The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
SLVSFLTGLGCPNCIEYFTSQGLQSIYHLQNLTIEDLGALKIPEQYRMTIWRGLQDL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of the C-Terminal Sterile Alpha-Motif (Sam) Domain of Human P73 Alpha
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
P53-LIKE TRANSCRIPTION FACTOR
|
| molecule tags |
Gene regulation
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
18
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-01-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2E8N A; 1KW4 A; 1WWV A; 2F44 A; 1SV4 A; 5JTI A; 2F3N A; 1UCV A; 2B6G A; 2YTU A; 4NL9 A; 1PK3 A; 2DL0 A; 2E8P A; 1F0M A; 2EAO A; 4RQM A; 1SV0 A; 5J8Y C; 3TAD A; 1V38 A; 2KSO B; 5KNI A; 1OW5 A; 3K1R B; 4IS7 A; 3KKA A; 4RQN A; 1COK A; 2F8K A; 1B4F A; 1SXE A; 1X66 A; 2EAP A; 2DKX A; 2D3D A; 1X9X A; 2JV3 A; 2E8O A; 2K60 A; 3IDW A; 2KG5 A; 2ESE A; 2EAN A; 2QB1 A; 1LKY B; 3BQ7 A; 3BS5 A; 2Y9U A; 4NL9 C; 1X40 A; 1LKY A; 5L1M A; 3H8M A; 2ES6 A; 2GLE A; 4NJ8 A; 1PK1 A; 1Z1V A; 2KE7 A; 1SV0 C; 1B0X A; 3TAD C; 1SXD A; 2D8C A; 3HIL A; 2QAR B; 2Y9T A; 1JI7 A; 5F3X B; 4PZN A; 5J8Y A; 2L5Y A; 2QAR A; 3BS7 A; 2FE9 A; 3BS5 B; 2K4P A; 1RG6 A; 2DKZ A; 3KKA C; 1WWU A; 1DXS A; 1OXJ A; 1PK1 B; 2LMR A; 2EAM A; 2KMD A; 1UQV A; 2KIV A; 2QB0 B; 4PZO A; 1V85 A; 5JU5 A; 3TAC B; 3SEI A; 1SGG A; 2LPE A; 2QB0 A; 2E8M A; 3SEN A; 2KSO A; 2QKQ A; 4MHV A; 5JRT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2E5S A; 4CGZ A; 3FM9 A; 4QZB A; 4UAV A; 4JUZ A; 3ZDC A; 3ZI4 A; 3L3F X; 4Q44 A; 2JHD A; 4ELT A; 4QWC A; 4C8L A; 5KFL A; 2BQ3 A; 4KLD A; 5AKL A; 4KLE A; 4QZD A; 2C22 A; 1S9F A; 1Q3U A; 8ICB A; 3RJE A; 2HBM A; 4HAI A; 4QZG A; 3EPI A; 5IIK A; 2C28 A; 4IQW A; 5CR0 A; 3TFS A; 3V6K A; 1KN5 A; 3K1R B; 2R8K A; 3NVW A; 2JEF A; 3DDH A; 1SXE A; 1ZQF A; 1JXE A; 4LVS A; 3MBY A; 2W04 A; 2AGQ A; 2WFA A; 3JPS A; 1S8O A; 1CUK A; 4QW8 A; 3TI0 A; 2JV3 A; 3OSP A; 3CP8 A; 4O3S A; 4YFK A; 3N7R C; 4YN4 A; 5D49 A; 4NL9 C; 1ZRN A; 2I6X A; 3JPQ A; 4F5O A; 1TAU A; 3GZF A; 3VC8 A; 1B0X A; 4M0A A; 5ALD A; 2ZIU B; 3ZDB A; 4G3I A; 4ED7 A; 4TQR A; 2A1A A; 5AK3 A; 5D4B A; 1ZQJ A; 2A3V A; 3ETR A; 3HW8 A; 4ED6 A; 1RDF A; 2PFN A; 5AKY A; 2YML A; 3MGV A; 2N1R A; 1T8E A; 4J9M A; 1F5S A; 1KEJ A; 3SEI A; 4XUS A; 4GXJ A; 2QB0 A; 3PX4 A; 3UPQ A; 3CNH A; 3PZP A; 1SV4 A; 2VA3 A; 5ALL A; 2F3N A; 3UXO A; 4DQR A; 2BCU A; 3C2K A; 1JRP A; 1FFU A; 2JGA A; 1SL1 A; 2KK0 A; 1ZD4 A; 2OWO A; 1KTQ A; 5L1I A; 1TK8 A; 3TAD A; 1QTM A; 3IN5 A; 3T5J A; 5AI5 A; 4EEL A; 2ZG6 A; 1SL0 A; 7ICR A; 3H8W A; 1S76 D; 4P0Q A; 5J2H A; 1L8O A; 1NOM A; 3SI8 A; 2HBK A; 2KN7 A; 1N56 A; 1ZQS A; 9ICJ A; 3AU2 A; 4UAU A; 5KG5 A; 4J9P A; 3E2E A; 4RU9 A; 5EWF A; 8ICK A; 5J2F A; 4DSE A; 3ICX A; 4KLM A; 2KKP A; 1XWL A; 3N7P D; 4DFM A; 2KOB A; 1QLN A; 2WF5 A; 2YN4 A; 2WF9 A; 3TQ1 A; 3RJJ A; 3ISB A; 1TAQ A; 1D8L A; 1JAL A; 9ICV A; 1ZQG A; 4KLG A; 3RH5 A; 5IIO A; 4C8N A; 4A8E A; 1L7M A; 2BCS A; 1UT8 A; 3N97 B; 4KLL A; 1S97 A; 4QJF B; 4I2E A; 1XSP A; 1ZYQ A; 3LK9 A; 2OXO A; 3TFR A; 4KN7 A; 1VDV A; 2G08 A; 4DF4 A; 3HWT A; 4UBB A; 9ICE A; 1LVH A; 2HOF A; 4EYH B; 4NLG A; 1UQV A; 1L5U A; 1COO A; 4AP9 A; 3RJI A; 1QQ5 A; 4QZ9 A; 2MRL A; 3MC1 A; 5EE3 A; 3PR4 A; 4DO9 A; 2ZJA A; 4DSI A; 4B9T A; 4O5K A; 5AKG A; 2JEJ A; 3RFA A; 4CCH A; 3B0Y A; 2H3F A; 2XY5 A; 4G9B A; 1UCV A; 3FC4 A; 3QX7 A; 3Q8L A; 3MAB A; 3BZC A; 2JEG A; 3V6J A; 3SAG A; 4Y2J A; 4PGY A; 4QZC A; 4KTQ A; 3MR3 A; 3F53 A; 2W7P A; 1J2M A; 4Y2U A; 4RQ7 A; 5GTI U; 5KFO A; 5B5E U; 1KLN A; 4ELU A; 3GFK B; 2G5I B; 4QWB A; 3ALR A; 2FLL A; 4U7C A; 1BNP A; 5L1L A; 2ISO A; 9ICX A; 4DCC A; 3HX0 A; 3NAS A; 2FMQ A; 3AQE A; 1YZ7 A; 4TUR A; 2LM4 A; 3S6J A; 1KSP A; 4M9N A; 2KJ9 A; 3BQ2 A; 5KFV A; 2EAN A; 4F92 B; 5J0T A; 3BS5 A; 3GIJ A; 1RXV A; 2HMX A; 2BDP A; 4KMO B; 2Y1I A; 4O3P A; 1X40 A; 4F5N A; 1ZQZ A; 1V9P A; 3EWA A; 1VLB A; 4ZOH C; 1QSS A; 4ICA A; 4J9O A; 4DFP A; 2YQE A; 2W9C B; 1JI7 A; 3H0M B; 1Z19 A; 4I2G A; 4O3Q A; 4UB3 A; 1QSY A; 8ICU A; 1N5W A; 1D9F A; 2W3S A; 1X9M A; 4DFJ A; 3V6H A; 1ZQK A; 4LZG A; 4P0P B; 2EAM A; 4DS5 A; 1BVS A; 3GQC A; 7ICE A; 2EH9 A; 5AIB A; 2KVC A; 8ICZ A; 4I2D A; 1CI4 A; 9ICO A; 1HEK A; 9ICU A; 3N28 A; 3SAF A; 4RUA A; 3DV9 A; 2YTU A; 4NL9 A; 5KT5 A; 5KFF A; 3CYM A; 4YMN A; 2PFP A; 2AH5 A; 1FFV A; 3QU9 A; 3G6V A; 2ZXI A; 5H2F U; 2KV2 A; 1KKX A; 5GTH U; 4DWI A; 4EEY A; 5AHX A; 3QXG A; 5HMM A; 7ICU A; 3LDA A; 1Q46 A; 2W7O A; 5J2G A; 5AI4 A; 4PPX A; 1NKB A; 1X66 A; 4RZR A; 1DK2 A; 1A77 A; 3GDX A; 3OGU A; 3N7S C; 4LJX A; 2FLN A; 2DF4 B; 3K1Z A; 1S0N A; 3C2M A; 2KG5 A; 5DQH A; 2YMP A; 3OSN A; 1T7P A; 3F5E A; 3JPR A; 1C20 A; 5K4L A; 3M9O B; 4YR3 A; 3PSI A; 2HDO A; 4UB2 A; 3OHB A; 3TAN A; 2P66 A; 5AKK A; 1Q8K A; 2PXI A; 2KVS A; 2WAQ C; 2FE9 A; 2HHT A; 3EYZ A; 5JUM A; 3RR8 A; 4ECX A; 4DL4 A; 2XCP A; 5KFR A; 1ZD5 A; 3PMN A; 4Q8E A; 1DGJ A; 2I9G A; 5AI6 A; 4GXK A; 4YMO A; 2K89 A; 4IQU A; 4I2F A; 2QB0 B; 3RBD A; 1GO3 F; 1N60 A; 5KFD A; 3LVV A; 3G6Y A; 2IMW P; 2E3T A; 4KX3 A; 4JMU A; 1N62 A; 4ECY A; 3PO4 A; 1KFD A; 1MQ2 A; 5J2A A; 3RAX A; 4ED2 A; 2JH1 A; 5ALO A; 5BOM A; 4DL2 A; 2KHQ A; 2ASL A; 4PHD A; 4USA A; 4B9S A; 2NV3 A; 4QZE A; 5J0Y A; 2E8P A; 2HOQ A; 1CEZ A; 4P0Q B; 5AKH A; 2OEH A; 1MN8 A; 4KLI A; 3WK8 A; 4ZH4 A; 2AU0 A; 4QW9 A; 2DWQ A; 4BUG A; 4FBU A; 7ICP A; 1BPX A; 2JRZ A; 2F8K A; 2IBK A; 1S0V A; 3GV7 B; 4CF5 A; 4HYK A; 4AYB F; 1ZQE A; 2DKX A; 2F1H A; 2PFQ A; 3KHG A; 2DQN B; 2ZUD A; 2MAX A; 4UAZ A; 4O3N A; 4ECT A; 3AEV A; 4FE3 A; 3THV A; 2ZIW A; 3WK4 A; 4J9S A; 1WCL A; 1S0O A; 3IRU A; 2WF7 A; 2Q0Z X; 4M9L A; 2KJ8 A; 4F4X A; 3SZ2 A; 5J0U A; 5HNK A; 4EEK A; 3HIL A; 2FMP A; 1K1Q A; 2MU2 A; 1L7P A; 4KX5 A; 1NJZ A; 4K4G A; 2E1E A; 5ALM A; 5TZV A; 5III A; 1FEZ A; 2K4P A; 1KBU A; 3SV4 A; 8ICR A; 5KFZ A; 3RAQ A; 3JPO A; 1PK1 B; 1S10 A; 2KMD A; 2LYB A; 3FAH A; 4B9V A; 3FDS A; 3QU2 A; 3UXN A; 1HUZ A; 2CXY A; 1IIP A; 4YMM A; 4QZI A; 4B9U A; 1NJY A; 4KLF A; 3GIM A; 4KLU A; 9ICQ A; 5EWG A; 1KL9 A; 7ICI A; 2KSO A; 2UVW A; 1RXW A; 4YQW A; 2E8N A; 1NK0 A; 2HVI A; 2C2D A; 1TKD A; 3KTQ A; 3ISC A; 2BPF A; 4Z6F A; 1ZQC A; 4J9N A; 2XID A; 3GIL A; 4RPX A; 2H3Q A; 1J2N A; 3WK7 A; 4E0D A; 4ED8 A; 2PI5 A; 5IIM A; 1ED1 A; 2JR5 A; 2XGP A; 5G5G A; 5KNI A; 1ZD2 P; 5CP2 A; 1ZQN A; 4F4K A; 4CNQ A; 1KRP A; 5DKW A; 2R8H A; 5G5H A; 4EX6 A; 4Y2V A; 3PVX A; 1MQ3 A; 2J6S A; 2KP7 A; 5KT6 A; 4KLH A; 2V4Q A; 4DQS A; 2FJ6 A; 1U9L A; 1C7Y A; 4QWA A; 3NRW A; 4C7Z A; 4C7Y A; 5KFY A; 2AQ0 A; 5KG1 A; 2EAP A; 3FYH A; 5KFX A; 4DFK A; 5DQI A; 4M9G A; 2FPL A; 4FZN A; 2KFZ A; 1RYR A; 1NZB A; 3QU5 A; 1UA0 A; 5EWE A; 2IOH A; 1DOQ A; 3ZD8 A; 7ICN A; 3NTU A; 4C8M A; 3HKZ C; 5J0R A; 1NZP A; 3WU2 U; 8ICJ A; 2IHN A; 1JRO A; 2F1I A; 4KLJ A; 2A1J B; 4NJ8 A; 1OUQ A; 5F9N A; 1SV0 C; 1PZN A; 4DOA A; 1D9D A; 1RZT A; 4YR2 A; 2UVV A; 5KFA A; 2D6F C; 5ALW A; 4US9 A; 1DRG A; 4LZD A; 5CJ7 A; 5AKZ A; 2ZUC A; 4RQ3 A; 2M9N A; 4BGD A; 2LMR A; 2G09 A; 2ATL A; 4QWD A; 3C5G A; 2HOI A; 4QZA A; 5KFJ A; 5J0W A; 1UA1 A; 8ICC A; 2RRD A; 1JX4 A; 4DSK A; 1TFR A; 3C1Y A; 1KDH A; 4P4P A; 3T79 A; 1O03 A; 5CRX A; 7ICF A; 5KL1 B; 5KL8 B; 5KG6 A; 2NRW A; 7ICO A; 3AUO A; 4KLO A; 2QLT A; 3H0R B; 4GLX A; 2HHQ A; 5AIA A; 1SIJ A; 2WF6 A; 5DBA A; 1ECW A; 2LBO A; 2ZIX A; 2KZ3 A; 1RQL A; 2BR0 A; 5DB7 A; 4B6J A; 1BPZ A; 2Y0S F; 4RQN A; 7ICM A; 4B9L A; 2KTQ A; 1NJX A; 3MGH A; 9ICP A; 5C0Y A; 5ALE A; 1NJW A; 1Z00 A; 4O0I A; 3AQF A; 5AM0 A; 3MGI A; 4R8U B; 1TAM A; 2RDI A; 4I2J A; 4KMU A; 2WTF A; 3LWL A; 4F4Y A; 3NRZ A; 5AK5 A; 4BXO A; 1L3V A; 1RYS A; 2MA1 A; 4UAW A; 7ICJ A; 3BQ7 A; 4RT3 A; 5L1M A; 3F2C A; 1JN3 A; 2W9M A; 4BWJ A; 4R66 A; 8ICE A; 1NK7 A; 1NK8 A; 3H8J A; 3U26 A; 3BQT A; 2Y0S C; 3BS7 A; 4ELV A; 1UT5 A; 3KBB A; 9ICW A; 3RB6 A; 2AQ4 A; 3QEA Z; 2EZZ A; 3WKA A; 5A0L A; 1MC8 A; 1FO4 A; 4FO6 A; 4FS2 A; 4UAY A; 1D8Y A; 3TAC B; 4IC9 A; 4F8R A; 3H4D A; 5ALY A; 2FPM A; 3AL0 B; 2K4E A; 2NRX A; 2F44 A; 2W9B A; 5DG9 A; 4PHE A; 2KKV A; 4OJ6 A; 2E1F A; 4F4Z A; 2K8B B; 5DLG A; 5ALF A; 4I2H A; 3M9N B; 5HR6 A; 3G6X A; 2OYY A; 1PUZ A; 3NUQ A; 4JWN A; 2JZB A; 4B9N A; 4GIB A; 5CA7 A; 2ZIV A; 3B9J A; 4DL6 A; 3D2S A; 4F2S A; 2JMG A; 2KIC A; 4RPY A; 1RPL A; 1ZQB A; 5E79 U; 3NVZ A; 1XSN A; 1ARO P; 4EX7 A; 4RQ5 A; 4M6W A; 2K8A A; 2VJ4 A; 1Y88 A; 3N4M B; 5AM5 A; 2LKY A; 2G5H B; 3OPX A; 2R8G A; 1SKR A; 1L6N A; 1XS9 D; 4UBC A; 2KEY A; 4UB5 A; 3UMB A; 2JEI A; 1QH9 A; 5ALV A; 3IM1 A; 2C2E A; 3M8S A; 3BZK A; 4KIT B; 4DQI A; 1SKW A; 1X2I A; 1RYU A; 3CRX A; 1ZOL A; 3DEE A; 2UVU A; 3BQ0 A; 3BDP A; 1CRX A; 1ZQ1 C; 2LM1 A; 5DGA A; 3ISD A; 1B22 A; 3V7L A; 2XVT A; 4I2I A; 4I2C A; 4Z6C A; 3PNC A; 3C29 A; 2LI6 A; 2F1J A; 1SKS A; 3KHL A; 3WKB A; 4GC6 A; 7ICL A; 1ZQR A; 1U49 A; 3R9K A; 5JRT A; 2XIC A; 9ICT A; 3PV8 A; 4YXJ A; 5KT4 A; 2R8I A; 3ZDE A; 2ZJ5 A; 1N63 A; 3H8S A; 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2YX8 A; 2PI4 A; 3QUT A; 5TIS U; 1A0P A; 1U45 A; 2KZM A; 4NV0 A; 1N48 A; 5KG3 A; 2J6T A; 1S0M A; 9ICC A; 2DL0 A; 4NY8 A; 4RQM A; 3IV6 A; 1QQ7 A; 1K1S A; 5J2K A; 2G07 A; 4J03 A; 3PX6 A; 1T3N A; 5KAI U; 2W8K A; 1TE2 A; 4DOC A; 4K4I A; 3M7D A; 5J29 A; 2JXJ A; 1XC9 A; 4IS7 A; 5DG7 A; 5KFT A; 1IXR A; 1Z00 B; 1XO1 A; 4O3R A; 4C8K A; 1N5X A; 5DGB A; 7ICV A; 4ECZ A; 5AK6 A; 4EBC A; 2HCF A; 2IHM A; 4M9H A; 4FZL A; 4F5Q A; 8ICM A; 1VJ5 A; 2W3R A; 2PFO A; 2F77 X; 5KT7 A; 1XNS A; 2H3Z A; 3M6K A; 5KFK A; 4R65 A; 2KJ5 A; 1ZQW A; 3Q8Q B; 3RB4 A; 2H3V A; 4P4O A; 1LKY A; 4DF8 A; 1TVA A; 3HT3 A; 2DGZ A; 3QEB Z; 5HML A; 2VKQ A; 4UAS A; 3Q8M A; 4PZN A; 3PML A; 5KFP A; 5DBC A; 2BGW A; 2JH7 A; 2NYV A; 2NO4 A; 4DLE A; 2RP5 A; 4ED3 A; 2HW3 A; 1NK5 A; 4RQ1 A; 1X9S A; 1ZQL A; 4KLT A; 1Z4O A; 2BQR A; 1N2X A; 1T3Q A; 2KNJ A; 5HHH A; 1K5O A; 4I2B A; 3WKC A; 1V85 A; 2CN1 A; 3Q8P B; 3AM9 A; 1MA7 A; 2W9B B; 3HP6 A; 4O5C A; 3MFI A; 9ICF A; 9ICS A; 1L3S A; 1JIH A; 1WYG A; 2XI9 A; 4NLC A; 4F3O A; 8ICO A; 3QZ8 A; 3UQ0 A; 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