The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
85
|
structure length |
85
|
Chain Sequence |
RVTVKYDRRELQRRLDVEKWIDGRLEELYRGREADMPDEVNIDELLELESEEERSRKIQGLLKSCTNPTENFVQELLVKLRGLHK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution NMR Structure of the Myosin Phosphatase Inhibitor Protein CPI-17 Shows Phosphorylation-induced Conformational Changes Responsible for Activation
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Sus scrofa
|
| molecule keywords |
CPI-17
|
| total genus |
20
|
| structure length |
85
|
| sequence length |
85
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | CPI-17 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1K5O A; 2RLT A; 1J2M A; 1J2N A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3QU7 A; 2B0C A; 1V38 A; 3BS5 B; 5III A; 3HT3 A; 4M2Y A; 3MDC A; 4DLE A; 4YD2 A; 4OO1 J; 1QLN A; 3Q8L A; 3E0F A; 5AI8 A; 5HR6 A; 1ZRN A; 5IIO A; 4UAU A; 4DEZ A; 5AM3 A; 4IRK A; 4EBE A; 3WKB A; 5F3X B; 4FO6 A; 1HEK A; 3UQ2 A; 5J0U A; 2BCS A; 2W54 A; 1SXD A; 3QU2 A; 1GO3 F; 2R8I A; 1N63 A; 3TAR A; 1RM6 C; 4RQ6 A; 4QWA A; 3M6Z A; 3FYH A; 2R18 A; 4KLL A; 2VA8 A; 5HML A; 3UXN A; 4P4M A; 1BGX T; 3ETL A; 1V97 A; 3H8W A; 2ATL A; 3Q8K A; 1SKW A; 7ICR A; 5DB6 A; 3C21 A; 8ICY A; 8ICJ A; 1NK0 A; 3B0X A; 1RQN A; 4QWC A; 1PK1 A; 2R8G A; 4DQP A; 4DQS A; 2LPE A; 4QZB A; 3QE9 Y; 2EAO A; 2BGW A; 4ACO A; 5ALQ A; 9ICC A; 1F0M A; 1KEJ A; 2BCR A; 1IV8 A; 2BPC A; 4KIT B; 2B21 A; 2CN1 A; 2KHV A; 4NLN A; 2HCF A; 1L7N A; 1T8E A; 3IM1 A; 4PGY A; 8ICR A; 4BUG A; 4CGZ A; 1KLN A; 4M47 A; 5ALS A; 1NJY A; 4JV2 A; 5ALR A; 5BPC A; 3SV3 A; 2JR5 A; 3N4M B; 2W9B B; 3TFR A; 5AI9 A; 1JN3 A; 2XCA A; 4BWJ A; 5KFB A; 4I27 A; 4PGX A; 4KLI A; 4KN7 A; 4AYB F; 2OWO A; 4MFA A; 4J9Q A; 1KDH A; 3SD7 A; 4IQT A; 2XI9 A; 3KZI U; 3UQ0 A; 4DS5 A; 4F2R A; 3T5H A; 4OJ6 A; 2PKE A; 8ICN A; 1KRP A; 4IR9 A; 2XY6 A; 2FLN A; 2ISP A; 4MF8 A; 3KFU F; 3D2S A; 8ICS A; 1L8O A; 2ES6 A; 4Z6C A; 2PFN A; 3PX4 A; 3V6K A; 2KJ8 A; 4JV1 A; 4P4O A; 2E8O A; 3K4G A; 2JZB B; 4QZG A; 3OHA A; 5KFL A; 2BZF A; 2ASD A; 2XC9 A; 2GLE A; 3NUQ A; 5IIL A; 4J9P A; 2E5S A; 2IOH A; 4UAS A; 2GO7 A; 2GH1 A; 1PZN A; 2K60 A; 4DOB A; 1XO0 A; 2KSO B; 1L7M A; 2YX8 A; 4U6P A; 5KG6 A; 4KMU A; 5KFV A; 1T3N A; 4EEK A; 1O03 A; 3IHQ B; 3PW2 A; 4B9N A; 2F1J A; 2B6G A; 2YMQ A; 7ICS A; 4O3S A; 3GV8 B; 1RXV A; 4UW9 A; 2WB1 C; 3KD3 A; 4CF5 A; 4FS2 A; 2E1E A; 1DK2 A; 3C28 A; 4JUZ A; 3RJK A; 2W3S A; 2LM4 A; 3F2C A; 2WF5 A; 3H8M A; 3UXO A; 4I2J A; 1QQ6 A; 2QKQ A; 1NZB A; 1Q3U A; 2EH9 A; 3HX0 A; 1T4G A; 3RJE A; 8ICT A; 1RG6 A; 4DSK A; 2F77 X; 2NRZ A; 5KFW A; 4GXI A; 3T5K A; 2IHN A; 4B9L A; 2MUT A; 5JU5 A; 4F50 A; 4F5N A; 3MBY A; 7ICM A; 3GZF A; 4F4W A; 3MFH A; 5JUM A; 1ZQP A; 4DSF A; 4B9T A; 1MQ3 A; 3AL0 B; 4ZH4 A; 2QB1 A; 2WFA A; 1RXW A; 4X5V A; 3C29 A; 3EUB 2; 2EDU A; 4C8K A; 5AKX A; 5D4B A; 4KLF A; 4GC6 A; 1ZXI A; 5AKJ A; 1TAQ A; 1P7D A; 5KFT A; 4ECT A; 2AHO B; 2MSN A; 4RNN A; 5J8Y A; 3H40 A; 4F8R A; 5AI5 A; 3UXP A; 5DKW A; 2W55 A; 2XO7 A; 2OCE A; 3ZD8 A; 1ZJN A; 1C20 A; 1L6N A; 3OGU A; 3H4B A; 1OW5 A; 5AM5 A; 2DKX A; 3N97 B; 1NKC A; 4LVS A; 2W04 A; 3H8S A; 2LBO A; 2NO5 A; 1TKD A; 3DEE A; 2HHV A; 5J0S A; 5J2G A; 3TKA A; 1SV0 C; 4R66 A; 3PZP A; 2JEF A; 1A77 A; 4JWM A; 5ALN A; 4ELV A; 2KNJ A; 2HVI A; 5G5H A; 4FS1 A; 4R63 A; 4RQ2 A; 1DGS A; 5KFR A; 3C2K A; 1TAU A; 3AMZ A; 2KVS A; 2K8B B; 2ZIX A; 1ZQU A; 4DFM A; 3QYP A; 2RRD A; 4QW8 A; 1X6I A; 4IS7 A; 4QZ8 A; 3I28 A; 1S0V A; 2CPR A; 2KFN A; 2HHU A; 4XUS A; 1IIP A; 4UAW A; 1L7P A; 3V6J A; 4UAY A; 5AK3 A; 4TUS A; 4R64 A; 2AH5 A; 3WK7 A; 2HOQ A; 2DBY A; 3KHH A; 1T3Q A; 2RDI A; 5KFF A; 2FMS A; 3IN5 A; 4F4Z A; 1U4B A; 1CUK A; 1ZET A; 4RZR A; 3M9N B; 4P0Q B; 1TVA A; 2JEI A; 1XNS A; 4O3Q A; 4HYK A; 5KFZ A; 1MC8 A; 1LV5 A; 3HWT A; 2KN7 A; 4C7Z A; 3CW2 C; 2E3T A; 2F44 A; 1ZQD A; 2IOF K; 5TZV A; 4HAI A; 1SL2 A; 1L8L A; 2F8L A; 4EX7 A; 4I2G A; 8ICU A; 5HHH A; 4C4R A; 2Y0S F; 2NRT A; 1AQ6 A; 2F1I A; 1PVR A; 4K4G A; 5AI6 A; 3QXG A; 5CP2 A; 3PNC A; 4DQR A; 4NM2 A; 1D8Y A; 4ED6 A; 2DGZ A; 3D6J A; 4O3M A; 7ICI A; 3A0H U; 3JPP A; 1S76 D; 5KG1 A; 5AKG A; 1V85 A; 5J0Q A; 4I2C A; 2AQ4 A; 3BS7 A; 3NRZ A; 2DPI A; 3JPQ A; 5AHX A; 1ZQ1 C; 4Q44 A; 1JXL A; 4R8U A; 1CI4 A; 3MFI A; 3AU2 A; 1A6S A; 5EWE A; 2ODG A; 1VDV A; 4CCH A; 4DSE A; 4US9 A; 5TIS U; 4Q8E A; 1Z4N A; 3RB6 A; 4DLG A; 4QWD A; 4FZM A; 3G6V A; 4F5Q A; 4DOC A; 2KEY A; 2YMP A; 2VJ5 A; 4F4Y A; 4DL7 A; 3TAN A; 2KIV A; 4MEX A; 3BQ7 A; 1PUZ A; 3M9M B; 3R9K A; 1KN5 A; 1CEZ A; 3RBE A; 2A3V A; 3PO5 A; 4KLM A; 1LKY A; 4GXK A; 5KFO A; 2P66 A; 1BPY A; 9ICR A; 3SZ2 A; 3H0R B; 4BXO A; 3EPI A; 3D2Q A; 1O08 A; 4QWB A; 1ZQG A; 1WG8 A; 4QZ9 A; 2IA6 A; 4QJF B; 4GFJ A; 2KJ9 A; 5ALF A; 1ZQR A; 1K1S A; 2KKP A; 2K4E A; 1KL9 A; 2YML A; 1MSW D; 1NZP A; 3LWL A; 1ZQN A; 2PFO A; 8ICI A; 5KFI A; 3NGD A; 2P6U A; 4M9L A; 1JXE A; 2D6F C; 1ZQC A; 1ZD2 P; 4OJO A; 5KFA A; 2DL0 A; 5KFY A; 2HHW A; 4FZL A; 2FPM A; 3QUC A; 2UVU A; 2EZY A; 1HIW A; 2HBL A; 2P35 A; 1RQL A; 2HMX A; 2PMZ F; 2AJQ A; 5HHI A; 2W9A A; 4Y2U A; 5KFU A; 2EQY A; 3H0L B; 5K4L A; 4C7Y A; 3TQ1 A; 1PVP A; 3RRH A; 2KHQ A; 1MN8 A; 2K8C B; 1MQ2 A; 5J2H A; 4ECZ A; 4P0P B; 5J8Y C; 2KOB A; 1NI3 A; 4ICA A; 3WK4 A; 4KX5 A; 2VJ4 A; 5CB1 A; 1TFR A; 3AM9 A; 3MC1 A; 4DSI A; 3SEI A; 8ICP A; 1QSS A; 1ZRM A; 3LDA A; 1YZ7 A; 4EZ9 A; 4YMO A; 5ALX A; 3GU3 A; 3N7P D; 3SEN A; 4ELT A; 4M9G A; 3M7D A; 2ZUB A; 4FFD A; 4A8E A; 2XY5 A; 1S5L U; 4I2I A; 2FPL A; 4XQ8 A; 3NRW A; 4LJX A; 1NJW A; 3MGV A; 4RPX A; 3ZD9 A; 3RH4 A; 2G5I B; 2P6R A; 2ZXI A; 4IQV A; 4YCX A; 2BCQ A; 1B43 A; 2R8K A; 3TAC B; 1XO1 A; 3C5F A; 4ZOH C; 5T14 A; 9ICG A; 2M0N A; 3ISB A; 4DS4 A; 1M6Y A; 4G9B A; 5AI4 A; 3GDX A; 4PHP A; 3QUT A; 4M6W B; 3B0Y A; 1EXN A; 3NS1 A; 3NVZ A; 3M9O B; 2DWQ A; 4GIB A; 5DBC A; 2W7O A; 3DV9 A; 3C23 A; 4GXJ A; 4Y2Q A; 3M1Y A; 3CRX A; 2ALZ A; 2Y9T A; 4U7C A; 4NLZ A; 1DRG A; 3QUB A; 2PFQ A; 3RJJ A; 5DB9 A; 5ALK A; 2HSZ A; 4J9L A; 1ARO P; 4QZD A; 2XGQ A; 1FIQ A; 2G06 A; 5ALH A; 3J81 j; 5AIC A; 9ICN A; 5B66 U; 5HR7 A; 5IIJ A; 2A1J B; 1J2M A; 1BNO A; 4C0Z A; 7ICG A; 7ICU A; 5L1M A; 4YXM A; 4J9N A; 1T94 A; 2ZIU B; 4O3N A; 2Y9U A; 4FBU A; 2W9B A; 1Y88 A; 4DF4 A; 5EE1 A; 2KVC A; 1ZQL A; 3LK9 A; 2OM6 A; 2F3N A; 2N1R A; 2KFZ A; 2DPJ A; 2ZIV B; 4I2D A; 5AK4 A; 3RR7 A; 3KTQ A; 3SYZ A; 2ZTD A; 4ED7 A; 3T5L A; 2G09 A; 5KNI A; 4M9N A; 9ICJ A; 8ICX A; 3O0F A; 1X9X A; 2BQ3 A; 4KMO B; 2UVV A; 2JZB A; 4IRC A; 4QIW C; 1N60 A; 2H3Q A; 4BWM A; 4EYI B; 3LVV A; 1ZQW A; 4I2E A; 4YP3 A; 1X9M A; 3ZDB A; 1QQ7 A; 1L3U A; 2KSO A; 2HBJ A; 3IG8 A; 1NKB A; 1KKX A; 3C1Y A; 5DG8 A; 4RPZ A; 2L5Y A; 4UB8 U; 4DL2 A; 5ALZ A; 2KZZ A; 2KD1 A; 1WWU A; 3EPG A; 3HPO A; 3QU4 A; 1WYG A; 3BQT A; 2WHE A; 5KFM A; 3RRG A; 1ZQY A; 5KFN A; 1ZJM A; 1XC9 A; 1QCK A; 5CEH A; 4F5P A; 4UAR A; 4NLG A; 1DOQ A; 3PSF A; 4DF8 A; 3T3F A; 2AU0 A; 4RT2 A; 5FP0 A; 1PK1 B; 3CNH A; 4MFC A; 3HJE A; 4ED1 A; 1YZ6 A; 5GTI U; 2ZXH A; 1V9P A; 3DDH A; 1U48 A; 1QSL A; 3G6Y A; 3JPR A; 1J97 A; 1NK7 A; 4ECV A; 4KX3 A; 4M9H A; 2A1A A; 2XIC A; 2YY6 A; 4R65 A; 1RPL A; 4BGD A; 1XSP A; 3WU2 U; 1L3V A; 2E8M A; 2HVH A; 3TAD A; 2KG5 A; 4PHD A; 1OXJ A; 4B9V A; 2LYH A; 3ETR A; 1JAL A; 2KV2 A; 3SQI A; 8ICW A; 9ICH A; 1X42 A; 1Z19 A; 2BHN A; 4DL6 A; 3GII A; 2VKQ A; 3QEA Z; 2J6U A; 2W3R A; 3PO4 A; 3RB4 A; 1XWL A; 1SKR A; 3EWA A; 5KFS A; 5DQG A; 1ZQF A; 4ECS A; 2BR0 A; 2KJ5 A; 3UMB A; 4ECX A; 1Z1V A; 2EAP A; 8ICG A; 1QH9 A; 1L3S A; 3BQ1 A; 2EZZ A; 2K4P A; 3HP6 A; 3KHG A; 3EYZ A; 5JRT A; 5KAI U; 4Z6D A; 4RNO A; 3PSI A; 1N2X A; 4IC9 A; 2IOF A; 3HIL A; 5CR0 A; 5F9L A; 2FMQ A; 2QB0 B; 2YTU A; 2ZIW B; 2D3D A; 5EWF A; 4OJ5 A; 3PW4 A; 5L1K A; 3M8R A; 4PL1 A; 9ICU A; 2A19 A; 4QNL A; 3L5K A; 3PW7 A; 5AKY A; 3RH6 A; 5CWR A; 3Q8M A; 2EZX A; 3MR5 A; 4DL3 A; 3LYS A; 4JK1 A; 3AQE A; 4Y2X A; 2DQN B; 4DL5 A; 3KZX A; 4YR0 A; 1SV4 A; 2W11 A; 5DGA A; 2E1F A; 5J2E A; 2HHT A; 2IMW P; 9ICI A; 2H3F A; 1N61 A; 4K4H A; 2LKY A; 2AQ0 A; 2WB1 F; 3K75 D; 2H3I A; 3BJY A; 1NJZ A; 3MGI A; 2HHS A; 4ECR A; 3BZC A; 5EOZ A; 4IL6 U; 3GV5 B; 2I1Q A; 1ZQM A; 4J9M A; 2K8A A; 2F1H A; 5F9N A; 4Y2J A; 4RU9 A; 1SZP A; 5DLG A; 3N28 A; 1ZQO A; 1X40 A; 9ICV A; 1ZQK A; 2F2A B; 4P0Q A; 7ICO A; 4DFJ A; 3HW8 A; 3PMN A; 4PPX A; 4ED3 A; 2WAQ C; 5J0T A; 5KG2 A; 2ISO A; 4CE6 A; 3A0B U; 8ICH A; 4P4P A; 3KHR A; 1S97 A; 4RQ0 A; 4DCC A; 2QAR B; 2HI0 A; 2ZJ5 A; 3F53 A; 4ED8 A; 3BQ0 A; 5AM0 A; 5J2B A; 4CF3 A; 4UB4 A; 1N56 A; 5J2J A; 2Q0Z X; 3HKZ C; 4Y2V A; 2KZM A; 3AEV A; 3KHL A; 1Z4O A; 4BX9 C; 2XY7 A; 3OHB A; 5HNK A; 2LYB A; 2KKV A; 4C4T A; 3IP4 B; 8ICM A; 4J9R A; 5J2C A; 5ALV A; 4JWN A; 5IIM A; 1B0X A; 4Z6E A; 3THV A; 3Q8S B; 4M0A A; 1UCV A; 4F3O A; 4I29 A; 4IQU A; 3N7R C; 1JIH A; 1KFD A; 4F72 A; 1X9S A; 1BPE A; 1RDF A; 1X6J A; 5ALU A; 3KBB A; 4UBB A; 1TAM A; 1DXS A; 5KT5 A; 2FLP A; 3WK8 A; 5DDM A; 1XSN A; 9ICL A; 4JB3 A; 4IQW A; 4ELU A; 2IBK A; 2I5H A; 2MU2 A; 4KLJ A; 7ICE A; 1JX4 A; 4NV0 A; 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4EBD A; 1NKE A; 4NL9 A; 2BCV A; 4BJQ A; 3F2B A; 3RTV A; 4UB1 A; 4YG2 A; 5ALG A; 4DO9 A; 4EX6 A; 4RQ8 A; 3E58 A; 2G0A A; 2ZG6 A; 2YN4 A; 3SMV A; 5HP4 A; 5L1L A; 2RLT A; 4M6W A; 2YQE A; 2BPG A; 3ONN A; 2KE7 A; 1ZQZ A; 4TQS A; 1L5U A; 4OD0 A; 5AKE A; 3Q8R B; 1NK9 A; 3BS5 A; 1SL0 A; 3H7I A; 5G5G A; 5DBA A; 3V7J A; 2RHF A; 1D8L A; 2IHM A; 8ICO A; 1NOM A; 1N5X A; 5CJ7 A; 1BPB A; 4KLU A; 1K1Q A; 3LWM A; 1UA0 A; 4CRX A; 5AM1 A; 2W9M A; 2A1J A; 1IXR A; 1UQV A; 2MAX A; 2AXT U; 3V7L A; 1HUO A; 1RYS A; 1ZQQ A; 4UAV A; 2ZIU A; 4RQM A; 3RJF A; 4FZN A; 3ZDD A; 1ZYQ A; 1S0O A; 2F76 X; 4RQ5 A; 2V9W A; 2J6T A; 3OTQ A; 5AIA A; 3AUO A; 2W9C B; 1Z00 B; 5ALM A; 2LYA A; 4KLE A; 1CRX A; 3CYM A; 1U9L A; 3GIJ A; 2ZIV A; 4I28 A; 2PXI A; 3EZ5 A; 1FEZ A; 1SKS A; 3ZDC A; 3JPT A; 5L1I A; 5ALD A; 4QZH A; 1KSP A; 1SV0 A; 9ICS A; 3KOO A; 4Q43 A; 4DFK A; 4DQQ A; 1IM4 A; 5KG5 A; 4QZE A; 1ZQI A; 4AYB C; 4ECU A; 2UVR A; 4I2F A; 2KK0 A; 4RNM A; 1YT3 A; 4TUP A; 2HW3 A; 3AN1 A; 2ZJ8 A; 4GC7 A; 2QLT A; 2HBK A; 3C2M A; 4M04 A; 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