The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
78
|
structure length |
78
|
Chain Sequence |
SIALPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILAQA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
E80-TELSAM domain
|
| molecule tags |
Hydrolase regulator
|
| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
19
|
| structure length |
78
|
| sequence length |
78
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Z1V A; 1COK A; 3H8M A; 5JU5 A; 3BS5 B; 3HIL A; 2QB0 A; 2ESE A; 1UCV A; 2B6G A; 1V85 A; 2YTU A; 1JI7 A; 1B4F A; 1SV0 A; 3TAD A; 2QKQ A; 2JV3 A; 1LKY B; 2E8O A; 3K1R B; 4PZO A; 2KMD A; 1OW5 A; 2KE7 A; 4NL9 A; 2KSO B; 4MHV A; 1PK1 B; 5KNI A; 3IDW A; 1X66 A; 3BS5 A; 2D8C A; 1SV4 A; 5J8Y A; 3KKA A; 2Y9T A; 4PZN A; 2E8N A; 5F3X B; 2K60 A; 1LKY A; 4RQN A; 2LPE A; 1PK3 A; 2FE9 A; 1WWV A; 1SV0 C; 3TAD C; 2KSO A; 3BS7 A; 2QAR B; 1PK1 A; 1X9X A; 5JTI A; 1SGG A; 1KW4 A; 4IS7 A; 1SXE A; 2EAP A; 2E8P A; 2F3N A; 3TAC B; 4NL9 C; 2EAN A; 2GLE A; 1V38 A; 1SXD A; 5L1M A; 2F8K A; 3SEI A; 1OXJ A; 2F44 A; 2EAO A; 5J8Y C; 3KKA C; 2ES6 A; 2L5Y A; 2DL0 A; 2QAR A; 5JRT A; 1WWU A; 2QB0 B; 1DXS A; 2QB1 A; 2KIV A; 2DKX A; 1X40 A; 3BQ7 A; 2D3D A; 4NJ8 A; 4RQM A; 2E8M A; 1B0X A; 1RG6 A; 2Y9U A; 2K4P A; 1F0M A; 2LMR A; 2KG5 A; 3SEN A; 2EAM A; 1UQV A; 2DKZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3B0X A; 2W9B B; 3LVW A; 3QUQ A; 5J2H A; 9ICP A; 2JHD A; 4C4T A; 2ZIX B; 2JEI A; 2ESE A; 4R64 A; 1L3V A; 2ALZ A; 2YTU A; 4JWM A; 5AIA A; 4GC6 A; 3ZD8 A; 5L1J A; 5KT3 A; 4I2E A; 2PI5 A; 3IG5 A; 9ICQ A; 2W11 A; 1NK5 A; 5DGB A; 3NGD A; 5KFZ A; 2WF8 A; 2F8L A; 4A8E A; 1L3U A; 2KP7 A; 2BCV A; 3GII A; 5HR6 A; 2W55 A; 4F5P A; 5IIO A; 2HBL A; 2LM4 A; 4GXJ A; 3PW2 A; 4QZD A; 1DRG A; 3V7L A; 1FIQ A; 3ZI4 A; 1K1S A; 8ICZ A; 3H0R B; 4PHP A; 3JPS A; 3SD7 A; 2FMS A; 8ICA A; 3GIL A; 2IMW P; 3JPR A; 2EAP A; 4P4P A; 1NJY A; 2GLE A; 5AKY A; 1SXD A; 1FO4 A; 3PO5 A; 2OEH A; 1OXJ A; 2I6X A; 1SWV A; 3QNM A; 2RDI A; 4F4Y A; 1JMS A; 4FZM A; 5J2I A; 5J2D A; 5KFA A; 1SIJ A; 2QAR A; 4O3R A; 5KG2 A; 9ICB A; 1Q8K A; 2KIC A; 4F4W A; 7ICJ A; 4ECQ A; 2IA6 A; 3C2M A; 4LJX A; 1DOQ A; 3AU2 A; 4QJF B; 1RXV A; 8ICK A; 2XY6 A; 5KT7 A; 5J0U A; 3PML A; 5AI8 A; 3EWA A; 1L7O A; 4I2I A; 2OHF A; 2ZUC A; 3QUC A; 5KFT A; 7ICU A; 1ZXI A; 5AM0 A; 4C8K A; 4B9L A; 2WF7 A; 3B9J A; 4JV1 A; 2M0N A; 3C23 A; 3UMC A; 4GC7 A; 5AHX A; 4Z6E A; 1BGX T; 4B9N A; 4DQI A; 5TZV A; 4TUS A; 4M6W A; 1ZQM A; 1ZQB A; 1ZQQ A; 4EX7 A; 3D2Q A; 4QWD A; 1YZ6 A; 4DSL A; 1JRP A; 4BXO A; 9ICA A; 1BNO A; 5G5G A; 2IBK A; 4F91 B; 4P0P A; 3BS5 A; 4O9M A; 1Q3V A; 2R8H A; 4EYH B; 5KG6 A; 2Y9T A; 3BQT A; 4Y2U A; 3M1Y A; 4F92 B; 2RHF A; 2AGO A; 3RF9 A; 2R8I A; 3THV A; 2W54 A; 4C8L A; 2EDU A; 2IOF K; 5K4L A; 3C2K A; 5H2F U; 2G5I B; 8ICJ A; 2RDJ A; 3MDC A; 3AM9 A; 4F2R A; 2E1E A; 1XWL A; 3V6K A; 3SZ2 A; 1NZB A; 2FPK A; 2VIX A; 3F5E A; 2BHN A; 1BPB A; 4F5O A; 7ICK A; 7ICR A; 1QQ7 A; 3KD3 A; 4FFD A; 4ELT A; 1B22 A; 4F93 B; 3KOO A; 4C0Z A; 4M9L A; 2CN1 A; 1ZRN A; 3H7I A; 2G0A A; 4QNL A; 3NVZ A; 5IIL A; 1ZQF A; 2BCU A; 4DFM A; 1ECW A; 1ZQT A; 2FPL A; 3AUO A; 4WJ3 B; 2MA1 A; 4P4M A; 2FLL A; 2W9A A; 4YFK A; 2Y9U A; 1A77 A; 2K4P A; 4M2Y A; 5AK5 A; 5EWE A; 2HHW A; 2YMM A; 2K4E A; 4LZD A; 2WB1 C; 3SV4 A; 4HAI A; 2NRV A; 4EEY A; 1TK0 A; 3EYZ A; 3GQC A; 1L3S A; 3PR5 B; 2OH2 A; 5AKE A; 3L3F X; 5AKZ A; 2PFO A; 1VDV A; 5KT2 A; 3TAP A; 3GDX A; 2E8O A; 3K1R B; 5T14 A; 4B9U A; 3EPG A; 2F77 X; 5J2G A; 2XCP A; 3TFS A; 5J0P A; 4F50 A; 3NRZ A; 1Z00 A; 5ALN A; 2CRX A; 5AI5 A; 1BPY A; 3CYM A; 4DQQ A; 3BQ1 A; 9ICJ A; 1KDH A; 2KZM A; 3M6Z A; 4Y2S A; 4O3S A; 4DF8 A; 3GIK A; 7ICM A; 4F8R A; 1PVP A; 1Z4N A; 2JZB A; 2JZB B; 3G6Y A; 4JMU A; 2JH7 A; 3ZDE A; 1AQ6 A; 5F9L A; 4F4X A; 4ED1 A; 5KTQ A; 1ZQK A; 2VAN A; 8ICO A; 2HHV A; 1NI3 A; 4EZ6 A; 1ZQL A; 4QIW F; 4C4R A; 3SQI A; 2RRD A; 2F8K A; 5J2J A; 1KQQ A; 3RJE A; 5B5E U; 4USA A; 4ACO A; 2YQE A; 5III A; 3MR6 A; 4BUG A; 4AYB C; 4M04 A; 4NM2 A; 2G06 A; 2PKE A; 5KG7 A; 4YQW A; 3TKA A; 2DPI A; 2A1A A; 5DB7 A; 3A0B U; 2ZIW B; 4UB4 A; 2UVU A; 1UA0 A; 4U7C A; 3H40 A; 2ZJA A; 1V9P A; 5E79 U; 5AM3 A; 4R63 A; 2W04 A; 5KFU A; 4BDP A; 1GO3 F; 3SEN A; 1IXR A; 4NXZ A; 3RJK A; 2K8C B; 1L7P A; 3F2C A; 3BDP A; 2XGP A; 1S76 D; 3J81 j; 3CRX A; 4J9M A; 3SV3 A; 1HIW A; 1SV0 A; 4DSF A; 4UB3 A; 3AU6 A; 3B0Y A; 5J0O A; 3L5K A; 3PSI A; 2YMP A; 2KMD A; 2ZJ8 A; 3QXG A; 3UXP A; 3QZ8 A; 1T3N A; 1XSP A; 2XVT A; 4LVS A; 5J0S A; 4P2H A; 1WCL A; 2VKQ A; 1N61 A; 4C7Z A; 4O3M A; 1N56 A; 7ICE A; 3V6J A; 4J9P A; 1SKW A; 2W03 A; 1SL1 A; 2GO7 A; 2K60 A; 2XCA A; 3OJU A; 2BQR A; 4DQR A; 4FE3 A; 3ISC A; 5DGA A; 9ICK A; 2KFZ A; 3UXO A; 4KLD A; 4NLN A; 1ZQO A; 1N5X A; 2FI1 A; 4YN4 A; 2W8K A; 1C7Y A; 4O3Q A; 4IR1 A; 5GTI U; 3PSF A; 3SEI A; 5J2B A; 5AM1 A; 2JXJ A; 5DDM A; 2OCE A; 1X9M A; 4CDG A; 3C1Y A; 2HOF A; 3WU2 U; 4DSE A; 4M9J A; 3QEA Z; 3C1Z A; 4BJQ A; 3LK9 A; 7ICF A; 7ICG A; 4KLF A; 4F5R A; 1X6J A; 2QB0 B; 2BZF A; 4UB8 U; 3QE9 Y; 4OJL A; 1HEK A; 4CF4 A; 5G5H A; 2Y1J A; 4RT3 A; 5AM4 A; 2AH5 A; 2NRX A; 3UQ2 A; 4XA5 A; 8ICW A; 5J29 A; 2KEY A; 4ED8 A; 2WB1 F; 2NRW A; 3RRH A; 4Y2Q A; 8ICV A; 3NVW A; 5ALH A; 4YG2 A; 1S0O A; 2BDP A; 4U6P A; 4ZH4 A; 2KKP A; 5JU5 A; 3F2D A; 3UQ0 A; 4DL6 A; 4YMM A; 3A0H U; 3MR2 A; 2Y1I A; 4KLH A; 1F5S A; 4RQ2 A; 1ZD2 P; 3FAH A; 4RQ0 A; 3BZK A; 2W7O A; 1C20 A; 3VCB A; 3ZD9 A; 2C22 A; 3T5K A; 1U49 A; 5KFC A; 2KVC A; 3H4B A; 4NWI A; 2G5H B; 4K4I A; 3MDA A; 3T3F A; 3S6J A; 4QZH A; 4P0Q A; 2NYV A; 5C5J A; 2AQ0 A; 1S0N A; 2NO5 A; 2BQ3 A; 5L1L A; 2A1J A; 4OJP A; 8ICX A; 4R66 A; 1LKY A; 4I2A A; 2P6U A; 2KZZ A; 3BJY A; 5AI9 A; 5KFM A; 2FE9 A; 1CEZ A; 1WYG A; 3Q8L A; 8ICN A; 2W3S A; 1XSL A; 3WKD A; 3AQF A; 4Y2J A; 2ZIU A; 1OUQ A; 4KN7 A; 1K5O A; 2ZIV A; 2ZIV B; 3H0L B; 3NS1 A; 1ED1 A; 4R8U A; 2GWS A; 3V7J A; 7ICS A; 2UVR A; 4ED0 A; 3I28 A; 3MGI A; 1JXL A; 4ED7 A; 2BGW A; 2C2R A; 5JRT A; 3PO4 A; 1TK8 A; 4YVZ A; 3Q8M A; 1YT3 A; 2DFL A; 2YX8 A; 3WKA A; 4NM1 A; 1N5W A; 3NRW A; 4F2S A; 1Q3U A; 2IHN A; 1PZN A; 7ICH A; 5ALE A; 5DLG A; 4B9T A; 4DL5 A; 3NAS A; 1ZQD A; 4Y2V A; 3QYP A; 4O3N A; 5EE1 A; 5L9X A; 5CA7 A; 2KJ9 A; 4TUQ A; 3RAQ A; 3C21 A; 1XS9 D; 3ISD A; 1JI7 A; 3M8S A; 5AKK A; 4MF8 A; 4RNO A; 3RBD A; 5KFH A; 4NV0 A; 4Y2X A; 1H38 A; 4J9N A; 4EEK A; 3BQ2 A; 3RJH A; 4X5V A; 4DOB A; 2W9B A; 2Q0Z X; 1T3Q A; 2FJ6 A; 4F3O A; 2ZIX A; 2D8C A; 3C28 A; 3I1Y A; 2GOL A; 4J03 A; 3D2N A; 2AGP A; 2DF4 B; 5HHH A; 3JPP A; 4PJ0 U; 4PGQ A; 1NKB A; 1CRX A; 3FC4 A; 4RPX A; 5AKX A; 1MQ2 A; 4Y2T A; 5EWF A; 1D8B A; 1RQL A; 1SGG A; 2DGZ A; 2LI6 A; 2ZTD A; 2KD1 A; 3E58 A; 4UAR A; 1S8O A; 4NL9 C; 5DBC A; 5DB6 A; 4QZF A; 2HHQ A; 4YR3 A; 4ECS A; 4DLG A; 4IR9 A; 5KFV A; 2F1H A; 5KFS A; 2OYY A; 4IL6 U; 5J8Y C; 5DBB A; 5J2K A; 1SB3 C; 3M9N B; 2J6T A; 2KIV A; 2AXT U; 2WTF A; 4KMU A; 4O5E A; 2I9G A; 4NJ8 A; 1A76 A; 1RYU A; 1ARO P; 2G09 A; 4GXI A; 3IHQ B; 9ICO A; 4QIW C; 3RH4 A; 1COK A; 1LB2 B; 5KFI A; 3M7D A; 4MEX A; 4KLU A; 4CF3 A; 1RPL A; 4MFF A; 4KLQ A; 1D9D A; 1NK4 A; 2BPF A; 4AP9 A; 3QU9 A; 2WF9 A; 1QQ6 A; 4KLG A; 2V4R A; 4ZOH C; 4ECT A; 2KHV A; 1S9F A; 1LVH A; 4PPX A; 4KN4 A; 5CB1 A; 1L8O A; 2IHM A; 3QU7 A; 1XO0 A; 3BQ0 A; 2RP5 A; 3N97 B; 5AM5 A; 2AU0 A; 4FBU A; 4FS2 A; 4DL3 A; 1HJP A; 2E8N A; 5C0Y A; 5ALP A; 2ZXI A; 4IQV A; 2LPE A; 1MSW D; 5CHG A; 8ICR A; 2JRZ A; 2IOH A; 3WK7 A; 4ECY A; 4DL2 A; 4QZC A; 4J9R A; 4P4O A; 4RPY A; 5JTI A; 1X9W A; 1S10 A; 1KW4 A; 1T4G A; 4RT2 A; 5AM2 A; 3SYZ A; 1JX4 A; 3LWM A; 1KRP A; 3RJG A; 2HI0 A; 4RNN A; 2I5H A; 1IIP A; 2JGA A; 5J0T A; 1ZQW A; 3ORY A; 9ICV A; 3KKA C; 2MAX A; 2H3I A; 7ICP A; 8ICI A; 4QZB A; 3PV8 A; 8ICU A; 2P6R A; 4EX6 A; 1ZQU A; 3HPO A; 5KFQ A; 1JRO A; 5J2E A; 2KJ5 A; 3HX0 A; 2F1J A; 5L1I A; 1RG6 A; 3L4P A; 2H3F A; 4I2C A; 1KL9 A; 8ICH A; 3WKB A; 1FFV A; 3M9M B; 5DDY A; 2RLT A; 2DKZ A; 4YD1 A; 5DBA A; 4BGD A; 3V6H A; 4MF2 A; 3WK6 A; 8ICF A; 2KJ8 A; 4YD2 A; 5F9N A; 4JB3 A; 4NLK A; 2BDU A; 2YN4 A; 5J2F A; 2Q4T A; 5EE9 A; 2B6G A; 4FBT A; 3PR4 A; 2IOF A; 1V85 A; 3GV5 B; 2HVH A; 5KG3 A; 5AI0 A; 5DG7 A; 5KFY A; 1RYR A; 2LBO A; 7ICN A; 5DQI A; 5ALT A; 1ZYQ A; 1JIH A; 4DLE A; 4CNQ A; 4RQ7 A; 2B0C A; 3QX7 A; 1QSL A; 4KIT B; 2O6K A; 2G07 A; 4ECW A; 2P35 A; 1S0M A; 4F71 A; 1ZD5 A; 1JN3 A; 1XU4 A; 5JUM A; 4YXM A; 2EZY A; 1N2X A; 4PZN A; 2PMZ C; 2PFQ A; 1S77 D; 1QH9 A; 4BWM A; 5ALZ A; 4M9G A; 3E0F A; 5AKH A; 1URJ A; 3TAN A; 4MEY A; 3TAD C; 4R65 A; 9ICN A; 1PVQ A; 2KTQ A; 5ALS A; 2HHS A; 1L3T A; 5ALJ A; 4QWA A; 2E5S A; 1KBU A; 4DS5 A; 4PH5 A; 5CWR A; 9ICI A; 4OCZ A; 2JEF A; 4IQW A; 2ZTC A; 1PVR A; 2DPJ A; 3RJI A; 2R8G A; 5DG8 A; 4ICA A; 1ZD3 A; 3IRU A; 4J9O A; 4RQ1 A; 4OJO A; 2VA2 A; 8ICL A; 1L7M A; 3NUQ A; 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4XQ8 A; 2EAM A; 1X9S A; 1J2M A; 2DQN B; 4KLS A; 5HMM A; 3RBE A; 4UAY A; 1Y88 A; 3KTQ A; 2ZXH A; 4DL4 A; 3Q8Q B; 1ZRM A; 3HJE A; 3RJF A; 4US9 A; 3HIL A; 2QB0 A; 4JUZ A; 3CNH A; 4C7Y A; 5KFB A; 4UAZ A; 4CCH A; 3KZX A; 1VLB A; 3ETL A; 3RH5 A; 1ZQC A; 3WK4 A; 2J6S A; 1ZQS A; 5KG4 A; 9ICF A; 1U47 A; 4LZG A; 2WHE A; 1UT5 A; 3ISB A; 9ICX A; 1PK1 B; 2W8L A; 4RQ3 A; 2PMZ F; 2WF5 A; 1B43 A; 1T94 A; 4M47 A; 4IC9 A; 1KFT A; 5CP2 A; 4KLE A; 2EZZ A; 1NK0 A; 5IIK A; 2FLP A; 4C8M A; 2BCS A; 2V9W A; 1T8E A; 1RM6 C; 1DGJ A; 4XUS A; 9ICC A; 4IRK A; 4F5Q A; 4QZ8 A; 5DB9 A; 3GIJ A; 3JPQ A; 3NTU A; 3UMG A; 4QWE A; 4EEL A; 1V38 A; 1Z4O A; 5ALM A; 4CE6 A; 4E0D A; 3PW7 A; 4BX9 C; 4OD0 A; 3UM9 A; 1JUD A; 5J0W A; 5BOL A; 2AHO B; 4Q45 A; 1N60 A; 1U9L A; 3OSN A; 5CJ7 A; 1U45 A; 1NK9 A; 2DKX A; 1JAL A; 5AIB A; 7ICL A; 3ED5 A; 2D3D A; 2HOQ A; 5DKW A; 2KIW A; 4Q43 A; 2ASJ A; 4O5K A; 1NKC A; 5KG1 A; 2KOB A; 3QU2 A; 2R8K A; 4O5C A; 2BR0 A; 4UAT A; 5BOM A; 3QUB A; 3RB3 A; 4QW8 A; 1IM4 A; 1UCV A; 1L7N A; 4Y2R A; 3PW5 A; 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