The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
SLVSFLTGLGCPNCIEYFTSQGLQSIYHLQNLTIEDLGALKIPEQYRMTIWRGLQDL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of the C-Terminal Sterile Alpha-Motif (Sam) Domain of Human P73 Alpha
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
P53-LIKE TRANSCRIPTION FACTOR
|
| molecule tags |
Gene regulation
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| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
18
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-01-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KSO A; 2DKX A; 3BS7 A; 1PK1 B; 1PK1 A; 2QKQ A; 2Y9U A; 5F3X B; 1V85 A; 1SXD A; 2DKZ A; 2E8N A; 1F0M A; 3TAC B; 2FE9 A; 1B0X A; 1OW5 A; 1X9X A; 2D3D A; 2F44 A; 2EAP A; 1SV0 A; 3KKA A; 1LKY B; 1X66 A; 1LKY A; 5KNI A; 3KKA C; 2LMR A; 1KW4 A; 2K4P A; 4PZO A; 3K1R B; 2KG5 A; 4MHV A; 1WWU A; 2B6G A; 2KIV A; 2KMD A; 3IDW A; 2K60 A; 2LPE A; 2GLE A; 2D8C A; 1B4F A; 2L5Y A; 2F3N A; 1JI7 A; 5JTI A; 4RQN A; 4NL9 A; 1V38 A; 2KE7 A; 3TAD A; 1UQV A; 2JV3 A; 1COK A; 2E8P A; 4NJ8 A; 3BQ7 A; 1SV0 C; 2EAO A; 4NL9 C; 4RQM A; 2F8K A; 3TAD C; 1Z1V A; 4PZN A; 2ES6 A; 2EAM A; 2E8M A; 4IS7 A; 1SGG A; 3HIL A; 5J8Y A; 2ESE A; 1UCV A; 2EAN A; 2QB0 A; 1OXJ A; 2YTU A; 5J8Y C; 2QAR B; 5L1M A; 3BS5 B; 2QB1 A; 2QAR A; 1SV4 A; 3BS5 A; 2E8O A; 1PK3 A; 1DXS A; 3SEI A; 1SXE A; 5JRT A; 1WWV A; 3SEN A; 1RG6 A; 2Y9T A; 2DL0 A; 2KSO B; 5JU5 A; 1X40 A; 2QB0 B; 3H8M A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1S5L U; 5KFZ A; 4O3M A; 3PW0 A; 1ZJN A; 2VA3 A; 3TQ1 A; 4I27 A; 1YZ6 A; 4QZB A; 3D2Q A; 5AIC A; 1Z19 A; 1BPY A; 2E8N A; 2ODG A; 4C8L A; 5F9N A; 4C7Z A; 2AXT U; 3GFK B; 2UVU A; 2HOQ A; 4KLI A; 1TAM A; 1IV8 A; 2DFL A; 5CHG A; 5J0T A; 3WK9 A; 4M9N A; 4F4Z A; 2AGO A; 2ZJ8 A; 4QZI A; 1UHU A; 1S8O A; 1RYS A; 4QNL A; 4KLJ A; 4R64 A; 9ICX A; 1ZQW A; 2ZIU B; 3RH5 A; 4B6J A; 1JIH A; 2ALZ A; 2FDR A; 4M9H A; 2JXJ A; 3ZDB A; 2WF6 A; 4XQ8 A; 5DB7 A; 4EEY A; 2FPL A; 4UW9 A; 4YXM A; 3V7L A; 2ZIV A; 2XO7 A; 4IQU A; 1A6S A; 5ALH A; 2C2D A; 8ICM A; 2WB1 C; 2KNJ A; 4B9U A; 1XU4 A; 3WKE A; 4F91 B; 3NVZ A; 3PW2 A; 1D9D A; 3PO4 A; 2KV2 A; 4B9V A; 2RDI A; 2R8K A; 4OJL A; 2K8A A; 1VLB A; 1S77 D; 5AKX A; 2QB1 A; 3C1Z A; 3BS5 A; 2HHU A; 4R8U B; 4M0A A; 3I76 A; 2YN4 A; 1ZQB A; 4DO9 A; 3NVY A; 2ZIW B; 3SV3 A; 5KT6 A; 5ALP A; 3B0Y A; 3AQE A; 4F4W A; 3AMZ A; 4BWJ A; 4UB4 A; 4JWN A; 2MU2 A; 3IHQ B; 3GIK A; 3HKZ C; 3LWL A; 4O5K A; 5TZV A; 2DUY A; 3LVV A; 1Z4N A; 3MBY A; 4GC7 A; 5IIK A; 2Z7J A; 4Q8E A; 2BCU A; 5ALW A; 3NTU A; 4BWM A; 1T3Q A; 5EWE A; 4RQ1 A; 2ZJA A; 2G09 A; 3WK4 A; 1WG8 A; 3LK9 A; 2I1Q A; 4Y2V A; 4TUR A; 9ICG A; 3RF9 A; 5KFO A; 3QUQ A; 4DLG A; 5CR0 A; 1LVH A; 2I6X A; 2ZIX A; 4IQW A; 2BPC A; 5DLF A; 4ED1 A; 2NRX A; 5ALJ A; 1K1Q A; 5EOZ A; 1BVS A; 1T7P A; 4CF4 A; 1TAQ A; 3F2D A; 3NRZ A; 4EBD A; 2D8C A; 5HML A; 4Q45 A; 3EPG A; 4Y2U A; 4DQQ A; 4P4O A; 4OD0 A; 5BPC A; 2JR5 A; 2FMQ A; 3TFS A; 3I28 A; 4GLX A; 5L9X A; 4JV2 A; 4O3R A; 3RB4 A; 3FC4 A; 1KSP A; 1L8L A; 4Q8F A; 3QU5 A; 1WUD A; 4TQR A; 4HYK A; 1Y88 A; 1NK7 A; 5KG0 A; 5J8Y C; 2EZZ A; 5ALZ A; 3M9N B; 3H40 A; 5AM0 A; 1N60 A; 2E8O A; 4TUQ A; 3VC8 A; 1XNS A; 2KIC A; 3EZ5 A; 1O08 A; 7ICM A; 2UVR A; 2BDU A; 2HI0 A; 4R65 A; 2C2R A; 2FJ6 A; 3FAH A; 1NJZ A; 5J2B A; 4UAR A; 5K4L A; 1FFV A; 1YZ7 A; 3GV8 B; 4DOC A; 4O3P A; 2XCP A; 4KX3 A; 1WYG A; 5C5J A; 5EWF A; 5III A; 2EQY A; 3Q8Q B; 8ICV A; 3OJU A; 5KTQ A; 3M8R A; 4J9K A; 5KG4 A; 3DEE A; 4I2F A; 2G06 A; 2DKZ A; 2NYV A; 4I2J A; 2FE9 A; 9ICC A; 1SIJ A; 5KFN A; 4FZM A; 5DB8 A; 2F44 A; 5IIL A; 1KDH A; 1SKR A; 3WK7 A; 3RJJ A; 5KL1 B; 3KKA A; 4UQG A; 5AK4 A; 1ZQQ A; 3J81 j; 2HVH A; 4G9B A; 2LMR A; 1HUZ A; 4FZN A; 4PZO A; 1U47 A; 1WWU A; 4P2H A; 8ICT A; 1BNO A; 2LPE A; 3MR3 A; 2L5Y A; 3QNM A; 4RQN A; 2W43 A; 4DF8 A; 4F5O A; 4BJQ A; 2P66 A; 1Q8K A; 4NM1 A; 4K4H A; 1T94 A; 5KT3 A; 4DL4 A; 3KHH A; 3RJE A; 4F71 A; 2OM6 A; 3HJE A; 2ES6 A; 3QXG A; 4RQ3 A; 4DEZ A; 1L7N A; 8ICN A; 4MEY A; 1L3U A; 4Z6C A; 2A1J A; 8ICX A; 3CYM A; 2MUT A; 2PFO A; 4KN7 A; 4DOB A; 1L3V A; 4MEX A; 3N7S C; 3QEA Z; 1PK3 A; 2VIX A; 2W3R A; 1QQ7 A; 5AM5 A; 4PH5 A; 4ECV A; 4NLN A; 4QIW F; 4US9 A; 4NLG A; 4CCH A; 1WWV A; 2W9B A; 4O0I A; 3QZ7 A; 2KEY A; 5ALT A; 2BR0 A; 3DV9 A; 3PW5 A; 2FPK A; 5TIS U; 2GH1 A; 2ZTD A; 2Y0S C; 1FIQ A; 2J6U A; 1IG6 A; 2F77 X; 3WKB A; 1JUD A; 2D3D A; 4E0D A; 4Z6F A; 2NO4 A; 4EBC A; 4NLC A; 4GC6 A; 3UQ0 A; 5KT7 A; 1SV0 A; 5J0U A; 5L1L A; 9ICT A; 4JWM A; 1UPH A; 3G6Y A; 2HHQ A; 5AIB A; 3IN5 A; 1OUQ A; 4ECY A; 1UT5 A; 1Z3E B; 3O0F A; 1ZYQ A; 5BOM A; 4TQS A; 1RXV A; 3V7K A; 4C8K A; 5AKL A; 5AK6 A; 2F1J A; 2OWO A; 1NK9 A; 3A0B U; 2VA2 A; 1ZRM A; 2KJ8 A; 1KTQ A; 4DL5 A; 1NK8 A; 4QJF B; 1N56 A; 3I1Y A; 5J0Q A; 4ECX A; 1S97 A; 1SV0 C; 4RQ5 A; 5HR6 A; 7ICT A; 2EAM A; 1N63 A; 4G3I A; 3N97 B; 4YFK A; 5J29 A; 3GIL A; 5J2A A; 3C21 A; 2W7O A; 4DL2 A; 4K4G A; 3BS5 B; 1TKD A; 1L8O A; 4NLB A; 5KG6 A; 4B9N A; 4KLF A; 3ED5 A; 7ICH A; 3RTV A; 4ICA A; 2LBO A; 1L3S A; 4RQ4 A; 2G08 A; 4AYB F; 5DG7 A; 1BPB A; 3F5A A; 3V7J A; 1DXS A; 4B9T A; 2IOF A; 5J0Y A; 2LKY A; 1ZQD A; 5KFR A; 1ZQZ A; 5HHH A; 2HBM A; 2Q0Z X; 2P6U A; 5JU5 A; 5ALX A; 3C2M A; 3RB6 A; 1RDF A; 3RJI A; 3ISB A; 1EXN A; 2W8K A; 3ZI4 A; 5DG8 A; 5ALY A; 1TVA A; 3S6J A; 4DFD A; 2DF4 B; 5AK3 A; 3RAX A; 3AEV A; 5CRX A; 5KAF U; 1NK0 A; 3KD3 A; 5AKI A; 4O5C A; 2ZXH A; 4PPX A; 4RNM A; 3CP8 A; 1L5U A; 2YB4 A; 2RRD A; 4ED7 A; 5KFX A; 2AQ0 A; 2ZIX B; 2KN7 A; 3SI8 A; 3AL0 B; 1DRG A; 2XIC A; 4ED6 A; 4QZG A; 3MGV A; 2B6G A; 5J2I A; 4FE3 A; 3KHR A; 3T5K A; 3PSI A; 2KKV A; 1V38 A; 2LM4 A; 3ETL A; 4RPZ A; 2WAQ C; 5KFG A; 1D8Y A; 2PKE A; 4OJP A; 1KN5 A; 2PMZ C; 5DDY A; 3BZK A; 8ICF A; 4RPY A; 4GXI A; 8ICB A; 1S10 A; 4ECR A; 1CRX A; 1ARO P; 3RBD A; 1JXL A; 3E2E A; 5DQG A; 4MFF A; 5IIJ A; 4AP9 A; 4YCX A; 4J9P A; 4CRX A; 5CP2 A; 3JPQ A; 5AM3 A; 4P0P A; 1QLN A; 1QH9 A; 4DCC A; 4ED8 A; 4ECU A; 5EE9 A; 5D4B A; 1Q3V A; 3F2B A; 2LI6 A; 5DB6 A; 4M6W A; 3K75 D; 5H2F U; 1BGX T; 5G5H A; 1ZQG A; 2NRT A; 3EPI A; 4YN4 A; 2KJ9 A; 2HBJ A; 2PI4 A; 5J2D A; 3IG5 A; 2Y9U A; 2H3V A; 4KTQ A; 4EEL A; 1PVR A; 2W8L A; 2W11 A; 2AU0 A; 2BCV A; 3H8J A; 4P4M A; 4R66 A; 4ELT A; 1B0X A; 1CUK A; 1X9X A; 5D46 A; 2C22 A; 4QZA A; 1X9W A; 2PFN A; 3SAG A; 2AQ4 A; 4DL6 A; 1N5W A; 3HWT A; 4X5V A; 4NLK A; 4F92 B; 4ECQ A; 2VJ5 A; 4RU9 A; 1DGJ A; 5ALN A; 1RZT A; 4UB2 A; 1KRP A; 7ICU A; 4DFM A; 3TAN A; 2H3Z A; 4MHV A; 2HHX A; 2IOF K; 2H5X A; 7ICO A; 1ED1 A; 2M0N A; 3E0F A; 3M1Y A; 2F3N A; 4KLS A; 5JTI A; 2JEI A; 4J9N A; 1JN3 A; 4U7C A; 4RPX A; 1URJ A; 1NK4 A; 1K5O A; 1KEJ A; 4KMU A; 1S9F A; 2BKE A; 2DQN B; 1RQL A; 1Z00 A; 1IM4 A; 5J0R A; 5AM4 A; 4Y2S A; 1ZQC A; 4KX5 A; 5HHI A; 3QYP A; 3SYZ A; 5EWG A; 1ZQL A; 3PST A; 8ICE A; 2YTU A; 1OXJ A; 3AN1 A; 2ISP A; 4ECT A; 2KFZ A; 4YR0 A; 2W7P A; 5L1M A; 3RB3 A; 1NK6 A; 3OGU A; 4C8O A; 4LZD A; 5J0O A; 4O9M A; 4YD1 A; 1D9F A; 3Q8S B; 1J97 A; 2RQ5 A; 8ICC A; 2KP7 A; 1SL2 A; 4ACO A; 5AI8 A; 1SXE A; 1DK2 A; 2BZF A; 2CPR A; 2W9B B; 5KFD A; 5L1J A; 1RYR A; 2DL0 A; 4XA5 A; 1ZJM A; 4I2C A; 3BS7 A; 3PZP A; 5ALV A; 2QKQ A; 4USA A; 4QZD A; 5J0W A; 2UVV A; 2PFP A; 4U6P A; 5HMM A; 2DWQ A; 5AKY A; 2J6T A; 4DL7 A; 3JPS A; 3MR5 A; 4NXZ A; 3H8S A; 4QWB A; 3TAC B; 2LHT A; 3BDP A; 2WTF A; 5J2C A; 2EDU A; 2HCF A; 2BHN A; 3NGD A; 9ICU A; 1Z4O A; 1VJ5 A; 3ISC A; 2XGP A; 4I28 A; 4KLQ A; 7ICF A; 2KZZ A; 1L6N A; 4OJ6 A; 1ZD4 A; 9ICM A; 1SWW A; 1T4G A; 4OJ5 A; 4O3S A; 2HHV A; 5GTI U; 4ED2 A; 2ISO A; 5G5G A; 9ICL A; 3NAS A; 2RLT A; 3M6Z A; 1ZQI A; 4PGQ A; 5KT5 A; 4PL1 A; 3ZD8 A; 2YX8 A; 3Q8L A; 4YD2 A; 2NV3 A; 4TUP A; 3WK6 A; 5AKE A; 4BDP A; 3TAD C; 3PMN A; 4PZN A; 8ICH A; 4P0Q A; 9ICE A; 3HIL A; 5J8Y A; 2KVC A; 3BQ2 A; 4C8N A; 1RQN A; 4F5R A; 2F2A B; 9ICN A; 7ICG A; 4F5N A; 9ICA A; 5DGB A; 1KBU A; 2YQE A; 2GO7 A; 3LVW A; 1TK5 A; 4TUS A; 9ICQ A; 5B66 U; 3WKA A; 1X42 A; 4UBC A; 4M47 A; 5AI5 A; 3C28 A; 4F2R A; 3HX0 A; 3RRH A; 3QUB A; 4F72 A; 2H3Q A; 5F3X B; 1V85 A; 4CF3 A; 4ECW A; 1JX4 A; 4I29 A; 3MAB A; 4DQP A; 1MN8 A; 3QU9 A; 3U26 A; 4UB3 A; 3VCB A; 4F4X A; 1SKS A; 1ZQV A; 2EH9 A; 1D8B A; 2JH7 A; 2B0C A; 1SZP A; 4GIB A; 3C5F A; 9ICK A; 1TFR A; 2OXO A; 4ZH4 A; 2KJ5 A; 4NV0 A; 4IR1 A; 5ALM A; 1ZQR A; 3GDX A; 1LB2 B; 3ZDE A; 3UMB A; 1C20 A; 1B22 A; 3ORY A; 5DQI A; 1XS9 D; 1QTM A; 3C23 A; 3HPO A; 4RT2 A; 5AK5 A; 4C4T A; 3QZ8 A; 4M9G A; 2F76 X; 3GII A; 2MSN A; 4IL6 U; 4C8M A; 2EAO A; 3PSF A; 3FM9 A; 4F4Y A; 2BQR A; 4KLH A; 2F8K A; 2W9M A; 4KIT B; 3QE9 Y; 4I2D A; 2MAX A; 3ICX A; 4FS1 A; 4F50 A; 2A19 A; 4CDG A; 3F2C A; 5ALL A; 2HSZ A; 1BPZ A; 2QB0 A; 1ZQU A; 5ALU A; 3UXP A; 5AI9 A; 4DSJ A; 4J9R A; 4YP3 A; 4HAI A; 2JMG A; 4EEK A; 3TAQ A; 5ALF A; 1S0O A; 2BCS A; 3KFU F; 1X6I A; 1WCL A; 1Z1B A; 4UBB A; 4M6W B; 2OYY A; 3N28 A; 1BPE A; 5KG1 A; 4F4K A; 2ASJ A; 4QZH A; 4C0Z A; 2IMW P; 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5CWR A; 2CXY A; 1ZQE A; 1TV9 A; 5GTH U; 4IRK A; 1KW4 A; 2HVI A; 2VKQ A; 3BQ0 A; 2V9W A; 2ZJ5 A; 1S0V A; 4QWD A; 2K4H A; 2GLE A; 1MC8 A; 1B4F A; 1JI7 A; 3WKD A; 3ZD9 A; 2HOI A; 4C4R A; 2IBK A; 1JMS A; 3RR8 A; 8ICJ A; 1MQ3 A; 4US8 A; 3C2L A; 1UT8 A; 4JV1 A; 3OSN A; 2CN1 A; 1ZQY A; 4ED0 A; 4P0Q B; 4ZOH C; 5EE0 A; 1QQ6 A; 3JPO A; 1ECW A; 4QZC A; 1NKC A; 4BX9 C; 1V9P A; 3OHA A; 4PGY A; 3G6V A; 3ZDA A; 4FBU A; 4IR9 A; 3Q8M A; 3QUC A; 2QAR A; 3RB0 A; 5FP0 A; 2W03 A; 1T3N A; 1F5S A; 4WJ3 B; 3OJS A; 1NNL A; 4Y2Y A; 2YMP A; 8ICK A; 4UB6 U; 4K4I A; 2HMX A; 1NJY A; 8ICQ A; 3BQ1 A; 1ZQT A; 5L1I A; 1UA0 A; 3PW7 A; 2ASD A; 1ZQA A; 4MFC A; 1BPD A; 3MFH A; 4JK1 A; 3PR4 A; 2IOH A; 2OHF A; 2K4I A; 5CJ7 A; 1SXD A; 7ICP A; 1RYU A; 5IIO A; 3TAP A; 4YQW A; 2JH1 A; 1SB3 C; 2ZUD A; 4DQI A; 1NZB A; 2HBK A; 9ICR A; 2BPG A; 4M04 A; 4RT3 A; 4XRH A; 1S0N A; 3V6J A; 4C80 A; 1RXW A; 4YVZ A; 4EX7 A; 1J2M A; 3EYZ A; 1TK0 A; 1LKY A; 1O03 A; 5BOL A; 5HR7 A; 3UM9 A; 4EZ6 A; 4NM2 A; 3KHG A; 1ZQH A; 1HJP A; 2GWS A; 3H0L B; 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