The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
78
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structure length |
78
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Chain Sequence |
VKNYETAVQFCWNHYKDQMDPIEKDWCDWAMISRPYSTLRDCLEHFAELFDLGFPNPLAERIIFETHQIHFANCSLVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Membrane protein
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Structure of the Extracellular Domain of Human Ramp2
rcsb |
| molecule keywords |
RECEPTOR ACTIVITY-MODIFYING PROTEIN 2
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| total genus |
28
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| structure length |
78
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| sequence length |
78
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-10-31 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YX8 A; 3N7R C; 3AQE A; 3N7P D; 3N7S C; 2XVT A; 3AQF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3HT3 A; 2BHN A; 8ICQ A; 2NRV A; 4KLD A; 8ICY A; 2FLL A; 3DDH A; 5ALQ A; 3ZDA A; 4HAI A; 3GV5 B; 1JI7 A; 8ICM A; 4CE6 A; 3GV7 B; 5HP4 A; 3QUC A; 1DOQ A; 2YMM A; 1BPD A; 1O03 A; 5DQH A; 4GC7 A; 9ICX A; 1L3T A; 2OEH A; 8ICO A; 1RXV A; 3RJF A; 4YR0 A; 4DQP A; 4F8R A; 2Q4T A; 1RPL A; 4YXM A; 5KG1 A; 2D3D A; 3T5L A; 2HVH A; 2QLT A; 4I2D A; 5KT7 A; 8ICH A; 4DEZ A; 2EAO A; 9ICI A; 1JMS A; 4Q8F A; 2K8B B; 1HIW A; 3SD7 A; 3AUO A; 2DPJ A; 4FS2 A; 5JTI A; 2B21 A; 3M8R A; 5GTH U; 1ZQM A; 7ICH A; 5L1M A; 4I29 A; 4I2F A; 5DKW A; 1K1S A; 4F71 A; 5DBA A; 8ICP A; 2XGQ A; 1X40 A; 2XID A; 2P35 A; 2IOF K; 4U6P A; 2B6G A; 8ICN A; 2ZG6 A; 3K1R B; 2KJ9 A; 7ICG A; 4ECZ A; 1UQV A; 1HUO A; 5KFR A; 4QZB A; 3ZDB A; 4DWI A; 3PW5 A; 3RJG A; 3F5A A; 3OJU A; 3H8M A; 3RJI A; 1ZD5 A; 4YMM A; 2W8K A; 3C5F A; 4IQV A; 2KJ5 A; 3NS1 A; 2WB1 C; 2HBK A; 4KX5 A; 2JEI A; 4O3N A; 4KN4 A; 3FM9 A; 3MR3 A; 1MQ3 A; 2JV3 A; 4IRD A; 3I76 A; 4GFJ A; 3TKA A; 4UAS A; 4FBT A; 2DKX A; 3KKA C; 3MAB A; 3QU9 A; 2G5H B; 4ED1 A; 1N56 A; 2R18 A; 2BQR A; 3AU2 A; 2K4E A; 4IR1 A; 5IIL A; 2C2E A; 3F2C A; 4RQ1 A; 4I2A A; 4YP3 A; 5CHG A; 2VA8 A; 1Z00 B; 5KG5 A; 4J9P A; 3LK9 A; 4DLG A; 9ICU A; 5KFQ A; 4Z6E A; 4XRH A; 5J2B A; 2UVW A; 4Y2X A; 3PZP A; 1DK2 A; 4P2H A; 3D6J A; 4U7C A; 4TUR A; 2KE7 A; 2DF4 B; 4UB8 U; 4ED3 A; 5F3X B; 2PXI A; 1VJ5 A; 5AI4 A; 3SV3 A; 1URJ A; 1U48 A; 1FO4 A; 3ZI4 A; 4F50 A; 1SKR A; 3U26 A; 4DL3 A; 1ZQG A; 5IIO A; 4F4Y A; 3M6Z A; 3QU7 A; 2BPG A; 4P0P B; 4PJ0 U; 1QQ7 A; 1XNS A; 3NVZ A; 2ZTC A; 1XO1 A; 2KZ3 A; 3KKA A; 4US9 A; 1NJX A; 3N7P D; 4Q43 A; 1U45 A; 2F44 A; 4B9M A; 3IG5 A; 2BPF A; 1RYU A; 2JZB A; 1X9X A; 3NUQ A; 2YQE A; 3LWL A; 5L1I A; 3RBD A; 5DB6 A; 3Q8M A; 5DDY A; 4R64 A; 5J0Q A; 4B9L A; 2ASD A; 1SXE A; 3H4B A; 1KDH A; 1LV5 A; 3CYM A; 2ZUD A; 4FZM A; 9ICB A; 1FEZ A; 4PZO A; 4QIW F; 4RU9 A; 1L7N A; 2VAN A; 5EWE A; 3LYS A; 2XIC A; 1TKD A; 4UB5 A; 4ECS A; 3ETL A; 1SKS A; 4OO1 J; 5ALJ A; 5ALH A; 1XSN A; 4I2B A; 3GV8 B; 2RQ5 A; 3T3F A; 4P4P A; 5J2K A; 2Y1I A; 1KW4 A; 1S77 D; 3H40 A; 5HR6 A; 3ZDD A; 4BWM A; 4RQ4 A; 3PW4 A; 4TUP A; 2EDU A; 1NJY A; 5DLG A; 4IQW A; 5KFZ A; 2HBL A; 4MEY A; 5AM3 A; 3MR6 A; 2LM4 A; 2PFN A; 2H3I A; 4ELT A; 4G9B A; 1QSS A; 2W9B B; 2AQ4 A; 1J2N A; 2CPR A; 1QCK A; 3WK5 A; 2FMS A; 1AQ6 A; 1QQ6 A; 3BQ0 A; 1TAU A; 3KTQ A; 2G07 A; 4R63 A; 1Z00 A; 5AKY A; 2W7O A; 5KFS A; 1DK3 A; 3UM9 A; 5AK4 A; 4C4S A; 1ZQT A; 1X9W A; 2YB1 A; 1ZOL A; 3GDX A; 1ZRN A; 2R8I A; 2BCQ A; 5JU5 A; 5AKE A; 4ICA A; 1BPX A; 1Y88 A; 2Y9U A; 3OGU A; 3HX0 A; 3F2D A; 2OXO A; 4DQR A; 1ZD2 P; 4J9K A; 5KFJ A; 4NLZ A; 2W04 A; 3HIL A; 3G6Y A; 2W7P A; 4ED8 A; 2MRL A; 4DS5 A; 3DV9 A; 2KKV A; 5G5H A; 4RQ8 A; 4M6W A; 4TUS A; 3ZDC A; 1S0O A; 4KLS A; 2V9W A; 3BQ1 A; 1NOM A; 4NLC A; 1OW5 A; 2DGZ A; 4O5C A; 2C2D A; 9ICQ A; 5J2I A; 5KFM A; 3D2Q A; 2LI6 A; 2ISO A; 4RQN A; 4DS4 A; 2G06 A; 2H3Z A; 4PHA A; 2ISP A; 2Z7J A; 3RR8 A; 2W03 A; 4UAW A; 1NK0 A; 7ICR A; 4UQG A; 2XI9 A; 1B4F A; 2HDO A; 1IV8 A; 4GIB A; 4NL9 C; 3BS5 B; 2VJ4 A; 3A0B U; 4BGD A; 4JWN A; 3M9M B; 5DB7 A; 5IIJ A; 5HMM A; 5E79 U; 3T5K A; 2FPK A; 2OH2 A; 5AM4 A; 4F72 A; 4PH5 A; 4M9H A; 4EZ6 A; 5HML A; 5L1J A; 1L7P A; 1SL1 A; 2NRT A; 3SR6 A; 1D8Y A; 1SWW A; 1T3N A; 2NRZ A; 3HW8 A; 3JPS A; 2F1J A; 3SEI A; 4MFC A; 5ALD A; 4UAR A; 2YTU A; 8ICJ A; 3EWA A; 2ATL A; 3BQ2 A; 1CRX A; 1Q3U A; 1D9D A; 4PPX A; 3PW7 A; 2GOL A; 5B5E U; 2HMX A; 1J2M A; 1LVH A; 2I1Q A; 2MA1 A; 4RPZ A; 4ZOH C; 2N1R A; 4QIW C; 1PK1 B; 2OM6 A; 4QZA A; 1B22 A; 3QNM A; 4EX7 A; 4R66 A; 2E8P A; 1SGG A; 2XVT A; 1ZQ1 C; 1BPY A; 3RRH A; 3K4G A; 1WG8 A; 4DCC A; 4DSF A; 4WJ3 B; 4NL9 A; 4DF8 A; 1XS9 D; 4DF4 A; 3FDS A; 4KLL A; 1MQ2 A; 1ZQJ A; 3PR5 B; 1HJP A; 3NVV A; 2EAM A; 9ICC A; 1SWV A; 4KLI A; 1ZQF A; 4Y2S A; 5AKX A; 4B9N A; 2H3F A; 4QZD A; 5ALV A; 4DFK A; 3RB6 A; 4M9N A; 2RHF A; 2DFL A; 2BCS A; 3THV A; 4GXI A; 5KG3 A; 1L3U A; 4KLH A; 3V7L A; 2HOQ A; 2H3V A; 5AIB A; 5D46 A; 5KFH A; 4KLQ A; 1T8E A; 2HHQ A; 1ZQB A; 3SEN A; 9ICK A; 1D8L A; 3ISC A; 2RRD A; 4DFJ A; 3RJH A; 4EYI B; 1JXL A; 2KFN A; 3NAS A; 5AIA A; 2LHT A; 1ZQC A; 1WYG A; 1S5L U; 1ZYQ A; 1ZQP A; 2KIW A; 3GIM A; 4CDG A; 5KFT A; 1BNP A; 2KZM A; 4J9N A; 1UA1 A; 4AYB F; 4RQ3 A; 4ECV A; 3N28 A; 3GQC A; 5DG7 A; 3UXO A; 2QKQ A; 2KVS A; 3RAX A; 4F92 B; 4TQR A; 2I5H A; 5F9N A; 4QWA A; 2P6U A; 3B0X A; 4YFK A; 3SYZ A; 1BPE A; 1PVR A; 2W11 A; 5CA7 A; 4DQQ A; 1T94 A; 3LDA A; 2XO7 A; 4Z6C A; 3BDP A; 1L6N A; 2W43 A; 5KAI U; 3C2K A; 3SZ2 A; 3RB4 A; 3NVY A; 4DSL A; 1MSW D; 4RUC A; 5ALK A; 4F2R A; 1N5W A; 1XSP A; 2MAX A; 1NK7 A; 2XY6 A; 3OJS A; 4NM1 A; 1QLN A; 8ICT A; 1KBU A; 1NKE A; 1PK1 A; 1RQL A; 1P7D A; 4OD0 A; 2MU2 A; 3F2B A; 2M9N A; 3GZF A; 1MA7 A; 3PML A; 9ICW A; 5H2F U; 2G08 A; 5CR0 A; 2BGW A; 3HRD D; 3V6H A; 2J6T A; 3WK4 A; 4QWB A; 4KN7 A; 4FZL A; 3UMB A; 3RH4 A; 2JEG A; 2ZTE A; 2F2A B; 2E3T A; 7ICT A; 2P6R A; 1S76 D; 2W9A A; 1SZP A; 1N61 A; 3BZC A; 5AK6 A; 4E0D A; 3S6J A; 4DSE A; 3E58 A; 4CF4 A; 2A1A A; 2C22 A; 5KG4 A; 3LWM A; 2E8M A; 1LKY B; 2AJQ A; 2K4H A; 3SAF A; 4F91 B; 4EEY A; 3QUT A; 3OSP A; 4O0I A; 4DFP A; 3TAD A; 2QAR B; 4ZH4 A; 4JB3 A; 4RQ6 A; 1BPB A; 1ECW A; 2C28 A; 1N2X A; 2WFA A; 4CGZ A; 1NK8 A; 1X9S A; 8ICK A; 3AU6 A; 5J0X A; 4BXO B; 4RQ2 A; 4DL4 A; 9ICF A; 4KLG A; 5AK3 A; 9ICS A; 3RR7 A; 3JPQ A; 2ZUB A; 3AN1 A; 1UCV A; 3LVV A; 4KMO B; 2K60 A; 4NM2 A; 2BDP A; 1DRG A; 4MEX A; 4ED2 A; 3RJK A; 4R8U B; 3ZD9 A; 3M6K A; 3JPO A; 4BUG A; 5CRX A; 1KQQ A; 5J2A A; 1JRP A; 2LKY A; 2HHS A; 1KLN A; 1ZQW A; 2AHO B; 4YXJ A; 5KT2 A; 3TAR A; 2VA3 A; 1U4B A; 5KFA A; 1WWV A; 3WKC A; 4LVS A; 5JRT A; 2WTF A; 7ICS A; 1N48 A; 2W9M A; 4AYB C; 5HHI A; 4EBD A; 2AH5 A; 4RQ7 A; 3IHQ B; 3TFS A; 4AP9 A; 3WKB A; 1WWU A; 2W55 A; 2VIX A; 4OCZ A; 1S0N A; 2YB4 A; 2R8G A; 2LBO A; 5ALL A; 4YQW A; 4EYH B; 3NVW A; 7ICN A; 2XY5 A; 2WAQ F; 5III A; 4I2H A; 2GLE A; 4QWD A; 8ICF A; 4BJQ A; 3PW2 A; 1HUZ A; 4P0Q B; 4IRC A; 1Z4O A; 5DBC A; 3RTV A; 2FMQ A; 4UBB A; 2FMP A; 2K8C B; 1RG6 A; 3V7K A; 4F4W A; 2F1I A; 4UBC A; 2YMP A; 2BCV A; 4F2S A; 1LKY A; 2IA6 A; 4M2Y A; 3HP6 A; 3QZ8 A; 5KT5 A; 1NJW A; 1S97 A; 4I2I A; 4GXK A; 1X42 A; 4B9U A; 4YN4 A; 2F76 X; 4J03 A; 5KFE A; 2QB0 B; 3MGI A; 2AXT U; 4RNO A; 2A19 A; 3LVW A; 4P4M A; 3B9J A; 5K4L A; 5ALE A; 4UB6 U; 3UMG A; 3V6J A; 1ZQA A; 4CCH A; 3QUB A; 5EWF A; 2DPI A; 1X2I A; 4Y2T A; 2IBK A; 5ALZ A; 4R65 A; 1CEZ A; 5ALR A; 7ICK A; 3ZDE A; 1X6J A; 5J29 A; 1ZQS A; 4USA A; 2VKQ A; 1Q3V A; 4DLE A; 4R8U A; 9ICL A; 4FBU A; 4F3O A; 2JH1 A; 3H8J A; 9ICJ A; 5DGB A; 3RFA A; 1L7O A; 2KSO B; 3JPN A; 2WHE A; 4QWE A; 2V4R A; 1ZQV A; 1XWL A; 8ICZ A; 5J0U A; 4DSJ A; 5KL8 B; 3TFR A; 1JXE A; 1ZQZ A; 4UW9 A; 1FFU A; 5J2C A; 3BS7 A; 4O3S A; 5EE1 A; 3QU2 A; 1KSP A; 2KG5 A; 5KFP A; 3MR2 A; 1S9F A; 3MC1 A; 3EYZ A; 5CB1 A; 4RT2 A; 1K1Q A; 4I2C A; 4C4R A; 4OJP A; 5ALI A; 5C0Y A; 5AI6 A; 5IIM A; 5IIN A; 4KLF A; 4YD1 A; 2PFQ A; 1ZQY A; 2GH1 A; 3RF9 A; 4EBC A; 2G09 A; 1UT8 A; 1IG6 A; 4P0Q A; 4GC6 A; 2FDR A; 2IHN A; 2J6S A; 3C21 A; 1D9F A; 4BDP A; 5DG9 A; 2HHU A; 3FC4 A; 3WKE A; 4RNM A; 1LB2 B; 2JMG A; 1M6Y A; 3RRG A; 3TAP A; 2FLN A; 1SV0 C; 4US8 A; 2GO7 A; 1NI3 A; 5EOZ A; 4C80 A; 1KKX A; 2ZXI A; 5AHX A; 1TVA A; 1RM6 C; 5J2E A; 4XUS A; 4C8L A; 3CW2 C; 3IP4 B; 1WCN A; 2LM1 A; 3E2E A; 5EE0 A; 1JUD A; 1WCL A; 4MHV A; 4DOC A; 1UT5 A; 5KG7 A; 4K4G A; 3TQ1 A; 3NRZ A; 1Z4N A; 2K4P A; 3RAQ A; 2FE9 A; 3I28 A; 2ZIW B; 2WAQ C; 3OTQ A; 5J0R A; 2JRZ A; 3PMN A; 4P0P A; 4KX3 A; 4A8E A; 4F93 B; 1A0P A; 3D2S A; 2PMZ F; 2NRX A; 5DQG A; 3GIL A; 5KFW A; 2W54 A; 4J9M A; 2PI5 A; 2L5Y A; 4KLT A; 4ECR A; 5CJ7 A; 1T4G A; 4QZE A; 4UB1 A; 2F3N A; 4X5V A; 4IS7 A; 1S8O A; 5HNK A; 4J9S A; 3BQT A; 2BKE A; 2ZXH A; 4ECX A; 3C28 A; 2JH7 A; 1SV0 A; 1O08 A; 3AQF A; 4EEK A; 3RBE A; 9ICO A; 4UAU A; 3AMZ A; 7ICV A; 3RJE A; 4UB4 A; 1L3V A; 2CN1 A; 3PSI A; 4F4X A; 5KL1 B; 5CP2 A; 2NO5 A; 4QZ9 A; 2EAN A; 1ZQH A; 4Y2R A; 2KV2 A; 4F5Q A; 5AI9 A; 4BWJ A; 3GII A; 2HOF A; 1Z19 A; 1BNO A; 5J0O A; 2XGP A; 4PHP A; 2ZJ8 A; 4RNN A; 7ICF A; 2R8H A; 2LMR A; 1JX4 A; 1H38 A; 9ICA A; 3UMC A; 2DUY A; 2W9B A; 3IRU A; 3QEB Z; 1ZQQ A; 3SMV A; 2D6F C; 3PSP A; 1NNL A; 2W3S A; 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1J97 A; 4IC9 A; 2KKP A; 2WF6 A; 5DG8 A; 3BQ7 A; 2K4I A; 1UHU A; 4YVZ A; 2E1F A; 3SV4 A; 3JPT A; 4Z6F A; 2XY7 A; 8ICC A; 2FPM A; 3Q8R B; 3MGH A; 2R8J A; 3K75 D; 4M47 A; 1IXR A; 1COO A; 1ZD4 A; 4Y2J A; 4DL5 A; 4KMU A; 1ZQU A; 2KN7 A; 1F0M A; 4QW8 A; 5IIK A; 5L9X A; 1RYR A; 4I27 A; 4FZN A; 3GU3 A; 3I1Y A; 1DXS A; 1U47 A; 3TAC B; 4UB3 A; 2KP7 A; 4PL2 A; 3PW0 A; 3IDW A; 1Z3E B; 5ALS A; 3PR4 A; 4FS1 A; 3WK8 A; 3WK9 A; 3RJJ A; 2EQY A; 3KZI U; 4PGQ A; 5J8Y C; 4ECQ A; 3AQE A; 1L8L A; 1SZH A; 3V7J A; 1QSY A; 2KEY A; 5J2F A; 3N7R C; 1ZQE A; 4KLU A; 5ALM A; 2ZIV B; 2W9C A; 5KFU A; 3UXP A; 4QZ8 A; 3RH6 A; 5J2J A; 5AKZ A; 8ICA A; 4M0A A; 3D2N A; 4Q44 A; 2PI4 A; 5CWR A; 5DB9 A; 1QQ5 A; 5TIS U; 1RYS A; 3CRX A; 4IRK A; 4G3I A; 5J0W A; 2LPE A; 3M9N B; 3EZ5 A; 2MUT A; 2IOF A; 4QNL A; 3MDA A; 4EBE A; 4J9Q A; 2WF9 A; 3ONN A; 2ZIX A; 5KTQ A; 4DFD A; 4KIT B; 4FE3 A; 1COK A; 2GWS A; 2F77 X; 3H0M B; 4I28 A; 2OCE A; 3V72 A; 2KIV A; 2HOI A; 3NGD A; 5KFN A; 3N4M B; 2KHQ A; 2Y0S F; 1ZD3 A; 2DQN B; 5ALT A; 1KFT A; 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