The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
23
|
sequence length |
65
|
structure length |
65
|
Chain Sequence |
MLQLWSKFDVGDWLESIHLGEHRDRFEDHEIEGAHLPALTKEDFVELGVTRVGHRENIERALRQL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
An architectural framework that may lie at the core of the postsynaptic density.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
SH3 and multiple ankyrin repeat domains 3
|
| molecule tags |
Structural protein
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| source organism |
Rattus norvegicus
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| total genus |
23
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| structure length |
65
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| sequence length |
65
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| chains with identical sequence |
B, C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-11-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00536 | SAM_1 | SAM domain (Sterile alpha motif) |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SV0 C; 1X9X A; 5J8Y A; 2DL0 A; 1SV0 A; 1X40 A; 2QAR A; 1LKY B; 5L1M A; 1V38 A; 2QB0 B; 3KKA C; 2FE9 A; 4NL9 C; 2JV3 A; 1SV4 A; 1PK3 A; 5JTI A; 3SEN A; 2E8O A; 2K4P A; 3KKA A; 4NL9 A; 2QKQ A; 2KG5 A; 1V85 A; 1LKY A; 2EAN A; 2QB0 A; 1DXS A; 4NJ8 A; 3BS5 B; 2EAM A; 1B0X A; 2KMD A; 1WWU A; 2B6G A; 2DKX A; 3HIL A; 5JRT A; 2ESE A; 2L5Y A; 3TAD C; 2K60 A; 3BS5 A; 1X66 A; 3H8M A; 2E8M A; 1SXE A; 1PK1 B; 4IS7 A; 3TAD A; 5JU5 A; 1SXD A; 1UQV A; 2KSO B; 4PZO A; 5KNI A; 2LMR A; 2DKZ A; 3BS7 A; 2YTU A; 3IDW A; 1OW5 A; 2GLE A; 4RQN A; 2F3N A; 1PK1 A; 3SEI A; 1WWV A; 1COK A; 2ES6 A; 2Y9T A; 2D8C A; 4RQM A; 2KIV A; 2QB1 A; 1B4F A; 2KSO A; 2D3D A; 1JI7 A; 2E8P A; 3BQ7 A; 3TAC B; 1RG6 A; 2EAP A; 2F44 A; 5F3X B; 2F8K A; 4MHV A; 2E8N A; 1UCV A; 1KW4 A; 2KE7 A; 2Y9U A; 2LPE A; 4PZN A; 2EAO A; 1SGG A; 1Z1V A; 1OXJ A; 2QAR B; 5J8Y C; 3K1R B; 1F0M A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1S0M A; 5KFE A; 2H3V A; 2MU2 A; 3Q8L A; 1ZD5 A; 1VDV A; 2RLT A; 3Q8P B; 4ECV A; 1FIQ A; 4UAU A; 5KFQ A; 3ED5 A; 3PSI A; 4HYK A; 1Q3U A; 4OO1 J; 3CNH A; 2CRX A; 5C0Y A; 3SEN A; 1H38 A; 4Q43 A; 2R8H A; 1NK6 A; 1V85 A; 4O3R A; 1RDF A; 5KT5 A; 3JPS A; 2QB0 A; 3RB6 A; 1NJX A; 3V6K A; 1ZQ1 C; 4RNN A; 5J0R A; 5KG3 A; 2F1J A; 9ICI A; 1L3V A; 3AU2 A; 4AYB F; 5DB6 A; 2HOI A; 2G09 A; 8ICP A; 3M9O B; 3I28 A; 1YZ6 A; 3D2Q A; 1YT3 A; 2MUT B; 3PX0 A; 1X9M A; 2YTU A; 5KG7 A; 3GII A; 3BQ1 A; 9ICJ A; 1HEK A; 2JMG A; 1ZRM A; 2UVV A; 3H8J A; 2PXI A; 2VA3 A; 5HR6 A; 1B4F A; 2KZZ A; 1JI7 A; 3CRX A; 5EWF A; 2PI4 A; 1A0P A; 5F9L A; 2JEG A; 4RPZ A; 4Z6E A; 2YN4 A; 2OXO A; 4MHV A; 1UPH A; 3H0L B; 5BPC A; 2XGP A; 3TAQ A; 4I2D A; 2Y9U A; 1C20 A; 1ZQX A; 4KLT A; 4RNM A; 4UB6 U; 4YXJ A; 4I2B A; 3RJE A; 3KOO A; 3PR5 B; 7ICJ A; 3OHA A; 3CP8 A; 5HNK A; 4FE3 A; 1F0M A; 2KP7 A; 1XS9 D; 3PW4 A; 4BWJ A; 4YVZ A; 1ZQZ A; 4TQR A; 3F2C A; 4KX3 A; 2A1J A; 2IOF K; 4EEY A; 5AKJ A; 4DCC A; 4DQQ A; 2G5I B; 4MFC A; 1TE2 A; 5KFS A; 5DB7 A; 3KKA A; 2V9W A; 5J0Y A; 3M6K A; 2HBJ A; 4I2E A; 2ASL A; 4YFK A; 4IRD A; 3NVW A; 4FBT A; 1C7Y A; 4YR2 A; 5DB9 A; 5G5H A; 3VCB A; 5J2E A; 3IHQ B; 2ZTE A; 3SAG A; 4PHA A; 4KIT B; 4ED6 A; 5KFW A; 4F4Z A; 4UBC A; 3BS5 A; 1X66 A; 3H0M B; 4IQW A; 1S97 A; 5KFP A; 5AKG A; 2R18 A; 1V9P A; 1WYG A; 1S76 D; 5AKE A; 1RQL A; 1UQV A; 2DKZ A; 4Y2X A; 1D8L A; 1FFV A; 5E79 U; 1QSS A; 2GLE A; 2HW3 A; 4EBE A; 4EEL A; 2W9M A; 2Z7J A; 4JUZ A; 3SYZ A; 3C28 A; 4EYI B; 7ICP A; 3TAC B; 1TV9 A; 3QX7 A; 5AI6 A; 2BQ3 A; 4R8U B; 5AKI A; 1N48 A; 5TZV A; 5BOM A; 1X9S A; 3AN1 A; 1BPE A; 4DO9 A; 3QU4 A; 1ZQS A; 3NVZ A; 5GTI U; 3JPN A; 3RJH A; 5J8Y C; 3TFS A; 4AP9 A; 2WAQ F; 4US9 A; 4M9N A; 1NK8 A; 3UXP A; 2JR5 A; 2WB1 F; 2HMX A; 2J6T A; 4UB5 A; 2QB0 B; 2JH1 A; 1L7O A; 1XSN A; 1NKB A; 5AI4 A; 2K4P A; 5L1J A; 5AHX A; 5G5G A; 1MSW D; 2RHF A; 1GO3 F; 1PUZ A; 5EWG A; 3HKZ C; 5D46 A; 3PX6 A; 1JAL A; 4QWA A; 7ICU A; 4DFD A; 5KFA A; 2ATL A; 1TVA A; 3RF9 A; 4JWM A; 7ICF A; 4I2H A; 4O3S A; 1KL9 A; 2R8I A; 1CI4 A; 3H0R B; 4M0A A; 2K8C B; 3OGU A; 4BUG A; 2E8M A; 9ICM A; 7ICO A; 4DOC A; 3TAD A; 5ALQ A; 3PST A; 4M6W A; 1Z1B A; 2KFZ A; 4PZO A; 2M0N A; 4M9J A; 2DPJ A; 1XC9 A; 3PW2 A; 2ISP A; 5KT7 A; 4RZR A; 5ALY A; 1WWV A; 2H3F A; 1COK A; 4JV2 A; 4ECZ A; 3PVX A; 1ZQC A; 4DSE A; 1ZQY A; 4Q44 A; 5J0O A; 4J9Q A; 1T3Q A; 5ALS A; 4USA A; 1U47 A; 3QU2 A; 5KFB A; 3I76 A; 4F92 B; 3UPQ A; 4CCH A; 3D2S A; 3BQ7 A; 5KFX A; 4DSK A; 3T5K A; 3H4D A; 2KHV A; 4UW9 A; 5ALL A; 9ICR A; 2W43 A; 1K1Q A; 3D2N A; 3EYZ A; 1MQ2 A; 5DDM A; 9ICU A; 5CEH A; 1IIP A; 3NRW A; 3TAR A; 2OH2 A; 2ASJ A; 2LHT A; 1T4G A; 3RBD A; 4LVS A; 2A1J B; 5AM4 A; 2PFO A; 3C1Y A; 5AM0 A; 3TAP A; 1T3N A; 1NK7 A; 1SV0 A; 2ZJA A; 5AK6 A; 3PW7 A; 2HOF A; 3AQE A; 2BQR A; 1ZQA A; 2C2D A; 4NL9 C; 2JV3 A; 3AU6 A; 5KFM A; 2YQE A; 2KZM A; 2ZUD A; 4KLQ A; 5ALW A; 1XU4 A; 3GIM A; 3JPT A; 2LI6 A; 3KFU F; 2KG5 A; 2W9C A; 1JUD A; 4QW9 A; 3TFR A; 2KN7 A; 4QZD A; 1ZQR A; 1SWV A; 5GTH U; 1BNP A; 5DG7 A; 3BS5 B; 1IXR A; 2W8L A; 3RB3 A; 3T79 A; 3RH4 A; 4I27 A; 9ICV A; 2ESE A; 2GWS A; 3MAB A; 9ICG A; 4DL4 A; 2DWQ A; 5KNI A; 1NNL A; 4CF5 A; 3C5F A; 2VAN A; 3TAN A; 2NO4 A; 4RQN A; 4QZI A; 1TK5 A; 1ZQT A; 7ICG A; 3RH6 A; 3MDA A; 5ALX A; 2QB1 A; 4U6P A; 3RRG A; 5KT4 A; 3AUO A; 4CNQ A; 3V7K A; 2FPL A; 3N7S C; 1MN8 A; 2I5H A; 1RYU A; 2E8P A; 1ZQM A; 1J2N A; 3PSP A; 3RAQ A; 2VJ5 A; 2IOF A; 3PML A; 3TKA A; 4P0P A; 1F44 A; 3PW0 A; 4C8K A; 4R65 A; 7ICN A; 1ED1 A; 3NVV A; 5KG6 A; 2KJ8 A; 3UMB A; 4RPY A; 4NLC A; 1U48 A; 2LM4 A; 2WF9 A; 3C2K A; 1XO1 A; 2DL0 A; 3WKC A; 1KLN A; 3IG5 A; 8ICQ A; 4J9P A; 2XCP A; 4KLJ A; 4UB1 A; 2KD1 A; 2WF5 A; 3BQ2 A; 3RJF A; 1ZJM A; 1N63 A; 4UB8 U; 3VC8 A; 5HP4 A; 2UVU A; 1S8O A; 2BGW A; 2BR0 A; 4F5P A; 3WU2 U; 3PY8 A; 4TUQ A; 2MAX A; 4DSF A; 1WWU A; 4I2G A; 4M6W B; 1NJZ A; 3GU3 A; 2YY6 A; 4DWI A; 1SWW A; 2HHU A; 2OCE A; 2KEY A; 4Y2Q A; 3HT3 A; 3RBE A; 7ICK A; 1L3U A; 3DDH A; 4YD2 A; 4C8O A; 1QSL A; 3ICX A; 2C28 A; 3EPG A; 4PH5 A; 5FP0 A; 1XO0 A; 1Q8K A; 3SV4 A; 4EBC A; 2DBY A; 1OW5 A; 3C21 A; 4PGX A; 8ICC A; 3SEI A; 2ISO A; 3EPI A; 4ECW A; 2Y9T A; 8ICN A; 1BPY A; 3RJG A; 3K1Z A; 2ZUB A; 3M8R A; 1BPZ A; 4Y2S A; 4OJ6 A; 8ICS A; 4KLL A; 2F1I A; 4M9H A; 5AIA A; 3WKD A; 5KG4 A; 1KW4 A; 1VJ5 A; 3BQ0 A; 2LPE A; 3ZDE A; 7ICS A; 2WHE A; 4ED3 A; 1ZQG A; 3KZI U; 2K4E A; 2ZIU A; 5ALF A; 7ICE A; 1BPX A; 2OM6 A; 5B5E U; 2EDU A; 2IA6 A; 4KX5 A; 4ECS A; 1YZ7 A; 2HHX A; 3SR6 A; 4I2F A; 5KG1 A; 3F2D A; 1N60 A; 5AI9 A; 4Z6D A; 4BWM A; 2QAR A; 2W9C B; 5L1M A; 3KZX A; 1KRP A; 1NZP A; 3MFH A; 3ZDD A; 3N7R C; 3QU5 A; 1RPL A; 4RU9 A; 1MC8 A; 1U4B A; 1TK8 A; 1IG6 A; 7ICM A; 5KFC A; 4DOB A; 1ZQV A; 1O08 A; 4Z6C A; 1QSY A; 3JPO A; 5IIO A; 2KMD A; 4OJ5 A; 3WK5 A; 2HHT A; 4PHD A; 5EWE A; 2Y1I A; 2DQN B; 5JRT A; 2JEJ A; 4R66 A; 1Q46 A; 1ZQD A; 4P4O A; 2CN1 A; 5JUM A; 3H8M A; 2KVS A; 1SXE A; 5DGB A; 3M8S A; 2HDO A; 4GIB A; 4UAS A; 3NGD A; 1NK4 A; 3HKZ F; 3H7I A; 3M9M B; 8ICE A; 3M7D A; 4P0Q A; 2G06 A; 4NM2 A; 1L6N A; 5DBB A; 4RPX A; 4J03 A; 4NXZ A; 5J2K A; 4P0P B; 2KIV A; 2BCU A; 1LVH A; 1IM4 A; 5KAI U; 1AQ6 A; 2VKQ A; 3QEB Z; 3C23 A; 3PO4 A; 4M47 A; 4R63 A; 4F4Y A; 2KNJ A; 2E1E A; 2E8N A; 1RYS A; 4PJ0 U; 4GLX A; 2AQ4 A; 4OJO A; 4DFK A; 4YD1 A; 5IIN A; 5K4L A; 4UBB A; 2EZZ A; 3AMZ A; 4F4X A; 3BZK A; 5AKX A; 2KTQ A; 4EEK A; 9ICQ A; 5J0X A; 4UAZ A; 2ZTD A; 2NO5 A; 3LVW A; 2O6K A; 1X9X A; 9ICK A; 4RQ2 A; 5DQI A; 2W7P A; 1ZQB A; 3ISD A; 4M2Y A; 2ZXH A; 3MGH A; 9ICL A; 2F77 X; 4QZF A; 3CW2 C; 3E2E A; 2MA1 A; 4TUS A; 5F9N A; 8ICH A; 4PGY A; 8ICJ A; 3UQ0 A; 2ASD A; 5C5J A; 2FLP A; 4NY8 A; 1Z19 A; 2W55 A; 4DQI A; 3N97 B; 5CR0 A; 1KFT A; 4ECX A; 1B0X A; 1S0V A; 1TKD A; 5DQG A; 2IBK A; 3MR6 A; 3IN5 A; 2L5Y A; 3PW5 A; 5DBC A; 2AGO A; 4RQ3 A; 4C0Z A; 2HHV A; 4UAY A; 3MGV A; 4BXO A; 2ALZ A; 1WG8 A; 3T3F A; 2R8K A; 3RR7 A; 2PMZ C; 1ZQK A; 2HOQ A; 3FAH A; 1SL0 A; 2A3V A; 3ONN A; 3IP4 B; 2VA8 A; 3RJI A; 4Q45 A; 1PK1 A; 3H8W A; 3F2B A; 4KLH A; 5KL1 B; 4YMM A; 1BVS A; 3GV7 B; 1URJ A; 7ICQ A; 2B0C A; 5DGA A; 2EH9 A; 1BGX T; 4ELV A; 4UAT A; 4C7Y A; 4DSI A; 1SL1 A; 1L8L A; 2EQY A; 4DFJ A; 1DOQ A; 3IG8 A; 3IV6 A; 2J6U A; 4QZA A; 4ELT A; 8ICY A; 2LYB A; 1L3S A; 9ICO A; 5L9X A; 2XCA A; 3GIL A; 2ZIV A; 2GH1 A; 2QAR B; 3K1R B; 4OJP A; 4KLE A; 1CUK A; 4MFA A; 3NAS A; 3PMN A; 3V6H A; 4Y2R A; 4E0D A; 8ICT A; 2HHQ A; 1ZD4 A; 3FM9 A; 4DEZ A; 5ALM A; 4EBD A; 2OWO A; 5HML A; 3BZC A; 3KKA C; 4FZM A; 4GC6 A; 2Q0Z X; 1U9L A; 4DOA A; 5JTI A; 5DQH A; 2E8O A; 2FLL A; 3AQF A; 1SZH A; 1LKY A; 1KN5 A; 2C22 A; 2FMS A; 3KHG A; 1QQ5 A; 2HBM A; 5HR7 A; 5KFU A; 1NJW A; 3V7J A; 1ZQU A; 1L7N A; 2B6G A; 2DKX A; 1MQ3 A; 5KFO A; 5HHH A; 5AK3 A; 4ECT A; 2FI1 A; 3QYP A; 2YB1 A; 4I28 A; 3IRU A; 4EEN A; 1RXW A; 8ICZ A; 2AGP A; 2UVR A; 4K4H A; 4OCZ A; 2BCV A; 1SIJ A; 3C5G A; 3IDW A; 1L7M A; 4QZE A; 1KFS A; 4ACO A; 3AM9 A; 4K4I A; 3ALR A; 2G08 A; 3L4P A; 3QU9 A; 4F3O A; 4BGD A; 4RQ0 A; 5III A; 1S0N A; 4C8N A; 3C29 A; 5L1I A; 1JXE A; 4I29 A; 2BQU A; 3O0F A; 3Q8S B; 4IRK A; 2D6F C; 4F93 B; 1N61 A; 4TUP A; 3V7L A; 3RRH A; 2F1H A; 4F5Q A; 3FYH A; 4RQ6 A; 5AKL A; 3M9N B; 4YN4 A; 8ICM A; 4I2J A; 3PV8 A; 2CPR A; 1KFD A; 5J2I A; 4F72 A; 1OUQ A; 4O3N A; 2BDP A; 4DQS A; 1M6Y A; 4GXJ A; 4NLB A; 1ZD2 P; 4IR9 A; 1NJY A; 2HBL A; 5J2H A; 1PVQ A; 3RTV A; 1IV8 A; 3SMV A; 4QJF B; 2PI5 A; 2DGZ A; 4Q8E A; 4G3I A; 1X40 A; 3QU7 A; 4UAV A; 5AI8 A; 3GV8 B; 1DGJ A; 4J9M A; 4RT2 A; 1PVR A; 3GV5 B; 3MR2 A; 1SV4 A; 5KG5 A; 2HVI A; 4UB2 A; 4Y2J A; 1N5W A; 2FLN A; 5CWR A; 3GDX A; 2EAM A; 4BXO B; 3LWM A; 8ICA A; 2PFQ A; 2XIC A; 4YXM A; 3KHR A; 4US8 A; 4ICA A; 5KAF U; 3TAD C; 2K60 A; 5KFL A; 1NI3 A; 2DF4 B; 5J2D A; 2IHN A; 1PK1 B; 4J9S A; 4KLI A; 3RJK A; 3SD7 A; 5JU5 A; 3Q8K A; 2W54 A; 4RQ8 A; 2KK0 A; 4J9K A; 5AKY A; 4UAR A; 2JEF A; 5EE9 A; 2HSZ A; 3MBY A; 3N28 A; 5CRX A; 1T7P A; 1UT5 A; 2N1R A; 8ICK A; 4R64 A; 4ECQ A; 4PHP A; 1U49 A; 5ALI A; 4DSJ A; 2MSN A; 5AKH A; 4FZL A; 4KN7 A; 3JPQ A; 5ALJ A; 2ZIV B; 5KT6 A; 4XQ8 A; 4F50 A; 5D4B A; 5IIL A; 3U26 A; 2ODG A; 4O3O A; 1P7D A; 3RJJ A; 2ZJ8 A; 5ALE A; 4C4T A; 2FDR A; 2NV3 A; 5IIK A; 2XID A; 2RDJ A; 2K89 A; 1ZQP A; 4JV0 A; 3QUC A; 1SV0 C; 2KJ9 A; 2AU0 A; 2W7O A; 1SZP A; 3QNM A; 4KMU A; 1KTQ A; 1BPB A; 5EOZ A; 3OJS A; 3PNC A; 4RQ7 A; 3ISB A; 2VIX A; 1ZQO A; 3EW9 A; 3MDC A; 4EZ9 A; 1LKY B; 1RXV A; 3PO5 A; 1ZRN A; 5KT2 A; 5DDY A; 4J9L A; 2IMW P; 5AM3 A; 4ED0 A; 8ICO A; 5ALG A; 2DFL A; 4HAI A; 1CRX A; 4ED2 A; 3OTQ A; 5ALZ A; 4QNL A; 4G9B A; 3PR4 A; 4A8E A; 1Y88 A; 5IIM A; 1ARO P; 3IM1 A; 2HI0 A; 2GOL A; 2NRV A; 2IOH A; 8ICV A; 3EWA A; 1TFR A; 1N5X A; 3RFA A; 5AKK A; 4DF8 A; 4X5V A; 5ALD A; 1SKW A; 4KLG A; 5KL8 B; 4QZG A; 3WK9 A; 4YQW A; 1U45 A; 2M9N A; 4F5R A; 1S5L U; 1XWL A; 5AKZ A; 4GXI A; 2PFN A; 1NK9 A; 1N56 A; 1PVP A; 4OJL A; 4CF3 A; 1ZQW A; 1ZYQ A; 4QIW C; 4BDP A; 3A0B U; 1J2M A; 2IHM A; 5TIS U; 2G07 A; 3GZF A; 3QZ8 A; 2W03 A; 5AI0 A; 5AM5 A; 9ICA A; 4KLO A; 2BPF A; 4JMU A; 5D49 A; 1TK0 A; 3RAX A; 2ZXI A; 4PPX A; 2PMZ F; 2BHN A; 3B0X A; 3QZ7 A; 3EZ5 A; 5AM1 A; 4YCX A; 1UA1 A; 1QQ7 A; 2R8G A; 1UHU A; 2FMQ A; 4NV0 A; 2EAO A; 3NTU A; 1KSP A; 4ZH4 A; 1Z1V A; 2H5X A; 5KTQ A; 4WJ3 B; 2LBO A; 3SQI A; 2C2E A; 2BPC A; 2F8L A; 1QH9 A; 3K75 D; 3A0H U; 4FS2 A; 4M04 A; 4JB3 A; 4ECR A; 4CRX A; 4M9G A; 4C8M A; 2KV2 A; 4IQT A; 4YG2 A; 4F71 A; 3KHL A; 4QWC A; 4ED1 A; 8ICG A; 1UA0 A; 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