The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
|
sequence length |
78
|
structure length |
78
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Chain Sequence |
VKNYETAVQFCWNHYKDQMDPIEKDWCDWAMISRPYSTLRDCLEHFAELFDLGFPNPLAERIIFETHQIHFANCSLVQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
RECEPTOR ACTIVITY-MODIFYING PROTEIN 2
|
| publication title |
Structure of the Extracellular Domain of Human Ramp2
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Membrane protein
|
| total genus |
28
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| structure length |
78
|
| sequence length |
78
|
| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-10-31 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3AQF A; 3N7S C; 3N7R C; 3N7P D; 2YX8 A; 2XVT A; 3AQE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3NVZ A; 4BDP A; 4P4M A; 5DB6 A; 2PMZ F; 1JXE A; 4BWM A; 4X5V A; 3LWL A; 2R8K A; 1LKY B; 3NUQ A; 3OHB A; 4RT3 A; 2KOB A; 4EYI B; 5KFD A; 1U48 A; 4QW8 A; 1KRP A; 3RR7 A; 4KLU A; 4J9L A; 2DF4 B; 5ALO A; 8ICC A; 1COK A; 2E3T A; 4F91 B; 5BOM A; 2G5H B; 3LDA A; 1RQL A; 7ICE A; 2W55 A; 4MFA A; 1Z4N A; 3UXN A; 4I2G A; 4GXI A; 4F4Y A; 3BQ7 A; 4JV0 A; 3PX6 A; 3C1Z A; 4E0D A; 4RQM A; 2J6S A; 8ICX A; 1NZP A; 3PW7 A; 2ZXI A; 3LWM A; 2XIC A; 2ZIU B; 1ZOL A; 5KFF A; 5L1K A; 4UAU A; 3M9O B; 4KLO A; 2MAX A; 2C2E A; 3PX0 A; 2IHN A; 2D3D A; 1WWV A; 3V72 A; 3E2E A; 4Y2Q A; 3H8M A; 1EXN A; 2AGP A; 1ZQX A; 1Q8K A; 2YMQ A; 1T94 A; 1SXE A; 4UAW A; 2AU0 A; 8ICM A; 2MUT A; 1L3V A; 3RH6 A; 2LM4 A; 3WK7 A; 2G5I B; 2H3Z A; 5KFQ A; 3KFU F; 5F3X B; 2QB1 A; 8ICE A; 4CNQ A; 2F77 X; 1Z19 A; 1JX4 A; 4Q8F A; 1KKX A; 3S6J A; 5J2F A; 1D9F A; 1A76 A; 4R65 A; 5AI9 A; 5J8Y C; 1SV0 C; 3WKA A; 4KTQ A; 4O3S A; 4I2D A; 5ALK A; 3QZ7 A; 1PVP A; 4M0A A; 3R9K A; 1UHU A; 1BPD A; 2JZB A; 5IIN A; 4IL6 U; 1NZB A; 3ISB A; 3FC4 A; 3ONN A; 2ES6 A; 3QUB A; 3WKE A; 4QZ9 A; 2ZIX B; 2OWO A; 9ICE A; 2IBK A; 1C20 A; 4PHD A; 3AUO A; 3RFA A; 1COO A; 3I1Y A; 5J0T A; 1K5O A; 1SZH A; 5KFU A; 2C22 A; 3F53 A; 3QU7 A; 4LZG A; 4DOA A; 1XNS A; 2DKZ A; 4PJ0 U; 3V6J A; 2YY6 A; 2WFA A; 3NTU A; 4DL2 A; 5H2F U; 5J0Q A; 1ZQP A; 3K75 D; 5KFP A; 5ALD A; 5J2E A; 4M47 A; 4KN7 A; 2HVH A; 2NV3 A; 3THV A; 3OGU A; 4ACO A; 1DXS A; 4TUS A; 4FZM A; 4C7Z A; 1L6N A; 3F5E A; 4RQ6 A; 5KFA A; 3WKB A; 2C28 A; 4RT2 A; 2R8J A; 2DBY A; 2YB4 A; 2DL0 A; 3ICX A; 4DFD A; 3KHG A; 4FS2 A; 4PZO A; 4Z6E A; 3KBB A; 4Y2Y A; 4EX6 A; 4MFF A; 4RNN A; 3RF9 A; 2W7P A; 4NWI A; 4QWE A; 4IRC A; 1V85 A; 4DF8 A; 2JEG A; 2A1J A; 4Y2U A; 3NVY A; 1XU4 A; 2BCQ A; 1V38 A; 5ALJ A; 4NLB A; 3J81 j; 3ZDD A; 2JH7 A; 3WU2 U; 5AI6 A; 3JPN A; 4JV1 A; 4Q43 A; 5DKW A; 2ZUD A; 4PZN A; 2W8K A; 4TQR A; 9ICR A; 5DQH A; 1ZQH A; 2XGQ A; 4R63 A; 4F5R A; 1FO4 A; 1NOM A; 2B0C A; 4DOC A; 1U4B A; 4ECQ A; 4B9L A; 2MUT B; 3B9J A; 2HW3 A; 2EH9 A; 3L5K A; 3H4B A; 4G9B A; 3PVX A; 1ZRM A; 5HHI A; 4F4K A; 9ICF A; 2VAN A; 3QU2 A; 1S0N A; 4CF4 A; 2IHM A; 4XUS A; 3NVW A; 2JMG A; 2FJ6 A; 4QNL A; 5AM4 A; 4I2C A; 4OJP A; 5ALQ A; 1ZQL A; 2W3R A; 2HHS A; 1CI4 A; 2Z7J A; 4DSJ A; 4F5P A; 2EZX A; 3C5F A; 3ZDA A; 2OM6 A; 2BPC A; 2FI1 A; 5AK4 A; 3WKD A; 4EX7 A; 5J2G A; 1LVH A; 1QLN A; 2F76 X; 3TFR A; 2PI5 A; 2BCS A; 2Y1J A; 5DLG A; 1JAL A; 4M04 A; 2HHU A; 1L3U A; 2JZB B; 5KFN A; 2JXJ A; 4NY8 A; 1NK7 A; 4UB8 U; 5AKH A; 4I28 A; 1KN5 A; 1N60 A; 4UB4 A; 4DL3 A; 3Q8Q B; 2PFN A; 4KX5 A; 3T5K A; 5EOZ A; 5AKX A; 3RBD A; 4CCH A; 5IIK A; 9ICC A; 3EYZ A; 3OPX A; 1ZQZ A; 1HIW A; 3SR6 A; 4R8U A; 3TAN A; 3QUC A; 2DGZ A; 2KJ5 A; 2KTQ A; 3JPQ A; 4YXJ A; 4O5C A; 1KQQ A; 4EEN A; 4Y2P A; 2DKX A; 2XCP A; 1BPE A; 1S97 A; 2K8A A; 4RPY A; 1BPZ A; 4ECU A; 4RUA A; 2ASJ A; 9ICB A; 2GH1 A; 4MEX A; 2WF5 A; 3PR4 A; 4NL9 C; 3U26 A; 4QZ8 A; 2F2A B; 2R8I A; 4P0P A; 2K4E A; 3NRW A; 4NXZ A; 5ALN A; 4UAZ A; 2BDU A; 4C8L A; 3RTV A; 2H3I A; 1YZ7 A; 2A1J B; 9ICN A; 5AM0 A; 3ZDE A; 2JH1 A; 4DSE A; 1IM4 A; 1K1S A; 2KZ3 A; 1PK1 A; 1U9L A; 9ICO A; 4UAV A; 2F44 A; 5KT3 A; 2QB0 A; 4IC9 A; 3H8S A; 5AKL A; 3GIK A; 3L4P A; 3M9N B; 2KKV A; 2KSO A; 3QEA Z; 3QZ8 A; 3GZF A; 1YT3 A; 4P4O A; 5ALR A; 3SAF A; 1ZQC A; 4K4H A; 4A8E A; 1KDH A; 7ICI A; 3UMC A; 4DL5 A; 2MA1 A; 5J2H A; 3C29 A; 4HAI A; 2HOQ A; 3KTQ A; 2KV2 A; 4DQP A; 2RHF A; 2LYB A; 1SB3 C; 2BPF A; 3LVV A; 4DL6 A; 4K4G A; 3M6Z A; 1PUZ A; 4QJF B; 5E79 U; 3KKA C; 5AKE A; 3HRD D; 5L1I A; 5KFO A; 2HI0 A; 5IIO A; 4ED0 A; 5III A; 1Z4O A; 1NI3 A; 3QUQ A; 2LPE A; 5KL8 B; 4JB3 A; 2QAR A; 2NRW A; 4KLL A; 8ICB A; 4EBD A; 1LV5 A; 3EUB 2; 3KZI U; 4PGX A; 4NLZ A; 1HEK A; 1MN8 A; 1V97 A; 3Q8K A; 4M9N A; 1KEJ A; 2AQ0 A; 1RXW A; 4UAT A; 2K60 A; 4KX3 A; 7ICQ A; 3H0L B; 3NAS A; 5KFY A; 5IIJ A; 1TK5 A; 3HJE A; 4F4W A; 1DK2 A; 2H5X A; 2IMW P; 2HHW A; 2JRZ A; 4B9V A; 4I2B A; 3MC1 A; 4RQ7 A; 7ICP A; 2LKY A; 2LMR A; 2HOF A; 1T7P A; 3HPO A; 5ALE A; 4LZD A; 3A0H U; 1N48 A; 2WB1 C; 5DB8 A; 7ICO A; 5KG7 A; 1SL2 A; 2F8K A; 5AKY A; 4R8U B; 4DSK A; 2FLN A; 5KT6 A; 4DLE A; 1JIH A; 5B66 U; 4EEY A; 4UW9 A; 8ICG A; 4QWC A; 1S0O A; 2KHV A; 3KHL A; 2ZG6 A; 3PSF A; 2B21 A; 4Y2T A; 3JPO A; 4C8M A; 4QW9 A; 2CPR A; 3ZI4 A; 1ZQU A; 3MGV A; 2VA2 A; 3H4D A; 1JMS A; 2VJ5 A; 3RRH A; 1TE2 A; 4YN4 A; 3RRG A; 1J2M A; 2ESE A; 4P0P B; 5AIA A; 2BCV A; 4NM2 A; 1NJW A; 2WAQ C; 2W7O A; 2DPJ A; 3MR3 A; 4FBU A; 1T3N A; 2WF7 A; 3V7L A; 4F4X A; 4ELT A; 4KLI A; 3KD3 A; 3K1R B; 4US9 A; 1ZQE A; 4I2I A; 1TAU A; 1PK1 B; 4C8N A; 3BDP A; 4XRH A; 5EE3 A; 2HHX A; 4UB2 A; 4GXJ A; 3TKA A; 4BXO A; 1NKB A; 2KMD A; 1XSP A; 2QB0 B; 5L1M A; 3BJY A; 1U45 A; 3BS5 A; 2KSO B; 9ICM A; 4FFD A; 1JN3 A; 9ICX A; 5EWE A; 1ZQS A; 1ZQF A; 5CJ7 A; 2E8N A; 4RPZ A; 5AI5 A; 5AKZ A; 9ICI A; 1RYR A; 3ZD8 A; 2I9G A; 5F9L A; 5BOL A; 5C5J A; 3AM9 A; 2HVI A; 2KG5 A; 4YR0 A; 4QZD A; 2XVT A; 4IQV A; 2AHO B; 4YCX A; 4YD2 A; 2ALZ A; 1IIP A; 3ALR A; 2A3V A; 3SMV A; 3RJG A; 2NRZ A; 4M9L A; 4KLF A; 4KLD A; 3BZK A; 1MQ2 A; 4YG2 A; 3UMB A; 4QIW C; 2QAR B; 3WKC A; 1X9M A; 3D6J A; 4UAY A; 3IG5 A; 3IN5 A; 1TKD A; 5ALP A; 7ICM A; 4B9U A; 1NKE A; 2JEI A; 4YR2 A; 4KLG A; 1KSP A; 5DBA A; 4RZR A; 2ZXH A; 5CB1 A; 1KW4 A; 2IOF A; 2JR5 A; 2FPK A; 3DEE A; 4IS7 A; 2HSZ A; 1OW5 A; 2ATL A; 2Y9T A; 3UXO A; 4U6P A; 3M9M B; 1D8B A; 1VJ5 A; 4RPX A; 3EWA A; 5KL1 B; 1L8O A; 5J2I A; 1NKC A; 5AIB A; 2OYY A; 3IP4 B; 3N28 A; 2DPI A; 8ICP A; 4Y2X A; 5DDY A; 4QZH A; 1B4F A; 4KIT B; 1ZQA A; 4EBC A; 2W3S A; 2FDR A; 5AM1 A; 4I2E A; 7ICG A; 1Z3E B; 2KZM A; 1Z1V A; 4JMU A; 1ZQ1 C; 4CE6 A; 2LM1 A; 4RQ5 A; 1ZQG A; 3GDX A; 3RBE A; 5KFJ A; 3Q8S B; 1UT8 A; 2LBO A; 3SD7 A; 3RAQ A; 3I28 A; 3B0X A; 1ZET A; 5ALS A; 2I1Q A; 5AI4 A; 4YQW A; 2K8B B; 2PI4 A; 4DO9 A; 3ISC A; 3N7P D; 3ETL A; 2XY5 A; 3CP8 A; 1CEZ A; 3RH4 A; 4QZF A; 4GFJ A; 2Q0Z X; 1VLB A; 4BXO B; 2RDI A; 1SL0 A; 1TAM A; 1GO3 F; 4C4T A; 3MAB A; 4KMU A; 4OCZ A; 1L3S A; 4Z6C A; 3BS5 B; 3T5H A; 5J0O A; 3C28 A; 1RZT A; 4RNM A; 3HKZ C; 1TFR A; 3TAD A; 4F50 A; 1B0X A; 2W11 A; 3M8R A; 3AMZ A; 2VA3 A; 1RDF A; 1ZRN A; 2G0A A; 5B5E U; 3SV4 A; 1KLN A; 1MQ3 A; 3HIL A; 2IA6 A; 3H40 A; 2BPG A; 4P4P A; 5HP4 A; 2ZTC A; 2E1F A; 3QU5 A; 4QWB A; 5DGA A; 4NLN A; 2K4H A; 5J0Y A; 4YFK A; 5DQI A; 1PVR A; 5J2J A; 4F2S A; 5A0L A; 2Y0S C; 5DB9 A; 5GTI U; 3MBY A; 2KKP A; 1N63 A; 2UVU A; 4M9G A; 4ECZ A; 2KHQ A; 5CHG A; 4F92 B; 3EPI A; 4ED2 A; 2JEF A; 3IM1 A; 4YMN A; 1XO1 A; 2VKQ A; 3WK4 A; 2KIV A; 3PST A; 4C7Y A; 4MF2 A; 4EEL A; 4J9M A; 1A77 A; 1X6I A; 1O03 A; 2W9A A; 2F1I A; 5KFM A; 2OH2 A; 3LK9 A; 1FEZ A; 3JPR A; 5CR0 A; 1BPY A; 1CRX A; 3SEI A; 2I6X A; 3QXG A; 2OHF A; 3SQI A; 2XGP A; 3L3F X; 3I76 A; 3WK5 A; 2D8C A; 4QWD A; 1ZQR A; 8ICS A; 1RXV A; 1DK3 A; 2EZZ A; 1ZQD A; 9ICW A; 3TAC B; 2ZIW A; 3RB0 A; 2G06 A; 4AP9 A; 1PZN A; 2DQN B; 1YZ6 A; 4DF4 A; 4DSF A; 4IRD A; 3FM9 A; 5TIS U; 3TAQ A; 1L7N A; 1N56 A; 1F44 A; 1SKS A; 2R8H A; 2XY6 A; 4Z6F A; 2OCE A; 3QE9 Y; 3ZDB A; 3PO4 A; 3RJK A; 2WF9 A; 4DSI A; 2ZUC A; 5DBB A; 3IG8 A; 2OEH A; 5EE9 A; 8ICJ A; 4I29 A; 1TV9 A; 4F5Q A; 2VJ4 A; 3PMN A; 4B9S A; 4DWI A; 1ARO P; 4QWA A; 2C2D A; 1WCN A; 4DCC A; 2RRD A; 3PW5 A; 2XI9 A; 1ZYQ A; 3V6H A; 3WK8 A; 3D2N A; 2L5Y A; 4B6J A; 4M9J A; 5KFH A; 2BHN A; 4YP3 A; 1S5L U; 4CDG A; 4NLK A; 2YN4 A; 1NNL A; 4UB3 A; 3M1Y A; 5J2B A; 1HUO A; 8ICY A; 5J0S A; 2ZJA A; 4YMM A; 5AK3 A; 1PVQ A; 2WTF A; 3C5G A; 1JXL A; 4USA A; 1BVS A; 4ECR A; 1KFT A; 4I2J A; 5KG2 A; 3H8J A; 1OXJ A; 4F8R A; 1T8E A; 1TK0 A; 4ECW A; 5AIC A; 3MDA A; 4EBE A; 1QQ5 A; 4PL2 A; 1NK6 A; 4HYK A; 3IRU A; 3PZP A; 4ED1 A; 2W03 A; 4ZOH C; 4P0Q A; 4M2Y A; 1ZQQ A; 1A0P A; 8ICO A; 3CNH A; 3VC8 A; 9ICU A; 4P2H A; 1ZQV A; 5AK6 A; 4MFC A; 2EAM A; 2W9B A; 1FFV A; 4B9T A; 5J29 A; 2ZJ5 A; 2W04 A; 4KLJ A; 2PKE A; 1D8Y A; 1L3T A; 5ALM A; 3MGH A; 2ZJ8 A; 5AKK A; 4UQG A; 1S8O A; 3RB4 A; 5ALF A; 2KZZ A; 2W43 A; 1FFU A; 1J2N A; 5KFZ A; 2HDO A; 2VIX A; 4CF5 A; 3PO5 A; 2NYV A; 4ELV A; 4F72 A; 5CP2 A; 2BR0 A; 2ASL A; 1UPH A; 2KD1 A; 3T3F A; 4TUR A; 4O5K A; 1QSS A; 1ZD3 A; 1ZQI A; 3M8S A; 3SZ2 A; 2HHQ A; 1SWV A; 2ZIW B; 4MHV A; 3N4M B; 2W8L A; 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7ICU A; 2ZUB A; 3GQC A; 2YX8 A; 4DFJ A; 4AYB C; 2E5S A; 5JU5 A; 4DL7 A; 3RAX A; 1RG6 A; 2W9C A; 5J0W A; 3M6K A; 4QIW F; 3UQ0 A; 4KLH A; 2BDP A; 4CRX A; 4TUQ A; 3NRZ A; 8ICL A; 1S9F A; 7ICS A; 5KFE A; 2HBK A; 3TAD C; 3AQE A; 2V4Q A; 5DBC A; 2KVS A; 3C21 A; 2ISO A; 2HMX A; 3FYH A; 5KFX A; 5J2A A; 4ED3 A; 3ORY A; 4GC6 A; 7ICV A; 1F5S A; 1ZD4 A; 1KTQ A; 4TQS A; 1KFD A; 1L7O A; 3JPT A; 2EZY A; 1BPX A; 3V7J A; 2FPL A; 1JRO A; 3PV8 A; 3HW8 A; 1Z1B A; 2J6T A; 1N2X A; 1Z00 B; 4GXK A; 2H3Q A; 5JRT A; 4PH5 A; 4MEY A; 1NK0 A; 2ZIX A; 3AEV A; 2A19 A; 1IXR A; 4EYH B; 4F3O A; 1Y88 A; 2PFP A; 2F8L A; 5HMM A; 2J6U A; 3OJS A; 2UVR A; 1NJY A; 1KFS A; 4IRK A; 5BPC A; 2M0N A; 3PW0 A; 2PXI A; 2BZF A; 1J97 A; 3EZ5 A; 3C23 A; 3C2K A; 4O3R A; 4FO6 A; 3NS1 A; 4Q8E A; 2V9W A; 2KIC A; 2KE7 A; 5J0P A; 2BCU A; 2EAN A; 4OJO A; 5HHH A; 3KKA A; 4EZ6 A; 4ECY A; 4F71 A; 4OJ5 A; 2CRX A; 2FMP A; 2HBL A; 5AKI A; 3UXP A; 1XSL A; 1Q3U A; 9ICJ A; 3FAH A; 3HX0 A; 4B9N A; 5D46 A; 2HHV A; 1JI7 A; 2QKQ A; 3B0Y A; 4YMO A; 3BQT A; 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