The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
72
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structure length |
72
|
Chain Sequence |
b'MDRIFMTRTEALEFLLKAHQTAVDKIGHPSHKQTPADHAAIEALDRLLLDVRARRVDQFQINASAAQIIVTD'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR structure for potential drug target from Burkholderia thailandensis E264
rcsb |
| molecule keywords |
Uncharacterized protein BTH I2711
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| source organism |
Burkholderia thailandensis e264
|
| molecule tags |
Unknown function
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| total genus |
15
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| structure length |
72
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| sequence length |
72
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-07-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2MRL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3OHB A; 1TK5 A; 7ICG A; 4I2J A; 2I1Q A; 5J0R A; 4DS5 A; 2EZZ A; 5AHX A; 5KFM A; 4TQR A; 3H4D A; 3AQE A; 2XC9 A; 1RXV A; 4DQI A; 4I2G A; 1JUD A; 3Q8L A; 2RDI A; 4Q43 A; 2ZIU A; 4BXO A; 1BPD A; 1NK4 A; 3RAX A; 4Z6D A; 2ZIW B; 9ICF A; 1V9P A; 2E1E A; 3HWT A; 2OCE A; 5L9X A; 2AGO A; 4GC7 A; 4RNN A; 5L1I A; 4C4R A; 4DFJ A; 9ICC A; 2KIW A; 5F9L A; 7ICV A; 2B0C A; 4KLE A; 3GIL A; 5BPC A; 3M8S A; 5AK5 A; 4RZR A; 1ZQF A; 1FO4 A; 7ICF A; 5KFI A; 5KFL A; 1Z19 A; 2YMP A; 5AK3 A; 4YD2 A; 4RUA A; 3N97 B; 5E79 U; 1ZQE A; 1Z4O A; 4IC9 A; 3QUB A; 3ISC A; 5DDM A; 4MFF A; 2HBK A; 1DXS A; 3PMN A; 2FE9 A; 2BCR A; 5DKW A; 1NKC A; 1JN3 A; 2NO5 A; 8ICL A; 4Y2R A; 4DOB A; 5CWR A; 3NS1 A; 5DB9 A; 2ZJ5 A; 2K8C B; 5DGB A; 1IG6 A; 4UW9 A; 4Y2Y A; 8ICK A; 3KFU F; 3TAC B; 3JPR A; 4NLK A; 5CEH A; 5AM0 A; 3V72 A; 4EYI B; 4F2R A; 5EWG A; 2NYV A; 3JPQ A; 3G6X A; 1SXD A; 3ZDA A; 4C7Y A; 2ZXI A; 5HML A; 4P0Q B; 1QCK A; 4UB3 A; 1PVQ A; 1L6N A; 2NRV A; 3OGU A; 9ICX A; 3ORY A; 3C5G A; 1U45 A; 3D6J A; 3LDA A; 4F8R A; 3UXO A; 5ALW A; 1S0M A; 2FLN A; 2NRW A; 2C22 A; 8ICT A; 4OD0 A; 3GV8 B; 8ICB A; 2P66 A; 3QXG A; 2KJ8 A; 4OJP A; 1KW4 A; 1ZET A; 2Y0S F; 4EBC A; 2YY6 A; 2D8C A; 2KK0 A; 4ED8 A; 5ALH A; 2ZIV A; 4Y2T A; 1NZB A; 2BPC A; 4CF4 A; 9ICT A; 4JWM A; 3JPS A; 4RQ4 A; 4IQV A; 2B21 A; 3SR6 A; 3WKB A; 5EE1 A; 3C29 A; 4F5Q A; 5G5G A; 2K4H A; 3SV3 A; 8ICP A; 5DDY A; 1N63 A; 2KIV A; 1D8Y A; 5T14 A; 4ED3 A; 5JTI A; 2JXJ A; 2EAO A; 3OTQ A; 1FFV A; 2F8L A; 5KG0 A; 5J0T A; 4OJ5 A; 4U7C A; 2IHM A; 2P6U A; 1S0V A; 1SKW A; 1X6I A; 4ED6 A; 5EE0 A; 2JEF A; 4OJL A; 3V7L A; 1RYS A; 1C7Y A; 3IHQ B; 3PVX A; 4Y2U A; 5KG1 A; 2XCA A; 2C2D A; 4G9B A; 4XQ8 A; 2WAQ C; 5AKH A; 4Y2X A; 5CRX A; 3H0M B; 4QZI A; 4YQW A; 3PX6 A; 3AM9 A; 1ZD2 P; 1TAU A; 3FM9 A; 5CA7 A; 4O9M A; 2PFP A; 4TUP A; 4ECU A; 1ZQW A; 2VKQ A; 4FS1 A; 1S97 A; 1KTQ A; 2BQR A; 2YN4 A; 2E8M A; 3KBB A; 2ODG A; 5J0O A; 4DQR A; 2XO7 A; 3NUQ A; 3QU7 A; 1F5S A; 4ED2 A; 1RQL A; 1L7M A; 2VA2 A; 5AI9 A; 1YZ6 A; 8ICN A; 9ICA A; 9ICG A; 5KT3 A; 3RB4 A; 4FS2 A; 2JEG A; 3K1R B; 1V85 A; 1X9M A; 4LZG A; 4GXI A; 1NJX A; 4ED0 A; 3IRU A; 2H3Z A; 4AP9 A; 2G09 A; 2GO7 A; 3FYH A; 3TFS A; 4C8L A; 5ALU A; 5KNI A; 5AI8 A; 2MUT B; 4ICA A; 5CHG A; 2FLP A; 3V6J A; 3PO5 A; 5IIL A; 1X9X A; 2LMR A; 3V6H A; 5J2K A; 4BXO B; 3UXP A; 5DQH A; 4DF4 A; 3N7R C; 4O3R A; 1SL2 A; 3M9O B; 3EYZ A; 3PNC A; 5DG7 A; 3K4G A; 5AKK A; 7ICR A; 1B43 A; 4F72 A; 1CRX A; 4R65 A; 4CRX A; 4PHD A; 1U47 A; 4I2H A; 2DFL A; 1ZQH A; 3BQ7 A; 4RQ6 A; 8ICO A; 5KTQ A; 3HRD D; 2WB1 F; 2JZB A; 8ICQ A; 4RNO A; 5GTI U; 4DSK A; 3EUB 2; 1NK6 A; 2AH5 A; 5AIB A; 4DL4 A; 2IOH A; 1NJY A; 5KFD A; 1K5O A; 2W7O A; 4ECT A; 3C1Z A; 5B66 U; 4B9U A; 4RPZ A; 1T3N A; 3FDS A; 8ICV A; 4RQ7 A; 2XVT A; 4NLG A; 3MR2 A; 2VIX A; 4J9N A; 3MGV A; 4P4P A; 2W9C B; 5B5E U; 1KQQ A; 5AK4 A; 2HMX A; 5ALY A; 4M9J A; 3ALR A; 1WG8 A; 3TAP A; 3AN1 A; 7ICM A; 2KVC A; 4YMN A; 4RQM A; 5KFV A; 3A0H U; 4RQ0 A; 4F4K A; 4F92 B; 1Q3V A; 3OPX A; 4ELV A; 2HHX A; 3RJI A; 2BPF A; 1Z1V A; 3KZX A; 3GIJ A; 4KLD A; 2OM6 A; 1KFT A; 4GXJ A; 4JV0 A; 3SEN A; 2QAR A; 2DWQ A; 5KL1 B; 4B9M A; 4EX7 A; 4PHE A; 4CDG A; 5ALQ A; 3C23 A; 1O08 A; 4M9G A; 4F3O A; 3KD3 A; 4QWD A; 5TIS U; 2KJ5 A; 4F5O A; 3Q8S B; 3KHL A; 3V7J A; 1ECW A; 4AYB F; 3B9J A; 2YQE A; 2DPI A; 2W7P A; 1PZN A; 4QWB A; 5J0Q A; 2FLL A; 7ICP A; 3GDX A; 2K8A A; 2UVW A; 4CF3 A; 4Y2Q A; 1AQ6 A; 4JK1 A; 5KAF U; 5DG9 A; 4DF8 A; 5F9N A; 3V7K A; 4F91 B; 1X9W A; 5KFB A; 3ZD9 A; 3S6J A; 3NVW A; 2KG5 A; 2IBK A; 4QWC A; 4PGY A; 9ICK A; 4F93 B; 2QB1 A; 4K4H A; 3IP4 B; 3JPT A; 4J9K A; 4B9N A; 4UB1 A; 1N60 A; 1O03 A; 2MRL A; 4QIW F; 5KFQ A; 1PVP A; 9ICI A; 4YR0 A; 3HPO A; 3ONN A; 2QB0 A; 2W03 A; 9ICV A; 2BDU A; 1A0P A; 2WFA A; 4F4X A; 4UQG A; 1PK1 B; 5ALZ A; 4C8O A; 2HBM A; 4O3S A; 5DB7 A; 2HOI A; 2EH9 A; 3ZDD A; 3ZDC A; 1N5X A; 4KLO A; 3AL0 B; 1MN8 A; 1N48 A; 5KAI U; 1RZT A; 3Q8P B; 4DWI A; 3TAD C; 5ALR A; 1ZQJ A; 1Z4N A; 3N4M B; 2ZUD A; 5HHH A; 3GU3 A; 1A76 A; 4Y2S A; 9ICS A; 1SKS A; 2RDJ A; 2EAP A; 2JR5 A; 4I2C A; 3PW2 A; 4EEY A; 3PZP A; 3AU6 A; 3TKA A; 2KEY A; 5ALO A; 3TQ1 A; 5DB6 A; 3I28 A; 5KFJ A; 2CPR A; 5CR0 A; 5DBB A; 1L7O A; 4FFD A; 4IQT A; 2VAN A; 3OHA A; 1ZQU A; 5JU5 A; 2G5I B; 2KIC A; 1T7P A; 2AXT U; 5AKX A; 5KFE A; 4QZB A; 3H0L B; 2XY7 A; 5EWF A; 1ARO P; 2F76 X; 3PY8 A; 2FPK A; 1NJW A; 4RU9 A; 1H38 A; 2F1J A; 1N56 A; 5AM3 A; 4LVS A; 2FDR A; 4Z6C A; 1L7P A; 2KD1 A; 4EEN A; 1EXN A; 1NJZ A; 2V9W A; 3WK5 A; 5IIK A; 4DQP A; 4MEY A; 1L8O A; 3PST A; 1UPH A; 4F5N A; 3B0X A; 3QNM A; 1OUQ A; 3C5F A; 3TFR A; 1X2I A; 4QWE A; 4M6W A; 5J2G A; 5KFG A; 2FMP A; 4I2A A; 1LKY A; 1X66 A; 4Z6E A; 5CP2 A; 5AI0 A; 4F5P A; 4DSE A; 2EDU A; 4Q8E A; 1ZQP A; 3RJG A; 7ICQ A; 5KFS A; 4J9P A; 3RR7 A; 4FZL A; 4P0P A; 3UPQ A; 2JEI A; 3AMZ A; 3RFA A; 4FE3 A; 2YB4 A; 2CRX A; 1XSN A; 8ICI A; 4KX5 A; 2IHN A; 1HEK A; 3PX0 A; 3Q8M A; 5DLG A; 3QZ7 A; 5ALI A; 2EAM A; 3QYP A; 5DQG A; 1Z00 A; 3M9M B; 2KN7 A; 3VC8 A; 4FO6 A; 3C2L A; 8ICE A; 3ETR A; 3RF9 A; 4R63 A; 2W9B A; 1VLB A; 3BQ1 A; 1UHU A; 3BS7 A; 1NK5 A; 1KBU A; 4RQ5 A; 2QLT A; 2R8G A; 3LWL A; 3GFK B; 4PHP A; 1SKR A; 1ZQR A; 5AKL A; 2F44 A; 4J9O A; 5KFZ A; 3SD7 A; 1XSP A; 1RXW A; 2PI5 A; 1ZQA A; 2LYA A; 1TAM A; 3H8M A; 3NAS A; 5KL8 B; 5A0L A; 2A1J A; 8ICF A; 3WKC A; 2A3V A; 2XI9 A; 3H8J A; 2V4Q A; 1COO A; 2BCQ A; 1UA1 A; 2YML A; 3WK8 A; 4C0Z A; 4ECR A; 1RG6 A; 4Q44 A; 4PJ0 U; 2BGW A; 1ZQX A; 2PKE A; 4O5C A; 5FP0 A; 2QAR B; 2BQU A; 4LZD A; 4US8 A; 4M2Y A; 1URJ A; 3M9N B; 1SV0 A; 2W43 A; 1XSL A; 4MFA A; 1ZQG A; 3ZDE A; 5KT5 A; 3PW7 A; 1JAL A; 1KN5 A; 3PW5 A; 3TAR A; 4B9V A; 1JXE A; 4QJF B; 2W11 A; 5HMM A; 1UT5 A; 3HKZ F; 5C0Y A; 2KFN A; 4RQ2 A; 2P6R A; 2QKQ A; 1KFD A; 2VA8 A; 4C4T A; 2ISP A; 1S5L U; 4ZOH C; 4BJQ A; 5AI5 A; 3NVY A; 3WK6 A; 1NK7 A; 1K1S A; 3KKA A; 1NI3 A; 4DSJ A; 1WWV A; 3IDW A; 2WAQ F; 5KG5 A; 2QB0 B; 3HP6 A; 1X42 A; 2LYB A; 3MR6 A; 4EEK A; 5IIJ A; 2HW3 A; 2E3T A; 4F4Y A; 4ACO A; 1IIP A; 1JIH A; 1KLN A; 4UAU A; 3SV4 A; 2LKY A; 3IG8 A; 3C2K A; 4M04 A; 5ALE A; 2KTQ A; 4B9T A; 2LHT A; 3BDP A; 4UAV A; 3KOO A; 1L3U A; 5III A; 4UAW A; 8ICS A; 2DQN B; 1SL0 A; 1DOQ A; 3RAQ A; 4KLJ A; 1ZQC A; 3QUC A; 4QZC A; 5KFT A; 1KL9 A; 3JPN A; 4M0A A; 2GLE A; 5KFH A; 4IR1 A; 2ZIX A; 1J2N A; 1D9D A; 4UB6 U; 4DL2 A; 4F2S A; 3LVW A; 4NLZ A; 2LYH A; 2F8K A; 3G6V A; 2ALZ A; 4BX9 C; 3RJH A; 2WF8 A; 4YR2 A; 5ALM A; 9ICR A; 4I2B A; 4QWA A; 4DOC A; 1N5W A; 2KZZ A; 4DFD A; 4RQ1 A; 3T5L A; 2Y0S C; 2H3Q A; 1N61 A; 4GFJ A; 2BDP A; 1X6J A; 9ICE A; 1HJP A; 4KLQ A; 5J8Y A; 2KZ3 A; 2M9N A; 3E2E A; 5BOM A; 5G5H A; 4CGZ A; 4EEL A; 5AKJ A; 2UVV A; 3F5E A; 5J29 A; 4YXJ A; 5KFA A; 4QZE A; 1NKE A; 4NL9 A; 4DQQ A; 1SXE A; 1TKD A; 2OH2 A; 5ALJ A; 2ASD A; 1XU4 A; 5KFX A; 1A77 A; 3GV5 B; 5KG7 A; 4O3P A; 2YB1 A; 4US9 A; 3MC1 A; 3EPG A; 3RH5 A; 2HVI A; 2FPL A; 4QZ9 A; 3MAB A; 2PMZ F; 5IIN A; 3IV6 A; 4QZF A; 1WYG A; 2XGP A; 4TUR A; 3SAH A; 1ZQL A; 4OJO A; 5HP4 A; 2BR0 A; 1LVH A; 1SB3 C; 4M6W B; 3H4B A; 2HHV A; 1SWV A; 1LKY B; 3O0F A; 1KFS A; 5J0X A; 3KHG A; 4B9S A; 1D9F A; 3PR4 A; 2EZX A; 4R8U A; 4O3N A; 4QZG A; 2EQY A; 2PI4 A; 5ALX A; 3Q8Q B; 4DLG A; 4J9R A; 4P0P B; 1ZYQ A; 3RJJ A; 3SZ2 A; 5KG3 A; 2AQ0 A; 1J2M A; 5EE3 A; 4JWN A; 1ZQT A; 1BNO A; 4MFC A; 3E58 A; 2ZIU B; 2F77 X; 3T79 A; 4KIT B; 2P35 A; 2HHT A; 2DGZ A; 5CB1 A; 4IRD A; 4LJX A; 1OW5 A; 2R8J A; 1SV0 C; 3F53 A; 1SL1 A; 2KMD A; 5J2F A; 3AU2 A; 2W9B B; 2HDO A; 5J0P A; 2ATL A; 2DUY A; 8ICG A; 4J9L A; 5HNK A; 3QU9 A; 3SI8 A; 1BPZ A; 1Q3U A; 4DQS A; 3UMC A; 2RP5 A; 3MR5 A; 3KZI U; 5L1M A; 3WK9 A; 5DB8 A; 4I2I A; 3M7D A; 2K4P A; 5AI6 A; 8ICU A; 4F4W A; 2W9M A; 2W8L A; 5ALN A; 5AM4 A; 3K1Z A; 3D2N A; 2Y9T A; 4DSI A; 4QW8 A; 5TZV A; 1TAQ A; 2HSZ A; 3J81 j; 2A1J B; 2ZXH A; 2YTU A; 1K1Q A; 2OEH A; 1BNP A; 1L3T A; 2HBJ A; 2RQ5 A; 3KKA C; 4QNL A; 2MU2 A; 5L1J A; 5EOZ A; 9ICU A; 1B0X A; 5AK6 A; 3T5H A; 4IR9 A; 2ZTC A; 1MQ3 A; 7ICS A; 4KLG A; 1ED1 A; 4ECQ A; 5AKI A; 5HR7 A; 1NZP A; 9ICQ A; 3NRW A; 3BZC A; 4PHA A; 1JXL A; 2DKZ A; 1PUZ A; 4MF8 A; 2ZUB A; 3N7P D; 1X9S A; 4ED7 A; 1JRP A; 7ICH A; 3SAG A; 4TUS A; 4F50 A; 4USA A; 1XO1 A; 1ZQI A; 4RNM A; 1A6S A; 2KHQ A; 2K4I A; 4B9L A; 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3KTQ A; 5AIA A; 2W9A A; 9ICN A; 3BQ0 A; 1ZD5 A; 4QIW C; 4C8M A; 5D49 A; 1U9L A; 3PSP A; 3C2M A; 5EE9 A; 2YMQ A; 2LPE A; 4DS4 A; 7ICK A; 3QUT A; 3PSI A; 3H8W A; 3FC4 A; 1HIW A; 1SZH A; 2OXO A; 2HOQ A; 4ZH4 A; 3C1Y A; 2GH1 A; 2R8I A; 2K4E A; 3RJE A; 2WF5 A; 5KG4 A; 2DBY A; 4C7Z A; 3KHR A; 3L4P A; 4R8U B; 1J97 A; 3T5J A; 1M6Y A; 1V97 A; 4NLN A; 3RJK A; 4IRK A; 3HX0 A; 5J0W A; 3MGI A; 5GTH U; 2DF4 B; 5HR6 A; 5AM2 A; 1OXJ A; 4NJ8 A; 2Q0Z X; 3FAH A; 3RB6 A; 4DFP A; 2WF9 A; 1KRP A; 4HAI A; 4DFM A; 2MA1 A; 5D4B A; 1ZQK A; 2VJ5 A; 5KFF A; 4KLS A; 3RH6 A; 1N62 A; 9ICM A; 4KMU A; 1FIQ A; 8ICW A; 3AQF A; 2ASL A; 2W55 A; 7ICU A; 2HVH A; 3CYM A; 9ICB A; 3QU5 A; 4EZ6 A; 2G08 A; 4UAR A; 3H7I A; 4YFK A; 2Y9U A; 2K89 A; 2FPM A; 5L1K A; 7ICJ A; 1L7N A; 3GQC A; 2E8N A; 3PW0 A; 1X40 A; 2MUT A; 2AHO B; 4F4Z A; 1BPB A; 2JZB B; 1NKB A; 2W54 A; 4IS7 A; 4HYK A; 1V38 A; 4KLI A; 5KFC A; 3RB0 A; 3I1Y A; 3LVV A; 5DQI A; 5ALG A; 2JH1 A; 1S0O A; 3GIK A; 2M0N A; 2HHQ A; 3ED5 A; 2E8P A; 3F2D A; 3L5K A; 5DBA A; 5ALF A; 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