The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
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sequence length |
82
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structure length |
82
|
Chain Sequence |
PLGSDGLPLDPRDWTRADVWKWLINMAVSEGLEVTAELPQKFPMNGKALCLMSLDMYLCRVPVGGKMLYRDFRVRLARAMSR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transcription
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| source organism |
Drosophila melanogaster
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| publication title |
Derepression by depolymerization; structural insights into the regulation of yan by mae.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Ets DNA-binding protein pokkuri
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| total genus |
27
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| structure length |
82
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| sequence length |
82
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-03-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3BS7 A; 3SEI A; 5JRT A; 1WWU A; 2QAR B; 4NL9 C; 2EAP A; 2LMR A; 1UCV A; 1X66 A; 2QAR A; 2GLE A; 2K60 A; 1DXS A; 5F3X B; 3TAD A; 2B6G A; 1B0X A; 3TAD C; 1UQV A; 2KSO B; 2JV3 A; 1Z1V A; 1SGG A; 2EAN A; 1SV4 A; 1JI7 A; 2KSO A; 2K4P A; 4NJ8 A; 1SXE A; 3SEN A; 5L1M A; 1PK3 A; 4PZO A; 2Y9U A; 1V85 A; 5J8Y A; 2KIV A; 3BS5 B; 2QKQ A; 4IS7 A; 2Y9T A; 3BQ7 A; 5J8Y C; 1V38 A; 1WWV A; 2E8M A; 5KNI A; 2KG5 A; 3BS5 A; 1SV0 A; 2D8C A; 1SV0 C; 2L5Y A; 5JU5 A; 1X9X A; 2E8O A; 2E8N A; 1SXD A; 2KE7 A; 1PK1 B; 2EAM A; 4PZN A; 2E8P A; 1OXJ A; 1PK1 A; 2F44 A; 1KW4 A; 3HIL A; 2ESE A; 2F8K A; 4MHV A; 5JTI A; 3KKA A; 2DKZ A; 3K1R B; 2D3D A; 2LPE A; 3KKA C; 2F3N A; 2EAO A; 1LKY B; 4RQN A; 1X40 A; 2ES6 A; 3IDW A; 2QB1 A; 1OW5 A; 3H8M A; 2QB0 B; 2FE9 A; 1COK A; 1B4F A; 2KMD A; 1LKY A; 3TAC B; 1F0M A; 2DKX A; 1RG6 A; 2DL0 A; 2QB0 A; 2YTU A; 4NL9 A; 4RQM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4DL6 A; 4C8K A; 1WWU A; 1XO1 A; 4NV0 A; 3M6Z A; 3JPQ A; 4Q43 A; 4KLT A; 2C22 A; 2O6K A; 5DGA A; 3G6Y A; 1ZQZ A; 4O5C A; 2DWQ A; 5IIJ A; 5J2B A; 4J9P A; 3ED5 A; 2W3R A; 3SAF A; 3BQ2 A; 1Z00 A; 4GXI A; 4KLD A; 3BJY A; 1FFV A; 5KG7 A; 1T4G A; 3N7P D; 1QQ6 A; 4DQQ A; 1PK3 A; 4KMU A; 3KZI U; 2KHQ A; 5J2I A; 3UXO A; 4QZ9 A; 2R8K A; 2MUT B; 1X2I A; 2A1J A; 4UAW A; 4EZ9 A; 5KL1 B; 3KD3 A; 4I2H A; 4DQI A; 5HML A; 5ALH A; 3NVZ A; 3EWA A; 4JWM A; 1SL1 A; 2F1J A; 1KEJ A; 3U26 A; 3BZK A; 2YMP A; 2FMQ A; 5ALO A; 2ESE A; 4KLU A; 3Q8Q B; 2BPF A; 2F8K A; 4Z6C A; 1L3V A; 4FO6 A; 1ZQB A; 1DGJ A; 2NYV A; 2WF5 A; 5J2H A; 3TFR A; 4RQ8 A; 5AKY A; 2EZX A; 2ATL A; 3Q8M A; 4C8N A; 4F4X A; 2ZIX A; 3WKB A; 4ECU A; 4BXO A; 3UQ2 A; 2K4I A; 3V7L A; 3M8S A; 1BPD A; 1N62 A; 5GTI U; 1PUZ A; 5CB1 A; 4F5Q A; 2UVR A; 2BZF A; 3HWT A; 2UVU A; 2DBY A; 4RT2 A; 1DRG A; 4DL4 A; 2KHV A; 2JZB B; 3D2Q A; 4Q8E A; 4DOB A; 5KFQ A; 2MRL A; 5AI0 A; 1H38 A; 2PKE A; 2KEY A; 3BQT A; 4UAT A; 4BJQ A; 3M9O B; 3N28 A; 5AI4 A; 3F5A A; 3HRD D; 1CEZ A; 9ICM A; 4IRD A; 3PX0 A; 2K8A A; 5KFO A; 3QUT A; 2K4P A; 5AI9 A; 5AI8 A; 4YXM A; 3SEN A; 1F44 A; 5L1M A; 2AXT U; 5AM1 A; 1PVP A; 3NVV A; 3WK6 A; 1XS9 D; 3IHQ B; 1IV8 A; 2Y9U A; 2WB1 C; 3BS5 B; 3PW0 A; 4EZ6 A; 5H2F U; 1ZQL A; 4RQ2 A; 3RR8 A; 3RB3 A; 5T14 A; 3RJE A; 4KLM A; 2YMM A; 1TV9 A; 5KFD A; 2E8O A; 3F5E A; 3GU3 A; 4NLB A; 2HBL A; 4DF4 A; 1Q3U A; 4O9M A; 4YR2 A; 1DOQ A; 1NK8 A; 2J6U A; 4UAU A; 2YY6 A; 3GFK B; 5EOZ A; 3TKA A; 4YD2 A; 2PI4 A; 5DKW A; 2DFL A; 1ZQG A; 3H7I A; 1N5X A; 3FDS A; 5F9L A; 3T5L A; 4GFJ A; 2LYA A; 2HBJ A; 4RPX A; 2ZJ8 A; 1LB2 B; 1U45 A; 2FE9 A; 3HT3 A; 4DOC A; 1ZQF A; 1Z4N A; 4ELT A; 8ICW A; 4US8 A; 2HOI A; 1RYR A; 2ZUC A; 4QJF B; 1ZQD A; 3C2L A; 3SEI A; 1Z3E B; 3H8S A; 2ZIU B; 4GXJ A; 4NL9 C; 1OUQ A; 5CP2 A; 5J2F A; 4FZM A; 4ECR A; 2F1H A; 1CRX A; 2DGZ A; 2QAR A; 9ICB A; 2AHO B; 3H4D A; 7ICP A; 2YX8 A; 1MQ2 A; 4Y2S A; 4I2E A; 1B0X A; 7ICO A; 2LHT A; 2KSO B; 3PR4 A; 5AIB A; 5AIC A; 2RQ5 A; 7ICU A; 5KFN A; 1N48 A; 2DUY A; 5HHH A; 3RRG A; 4NWI A; 5AM4 A; 1D9D A; 4KLG A; 4DL7 A; 2IA6 A; 1MN8 A; 1CI4 A; 3L3F X; 2OEH A; 3NS1 A; 4EBD A; 4BDP A; 4DFK A; 4DLE A; 2KZ3 A; 4U6P A; 4UAR A; 3MAB A; 2HDO A; 2KG5 A; 1NJZ A; 3M1Y A; 4UAY A; 1U47 A; 4GXK A; 3QU7 A; 5DLG A; 5J0T A; 2HHT A; 3KHR A; 2NV3 A; 3GIM A; 3UXP A; 2KE7 A; 4B9M A; 4PGQ A; 4O3Q A; 4KX3 A; 2BQR A; 4JB3 A; 2IOH A; 3Q8K A; 3IG5 A; 3ZD8 A; 2KZM A; 4O3S A; 8ICZ A; 3PVX A; 9ICK A; 2BCR A; 5EE0 A; 5L1L A; 2KP7 A; 1ECW A; 1JIH A; 5KFA A; 3DDH A; 2HOQ A; 5ALW A; 3K1Z A; 3UM9 A; 4RQN A; 4EX7 A; 3C23 A; 3BQ0 A; 2VJ5 A; 1OW5 A; 1BPX A; 3F2D A; 4YMN A; 4CNQ A; 4Q44 A; 3ZI4 A; 5ALM A; 5CWR A; 2KTQ A; 1KRP A; 1FEZ A; 2FJ6 A; 1T3N A; 3ISC A; 3PNC A; 4PGX A; 1ED1 A; 3MFI A; 3C5F A; 5IIL A; 2ODG A; 1Y88 A; 1S77 D; 2WB1 F; 4JK1 A; 5DLF A; 3HP6 A; 5EWF A; 8ICY A; 1BNO A; 3KHL A; 5J2D A; 2ASJ A; 8ICB A; 3IM1 A; 4Y2U A; 1NOM A; 3E2E A; 4NY8 A; 3KFU F; 2CPR A; 4YD1 A; 1HUO A; 2KIW A; 2HBK A; 4QZH A; 3ZD9 A; 4TQS A; 3EPI A; 9ICL A; 1TVA A; 1JI7 A; 5K4L A; 4YQW A; 1F5S A; 3AM9 A; 1U48 A; 4ECV A; 4QZ8 A; 4NJ8 A; 4MEY A; 4UAV A; 2HHX A; 9ICO A; 2KN7 A; 5III A; 5CEH A; 1RPL A; 2BQ3 A; 3T5H A; 8ICH A; 1K5O A; 2G0A A; 3BQ7 A; 4F72 A; 3SI8 A; 1WWV A; 2RHF A; 1BNP A; 3EPG A; 4QWD A; 4NLZ A; 5KAI U; 4CCH A; 2JMG A; 5ALI A; 1KQQ A; 4DSF A; 4M9N A; 4ICA A; 2E8N A; 1TAU A; 3FC4 A; 4RQ1 A; 2ASD A; 2ZXI A; 1V97 A; 3WK7 A; 4B9U A; 3M8R A; 4PZN A; 2KIC A; 1N63 A; 5L9X A; 3F2B A; 5KFW A; 8ICP A; 3HKZ C; 2XO7 A; 2UVV A; 4MHV A; 4CF3 A; 4UBB A; 5AKG A; 4I2D A; 1ZQM A; 3RJF A; 2H3Z A; 3NRW A; 2Q0Z X; 3A0B U; 3MR2 A; 3B0X A; 3WKD A; 2N1R A; 4TQR A; 3C1Y A; 2YN4 A; 3SV4 A; 2HBM A; 3H8W A; 9ICE A; 2DL0 A; 4XQ8 A; 4PL2 A; 1D8Y A; 4UAS A; 3LWM A; 1ZQK A; 3L4P A; 1JXE A; 4J9S A; 5KFC A; 2B0C A; 1NKE A; 7ICR A; 3BQ1 A; 3QZ7 A; 4R8U B; 3CP8 A; 4DS5 A; 4DSI A; 2GLE A; 9ICN A; 5J2K A; 1ZQQ A; 1L6N A; 4UB3 A; 9ICJ A; 4CGZ A; 1L7O A; 1NJW A; 4FZL A; 2D6F C; 9ICU A; 2FLP A; 1ZRM A; 4CRX A; 1UQV A; 5AM3 A; 1Z1V A; 2E3T A; 3KZX A; 5KTQ A; 2F8L A; 3NVY A; 3NTU A; 3GV8 B; 3PO5 A; 3V6K A; 4IL6 U; 4TUS A; 2ZXH A; 2KOB A; 2ZIV A; 3WKC A; 2LYH A; 1HEK A; 1Z19 A; 2F77 X; 3PW7 A; 3KOO A; 4E0D A; 5G5G A; 5DDY A; 4QIW C; 3WK4 A; 2ALZ A; 4JWN A; 1L3S A; 5C5J A; 2R8H A; 3N7R C; 3H0L B; 4RQ5 A; 3I28 A; 4UAZ A; 4PGY A; 2VJ4 A; 1PK1 B; 3QEA Z; 1S10 A; 3SMV A; 1KTQ A; 1N61 A; 4B9T A; 3MBY A; 1XSP A; 3QUB A; 5DQI A; 5ALS A; 9ICF A; 1S8O A; 3GIJ A; 4RQ7 A; 1N60 A; 4DO9 A; 2HCF A; 3E0F A; 4OJ5 A; 8ICL A; 4R64 A; 4EYH B; 4UB2 A; 4QW9 A; 4MFC A; 2K8B B; 2JXJ A; 4O3M A; 4ACO A; 2DKX A; 4QZC A; 4C4T A; 3UXN A; 2PFP A; 2BHN A; 3RBD A; 2E5S A; 1ARO P; 1JN3 A; 3GDX A; 3WK5 A; 4NL9 A; 4ED0 A; 2XGQ A; 4UB1 A; 4YR3 A; 3PX6 A; 2IHM A; 3AUO A; 1NJX A; 3QX7 A; 4AYB C; 1Q8K A; 2GH1 A; 3SAH A; 4YN4 A; 5AK5 A; 1VDV A; 3RR7 A; 4F3O A; 3RH5 A; 3RB6 A; 4F2R A; 1SV4 A; 1X9W A; 5J0P A; 5J0U A; 1RM6 C; 4DFJ A; 2AJQ A; 1IM4 A; 1KFD A; 2E8M A; 5ALT A; 7ICM A; 1N5W A; 2V9W A; 2D8C A; 4Y2R A; 5BOM A; 1IXR A; 3UQ0 A; 4C4R A; 4M6W A; 4ED3 A; 5KG2 A; 3D2N A; 4JUZ A; 4P4P A; 4ZOH C; 1TAQ A; 3GIL A; 4B9S A; 3WK8 A; 9ICP A; 3HIL A; 3MC1 A; 9ICS A; 2V4R A; 4R66 A; 5KG3 A; 3B9J A; 2BCV A; 5JTI A; 1HIW A; 3QNM A; 4DEZ A; 5J2C A; 1NI3 A; 3V72 A; 2J6S A; 2W9C A; 3I76 A; 4J9Q A; 2HHS A; 8ICK A; 3OHA A; 5IIK A; 2DF4 B; 2VKQ A; 8ICJ A; 4C8O A; 1FIQ A; 3TAC B; 2W04 A; 4I2A A; 4F4K A; 2ZUD A; 2W9B B; 2Y0S F; 3WK9 A; 1T94 A; 2G09 A; 2HHQ A; 5JRT A; 2P35 A; 5AKJ A; 2EAP A; 2M0N A; 4RNM A; 4B9V A; 1C20 A; 3PW2 A; 2R8J A; 1Z00 B; 2F2A B; 2XCP A; 2B6G A; 2ISO A; 5KFR A; 1SZP A; 2WAQ F; 1UA0 A; 8ICV A; 4P0Q A; 3LDA A; 4FFD A; 1UT5 A; 2IBK A; 3MFH A; 3MGV A; 2I9G A; 5J2G A; 1RYS A; 5ALG A; 1JRO A; 4Y2V A; 4ED1 A; 3PW4 A; 2A19 A; 5KFM A; 9ICI A; 4KLF A; 9ICW A; 2A1J B; 1WUD A; 1ZQT A; 1PVR A; 1RXW A; 2UVW A; 3QUQ A; 4XA5 A; 5ALK A; 2H3V A; 1PZN A; 2RDJ A; 4KLJ A; 4GC7 A; 1T7P A; 3ISB A; 3FM9 A; 3N97 B; 1K1S A; 5J0R A; 3JPO A; 2ISP A; 4NLK A; 4RQ3 A; 1ZQU A; 4JV1 A; 1ZQW A; 5KFS A; 1L7M A; 5ALJ A; 4ZH4 A; 2JR5 A; 4NM2 A; 5ALV A; 8ICA A; 2KV2 A; 5AK3 A; 2W11 A; 1KW4 A; 1D9F A; 1ZD4 A; 3GV5 B; 5CHG A; 4YMO A; 1IG6 A; 1GO3 F; 1SKS A; 3D6J A; 2HI0 A; 5KG1 A; 2ZIX B; 1T3Q A; 2H5X A; 1ZQA A; 2LYB A; 3GV7 B; 4BXO B; 3KKA C; 4F5R A; 4PHE A; 5DG9 A; 1DK2 A; 2EAO A; 3GQC A; 4MEX A; 4MFF A; 2W43 A; 1JUD A; 2HW3 A; 2YB1 A; 1T8E A; 4OJ6 A; 1BVS A; 3EUB 2; 5ALL A; 3MR5 A; 4EBC A; 1NK6 A; 5AM5 A; 2YTU A; 3GIK A; 4YVZ A; 4Y2Q A; 4KLL A; 2ZIW A; 3CRX A; 1SKW A; 3S6J A; 5KFE A; 4RUA A; 3ICX A; 2HVI A; 4QZA A; 5ALP A; 3JPR A; 1ZD5 A; 1NK4 A; 2ZTE A; 5F3X B; 2AGP A; 4US9 A; 2HSZ A; 3ONN A; 1Q3V A; 3DV9 A; 3T79 A; 2XGP A; 3OSP A; 4Z6D A; 3RTV A; 5HMM A; 2NRV A; 1YT3 A; 4BGD A; 4OJL A; 3ETL A; 3RAQ A; 4J03 A; 8ICR A; 5KFI A; 3AQE A; 1NNL A; 2QKQ A; 4EYI B; 4K4I A; 4M9L A; 1SB3 C; 3F2C A; 2B21 A; 1BPY A; 1TFR A; 1COO A; 5J0W A; 4OD0 A; 5AKX A; 3OSN A; 4O3N A; 3NGD A; 7ICN A; 1LVH A; 2XY5 A; 1KFT A; 3PMN A; 1SWV A; 7ICI A; 5DGB A; 5DB6 A; 1ZOL A; 3IRU A; 3KTQ A; 4OJO A; 1ZQV A; 3PSP A; 3OJS A; 4OJP A; 4JV0 A; 2AQ4 A; 4DWI A; 4P0P A; 4Y2T A; 4M0A A; 2JRZ A; 1L8O A; 9ICX A; 5DQH A; 1ZXI A; 2MAX A; 4MF2 A; 4QWB A; 2LM4 A; 2BPC A; 3RB0 A; 1COK A; 4ECW A; 1RG6 A; 5IIM A; 8ICC A; 1S0O A; 2PMZ C; 2QB0 A; 3BZC A; 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3RAX A; 4EEN A; 4RZR A; 1N56 A; 5KFB A; 3CW2 C; 5DB7 A; 3THV A; 2BDU A; 3PST A; 4OO1 J; 2YMQ A; 5KT5 A; 2GO7 A; 3Q8L A; 2KD1 A; 4C7Z A; 1WG8 A; 2BQU A; 5J0Y A; 1HJP A; 5AI6 A; 4DS4 A; 2J6T A; 3SQI A; 4B6J A; 4F50 A; 3T3F A; 4IR9 A; 2EAN A; 3QUC A; 3H40 A; 3RJJ A; 4QZE A; 4NLC A; 2JH1 A; 4MFA A; 1YZ6 A; 2KJ9 A; 9ICQ A; 4F5N A; 3H0R B; 1ZQI A; 3RJH A; 3TAP A; 5B5E U; 3MGI A; 5IIN A; 8ICM A; 4DSJ A; 4R63 A; 5ALR A; 1QQ5 A; 1NKB A; 2HVH A; 2I5H A; 5J8Y C; 4F2S A; 2NRZ A; 3HJE A; 4TUR A; 2IMW P; 2HHV A; 3DEE A; 7ICH A; 3HX0 A; 2PFO A; 4I29 A; 4NM1 A; 3SR6 A; 3C2M A; 3JPS A; 4PHA A; 5AK4 A; 9ICR A; 2JH7 A; 3OJU A; 4F8R A; 4DOA A; 5ALF A; 3UMC A; 2KK0 A; 4M9J A; 5KFZ A; 1BPZ A; 4F71 A; 4TUP A; 3QZ8 A; 1TE2 A; 3LYS A; 1ZQJ A; 4KMO B; 3KKA A; 3RRH A; 5ALN A; 2AGO A; 3D2S A; 5J29 A; 4I2F A; 1JRP A; 3TAN A; 3K4G A; 1L3T A; 4FE3 A; 1NK5 A; 2KMD A; 9ICC A; 2OM6 A; 3UMB A; 4QWC A; 2CXY A; 3QYP A; 2R8G A; 2AGQ A; 1Q46 A; 2KVS A; 2Z7J A; 2WHE A; 3Q8P B; 2W8K A; 4KLQ A; 5KT6 A; 3AL0 B; 2NRT A; 3I1Y A; 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