The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
72
|
structure length |
72
|
Chain Sequence |
MDRIFMTRTEALEFLLKAHQTAVDKIGHPSHKQTPADHAAIEALDRLLLDVRARRVDQFQINASAAQIIVTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR structure for potential drug target from Burkholderia thailandensis E264
rcsb |
| molecule keywords |
Uncharacterized protein BTH I2711
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| molecule tags |
Unknown function
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| source organism |
Burkholderia thailandensis e264
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| total genus |
15
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| structure length |
72
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| sequence length |
72
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-07-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2MRL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1D9F A; 4K4I A; 1MA7 A; 2NRZ A; 3RBE A; 5AKX A; 4NLN A; 3RJF A; 5AIC A; 3N28 A; 1FFU A; 1X42 A; 4JV1 A; 2PFN A; 2EZZ A; 2DL0 A; 4I2E A; 1V38 A; 4M47 A; 2ZIV B; 4A8E A; 5JTI A; 3UXN A; 3M8R A; 2P6U A; 4RT2 A; 4F5P A; 4OJP A; 2F1H A; 4ECX A; 2HSZ A; 4PH5 A; 4F5N A; 1K1Q A; 3TAP A; 2LM1 A; 3PSF A; 3WKD A; 1OUQ A; 5KFJ A; 1IG6 A; 4JB3 A; 3TFR A; 3H40 A; 5ALR A; 2ZIW B; 4QZH A; 1Q46 A; 5F9L A; 3AUO A; 2K8C B; 3H0M B; 1SKW A; 4XUS A; 8ICX A; 1S0M A; 1NK9 A; 4E0D A; 3E2E A; 4QZA A; 2KJ5 A; 2XCA A; 5DBA A; 2NO5 A; 3E0F A; 3SI8 A; 4QW8 A; 3RH5 A; 3H8S A; 1N61 A; 2OH2 A; 1ZQW A; 3EPI A; 8ICF A; 3WK7 A; 3B9J A; 1L8O A; 4YMM A; 4YCX A; 3WU2 U; 2QAR B; 1MC8 A; 1KL9 A; 4F72 A; 8ICC A; 5CB1 A; 1OW5 A; 5KFO A; 2WHE A; 2ISO A; 4IQT A; 5KT3 A; 5IIL A; 4F91 B; 4RPZ A; 3NRW A; 4P0P B; 5KFG A; 1S8O A; 1TAM A; 4FFD A; 1NNL A; 3V7J A; 2KIV A; 4BDP A; 2JXJ A; 3AM9 A; 2EDU A; 7ICP A; 4J9O A; 4NLC A; 1PUZ A; 4I2F A; 8ICJ A; 1SV0 C; 5KG3 A; 2CPR A; 1ZQZ A; 1JIH A; 2K8A A; 3F5A A; 4IL6 U; 5ALF A; 8ICS A; 4I2J A; 5L1K A; 3RAQ A; 4UW9 A; 1H38 A; 4J9L A; 1N62 A; 2YMQ A; 5KFN A; 2XIC A; 3OHA A; 3PV8 A; 1FFV A; 5KFT A; 3UQ0 A; 2E3T A; 1X2I A; 4DSF A; 1EXN A; 4DOC A; 4M9J A; 5JUM A; 2HVH A; 1D9D A; 4DWI A; 2E5S A; 1UHU A; 5KFY A; 1F5S A; 2E1F A; 4RNO A; 2BCQ A; 3PW2 A; 2GO7 A; 2C2R A; 3NS1 A; 2JEF A; 1SL0 A; 2FMP A; 4BGD A; 2PI5 A; 5ALE A; 5KFP A; 4RU9 A; 1SIJ A; 3GU3 A; 2VA8 A; 4B9S A; 1QLN A; 2RLT A; 1JN3 A; 2H3V A; 2FLL A; 8ICI A; 4YQW A; 1A77 A; 1ZQC A; 3EPG A; 4DFD A; 5DG8 A; 3LWL A; 1NJX A; 4IQW A; 5AM4 A; 1TAQ A; 2KZ3 A; 5HHH A; 3V6H A; 7ICK A; 4UQG A; 1BVS A; 5ALK A; 1SL2 A; 2LBO A; 2VIX A; 5ALW A; 1C20 A; 4NM2 A; 3OSP A; 3PML A; 2F2A B; 4DO9 A; 1NOM A; 5J0W A; 1ARO P; 2YY6 A; 5H2F U; 2LHT A; 8ICT A; 1WUD A; 3BJY A; 7ICG A; 3UXP A; 2Z7J A; 3RB4 A; 3ICX A; 5KT7 A; 5DGA A; 3NRZ A; 4MEY A; 3VCB A; 1XWL A; 4RUA A; 3AMZ A; 1BGX T; 7ICQ A; 3BZK A; 1RQN A; 4R8U A; 4FBT A; 4IQU A; 4C80 A; 2UVU A; 4X5V A; 4O3Q A; 5EWG A; 2W11 A; 1D8Y A; 1CEZ A; 1ZJM A; 2HBK A; 1YT3 A; 5J0U A; 3GV5 B; 3OTQ A; 1NJY A; 3KHG A; 3ONN A; 4DSI A; 2FPK A; 4F92 B; 1B22 A; 4USA A; 3TKA A; 4QZ9 A; 3NUQ A; 5CRX A; 1J2M A; 3FC4 A; 3GIJ A; 9ICP A; 2JRZ A; 1U9L A; 5L1J A; 4F3O A; 3JPO A; 5DLF A; 3HX0 A; 5CHG A; 2K4P A; 2MAX A; 3N7S C; 3IRU A; 4DL2 A; 2LM4 A; 3WK4 A; 4DLG A; 5AM0 A; 4ECR A; 2I5H A; 3OHB A; 3RB6 A; 3Q8S B; 3GIL A; 4OJO A; 1S5L U; 3QUC A; 3WKE A; 1Q3U A; 1VLB A; 1IXR A; 3PSI A; 1U45 A; 4KLI A; 1M6Y A; 1V97 A; 1F0M A; 4ZOH C; 4LVS A; 2E8N A; 1NK7 A; 5KG7 A; 4UAU A; 3QE9 Y; 2IA6 A; 3S6J A; 4XRH A; 3BDP A; 1ZD2 P; 1PVQ A; 2C2E A; 4RQ1 A; 2F8L A; 5IIJ A; 3SR6 A; 3PNC A; 4I28 A; 1TK8 A; 4I2H A; 2J6T A; 5ALG A; 4UAT A; 1FO4 A; 2E8M A; 3PX0 A; 4TQR A; 2HHT A; 4UB3 A; 3FM9 A; 5AK3 A; 4Z6E A; 1XO0 A; 4B9V A; 4CDG A; 4KLJ A; 3O0F A; 4YXM A; 4Q43 A; 1D8B A; 2FDR A; 3G6Y A; 2HDO A; 2ISP A; 2PFO A; 2W8L A; 3SAH A; 1U4B A; 2VA3 A; 4I29 A; 3SYZ A; 3JPQ A; 1T7P A; 2KSO A; 4B9U A; 3QUT A; 4DL3 A; 3MBY A; 2LYB A; 2ASD A; 1U48 A; 2XY6 A; 4KTQ A; 4PZO A; 3M9M B; 2YMM A; 2KV2 A; 3KOO A; 2VJ5 A; 2WF9 A; 3AEV A; 3SV3 A; 3UMC A; 3PY8 A; 3AU2 A; 3QXG A; 1ZQI A; 4Y2U A; 5DDM A; 4F50 A; 2WF8 A; 2F77 X; 4UBC A; 3KZX A; 4DEZ A; 3NAS A; 2JH1 A; 1U47 A; 4J9P A; 2ES6 A; 2OCE A; 3NVZ A; 5AI4 A; 5CEH A; 5DB8 A; 2DKX A; 2BHN A; 2KNJ A; 3ZD8 A; 3F2B A; 4C8M A; 4RPY A; 3RTV A; 1NK0 A; 5KG4 A; 1X66 A; 4BUG A; 3KHR A; 5D4B A; 5KT2 A; 4QZ8 A; 3HPO A; 4NL9 A; 2YB1 A; 5KFU A; 2MSN A; 3C1Y A; 1TAU A; 3ETL A; 2C22 A; 5B66 U; 2DBY A; 3HWT A; 4NV0 A; 5HHI A; 2A3V A; 1RXV A; 5IIO A; 4KLT A; 8ICV A; 4DFJ A; 2K60 A; 5J8Y A; 5ALO A; 1XSN A; 4KLO A; 2M0N A; 5F9N A; 3IG5 A; 4QZG A; 3F2C A; 5JU5 A; 2KMD A; 3C21 A; 4OJ6 A; 4BWM A; 4G9B A; 4GC6 A; 2BCV A; 4FZM A; 4FZN A; 3Q8Q B; 3I76 A; 4CF4 A; 4CNQ A; 1XU4 A; 2C28 A; 4US9 A; 5HNK A; 2LYH A; 4OJ5 A; 5ALL A; 1XNS A; 2Y9U A; 2E1E A; 4ED8 A; 5DLG A; 1KDH A; 2ZTC A; 1ZQF A; 4FO6 A; 2PFQ A; 2RDJ A; 3C2M A; 1X6I A; 1NKC A; 4RZR A; 5GTI U; 2HVI A; 5IIM A; 3ZDE A; 1T3N A; 2IBK A; 4M9G A; 1BPZ A; 4QWE A; 4FS2 A; 3JPT A; 4P2H A; 4ED2 A; 4UAZ A; 3K75 D; 4RUC A; 1HIW A; 3MAB A; 4C4R A; 3LVW A; 7ICE A; 5KFS A; 2RHF A; 1D8L A; 5L9X A; 9ICB A; 2H5X A; 4R8U B; 5KG6 A; 3SQI A; 3NVV A; 1BPX A; 5ALV A; 2EZX A; 2F76 X; 4FE3 A; 3ZDB A; 2HBL A; 3OPX A; 4UB4 A; 2FE9 A; 3UPQ A; 3FYH A; 3SD7 A; 4KN7 A; 1X6J A; 4YXJ A; 5J0S A; 2GWS A; 4UAY A; 2J6U A; 5KT5 A; 3L3F X; 3BQ2 A; 3D2N A; 7ICF A; 1GO3 F; 3PSP A; 4GXI A; 4C4S A; 5IIN A; 4JK1 A; 3ORY A; 4YP3 A; 5IIK A; 5L1I A; 3RJE A; 2IHN A; 4GLX A; 4HAI A; 1KEJ A; 5J2D A; 7ICH A; 1L3T A; 1ZJN A; 1QSL A; 1DK3 A; 1SKR A; 2JEG A; 3WK8 A; 1BPE A; 4Y2V A; 3B0Y A; 2EAN A; 3C29 A; 4YMN A; 2DGZ A; 2W54 A; 4QWD A; 1J2N A; 2XVT A; 1UPH A; 1J97 A; 1JXL A; 2OXO A; 5J29 A; 3CP8 A; 2LI6 A; 2P35 A; 3SZ2 A; 4MFC A; 4I2G A; 2JEI A; 1SV0 A; 5AHX A; 3KBB A; 9ICM A; 3CNH A; 2YB4 A; 2FJ6 A; 4DCC A; 4J03 A; 4EYH B; 1ZQV A; 5KFF A; 2R8K A; 4C8K A; 3SEN A; 2BKE A; 2G06 A; 1ZQR A; 4PPX A; 2HOQ A; 2AGP A; 3IG8 A; 2V4Q A; 2IMW P; 4KLQ A; 3OSN A; 2XY7 A; 1PK1 A; 5J0Q A; 4P0Q A; 5ALX A; 3T5J A; 9ICX A; 5EWF A; 3MR2 A; 1KBU A; 5KTQ A; 2BPG A; 2KSO B; 2JHD A; 3H4D A; 4DL5 A; 4RQN A; 4YMO A; 4ECY A; 2Q0Z X; 2KP7 A; 2VKQ A; 1RQL A; 3ZDC A; 7ICO A; 5EE9 A; 1RYU A; 5KT4 A; 2MA1 A; 1TE2 A; 4NM1 A; 5KFI A; 3OGU A; 5J2F A; 2QB0 A; 4JWM A; 4LZD A; 4G3I A; 3A0B U; 1ZQK A; 3N97 B; 3F5E A; 4YN4 A; 5ALZ A; 2ZIU B; 4EX6 A; 4PJ0 U; 3RF9 A; 4KN4 A; 2XI9 A; 3RJG A; 4M9N A; 3MR5 A; 2ZIX A; 2XGQ A; 2LKY A; 4EZ9 A; 2A1A A; 3RJK A; 4Z6D A; 8ICK A; 9ICG A; 2EAP A; 4F5O A; 4DOB A; 1BPB A; 3WKC A; 5KFH A; 2XO7 A; 3H8J A; 3TAN A; 5HMM A; 4NLB A; 1ZQX A; 1XSP A; 1OXJ A; 4C8L A; 4EEK A; 2O6K A; 1CRX A; 2VA2 A; 1L7P A; 4PL2 A; 3CRX A; 4P4M A; 4CE6 A; 4EEL A; 4P4P A; 5KNI A; 2BZF A; 5AKE A; 3ALR A; 1NZP A; 4F2R A; 2AJQ A; 8ICN A; 1QH9 A; 4C8N A; 1ECW A; 4YR2 A; 5KFQ A; 5ALU A; 2WF5 A; 5AKJ A; 5AI0 A; 2GH1 A; 3UMB A; 5DBC A; 3TQ1 A; 3HIL A; 4DL7 A; 1ZQG A; 1S0O A; 2FPL A; 3QUQ A; 2BQU A; 2K4H A; 2W9B A; 4B9M A; 4UAW A; 4QW9 A; 4JWN A; 1TKD A; 5AKI A; 2B6G A; 2HOI A; 4RQ2 A; 1JRP A; 4PHE A; 3U26 A; 3I28 A; 3TAC B; 4DSK A; 2ATL A; 1UCV A; 3QU7 A; 4GIB A; 1PZN A; 5J2G A; 3C2K A; 5KL8 B; 5EE3 A; 5ALN A; 4MF2 A; 2HOF A; 4QZB A; 4DF8 A; 9ICK A; 5HR7 A; 4EX7 A; 3ISD A; 3GII A; 3TAD C; 2G07 A; 2DQN B; 4YD2 A; 4ECZ A; 1DRG A; 1UT8 A; 4BX9 C; 3AQF A; 1X9S A; 9ICC A; 1V85 A; 2K89 A; 5KFB A; 1F44 A; 2K4I A; 2PKE A; 5KG0 A; 4IS7 A; 3H0L B; 1YZ6 A; 2W8K A; 3M7D A; 5D49 A; 3MDA A; 3B0X A; 4F93 B; 4IRC A; 5AKK A; 4ICA A; 2GOL A; 1N63 A; 3SMV A; 3Q8K A; 2AU0 A; 2AQ4 A; 3THV A; 2LMR A; 4RPX A; 2KJ9 A; 2JH7 A; 4O3O A; 2JV3 A; 3PX6 A; 3MDC A; 1ZQ1 C; 3Q8M A; 4UB8 U; 4YR0 A; 4LZG A; 3PO5 A; 1MSW D; 4MFF A; 1JI7 A; 1LV5 A; 3LDA A; 1K5O A; 1ZRM A; 5AKG A; 4RQ8 A; 5BOM A; 1BNO A; 2N1R A; 2JGA A; 4Q44 A; 2Y0S F; 4RQ3 A; 3H8M A; 3A0H U; 3NGD A; 1ZQP A; 2BGW A; 1PK1 B; 4EZ6 A; 4P0Q B; 3QU5 A; 1L3S A; 9ICI A; 1Z1B A; 8ICQ A; 2UVR A; 4DFM A; 3EWA A; 3PR4 A; 4I2B A; 3QZ8 A; 1TK0 A; 3PZP A; 3D6J A; 3DV9 A; 1NK5 A; 2XC9 A; 1UT5 A; 4DOA A; 4F8R A; 3ISC A; 1JUD A; 4KLF A; 2WF7 A; 3PW7 A; 2HI0 A; 3MFH A; 5J0O A; 8ICH A; 1ZD3 A; 4DS5 A; 4DQS A; 1Z19 A; 2QB0 B; 5KFW A; 2K4E A; 2KZM A; 5EE1 A; 2H3I A; 2FLN A; 1HUO A; 3V6J A; 2I1Q A; 8ICR A; 8ICP A; 1JRO A; 5AI9 A; 3PMN A; 2ZJ5 A; 9ICA A; 1N5X A; 2YQE A; 2BR0 A; 3EYZ A; 1JAL A; 1JMS A; 7ICU A; 4M6W A; 3BS5 A; 1JX4 A; 1S9F A; 1SWW A; 1QQ6 A; 3GZF A; 2DKZ A; 5KG1 A; 2P6R A; 4ACO A; 5ALI A; 1ZOL A; 3TAR A; 4DSJ A; 4NJ8 A; 1FEZ A; 4ED1 A; 3RB3 A; 1RZT A; 2Y0S C; 4KLM A; 9ICQ A; 2JR5 A; 3GDX A; 2RQ5 A; 2NV3 A; 3JPR A; 4R65 A; 4RQ5 A; 9ICN A; 1HJP A; 5B5E U; 2CN1 A; 2GLE A; 2XID A; 2W3R A; 5KG5 A; 1LKY A; 2L5Y A; 3Q8R B; 4J9M A; 3NVY A; 5J0P A; 3H4B A; 4R64 A; 4DQQ A; 9ICU A; 5GTH U; 5KFR A; 2HW3 A; 1N5W A; 4RQ0 A; 2AQ0 A; 1L5U A; 3PST A; 4MF8 A; 3C23 A; 4ELV A; 2G5I B; 1HUZ A; 2BCU A; 4K4G A; 9ICF A; 2W9A A; 1ZQJ A; 3WK5 A; 5KFD A; 4R63 A; 5C5J A; 3C2L A; 4YD1 A; 5G5G A; 4EBD A; 8ICG A; 4Y2X A; 2YN4 A; 1ZQB A; 1PK3 A; 2OEH A; 1WCL A; 2KVS A; 5EWE A; 8ICA A; 5AM3 A; 2W9B B; 2ZUD A; 1B43 A; 2KKP A; 2F1I A; 1RM6 C; 3RH4 A; 2P66 A; 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4ED7 A; 4Q45 A; 3PW5 A; 2LYA A; 1A76 A; 4M04 A; 4DSL A; 5ALY A; 9ICW A; 5DGB A; 1QSS A; 3AL0 B; 1X9X A; 4O3S A; 2D6F C; 4F5R A; 3GIK A; 4F4K A; 2G09 A; 4I2A A; 4CGZ A; 3BQ0 A; 4FBU A; 4GC7 A; 1L6N A; 4NLZ A; 2A1J A; 3T5L A; 4KLS A; 5J2K A; 3KKA C; 4Y2S A; 1NJW A; 9ICJ A; 4EBE A; 4Y2R A; 3R9K A; 1ZQS A; 2EH9 A; 2WF6 A; 3UXO A; 3IHQ B; 2AH5 A; 4M6W B; 3BS5 B; 4KX3 A; 4KLH A; 3GV7 B; 4IRD A; 3QYP A; 2PFP A; 1ZD4 A; 3TFS A; 3RRG A; 4IC9 A; 3H7I A; 4IR9 A; 4Y2J A; 4GXJ A; 3IDW A; 4F5Q A; 2K8B B; 3V6K A; 3PX4 A; 4YG2 A; 3V72 A; 3TAD A; 9ICR A; 3IN5 A; 2CRX A; 3PO4 A; 4Y2P A; 1LKY B; 3QEA Z; 4P4O A; 1L8L A; 3TAQ A; 1AQ6 A; 5C0Y A; 1L3V A; 2OHF A; 3C1Z A; 4B9L A; 1NK8 A; 2HHU A; 4ECQ A; 4U7C A; 4TUR A; 8ICL A; 3ETR A; 2IOF K; 4J9R A; 4CF5 A; 3KHL A; 4KMU A; 4ZH4 A; 2KIC A; 3GFK B; 2KD1 A; 3RH6 A; 2D3D A; 4PGQ A; 4M9H A; 1MN8 A; 1KW4 A; 3IM1 A; 2W3S A; 3QU2 A; 1SV4 A; 2ZUC A; 2KHQ A; 1SXE A; 2R8J A; 1SZP A; 1WWU A; 1ZQE A; 1Z3E B; 3FAH A; 4EEY A; 2WB1 F; 1KKX A; 4U6P A; 4EEN A; 4UB2 A; 4M2Y A; 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