The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
78
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structure length |
78
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Chain Sequence |
VKNYETAVQFCWNHYKDQMDPIEKDWCDWAMISRPYSTLRDCLEHFAELFDLGFPNPLAERIIFETHQIHFANCSLVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
RECEPTOR ACTIVITY-MODIFYING PROTEIN 2
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| publication title |
Structure of the Extracellular Domain of Human Ramp2
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Membrane protein
|
| total genus |
28
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| structure length |
78
|
| sequence length |
78
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-10-31 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YX8 A; 3N7R C; 3N7S C; 3AQF A; 3AQE A; 2XVT A; 3N7P D; #chains in the Genus database with same CATH topology 1COO A; 2QKQ A; 4OJ5 A; 4DL7 A; 5AIA A; 5JUM A; 2EDU A; 1IG6 A; 1C20 A; 4KMO B; 3ICX A; 5CRX A; 4Q8E A; 4DSF A; 2W55 A; 2VA2 A; 4NLG A; 2F1I A; 3RJF A; 4UAS A; 3QZ8 A; 2I6X A; 1FO4 A; 4NWI A; 3OHB A; 3QNM A; 1A0P A; 4B9S A; 1SV0 C; 1MN8 A; 4ECS A; 2WF5 A; 3QU9 A; 5KFA A; 1QSY A; 1EXN A; 5IIJ A; 3TAD A; 3RR8 A; 3AU2 A; 2G5H B; 1ZET A; 2I9G A; 1X9M A; 3I76 A; 1B22 A; 8ICG A; 8ICA A; 5D4B A; 4I2J A; 4PJ0 U; 3ZDB A; 4QW8 A; 4IQT A; 5GTH U; 2W9M A; 4YXJ A; 3GV7 B; 3QX7 A; 3PSI A; 2WB1 F; 3PMN A; 3NVZ A; 1ZD4 A; 5DQH A; 3KZX A; 5KFR A; 1N63 A; 1BNO A; 1OW5 A; 3NVV A; 2JMG A; 4RNM A; 4UAZ A; 1KKX A; 4B9V A; 4DSE A; 5EE1 A; 5AKG A; 2KV2 A; 1L7M A; 1PK1 B; 2H5X A; 5KFD A; 4AYB F; 4ED6 A; 2KKV A; 4IRD A; 2W3R A; 3UMC A; 5DGA A; 5KT2 A; 2YMM A; 4DFP A; 9ICI A; 9ICG A; 4YN4 A; 1JX4 A; 4Q45 A; 4K4H A; 3H8W A; 3WK4 A; 2C2E A; 4PGY A; 1QSS A; 1ZQA A; 1IV8 A; 2UVW A; 1IXR A; 2F1H A; 4FO6 A; 1Z19 A; 4PH5 A; 1UT8 A; 1SKS A; 2BPC A; 2KHV A; 4KLL A; 3ED5 A; 5KFT A; 1SWW A; 3H4D A; 3ZDC A; 4KN4 A; 2HW3 A; 1WWU A; 1RM6 C; 2HSZ A; 3WKA A; 4KLU A; 4ECW A; 2DPI A; 5ALQ A; 2WF9 A; 4F2S A; 2E3T A; 2MRL A; 2YMQ A; 4C0Z A; 5KFW A; 1MSW D; 3T5K A; 9ICL A; 2HHS A; 2EQY A; 2W03 A; 3FYH A; 2L5Y A; 4UAR A; 2ASD A; 4OJL A; 4MF8 A; 1U4B A; 1L3V A; 5AK3 A; 2HHU A; 4ED8 A; 5ALH A; 3S6J A; 3Q8L A; 3H8M A; 3QZ7 A; 9ICM A; 1U45 A; 4Y2J A; 3IG8 A; 5KFM A; 1PUZ A; 1Z1B A; 5ALI A; 3RJK A; 3TAQ A; 4J9P A; 3OJS A; 4I2E A; 3MDC A; 2XGP A; 7ICT A; 4G9B A; 2A1J A; 4LVS A; 4YR0 A; 3IP4 B; 5DKW A; 3MR5 A; 4RQN A; 4TUP A; 4B6J A; 2FDR A; 1T94 A; 5KFG A; 5HP4 A; 2W9C B; 3GQC A; 2K4E A; 4F4W A; 2QLT A; 1KRP A; 2AJQ A; 2LHT A; 1HEK A; 2E5S A; 2GO7 A; 4NJ8 A; 3UXP A; 4ELV A; 3V72 A; 2YTU A; 4Y2S A; 5HR7 A; 4RUA A; 2BZF A; 2CRX A; 4O9M A; 2IOH A; 5DDM A; 2HHX A; 4QJF B; 4C7Z A; 1SL2 A; 9ICN A; 9ICH A; 3MDA A; 5IIN A; 3PO5 A; 2BDU A; 3E58 A; 3LVW A; 2MSN A; 4RPX A; 5KG6 A; 2C2D A; 1MA7 A; 2NRZ A; 9ICA A; 4GFJ A; 5CJ7 A; 2LM1 A; 2CPR A; 5AM1 A; 4EX7 A; 4NM2 A; 1NK4 A; 5ALW A; 2DWQ A; 3LWL A; 4PL2 A; 5ALX A; 1QQ5 A; 4DL4 A; 2XCA A; 2G08 A; 4EEL A; 3HJE A; 4I2G A; 7ICK A; 2DFL A; 3OJU A; 2FLP A; 4XQ8 A; 1A77 A; 4P2H A; 5AKL A; 8ICT A; 9ICC A; 1LB2 B; 5KFJ A; 2G0A A; 4I2F A; 4DF8 A; 1ZQM A; 4F91 B; 9ICS A; 5ALR A; 4PHD A; 2JEF A; 2IHN A; 9ICR A; 4C8K A; 2M0N A; 1XSP A; 3L3F X; 4UB2 A; 1ZQU A; 4ECZ A; 5DBA A; 1N62 A; 1WYG A; 4RQ0 A; 4J9O A; 3T5L A; 1S8O A; 3SV3 A; 3SAG A; 4B9M A; 1ED1 A; 2BCQ A; 4ICA A; 4Z6E A; 4O3N A; 4P0Q B; 4RPZ A; 5KFS A; 3TI0 A; 1DOQ A; 2WF8 A; 3GV5 B; 5F3X B; 4CNQ A; 1O08 A; 1ZXI A; 4DQI A; 4GC7 A; 4DS5 A; 3KD3 A; 1NK8 A; 1D9D A; 1K1S A; 4UBB A; 1JRP A; 9ICX A; 2LYB A; 1WUD A; 3CYM A; 1TAQ A; 2CN1 A; 1QQ6 A; 5J0U A; 2R8K A; 5J0S A; 4EEK A; 2K4H A; 5ALF A; 4BGD A; 4O3Q A; 5AKJ A; 5KFI A; 2G07 A; 3GFK B; 1ZQD A; 1PK1 A; 5DB6 A; 4F5P A; 3H8J A; 1B43 A; 1ZQZ A; 2IBK A; 4Z6C A; 5DQI A; 1X42 A; 4YFK A; 4I29 A; 2PFO A; 2K4I A; 5AM0 A; 5KT7 A; 2EZZ A; 1TAU A; 3Q8K A; 2E1F A; 2P6U A; 3Q8Q B; 4PL1 A; 1RDF A; 1KL9 A; 3M9M B; 2PKE A; 5EWE A; 3OGU A; 5KAF U; 2LYH A; 3AQF A; 5ALS A; 2HI0 A; 4HAI A; 3PR4 A; 1T8E A; 3UM9 A; 2ZUB A; 4KX5 A; 4NV0 A; 1SKR A; 5DBB A; 4EX6 A; 1UCV A; 2LPE A; 4YG2 A; 4O3O A; 2KP7 A; 4IQU A; 3T5H A; 3WKD A; 3J81 j; 2ASL A; 4FBT A; 1N61 A; 4DEZ A; 1KLN A; 4DLE A; 1S97 A; 3QXG A; 3PX6 A; 2N1R A; 2EAP A; 2HHT A; 5G5G A; 4KTQ A; 5KG4 A; 1X9X A; 5J2H A; 1UQV A; 1ZD3 A; 2DBY A; 1A6S A; 2PI5 A; 3AN1 A; 2YB4 A; 4J03 A; 4M9N A; 4NXZ A; 1V38 A; 3N28 A; 5ALT A; 4DFM A; 2ISO A; 2KIW A; 4I2C A; 3VC8 A; 5J0P A; 5DBC A; 1J97 A; 3IN5 A; 2QB0 B; 4RT3 A; 4DFD A; 3PVX A; 1F0M A; 2DGZ A; 4P4P A; 3N97 B; 1ZJN A; 2RP5 A; 4YR3 A; 9ICK A; 3K1R B; 3NTU A; 2W9C A; 1FFU A; 4UW9 A; 4BX9 C; 4QZI A; 5KFL A; 2WAQ C; 2O6K A; 5D49 A; 5ALG A; 4M0A A; 3EWA A; 4F92 B; 2BHN A; 8ICM A; 3KHL A; 4KLG A; 2F8K A; 3PNC A; 4ECT A; 5BPC A; 1BPE A; 1VJ5 A; 1JXE A; 1Z4O A; 1KQQ A; 1S5L U; 4R64 A; 3C28 A; 4LZD A; 4BDP A; 4DQS A; 7ICJ A; 3N7P D; 2OH2 A; 1HUO A; 4JWN A; 4K4G A; 5ALD A; 5KTQ A; 1A76 A; 2XID A; 1T4G A; 2BCV A; 3QYP A; 3Q8P B; 1N2X A; 2HDO A; 4EBD A; 2RDI A; 4YP3 A; 3MGI A; 2OXO A; 4ED3 A; 1S0V A; 3FC4 A; 4KLO A; 4R66 A; 5KL1 B; 2ZIX B; 5KT4 A; 4NLK A; 5CEH A; 1RZT A; 3LDA A; 1TK0 A; 4F3O A; 4YMO A; 1BPZ A; 2ES6 A; 1RXV A; 3JPO A; 1Y88 A; 5CA7 A; 5KG1 A; 2G5I B; 1BPY A; 3MR2 A; 4XA5 A; 5J0Q A; 2Q0Z X; 2YN4 A; 3H0R B; 3LK9 A; 2R18 A; 5ALZ A; 9ICO A; 2E8N A; 3V6H A; 1X9S A; 5CHG A; 3B0X A; 4OCZ A; 3QEB Z; 2C2R A; 3RF9 A; 3SMV A; 2JEG A; 8ICU A; 5JRT A; 3AL0 B; 4Y2X A; 4P0Q A; 2Q4T A; 3IDW A; 7ICI A; 1FEZ A; 1WCL A; 2Z7J A; 2C28 A; 2PMZ C; 2VAN A; 4DFK A; 4C8L A; 2KD1 A; 4R65 A; 1JAL A; 3JPQ A; 4LJX A; 2LKY A; 3PW5 A; 2KG5 A; 4USA A; 3OSN A; 4KLM A; 1WWV A; 5J0O A; 5J0T A; 5EWF A; 2GLE A; 4Y2T A; 5J2K A; 2FE9 A; 2J6U A; 4EBE A; 3RB3 A; 1NJW A; 1RYS A; 3HKZ C; 3D2Q A; 1ECW A; 2AXT U; 1FFV A; 1D8L A; 4IL6 U; 2KIV A; 2K60 A; 3MAB A; 4KMU A; 2H3V A; 3NVW A; 1ZQV A; 4PZO A; 5AKZ A; 5CR0 A; 3MR3 A; 4TUQ A; 4US8 A; 3C2K A; 4DOC A; 8ICQ A; 4GXJ A; 2Y0S C; 2PI4 A; 4F72 A; 3DDH A; 5AIC A; 5J2I A; 5GTI U; 7ICH A; 2F1J A; 5KFC A; 4DWI A; 8ICC A; 3E0F A; 4JV2 A; 5JU5 A; 2GWS A; 4OJO A; 2KN7 A; 4JWM A; 1F44 A; 3G6Y A; 3ISC A; 3M8R A; 1TFR A; 3RB4 A; 2W54 A; 3JPP A; 2ZTC A; 4ED2 A; 2OYY A; 3O0F A; 2H3Z A; 2FMQ A; 2PFN A; 2Y1I A; 4RQ1 A; 2KKP A; 3TQ1 A; 2R8G A; 1SWV A; 2JH7 A; 4OD0 A; 5CP2 A; 1T3N A; 4CE6 A; 3KFU F; 4KLT A; 3HRD D; 5DB9 A; 1L3U A; 3T79 A; 4RU9 A; 4BJQ A; 1S9F A; 4ED7 A; 5L1I A; 3LWM A; 2ZIU B; 5KFZ A; 5F9L A; 3SEN A; 5DG9 A; 4Y2P A; 5AK5 A; 3OHA A; 2AQ4 A; 2KVS A; 1XO1 A; 3DV9 A; 1ZQF A; 1V85 A; 2MUT B; 4O3P A; 5J2B A; 2DUY A; 5KFF A; 4EEN A; 3B9J A; 1ZQT A; 8ICO A; 5EWG A; 4C4T A; 4I2B A; 3WKE A; 5KFX A; 5AI5 A; 2KFN A; 3ZDD A; 8ICR A; 2WHE A; 2FJ6 A; 5J0W A; 2AHO B; 1OUQ A; 3RH4 A; 1ZYQ A; 4JV1 A; 2IA6 A; 4EYI B; 1QLN A; 4FFD A; 2XIC A; 1CUK A; 2QB0 A; 2ZG6 A; 4ED0 A; 2GOL A; 3V7K A; 1JI7 A; 1D9F A; 1JUD A; 1JMS A; 5FP0 A; 2DPJ A; 4NY8 A; 5KFQ A; 2ZIV B; 3EPG A; 4GXI A; 3RRG A; 2WB1 C; 8ICS A; 5J8Y A; 1QH9 A; 2KMD A; 3G6X A; 3N7S C; 2H3I A; 3ISB A; 4UB6 U; 2JEJ A; 3F53 A; 4EEY A; 2PXI A; 8ICJ A; 1V9P A; 2BCU A; 4F5Q A; 4JV0 A; 1NJX A; 4E0D A; 4KN7 A; 4TUS A; 4JMU A; 2FPK A; 4RQ3 A; 5AI8 A; 8ICE A; 1B4F A; 3ZD8 A; 8ICI A; 1DK2 A; 3MGH A; 3GIM A; 3LVV A; 4K4I A; 3VCB A; 4DSK A; 2VJ5 A; 4IQW A; 1NK0 A; 5KFN A; 2JGA A; 1L3T A; 1ZQS A; 3K4G A; 3C21 A; 1JIH A; 3ETR A; 4B9U A; 4OO1 J; 5KT3 A; 1Q46 A; 5K4L A; 1ZQE A; 1PVQ A; 2XO7 A; 1ZQP A; 1PVP A; 1J2N A; 8ICL A; 3H8S A; 2IHM A; 3EYZ A; 2ZIX A; 1L8L A; 2BDP A; 5C5J A; 2A19 A; 4MEY A; 5KT5 A; 4YMN A; 4Y2V A; 1JRO A; 1NKE A; 2MA1 A; 1ZQW A; 4J9N A; 3CRX A; 3FAH A; 4GIB A; 7ICS A; 2FPM A; 1ZQQ A; 1BGX T; 3WK8 A; 3GII A; 2KFZ A; 1YZ6 A; 4CCH A; 3UQ0 A; 2AGQ A; 5B5E U; 3H40 A; 5ALE A; 5A0L A; 1BVS A; 2ZXH A; 4FZL A; 4M6W B; 2W7P A; 4DSL A; 2DKX A; 3CNH A; 2FPL A; 3MFI A; 1DRG A; 3NGD A; 1X2I A; 4DSI A; 4J9R A; 3EUB 2; 3R9K A; 5CB1 A; 5III A; 2AQ0 A; 4QZA A; 4UAW A; 4NLZ A; 4XUS A; 4RZR A; 1TK5 A; 4KLF A; 1Z4N A; 1Z3E B; 2NYV A; 4CF4 A; 1GO3 F; 4Q43 A; 3QUC A; 4Y2Y A; 4QZG A; 3RJI A; 3KHR A; 1RYU A; 1ZD5 A; 5E79 U; 5KFH A; 3AU6 A; 3M7D A; 1NJY A; 2XY5 A; 4P4M A; 3T5J A; 3QU2 A; 3KZI U; 4F5R A; 4PHE A; 3GIK A; 3A0H U; 2FLN A; 3KTQ A; 3HPO A; 4HYK A; 4QWB A; 2XVT A; 1KEJ A; 2D6F C; 1YT3 A; 3TAC B; 4KLD A; 4NL9 A; 1X6J A; 1KFT A; 2AU0 A; 4QIW F; 4C80 A; 3HX0 A; 4M9L A; 3RB6 A; 4F4Y A; 2W9B B; 3AM9 A; 2YMP A; 1KFD A; 2BR0 A; 1B0X A; 2ODG A; 3RJJ A; 2MU2 A; 7ICG A; 3C23 A; 1T7P A; 3PX0 A; 3BDP A; 2KE7 A; 4IRC A; 5ALO A; 3SV4 A; 3BQT A; 4J9Q A; 1XWL A; 4F8R A; 5AI4 A; 2ZIU A; 3KKA A; 2KJ5 A; 2XI9 A; 2D3D A; 2G06 A; 5AI6 A; 4B9L A; 5TZV A; 4CF3 A; 4QZH A; 7ICV A; 3TFR A; 1AQ6 A; 8ICX A; 4NM1 A; 2WFA A; 1ZJM A; 3GDX A; 1U9L A; 3V7L A; 4RUC A; 3KHH A; 4C8O A; 2MUT A; 3WU2 U; 1SB3 C; 1MC8 A; 1K1Q A; 4CDG A; 4UB1 A; 3T3F A; 2QB1 A; 4MEX A; 4KLH A; 2ZXI A; 1P7D A; 2VA3 A; 4R8U B; 4PZN A; 4YXM A; 3PO4 A; 3K1Z A; 1NI3 A; 4O3M A; 4Y2U A; 3F5A A; 3IRU A; 1N60 A; 3MBY A; 1XSN A; 5HR6 A; 5EE3 A; 2W43 A; 2OHF A; 2B0C A; 3AEV A; 3BS7 A; 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1QCK A; 8ICH A; 1NKB A; 3H7I A; 3V7J A; 4Z6D A; 4PHP A; 2RDJ A; 2A3V A; 2BGW A; 3RRH A; 5DG7 A; 2DQN B; 5AIB A; 1ZQI A; 2P35 A; 1O03 A; 5AM3 A; 3M9O B; 3SZ2 A; 1KSP A; 2JRZ A; 3Q8M A; 4M04 A; 4DSJ A; 3RAQ A; 2NRT A; 1RQN A; 2K89 A; 3F2C A; 3AQE A; 5J2J A; 1SKW A; 3N4M B; 5HMM A; 3QUT A; 3LYS A; 5KG5 A; 3BQ7 A; 5L1K A; 1V97 A; 2FI1 A; 3RJG A; 3NS1 A; 5EOZ A; 2AGP A; 4QZB A; 3HW8 A; 1RQL A; 5KFE A; 4MFF A; 5AK6 A; 4J9S A; 4AP9 A; 2HOQ A; 2F77 X; 2JZB B; 3EW9 A; 2M9N A; 5CWR A; 1VLB A; 2W9B A; 4RQM A; 5KAI U; 5L1J A; 1UA1 A; 1SXE A; 1ZRN A; 2BQU A; 2HVI A; 2Y9U A; 1BPD A; 2KVC A; 2NV3 A; 3BJY A; 1NZB A; 2BKE A; 2ATL A; 2HBM A; 5KFU A; 2R8H A; 3ONN A; 4FS2 A; 3HWT A; 1SIJ A; 3Q8R B; 4OJP A; 4IR9 A; 1XU4 A; 2UVR A; 1CI4 A; 1OXJ A; 2OEH A; 4CRX A; 2KSO B; 5IIL A; 4C8M A; 1X9W A; 5IIO A; 5EE0 A; 3NAS A; 2HBJ A; 2CXY A; 4GC6 A; 5AI0 A; 4IS7 A; 1PVR A; 3WK5 A; 3QUB A; 2F44 A; 2BQ3 A; 4JK1 A; 4UB3 A; 7ICL A; 1QQ7 A; 4R8U A; 4P4O A; 3KOO A; 1SZP A; 4TQR A; 4M9J A; 2ZJ5 A; 4ECY A; 1TV9 A; 2IOF K; 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