The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
86
|
structure length |
86
|
Chain Sequence |
ASIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLSPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDELYELLQHILKQRPGGGGST
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Hydrolase regulator
|
| source organism |
Escherichia coli
|
| molecule keywords |
E80-TELSAM domain
|
| total genus |
19
|
| structure length |
86
|
| sequence length |
86
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3KKA A; 2QB0 B; 1V85 A; 2EAM A; 5KNI A; 4PZO A; 3KKA C; 2EAN A; 2L5Y A; 1COK A; 4NJ8 A; 2F3N A; 2EAP A; 3BS5 A; 1SGG A; 2KSO A; 2DKX A; 2LMR A; 5JTI A; 2JV3 A; 1X66 A; 3BS5 B; 5F3X B; 2KSO B; 3TAD C; 1KW4 A; 2Y9T A; 1UCV A; 2E8P A; 2QB1 A; 1RG6 A; 2DKZ A; 1PK1 A; 5JRT A; 2KG5 A; 3H8M A; 4PZN A; 1PK1 B; 3IDW A; 5J8Y C; 2KMD A; 2D8C A; 2LPE A; 2E8O A; 2F44 A; 1WWU A; 3TAD A; 1SV4 A; 1WWV A; 2QAR A; 1B4F A; 5L1M A; 4MHV A; 1SV0 A; 1LKY A; 2D3D A; 2QAR B; 2QKQ A; 1UQV A; 1SV0 C; 2FE9 A; 1X40 A; 1OXJ A; 2Y9U A; 1LKY B; 2ES6 A; 5J8Y A; 3BS7 A; 4IS7 A; 2F8K A; 1DXS A; 1JI7 A; 2DL0 A; 2B6G A; 4RQN A; 2ESE A; 2GLE A; 2K4P A; 3SEI A; 1SXE A; 2E8M A; 5JU5 A; 3HIL A; 3SEN A; 4NL9 A; 2YTU A; 1V38 A; 4NL9 C; 1X9X A; 1OW5 A; 2KIV A; 4RQM A; 1SXD A; 1Z1V A; 3TAC B; 2E8N A; 1PK3 A; 1B0X A; 2K60 A; 2KE7 A; 3K1R B; 3BQ7 A; 2EAO A; 2QB0 A; 1F0M A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2LM1 A; 4J9P A; 1TVA A; 2DPI A; 4NV0 A; 4YMO A; 1RYU A; 3SV4 A; 3PO4 A; 3RJH A; 1ZQ1 C; 2B0C A; 2NV3 A; 4CE6 A; 1SIJ A; 5AKJ A; 4O3Q A; 4QWD A; 1ARO P; 4UBB A; 4F4X A; 4UAU A; 2Z7J A; 2F1I A; 4F3O A; 3SR6 A; 5C5J A; 2LMR A; 4O3N A; 2ZTC A; 1UA0 A; 3GV8 B; 3HKZ F; 5BOL A; 3WK9 A; 3M9N B; 1T8E A; 4J9M A; 5CEH A; 3PW7 A; 2DKZ A; 1L8O A; 3RAX A; 1ZQC A; 3HX0 A; 7ICL A; 4KN4 A; 2NO5 A; 1Q3U A; 2YX8 A; 4FBU A; 1SZP A; 3M9O B; 4UAY A; 1B4F A; 1DGS A; 5ALM A; 4PH5 A; 2RLT A; 2HBJ A; 2BPC A; 3ZDE A; 3SV3 A; 1H38 A; 4Y2Y A; 4I27 A; 3LWL A; 1JIH A; 3QNM A; 3JPO A; 1ZQP A; 2C2R A; 1A6S A; 2F8K A; 1DXS A; 2ALZ A; 4Q43 A; 3K1Z A; 4YN4 A; 3M6Z A; 2HSZ A; 2YQE A; 4ECW A; 5KG2 A; 3MBY A; 3QUT A; 3KZX A; 1DGJ A; 4M9J A; 3LK9 A; 1TFR A; 5KFX A; 3BZK A; 2FPM A; 4LJX A; 9ICV A; 9ICL A; 1ZD4 A; 1SXD A; 4JUZ A; 3MGV A; 3C23 A; 3QU2 A; 4EYH B; 4QZI A; 4F4K A; 4GXK A; 2KE7 A; 2OM6 A; 8ICH A; 2E1F A; 2UVR A; 4RQ2 A; 2ZJ5 A; 2EH9 A; 3KKA A; 1B43 A; 5KNI A; 3ALR A; 5ALD A; 2KKV A; 3J81 j; 4FZL A; 1QCK A; 3KHR A; 1ZQJ A; 3G6Y A; 2BZF A; 1SGG A; 3RB3 A; 2I5H A; 1SWV A; 2OH2 A; 4P0P A; 3TAR A; 2PXI A; 3TAQ A; 5IIJ A; 2C2E A; 2P66 A; 8ICJ A; 3QUC A; 1UCV A; 2E8P A; 3E0F A; 2PFQ A; 4F5P A; 4BUG A; 5ALK A; 2WTF A; 2EQY A; 1VDV A; 4J9K A; 2W55 A; 4RZR A; 3EUB 2; 4PZN A; 4PPX A; 1RXV A; 1WCN A; 4ECX A; 2O6K A; 3PO5 A; 1ZRM A; 1AQ6 A; 3Q8S B; 3GII A; 5KFP A; 4FE3 A; 5DDM A; 5ALG A; 2P35 A; 1XO0 A; 2KZM A; 5AM2 A; 1T3Q A; 2NRX A; 5DBB A; 4DL2 A; 1O03 A; 2NRZ A; 2PMZ C; 3OPX A; 3AU6 A; 5AK4 A; 4IQW A; 3F5A A; 1Q8K A; 3IG8 A; 2F8L A; 4DQQ A; 4IS7 A; 1ZQD A; 9ICK A; 3GU3 A; 1QQ5 A; 1V97 A; 3JPS A; 3HIL A; 2FMQ A; 1ZD3 A; 2LM4 A; 8ICX A; 4NL9 A; 3PX6 A; 2AGP A; 5EE0 A; 4DSE A; 1ZQW A; 1KDH A; 5KFA A; 3I28 A; 2FLN A; 2ZIV A; 4Z6D A; 4RNN A; 4US8 A; 1COO A; 1WYG A; 4KLO A; 1NK5 A; 4F2R A; 4I2C A; 5EE3 A; 9ICQ A; 2F1J A; 4I2F A; 3C5F A; 3Q8P B; 4CCH A; 1BPD A; 3FM9 A; 1Z3E B; 4U7C A; 1ZQV A; 1ZQU A; 4M6W A; 2XID A; 3QZ8 A; 2IOH A; 2WF8 A; 3HP6 A; 1ZQX A; 5J2G A; 2JMG A; 4XRH A; 4C4S A; 4DSJ A; 2KSO B; 4FZN A; 3ONN A; 4JWN A; 1N48 A; 5DB9 A; 4ELV A; 1RG6 A; 2ISO A; 1T94 A; 2KZ3 A; 4DL7 A; 4I2H A; 2M9N A; 3H8M A; 1NK9 A; 4Y2X A; 1FIQ A; 5KFE A; 2KMD A; 4Q8E A; 2C2D A; 2FMS A; 7ICU A; 1KBU A; 2ZTE A; 1C20 A; 5DDY A; 1SV0 C; 4ECR A; 2WF9 A; 4DF4 A; 1NI3 A; 4M0A A; 2ES6 A; 5ALX A; 4DLG A; 4Q44 A; 2W9B A; 2VJ4 A; 3WK7 A; 3RB6 A; 5D49 A; 1TAU A; 2VIX A; 2HHX A; 2H5X A; 4DSI A; 3SEN A; 4ED8 A; 4YCX A; 5J0T A; 5DB7 A; 2XC9 A; 3MR6 A; 4F72 A; 2R8J A; 2W8K A; 3TI0 A; 4ACO A; 1B22 A; 4F8R A; 1OUQ A; 3BQT A; 1XSN A; 2QB0 A; 4BX9 C; 2KJ8 A; 4NXZ A; 3S6J A; 4NLB A; 2OEH A; 1V85 A; 4FS1 A; 4P4O A; 2DQN B; 4BDP A; 4G9B A; 5KTQ A; 5IIL A; 3QUQ A; 1XNS A; 1COK A; 4FZM A; 1ZQO A; 2F3N A; 3V6K A; 9ICA A; 2JH1 A; 1L7M A; 1Z19 A; 3BS5 A; 4WJ3 B; 1U48 A; 5AI6 A; 5J0X A; 9ICR A; 2MRL A; 5AM4 A; 1WG8 A; 1SWW A; 2R18 A; 2XCA A; 1K1S A; 4QIW C; 3UMC A; 2D6F C; 4M47 A; 2ZUB A; 5DG9 A; 2J6U A; 3QU7 A; 3RR8 A; 2DBY A; 5KG6 A; 2KN7 A; 2HVH A; 1ZD5 A; 4ZH4 A; 5HMM A; 2W7P A; 3ZD8 A; 2YMM A; 1WWV A; 3QU4 A; 4YFK A; 2HHQ A; 3V6J A; 2PFP A; 3SAG A; 5ALH A; 1ZQG A; 2QAR B; 2LKY A; 5J0P A; 2E1E A; 1HUZ A; 5ALE A; 5KFJ A; 4EZ6 A; 3QU5 A; 1NKC A; 3TKA A; 1S0N A; 2BCU A; 2IBK A; 1LB2 B; 1YZ6 A; 4F4W A; 3PW5 A; 3NRW A; 4UAS A; 3WK6 A; 1L7N A; 4M9G A; 2Q0Z X; 5KL1 B; 1L3S A; 2F77 X; 1V38 A; 3OJU A; 1F44 A; 4J03 A; 3RJG A; 4DS4 A; 2DGZ A; 1ZJN A; 4ED6 A; 4RT2 A; 1OW5 A; 4B9U A; 1JUD A; 4OJ5 A; 2J6T A; 4DCC A; 4PGX A; 2AXT U; 4NWI A; 2ZIX A; 8ICV A; 1SB3 C; 2HCF A; 2E3T A; 4JMU A; 3EYZ A; 5AM3 A; 2KJ9 A; 1X9S A; 2K4E A; 1K1Q A; 3ETR A; 4R8U A; 3V7L A; 5TIS U; 1U4B A; 1KL9 A; 1XSL A; 1TKD A; 1BPE A; 3PST A; 2LHT A; 5KFN A; 1D8B A; 1S5L U; 4Y2J A; 2BCQ A; 2W3R A; 2DFL A; 1URJ A; 3EPG A; 1BPX A; 4YVZ A; 2AHO B; 1SL0 A; 4Y2S A; 2W8L A; 1RQL A; 1PK1 A; 3NVY A; 2CN1 A; 3D2N A; 4MF2 A; 4KLH A; 5AM5 A; 2R8G A; 2LI6 A; 3M1Y A; 1UHU A; 2BCV A; 2D8C A; 2G06 A; 3TAD A; 4ECU A; 4UB5 A; 1N63 A; 1HIW A; 5J2I A; 1SV0 A; 8ICI A; 3D2S A; 4RQ6 A; 3N28 A; 4DWI A; 4JV0 A; 1ZXI A; 4RNM A; 3WKA A; 5J29 A; 2HHV A; 4EEL A; 3KHH A; 9ICB A; 4RT3 A; 3KFU F; 3PSF A; 4CNQ A; 1UT5 A; 5J8Y A; 4QZ9 A; 3C1Z A; 2F2A B; 2XVT A; 5DG7 A; 2C28 A; 2HHS A; 1KEJ A; 1VJ5 A; 5CWR A; 4QJF B; 5F9N A; 2ZUD A; 1N56 A; 4KLJ A; 3NTU A; 3H4D A; 1ZQL A; 4IQV A; 9ICH A; 3MFI A; 2YMQ A; 4QZD A; 5L1I A; 2LYA A; 1TK5 A; 5KFD A; 4DSK A; 4JV2 A; 2HBK A; 3F5E A; 3MDC A; 1QQ7 A; 3GFK B; 1ZQF A; 1PUZ A; 3QEA Z; 2JZB B; 1NOM A; 4YMM A; 4Q45 A; 5FP0 A; 4RQ4 A; 4OJL A; 1RXW A; 2KZZ A; 3PML A; 4GXI A; 2BKE A; 4DFK A; 8ICR A; 2L5Y A; 4R66 A; 4QZB A; 4QZ8 A; 5HR6 A; 4AYB F; 4IQU A; 4A8E A; 3H0L B; 1V9P A; 3DV9 A; 2YMP A; 4KLM A; 2JV3 A; 2ASJ A; 4O3M A; 2XIC A; 1KW4 A; 5ALQ A; 2VA3 A; 4Z6F A; 3HW8 A; 3PW4 A; 4F4Z A; 4C8O A; 3L3F X; 3NAS A; 1Z00 B; 2KG5 A; 3C21 A; 4DF8 A; 3GIL A; 3OHA A; 5ALY A; 1TE2 A; 2ZIW B; 2GOL A; 5DGA A; 5DKW A; 4KN7 A; 3B0X A; 4IC9 A; 1XS9 D; 4IRC A; 3QX7 A; 2G0A A; 3ZDB A; 3UMB A; 4ICA A; 4ED1 A; 3M9M B; 1A0P A; 2D3D A; 4ELU A; 2QKQ A; 1ZJM A; 4RU9 A; 5J0O A; 4O5K A; 3JPN A; 1ZQA A; 2OYY A; 2Y0S F; 5J2H A; 4G3I A; 2DL0 A; 1D9D A; 5TZV A; 3ETL A; 4GFJ A; 3CNH A; 2EZX A; 5CB1 A; 3H0R B; 2KD1 A; 3IV6 A; 1N62 A; 3TFR A; 2K4H A; 1SL1 A; 4O3O A; 5KT2 A; 1L8L A; 4C4R A; 3SZ2 A; 5CP2 A; 4I2A A; 4P4P A; 4UB6 U; 3MGI A; 5KFI A; 2KHQ A; 3I76 A; 3WKE A; 4RQM A; 2MUT B; 1DRG A; 4O5E A; 2DUY A; 3HPO A; 3KZI U; 3IM1 A; 5HHI A; 1UT8 A; 5AHX A; 5AI0 A; 3K4G A; 2ZTD A; 5ALO A; 3N4M B; 5KG3 A; 3RJI A; 2RDJ A; 4UAV A; 4KLG A; 7ICT A; 2ZXH A; 2FJ6 A; 4DFP A; 3PMN A; 3OSN A; 4YR0 A; 3IG5 A; 2P6R A; 5J2D A; 5KAI U; 1TK0 A; 1NKB A; 3H8S A; 3ISC A; 3N7P D; 2MSN A; 3EWA A; 1PVQ A; 4KMU A; 4DL3 A; 2Y9T A; 1TAQ A; 5KFH A; 5L1J A; 1M6Y A; 8ICG A; 1QQ6 A; 1D8L A; 2WF7 A; 3AN1 A; 1J2N A; 1NK8 A; 3IRU A; 1QSY A; 7ICV A; 4QIW F; 2R8I A; 4RQ1 A; 2KEY A; 4KLT A; 3IDW A; 4PJ0 U; 4I2J A; 1GO3 F; 5L1K A; 2IOF A; 3LVV A; 5L1M A; 1ZQY A; 3NRZ A; 3SI8 A; 4QWB A; 3NGD A; 2HW3 A; 4JB3 A; 3ISD A; 4B9S A; 4IL6 U; 1LKY B; 1ECW A; 5IIO A; 4OJ6 A; 5IIK A; 4Z6C A; 2BPF A; 1ZQQ A; 4QW9 A; 3QYP A; 4ECS A; 2ZJ8 A; 2H3V A; 4P0Q B; 4Y2Q A; 4FS2 A; 1NJX A; 4MFF A; 1FFU A; 2P6U A; 2HDO A; 5EWF A; 4BXO A; 4NY8 A; 3H4B A; 1MQ2 A; 2MU2 A; 1X9X A; 2HBL A; 5EE9 A; 1S0V A; 3TAN A; 4B9L A; 2UVU A; 2GO7 A; 2B21 A; 2R8H A; 4LVS A; 2WB1 C; 3ICX A; 4F5Q A; 5GTH U; 2XY5 A; 3HWT A; 1D8Y A; 4XQ8 A; 1S0M A; 4CF4 A; 2K8A A; 5J0W A; 1XSP A; 3AEV A; 4DS5 A; 3DDH A; 4EEK A; 3KD3 A; 3AMZ A; 3DEE A; 4HYK A; 5KL8 B; 1XU4 A; 4NM2 A; 3MR5 A; 5DGB A; 2OXO A; 3F2B A; 1KTQ A; 4DL4 A; 3UXP A; 4KLD A; 2AU0 A; 5AKG A; 4YR3 A; 2H3F A; 1L3V A; 7ICO A; 2DPJ A; 2BQU A; 4ED0 A; 2AH5 A; 3H8W A; 1T3N A; 1ZQN A; 1BPY A; 2KTQ A; 4QWA A; 1ZQR A; 4P4M A; 4DOB A; 3F53 A; 3I1Y A; 4YR2 A; 3C5G A; 2QLT A; 4ED7 A; 4ECQ A; 4F71 A; 2YN4 A; 3LDA A; 5J2B A; 4CF5 A; 2F44 A; 3BDP A; 1C7Y A; 2UVV A; 3BQ1 A; 2VA8 A; 4C8M A; 4IQT A; 2G5H B; 4MF8 A; 2OHF A; 4F93 B; 1T4G A; 2WHE A; 2W9C B; 3GQC A; 4O3S A; 4ZOH C; 1YT3 A; 3GV7 B; 3H40 A; 9ICI A; 1CRX A; 3BS7 A; 4TUQ A; 3SD7 A; 2KFN A; 4RQN A; 4F4Y A; 4J9O A; 3EZ5 A; 1NJY A; 5KG1 A; 4PL2 A; 5CJ7 A; 3HRD D; 4RQ3 A; 3BQ0 A; 2BCS A; 1HEK A; 4OCZ A; 4TQS A; 4ELT A; 4O0I A; 2RQ5 A; 2MAX A; 1F5S A; 3N7R C; 9ICU A; 3PX0 A; 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3N7S C; 5KFM A; 2N1R A; 5ALT A; 3SAF A; 1XWL A; 2ZUC A; 5KAF U; 4DFJ A; 2PKE A; 4DOA A; 3SYZ A; 4R64 A; 9ICP A; 5ALJ A; 1ZQS A; 4JWM A; 1MC8 A; 5A0L A; 7ICF A; 1T7P A; 4LZD A; 3V7K A; 2RHF A; 4P0P B; 4QNL A; 4UB2 A; 4X5V A; 2ASD A; 2W43 A; 3MR3 A; 4ECZ A; 4USA A; 4EEN A; 4EX7 A; 2V4Q A; 4C80 A; 2XGQ A; 2G5I B; 2K4I A; 4RQ7 A; 4KLE A; 2W11 A; 2BDU A; 4C4T A; 4MEX A; 3C2L A; 2H3I A; 3T5K A; 4TUR A; 3H8J A; 8ICC A; 2NO4 A; 1K5O A; 5KFC A; 4GLX A; 9ICW A; 3JPP A; 2W7O A; 2R8K A; 2KFZ A; 3QU9 A; 2IMW P; 1FEZ A; 2I9G A; 4J9L A; 4NLG A; 5KFS A; 5DBC A; 2OCE A; 1NZP A; 2H3Q A; 4K4I A; 3ISB A; 2JEF A; 1TAM A; 3WK8 A; 1CUK A; 5HNK A; 1NJW A; 3R9K A; 5JUM A; 1L7O A; 4C8L A; 1Z1V A; 5J2E A; 3V6H A; 2IHN A; 1B0X A; 4PL1 A; 4YD2 A; 2PMZ F; 2ZIV B; 3T3F A; 1TK8 A; 5KFT A; 2ZG6 A; 5ALV A; 4QZH A; 3VCB A; 1DK2 A; 8ICB A; 3G6X A; 2IHM A; 3JPQ A; 4Y2T A; 2ISP A; 1HJP A; 1QSS A; 3LWM A; 1ZET A; 7ICQ A; 4EBE A; 4ECT A; 2IA6 A; 3MGH A; 3UXO A; 2KSO A; 7ICK A; 1BVS A; 2KOB A; 4M6W B; 1X6I A; 5DLF A; 1X66 A; 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