; 3TAD C; 3OTQ A; 5KFG A; 1PZN A; 1QSY A; 9ICR A; 2ZIW B; 1QLN A; 2LHT A; 3KHH A; 4NXZ A; 1BPZ A; 4UB8 U; 2P6U A; 1SL1 A; 2V4R A; 3HKZ F; 5HP4 A; 2O6K A; 5III A; 2AGO A; 2Y0S F; 4IRK A; 3LWL A; 8ICW A; 1L3T A; 5EE1 A; 4J9M A; 1L8L A; 4C7Z A; 4IR1 A; 4OJP A; 5ALT A; 2ZIX A; 4XRH A; 3WU2 U; 1XNS A; 2I9G A; 4F72 A; 4I2F A; 3EPI A; 2D8C A; 4LZG A; 5DDY A; 2ZG6 A; 2RLT A; 5F3X B; 5TIS U; 2KKP A; 5DGA A; 4KLL A; 5KG7 A; 1DRG A; 4O5E A; 4GC7 A; 3A0H U; 3GQC A; 2LMR A; 4I2I A; 1OUQ A; 1X42 A; 2V4Q A; 3LK9 A; 3GZF A; 5KT2 A; 1NJY A; 1L3S A; 4KLS A; 4DF4 A; 1ZD3 A; 2YX8 A; 4B9L A; 4IRC A; 4RZR A; 4RPY A; 3TFS A; 4QIW C; 4IC9 A; 4YR3 A; 3NGD A; 1T3N A; 3PR5 B; 5G5H A; 2W03 A; 1K1S A; 1JRO A; 3EPG A; 2XI9 A; 4C4R A; 2IOF K; 8ICE A; 5L1I A; 2ASJ A; 1FIQ A; 2KFZ A; 1XU4 A; 3TAN A; 3MFH A; 3NS1 A; 1L7P A; 5KG1 A; 5KAI U; 5KNI A; 1D8B A; 4Z6D A; 1Q46 A; 1NJW A; 1H38 A; 2BCS A; 4DL2 A; 4DS4 A; 5T14 A; 3D2N A; 4KN7 A; 5C5J A; 3PW0 A; 1L7M A; 5ALZ A; 3PX0 A; 1L8O A; 1NNL A; 5DKW A; 5IIJ A; 1XO1 A; 1L3U A; 4P4P A; 4C8O A; 3PW2 A; 3FYH A; 3VCB A; 2LKY A; 2ZTD A; 3ZI4 A; 5KL1 B; 3WKB A; 3T5H A; 1NZP A; 4UB6 U; 2DGZ A; 3HP6 A; 8ICU A; 4DOA A; 2G06 A; 2YMM A; 3KHL A; 3V7L A; 3PSP A; 5DG7 A; 2ZTE A; 2FPM A; 2UVR A; 1QSL A; 4KLG A; 4KMO B; 4TQS A; 4QW8 A; 2GH1 A; 2LI6 A; 5J2E A; 2MSN A; 4ED3 A; 2R8J A; 1L3V A; 4I2A A; 5AI5 A; 4IL6 U; 5HHI A; 4M6W B; 9ICF A; 1TKD A; 2NRV A; 4JV1 A; 1TE2 A; 2E1E A; 3RF9 A; 4OCZ A; 5KFK A; 3Q8R B; 4EEK A; 2HOQ A; 3SMV A; 2HDO A; 4DL5 A; 1JN3 A; 1BNO A; 2E8N A; 2RDJ A; 5AKE A; 1ZQP A; 2HOF A; 1WUD A; 3RBE A; 2HI0 A; 1TFR A; 3G6Y A; 2KIV A; 4LJX A; 4QZD A; 5G5G A; 2P35 A; 4UB4 A; 5DQH A; 3ETL A; 4M9J A; 1N61 A; 2RHF A; 2GWS A; 5AKL A; 2ZIV B; 5KFY A; 3UMC A; 3QU2 A; 4NLN A; 2AGQ A; 2Y1J A; 1S9F A; 5KT6 A; 5J2C A; 4R64 A; 3BQ0 A; 5KT4 A; 5HR7 A; 3PSF A; 2W3R A; 4Q44 A; 1XSP A; 5AK3 A; 3KFU F; 2R8K A; 2QB0 A; 1ZXI A; 4EZ6 A; 4ICA A; 4F93 B; 5J8Y C; 2FJ6 A; 3HIL A; 5BOM A; 4F4Y A; 2ASD A; 4MFC A; 1JUD A; 2CPR A; 5AI9 A; 3RAQ A; 2ZIU A; 4YXJ A; 2HW3 A; 5ALL A; 2I1Q A; 1Z4N A; 3MR5 A; 1NKE A; 5ALF A; 4P0P B; 2NO4 A; 5EOZ A; 2E8O A; 2ATL A; 3SI8 A; 2WF8 A; 2ZJ8 A; 1RXW A; 5DDM A; 4ECQ A; 2DBY A; 2KN7 A; 2LPE A; 3LVW A; 2HHW A; 3BZK A; 1LKY B; 4PJ0 U; 1JI7 A; 1ZD5 A; 2RQ5 A; 2AU0 A; 5AKI A; 1WCL A; 1SXD A; 2R18 A; 5A0L A; 5AKX A; 5J0S A; 1PVP A; 4IRD A; 3H4D A; 3Q8M A; 4DEZ A; 2F1J A; 3F2C A; 5BOL A; 4C8N A; 3N28 A; 4F5O A; 1UA1 A; 3AQE A; 2FPK A; 2DL0 A; 2NRZ A; 8ICH A; 3PNC A; 5AIB A; 1SKS A; 4P4M A; 5KL8 B; 1ZQZ A; 2HMX A; 5HMM A; 5KFU A; 5KFH A; 5KG4 A; 4GXI A; 1S0N A; 2H5X A; 4M2Y A; 2DPJ A; 8ICC A; 3ISC A; 5ALY A; 1D9D A; 4KMU A; 1XSN A; 3OJS A; 1WG8 A; 3NVV A; 1A76 A; 3RH6 A; 5ALM A; 1X9X A; 4CE6 A; 4EYI B; 2M9N A; 2N1R A; 5CB1 A; 3PZP A; 1Q3U A; 4ELT A; 5DBA A; 1A6S A; 4I27 A; 9ICO A; 4UAS A; 3IV6 A; 2Q0Z X; 5AI0 A; 4DWI A; 3BQ1 A; 1BGX T; 2YQE A; 1GO3 F; 2W54 A; 3ISD A; 4B9U A; 4FFD A; 7ICL A; 2LM4 A; 3OSP A; 3TAQ A; 4NL9 A; 1ZQR A; 1ZQM A; 8ICZ A; 8ICX A; 2OWO A; 4IQU A; 3M9M B; 3H4B A; 1NK9 A; 3H8J A; 2EZZ A; 3G6X A; 4BXO B; 1ZQI A; 3M9N B; 2EAM A; 5ALU A; 1Q8K A; 4ECV A; 5J2D A; 3ETR A; 2EQY A; 1NK7 A; 2D3D A; 5TZV A; 2HBM A; 2ALZ A; 3CRX A; 1ZQW A; 2QLT A; 3IM1 A; 2Y1I A; 2VJ4 A; 1QH9 A; 3JPQ A; 1DOQ A; 1WYG A; 7ICU A; 5ALO A; 4DO9 A; 4DQQ A; 3OPX A; 3CYM A; 2K4P A; 1ZQV A; 3QU5 A; 5JU5 A; 4RNM A; 2C2R A; 3QNM A; 2XIC A; 2E8P A; 4GIB A; 1T4G A; 2R8G A; 1ZJN A; 2DWQ A; 2RRD A; 1X2I A; 2FLP A; 1SWW A; 5KFE A; 3KZI U; 4I28 A; 2RDI A; 1JXE A; 3UM9 A; 1FFU A; 4F5N A; 3HPO A; 2WAQ C; 4GXK A; 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4M9G A; 4RQ2 A; 1S5L U; 2KZ3 A; 3RJG A; 8ICA A; 3WK7 A; 5AM5 A; 4RPZ A; 4F4X A; 2PKE A; 7ICO A; 5KFA A; 3GIJ A; 4NY8 A; 1S8O A; 1ZQE A; 2EZY A; 1JIH A; 5J0Y A; 2KVC A; 2B0C A; 1COK A; 5AKH A; 3FDS A; 4JK1 A; 4K4H A; 3T5J A; 7ICS A; 4O5K A; 3LDA A; 2H3I A; 2JH7 A; 2E1F A; 4I29 A; 2K4E A; 3WK4 A; 5KFC A; 1HIW A; 2JZB A; 4QZF A; 5D4B A; 1PVR A; 4DQR A; 1ZQN A; 4UBB A; 3N4M B; 3WKC A; 3LYS A; 7ICG A; 4F92 B; 5EE0 A; 1C7Y A; 3KKA C; 2J6U A; 1T8E A; 2AJQ A; 1ZQX A; 2PXI A; 1SZH A; 2AQ4 A; 1QQ6 A; 4F2R A; 2KVS A; 3GV5 B; 5KT7 A; 3MDC A; 3K1R B; 2IOH A; 3SEI A; 4QJF B; 2E3T A; 1ZD4 A; 2W9C A; 1ZQJ A; 5ALV A; 4NLK A; 3KBB A; 5ALH A; 4QZ9 A; 4KTQ A; 2KHV A; 4GLX A; 2WF9 A; 3MDA A; 1MQ2 A; 2QAR A; 5DB7 A; 3EZ5 A; 5ALS A; 4J9Q A; 4DQP A; 4JV2 A; 5J2J A; 1K1Q A; 2YB4 A; 4U7C A; 3IHQ B; 4RPX A; 3E2E A; 4MFF A; 1IIP A; 3L5K A; 2CRX A; 3MBY A; 2JEI A; 1BNP A; 9ICH A; 2OXO A; 3SYZ A; 4YVZ A; 5J0R A; 3PW4 A; 4NLG A; 3GIK A; 1S97 A; 1HUO A; 4PGQ A; 1N48 A; 4Y2V A; 4RQ1 A; 5DB9 A; 2FLN A; 4PH5 A; 1X9M A; 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