The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
78
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structure length |
78
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Chain Sequence |
b'VKNYETAVQFCWNHYKDQMDPIEKDWCDWAMISRPYSTLRDCLEHFAELFDLGFPNPLAERIIFETHQIHFANCSLVQ'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
RECEPTOR ACTIVITY-MODIFYING PROTEIN 2
|
| publication title |
Structure of the Extracellular Domain of Human Ramp2
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Membrane protein
|
| total genus |
28
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| structure length |
78
|
| sequence length |
78
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-10-31 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3AQF A; 3N7R C; 3N7P D; 3N7S C; 2YX8 A; 2XVT A; 3AQE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4EEN A; 2IMW P; 5KFO A; 2YB4 A; 4UBC A; 4Y2J A; 4EBE A; 5DLG A; 2HHV A; 5CA7 A; 4O5K A; 2A1J A; 3I1Y A; 2F76 X; 5ALE A; 3C2M A; 1ZD5 A; 1ZOL A; 2BHN A; 1BPY A; 8ICK A; 4ED7 A; 5CEH A; 3C2K A; 4NV0 A; 9ICS A; 3MR3 A; 3UQ2 A; 3KHG A; 8ICJ A; 5AKJ A; 5DGA A; 3U26 A; 8ICP A; 4EEK A; 1WYG A; 2Y0S C; 1ZQL A; 4I2J A; 3M8R A; 4MEX A; 1S97 A; 3GIJ A; 1NK9 A; 4PHD A; 1MQ2 A; 5ALL A; 3IM1 A; 1A77 A; 3PW4 A; 2YTU A; 2FJ6 A; 4UB8 U; 9ICO A; 1Z4O A; 3RRG A; 5KFL A; 4F4Z A; 1ZQZ A; 2JH1 A; 4P4O A; 2G08 A; 5AM4 A; 1XC9 A; 2IHN A; 4IS7 A; 2F2A B; 4RNN A; 3I28 A; 5KTQ A; 2VJ5 A; 3TI0 A; 1EXN A; 2MUT B; 4DSK A; 1BPE A; 4AYB F; 8ICA A; 7ICO A; 3PW2 A; 3RR7 A; 4JWM A; 2ESE A; 4RT3 A; 3QE9 Y; 4PZN A; 4NLK A; 2KZZ A; 2KJ8 A; 9ICA A; 1L3T A; 1SIJ A; 3QU5 A; 5BPC A; 4ECX A; 4ECR A; 2XO7 A; 2W9A A; 3T5L A; 4KLU A; 3D2Q A; 2LM1 A; 4KMU A; 3BDP A; 4BWJ A; 2XGQ A; 4UB1 A; 5DG7 A; 4Y2P A; 1X66 A; 4NY8 A; 1VJ5 A; 3OTQ A; 4QW8 A; 4DS4 A; 1ZQA A; 4US9 A; 2HW3 A; 1B0X A; 2RLT A; 3UMC A; 1U48 A; 3N4M B; 2BCQ A; 1DOQ A; 2W04 A; 4UB5 A; 1ZQ1 C; 5ALU A; 4X5V A; 3L3F X; 4RPZ A; 2J6T A; 4FBT A; 3ZDC A; 4KX5 A; 3NVZ A; 2JEJ A; 2DGZ A; 7ICM A; 2VAN A; 4NL9 A; 1KEJ A; 3R9K A; 4ZH4 A; 3V7K A; 3MR6 A; 1QH9 A; 2ZIX B; 1D9F A; 4I2B A; 2JXJ A; 1RQN A; 3KHL A; 3RJK A; 2HHT A; 3QX7 A; 3AQF A; 2ZTC A; 2P6U A; 1Z4N A; 5KFG A; 2DL0 A; 1A6S A; 4ELT A; 4BX9 C; 1SXD A; 1U9L A; 5DB6 A; 4RQ5 A; 1CEZ A; 3QNM A; 1LVH A; 4K4G A; 1YT3 A; 4TQR A; 5CHG A; 3H4B A; 1F0M A; 1PZN A; 4BJQ A; 4QJF B; 8ICF A; 4U7C A; 2KN7 A; 4TQS A; 4B9T A; 3TAN A; 5J0W A; 1AQ6 A; 5J2D A; 3F53 A; 3VC8 A; 3GZF A; 3PV8 A; 1Q8K A; 1KN5 A; 3B0Y A; 2H3F A; 1N5X A; 4RQ7 A; 1COO A; 3TAR A; 1X9S A; 4DSJ A; 1UPH A; 5ALP A; 4CF3 A; 4I29 A; 3TAD A; 1TAU A; 2DPJ A; 2C2D A; 4TUR A; 3EPG A; 5IIM A; 5ALD A; 1TFR A; 4K4I A; 4QZG A; 2DWQ A; 2KKV A; 3HJE A; 2F1I A; 5KG3 A; 4M9H A; 2ZUD A; 4ICA A; 5KFS A; 3WKE A; 8ICI A; 3RJF A; 5JUM A; 7ICN A; 2G5H B; 4I2G A; 5C0Y A; 2HOF A; 5DLF A; 3QXG A; 7ICP A; 1K5O A; 2ASL A; 5KT7 A; 3M9M B; 1U49 A; 3H8M A; 4DEZ A; 3Q8S B; 5KFP A; 3A0B U; 2ZIX A; 4JK1 A; 4M9J A; 1NJY A; 3MGV A; 3SAG A; 2FI1 A; 4FO6 A; 4QWE A; 4P2H A; 3ISC A; 3E58 A; 4OD0 A; 1S77 D; 3KKA A; 1ZQW A; 1XSL A; 3ICX A; 2EAO A; 3QEB Z; 5HMM A; 3IRU A; 2IOH A; 1TV9 A; 2HOI A; 2LYH A; 1K1S A; 4ED1 A; 7ICG A; 5AM3 A; 3C28 A; 2R8H A; 2YMQ A; 1QQ5 A; 4YR3 A; 3MBY A; 1TK0 A; 3L5K A; 2Q0Z X; 2FMQ A; 4KLM A; 3IN5 A; 2L5Y A; 5AKG A; 2KFZ A; 2KKP A; 3ZDD A; 5HML A; 4PHE A; 1A76 A; 2KSO B; 4UAY A; 5F9L A; 3HWT A; 1SWV A; 1Z1B A; 1KLN A; 4ELV A; 2WB1 C; 4J03 A; 4C4S A; 4KIT B; 4EZ9 A; 2R18 A; 3RTV A; 2OXO A; 4KMO B; 1IG6 A; 5EWG A; 2PFO A; 2W9M A; 1FIQ A; 1QSY A; 3DV9 A; 3AQE A; 3AUO A; 3V6H A; 4M6W B; 3WKA A; 4YD1 A; 5KG0 A; 4Q45 A; 4YQW A; 2ZJ8 A; 3M1Y A; 1SL0 A; 2HI0 A; 2V4Q A; 1ZQF A; 5J0S A; 2J6S A; 2VA3 A; 1URJ A; 5D46 A; 3RB3 A; 2EZX A; 3GIM A; 1CRX A; 1IXR A; 2NV3 A; 1J2M A; 4P4M A; 3MR5 A; 1S0M A; 5KNI A; 1QQ6 A; 2CPR A; 3SR6 A; 3ISD A; 2AQ0 A; 2OH2 A; 1OXJ A; 5DDM A; 5ALO A; 4DFP A; 2GOL A; 4RQ3 A; 4ED8 A; 2KOB A; 1KFD A; 4EX7 A; 4B9M A; 5KFI A; 2AHO B; 5EE0 A; 4B6J A; 2LHT A; 3FAH A; 4LZD A; 1T3Q A; 5J0R A; 3CRX A; 4RT2 A; 9ICE A; 1SXE A; 3RAX A; 4UQG A; 2LYA A; 2BQR A; 7ICI A; 2D6F C; 5ALZ A; 2F8L A; 1X9M A; 4GXJ A; 2ZUC A; 2LPE A; 3K1Z A; 4RUA A; 1TK8 A; 4YP3 A; 4OCZ A; 2B6G A; 1WCL A; 2MSN A; 5J0O A; 3NTU A; 2ZG6 A; 1RG6 A; 3RAQ A; 1DGJ A; 5AKY A; 5ALI A; 4M6W A; 2W7O A; 1ZQN A; 5AM2 A; 2AH5 A; 4UAW A; 1ZD2 P; 3MC1 A; 2PFN A; 4XA5 A; 5EWE A; 5HR6 A; 2RDI A; 5KAF U; 2QB1 A; 4FZL A; 5H2F U; 4C0Z A; 4NXZ A; 3MFH A; 4MFA A; 3PY8 A; 4F2S A; 1KW4 A; 5III A; 4J9O A; 2R8J A; 4ELU A; 8ICU A; 2JZB B; 4Y2T A; 4QZA A; 2Y1I A; 3BQ7 A; 4ACO A; 2QB0 B; 5J0Y A; 8ICO A; 2HOQ A; 1ZD3 A; 3AU6 A; 5KFR A; 2RQ5 A; 2G07 A; 3EZ5 A; 3RJJ A; 2KV2 A; 1N60 A; 4PPX A; 1JXE A; 2VJ4 A; 5DQI A; 4Y2Y A; 5JRT A; 2PMZ C; 2YQE A; 4FE3 A; 1GO3 F; 1TVA A; 1MQ3 A; 5AKI A; 2W9C B; 1FFV A; 3OJU A; 1KKX A; 3NVY A; 1SB3 C; 1ZQI A; 2A1J B; 5CR0 A; 4IRC A; 4IRK A; 2HBJ A; 1KL9 A; 5DB8 A; 2W8K A; 1S5L U; 1QTM A; 9ICK A; 3WK4 A; 2BR0 A; 4DOC A; 3GII A; 4F93 B; 4FS2 A; 3H8W A; 4ECZ A; 4R63 A; 1BNO A; 4DLG A; 2OCE A; 7ICJ A; 5ALW A; 5KT4 A; 2Y9T A; 5KFZ A; 2I9G A; 3KOO A; 1B22 A; 2LKY A; 3THV A; 2E5S A; 4G9B A; 2JZB A; 4F8R A; 4KLL A; 2QB0 A; 4UAT A; 4YMN A; 1V85 A; 2JEG A; 4BXO A; 4P0Q B; 1UT8 A; 3PW5 A; 2BCS A; 1A0P A; 4KLO A; 3NUQ A; 5KFQ A; 1NZP A; 4GC7 A; 1WUD A; 2G09 A; 3JPP A; 5AI9 A; 5J2I A; 3GV5 B; 4Y2U A; 2ODG A; 2XVT A; 2F8K A; 4KLE A; 3H0M B; 4QWC A; 2QLT A; 2LBO A; 2B21 A; 1D8Y A; 1VDV A; 2W9C A; 2I1Q A; 1KSP A; 5AHX A; 4B9N A; 3V72 A; 4NLN A; 4DQQ A; 4ECU A; 2F3N A; 3PR5 B; 4B9L A; 3ETR A; 1HJP A; 3RF9 A; 4J9S A; 3RH5 A; 1F5S A; 7ICT A; 4NWI A; 3RJH A; 5KFD A; 4GIB A; 4KLD A; 2HMX A; 3MGH A; 3K1R B; 5J2C A; 2P6R A; 3E0F A; 1NOM A; 1ZQP A; 1ED1 A; 3F2B A; 2H3I A; 3N97 B; 4IQT A; 5EE1 A; 1V9P A; 3NGD A; 2ATL A; 1S9F A; 8ICN A; 2AJQ A; 1TK5 A; 4CDG A; 4QIW C; 5HP4 A; 1N61 A; 2YB1 A; 2LMR A; 1HUO A; 3ONN A; 3AU2 A; 2WAQ F; 2FPK A; 5AI5 A; 2HCF A; 2DBY A; 3QU4 A; 4P0Q A; 4YG2 A; 4M04 A; 1QSS A; 2FPL A; 5KT6 A; 5L1K A; 4AYB C; 5DG9 A; 3QU2 A; 4ECS A; 5DQG A; 4UB3 A; 2JRZ A; 2KZM A; 5CWR A; 1XSN A; 4QZF A; 1ZQR A; 5KT5 A; 2E8N A; 5AI0 A; 4DSE A; 1ZQY A; 3LVV A; 2NRT A; 3HPO A; 5J0X A; 2E3T A; 5ALS A; 5AKL A; 8ICW A; 4YMO A; 3TAD C; 3ZDB A; 4DSI A; 3TAP A; 4DL3 A; 8ICL A; 4OJ6 A; 2BZF A; 2W11 A; 3PZP A; 3GDX A; 2KIV A; 2RDJ A; 1PK1 B; 4M0A A; 4K4H A; 1NI3 A; 3F2D A; 3G6X A; 3KBB A; 4UAZ A; 1QQ7 A; 5KFX A; 1JIH A; 3BS5 B; 2JEI A; 2I5H A; 4MFC A; 3NRZ A; 7ICV A; 5KFV A; 4EEY A; 1JX4 A; 9ICU A; 4DL7 A; 4KLI A; 4GC6 A; 9ICX A; 2YMP A; 3SEI A; 2KNJ A; 3PO5 A; 3GV7 B; 2E8O A; 3KTQ A; 2ZIU B; 3VCB A; 3PSF A; 2XIC A; 4DCC A; 5AI4 A; 8ICV A; 2GLE A; 1XO1 A; 2GO7 A; 4O0I A; 4UB2 A; 1N48 A; 2KJ9 A; 2K89 A; 2P66 A; 3HRD D; 3K75 D; 3BQ2 A; 1UA1 A; 4DSF A; 1ZQJ A; 3T5H A; 2ZTD A; 1SV0 C; 1ZQE A; 1Q3U A; 5AKK A; 2E1E A; 1ZQT A; 4IL6 U; 5KFJ A; 4O3R A; 1L8O A; 1ZYQ A; 2A19 A; 5ALR A; 4DLE A; 3TKA A; 5ALN A; 2XI9 A; 3CP8 A; 1L6N A; 1ZQK A; 5KFT A; 3UMB A; 3ISB A; 4FFD A; 2D3D A; 1Z3E B; 1DRG A; 5DBC A; 4O3Q A; 4BWM A; 4O3O A; 3TFS A; 1YZ7 A; 2FLN A; 1JRP A; 2O6K A; 4CRX A; 4USA A; 1XS9 D; 2HHS A; 1JMS A; 4NLG A; 1JN3 A; 1SL1 A; 2BCU A; 2XCA A; 3N7P D; 4ECV A; 1D9D A; 4QNL A; 2ZIV A; 4I2I A; 5KG5 A; 1PK1 A; 4TUP A; 4NLB A; 1TKD A; 1U45 A; 1BPD A; 3I76 A; 4O3P A; 1B4F A; 1WG8 A; 3HW8 A; 5J0T A; 2NRZ A; 3BS5 A; 3JPS A; 2C2R A; 1RM6 C; 5AKX A; 4DQR A; 1U47 A; 1P7D A; 2W3S A; 3LK9 A; 3CNH A; 4F92 B; 4C7Y A; 3FM9 A; 2IA6 A; 1TAM A; 4PHP A; 4YFK A; 7ICL A; 2ZIU A; 2EAN A; 5ALV A; 1X9X A; 5KG6 A; 1XSP A; 2WF5 A; 5AIC A; 3WKC A; 2V4R A; 3ZDA A; 3QZ8 A; 2M0N A; 1NK7 A; 4FZM A; 3PST A; 4ECT A; 3RJG A; 2DQN B; 4Q8F A; 2M9N A; 1S0N A; 3FDS A; 2FLP A; 5TZV A; 1ZQD A; 4GXK A; 2PKE A; 1L8L A; 3Q8L A; 2ASJ A; 3RBE A; 3AM9 A; 5J2H A; 5AI6 A; 4ED0 A; 1Q46 A; 1ZQG A; 2KEY A; 1ZXI A; 3WK9 A; 2JR5 A; 2ZXI A; 3ETL A; 9ICB A; 3PSP A; 4R66 A; 8ICS A; 4KN7 A; 2R8K A; 2G06 A; 4RQ8 A; 1FEZ A; 5AK3 A; 4DL5 A; 3C23 A; 3Q8P B; 2OHF A; 1MSW D; 4QWB A; 3EYZ A; 1F44 A; 3PO4 A; 2F1J A; 4YXM A; 4RPX A; 5AI8 A; 2EQY A; 3TAC B; 2HVI A; 5C5J A; 3OHA A; 2HBL A; 1UHU A; 4JB3 A; 3Q8Q B; 1QCK A; 2WTF A; 2B0C A; 3IHQ B; 4IRD A; 2BQ3 A; 1N62 A; 1L5U A; 1ZQS A; 4PL2 A; 4I2D A; 1SZP A; 1L7N A; 1IM4 A; 4UAS A; 3FYH A; 5KFK A; 2K60 A; 3QUQ A; 4GFJ A; 4O5E A; 2QKQ A; 1JRO A; 5ALT A; 4KLG A; 1TAQ A; 3ZD8 A; 4DL6 A; 1UCV A; 1Z00 B; 2VA2 A; 4G3I A; 4Q8E A; 4CE6 A; 3PVX A; 3SZ2 A; 3KFU F; 4J9R A; 4DL4 A; 4MEY A; 3TQ1 A; 3C5G A; 4YVZ A; 5TIS U; 5KFU A; 1Y88 A; 2YML A; 1S76 D; 1NKC A; 4JV0 A; 5HR7 A; 2YN4 A; 5F9N A; 1S10 A; 3M6K A; 3H8S A; 2LYB A; 4RQ6 A; 4KLH A; 1DK3 A; 2BPG A; 3SD7 A; 4DWI A; 1XWL A; 5DDY A; 2WFA A; 2FE9 A; 3SI8 A; 4OJP A; 1SL2 A; 1T4G A; 2MRL A; 8ICT A; 3ORY A; 4AP9 A; 1IIP A; 2KTQ A; 5BOM A; 5JU5 A; 2BKE A; 4ED6 A; 3V6J A; 4QZ8 A; 9ICH A; 4O3N A; 2BPF A; 2PFQ A; 4F2R A; 1D8B A; 5AM1 A; 4M47 A; 4EEL A; 4Q44 A; 3C29 A; 1L7O A; 3H4D A; 3JPN A; 1N5W A; 2OYY A; 4Z6D A; 4YXJ A; 3JPR A; 3LYS A; 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2DKZ A; 2XGP A; 5T14 A; 3HKZ F; 3OGU A; 1NNL A; 3RH4 A; 5G5G A; 3OHB A; 3QU9 A; 1LKY B; 5DB7 A; 4RNO A; 4GXI A; 2F77 X; 3Q8K A; 3S6J A; 2JV3 A; 4HYK A; 1ZQM A; 5ALG A; 4RQ1 A; 3RB6 A; 5IIJ A; 5K4L A; 2YX8 A; 4MHV A; 2K8B B; 2UVU A; 3KZI U; 5DBB A; 4O3S A; 2AGP A; 5KFB A; 1ZRN A; 4F5Q A; 2AXT U; 2ZJ5 A; 1H38 A; 9ICM A; 2K8A A; 9ICI A; 4YN4 A; 1SWW A; 2AU0 A; 8ICG A; 1KRP A; 3GFK B; 4YCX A; 3T79 A; 2EZZ A; 2HHQ A; 4NM1 A; 1NKE A; 2JH7 A; 2G5I B; 5KFH A; 4I28 A; 3NS1 A; 1DXS A; 1SV4 A; 5J2F A; 4M2Y A; 2H3Z A; 4QZE A; 5KFW A; 2H3V A; 4I2E A; 1MA7 A; 5ALH A; 1UQV A; 5ALF A; 4YD2 A; 2K8C B; 5ALJ A; 3SAF A; 4EBD A; 4P0P A; 5L1I A; 8ICC A; 3K4G A; 5EWF A; 2LI6 A; 4NL9 C; 5DGB A; 2WAQ C; 1HIW A; 4UW9 A; 4BDP A; 5E79 U; 3BJY A; 1FFU A; 2D8C A; 3JPQ A; 3NRW A; 4C8N A; 4HAI A; 4YR0 A; 5J2J A; 3T3F A; 3MDA A; 4R8U B; 7ICR A; 3KHR A; 4U6P A; 3RBD A; 4O9M A; 5ALM A; 2KVS A; 5J0P A; 1BPX A; 1N56 A; 2H5X A; 5ALQ A; 4UB4 A; 3H7I A; 4YR2 A; 1NJZ A; 4O5C A; 1LKY A; 1UT5 A; 1CUK A; 3D6J A; 2ASD A; 1COK A; 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