The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
80
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structure length |
80
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Chain Sequence |
ANQQTSGKVLYEGKEFDYVFSIDVNEGGPSYKLPYNTSDDPWLTAYNFLQKNDLNPMFLDQVAKFIIDNTKGQMLGLGNP
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Phospholipase A-2-activating protein
|
| publication title |
Structural Basis for Ubiquitin Recognition by a Novel Domain from Human Phospholipase A2-activating Protein.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Protein binding
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| total genus |
12
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| structure length |
80
|
| sequence length |
80
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-09-04 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3PST A; 2K8C B; 2K89 A; 2K8A A; 3L3F X; 2K8B B; 3PSP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3AU2 A; 2BPC A; 4KX3 A; 3A0B U; 1S8O A; 4DO9 A; 4J9L A; 3E2E A; 4DOC A; 1EXN A; 3V7K A; 4ELV A; 4F4X A; 2JH7 A; 4XUS A; 3V7J A; 3PO4 A; 2F44 A; 4TUP A; 1F5S A; 4IQV A; 2IOH A; 2NO4 A; 4O3N A; 3ZI4 A; 4MEX A; 3WKE A; 4F92 B; 3NUQ A; 1RPL A; 4XQ8 A; 5CB1 A; 1U9L A; 3SAF A; 8ICC A; 2WAQ F; 3ISD A; 3PW5 A; 1DK2 A; 4RQ8 A; 3SMV A; 1ZD3 A; 1UT8 A; 2YB1 A; 3JPO A; 4ECV A; 3AQE A; 8ICH A; 1ZQQ A; 1MSW D; 5AI4 A; 3BS5 A; 2R8K A; 4DL4 A; 3UMC A; 5J29 A; 1ZD5 A; 5IIN A; 2ZIU A; 9ICS A; 4I2H A; 2XC9 A; 5KG4 A; 3QEB Z; 1B22 A; 2E8O A; 1D8L A; 1TAM A; 2UVR A; 3PST A; 4G9B A; 4ECQ A; 4F72 A; 7ICV A; 4EBE A; 1VDV A; 5HMM A; 4FZN A; 2ZJ8 A; 3C1Z A; 9ICR A; 1KLN A; 1Y88 A; 2BGW A; 1KSP A; 4ED8 A; 4C0Z A; 4GC6 A; 4QIW C; 5EE3 A; 4PZN A; 3UMG A; 5AIB A; 1DXS A; 9ICI A; 1K1S A; 3UPQ A; 2RQ5 A; 4I27 A; 1C7Y A; 3PY8 A; 3MR5 A; 4Z6F A; 9ICO A; 1RXW A; 4PHP A; 2XY5 A; 3CP8 A; 2FLL A; 5IIO A; 2ZXI A; 3IN5 A; 3CW2 C; 2HHW A; 4DFD A; 5CWR A; 1Q3V A; 2R8H A; 2HDO A; 2FPL A; 3V6H A; 4ECU A; 2UVU A; 2JEG A; 1H38 A; 3WKA A; 2HOI A; 4A8E A; 2FMS A; 5CEH A; 2PI4 A; 7ICP A; 1JI7 A; 4RNN A; 3TAC B; 1BVS A; 4NLB A; 1UA0 A; 2KJ5 A; 1CI4 A; 5AIC A; 3T3F A; 1RG6 A; 4DL6 A; 2ISP A; 4EX7 A; 5J2H A; 4IC9 A; 3SEI A; 3RAQ A; 1KL9 A; 1N2X A; 4M6W A; 2D6F C; 5DGA A; 5CJ7 A; 4WJ3 B; 3QNM A; 1MQ2 A; 2H5X A; 1ZQT A; 4PJ0 U; 4EEK A; 3FC4 A; 4RQ7 A; 2K8C B; 4ED1 A; 2W3S A; 3MGH A; 2DPJ A; 3OSP A; 3NAS A; 3NS1 A; 4F5N A; 2FMQ A; 3Q8K A; 2XI9 A; 4O3M A; 2GOL A; 2VJ4 A; 8ICB A; 5JUM A; 2YN4 A; 3OHB A; 2WFA A; 7ICS A; 4UB4 A; 4PH5 A; 1M6Y A; 4ECX A; 4TUS A; 4I2I A; 5G5G A; 2GWS A; 3MFH A; 4RQ1 A; 1N5W A; 4DLE A; 4I2E A; 2KVS A; 4Y2T A; 3N97 B; 4FBT A; 4UB2 A; 5JU5 A; 1DK3 A; 4CE6 A; 1D8B A; 5ALZ A; 1ARO P; 2KJ9 A; 3CRX A; 5BOM A; 4R8U A; 3UQ2 A; 2EQY A; 8ICO A; 1T3Q A; 1YZ6 A; 4RUC A; 5K4L A; 5J0S A; 1RQN A; 2VA3 A; 4UAS A; 4NLC A; 1QLN A; 2ZTD A; 5AI9 A; 3TQ1 A; 2J6S A; 5DB7 A; 1KBU A; 5KFT A; 1QQ7 A; 5ALV A; 2A1J A; 5ALW A; 1SV4 A; 3IP4 B; 4B9M A; 1FIQ A; 7ICM A; 1RQL A; 1X9W A; 1YT3 A; 4JWN A; 3AN1 A; 2A19 A; 3GIJ A; 1NKB A; 3QU2 A; 3T5L A; 5AK3 A; 2G5I B; 1FO4 A; 4J9K A; 4LZD A; 2YML A; 2HBM A; 2V4Q A; 1T8E A; 3BQ0 A; 5DB6 A; 4JK1 A; 5J2K A; 3PX4 A; 1J2N A; 5KG5 A; 1FFV A; 2PFQ A; 5ALH A; 7ICT A; 3MFI A; 5JRT A; 1Q46 A; 5KL1 B; 3HT3 A; 3EW9 A; 4PL1 A; 4QZF A; 3AL0 B; 4O5E A; 3EUB 2; 2DGZ A; 1HJP A; 2WTF A; 2K4H A; 5KG1 A; 3M9N B; 5HHI A; 3BS5 B; 2KNJ A; 2PKE A; 1DGJ A; 4ELT A; 4MF8 A; 4FS1 A; 2BR0 A; 1JN3 A; 1NK0 A; 5ALJ A; 1X6I A; 2I1Q A; 3QU9 A; 2ZIU B; 2J6T A; 2KIW A; 4F93 B; 3HJE A; 5CP2 A; 1TVA A; 1KDH A; 2EDU A; 4NLK A; 1UHU A; 4Z6C A; 5KFD A; 2L5Y A; 5G5H A; 1Z4N A; 4NY8 A; 4MFA A; 3BS7 A; 2KP7 A; 4DQS A; 4LZG A; 3ICX A; 3JPR A; 1N60 A; 2YMP A; 1D9F A; 3CYM A; 5J0T A; 4YP3 A; 4DSE A; 3RB0 A; 9ICN A; 5J0R A; 2W7P A; 8ICW A; 3HPO A; 4US8 A; 4B9T A; 3PV8 A; 1LB2 B; 8ICN A; 3C28 A; 5AKH A; 2IBK A; 1QH9 A; 3F2B A; 1URJ A; 1KFT A; 3JPN A; 4IS7 A; 2Y1J A; 1PVP A; 3BQ2 A; 3SV4 A; 1T94 A; 2XID A; 3RRG A; 2G5H B; 1JIH A; 2DKZ A; 2GLE A; 2KIC A; 3BJY A; 3N7P D; 5CHG A; 2V4R A; 4GLX A; 5DLF A; 4IR1 A; 4NL9 C; 5BPC A; 3IG8 A; 5KL8 B; 4QNL A; 1D9D A; 1PK1 A; 3PX0 A; 2KMD A; 9ICV A; 3KKA A; 8ICR A; 4CDG A; 4I29 A; 3EZ5 A; 4QWA A; 3I28 A; 4QZ9 A; 4DS5 A; 4DOA A; 4K4H A; 4KLT A; 2JHD A; 4KLO A; 2HHV A; 3HIL A; 2ISO A; 4M6W B; 2K89 A; 2R18 A; 5KT6 A; 2DBY A; 3Q8R B; 3SQI A; 4PGY A; 3QZ8 A; 2WAQ C; 5EWE A; 1NKC A; 3C5G A; 3RR8 A; 4NLN A; 2ZJ5 A; 2AU0 A; 1ZYQ A; 7ICH A; 5HP4 A; 1JMS A; 4RPZ A; 4RT3 A; 3RJF A; 3OGU A; 1ZQX A; 2A3V A; 1ZQZ A; 5J8Y A; 1QCK A; 3HX0 A; 2HVI A; 5KFN A; 4BX9 C; 5D4B A; 2AH5 A; 4FBU A; 2E8M A; 2I9G A; 8ICQ A; 1J97 A; 2XY6 A; 1B4F A; 3F5E A; 3QXG A; 2PFN A; 5AI8 A; 5KT4 A; 5L1M A; 3SYZ A; 4UAT A; 4YG2 A; 4YR0 A; 5HR6 A; 4Y2Q A; 3JPQ A; 3WU2 U; 5KFU A; 2BDP A; 4QWC A; 4PHA A; 1SWV A; 2K8A A; 3PML A; 4Q44 A; 2KHV A; 5AIA A; 1JX4 A; 1QSL A; 3SEN A; 4RZR A; 4YQW A; 4DS4 A; 2IA6 A; 3L3F X; 2KZZ A; 5AK4 A; 5KG3 A; 3IV6 A; 3D2N A; 1Z1B A; 1WG8 A; 4R8U B; 3TKA A; 1NK8 A; 3PZP A; 2JZB A; 3ORY A; 4Y2P A; 5ALX A; 4QWD A; 1IV8 A; 3QX7 A; 4Q8E A; 5JTI A; 7ICL A; 5L1L A; 2OCE A; 1U45 A; 3L4P A; 3UMB A; 4FZL A; 2D8C A; 4KLI A; 4EZ9 A; 4P0Q B; 4YR2 A; 4GFJ A; 4F5O A; 2JEF A; 2YX8 A; 2A1J B; 4F50 A; 5KFB A; 1ZQN A; 3H8S A; 5KFJ A; 4OD0 A; 2OEH A; 3MR6 A; 5KT7 A; 1TE2 A; 5AK6 A; 1SV0 C; 8ICP A; 4DSF A; 5KFG A; 2CPR A; 1IIP A; 4F2R A; 1QQ6 A; 4DSK A; 4O0I A; 3FAH A; 4LJX A; 3EWA A; 5KNI A; 3SR6 A; 4YFK A; 4UB5 A; 2MSN A; 3BQ1 A; 3LYS A; 4IRD A; 1KN5 A; 1ZQJ A; 5KG7 A; 4I2J A; 3MBY A; 2G0A A; 5DG9 A; 3OPX A; 2GO7 A; 9ICJ A; 4B9V A; 2W9C A; 3N28 A; 5J2E A; 3H0R B; 5D49 A; 1NOM A; 3PO5 A; 5DDY A; 3WK8 A; 7ICN A; 1O08 A; 2EAM A; 1WWU A; 1TFR A; 4PL2 A; 2BHN A; 4GIB A; 4PPX A; 1ZQG A; 5AKZ A; 4EBC A; 4NM2 A; 4BXO B; 2MAX A; 4CF4 A; 5KFZ A; 1CRX A; 1RDF A; 4C80 A; 4BDP A; 4IQT A; 2NRZ A; 3H4D A; 8ICG A; 2JXJ A; 4J9R A; 1OUQ A; 3PSI A; 4NLZ A; 4Y2X A; 5AM2 A; 4Q8F A; 3MGI A; 5DQH A; 4Q43 A; 3D2S A; 1RZT A; 2YY6 A; 2ASL A; 4YMO A; 3T79 A; 2QAR B; 4HAI A; 4RU9 A; 2ZUD A; 1PUZ A; 3ISB A; 1MN8 A; 3KFU F; 2WHE A; 4DQP A; 4ICA A; 4Y2S A; 1L3S A; 3SV3 A; 3IDW A; 4ECZ A; 5AKX A; 4M9H A; 3THV A; 4ZH4 A; 2R8G A; 2QKQ A; 4KLU A; 9ICG A; 4QZH A; 4B6J A; 1MC8 A; 3WK6 A; 4B9L A; 4O5C A; 1IG6 A; 2HMX A; 3TAD C; 2H3Q A; 2BPG A; 1JRO A; 3E0F A; 5KG2 A; 5TIS U; 3CNH A; 4R64 A; 3BQ7 A; 1BPE A; 2Y1I A; 4C4T A; 4CRX A; 4DCC A; 2AGP A; 3UXO A; 1JRP A; 1L7M A; 3MDA A; 2BCV A; 2BCQ A; 2KSO B; 2W54 A; 5AKE A; 5B66 U; 4IQW A; 4EX6 A; 2JMG A; 5KT2 A; 5A0L A; 2Q4T A; 1BPD A; 4M47 A; 4F5P A; 3T5H A; 2LPE A; 1SB3 C; 3RFA A; 4QWE A; 4IRC A; 3H0L B; 2Y9T A; 4YD2 A; 3RB4 A; 2XY7 A; 2AXT U; 5KT5 A; 3C29 A; 4G3I A; 2H3Z A; 4C7Y A; 2Z7J A; 1SKS A; 4UAR A; 5ALT A; 1KKX A; 3MC1 A; 5KTQ A; 1ZQI A; 2P66 A; 3OJS A; 2XIC A; 3GQC A; 4AYB C; 8ICY A; 5HR7 A; 4R63 A; 5ALY A; 2KEY A; 5AI6 A; 2HBJ A; 4C4R A; 1S0V A; 3GIM A; 3ETL A; 4EBD A; 3NVV A; 2E1E A; 3N7S C; 4O3S A; 2HBK A; 2KKP A; 1ZJM A; 2VIX A; 4FS2 A; 3TAR A; 8ICE A; 1F0M A; 5DQG A; 5J2J A; 3G6V A; 4M2Y A; 3QUT A; 2MUT A; 2DL0 A; 3G6X A; 1ZQL A; 3NVZ A; 1MA7 A; 2NRT A; 4MFF A; 1VLB A; 4PHE A; 2EZZ A; 5KFE A; 3WK9 A; 5IIM A; 2HBL A; 3DDH A; 4J03 A; 2QLT A; 3UQ0 A; 4KMO B; 4YN4 A; 1KFD A; 2ZIW B; 4O3R A; 4UAV A; 3M7D A; 4YMN A; 4ECT A; 1ZD2 P; 5ALK A; 4KLE A; 4FE3 A; 2H3F A; 4MHV A; 5EE0 A; 1FEZ A; 3PW4 A; 4ELU A; 2JGA A; 1UPH A; 2OXO A; 4B9U A; 3RAX A; 3AU6 A; 4OJP A; 4O3O A; 5KFI A; 3T5J A; 2LYB A; 5AKG A; 1VJ5 A; 3PNC A; 3M9M B; 1T3N A; 5KFR A; 3EPG A; 3SAH A; 4OJO A; 5J2F A; 1V85 A; 4O3P A; 2KIV A; 4Y2U A; 3DEE A; 4UB8 U; 2BCS A; 1QTM A; 4CGZ A; 3QZ7 A; 2ES6 A; 4DFK A; 4FFD A; 5AM3 A; 1KFS A; 4KLQ A; 4ECY A; 1PVR A; 1ZRN A; 4KLJ A; 5AI5 A; 2MU2 A; 1RYS A; 2OH2 A; 4DL2 A; 1Q8K A; 2W9C B; 2Q0Z X; 4B9N A; 1QQ5 A; 4DFM A; 2KZM A; 1XSL A; 2BCR A; 1U4B A; 1HEK A; 1ZQU A; 2AQ4 A; 4K4G A; 2ZUC A; 1HUZ A; 1U47 A; 1LKY B; 3RJI A; 3TI0 A; 2KJ8 A; 3ALR A; 1ZQH A; 3V6J A; 2YMQ A; 1N56 A; 3NVY A; 1XO1 A; 4US9 A; 3AMZ A; 3LWM A; 3N4M B; 2EZX A; 5ALD A; 2A1A A; 5IIK A; 4DL5 A; 4M0A A; 8ICZ A; 1TKD A; 5KG0 A; 4QZE A; 1B43 A; 2WB1 F; 5BOL A; 3T5K A; 2ZIX A; 4C8L A; 2XCP A; 4CCH A; 4O5K A; 2ATL A; 2E8P A; 3IG5 A; 1X9M A; 2AQ0 A; 4EYH B; 2W7O A; 2PMZ F; 5KAF U; 3LVW A; 2KKV A; 1SKW A; 4I2A A; 4RQN A; 2RHF A; 4UB1 A; 2KE7 A; 2KFN A; 3U26 A; 4AYB F; 3K75 D; 5DBB A; 2XVT A; 3TFS A; 4YXJ A; 1C20 A; 4P4P A; 3H40 A; 2K8B B; 4NLG A; 1O03 A; 3V72 A; 2HHS A; 1KW4 A; 4R65 A; 3M8S A; 4DLG A; 2KTQ A; 4F5Q A; 5HNK A; 4OJ6 A; 1XO0 A; 4Y2R A; 1T7P A; 3HRD D; 1X66 A; 3G6Y A; 4BWM A; 2W8L A; 2ZTE A; 4F2S A; 3RJH A; 1X6J A; 3OSN A; 2CN1 A; 4DF8 A; 3AEV A; 2DUY A; 1U49 A; 5EE9 A; 1S97 A; 5CA7 A; 1L3T A; 3M6Z A; 4QZD A; 1ZQB A; 1CUK A; 4JMU A; 2F2A B; 7ICJ A; 2F1H A; 3WK4 A; 2HOQ A; 5KFQ A; 3M8R A; 4I2B A; 4KIT B; 2IOF A; 3QEA Z; 4MFC A; 3B0Y A; 2RDJ A; 3BQT A; 4QZI A; 4GC7 A; 5AK5 A; 5J0O A; 2W9B A; 3Q8L A; 3IM1 A; 3GV7 B; 4QZA A; 1NKE A; 9ICX A; 1ZQO A; 3Q8S B; 5KFM A; 4IR9 A; 5AM5 A; 1ZQE A; 3QUQ A; 4YD1 A; 5J2G A; 1ZQ1 C; 4I2C A; 5KFH A; 3GII A; 2LKY A; 3KBB A; 4F4Z A; 2MUT B; 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9ICF A; 5KFY A; 4C8K A; 4QZB A; 3RJG A; 5ALG A; 3LDA A; 3V6K A; 3QE9 Y; 7ICQ A; 1TK8 A; 3RH4 A; 3UM9 A; 2ZIX B; 1Z19 A; 2KN7 A; 2LYA A; 5AM1 A; 1X2I A; 2H3V A; 2ZG6 A; 4DQR A; 5L1K A; 5TZV A; 5J2B A; 2I6X A; 2NRW A; 7ICU A; 4RQ3 A; 5ALE A; 7ICO A; 1XWL A; 1AQ6 A; 9ICA A; 2E8N A; 4NM1 A; 1S0M A; 2NRV A; 1ZRM A; 2GH1 A; 2W9M A; 5J2I A; 2DWQ A; 8ICU A; 4QW9 A; 1ZXI A; 2AJQ A; 3SAG A; 4QJF B; 5KFA A; 5CRX A; 2M0N A; 2B21 A; 9ICK A; 4Z6D A; 5DDM A; 2YQE A; 1V38 A; 5GTH U; 4BGD A; 4P4M A; 1A77 A; 2W04 A; 2KG5 A; 5E79 U; 1BPX A; 9ICL A; 2J6U A; 1A76 A; 1BPY A; 3GFK B; 4F4K A; 5IIL A; 1S0O A; 5D46 A; 3H8M A; 5DGB A; 5KFK A; 1FFU A; 2RP5 A; 4KMU A; 1NK5 A; 2QB1 A; 4P4O A; 5J2C A; 4PGQ A; 2XO7 A; 4OO1 J; 1BPB A; 1SL0 A; 2EAO A; 2CRX A; 3HP6 A; 1NK6 A; 1BGX T; 3OJU A; 9ICQ A; 2HHU A; 3GDX A; 1SV0 A; 4IL6 U; 1NJX A; 3MR2 A; 3GIL A; 2W9B B; 4JUZ A; 2NYV A; 3EYZ A; 2YB4 A; 2M9N A; 1XS9 D; 4J9O A; 2W3R A; 2XCA A; 2AHO B; 1Z00 A; 2BCU A; 3F5A A; 2NRX A; 4NV0 A; 2OWO A; 8ICA A; 4KLG A; 1RM6 C; 3VCB A; 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