The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
76
|
structure length |
76
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Chain Sequence |
TKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural insights into RNA recognition by the alternative-splicing regulator muscleblind-like MBNL1.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Muscleblind-like protein 1
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| molecule tags |
Metal binding, rna binding protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
19
|
| structure length |
76
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| sequence length |
76
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-05-08 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3D2S A; 3D2Q A; 2E5S A; 3D2N A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3MGI A; 4F5O A; 1X66 A; 5CR0 A; 4QWB A; 8ICS A; 2DQN B; 1BNP A; 9ICI A; 1T3Q A; 5KAI U; 4YMM A; 3QU9 A; 3TAD A; 4DSE A; 4RQ4 A; 2K89 A; 4DFK A; 3K1R B; 2NO4 A; 5AI9 A; 2J6T A; 1ZD3 A; 2YMQ A; 1KFT A; 3DV9 A; 2LKY A; 1JIH A; 3JPT A; 4O3N A; 8ICA A; 4TQS A; 1QH9 A; 4M6W B; 3UQ2 A; 2ASD A; 4KLT A; 4F4X A; 4CF4 A; 3GFK B; 2A1A A; 5KAF U; 3TFR A; 3GV8 B; 4DQP A; 8ICY A; 3WK7 A; 2HW3 A; 3BQ0 A; 3PX0 A; 2G07 A; 2AGP A; 2JEI A; 1ZQW A; 1RYS A; 2MUT A; 1JN3 A; 5EOZ A; 4J9K A; 2K8B B; 2VAN A; 5DKW A; 3BJY A; 2GLE A; 2KIC A; 1IV8 A; 1N62 A; 5AI6 A; 3QU7 A; 4NWI A; 3GIK A; 5AKE A; 1B4F A; 2RLT A; 3THV A; 3HP6 A; 8ICQ A; 5ALI A; 2ZTC A; 7ICN A; 2VKQ A; 2LHT A; 2E8P A; 3ED5 A; 3M9M B; 1U47 A; 9ICO A; 5KFZ A; 5KG0 A; 3H7I A; 3C2M A; 1N2X A; 1SKS A; 2W43 A; 3SR6 A; 2GWS A; 2LYH A; 2K8C B; 5KFO A; 2YB4 A; 9ICA A; 4FBT A; 9ICW A; 3QX7 A; 2AH5 A; 2FPL A; 1JXE A; 2GO7 A; 1WYG A; 2BKE A; 4C8N A; 4DFM A; 3DDH A; 5DG8 A; 1L7M A; 4AYB C; 4Y2U A; 7ICK A; 2ZTD A; 2K4E A; 2OH2 A; 5DB7 A; 2YTU A; 2DFL A; 2KK0 A; 4ECV A; 2ZIU A; 2XY5 A; 2WAQ C; 3OHA A; 1YT3 A; 2AJQ A; 3IG8 A; 3ZDA A; 2EAP A; 1T7P A; 3ALR A; 5L1K A; 1TK0 A; 3KD3 A; 4DL4 A; 4C8O A; 2MRL A; 2PFQ A; 3RJF A; 2ZIW B; 3OSN A; 2NRX A; 3Q8Q B; 1BPY A; 2E8O A; 2VIX A; 3BQ2 A; 5ALH A; 2ZXH A; 2KFN A; 1ZD2 P; 1A0P A; 4YMN A; 4R8U A; 2JGA A; 3BS7 A; 3RB3 A; 2XCP A; 3PV8 A; 5CEH A; 2EZZ A; 5J2B A; 3Q8S B; 1LB2 B; 5KG1 A; 2XO7 A; 4KLD A; 2PFP A; 3UQ0 A; 4AYB F; 5KG5 A; 2W9A A; 7ICT A; 2NV3 A; 2BDP A; 3A0H U; 3FAH A; 5KFR A; 2OCE A; 1S0M A; 2HBM A; 1SV0 C; 2WF8 A; 5J2I A; 2WAQ F; 5A0L A; 1NJW A; 4LJX A; 1NZP A; 2JZB B; 4EEN A; 4I2H A; 1OXJ A; 2VJ5 A; 4I2B A; 3H8M A; 1ECW A; 3E0F A; 1FIQ A; 5ALO A; 3MFH A; 2BCV A; 5F3X B; 3V6H A; 1S0O A; 2LYA A; 1JXL A; 1ZD4 A; 1ZQU A; 1SV0 A; 4PHE A; 1M6Y A; 2FLN A; 4Z6E A; 2BQ3 A; 5AKY A; 3N7P D; 4B6J A; 2FJ6 A; 3RB6 A; 3QU5 A; 3GIM A; 1X9M A; 5J0U A; 3V6K A; 1BNO A; 2XC9 A; 1ZQE A; 5AM5 A; 9ICH A; 3WK8 A; 3PR5 B; 2VJ4 A; 2PI4 A; 1RQN A; 2BQU A; 5EWG A; 4IQU A; 2ZJ8 A; 2KV2 A; 1ZYQ A; 4B9L A; 1ZXI A; 2KN7 A; 5DGA A; 3BZC A; 4DCC A; 3RRG A; 3WK6 A; 5KFJ A; 2K8A A; 5ALL A; 2FPM A; 1CUK A; 4ECR A; 5J0Y A; 8ICL A; 1ZQO A; 4DQR A; 4IQV A; 3MDC A; 5GTH U; 3ETR A; 3V7L A; 5CA7 A; 2ZUB A; 3EYZ A; 1BGX T; 4Y2Y A; 3C29 A; 4IRC A; 4J9R A; 4QZ9 A; 1WCL A; 5DBA A; 5AKX A; 3JPS A; 2HMX A; 1QTM A; 2LYB A; 5DB6 A; 2QB1 A; 3D2S A; 2A1J A; 1MQ3 A; 2Z7J A; 2YMM A; 1D8B A; 4RUC A; 2W9C A; 5AIA A; 4PH5 A; 3QNM A; 4I2J A; 3PY8 A; 1L3V A; 3PZP A; 2CN1 A; 3ETL A; 4Z6F A; 2KP7 A; 3ZDC A; 5J0X A; 4LZG A; 5KG7 A; 8ICZ A; 1BPE A; 2C2D A; 4FZL A; 2AHO B; 3AL0 B; 5CB1 A; 2K4P A; 4F4Y A; 1L7N A; 2W11 A; 3EUB 2; 3UMG A; 1HEK A; 4FFD A; 4QNL A; 3GZF A; 9ICS A; 5HHH A; 5JUM A; 4K4H A; 8ICH A; 4P0Q B; 4PHP A; 2KVS A; 4QW9 A; 1NJX A; 4C8L A; 2KIW A; 4UB8 U; 2W9M A; 2IBK A; 1PVQ A; 5IIO A; 1DOQ A; 1TAU A; 1DGS A; 4QWC A; 4PHD A; 4DL6 A; 3KHH A; 4O3S A; 1NZB A; 4QZB A; 5KFC A; 2ISP A; 4JWM A; 2BQR A; 2ESE A; 3OJS A; 3D2Q A; 1N61 A; 2KSO B; 2AXT U; 4BXO B; 3KHL A; 5AM0 A; 1ZQM A; 8ICF A; 1J2N A; 2RDI A; 5BOL A; 4YXM A; 3N7R C; 4RPY A; 2QLT A; 4JV2 A; 2AGQ A; 1L3S A; 5KFN A; 1PK1 B; 5KG4 A; 3JPP A; 4BJQ A; 4MFC A; 2E5S A; 2ZUC A; 2ISO A; 2JH7 A; 2R8I A; 2W8L A; 1Z00 A; 4ECW A; 1ZD5 A; 4EYH B; 4P4P A; 4P4O A; 4P4M A; 2IMW P; 4B9M A; 5AM3 A; 2Y1J A; 4DQQ A; 3BQT A; 2ASJ A; 1RQL A; 4ECU A; 4DL3 A; 3BQ1 A; 4M9L A; 3HPO A; 2XID A; 5KT3 A; 2ZIV B; 4DSF A; 4EEY A; 2ZJA A; 4YR2 A; 1QQ6 A; 1QSY A; 1Y88 A; 4U6P A; 3EPG A; 3PX4 A; 3MFI A; 1EXN A; 7ICL A; 4OJ5 A; 1HUZ A; 4P0P B; 3PX6 A; 2BCR A; 5L1L A; 5ALT A; 2A19 A; 9ICV A; 1K1S A; 1T4G A; 1XNS A; 1N5W A; 2MU2 A; 1V38 A; 4TUS A; 3JPQ A; 3C2K A; 3PST A; 4GXI A; 2KE7 A; 3RH4 A; 5E79 U; 4NLZ A; 1KFD A; 1TAQ A; 2W9B B; 3IN5 A; 3F2C A; 2HHW A; 2OEH A; 3WKC A; 3M6Z A; 4NXZ A; 4KLE A; 4FS2 A; 2DUY A; 3T3F A; 3RH5 A; 4U7C A; 2JXJ A; 4WJ3 B; 5L9X A; 5J2G A; 5J29 A; 5J0T A; 1B22 A; 2EAO A; 2F1H A; 4F2R A; 5KFA A; 1XO1 A; 9ICG A; 5J0Q A; 4YVZ A; 3H4D A; 5J0O A; 1NJY A; 3M1Y A; 4AP9 A; 9ICQ A; 4UB6 U; 5DBB A; 7ICQ A; 3RBD A; 5KG6 A; 4FE3 A; 1F0M A; 3SV4 A; 1WCN A; 4ELU A; 5ALM A; 2P35 A; 3LWM A; 4KLU A; 1XSP A; 4KX5 A; 5J2A A; 3QUQ A; 2K60 A; 4C80 A; 4OJL A; 1KRP A; 2WF7 A; 4ECT A; 1KTQ A; 2HCF A; 1FO4 A; 5CP2 A; 2WTF A; 4PJ0 U; 3PVX A; 5KL1 B; 4PL1 A; 1CI4 A; 3LK9 A; 5KFK A; 4JB3 A; 3CNH A; 1D8Y A; 2BPG A; 4C4S A; 1NK7 A; 2F2A B; 3TQ1 A; 2KTQ A; 1YZ6 A; 2CPR A; 3F2D A; 5IIL A; 1MSW D; 3F5E A; 3LVW A; 4OD0 A; 4IC9 A; 2QAR B; 5AM1 A; 3VCB A; 2HVH A; 4QZG A; 2W8K A; 1L6N A; 3WK9 A; 3IP4 B; 4QIW C; 1T8E A; 5AM2 A; 1B43 A; 4DSI A; 1S76 D; 3BDP A; 2XGP A; 5JRT A; 4KLH A; 3G6Y A; 3RJI A; 3F2B A; 5J2D A; 5J0R A; 8ICO A; 1D9D A; 5KFS A; 3QUB A; 3B9J A; 3K75 D; 1RYR A; 2K4I A; 1D8L A; 3B0Y A; 3MR5 A; 2K4H A; 4KMU A; 5DDM A; 4J9M A; 2EDU A; 2PI5 A; 3JPR A; 2HHU A; 3AQE A; 8ICR A; 2KG5 A; 1MN8 A; 4XQ8 A; 3RRH A; 3RJE A; 5CHG A; 4C7Y A; 3GQC A; 4MHV A; 3RBE A; 2EAM A; 5J2E A; 3C28 A; 2DL0 A; 2J6U A; 1UHU A; 1S0V A; 3PMN A; 4Y2S A; 2LBO A; 1ZOL A; 2HHT A; 4UB2 A; 4O3R A; 2HBL A; 2NRZ A; 4KIT B; 2RHF A; 1A77 A; 4I2A A; 3N4M B; 2I5H A; 4XRH A; 2ZTE A; 4C7Z A; 4QIW F; 2W55 A; 3V7J A; 5KNI A; 5ALJ A; 1FFV A; 4F2S A; 1S10 A; 1KW4 A; 4MFA A; 4J9P A; 4ED3 A; 3QUC A; 2XY6 A; 1OW5 A; 4DQS A; 4F50 A; 1QQ5 A; 3MGV A; 2KVC A; 4F8R A; 2DBY A; 5KFG A; 4UAZ A; 3LYS A; 1X6I A; 1QSL A; 7ICP A; 4YP3 A; 3LVV A; 1NKE A; 3ICX A; 2LM1 A; 5KFQ A; 2Y9T A; 3G6X A; 3RF9 A; 3ISD A; 9ICE A; 2H3F A; 5ALU A; 5C5J A; 5IIJ A; 1S97 A; 5B5E U; 1V9P A; 3A0B U; 2FLP A; 5DDY A; 1FEZ A; 2ZIX A; 3UM9 A; 1TFR A; 2OWO A; 3TAQ A; 3SAG A; 4R66 A; 3SD7 A; 4I2E A; 2NO5 A; 3N7S C; 5BOM A; 1IG6 A; 2DPJ A; 1U9L A; 2KZM A; 8ICN A; 4IQW A; 3E58 A; 1L7O A; 1TE2 A; 1S9F A; 3UXP A; 1KBU A; 2W9C B; 2Y0S C; 4CRX A; 5ALF A; 3D6J A; 4K4G A; 3IRU A; 4O3M A; 4DWI A; 1ZQX A; 5HML A; 4PHA A; 3HKZ C; 3AEV A; 2KIV A; 4ICA A; 5AIC A; 1KFS A; 3T5K A; 5AKH A; 3KZX A; 2JR5 A; 1ZQQ A; 4ECX A; 2I6X A; 5ALK A; 4UB3 A; 3NTU A; 2RRD A; 2R8G A; 5L1I A; 2ES6 A; 2BHN A; 1Z1B A; 4DL7 A; 3M8S A; 1AQ6 A; 4UAW A; 1MC8 A; 1SL2 A; 2W3R A; 4UQG A; 1U45 A; 2G08 A; 1Q8K A; 3SQI A; 1XU4 A; 2W54 A; 4USA A; 5ALY A; 3ORY A; 4UAU A; 5DBC A; 3OTQ A; 2V9W A; 1S5L U; 5KFH A; 1ZET A; 3NUQ A; 1TK8 A; 3TAR A; 4XUS A; 3ZD9 A; 2P6R A; 4M6W A; 2J6S A; 3M7D A; 4NLN A; 5DB8 A; 3FDS A; 4G9B A; 4X5V A; 2Y0S F; 3O0F A; 3AM9 A; 1UT8 A; 2GH1 A; 2IOF A; 5TZV A; 1F5S A; 4ELT A; 3GIL A; 1L5U A; 2JRZ A; 2MA1 A; 4UAV A; 2D6F C; 3HKZ F; 5GTI U; 2I1Q A; 4ED1 A; 4EEL A; 8ICE A; 3ZD8 A; 4KLI A; 4B9T A; 2Y9U A; 3MR3 A; 4US8 A; 2G09 A; 4RQ5 A; 4C0Z A; 2E3T A; 2JH1 A; 4OJP A; 3PW7 A; 2L5Y A; 1CRX A; 1N60 A; 4M47 A; 3NGD A; 4CF5 A; 4DQI A; 2ASL A; 4UB4 A; 3UMC A; 1QQ7 A; 1U49 A; 2B6G A; 3NS1 A; 4F91 B; 3GU3 A; 4UAY A; 4MFF A; 1ARO P; 1B0X A; 2HOF A; 4JK1 A; 5KFY A; 5KFP A; 3M8R A; 4KLG A; 3ZI4 A; 1VDV A; 1NKC A; 2ZG6 A; 1X9W A; 2MSN A; 3C1Z A; 4DFP A; 1UA0 A; 3I76 A; 2A3V A; 2XY7 A; 4OJ6 A; 2HI0 A; 7ICM A; 2AGO A; 3H40 A; 2F44 A; 4YXJ A; 3ISB A; 3KFU F; 3QEA Z; 4RT3 A; 5DGB A; 5ALN A; 4O3O A; 5BPC A; 1JUD A; 4YG2 A; 2UVR A; 3GV7 B; 2YB1 A; 7ICG A; 2FE9 A; 3OJU A; 2QB0 B; 2XIC A; 2RDJ A; 2PXI A; 9ICL A; 4F4Z A; 1OUQ A; 2KJ8 A; 1N5X A; 2HBK A; 2VA2 A; 4YR3 A; 2ZIW A; 5ALR A; 5CJ7 A; 1YZ7 A; 3WKA A; 4R65 A; 4GXK A; 5HNK A; 8ICB A; 3C21 A; 3PW0 A; 9ICM A; 9ICP A; 5KTQ A; 1P7D A; 3WU2 U; 1J2M A; 3TKA A; 3UXO A; 4EX6 A; 3TFS A; 2PFN A; 4Y2V A; 1QCK A; 1KL9 A; 2EAN A; 1TV9 A; 1KLN A; 4Y2J A; 2HOI A; 4M0A A; 3QEB Z; 1WUD A; 4OJO A; 4RQN A; 4KLJ A; 2F8L A; 3HWT A; 2DKX A; 2I9G A; 9ICX A; 5KFF A; 1X9X A; 5DG7 A; 1K1Q A; 2FI1 A; 3WK5 A; 4EZ6 A; 3PSF A; 1X9S A; 1PVP A; 3RR7 A; 4NLC A; 2OHF A; 1UT5 A; 2G06 A; 4CDG A; 3C2L A; 4KLM A; 9ICN A; 1KDH A; 4P2H A; 2AQ0 A; 2Q4T A; 1Q46 A; 2XVT A; 1TAM A; 3QYP A; 5AHX A; 5AKZ A; 3H8J A; 4DF8 A; 2F77 X; 4DL5 A; 4NLG A; 3NVW A; 2O6K A; 1L8O A; 1JRP A; 4JWN A; 5AIB A; 4I27 A; 2LPE A; 4ZH4 A; 1TK5 A; 3FC4 A; 5IIK A; 3EZ5 A; 1RXW A; 4CF3 A; 4FZM A; 4ELV A; 2EZX A; 3KBB A; 2HDO A; 2QKQ A; 4GXJ A; 3MAB A; 3HRD D; 3AUO A; 1TKD A; 3GDX A; 1QLN A; 4Z6D A; 3NAS A; 1JX4 A; 4C4R A; 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2ZIX B; 7ICF A; 5KT2 A; 5KFT A; 2ZIU B; 5KFI A; 3VC8 A; 5DLG A; 4RUA A; 5HP4 A; 4QZH A; 1SV4 A; 2KSO A; 4OO1 J; 4I28 A; 1BPD A; 5KT5 A; 1A76 A; 3MR6 A; 4QZA A; 4ACO A; 3BZK A; 1Z19 A; 1LKY A; 3Q8R B; 4Y2R A; 4DOA A; 4RZR A; 3MGH A; 1L8L A; 4QJF B; 2JEF A; 2CRX A; 2F3N A; 1DK3 A; 4TUP A; 5HMM A; 4GC6 A; 7ICH A; 2H3I A; 4BWJ A; 5EE9 A; 1UA1 A; 4UAS A; 5DLF A; 3PW4 A; 4CCH A; 4R8U B; 2WB1 F; 2OM6 A; 4J9S A; 3M6K A; 4DLG A; 7ICO A; 3B0X A; 4US9 A; 8ICM A; 5DQH A; 4BGD A; 3WK4 A; 5KFX A; 4M9G A; 2HHV A; 2ZIV A; 2KZ3 A; 4DLE A; 3V6J A; 3K1Z A; 2KFZ A; 4J9L A; 5ALE A; 1ZQN A; 8ICV A; 1S77 D; 5ALG A; 1COO A; 1O08 A; 3C23 A; 3MBY A; 1C7Y A; 1N63 A; 1LV5 A; 2XI9 A; 4IQT A; 5L1M A; 3CRX A; 4RNO A; 4P0P A; 1NK8 A; 1K5O A; 3SMV A; 3QZ7 A; 4IL6 U; 5AI4 A; 1Q3U A; 4I2C A; 2FPK A; 4PL2 A; 3AQF A; 4MF2 A; 1IM4 A; 2W9B A; 2HSZ A; 1FFU A; 1ZQV A; 2YN4 A; 5AKG A; 1U4B A; 3JPO A; 4GFJ A; 2H5X A; 3DEE A; 3V7K A; 1RM6 C; 3UPQ A; 2VA8 A; 1ZQT A; 1NNL A; 5J8Y C; 4MEY A; 1ZQF A; 1ZQD A; 4Z6C A; 3UXN A; 2KD1 A; 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