The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
72
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structure length |
72
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Chain Sequence |
MDRIFMTRTEALEFLLKAHQTAVDKIGHPSHKQTPADHAAIEALDRLLLDVRARRVDQFQINASAAQIIVTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR structure for potential drug target from Burkholderia thailandensis E264
rcsb |
| molecule keywords |
Uncharacterized protein BTH I2711
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| molecule tags |
Unknown function
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| source organism |
Burkholderia thailandensis e264
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| total genus |
15
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| structure length |
72
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| sequence length |
72
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-07-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2MRL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4IQW A; 2G0A A; 5KG0 A; 2KZM A; 3JPO A; 4UAU A; 3NUQ A; 3Q8M A; 5J8Y A; 4Y2V A; 3PML A; 2J6S A; 1ZQM A; 1ZQF A; 3T5J A; 3T5H A; 2VJ4 A; 4F2S A; 4QZE A; 7ICU A; 4BXO B; 5AM0 A; 3BQ0 A; 3SYZ A; 2DFL A; 5ALU A; 2LBO A; 1SKS A; 3QZ7 A; 3JPQ A; 4DL2 A; 2LKY A; 1U4B A; 3AMZ A; 3WKC A; 3NGD A; 4DSK A; 2LI6 A; 5J0W A; 5AKY A; 4I28 A; 2ZIU B; 4NWI A; 4TQR A; 4Y2T A; 2RDJ A; 2F2A B; 1CUK A; 4J03 A; 5ALP A; 4JV2 A; 4DFM A; 4O0I A; 2F1J A; 5CHG A; 3EW9 A; 1LKY A; 1KKX A; 4KX5 A; 2ZIV A; 1N48 A; 4P4M A; 3HP6 A; 3PO4 A; 4M9H A; 2E1E A; 4BGD A; 3OJS A; 3OSP A; 2EAN A; 3TAD C; 4C8O A; 5B66 U; 1ZQE A; 4P4P A; 2W04 A; 3PVX A; 5KFU A; 2XC9 A; 1QSY A; 1A0P A; 5KFB A; 2B6G A; 4KN4 A; 5HMM A; 3Q8L A; 4PH5 A; 2P66 A; 4K4I A; 4PHE A; 4EYI B; 2K4E A; 5ALT A; 2VA8 A; 4PZO A; 1QLN A; 3LDA A; 3CRX A; 4GC7 A; 1C7Y A; 5CP2 A; 1YZ7 A; 3RR7 A; 4KLM A; 2KIC A; 4PL1 A; 3GU3 A; 1WYG A; 8ICP A; 2HMX A; 4NXZ A; 3ZD9 A; 4CRX A; 2EH9 A; 3HJE A; 1IG6 A; 2E8O A; 1ZRN A; 3FM9 A; 3N7S C; 4QWB A; 4B9V A; 4C8K A; 5AK5 A; 2H3Z A; 3FYH A; 1MSW D; 3WK4 A; 9ICJ A; 4P0Q A; 3HW8 A; 2KN7 A; 3KKA A; 4ICA A; 3RJJ A; 2WHE A; 1SL0 A; 1UPH A; 5IIN A; 4LZD A; 3QX7 A; 1OW5 A; 5AIB A; 3C1Y A; 1MQ3 A; 1K1S A; 4MEY A; 1WCL A; 4DFD A; 2D8C A; 2LM4 A; 8ICW A; 2XI9 A; 2YML A; 5EOZ A; 4BX9 C; 1URJ A; 4UB5 A; 3MDC A; 4C8M A; 3BZC A; 3QUB A; 7ICR A; 3PST A; 2KIV A; 4O3S A; 3WK6 A; 8ICU A; 4RQ2 A; 2BPG A; 1ZD2 P; 3SI8 A; 2GOL A; 5ALF A; 2W9B B; 2Y0S F; 1UT5 A; 1N62 A; 2FJ6 A; 2JV3 A; 3BZK A; 9ICS A; 4F91 B; 4RQM A; 4PHP A; 5TIS U; 1FIQ A; 2KKV A; 9ICM A; 1BNO A; 1SWV A; 3ZDD A; 1JX4 A; 5BOL A; 3L4P A; 4O3Q A; 5ALM A; 2KZZ A; 2F8L A; 3RF9 A; 2WF6 A; 2BKE A; 5JU5 A; 3A0H U; 4Y2P A; 4TUS A; 1PZN A; 1X9S A; 1PK3 A; 2WF7 A; 3MR2 A; 1YZ6 A; 1U48 A; 4F72 A; 4C4S A; 3BQ2 A; 4UB2 A; 7ICH A; 4YXM A; 1ZQZ A; 2Y9U A; 1NJX A; 3F2C A; 1T4G A; 1NK8 A; 7ICI A; 2VA3 A; 5IIM A; 4F4W A; 4F5N A; 1T94 A; 2HBM A; 1U47 A; 4O3M A; 4QWC A; 5HR7 A; 4ED3 A; 4JV0 A; 3BQ1 A; 3QU4 A; 4F4Z A; 2HCF A; 1ZQB A; 4I2B A; 2ZXH A; 5DB8 A; 5ALD A; 2FLL A; 5KG1 A; 3QU9 A; 3RBE A; 5T14 A; 2EZZ A; 5EWF A; 2NO4 A; 3NTU A; 1PVR A; 4QZD A; 3J81 j; 5CWR A; 4F93 B; 2ZJA A; 4UAR A; 4B9T A; 2AXT U; 2K4I A; 1ZD5 A; 1RXV A; 1OXJ A; 3TI0 A; 5DB7 A; 3KZX A; 1SZH A; 4YN4 A; 1TAM A; 2YX8 A; 4HAI A; 4KMU A; 5ALL A; 1LKY B; 3KFU F; 2M9N A; 2ZIV B; 1S9F A; 9ICT A; 2J6T A; 3B9J A; 2YMM A; 2ODG A; 2XIC A; 1N60 A; 3RH6 A; 2ZXI A; 2RQ5 A; 2R8I A; 2IMW P; 1UCV A; 5DBA A; 5J0T A; 4FZN A; 4KTQ A; 3EWA A; 4R65 A; 3TAR A; 4XUS A; 3C29 A; 1ZQX A; 2JRZ A; 4Z6D A; 2KSO B; 3OGU A; 1EXN A; 1ZJM A; 3PW7 A; 1XSL A; 1BPY A; 5IIL A; 3WU2 U; 2L5Y A; 4BDP A; 1TVA A; 8ICT A; 4MFC A; 5J8Y C; 4B9L A; 3THV A; 2AGP A; 2OEH A; 2RLT A; 2F77 X; 9ICL A; 4EBC A; 3JPP A; 3K1Z A; 1ZQS A; 2JH1 A; 2FPM A; 2F3N A; 4RQ1 A; 3ZI4 A; 1XU4 A; 5KFR A; 5KG5 A; 3QUQ A; 1KSP A; 1ZQA A; 1T7P A; 1VLB A; 3L5K A; 4LVS A; 8ICL A; 4O9M A; 1SV0 A; 1ZQY A; 3WKA A; 1WUD A; 7ICP A; 1Y88 A; 1ARO P; 2DWQ A; 3NVW A; 2H3F A; 4EZ6 A; 5KFS A; 2Y1I A; 1ZQV A; 4YR2 A; 4GXK A; 1KQQ A; 1ZYQ A; 2PFO A; 3PV8 A; 3UMG A; 3QEA Z; 1ZQC A; 4QZF A; 4JV1 A; 1X66 A; 2K8B B; 4M9J A; 3QE9 Y; 4QZG A; 2BCS A; 5AKE A; 4J9N A; 2Y9T A; 1SXD A; 3M8R A; 3KHL A; 4CNQ A; 1IM4 A; 2OHF A; 2JEI A; 3Q8S B; 3D2S A; 3A0B U; 8ICX A; 5F3X B; 3TKA A; 1IIP A; 2XO7 A; 2B0C A; 2YB4 A; 4PHD A; 4C8N A; 2BHN A; 3SAF A; 3H4D A; 1SL2 A; 3Q8Q B; 5KFJ A; 1MN8 A; 1MA7 A; 2KJ9 A; 3CYM A; 4DL7 A; 4UB8 U; 2W54 A; 1ZQP A; 2W9A A; 3WK7 A; 1XSP A; 1ZQK A; 5AIC A; 2VAN A; 3PR4 A; 1RZT A; 1ZQJ A; 1XO1 A; 3RFA A; 4I2A A; 3QU5 A; 4Y2Q A; 3G6X A; 5KFZ A; 1ZQN A; 4DSI A; 1XC9 A; 9ICH A; 5ALI A; 3KKA C; 1SZP A; 3M1Y A; 2W11 A; 4Z6C A; 3RJK A; 9ICB A; 5J0Y A; 2HHS A; 2WB1 C; 2CXY A; 5J2K A; 5DGB A; 4F5Q A; 5KT3 A; 2BGW A; 4C7Z A; 3NS1 A; 2JGA A; 5KFW A; 3PSP A; 2HHU A; 5F9N A; 3F5A A; 3MDA A; 1D8Y A; 8ICB A; 3S6J A; 2GH1 A; 8ICI A; 4RQ3 A; 2KFN A; 4RNM A; 5ALJ A; 3WKD A; 1S8O A; 1KTQ A; 1ECW A; 2QB1 A; 2PXI A; 3ZDB A; 5AKZ A; 2FPK A; 3C2K A; 5KFX A; 5KFP A; 3UXN A; 1TFR A; 2N1R A; 3U26 A; 3RJE A; 4GC6 A; 3OSN A; 1KRP A; 4Z6E A; 3VCB A; 1NK7 A; 4CF4 A; 3GZF A; 2KOB A; 5DB6 A; 2Y1J A; 2BCU A; 1FFU A; 1O08 A; 3MBY A; 4XRH A; 1Q46 A; 2K4P A; 9ICE A; 3E58 A; 9ICV A; 1DGJ A; 1S10 A; 2ISP A; 1XS9 D; 2KEY A; 2K4H A; 1L7P A; 4OJP A; 3H8S A; 2C28 A; 4IQU A; 1K1Q A; 4CGZ A; 5J2E A; 4I2G A; 5D4B A; 3OPX A; 5ALV A; 5AKH A; 3ZDE A; 4OD0 A; 1U45 A; 1S0V A; 5CR0 A; 7ICJ A; 4OJL A; 3NVZ A; 3WK9 A; 4C80 A; 2HHQ A; 5AKK A; 1FFV A; 4Z6F A; 5KG6 A; 2GLE A; 3I1Y A; 1UHU A; 2LPE A; 3IRU A; 1J2M A; 1TV9 A; 4A8E A; 2KE7 A; 3AQE A; 3PMN A; 3V7J A; 2RDI A; 4DSF A; 2A1J A; 3EYZ A; 3PSF A; 1S5L U; 3SR6 A; 3RH5 A; 1U49 A; 1D8B A; 4WJ3 B; 1ZQI A; 1PUZ A; 4IL6 U; 2ZTE A; 1RM6 C; 2HHV A; 3PR5 B; 1RYU A; 4RT3 A; 2BQR A; 3ETL A; 1LVH A; 2OCE A; 2MAX A; 1NJY A; 3SMV A; 5AKG A; 2E5S A; 3UXO A; 2W55 A; 3LWL A; 4DSE A; 4M2Y A; 3DEE A; 3F53 A; 2I5H A; 3UMC A; 4RPX A; 2W03 A; 3QU2 A; 1SWW A; 3NVV A; 3D2Q A; 5J2I A; 4F8R A; 3TAN A; 1ZQU A; 2ZIW A; 1L3T A; 4KLI A; 4DOB A; 5AI6 A; 4KN7 A; 2EQY A; 2JHD A; 3E0F A; 3C1Z A; 1ZQD A; 1FO4 A; 2NRX A; 2HSZ A; 1NJZ A; 4LJX A; 4O5K A; 3PX6 A; 1JRP A; 4ELU A; 1HIW A; 4US8 A; 2LYB A; 2HW3 A; 8ICY A; 2WF8 A; 2QKQ A; 3T5L A; 1SV0 C; 4Y2U A; 1KW4 A; 2UVV A; 4PGY A; 2G09 A; 3MGH A; 4UBC A; 4F92 B; 4EBD A; 1NJW A; 2YQE A; 3Q8K A; 1S76 D; 4EYH B; 3PY8 A; 5J29 A; 4EEL A; 5KFE A; 2YN4 A; 4CDG A; 1X42 A; 2ZUD A; 2DQN B; 5J0O A; 2ASJ A; 1LV5 A; 3GIJ A; 2IHM A; 5C5J A; 3O0F A; 4Q8F A; 1V97 A; 2JEG A; 4JWN A; 4Q8E A; 5DGA A; 2KSO A; 4DFJ A; 5KTQ A; 4DQR A; 3GIL A; 4RUC A; 2C2D A; 3WKB A; 4MHV A; 3G6Y A; 1UA1 A; 2FMQ A; 5EE9 A; 4O3P A; 2F1I A; 5EE3 A; 1B22 A; 3CNH A; 5L1M A; 4J9S A; 2Y0S C; 3GV7 B; 5DBB A; 3BDP A; 2W7P A; 5CRX A; 1ZQW A; 1L3S A; 5BOM A; 2K60 A; 4K4H A; 1NK5 A; 5J0S A; 5KG3 A; 8ICC A; 1N5X A; 4Y2R A; 3N97 B; 3RR8 A; 4KLG A; 2FPL A; 4RQ0 A; 4UAW A; 4JUZ A; 5L1I A; 4ECS A; 2J6U A; 3T3F A; 1FEZ A; 2UVU A; 4YMN A; 1B4F A; 3PW5 A; 4M6W A; 4KIT B; 4J9M A; 5DDM A; 1COO A; 4KLU A; 5J0U A; 1GO3 F; 2DBY A; 5ALY A; 2HOF A; 2F76 X; 3IG8 A; 5AHX A; 5KFV A; 4DFK A; 4YMM A; 3LK9 A; 5J2C A; 4NLG A; 1KBU A; 2JMG A; 4B9U A; 1T8E A; 2NRW A; 3HKZ F; 3PW4 A; 4NM1 A; 5DLG A; 3ONN A; 5B5E U; 3M8S A; 4NLB A; 2E8N A; 4RZR A; 3RAQ A; 8ICV A; 4J9O A; 4GXI A; 2H5X A; 4UB3 A; 5ALH A; 4NV0 A; 2PI4 A; 9ICQ A; 3SZ2 A; 4OJ5 A; 1JMS A; 5KAI U; 2VKQ A; 2A1J B; 1SV4 A; 4UAZ A; 1COK A; 3SEI A; 3IM1 A; 4E0D A; 1T3Q A; 2JEF A; 3NAS A; 4Q43 A; 2W7O A; 3HT3 A; 4KLS A; 1ZRM A; 4OO1 J; 5CB1 A; 3NRW A; 3UQ2 A; 2LYA A; 5AIA A; 3AL0 B; 1L6N A; 4KLH A; 3C2M A; 3K75 D; 4O5E A; 2EAO A; 2V9W A; 1KN5 A; 3SEN A; 4YXJ A; 4B9S A; 3LYS A; 2EZY A; 5DDY A; 4NM2 A; 1QQ7 A; 5ALK A; 8ICF A; 9ICP A; 2MA1 A; 2D6F C; 4GXJ A; 4QZ8 A; 4ECR A; 1X9W A; 4P4O A; 5AI5 A; 9ICA A; 2XY5 A; 4MFF A; 2ZIW B; 5DG8 A; 4ELV A; 5HNK A; 5AI9 A; 2G08 A; 4U6P A; 1KFS A; 7ICO A; 2ZIX A; 3D2N A; 9ICK A; 2ZTD A; 3NVY A; 4TUP A; 3PNC A; 4Q44 A; 3T5K A; 5AM3 A; 3BJY A; 1TAQ A; 3H40 A; 4DS4 A; 1SXE A; 4OJ6 A; 4ACO A; 4US9 A; 4J9R A; 4RT2 A; 3N28 A; 4QWA A; 2NRT A; 1XO0 A; 1TE2 A; 1VDV A; 5TZV A; 9ICI A; 2HBL A; 3C21 A; 1RQL A; 4J9K A; 1UT8 A; 3EPG A; 3GQC A; 3RRG A; 3B0X A; 5J0Q A; 3PW0 A; 4KMO B; 2AQ4 A; 3VC8 A; 2W3R A; 2KIW A; 1ZD4 A; 4KX3 A; 1TK0 A; 2DKX A; 1NK4 A; 2NO5 A; 1KEJ A; 2ES6 A; 1D9D A; 2DKZ A; 9ICN A; 1L7N A; 5IIK A; 3L3F X; 2A3V A; 5KT2 A; 3OTQ A; 4KLL A; 2A1A A; 2XCA A; 5F9L A; 3RBD A; 2KJ8 A; 8ICJ A; 5L1L A; 1UQV A; 4ECX A; 4PHA A; 2M0N A; 2E3T A; 4DQS A; 2F8K A; 4U7C A; 4RNN A; 2XVT A; 4KLQ A; 2ALZ A; 4RQ4 A; 4UQG A; 1SKR A; 4KLT A; 2KJ5 A; 1PK1 B; 2HHW A; 3RAX A; 2QLT A; 5DG7 A; 4C0Z A; 8ICQ A; 1WCN A; 4Q45 A; 3RJI A; 2UVR A; 4KLD A; 3H8J A; 3CP8 A; 1MQ2 A; 4IR9 A; 1BPE A; 3E2E A; 3KHG A; 4F5O A; 4M6W B; 1TK8 A; 4QZI A; 3PX0 A; 4DF4 A; 3KBB A; 4I29 A; 1CRX A; 9ICC A; 4IC9 A; 3AQF A; 2KTQ A; 7ICT A; 3DDH A; 3MFI A; 5DQH A; 9ICF A; 2E8M A; 4BWM A; 5KFI A; 1ZOL A; 1UA0 A; 1DOQ A; 4PJ0 U; 3MAB A; 4O3N A; 4GIB A; 1ZXI A; 5AK3 A; 3TFS A; 3UM9 A; 7ICL A; 8ICA A; 3EZ5 A; 4JMU A; 3LVW A; 2VA2 A; 1WG8 A; 1ZQT A; 4NY8 A; 4ECW A; 2NV3 A; 2BQ3 A; 1L5U A; 1WWU A; 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