The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
63
|
structure length |
63
|
Chain Sequence |
GIPYRTVSEWLESIRMKRYILHFHSAGLDTMECVLELTAEDLTQMGITLPGHQKRILCSIQGF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
SAM Domain of Human Ephrin Type-A Receptor 1 (EphA1).
rcsb |
| molecule keywords |
Ephrin type-A receptor 1
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
19
|
| structure length |
63
|
| sequence length |
63
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-05-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WWU A; 1SV0 A; 3H8M A; 5KNI A; 2QB0 A; 1X40 A; 1X66 A; 5J8Y C; 4PZN A; 1Z1V A; 2KSO B; 1X9X A; 3KKA C; 2FE9 A; 2KG5 A; 3BS7 A; 1WWV A; 2KSO A; 2Y9U A; 2ESE A; 2F8K A; 2EAO A; 2K60 A; 4MHV A; 5JRT A; 2QB0 B; 2E8M A; 1PK3 A; 4PZO A; 1SV4 A; 1V85 A; 2E8P A; 2F3N A; 2YTU A; 2EAP A; 1F0M A; 1B0X A; 2KMD A; 3TAD A; 1SV0 C; 1UCV A; 2Y9T A; 5F3X B; 4IS7 A; 2B6G A; 2K4P A; 1SXD A; 4RQM A; 2KIV A; 2EAM A; 2L5Y A; 2DKX A; 3TAC B; 2JV3 A; 1SGG A; 1LKY B; 2LPE A; 4NL9 C; 4NL9 A; 1V38 A; 2QKQ A; 4RQN A; 1RG6 A; 1KW4 A; 3SEN A; 2DKZ A; 3TAD C; 2E8O A; 1LKY A; 2D3D A; 2F44 A; 2D8C A; 3BS5 A; 2ES6 A; 3K1R B; 2DL0 A; 1JI7 A; 1SXE A; 1B4F A; 2KE7 A; 3IDW A; 1DXS A; 2QAR A; 1COK A; 3BQ7 A; 2GLE A; 2E8N A; 3HIL A; 1UQV A; 2QB1 A; 5J8Y A; 3BS5 B; 3SEI A; 3KKA A; 2EAN A; 5JU5 A; 1PK1 B; 2QAR B; 1OW5 A; 4NJ8 A; 5L1M A; 5JTI A; 2LMR A; 1PK1 A; 1OXJ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1QSS A; 1X40 A; 2R8H A; 3NRW A; 1VJ5 A; 2WAQ C; 3M1Y A; 2VA3 A; 1RZT A; 3MC1 A; 1PVP A; 3QUC A; 5HHI A; 5HMM A; 4PHP A; 4O3Q A; 4QWE A; 4RUA A; 4DS4 A; 2JMG A; 5AKZ A; 4EYH B; 5HP4 A; 4O3N A; 1B0X A; 2KMD A; 3C23 A; 3ETR A; 5KFK A; 2XCA A; 4R66 A; 4DOA A; 4Y2X A; 2ATL A; 4M47 A; 1Y88 A; 2EAM A; 3JPN A; 1YZ7 A; 1N63 A; 1ZQH A; 1N5X A; 1NJZ A; 3IM1 A; 2XY7 A; 2HBM A; 4XUS A; 5AIB A; 1ZQP A; 2DF4 B; 4JUZ A; 5J2F A; 2D3D A; 4QWB A; 5C5J A; 1SB3 C; 3C5G A; 1ZQG A; 3GU3 A; 2EH9 A; 5AK3 A; 2I1Q A; 9ICF A; 2RDJ A; 3T5J A; 2K4H A; 3T79 A; 1V97 A; 3PW4 A; 2I9G A; 3JPQ A; 2JEI A; 3DDH A; 1N60 A; 4P0P A; 3QU5 A; 3SAH A; 1KSP A; 4A8E A; 5J2J A; 4O3O A; 2HCF A; 3PSP A; 1ZET A; 3TKA A; 2XIC A; 1TFR A; 2ZJ8 A; 3GV7 B; 5G5H A; 2K8C B; 3RJK A; 1U9L A; 3MAB A; 3N7R C; 1OUQ A; 4NJ8 A; 4RT3 A; 2BPG A; 5L1M A; 3SD7 A; 1IM4 A; 3E0F A; 4F3O A; 1D9D A; 4QWA A; 2HOI A; 3ZD9 A; 1J97 A; 2RDI A; 4OJ5 A; 4M6W B; 3QEB Z; 3N4M B; 2NRW A; 3SAG A; 3QU2 A; 5AIC A; 3MDC A; 3EWA A; 1HUZ A; 4Y2S A; 1L7P A; 2C28 A; 1CUK A; 2W9C A; 3ZDE A; 1RXW A; 2KK0 A; 7ICP A; 5AKX A; 3QZ8 A; 4C80 A; 2IHM A; 4FZM A; 5J0U A; 3C29 A; 4C7Y A; 5IIK A; 2M9N A; 3BZC A; 4J9P A; 4OJP A; 5ALG A; 2NV3 A; 3D2S A; 4F92 B; 2Y0S C; 1PK3 A; 1SZH A; 1F5S A; 2KKP A; 4GXI A; 1JXE A; 3TAD A; 2WFA A; 2Y9T A; 4YMO A; 1S9F A; 3H4B A; 4ED8 A; 2B6G A; 4M9N A; 3MR6 A; 1L8L A; 3A0B U; 1LV5 A; 5ALP A; 5DB6 A; 1LB2 B; 2Q0Z X; 3O0F A; 2DKX A; 3AMZ A; 3TAC B; 4UQG A; 1ZQZ A; 2JEF A; 1JRO A; 4M9H A; 2PFP A; 2FPK A; 4EEY A; 4QZH A; 4ECQ A; 1T3N A; 1ZQD A; 4MEX A; 3RH4 A; 1LKY A; 4DL3 A; 1XNS A; 2KNJ A; 3EPG A; 1FIQ A; 1KFS A; 3IDW A; 4C8L A; 1DXS A; 4DQI A; 8ICX A; 5ALX A; 1Z1B A; 4LZD A; 1KDH A; 1U47 A; 3H0R B; 5IIL A; 2LM1 A; 3ZD8 A; 4NM1 A; 1XC9 A; 4LZG A; 3WK5 A; 1ZQC A; 2OYY A; 3UMB A; 3Q8Q B; 5C0Y A; 5IIJ A; 2AHO B; 1URJ A; 2FMP A; 5KT7 A; 4P0P B; 4F2S A; 5AM0 A; 3V7L A; 1RYU A; 5J2E A; 2W9M A; 1ZQJ A; 4YD1 A; 4U7C A; 1BPX A; 4FE3 A; 2KVS A; 5J8Y C; 1T7P A; 1FO4 A; 4B9N A; 3U26 A; 1JXL A; 4FZN A; 1MSW D; 3KFU F; 2HHX A; 2J6U A; 4AP9 A; 4QIW C; 2CRX A; 2F3N A; 3I76 A; 2W9C B; 2EZZ A; 2RP5 A; 2RHF A; 3ORY A; 1ZOL A; 4M2Y A; 5AKL A; 3PO5 A; 3JPT A; 3QE9 Y; 1NK4 A; 4QZB A; 2KD1 A; 5KG3 A; 4DOB A; 5KFB A; 3ZI4 A; 1NK7 A; 1JMS A; 4DL2 A; 7ICF A; 2P66 A; 3OPX A; 1ZQT A; 3PVX A; 1QCK A; 5DG8 A; 4I2C A; 3B0Y A; 1N48 A; 3FC4 A; 4UW9 A; 1C20 A; 1JI7 A; 1SXE A; 2CN1 A; 1ZQW A; 4DL4 A; 3WK6 A; 2G06 A; 4DL6 A; 1MQ2 A; 1COK A; 1PVQ A; 3SZ2 A; 5AKJ A; 4TUS A; 3UXO A; 2FLL A; 2E8N A; 3T5K A; 4I28 A; 5AM5 A; 1WUD A; 3HIL A; 2FDR A; 4EX7 A; 2ZUD A; 3ICX A; 2ZTE A; 2NRZ A; 2OWO A; 5J2K A; 1RYS A; 4QZC A; 8ICC A; 3C1Z A; 4QW8 A; 3OSN A; 2OM6 A; 4PHE A; 4KLE A; 3UM9 A; 3Q8S B; 3TAQ A; 1ZQE A; 4B9S A; 2K8A A; 3RF9 A; 1KFD A; 1BNO A; 5KAI U; 1J2N A; 2BQ3 A; 1K1S A; 2ZJ5 A; 4RNN A; 1S77 D; 2KOB A; 4J9K A; 1SV0 A; 4CF4 A; 4DSJ A; 5KFP A; 3Q8R B; 3RH6 A; 1X9X A; 3PR4 A; 1MA7 A; 5H2F U; 5KTQ A; 2W54 A; 4I2I A; 2F8K A; 2GH1 A; 5KG6 A; 8ICU A; 4PZO A; 4KLQ A; 7ICK A; 2ZUB A; 5ALM A; 4DS5 A; 4C4T A; 4KLF A; 1QQ7 A; 5DDM A; 4PJ0 U; 5J0W A; 3RBD A; 2ASJ A; 2IOH A; 5ALD A; 1Z00 A; 2HBL A; 2YB4 A; 2KJ9 A; 4F5Q A; 2WB1 C; 1SL2 A; 2JH1 A; 1ZQB A; 4IQU A; 4EBD A; 5CEH A; 1QSY A; 3IRU A; 4NL9 C; 3GQC A; 1V38 A; 9ICG A; 2RQ5 A; 2H3Z A; 4QZE A; 3KD3 A; 3WKD A; 2C2R A; 1A76 A; 4Q43 A; 1NKB A; 1S8O A; 1HJP A; 4HYK A; 4TUR A; 2W3R A; 2JRZ A; 4BDP A; 5DBA A; 4PL1 A; 2KE7 A; 4YQW A; 2MU2 A; 2KKV A; 2FMQ A; 4IC9 A; 5KAF U; 3V7J A; 4KLD A; 4C4S A; 3LWL A; 1JAL A; 3PW0 A; 1D9F A; 4EEK A; 3EPI A; 1XO1 A; 5BOM A; 2AGO A; 4R8U A; 5ALL A; 1SIJ A; 3QNM A; 2E5S A; 4M9L A; 5HML A; 1KRP A; 5KFR A; 4F50 A; 4HAI A; 2N1R A; 5IIN A; 1ZQR A; 4EZ9 A; 1B43 A; 3AU2 A; 2XCP A; 2JGA A; 2W9B A; 4F4Y A; 7ICO A; 1QQ5 A; 4RQ8 A; 1RM6 C; 3WKA A; 2K4I A; 1BPB A; 3EZ5 A; 2YY6 A; 4EX6 A; 4TUP A; 1ECW A; 1ZRM A; 2FE9 A; 1RQL A; 4B9U A; 3ZDB A; 2HMX A; 4O9M A; 2BDU A; 5L1I A; 4Y2Q A; 1SWV A; 4KLL A; 2YMM A; 5AKY A; 4B6J A; 1U49 A; 5KG5 A; 1UT5 A; 5HHH A; 4F8R A; 3T3F A; 1BPD A; 3HJE A; 2MA1 A; 2MRL A; 4EBE A; 4B9L A; 4DSF A; 2V4Q A; 3OHA A; 4DQS A; 4EYI B; 5KFF A; 1UA1 A; 5J2C A; 2HHU A; 3K4G A; 5D49 A; 2AGP A; 4Y2P A; 1NKE A; 1VLB A; 4NWI A; 1A0P A; 1S0V A; 4YP3 A; 2VA8 A; 3SEN A; 5CHG A; 1Z00 B; 4DLE A; 4BWJ A; 5ALK A; 2DPJ A; 2OHF A; 3AL0 B; 3MBY A; 4KLM A; 1WG8 A; 4ECX A; 3BQ7 A; 5AKK A; 3IV6 A; 1L3S A; 4RQ2 A; 2KHV A; 3QUQ A; 1TV9 A; 8ICZ A; 2NYV A; 2OEH A; 2BPF A; 2H3I A; 2QB1 A; 3K75 D; 5J0R A; 1ZQQ A; 4QZA A; 4JWN A; 4F5R A; 4KLT A; 2DBY A; 9ICU A; 5ALO A; 8ICR A; 3TAN A; 2GWS A; 1TK0 A; 3OTQ A; 2KHQ A; 4OJL A; 3FYH A; 4O3R A; 5AKE A; 4NXZ A; 5KG4 A; 1SL1 A; 3UMC A; 2JEJ A; 1Z3E B; 1QLN A; 2A1J A; 2JHD A; 4C0Z A; 2KG5 A; 4R63 A; 8ICG A; 5A0L A; 2G5I B; 9ICJ A; 2W9B B; 9ICX A; 1XSL A; 2IA6 A; 1PUZ A; 3D6J A; 4OO1 J; 4FBT A; 1NZB A; 4ELU A; 4RUC A; 7ICS A; 1UCV A; 4Q45 A; 4PGY A; 3HPO A; 5ALR A; 5DQH A; 3RFA A; 4PH5 A; 3RR7 A; 4QZ9 A; 2FI1 A; 5G5G A; 4Q8E A; 3V6H A; 1SZP A; 4RQM A; 1L5U A; 1ZQA A; 4C8N A; 2JV3 A; 5J2A A; 1SGG A; 5KG2 A; 2PXI A; 4I2F A; 4RQN A; 1JX4 A; 5ALI A; 4F4X A; 4KLG A; 2NO5 A; 1X6I A; 3H8S A; 1KLN A; 3QUT A; 1S97 A; 8ICO A; 2OCE A; 5KFL A; 1FFV A; 1WYG A; 5DB9 A; 4UAV A; 4PHD A; 1X6J A; 3KHR A; 4NLN A; 2G0A A; 5J8Y A; 4K4H A; 3TAP A; 2ZXI A; 2XID A; 4G3I A; 1NK6 A; 2KN7 A; 2HHQ A; 5AM1 A; 4RQ1 A; 4DOC A; 3NAS A; 3Q8L A; 7ICH A; 1OW5 A; 3BQ1 A; 4F5N A; 2UVW A; 5DBB A; 7ICN A; 3OJS A; 3JPS A; 2YX8 A; 4F4W A; 1T94 A; 5FP0 A; 5L9X A; 4YN4 A; 1SKS A; 3NVZ A; 2VA2 A; 1J2M A; 4TQR A; 1S5L U; 1OXJ A; 4BUG A; 4O5K A; 9ICO A; 3AM9 A; 3C2K A; 2BPC A; 2QB0 A; 4PZN A; 2KSO B; 5DQG A; 4P0Q A; 4BXO B; 3CP8 A; 8ICJ A; 1MN8 A; 1NKC A; 4RZR A; 1ZQL A; 2HSZ A; 4BGD A; 1ZQX A; 5EE1 A; 2LYH A; 2A19 A; 4ED0 A; 4M9J A; 5ALN A; 3PX4 A; 1CEZ A; 2XY5 A; 3WK9 A; 2HHS A; 4MFF A; 2E8P A; 1NJW A; 2A1J B; 5IIM A; 4RNO A; 4JWM A; 8ICY A; 5AM3 A; 1ZQK A; 4F5P A; 3V72 A; 3RJH A; 5KFI A; 4ZH4 A; 3C5F A; 3BDP A; 4I2H A; 5ALV A; 1L7O A; 1SXD A; 1TAQ A; 2WF7 A; 4MF8 A; 5L1L A; 3MR3 A; 4UBB A; 4ECZ A; 2KJ5 A; 2L5Y A; 3JPO A; 1L3T A; 2JZB A; 4US8 A; 2K8B B; 1U45 A; 4NM2 A; 1KTQ A; 3MDA A; 2JXJ A; 2G07 A; 4ED1 A; 2XI9 A; 4GC6 A; 1L3U A; 1ARO P; 5DKW A; 1IG6 A; 5DQI A; 4UAR A; 3RH5 A; 2I6X A; 2W55 A; 3PMN A; 1QH9 A; 5J0Y A; 3L5K A; 3SMV A; 4IQT A; 4IR9 A; 4UB2 A; 2WF5 A; 4IR1 A; 5KT5 A; 5ALU A; 2F1H A; 4PGX A; 3ALR A; 5KT6 A; 3KOO A; 3SR6 A; 2XO7 A; 3F2B A; 1S76 D; 5JU5 A; 2BGW A; 2BCV A; 1PK1 B; 8ICL A; 5J29 A; 3EUB 2; 5JTI A; 1IIP A; 3M7D A; 5EE3 A; 4RQ7 A; 3UXN A; 4YR0 A; 1ZD4 A; 3HT3 A; 1D8L A; 2YB1 A; 4RQ4 A; 4OJ6 A; 2KZZ A; 2K89 A; 3QU9 A; 2FLN A; 1C7Y A; 2G5H B; 1XO0 A; 4YR3 A; 5J0Q A; 2LYB A; 3LYS A; 8ICF A; 2XGP A; 1WWV A; 1ZQS A; 4IRC A; 3PV8 A; 4AYB C; 2B21 A; 4O3S A; 5DLG A; 1Z4N A; 4ICA A; 2GOL A; 1ZQO A; 4MHV A; 2ZIX A; 1JIH A; 8ICB A; 5JRT A; 2QB0 B; 1ZJM A; 2F1J A; 3NVW A; 5KFO A; 5KFY A; 4P0Q B; 2XGQ A; 1K5O A; 1K1Q A; 8ICT A; 1XS9 D; 4DFK A; 5F3X B; 4CF3 A; 2KIW A; 2W7O A; 2HHV A; 4KX5 A; 4Q44 A; 2KFN A; 2UVR A; 4G9B A; 3N97 B; 1BGX T; 3HKZ F; 3S6J A; 5DBC A; 4NY8 A; 1N61 A; 1A77 A; 3QUB A; 3JPR A; 4KLO A; 4FZL A; 2WF6 A; 2J6S A; 2DUY A; 1ZQF A; 5AI4 A; 1N2X A; 9ICH A; 1XSN A; 1O08 A; 1BPY A; 5DB7 A; 1B4F A; 2JZB B; 4QZD A; 3PY8 A; 3IHQ B; 4PPX A; 5ALJ A; 2NO4 A; 1IXR A; 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1ED1 A; 1WWU A; 3PSF A; 3IG8 A; 1KKX A; 1DK3 A; 3NVY A; 5J2B A; 4CCH A; 5EWE A; 1ZYQ A; 9ICL A; 2FMS A; 2KZ3 A; 4M9G A; 2H5X A; 1ZRN A; 4R64 A; 1Q8K A; 2C2D A; 5HNK A; 1UA0 A; 1ZXI A; 2Y1J A; 5L1K A; 2R8J A; 2WF8 A; 5AI9 A; 1YZ6 A; 2LKY A; 4IS7 A; 9ICE A; 1BNP A; 4LVS A; 2IBK A; 5TZV A; 4RU9 A; 3WKB A; 1KN5 A; 2R8I A; 5D4B A; 3PW7 A; 4IRK A; 1ZQ1 C; 3TAR A; 2D6F C; 4DSI A; 4JV2 A; 4KMO B; 4J9O A; 5KT3 A; 2ASL A; 4ED6 A; 3L3F X; 2Y0S F; 2PFQ A; 4KLJ A; 2RLT A; 2QLT A; 2NRT A; 4Y2R A; 5DDY A; 3TQ1 A; 3RJG A; 3I1Y A; 5AK5 A; 5ALQ A; 4DL5 A; 5ALS A; 5B5E U; 3HP6 A; 4J9N A; 5DGB A; 2W9A A; 2AU0 A; 5ALY A; 3WK7 A; 2ZIV B; 1SL0 A; 5AM4 A; 4B9V A; 4YR2 A; 1S0N A; 5AM2 A; 3RJI A; 9ICM A; 4UBC A; 5KT4 A; 2HVH A; 5AK6 A; 5L1J A; 1DGJ A; 3KZX A; 2YQE A; 4Q8F A; 8ICE A; 2WHE A; 1WCN A; 2MUT B; 4Y2J A; 1S10 A; 4UAW A; 2OH2 A; 3GZF A; 4JV1 A; 3M9O B; 4QJF B; 3M9N B; 2JEG A; 4XQ8 A; 3KKA C; 4QW9 A; 4JB3 A; 3NUQ A; 4ED7 A; 4UAS A; 2KSO A; 4BXO A; 5KFG A; 2E3T A; 5AI0 A; 3H0L B; 2ZIW B; 2YMP A; 2G09 A; 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