The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
|
sequence length |
78
|
structure length |
78
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Chain Sequence |
VKNYETAVQFCWNHYKDQMDPIEKDWCDWAMISRPYSTLRDCLEHFAELFDLGFPNPLAERIIFETHQIHFANCSLVQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of the Extracellular Domain of Human Ramp2
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Membrane protein
|
| molecule keywords |
RECEPTOR ACTIVITY-MODIFYING PROTEIN 2
|
| total genus |
28
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| structure length |
78
|
| sequence length |
78
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-10-31 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3N7S C; 3N7R C; 3N7P D; 2XVT A; 3AQF A; 3AQE A; 2YX8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3K75 D; 3GZF A; 3ORY A; 3NS1 A; 2W3S A; 4EYI B; 2K60 A; 1FFV A; 8ICG A; 3K1R B; 1RYU A; 1RYR A; 4M2Y A; 2KSO B; 3C21 A; 2HBJ A; 4MF8 A; 1L3T A; 5J0O A; 1PVR A; 3F5A A; 8ICK A; 2HHT A; 4BWM A; 5ALH A; 4M9J A; 3TAC B; 2OHF A; 2XVT A; 5F3X B; 2W7O A; 1ZQN A; 2ISO A; 3SAG A; 1UHU A; 4KTQ A; 2H3Q A; 1IXR A; 2FPL A; 3SR6 A; 9ICU A; 2G09 A; 4Q43 A; 4IR9 A; 4DOC A; 3OSN A; 2JRZ A; 3SYZ A; 2K8C B; 2PMZ C; 4U6P A; 3QU5 A; 4ED2 A; 4Q45 A; 5KFK A; 1NK5 A; 1PVQ A; 2DPI A; 4B9V A; 4YVZ A; 5E79 U; 3QXG A; 5B5E U; 4IRK A; 1SIJ A; 4K4I A; 4ZH4 A; 2IHN A; 1S76 D; 3B0Y A; 5J2E A; 2F2A B; 4PHA A; 4ECX A; 1A6S A; 1N62 A; 5DQI A; 1BGX T; 4MF2 A; 4ED1 A; 1SWV A; 3GIK A; 4PGQ A; 3OSP A; 4O3R A; 4KLI A; 3M9O B; 4J9R A; 4KLT A; 3MC1 A; 2W8L A; 1L3V A; 3JPT A; 1NJX A; 5KFN A; 5HHI A; 2VIX A; 2VKQ A; 2XGP A; 3WK8 A; 3WU2 U; 1N63 A; 5ALI A; 5CA7 A; 2DBY A; 5AK5 A; 2Y1I A; 3PSP A; 1LV5 A; 1L8O A; 5KG4 A; 1X9S A; 2KVS A; 5AI0 A; 2WFA A; 8ICP A; 3HJE A; 4KLQ A; 5AKI A; 2VJ4 A; 3TI0 A; 1ZYQ A; 2NRX A; 5K4L A; 1J2N A; 1ZQC A; 5J0T A; 5J0P A; 4CGZ A; 4M04 A; 2BCS A; 2GH1 A; 3RH6 A; 4Z6E A; 1HIW A; 3VC8 A; 3ZDA A; 1T8E A; 3LK9 A; 1B4F A; 1NK6 A; 4M6W B; 3M9N B; 1ZQD A; 2ZIW A; 2G0A A; 1ZQF A; 1S0N A; 3C23 A; 4GXJ A; 4ECU A; 4ICA A; 4NV0 A; 4C7Y A; 1JXL A; 1KW4 A; 5AM0 A; 3T5J A; 3AM9 A; 3RB4 A; 3H0L B; 4I2B A; 1ZQ1 C; 1T4G A; 5TIS U; 5ALM A; 1ZQJ A; 5KFC A; 2FMP A; 3OJU A; 5KFZ A; 3K4G A; 3SAF A; 1TFR A; 1SGG A; 4QNL A; 1KL9 A; 2MUT B; 3N4M B; 5KFH A; 3QZ7 A; 4DL2 A; 5ALT A; 9ICS A; 5AKJ A; 3NUQ A; 3OTQ A; 5KT5 A; 5EE3 A; 2E8N A; 3O0F A; 5ALL A; 4CF4 A; 3TFR A; 5KG3 A; 5AKE A; 9ICW A; 3C29 A; 3I76 A; 1FFU A; 2IOH A; 4B9N A; 4ECV A; 2QB1 A; 1KFS A; 3F2D A; 1IM4 A; 4EBD A; 2KZZ A; 1VDV A; 1TAU A; 2EAM A; 9ICN A; 1FO4 A; 4Y2J A; 1KDH A; 7ICM A; 3H0R B; 3GII A; 4TUP A; 1SV4 A; 3QUC A; 4KIT B; 4F92 B; 1ARO P; 3NVZ A; 5ALD A; 5KG0 A; 4QIW F; 2HI0 A; 4I2E A; 3JPR A; 2MU2 A; 2EAP A; 2WF6 A; 2ZIU B; 4P0Q A; 8ICR A; 4IQW A; 2HVI A; 1T3Q A; 3MFH A; 1QH9 A; 3T79 A; 1TK8 A; 5J0X A; 5AKK A; 4E0D A; 2KEY A; 3RJK A; 7ICL A; 5B66 U; 3HPO A; 8ICO A; 4ED0 A; 3TAD A; 1X9M A; 3FM9 A; 2G07 A; 5HHH A; 3M8S A; 4KMU A; 4ACO A; 3NVV A; 3QE9 Y; 2M9N A; 3ETL A; 3HWT A; 1DGJ A; 1ZXI A; 3RJE A; 2NRZ A; 3RRG A; 2YX8 A; 4OCZ A; 1UCV A; 5KFU A; 1KSP A; 9ICT A; 5EOZ A; 3H0M B; 5J0Y A; 2E8M A; 3FAH A; 5JU5 A; 4PHD A; 2BZF A; 4NJ8 A; 5KG6 A; 5ALY A; 7ICT A; 3IRU A; 2ZXH A; 1NJW A; 2QLT A; 1UT5 A; 2HVH A; 2DWQ A; 2KD1 A; 8ICL A; 1Z4N A; 4B9T A; 5CWR A; 1VLB A; 5KFD A; 9ICK A; 5KFV A; 4Z6F A; 5J2A A; 2W7P A; 2FPK A; 1RYS A; 4U7C A; 4IC9 A; 3WKB A; 5DB6 A; 4C4T A; 4DQI A; 2RP5 A; 4FBU A; 4KLF A; 1NI3 A; 2W54 A; 4G9B A; 1NK9 A; 2I9G A; 2Z7J A; 4B6J A; 4QZI A; 4NLB A; 4O9M A; 3HT3 A; 1JRP A; 4C8K A; 4F4X A; 3GV8 B; 5AIA A; 4DWI A; 2VA8 A; 3JPO A; 3WK4 A; 2NRV A; 1NKE A; 1UA0 A; 1S9F A; 5ALP A; 4M9L A; 4ELV A; 3OHB A; 5KFM A; 4B9M A; 4PPX A; 4BUG A; 2IA6 A; 1C7Y A; 1NKC A; 4FBT A; 1Q8K A; 3BJY A; 3EPG A; 3KHH A; 3IHQ B; 4ED3 A; 2WAQ C; 5AHX A; 4P4M A; 1MQ2 A; 4Y2R A; 1L7N A; 2R18 A; 1XO1 A; 3WK7 A; 1UT8 A; 4KLE A; 5CHG A; 4RQN A; 1XSL A; 4J9M A; 2W43 A; 4CCH A; 3GV7 B; 1DK2 A; 1S97 A; 4DFK A; 2AHO B; 1K1S A; 2MSN A; 3Q8Q B; 4ECR A; 4K4H A; 8ICC A; 2KHV A; 5KFW A; 1PK1 B; 4YP3 A; 4UAT A; 3E2E A; 1BPX A; 5DG9 A; 5L1I A; 5DG8 A; 1BPE A; 3HKZ C; 3DV9 A; 9ICC A; 8ICY A; 2H5X A; 1ZQW A; 1ZQE A; 2ZIX B; 5T14 A; 4DFP A; 1XNS A; 1IG6 A; 4KMO B; 5JUM A; 1XC9 A; 3I28 A; 3D2S A; 1NJY A; 2KIC A; 4I27 A; 1S5L U; 2K4H A; 5ALF A; 2E1F A; 3BQ0 A; 4RQM A; 1Z3E B; 2JZB A; 5J2J A; 3J81 j; 5L1M A; 2R8H A; 5KFI A; 5JRT A; 3PX6 A; 4KX5 A; 2W04 A; 7ICG A; 4LJX A; 1HJP A; 1TAQ A; 3G6X A; 2Y9U A; 2FLL A; 2I5H A; 2K8A A; 3GFK B; 2UVR A; 4Q8E A; 3KFU F; 4RNM A; 5J2G A; 3L4P A; 2W9C B; 2AQ4 A; 3QUT A; 5KTQ A; 2W9A A; 4O3P A; 3V6K A; 2AJQ A; 4OD0 A; 1WCL A; 2QB0 A; 4KLJ A; 3MR5 A; 2QB0 B; 2ZJ8 A; 3H4B A; 2HBL A; 1IV8 A; 3AQF A; 3UXO A; 2V9W A; 2J6U A; 4P4O A; 8ICW A; 1S0M A; 5HR6 A; 5DBB A; 3WKC A; 2WTF A; 2PFO A; 2VJ5 A; 1ZQI A; 4I28 A; 2KHQ A; 3V72 A; 5J2D A; 4RQ0 A; 2ASL A; 3MBY A; 4YMM A; 2HOF A; 3MGH A; 4O3M A; 5DGB A; 5KFS A; 3LDA A; 3C5G A; 3BS5 B; 1D8Y A; 4C4S A; 3GDX A; 3N7R C; 2RLT A; 3EUB 2; 5ALR A; 5KNI A; 4FZM A; 2ZTE A; 2GWS A; 2YB1 A; 4RPX A; 1O03 A; 3UQ0 A; 2YMM A; 4KLD A; 4I2G A; 3SV3 A; 5J2H A; 4DSL A; 4NL9 C; 3PML A; 5KL1 B; 3SI8 A; 1ZQP A; 2IOF A; 4QW9 A; 3GIL A; 5J8Y C; 2KKP A; 3UXN A; 4I2F A; 4DSJ A; 2H3I A; 1DXS A; 5J0R A; 1SB3 C; 1ZQG A; 4Y2X A; 1ECW A; 4ELU A; 8ICF A; 2FMS A; 3T5H A; 4DO9 A; 4DS5 A; 3QEB Z; 5TZV A; 4UBB A; 1ZQS A; 9ICO A; 3LVV A; 1SV0 C; 1BVS A; 3UMG A; 3G6Y A; 2HBM A; 2XI9 A; 4C8O A; 3PW5 A; 5ALQ A; 3EW9 A; 2E8O A; 3PSI A; 2HHU A; 1L3U A; 4XQ8 A; 3GQC A; 4FS2 A; 3AQE A; 4YFK A; 3Q8M A; 2F76 X; 4O3N A; 2E8P A; 5D4B A; 4EEK A; 3HRD D; 5H2F U; 2ZIW B; 4C8M A; 4BDP A; 2H3Z A; 2EZY A; 4RQ8 A; 1J97 A; 1RZT A; 3N28 A; 2G5H B; 5KFX A; 5J0W A; 3KZI U; 2EDU A; 3M6K A; 5L1J A; 1KTQ A; 3BQ2 A; 5J2F A; 5EE1 A; 5AI9 A; 1QTM A; 7ICI A; 1ZD4 A; 4IQU A; 4PGX A; 1RPL A; 4QZC A; 2ZXI A; 2AH5 A; 5AM1 A; 2W9B A; 3ZDB A; 1Y88 A; 1X66 A; 2CRX A; 5AIC A; 4GXI A; 4RNN A; 1LKY B; 3BQ7 A; 3BQT A; 2AGQ A; 2FLN A; 3KHG A; 5DDM A; 3TAQ A; 2UVU A; 7ICE A; 5AK4 A; 1L5U A; 3LVW A; 4DL7 A; 3UM9 A; 1NJZ A; 2LYB A; 1ZQM A; 2N1R A; 1DGS A; 4QWE A; 2Q0Z X; 3ZDC A; 5GTI U; 2KE7 A; 7ICP A; 1HEK A; 3PW0 A; 5EE0 A; 3HW8 A; 2NO5 A; 4J9Q A; 1NZP A; 2BCQ A; 5L9X A; 4UW9 A; 2MA1 A; 1U45 A; 1P7D A; 4UB5 A; 4LZG A; 5J0U A; 2E1E A; 2DQN B; 4DLG A; 2KJ9 A; 2P6R A; 4PL1 A; 1RXV A; 1NNL A; 2H3V A; 4XRH A; 3AMZ A; 3OHA A; 2A3V A; 3B0X A; 3H7I A; 4O3S A; 7ICH A; 2ZTC A; 4EEY A; 2CPR A; 2ZUB A; 4QZ9 A; 2EZZ A; 1FIQ A; 2OH2 A; 2KN7 A; 1NK0 A; 2DFL A; 4IRC A; 4KLL A; 2E3T A; 4PJ0 U; 4Y2S A; 3RTV A; 5KFG A; 4US8 A; 3PW4 A; 2QAR B; 2B0C A; 4MEY A; 4O3Q A; 3RAX A; 3UMC A; 4QWC A; 1DK3 A; 1N60 A; 4EZ6 A; 5EWG A; 5KG2 A; 3C28 A; 2RRD A; 4GXK A; 2NRT A; 5ALE A; 3QU4 A; 2I1Q A; 1BPB A; 4AYB F; 4QWA A; 3BZK A; 1SZP A; 4M9N A; 1KKX A; 4DL4 A; 2ZIU A; 3PV8 A; 3SQI A; 4DL3 A; 2MAX A; 4F2S A; 3C5F A; 2WF8 A; 1YT3 A; 1S8O A; 3SMV A; 4XUS A; 1L3S A; 1ZQB A; 1BPD A; 5CRX A; 3ALR A; 5KFQ A; 4NL9 A; 1SL2 A; 4M9G A; 3RB3 A; 4PZN A; 4UAW A; 1BPY A; 4YXM A; 1K1Q A; 5KAI U; 4KLO A; 1S10 A; 1RM6 C; 1ZQO A; 5KFB A; 2XO7 A; 5AKH A; 1SL1 A; 2LMR A; 3WKE A; 3BZC A; 4F72 A; 2FI1 A; 1F0M A; 3NTU A; 5F9L A; 3LWM A; 3DEE A; 5DB7 A; 3UMB A; 2A1A A; 3JPN A; 2DKZ A; 4PZO A; 2W8K A; 2JEG A; 5KG7 A; 3EWA A; 5KG5 A; 3SV4 A; 3QUB A; 5KFE A; 4FS1 A; 2NRW A; 4DL6 A; 2Q4T A; 5CEH A; 3MFI A; 9ICB A; 1T94 A; 4IQT A; 4B9S A; 5ALS A; 5DBA A; 4DSK A; 3ICX A; 2JH1 A; 4NLG A; 3HKZ F; 2BHN A; 4A8E A; 1JX4 A; 4DOA A; 4UB3 A; 2ASJ A; 4F5R A; 4I2I A; 4DL5 A; 1YZ7 A; 3TAD C; 1D8B A; 1KEJ A; 1N2X A; 3M1Y A; 3MR2 A; 5L1L A; 4G3I A; 2XGQ A; 2R8K A; 2BKE A; 4DSE A; 2F1I A; 9ICL A; 1S77 D; 4UAR A; 2JGA A; 4XA5 A; 4MFF A; 5J0Q A; 3F53 A; 3TFS A; 1TK0 A; 1NK4 A; 4JMU A; 4J9N A; 2C2E A; 1PVP A; 4MHV A; 2C2R A; 4GLX A; 2F44 A; 4CRX A; 4YD2 A; 2XIC A; 2LI6 A; 5KFR A; 9ICA A; 3T5L A; 5KT2 A; 4P2H A; 1FEZ A; 5ALU A; 1RQL A; 1WG8 A; 3N7P D; 1ZQZ A; 2ATL A; 4IR1 A; 1ZQR A; 9ICH A; 3AEV A; 7ICK A; 1V38 A; 4EX7 A; 3PR4 A; 1ZQT A; 2LM1 A; 2LBO A; 1ZQX A; 2YQE A; 2J6S A; 3OPX A; 1BNO A; 2ZJ5 A; 2AXT U; 1X6J A; 2JZB B; 2KJ5 A; 4JWN A; 1Q46 A; 2D8C A; 4I2A A; 4QW8 A; 2KFZ A; 4P0P A; 2OXO A; 1Z19 A; 3ZDE A; 4ECY A; 5KFJ A; 3RJJ A; 3KKA C; 3AU2 A; 3RBE A; 3H8W A; 3SAH A; 3C2K A; 1ZQQ A; 3RR7 A; 3RJI A; 1U47 A; 4PL2 A; 5KFA A; 4TUQ A; 2OWO A; 1X9X A; 5HP4 A; 4Y2U A; 2XCP A; 4UB4 A; 1NZB A; 1N48 A; 2LKY A; 4O5C A; 2HOQ A; 2XC9 A; 2O6K A; 3AU6 A; 4F5O A; 3ZD9 A; 3MAB A; 2BCR A; 2KJ8 A; 3A0B U; 1LB2 B; 4C8L A; 1L7O A; 3THV A; 2AGO A; 4GC6 A; 3IV6 A; 2BCU A; 2HSZ A; 3KHL A; 4F91 B; 2KZM A; 1ED1 A; 1AQ6 A; 4QWB A; 3QU7 A; 2YMP A; 4MFA A; 2C28 A; 1WCN A; 3IDW A; 2HHV A; 1WWU A; 1XSN A; 2B6G A; 4RT3 A; 5DB9 A; 1JI7 A; 4RNO A; 5IIL A; 4R65 A; 3IN5 A; 4DQS A; 2A19 A; 5DG7 A; 2BQR A; 4UB2 A; 2LHT A; 5J0S A; 4M0A A; 1K5O A; 3AL0 B; 4RPY A; 4C4R A; 1SXD A; 2WHE A; 4ELT A; 1ZQA A; 1MSW D; 4YR2 A; 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4RU9 A; 5HR7 A; 1KFT A; 3FC4 A; 1J2M A; 2ZUC A; 4RQ2 A; 1ZJM A; 2KNJ A; 3V7K A; 3OGU A; 5KT6 A; 2JR5 A; 4BWJ A; 2UVV A; 4O5K A; 1GO3 F; 2F8K A; 4Z6D A; 3F5E A; 3RFA A; 7ICU A; 1D9F A; 1QQ5 A; 1QCK A; 4RQ6 A; 1ZQH A; 2PXI A; 2Y9T A; 5AKX A; 4OJ5 A; 2FMQ A; 3Q8P B; 3AUO A; 2HBK A; 2GO7 A; 1T3N A; 2C22 A; 5AK6 A; 3D6J A; 4RUC A; 1N5W A; 5DBC A; 4I2J A; 1X42 A; 7ICS A; 5AI6 A; 1QLN A; 2F1J A; 5IIO A; 4WJ3 B; 3ZD8 A; 3RB6 A; 4DS4 A; 5AIB A; 1ZJN A; 4YR3 A; 3ONN A; 2BPF A; 2P6U A; 9ICX A; 2YB4 A; 1QQ6 A; 2B21 A; 1Q3U A; 3NVY A; 4X5V A; 3H8M A; 5L1K A; 1COK A; 2D3D A; 1SWW A; 1KLN A; 3PST A; 2F3N A; 3JPS A; 1B43 A; 4I29 A; 4KLM A; 2XY5 A; 4NM2 A; 4R64 A; 2PI5 A; 2DUY A; 2K8B B; 2BDU A; 2W03 A; 4UAS A; 2PKE A; 3C2M A; 3ISC A; 3PO4 A; 3MR3 A; 3T3F A; 1WYG A; 3D2Q A; 3CRX A; 3RJH A; 2JV3 A; 3ED5 A; 4MFC A; 3H40 A; 4BX9 C; 2AGP A; 1XS9 D; 2KP7 A; 2ESE A; 3GV5 B; 2PFQ A; 4Y2V A; 1HUZ A; 4LVS A; 2A1J A; 3RB0 A; 4JV1 A; 2ZTD A; 1JXE A; 2IHM A; 2WF7 A; 3RBD A; 1U48 A; 2K89 A; 2JHD A; 2FLP A; 4KN7 A; 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