The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
76
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structure length |
76
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Chain Sequence |
TKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural insights into RNA recognition by the alternative-splicing regulator muscleblind-like MBNL1.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Metal binding, rna binding protein
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| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Muscleblind-like protein 1
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| total genus |
19
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| structure length |
76
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| sequence length |
76
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-05-08 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3D2Q A; 3D2N A; 2E5S A; 3D2S A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2NO4 A; 2OXO A; 3KHG A; 1URJ A; 4O3N A; 3M8S A; 5ALD A; 2EAO A; 1S8O A; 4RNO A; 1KFT A; 1NK7 A; 5J2C A; 4RPX A; 1BGX T; 4J9L A; 1U49 A; 4R66 A; 3RJK A; 2Q4T A; 2XVT A; 2PFO A; 5CRX A; 1J97 A; 4KX5 A; 4DL5 A; 2LI6 A; 2UVW A; 3RJE A; 2JV3 A; 1ZQW A; 1IXR A; 2JH1 A; 2Y9U A; 1XSP A; 1S0O A; 3TAQ A; 5L1J A; 1ZQF A; 5HR6 A; 4QZE A; 5B66 U; 1U47 A; 1MA7 A; 1ZQU A; 3TAR A; 4I27 A; 1X9W A; 8ICB A; 5H2F U; 4Z6C A; 1B43 A; 1S0V A; 1ZQD A; 7ICI A; 2QB1 A; 2HVH A; 4YG2 A; 5KFQ A; 5DDM A; 7ICT A; 4YFK A; 1JRP A; 4NL9 C; 4YMM A; 2B6G A; 2KJ5 A; 4DO9 A; 4BGD A; 8ICV A; 1JUD A; 3H40 A; 4K4I A; 2QB0 A; 3WK4 A; 5TZV A; 2FPM A; 1ECW A; 9ICP A; 2LM4 A; 4CF5 A; 4Q43 A; 1CEZ A; 2DUY A; 5DBA A; 4ACO A; 5KFZ A; 4YXM A; 5J0T A; 3WKD A; 2PKE A; 2E8N A; 4RQ5 A; 1D9F A; 4J9K A; 1ZYQ A; 8ICI A; 4IRC A; 3PSP A; 4MF8 A; 4QZC A; 4ED3 A; 1SZP A; 4JV0 A; 2HI0 A; 2XCA A; 4J9R A; 3CNH A; 2PFQ A; 1J2N A; 4RUC A; 2ZIX A; 1X9S A; 1S9F A; 2WF6 A; 2XCP A; 2LKY A; 5IIK A; 1XO1 A; 4DL4 A; 1D8B A; 3AEV A; 4JMU A; 1A76 A; 1NNL A; 3TAD A; 1ZQA A; 4R63 A; 1GO3 F; 2XGP A; 4LZG A; 5HHH A; 2ZIU A; 3QUT A; 4NM1 A; 2JRZ A; 5L9X A; 2YMM A; 2WF8 A; 4CF4 A; 1X9M A; 4Q45 A; 3GIJ A; 3EZ5 A; 3MDC A; 1T8E A; 4FBU A; 1ZD3 A; 1N48 A; 2ZG6 A; 4ED6 A; 3H4D A; 5KFH A; 3N7S C; 1FO4 A; 1MSW D; 4NLZ A; 2HBJ A; 1L8O A; 3EWA A; 3ISC A; 1KRP A; 2PFN A; 3HW8 A; 4FBT A; 4JV2 A; 2CN1 A; 2XC9 A; 4ECR A; 5DB8 A; 4GXJ A; 3OSP A; 3ORY A; 1RYS A; 3H4B A; 5KFO A; 2BCR A; 5L1K A; 4PHP A; 2K8A A; 2ASL A; 4KLD A; 4DQR A; 5CHG A; 3NVZ A; 1K1S A; 2KSO B; 5AIB A; 3NAS A; 5KG7 A; 1SV0 C; 4GIB A; 2YN4 A; 1QSL A; 1KEJ A; 4DQP A; 5IIM A; 8ICL A; 2V9W A; 4UW9 A; 3G6V A; 5J0P A; 3Q8R B; 3B9J A; 2OHF A; 2P66 A; 3KBB A; 1EXN A; 5ALL A; 9ICU A; 1MC8 A; 3F2D A; 2YQE A; 1TK0 A; 4DOC A; 4BX9 C; 2IOF A; 1LKY B; 2KKP A; 1CUK A; 2KOB A; 4RZR A; 4UAW A; 9ICM A; 4KLS A; 3AMZ A; 1DOQ A; 5HR7 A; 4FZM A; 3BZK A; 5ALK A; 5KFM A; 1SXD A; 2KE7 A; 5CWR A; 3KKA C; 1QLN A; 5ALX A; 1H38 A; 4PHE A; 1SV4 A; 1ZQP A; 3GU3 A; 5DKW A; 4I2J A; 2G5I B; 2JHD A; 2YB4 A; 3TI0 A; 1PVP A; 2E1E A; 3PW7 A; 2EDU A; 3RJH A; 3UM9 A; 5AI9 A; 3G6Y A; 2F2A B; 3FAH A; 1S0M A; 2WFA A; 1BPB A; 3QZ7 A; 8ICG A; 2ZJA A; 4U6P A; 1Z4O A; 5KG2 A; 5AM5 A; 3PSF A; 4RQ7 A; 1Z00 A; 3H8M A; 9ICK A; 1ZQJ A; 5DDY A; 4NXZ A; 1NKE A; 3BS5 B; 3QX7 A; 4RPY A; 1ARO P; 2E5S A; 5J2H A; 1V9P A; 2AQ0 A; 4RQ4 A; 4P4M A; 2F8L A; 1X40 A; 3R9K A; 5AM4 A; 3HKZ F; 3T3F A; 2PI5 A; 2ISO A; 4IQT A; 2WAQ C; 2EQY A; 2YX8 A; 4MFA A; 2AQ4 A; 4KIT B; 5KG3 A; 4PHA A; 5AKL A; 2N1R A; 2H3V A; 3A0B U; 2RDI A; 3QEA Z; 1M6Y A; 2IHM A; 2ZIV B; 3C23 A; 4PH5 A; 4UBC A; 2F77 X; 1X9X A; 8ICO A; 5EWF A; 2OCE A; 3N7R C; 3Q8M A; 5DB6 A; 5J0Q A; 2RRD A; 5EE9 A; 3SV3 A; 1C7Y A; 4F72 A; 1QH9 A; 2KMD A; 1TAU A; 4R65 A; 3WU2 U; 2C22 A; 4QIW F; 4YD2 A; 4DFK A; 2Y1J A; 2BQ3 A; 2JH7 A; 4O3Q A; 4BWJ A; 3T5K A; 1QSS A; 4RQ8 A; 4Y2U A; 5J0Y A; 3BQ1 A; 3V7J A; 1XNS A; 1TVA A; 1S10 A; 5ALQ A; 4RQ1 A; 3SAF A; 2BQR A; 4P0Q B; 1N5W A; 2DPJ A; 4OJ5 A; 4K4H A; 1KTQ A; 1SL0 A; 2KFN A; 2YTU A; 5ALT A; 4DQQ A; 1ZD5 A; 3NGD A; 2FPL A; 4EX6 A; 4QWE A; 2NV3 A; 5AKY A; 1U48 A; 5KFG A; 3AL0 B; 4F71 A; 5J0R A; 2R8J A; 3KD3 A; 7ICO A; 4YMN A; 3GIK A; 5F3X B; 1PK3 A; 5AKH A; 3UQ0 A; 1N62 A; 1ZQE A; 4EBC A; 5KFE A; 4DFP A; 1V97 A; 5KG5 A; 4EZ6 A; 1RQN A; 4CGZ A; 2A1J B; 1JXL A; 3C2L A; 5KT2 A; 4ZOH C; 1B0X A; 4ECZ A; 2O6K A; 2MAX A; 4DWI A; 3KFU F; 3LDA A; 3RH4 A; 4BJQ A; 1KKX A; 1RM6 C; 5AI5 A; 1Z1B A; 4M6W A; 2RLT A; 4KLI A; 5J2J A; 7ICJ A; 5KG1 A; 4YR0 A; 2XID A; 3WKA A; 1S97 A; 5J2G A; 1WUD A; 4ECQ A; 1D9D A; 1KLN A; 4M04 A; 2HCF A; 5KT7 A; 8ICF A; 1ZD2 P; 2F44 A; 3T5H A; 4C8L A; 2ALZ A; 4O3O A; 1L8L A; 4QZD A; 4YR2 A; 4FFD A; 4UAR A; 3HP6 A; 4DSE A; 2LYB A; 3EPG A; 4GLX A; 5F9N A; 5KT6 A; 2KJ9 A; 3AQF A; 4RNM A; 3K4G A; 4DSI A; 2XY6 A; 4M2Y A; 3M8R A; 3IG5 A; 2IHN A; 3ONN A; 9ICI A; 2P6R A; 4AP9 A; 1Q46 A; 5ALM A; 3NVW A; 3BS5 A; 2ATL A; 2JEG A; 1JXE A; 1XS9 D; 4KLL A; 5KL8 B; 5KFB A; 4C4S A; 1A6S A; 4ED7 A; 4QWD A; 2HVI A; 2OH2 A; 3D6J A; 4M9N A; 4GC7 A; 3UMC A; 1RPL A; 2W3R A; 1YZ7 A; 4C80 A; 2ZTD A; 4DCC A; 3PO4 A; 2PMZ C; 2G09 A; 4RT3 A; 2G5H B; 5KFP A; 2K89 A; 5DG8 A; 3N7P D; 3SAG A; 1JAL A; 3KZX A; 2PXI A; 5D4B A; 5KT3 A; 2YML A; 5JTI A; 3KHL A; 3RB6 A; 2QB0 B; 4KLH A; 1L3V A; 8ICH A; 5DBC A; 5ALZ A; 4QZG A; 1KDH A; 1BPX A; 3I28 A; 4I2G A; 4JWM A; 1KW4 A; 4IRK A; 5KFC A; 5EWG A; 2DBY A; 4LVS A; 4P0Q A; 8ICR A; 5DGA A; 5K4L A; 2KJ8 A; 3M7D A; 2W03 A; 4J9N A; 5AKJ A; 5EE3 A; 5AM2 A; 1KQQ A; 2BCU A; 4KN4 A; 4Y2Q A; 2HOF A; 2HOI A; 4FZN A; 1L6N A; 3PX0 A; 4F4K A; 9ICQ A; 4NLN A; 2AHO B; 4A8E A; 3PVX A; 4JK1 A; 3WK9 A; 5DB7 A; 5J2A A; 3N28 A; 1LVH A; 2ASD A; 2KP7 A; 4I2H A; 4EYI B; 4Y2J A; 1FIQ A; 3M6K A; 5HP4 A; 1NK8 A; 1O03 A; 4XQ8 A; 4KLT A; 2A1J A; 3RFA A; 4KLF A; 8ICX A; 2EAM A; 3L5K A; 1UPH A; 3QU2 A; 3V7K A; 2IOF K; 4ECT A; 4ELU A; 3QE9 Y; 1RYU A; 4EBD A; 1ZQV A; 1JIH A; 2AXT U; 3C5G A; 1N5X A; 5J8Y A; 3PNC A; 1NK4 A; 3JPR A; 4UAS A; 4JV1 A; 4C4T A; 1L3T A; 3DEE A; 5KG4 A; 2BQU A; 2ESE A; 1Q8K A; 1DXS A; 1WWV A; 3MR5 A; 4NWI A; 3JPO A; 3AU6 A; 2WHE A; 3CYM A; 1ZRN A; 2YB1 A; 4UB8 U; 3QUC A; 4MEX A; 3RJF A; 4KMO B; 5KG6 A; 4FZL A; 2KV2 A; 4EEY A; 3K1R B; 4F93 B; 4QW8 A; 2W7P A; 4PL1 A; 3T5L A; 1SWW A; 4ICA A; 5G5G A; 7ICU A; 1NKB A; 2HHQ A; 3MGH A; 1DK3 A; 2ZIW A; 3WK7 A; 1ZRM A; 7ICG A; 1ZOL A; 2D8C A; 2KHQ A; 1S77 D; 1RYR A; 2IA6 A; 3SYZ A; 1IIP A; 5J2B A; 4QWB A; 4YMO A; 2KD1 A; 4C4R A; 3C2M A; 2HBK A; 2G08 A; 1L7O A; 3SD7 A; 3T79 A; 7ICM A; 1ZQS A; 1PZN A; 3E0F A; 1XSL A; 3V6H A; 3JPN A; 4F5Q A; 2C28 A; 2K4P A; 4C8M A; 4M9J A; 4BWM A; 3OJS A; 1UT5 A; 5KFD A; 2FE9 A; 3NUQ A; 2AU0 A; 3BQT A; 4QZB A; 4DLE A; 3MAB A; 2ZTE A; 3QU9 A; 1JN3 A; 4PZN A; 2LMR A; 2NYV A; 4R8U A; 4ED2 A; 1ZJN A; 4GC6 A; 2MA1 A; 2WF7 A; 4C7Y A; 2DPI A; 1PK1 B; 1A0P A; 3M1Y A; 4CCH A; 1Z00 B; 2ODG A; 2EAN A; 1XSN A; 3ETR A; 1XU4 A; 3HX0 A; 3RH5 A; 1UCV A; 5AM0 A; 5L1M A; 3DV9 A; 5AIA A; 4PPX A; 4KN7 A; 3KKA A; 2HSZ A; 1YZ6 A; 2MU2 A; 3LWM A; 5ALW A; 9ICJ A; 4WJ3 B; 5AKK A; 4R64 A; 4J9O A; 1TAQ A; 3JPQ A; 4O5E A; 5J29 A; 3OHB A; 2DKX A; 4B9T A; 2M9N A; 4YVZ A; 5KFF A; 2BZF A; 4Q8E A; 2DKZ A; 8ICP A; 1Z3E B; 1U4B A; 2IMW P; 1OXJ A; 1XO0 A; 2W9A A; 4LZD A; 3HWT A; 2KEY A; 4KLE A; 2DF4 B; 3LWL A; 2FPK A; 4F5R A; 3V7L A; 4MF2 A; 1X66 A; 4EX7 A; 5BOM A; 3FDS A; 3TFS A; 4UB2 A; 3SAH A; 1QCK A; 3D2Q A; 4B6J A; 4O3M A; 1SIJ A; 3IP4 B; 2CPR A; 1COK A; 5DQI A; 9ICC A; 4Y2V A; 1XWL A; 3QZ8 A; 4F5P A; 4F4Y A; 2GO7 A; 3RB0 A; 9ICV A; 2KZ3 A; 4X5V A; 4NLC A; 2C2R A; 4C8N A; 2NRZ A; 3WK5 A; 4KLO A; 3RR8 A; 2BCS A; 3F2B A; 8ICN A; 3H0M B; 2W7O A; 7ICH A; 3L4P A; 5C5J A; 4XUS A; 2NO5 A; 3NVV A; 1WWU A; 2Y9T A; 2R8K A; 1DGS A; 2UVR A; 5ALI A; 3PX6 A; 3C2K A; 2BR0 A; 1T3N A; 3C1Y A; 2VAN A; 2UVV A; 3OPX A; 2K4E A; 3OTQ A; 4MEY A; 2FLP A; 4IR1 A; 1T94 A; 5KFK A; 1U45 A; 1NJY A; 3D2N A; 5AM3 A; 3SMV A; 2K4I A; 1SKW A; 3C5F A; 4F5O A; 4M6W B; 1OW5 A; 4RQN A; 1T3Q A; 4DSK A; 5AK5 A; 4J9P A; 2ES6 A; 1PUZ A; 4CE6 A; 4DF8 A; 2NRT A; 2HHT A; 4Y2R A; 5EE1 A; 3RBD A; 5ALN A; 5T14 A; 2MRL A; 2ISP A; 4KLQ A; 5D46 A; 2H3F A; 3PO5 A; 5ALP A; 3RB3 A; 2I6X A; 4TUP A; 1BPE A; 1S0N A; 1HJP A; 1Y88 A; 2W9B B; 2PI4 A; 4BDP A; 3MGV A; 1HEK A; 9ICR A; 1PK1 A; 2K8B B; 3OHA A; 4DSF A; 1ZQO A; 2XY7 A; 3OJU A; 3WKE A; 5JUM A; 3TAD C; 2DL0 A; 1SL2 A; 5DG7 A; 1L7N A; 3GV5 B; 3HKZ C; 2CXY A; 2XIC A; 1KL9 A; 2Y0S F; 4QZI A; 2JZB B; 4XA5 A; 8ICW A; 2HHX A; 4FS2 A; 2JEF A; 1N56 A; 1UQV A; 5AI6 A; 4TQR A; 4QZA A; 2NRX A; 3BQ0 A; 4QWA A; 2K8C B; 2VA2 A; 3SZ2 A; 5GTI U; 1COO A; 4KMU A; 4NM2 A; 1LV5 A; 2R18 A; 2RP5 A; 5J0S A; 2ASJ A; 3MR6 A; 2E8M A; 4QIW C; 1SKS A; 5EWE A; 3GIM A; 1TK5 A; 2OWO A; 2IOH A; 3AN1 A; 2K60 A; 1BPY A; 5ALU A; 3KHR A; 5AM1 A; 3JPS A; 5ALY A; 3H8S A; 4F91 B; 3IV6 A; 4YR3 A; 1IG6 A; 4UAV A; 2L5Y A; 4UB3 A; 4DS5 A; 3THV A; 4OJO A; 2XO7 A; 4ELV A; 2ZXI A; 1U9L A; 1ZQB A; 5D49 A; 1DK2 A; 3PX4 A; 1NK5 A; 2F8K A; 3NTU A; 3F5E A; 3NRW A; 4ECW A; 4Y2X A; 2GLE A; 1NJW A; 1X2I A; 4TUS A; 4Y2Y A; 4QJF B; 4TUR A; 3PW2 A; 2JR5 A; 3KOO A; 3PV8 A; 3G6X A; 3C1Z A; 4M9L A; 3RRH A; 2W3S A; 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1QQ6 A; 4R8U B; 4DSJ A; 2F1I A; 1X6I A; 3TAN A; 3QXG A; 4QZ9 A; 2QAR B; 4MHV A; 1WG8 A; 5J0W A; 7ICP A; 2F1J A; 4NJ8 A; 4F5N A; 5E79 U; 5G5H A; 4UB1 A; 5DGB A; 5AK3 A; 4DOA A; 3LVV A; 3F5A A; 2RQ5 A; 3SQI A; 1SL1 A; 3TAP A; 3RAX A; 1TV9 A; 5CEH A; 1N63 A; 8ICM A; 4B9U A; 4ZH4 A; 5J2K A; 4DLG A; 2E1F A; 3HIL A; 5EOZ A; 4NL9 A; 2JXJ A; 1F0M A; 3GII A; 1T7P A; 2HBM A; 4B9S A; 5KFU A; 1KFD A; 8ICK A; 4DL2 A; 3VC8 A; 2P6U A; 2GOL A; 4CRX A; 4Z6F A; 2R8I A; 5HMM A; 4C0Z A; 2ZUC A; 4Y2T A; 3AU2 A; 4NLG A; 5KFL A; 5HNK A; 4MFC A; 3EUB 2; 5DBB A; 4YCX A; 5F9L A; 2K4H A; 3PY8 A; 2AGO A; 4EYH B; 1L5U A; 3MDA A; 3K1Z A; 1SB3 C; 4UAY A; 4IC9 A; 2W9C A; 4DFD A; 1P7D A; 4OO1 J; 4BUG A; 1ZQR A; 2GWS A; 4ELT A; 4Z6E A; 5IIN A; 1UT8 A; 5AKE A; 8ICY A; 4F8R A; 5CP2 A; 2HOQ A; 8ICE A; 2OYY A; 3MFI A; 4EEL A; 4YN4 A; 5JRT A; 3BS7 A; 4I2F A; 3H8W A; 3PZP A; 2P35 A; 3GV7 B; 4FE3 A; 2HHW A; 4J9S A; 4O3P A; 2AJQ A; 2RDJ A; 2JEI A; 1IV8 A; 3WK8 A; 1LB2 B; 3B0Y A; 2WF5 A; 4RNN A; 4PGQ A; 2AGQ A; 9ICO A; 1UHU A; 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