The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
SLVSFLTGLGCPNCIEYFTSQGLQSIYHLQNLTIEDLGALKIPEQYRMTIWRGLQDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Gene regulation
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Structure of the C-Terminal Sterile Alpha-Motif (Sam) Domain of Human P73 Alpha
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
P53-LIKE TRANSCRIPTION FACTOR
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| total genus |
18
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-01-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2EAO A; 1PK1 A; 4NL9 A; 3K1R B; 1WWU A; 3SEI A; 1B4F A; 2FE9 A; 4PZN A; 2ES6 A; 4RQM A; 2E8M A; 2B6G A; 1X9X A; 5JRT A; 1SXE A; 1X66 A; 2ESE A; 3BS5 A; 2E8P A; 2DL0 A; 2KMD A; 5JTI A; 5J8Y C; 3TAD A; 2QAR B; 1UQV A; 2QAR A; 5JU5 A; 1PK1 B; 4PZO A; 5J8Y A; 2L5Y A; 5KNI A; 2F8K A; 1SGG A; 3KKA C; 2QKQ A; 4RQN A; 2K60 A; 2E8O A; 2K4P A; 3TAD C; 3BS5 B; 3KKA A; 1V85 A; 3HIL A; 2E8N A; 2F44 A; 2QB0 A; 4MHV A; 3IDW A; 1JI7 A; 2DKX A; 2D3D A; 1X40 A; 2JV3 A; 3BQ7 A; 3SEN A; 1KW4 A; 2YTU A; 1SXD A; 2F3N A; 3H8M A; 1Z1V A; 1F0M A; 2DKZ A; 2EAP A; 2QB1 A; 1RG6 A; 2EAN A; 2QB0 B; 1COK A; 2Y9T A; 1V38 A; 1OXJ A; 1SV4 A; 2LMR A; 2D8C A; 1SV0 C; 3BS7 A; 1UCV A; 2KG5 A; 5F3X B; 2KSO B; 2EAM A; 2KSO A; 2KE7 A; 1SV0 A; 1LKY B; 1LKY A; 3TAC B; 1DXS A; 4NJ8 A; 5L1M A; 2KIV A; 1OW5 A; 2GLE A; 1PK3 A; 4NL9 C; 1B0X A; 2LPE A; 4IS7 A; 2Y9U A; 1WWV A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1CI4 A; 2HHW A; 1PK1 A; 5HHI A; 4KX3 A; 1ZQ1 C; 2B6G A; 4I28 A; 1X9X A; 3BDP A; 1K1S A; 4M9G A; 2RDI A; 3H8S A; 3A0B U; 1UT8 A; 5G5H A; 4RU9 A; 1S5L U; 4UB5 A; 3GIJ A; 4QW9 A; 1ZQX A; 4DSF A; 2NYV A; 4KLF A; 2GH1 A; 1GO3 F; 3K1Z A; 4Y2Q A; 3GU3 A; 4TUS A; 2J6U A; 4NLC A; 5D49 A; 4DS5 A; 2BGW A; 3M9N B; 4FZN A; 4DLE A; 2K4P A; 3M8S A; 4JK1 A; 1ZQR A; 3SV4 A; 3QEB Z; 5AM0 A; 1S8O A; 5KFO A; 4GIB A; 2ZUD A; 4QZ9 A; 3RB3 A; 2FLP A; 2V9W A; 5FP0 A; 4NM2 A; 2OCE A; 2LI6 A; 4E0D A; 2KKV A; 2RHF A; 5ALQ A; 1ZRM A; 1BPD A; 4UB8 U; 2W03 A; 4Q8E A; 8ICE A; 8ICA A; 1DRG A; 1SWV A; 2PMZ C; 2HMX A; 5KFD A; 4HAI A; 4F5O A; 3R9K A; 4R8U A; 5KFL A; 1Z1V A; 2DKZ A; 2QB1 A; 4EZ9 A; 4QZD A; 2EZY A; 4DWI A; 5J0Q A; 9ICB A; 3F2D A; 4ACO A; 2FLN A; 3HP6 A; 4I2J A; 3D2S A; 2VA2 A; 3TKA A; 2ISP A; 2K89 A; 3C1Y A; 4OCZ A; 3ZDE A; 5AIC A; 3JPT A; 3HWT A; 2XY6 A; 1LKY B; 2W8L A; 1KDH A; 5L1M A; 4Y2S A; 4KLT A; 2WHE A; 1U47 A; 1N48 A; 4O5E A; 1FFV A; 5AM2 A; 4MFA A; 2HHQ A; 2G0A A; 5AI0 A; 1Z1B A; 1N60 A; 3RR8 A; 4LZD A; 3FAH A; 3C2L A; 5KFM A; 4IL6 U; 1IV8 A; 3C21 A; 2ATL A; 1NZB A; 3EPG A; 3V7L A; 4RUC A; 4Z6D A; 4EEY A; 3MDC A; 2XCA A; 1N63 A; 1L3T A; 1N2X A; 2ZIW A; 3RH5 A; 5ALF A; 2JEG A; 1SGG A; 1S0V A; 4I2C A; 5AM1 A; 2QKQ A; 3KD3 A; 5L9X A; 2CN1 A; 2E8O A; 7ICL A; 4LJX A; 3AQF A; 2KVS A; 3QX7 A; 3Q8K A; 5KFV A; 4ZOH C; 4UAR A; 3SV3 A; 3UMB A; 4KLE A; 4OJP A; 2OEH A; 2HBK A; 3PR4 A; 5KFZ A; 2K4H A; 1Q46 A; 2XGP A; 3GIM A; 1L7P A; 1IG6 A; 5J0W A; 3RJJ A; 1ZQA A; 2WB1 F; 3WK7 A; 4GFJ A; 4UQG A; 1KFT A; 4R8U B; 3AQE A; 3PW7 A; 3QZ8 A; 1D9F A; 1MC8 A; 4I2D A; 4Y2P A; 4M9H A; 4CNQ A; 4J9Q A; 5AKY A; 4BX9 C; 2HHS A; 4TQR A; 1S77 D; 1SV4 A; 4ECU A; 4B9U A; 4RT3 A; 2AGP A; 3AU6 A; 4P4P A; 3TAN A; 2W8K A; 1QQ6 A; 5G5G A; 3GV7 B; 4ECR A; 5J0T A; 4FZL A; 4UB3 A; 4OO1 J; 4NWI A; 3NVY A; 3RB6 A; 3QEA Z; 5AK4 A; 2KK0 A; 3MR2 A; 3TFR A; 9ICR A; 4BXO A; 2EAO A; 4JMU A; 5T14 A; 4YMN A; 4KMO B; 9ICX A; 2KOB A; 2FE9 A; 1ZQP A; 4F3O A; 1HEK A; 3C5F A; 4F8R A; 2BPC A; 5KL8 B; 2LBO A; 2I6X A; 5KT2 A; 2WF6 A; 5CRX A; 4DL3 A; 2PFQ A; 4TUQ A; 3QUQ A; 4RZR A; 3T79 A; 2QAR A; 2JGA A; 1L8L A; 3ZDD A; 2H3Z A; 2FPK A; 2ZIW B; 5J0U A; 3H0R B; 4OJ5 A; 2GWS A; 4F4K A; 2GO7 A; 3UQ0 A; 1SL2 A; 5KTQ A; 4RQN A; 4LVS A; 1MN8 A; 2XCP A; 1BNO A; 3B9J A; 4P0Q A; 3ISB A; 1QQ5 A; 4GXK A; 4MHV A; 9ICK A; 2RP5 A; 4FFD A; 2AHO B; 8ICB A; 1BPX A; 4JV0 A; 2XGQ A; 1FO4 A; 5AI5 A; 4QZF A; 1KW4 A; 3RR7 A; 3QZ7 A; 1SZH A; 2HI0 A; 2KZM A; 5F9L A; 3EUB 2; 5K4L A; 1ZQT A; 1S0M A; 1T3Q A; 2Y1J A; 4EBE A; 2KIC A; 5L1K A; 4J9N A; 3Q8R B; 2OYY A; 1ZQW A; 2XI9 A; 2FPL A; 5KG2 A; 3V7K A; 8ICY A; 3F2C A; 4PHP A; 2KEY A; 2EAM A; 5J0O A; 4KLO A; 1T94 A; 3KHL A; 2WF5 A; 1LVH A; 5KFU A; 1ZD4 A; 3A0H U; 2W9C A; 5KFG A; 1ZQS A; 4O3M A; 4KLM A; 3CW2 C; 5E79 U; 4PL1 A; 4F71 A; 4BXO B; 2KTQ A; 3GIL A; 4QWC A; 4GLX A; 4RQM A; 5EOZ A; 2JH1 A; 4DSE A; 4IR9 A; 2N1R A; 4ED3 A; 1SXE A; 1UA0 A; 4YCX A; 2E8P A; 3UQ2 A; 1QH9 A; 2RQ5 A; 5DDY A; 2QAR B; 3GQC A; 3NRW A; 4F92 B; 7ICO A; 1S10 A; 1TAM A; 3OGU A; 2YY6 A; 1X9S A; 5IIM A; 4R66 A; 4ICA A; 4ED0 A; 3V72 A; 1B22 A; 4Y2Y A; 4O5K A; 4OD0 A; 5HR6 A; 5GTI U; 4P0Q B; 3IG8 A; 2BCV A; 3BZC A; 4CRX A; 2JEJ A; 4RQ6 A; 4I2I A; 1HIW A; 1KRP A; 5CEH A; 2AU0 A; 1PVP A; 2B0C A; 4DF8 A; 2JHD A; 2A1A A; 4M0A A; 1JXL A; 5HR7 A; 2VA8 A; 4YD1 A; 4F4Z A; 1QSY A; 2KKP A; 3QU5 A; 5A0L A; 1BPZ A; 8ICF A; 3HKZ F; 5ALH A; 2OWO A; 5J0Y A; 4QZG A; 4QZ8 A; 3C2K A; 5J29 A; 4MEX A; 3ZDA A; 4QZC A; 3KTQ A; 3FM9 A; 3NGD A; 5F3X B; 7ICF A; 4Y2T A; 5AIB A; 1DGJ A; 3MDA A; 3I28 A; 8ICH A; 5DB8 A; 2KV2 A; 3PMN A; 4PJ0 U; 3C2M A; 5J0P A; 2W9C B; 1SWW A; 3M6Z A; 4O3P A; 2ODG A; 3DV9 A; 4QW8 A; 5KFN A; 4RQ8 A; 4UBB A; 3WKC A; 4YMM A; 7ICJ A; 1U9L A; 4C0Z A; 2IOH A; 2YMP A; 1ZQG A; 3BQ1 A; 1LB2 B; 3AL0 B; 2K8C B; 4FE3 A; 3ISC A; 3EZ5 A; 1ZQY A; 2Z7J A; 4B9N A; 5KFK A; 3CRX A; 2LKY A; 4M2Y A; 1V9P A; 4M47 A; 4CGZ A; 2NRV A; 1BPB A; 2AGO A; 2P6R A; 4USA A; 4UBC A; 2C2E A; 4YQW A; 4RUA A; 2ASD A; 2A3V A; 3ZD9 A; 2YX8 A; 3ED5 A; 5ALI A; 4AP9 A; 3C5G A; 1SKR A; 4O5C A; 1S9F A; 2B21 A; 4FO6 A; 2DUY A; 2ZIU B; 4DQR A; 3N97 B; 1ZJM A; 3TAD C; 2ZUC A; 3PR5 B; 1DOQ A; 5AKG A; 5AHX A; 5AK5 A; 5J2B A; 2H3F A; 2Y1I A; 4DQP A; 1ZQM A; 4QZE A; 5L1J A; 2AGQ A; 2MUT A; 3BQ7 A; 2IHM A; 4EX6 A; 3UXN A; 4BDP A; 2FDR A; 2YTU A; 2OH2 A; 2UVV A; 2A19 A; 9ICI A; 4UAW A; 3TFS A; 1D9D A; 1RYU A; 2JH7 A; 1Z4O A; 5KFB A; 2EDU A; 1A6S A; 3QU9 A; 1X9W A; 1LV5 A; 4DF4 A; 2MAX A; 2Y9T A; 3KHG A; 2BCS A; 7ICQ A; 2F2A B; 3UXO A; 3WKA A; 4NLZ A; 2P6U A; 5KFW A; 3EPI A; 2BQR A; 4RQ3 A; 4ECZ A; 3MR5 A; 2FLL A; 3JPS A; 2NO5 A; 4ELT A; 2E1F A; 1O03 A; 4UAZ A; 1L7M A; 5AM4 A; 7ICR A; 4NJ8 A; 2HW3 A; 1OW5 A; 1NJZ A; 3ETR A; 1COO A; 1EXN A; 3JPP A; 7ICS A; 2BDP A; 4PZN A; 5ALT A; 4UAT A; 5BOL A; 4C7Y A; 5BOM A; 2BCR A; 2RRD A; 4QIW F; 1TK5 A; 4QNL A; 3VC8 A; 4ZH4 A; 1ZQF A; 1L3U A; 1A0P A; 3IP4 B; 4FS2 A; 2KMD A; 4Y2X A; 4J9M A; 1ZQJ A; 2VIX A; 5JU5 A; 1ZQI A; 4F4Y A; 4O3N A; 3QUT A; 4F2S A; 1HJP A; 4KLH A; 4P0P A; 4O3S A; 1QQ7 A; 3EYZ A; 4O0I A; 2L5Y A; 2JR5 A; 7ICE A; 1S97 A; 3SMV A; 2KHQ A; 4PH5 A; 4F5R A; 4OJO A; 4KN4 A; 3QNM A; 4I2A A; 2PI5 A; 5KG6 A; 3QYP A; 9ICF A; 1KFS A; 3TAR A; 7ICN A; 4ED8 A; 1ZD2 P; 4BWJ A; 1JI7 A; 3LDA A; 2F76 X; 2MUT B; 4ECS A; 3FYH A; 4P4O A; 4PGQ A; 5IIN A; 1BNP A; 2HVI A; 1ED1 A; 1RQN A; 2Y0S C; 3MR3 A; 5KFH A; 4I2H A; 2UVW A; 4TUP A; 4YP3 A; 3Q8S B; 5KT7 A; 4KTQ A; 2I1Q A; 2QB0 B; 3ZDC A; 3N28 A; 9ICN A; 4B9L A; 1V38 A; 3GV5 B; 1MA7 A; 2VJ5 A; 8ICN A; 1ZQD A; 2R8J A; 4J9O A; 1NK8 A; 5IIO A; 4DQQ A; 8ICX A; 2F1I A; 3F5A A; 4Z6C A; 1XC9 A; 1TVA A; 1D8Y A; 4Q44 A; 4FS1 A; 3D2Q A; 4B9T A; 1WG8 A; 2KNJ A; 3V6H A; 2GLE A; 1L5U A; 2P66 A; 4YR0 A; 4JV2 A; 3RH6 A; 8ICT A; 2XVT A; 3K1R B; 3NVV A; 1ZXI A; 2ES6 A; 1MQ3 A; 2KVC A; 4UB2 A; 1BPE A; 4KN7 A; 5TZV A; 5L1I A; 1NOM A; 3QU7 A; 8ICM A; 5IIL A; 5EWG A; 1Z4N A; 4IQV A; 4P0P B; 4RQ4 A; 9ICP A; 5KFY A; 3WK9 A; 1YZ7 A; 3RJG A; 1PK1 B; 4R64 A; 1U48 A; 3WKB A; 4IRK A; 4ECV A; 4EBC A; 9ICV A; 2K60 A; 2WF7 A; 4NLK A; 1X9M A; 3KKA A; 3BJY A; 1XSN A; 8ICQ A; 1JUD A; 2BCQ A; 4M6W A; 1MQ2 A; 3NVZ A; 3WK8 A; 4F5Q A; 3RJH A; 4I2G A; 3RJF A; 2W9B A; 2LM4 A; 4R65 A; 4BGD A; 5DB6 A; 2KD1 A; 4PHE A; 4O3O A; 2YMM A; 7ICT A; 1F0M A; 4Y2R A; 4YMO A; 3GDX A; 4C8N A; 8ICG A; 3OHA A; 4DSI A; 3L4P A; 5IIK A; 5CP2 A; 1O08 A; 5KT3 A; 5DLG A; 4GXI A; 3D2N A; 2R8I A; 3SAF A; 4XQ8 A; 3TAC B; 3KHH A; 4DLG A; 2KIV A; 3LVW A; 3PW2 A; 3H8W A; 3GIK A; 1NJY A; 4DSL A; 4IS7 A; 5CHG A; 4RNM A; 5KFR A; 3C29 A; 4LZG A; 3LYS A; 9ICA A; 2PFN A; 2WF9 A; 4NL9 A; 4OJ6 A; 1P7D A; 1QTM A; 5KG1 A; 5AKX A; 2ESE A; 1ZQU A; 3T5L A; 3U26 A; 4KLD A; 4B9S A; 4KLG A; 2ALZ A; 2OM6 A; 3DDH A; 4CCH A; 3PX4 A; 1H38 A; 1J2N A; 8ICK A; 1N56 A; 3ZI4 A; 4RNN A; 5EE1 A; 2KHV A; 9ICJ A; 3RH4 A; 2DGZ A; 3RBD A; 3K4G A; 4P4M A; 1ZQC A; 8ICU A; 2W55 A; 3PW5 A; 1BVS A; 5ALD A; 5ALO A; 4KLJ A; 2NRT A; 3MFI A; 2MA1 A; 2LYB A; 3M1Y A; 5DQH A; 3KZI U; 4M6W B; 5HP4 A; 3OJS A; 3FDS A; 2BPF A; 3PX6 A; 5ALX A; 2W9B B; 3GV8 B; 3UXP A; 4F50 A; 2BPG A; 1KL9 A; 2H3Q A; 2LYH A; 4YR2 A; 4QZA A; 3HW8 A; 4ED2 A; 4B9M A; 4PHA A; 4XRH A; 4J9P A; 4EEL A; 1N61 A; 4MF8 A; 1ZQQ A; 4JWN A; 9ICG A; 3SAH A; 2WAQ C; 1X42 A; 3PSI A; 3MC1 A; 3B0Y A; 3M8R A; 1TV9 A; 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2PFP A; 5ALL A; 2W04 A; 4US9 A; 5J0R A; 1OUQ A; 3C23 A; 1D8L A; 4NL9 C; 2P35 A; 4KLU A; 5J2C A; 3SR6 A; 3JPR A; 1AQ6 A; 4Y2U A; 5KG4 A; 4GXJ A; 5ALU A; 3RBE A; 1ZD3 A; 1Q8K A; 4WJ3 B; 5ALR A; 8ICP A; 1CEZ A; 2R8K A; 1FEZ A; 2HDO A; 2ZIV B; 4I27 A; 2WFA A; 5KT5 A; 4EEN A; 1FIQ A; 3BS5 A; 4XUS A; 2G07 A; 2KJ9 A; 5KG0 A; 3UMC A; 1RDF A; 5H2F U; 5J2E A; 2E1E A; 3C1Z A; 4DL4 A; 4M9N A; 1N62 A; 5KFX A; 1NK9 A; 2E3T A; 3JPN A; 1QLN A; 3M7D A; 2V4Q A; 8ICJ A; 2F8K A; 1RXW A; 1UPH A; 1J2M A; 1TKD A; 3VCB A; 3QE9 Y; 4R63 A; 9ICW A; 3IG5 A; 4G9B A; 4Y2V A; 1CUK A; 2AQ0 A; 4QZB A; 3KBB A; 1XWL A; 4CF3 A; 1RYS A; 2WF8 A; 2KZ3 A; 3HRD D; 2ASL A; 3M6K A; 1XS9 D; 3T3F A; 4MFC A; 9ICC A; 3Q8Q B; 2OXO A; 4ECY A; 3RJE A; 3TI0 A; 2HBJ A; 1SXD A; 4FBU A; 9ICS A; 3WU2 U; 1Z00 A; 2EAP A; 2W9M A; 4P2H A; 7ICH A; 2F1H A; 5KFQ A; 2O6K A; 2KFZ A; 3GZF A; 3QXG A; 5J2K A; 4PPX A; 1ZQV A; 4IQU A; 1K1Q A; 2G5I B; 3OSP A; 2KSO A; 2WTF A; 4G3I A; 7ICM A; 1IXR A; 4K4G A; 3LWL A; 4NLN A; 2ZUB A; 2ZTC A; 4DQS A; 4YD2 A; 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