The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
85
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structure length |
85
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Chain Sequence |
RVTVKYDRRELQRRLDVEKWIDGRLEELYRGREADMPDEVNIDELLELESEEERSRKIQGLLKSCTNPTENFVQELLVKLRGLHK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Sus scrofa
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| publication title |
Solution NMR Structure of the Myosin Phosphatase Inhibitor Protein CPI-17 Shows Phosphorylation-induced Conformational Changes Responsible for Activation
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CPI-17
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| total genus |
20
|
| structure length |
85
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| sequence length |
85
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | CPI-17 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RLT A; 1K5O A; 1J2M A; 1J2N A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5F9N A; 3Q8L A; 3L3F X; 5KG7 A; 3Q8K A; 1U47 A; 4IL6 U; 4YXJ A; 1KLN A; 2BQR A; 4C7Y A; 4B9T A; 1ZQV A; 5IIL A; 3V7J A; 4R66 A; 2EAO A; 1X9W A; 1SWV A; 3JPO A; 5B5E U; 1URJ A; 4KN4 A; 4ELV A; 1S76 D; 2W11 A; 1FIQ A; 3K1Z A; 2OHF A; 3RJE A; 2HOF A; 4I29 A; 5J2G A; 1H38 A; 1O08 A; 2MA1 A; 3KKA A; 3TAD A; 1MQ3 A; 4RT3 A; 3Q8M A; 2H3V A; 3SAF A; 3OSP A; 4KMO B; 8ICR A; 3HKZ C; 5J2D A; 5KFW A; 2MAX A; 4NM2 A; 1Z19 A; 1QTM A; 1JIH A; 4KLT A; 2ZTD A; 4UB4 A; 1CRX A; 3RB3 A; 5HR7 A; 1V38 A; 9ICO A; 5DBA A; 4GC7 A; 1B4F A; 4JWN A; 1N61 A; 1DGS A; 5ALR A; 2EDU A; 1SWW A; 2ZUD A; 5HHI A; 4QWA A; 2IOF A; 3UPQ A; 4XRH A; 2DF4 B; 5AM0 A; 2KFN A; 1N63 A; 4ZH4 A; 2MU2 A; 1B0X A; 4O0I A; 2K4H A; 4F72 A; 2AQ0 A; 4NLB A; 2RDJ A; 4EBE A; 5KFZ A; 4Z6E A; 4PHE A; 4O3R A; 1J2N A; 1U48 A; 2O6K A; 2AXT U; 1KSP A; 9ICP A; 1U9L A; 1S5L U; 2KKP A; 4Y2Q A; 5ALU A; 4ED3 A; 1Z4O A; 4YQW A; 4F5R A; 1PVR A; 1L5U A; 5D4B A; 2R8J A; 4QZI A; 4NM1 A; 5J8Y A; 2OH2 A; 2G0A A; 5ALQ A; 3C28 A; 4CF5 A; 1ZRM A; 3RF9 A; 1SKS A; 3KTQ A; 1ZQK A; 3WK5 A; 3M9N B; 4IQV A; 2DL0 A; 5KFT A; 4C8L A; 3QUQ A; 3HX0 A; 3T5J A; 3I1Y A; 2LKY A; 5AKH A; 4PL2 A; 4QNL A; 1DK3 A; 2HI0 A; 1A76 A; 3BQ0 A; 2YML A; 4F93 B; 4RT2 A; 1WUD A; 2UVU A; 4B9L A; 1ZD3 A; 2BCU A; 2DUY A; 2R8K A; 1XSN A; 4KLD A; 3FM9 A; 3DV9 A; 4C8N A; 4RNO A; 2P6R A; 2KEY A; 3QNM A; 8ICZ A; 4MFA A; 1BPX A; 2FPM A; 3R9K A; 2LI6 A; 5AIB A; 1S9F A; 2PFO A; 9ICA A; 4R8U B; 3QYP A; 4FE3 A; 1T94 A; 3H7I A; 9ICU A; 1ZQF A; 1TAM A; 5IIM A; 5G5H A; 3MR6 A; 4FZL A; 5J0X A; 2I6X A; 3PZP A; 4MEY A; 3MFH A; 4I2E A; 4ECY A; 1MC8 A; 4PH5 A; 1RXW A; 4NLK A; 2NO5 A; 2D6F C; 2HHW A; 3Q8R B; 3GIK A; 3LK9 A; 3PR5 B; 2B21 A; 5KFY A; 5KAI U; 1X6J A; 1S8O A; 3WKA A; 4EZ9 A; 5ALS A; 3DEE A; 5IIO A; 1ZJM A; 4I2D A; 3HT3 A; 4YFK A; 2GOL A; 4F3O A; 1WWU A; 4IR9 A; 2C2E A; 3RJF A; 3KKA C; 3AL0 B; 5AM1 A; 3LVW A; 4Y2R A; 2ZTE A; 2AQ4 A; 3L4P A; 2A1A A; 3M6Z A; 2R8I A; 1KFT A; 4YMM A; 1PVQ A; 1WG8 A; 4P4P A; 4F71 A; 1L7N A; 2EZX A; 4EBD A; 5ALT A; 1SIJ A; 1JN3 A; 2YY6 A; 5CWR A; 3OHB A; 1NK9 A; 4IS7 A; 4CDG A; 1Q46 A; 1ZQP A; 1PK3 A; 3N28 A; 4RQ1 A; 4M47 A; 2D3D A; 4DSL A; 4CF4 A; 1EXN A; 3WKE A; 2LM1 A; 3O0F A; 1UT5 A; 5KNI A; 5DBC A; 4YMO A; 2CN1 A; 3SZ2 A; 1L7M A; 5AKK A; 2ZIW B; 3H4D A; 5EWE A; 1B22 A; 4I2J A; 4DL3 A; 5J0T A; 2ZG6 A; 4I2I A; 1PZN A; 5J2J A; 2JV3 A; 2ZIU B; 5ALD A; 5J2B A; 4UAU A; 5DGA A; 1X2I A; 1Z3E B; 1IXR A; 1SL0 A; 3ZI4 A; 2LYA A; 4PGY A; 3NGD A; 4DF4 A; 2KFZ A; 1DXS A; 5ALO A; 1U4B A; 2K4P A; 1IIP A; 1D8B A; 4DFJ A; 1NOM A; 5KFU A; 4DLG A; 3N4M B; 3MGH A; 4JV0 A; 5AKL A; 4QZE A; 1OUQ A; 4KLO A; 4UB3 A; 5TIS U; 4C8O A; 4R8U A; 4GLX A; 2JGA A; 2QB1 A; 1KW4 A; 3BS5 B; 2VKQ A; 3NVW A; 5AKE A; 2H3F A; 5L1M A; 4RQN A; 1X40 A; 4TQS A; 3SR6 A; 3H0L B; 3ZDB A; 3GQC A; 8ICS A; 4FBT A; 2ESE A; 4GIB A; 2J6T A; 4M9J A; 1QQ6 A; 3BZC A; 4P4M A; 4DSJ A; 2QAR B; 4KLJ A; 3A0H U; 3H0M B; 4P2H A; 3IHQ B; 3AU6 A; 4EEY A; 3H8J A; 1ZQB A; 3QUB A; 5JUM A; 1ZRN A; 2KMD A; 2KZZ A; 4ED8 A; 4QZB A; 4PGQ A; 1KTQ A; 3GIM A; 4NLN A; 2H5X A; 4I27 A; 4AYB F; 5H2F U; 2E1F A; 4DF8 A; 4YMN A; 1N60 A; 3PW7 A; 1QQ5 A; 1B43 A; 2NV3 A; 4R63 A; 2BHN A; 2RRD A; 3PMN A; 8ICE A; 3PW2 A; 2FPL A; 3H8M A; 1T3N A; 1DRG A; 2B6G A; 3K1R B; 1X42 A; 5ALZ A; 2EAM A; 2HW3 A; 2F1J A; 4FS2 A; 2J6U A; 3LWM A; 1TK8 A; 1KBU A; 3RFA A; 4KLI A; 1X9S A; 4K4G A; 7ICS A; 3QE9 Y; 1KN5 A; 2DFL A; 2KVS A; 8ICV A; 1RYS A; 2ZIW A; 4BX9 C; 3GIL A; 3NVV A; 2NRZ A; 2OWO A; 1ZXI A; 3EPG A; 1QSS A; 1NK0 A; 3MBY A; 4C8M A; 2BQU A; 5BPC A; 9ICV A; 2UVV A; 5TZV A; 4NWI A; 2Y0S C; 4M9H A; 2ZXH A; 3KHG A; 1V9P A; 1L8L A; 4RPZ A; 4QW8 A; 2ZIU A; 4O3O A; 5ALW A; 2HSZ A; 1HEK A; 8ICK A; 3UXP A; 4EZ6 A; 1ZQW A; 4DS5 A; 1UCV A; 2Y9T A; 3RBE A; 5AKZ A; 2YB4 A; 1T4G A; 4OJP A; 2MRL A; 4J9P A; 1ZQR A; 1DK2 A; 2WF9 A; 2EAN A; 5GTH U; 3SD7 A; 2BQ3 A; 1ZQY A; 1X9M A; 3RJJ A; 5KFN A; 3M8S A; 2FI1 A; 3G6X A; 2YTU A; 2GH1 A; 2Y1J A; 3RRG A; 2XCA A; 1ZQ1 C; 4Z6C A; 5L1K A; 2HMX A; 3ORY A; 1N62 A; 1D8L A; 9ICI A; 8ICX A; 5DQG A; 1BPE A; 2EQY A; 4FFD A; 5KFA A; 3BS5 A; 1RPL A; 2WAQ C; 1TAU A; 4UAZ A; 1QSY A; 4LZG A; 2GLE A; 3F2C A; 1L7O A; 3A0B U; 5KG0 A; 4IQT A; 1KFS A; 2FPK A; 3PO4 A; 4R65 A; 2VA2 A; 2JEG A; 5DDY A; 2OM6 A; 5G5G A; 4ED0 A; 2ZXI A; 3BZK A; 2W9M A; 5AI9 A; 1XO1 A; 3ZD8 A; 1ED1 A; 2ALZ A; 4ECX A; 4JK1 A; 4KLS A; 5J0S A; 4C4S A; 2ZIV B; 2ZUC A; 2RHF A; 3C2L A; 4RQ0 A; 2FJ6 A; 3RH6 A; 5AK6 A; 2KKV A; 3PSP A; 5HR6 A; 2K89 A; 1SL1 A; 5CRX A; 2FE9 A; 1ZQN A; 3WK6 A; 5JRT A; 1Q8K A; 2JXJ A; 1Z1B A; 1BPZ A; 1YZ6 A; 2KHV A; 3KOO A; 1NJZ A; 2KJ8 A; 7ICI A; 2KSO B; 4RU9 A; 2RDI A; 4IC9 A; 1SV4 A; 1SL2 A; 4XUS A; 5ALV A; 2Z7J A; 3AQF A; 3PW0 A; 5ALH A; 5ALI A; 2HBM A; 4YCX A; 4YR2 A; 2WB1 C; 1ZQE A; 5HNK A; 3UMG A; 7ICT A; 9ICT A; 2W9A A; 4BGD A; 2QLT A; 5DG8 A; 3BQT A; 3B0X A; 1NJX A; 4PGX A; 4QIW C; 1RXV A; 2H3Z A; 4FZM A; 3AMZ A; 2Q4T A; 4RQ2 A; 3ICX A; 4Y2P A; 4EEL A; 3H40 A; 2LHT A; 2JHD A; 3WKD A; 3T3F A; 1N2X A; 2RP5 A; 7ICH A; 3NS1 A; 5J0W A; 4QZ8 A; 5IIK A; 4RNM A; 5E79 U; 4IRD A; 4HAI A; 8ICO A; 3K75 D; 1FFV A; 1QH9 A; 4EX7 A; 3PSI A; 3C1Z A; 3LWL A; 1T8E A; 2G07 A; 3I28 A; 1QCK A; 2DKX A; 5CJ7 A; 3CRX A; 3PVX A; 9ICC A; 5AI4 A; 4P4O A; 2JEF A; 4EEK A; 4NL9 A; 2ZJ5 A; 1UA0 A; 3IM1 A; 3NVZ A; 1CEZ A; 4Y2T A; 1XSL A; 2RLT A; 1X6I A; 2XC9 A; 1T3Q A; 4GFJ A; 3OJS A; 5KTQ A; 3EPI A; 5J2H A; 4ELU A; 4UAS A; 2EAP A; 2R18 A; 1U45 A; 2CRX A; 2UVW A; 4F8R A; 1ZQJ A; 3C1Y A; 4ED6 A; 2FLL A; 3FAH A; 5ALG A; 1OXJ A; 4AP9 A; 5KT2 A; 3TKA A; 1SKW A; 4JWM A; 4RQ8 A; 3D2N A; 4ICA A; 1ZET A; 4RPX A; 2KZM A; 2G09 A; 1KDH A; 3B0Y A; 2ZIV A; 4UQG A; 2VIX A; 2E8N A; 3F2D A; 4M6W B; 2VJ5 A; 5KG4 A; 3NUQ A; 3N7R C; 3TAR A; 4C4R A; 1N5X A; 3GFK B; 2MSN A; 4I2C A; 5HP4 A; 1ZQA A; 4P0P B; 3JPN A; 4DQS A; 1TK0 A; 7ICQ A; 2GWS A; 3IV6 A; 2VJ4 A; 4M2Y A; 4IQW A; 2W04 A; 2HHT A; 5DBB A; 2KSO A; 2ZJA A; 1ZQO A; 1YZ7 A; 1S97 A; 1ZOL A; 4DOA A; 4TQR A; 2KIW A; 4U6P A; 4UB5 A; 5EE9 A; 3H8W A; 4LJX A; 5KFE A; 2BCV A; 2I1Q A; 5A0L A; 2NRV A; 2YMM A; 2AU0 A; 4KLE A; 3F5A A; 2CXY A; 3QZ8 A; 3GV8 B; 4ECS A; 2HVH A; 2AGP A; 4PZO A; 2OYY A; 5AM3 A; 1IV8 A; 3T79 A; 2KNJ A; 2F2A B; 5KFV A; 3NAS A; 7ICV A; 1NNL A; 3I76 A; 1C7Y A; 2V9W A; 1NI3 A; 1ZQG A; 4DWI A; 2AJQ A; 4ELT A; 9ICM A; 2VA8 A; 5EWG A; 7ICR A; 2A1J B; 1SXE A; 5BOL A; 2ISP A; 2KHQ A; 4DOB A; 1Z1V A; 2BZF A; 1U49 A; 4DL7 A; 5KFM A; 5J29 A; 3TAC B; 3M6K A; 4J9Q A; 3J81 j; 1MA7 A; 4JMU A; 3GV5 B; 4EEN A; 3QUC A; 1FO4 A; 3ZDC A; 5J0P A; 5DQH A; 3H8S A; 4QZG A; 2J6S A; 2BGW A; 1ZQX A; 2JH7 A; 4DCC A; 4QZ9 A; 5ALX A; 2KD1 A; 4O3N A; 4FS1 A; 2IHM A; 2HBK A; 4JUZ A; 2AGQ A; 1ZQQ A; 4QZF A; 5DB6 A; 4NLC A; 4PZN A; 3U26 A; 2K60 A; 5KFK A; 4Q8F A; 4UB1 A; 3RB0 A; 5HHH A; 2JZB B; 3TAD C; 1XC9 A; 2BPG A; 7ICP A; 4CE6 A; 3BS7 A; 7ICG A; 4DFD A; 1L3U A; 8ICU A; 2DQN B; 3HKZ F; 3UXN A; 5AKG A; 2BR0 A; 1ZJN A; 5KG5 A; 2HVI A; 4J9L A; 3V7L A; 3WK7 A; 2NRT A; 1TFR A; 4DLE A; 2WF8 A; 4DL5 A; 3C5G A; 1PVP A; 4F2R A; 5J2C A; 2F1H A; 3CW2 C; 5AI8 A; 3N97 B; 4Q43 A; 1ZYQ A; 1DOQ A; 4KIT B; 4M6W A; 3WK4 A; 3EWA A; 3RB6 A; 2JH1 A; 4J9K A; 4ECT A; 1IG6 A; 8ICT A; 5KG2 A; 5KFF A; 4DQI A; 3OHA A; 1ECW A; 1RM6 C; 5AK4 A; 1WWV A; 4P0P A; 4Y2J A; 1QQ7 A; 4FZN A; 4YG2 A; 2P66 A; 4F5N A; 5KL8 B; 4RZR A; 2WF6 A; 4NJ8 A; 3PSF A; 3TQ1 A; 3UXO A; 4DL6 A; 4O5C A; 1COO A; 5J8Y C; 5KAF U; 1KFD A; 3PV8 A; 2W7P A; 4UAY A; 4P0Q B; 4GC6 A; 4EX6 A; 2W3S A; 3VCB A; 4KTQ A; 4GXJ A; 1NJW A; 1PUZ A; 1A0P A; 4RQM A; 3MR2 A; 1LKY B; 1Z4N A; 4F4W A; 4B9V A; 4J9N A; 3PW4 A; 4UB2 A; 4CRX A; 1ZQI A; 2XGQ A; 3PR4 A; 4QZC A; 4B9M A; 1ZQD A; 3RJK A; 5ALE A; 1XSP A; 5J0Q A; 1F44 A; 4EBC A; 1SV0 A; 4IRK A; 5AKX A; 4KLG A; 4NXZ A; 3NRZ A; 1D9D A; 3MFI A; 3UMB A; 1RDF A; 3VC8 A; 1LVH A; 3TI0 A; 5AIA A; 5AM5 A; 5D46 A; 2FMS A; 5IIN A; 2RQ5 A; 5KFS A; 4RQ5 A; 1A77 A; 3PW5 A; 4X5V A; 4NY8 A; 1WYG A; 1MSW D; 2JZB A; 4PL1 A; 4Y2S A; 4J9R A; 1WCN A; 4DQP A; 2NO4 A; 4QZH A; 5DG7 A; 2W3R A; 1TAQ A; 2OXO A; 1RQL A; 2QKQ A; 3ETL A; 4C8K A; 1S0N A; 4RQ6 A; 4UAR A; 4KX3 A; 3OJU A; 1P7D A; 1X9X A; 8ICJ A; 2K4E A; 4RUA A; 2VA3 A; 3IDW A; 5CP2 A; 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1TE2 A; 4C4T A; 2R8H A; 2C2D A; 2C28 A; 4J03 A; 1JXL A; 3PY8 A; 4RQ7 A; 5KT7 A; 5KFG A; 1SXD A; 3IP4 B; 4C7Z A; 4B9N A; 3B9J A; 3LVV A; 5F3X B; 1SKR A; 5C5J A; 4F4X A; 2KZ3 A; 2KOB A; 2N1R A; 3RAQ A; 4DOC A; 5CEH A; 4LVS A; 4B9S A; 3QU4 A; 1XWL A; 2PFN A; 1UHU A; 5EE0 A; 1MN8 A; 3QZ7 A; 5AM2 A; 5AI6 A; 4ECV A; 2W55 A; 8ICQ A; 7ICK A; 2Y1I A; 1FFU A; 3MC1 A; 3SV4 A; 2LMR A; 2BPC A; 4YN4 A; 3SYZ A; 4C80 A; 7ICN A; 3E2E A; 1ZQZ A; 2ZJ8 A; 4ED1 A; 1UPH A; 5KFQ A; 1AQ6 A; 1TVA A; 5KG3 A; 3ZD9 A; 3HWT A; 2ASJ A; 4YR0 A; 4KX5 A; 1XNS A; 2ISO A; 5KFB A; 3BQ2 A; 5KT5 A; 3NTU A; 2DWQ A; 1LB2 B; 5J0O A; 3KHH A; 5J2I A; 4Y2V A; 4DSF A; 2KP7 A; 1LV5 A; 5KFJ A; 2WF5 A; 3ISD A; 2ZIX B; 3RJH A; 3NRW A; 3KHL A; 5ALN A; 8ICL A; 2YX8 A; 2JEI A; 4YP3 A; 2BPF A; 4OO1 J; 2Y0S F; 3UQ2 A; 1S10 A; 5CR0 A; 4O3P A; 1ZQT A; 1KL9 A; 3AM9 A; 4Y2U A; 2LYB A; 2XY6 A; 1JUD A; 2MUT A; 1NK4 A; 2XY7 A; 3MR5 A; 3F53 A; 4KLU A; 3BQ7 A; 4OJ6 A; 3V6K A; 1PK1 B; 4DFP A; 1RYR A; 4ZOH C; 5J0Y A; 2LPE A; 2KTQ A; 2QB0 B; 3FC4 A; 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