The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
|
sequence length |
77
|
structure length |
77
|
Chain Sequence |
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDRLYELLQHILKQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Native interface of the SAM domain polymer of TEL.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
TRANSCRIPTION FACTOR ETV6
|
| molecule tags |
Transcription
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
24
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
|
| chains with identical sequence |
C, E
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-04-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2EAP A; 1LKY A; 1OW5 A; 1X66 A; 1WWV A; 2D3D A; 1SXE A; 3BS7 A; 1PK1 A; 1SV0 C; 2E8O A; 2JV3 A; 2L5Y A; 1Z1V A; 5KNI A; 3TAC B; 1RG6 A; 2DL0 A; 2KSO B; 2KIV A; 4NL9 A; 2QKQ A; 2EAN A; 2K4P A; 2QB0 B; 2F8K A; 2KE7 A; 2FE9 A; 3SEN A; 2E8N A; 2E8M A; 1SXD A; 5F3X B; 2QB1 A; 4IS7 A; 2QB0 A; 2KG5 A; 2Y9U A; 1PK3 A; 1SGG A; 3SEI A; 3TAD C; 5JTI A; 1B4F A; 4NJ8 A; 3H8M A; 4RQM A; 5J8Y A; 2QAR B; 2Y9T A; 3IDW A; 3KKA A; 1JI7 A; 2ES6 A; 1V85 A; 2D8C A; 4MHV A; 2KSO A; 1SV4 A; 2LPE A; 1WWU A; 1SV0 A; 1DXS A; 2EAM A; 2GLE A; 5JU5 A; 1LKY B; 2F3N A; 1OXJ A; 1KW4 A; 4NL9 C; 1UCV A; 5JRT A; 2DKX A; 2LMR A; 1V38 A; 2K60 A; 3BS5 B; 3HIL A; 3BQ7 A; 4RQN A; 4PZN A; 1F0M A; 2F44 A; 2QAR A; 2B6G A; 4PZO A; 5L1M A; 3K1R B; 3BS5 A; 2DKZ A; 1UQV A; 1B0X A; 2EAO A; 1X9X A; 3TAD A; 5J8Y C; 3KKA C; 2YTU A; 2E8P A; 1X40 A; 2KMD A; 1PK1 B; 1COK A; 2ESE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4QWC A; 4JMU A; 5KFZ A; 1HUZ A; 1NJX A; 2WTF A; 4XQ8 A; 8ICN A; 3EZ5 A; 3HKZ F; 4ED8 A; 2HOI A; 3BS7 A; 3QYP A; 1SWW A; 2BR0 A; 4Z6F A; 2L5Y A; 2HW3 A; 4ED7 A; 2OHF A; 3GV8 B; 2AXT U; 1TK5 A; 4XRH A; 4U6P A; 5KAI U; 1TVA A; 3MR6 A; 8ICQ A; 4LZD A; 1L8O A; 2KOB A; 3OGU A; 4ED6 A; 9ICW A; 3WKA A; 1T8E A; 1BNO A; 2VJ4 A; 3RB3 A; 4O3R A; 2PFN A; 4E0D A; 1Z4O A; 2F1I A; 1K1S A; 3RAQ A; 4RQM A; 4YXM A; 8ICB A; 3PSI A; 1D9F A; 5AM3 A; 4UB2 A; 1L7M A; 4DEZ A; 3JPQ A; 1NK7 A; 5CP2 A; 1KQQ A; 5J2D A; 5BPC A; 2V9W A; 3V72 A; 7ICM A; 1Q8K A; 4OJO A; 4IRD A; 3RJG A; 4G9B A; 2C22 A; 2ZIW B; 3H0R B; 2KKV A; 2P6U A; 4M04 A; 1ZJN A; 4AP9 A; 3SZ2 A; 2F8L A; 2RDI A; 3BS5 B; 1VDV A; 1TK0 A; 1N2X A; 5AK6 A; 4TUR A; 4I2H A; 1JMS A; 2B6G A; 5H2F U; 3MGI A; 1RXV A; 2DPI A; 3PST A; 5J2B A; 1SIJ A; 2Y0S F; 1L3V A; 4ECU A; 4JV0 A; 5KL1 B; 1ZQJ A; 1FEZ A; 2HBM A; 5IIJ A; 5J2E A; 3D2Q A; 1COK A; 5DGA A; 2EZX A; 2JEJ A; 2MUT B; 7ICI A; 4YFK A; 5KFD A; 1U9L A; 3PX0 A; 3RBE A; 7ICO A; 1SV0 C; 3C2L A; 4P4P A; 3SAF A; 3H8J A; 3EYZ A; 1QLN A; 1ZQC A; 4CRX A; 9ICL A; 3Q8K A; 1S77 D; 2N1R A; 4EEL A; 1NK6 A; 3Q8S B; 3LYS A; 2HBL A; 3ONN A; 1DGS A; 2K4P A; 4RNN A; 4QW8 A; 1N63 A; 3RJF A; 5GTH U; 8ICS A; 2AGQ A; 4Y2P A; 5F3X B; 5DB7 A; 2ZIX A; 2OXO A; 4DL7 A; 3I76 A; 1SGG A; 2ZXH A; 3SEI A; 3LK9 A; 2NO4 A; 2C28 A; 4O3S A; 8ICW A; 2PFQ A; 4HAI A; 3SV4 A; 3V6K A; 4KLH A; 2RP5 A; 4KN7 A; 9ICG A; 1A6S A; 2V4Q A; 4O5E A; 4BX9 C; 4YQW A; 4JWM A; 3PO4 A; 4QZB A; 5L1K A; 3NVV A; 5ALT A; 9ICX A; 4QZC A; 2XY5 A; 5AKZ A; 4IR9 A; 8ICX A; 4RQ6 A; 1XNS A; 2A1J B; 4YD1 A; 8ICK A; 5BOM A; 2KZZ A; 3I1Y A; 1RYS A; 2MU2 A; 2A3V A; 2PFO A; 3IM1 A; 3M9M B; 5CEH A; 3PW5 A; 4K4H A; 2WF7 A; 2UVR A; 4OCZ A; 5DB6 A; 5KFV A; 1BPY A; 2H3F A; 1Z1B A; 4YG2 A; 9ICI A; 1FIQ A; 4GC6 A; 1UQV A; 4UAR A; 3H0L B; 2BQ3 A; 3BJY A; 5JUM A; 1ARO P; 2FLN A; 7ICJ A; 4P0P B; 2HHS A; 3AL0 B; 1OW5 A; 5D49 A; 2UVU A; 3QUT A; 3MGH A; 5J0O A; 3U26 A; 1Z4N A; 4JUZ A; 4YCX A; 3NVY A; 9ICS A; 4EX6 A; 7ICH A; 4NLN A; 2W7O A; 4O0I A; 1KBU A; 1ZYQ A; 2MSN A; 4DSI A; 4ZH4 A; 1LVH A; 3M7D A; 3RJH A; 2V4R A; 1LB2 B; 2IOF K; 3QE9 Y; 4EEY A; 1URJ A; 1Z00 A; 3J81 j; 2ISP A; 1NNL A; 2QB0 B; 3NAS A; 4R64 A; 2FMQ A; 5ALM A; 3BZK A; 4DQP A; 2FE9 A; 4KN4 A; 4JV2 A; 2W9A A; 2BPC A; 4F4X A; 2F1J A; 2KIW A; 4O9M A; 2A19 A; 4ECV A; 5AKK A; 1DGJ A; 4P0Q A; 5K4L A; 4RQ4 A; 1Q46 A; 5DQI A; 4P4M A; 1D8B A; 4GC7 A; 2LYH A; 3RJJ A; 5DG8 A; 2Y1J A; 4U7C A; 2WFA A; 1L3T A; 2AHO B; 2DBY A; 2Q4T A; 2E1E A; 3UXN A; 4KTQ A; 1SZP A; 4C0Z A; 2HHW A; 1ZQG A; 1UCV A; 5KG1 A; 4RQ2 A; 2BCS A; 4PL1 A; 5KFK A; 5GTI U; 3HIL A; 4Y2U A; 2HDO A; 2AQ0 A; 5ALF A; 4DFM A; 3H8W A; 2W55 A; 3E2E A; 9ICV A; 2JZB B; 4RQ0 A; 3BS5 A; 2KFN A; 1F5S A; 4QWA A; 2W9B B; 1L8L A; 3N4M B; 5DDY A; 4F8R A; 2KTQ A; 3L5K A; 5AM2 A; 3EUB 2; 1BPX A; 4ECQ A; 1ZQK A; 1ZQE A; 4EBE A; 7ICR A; 3PV8 A; 4MFF A; 3V6H A; 5ALW A; 4EBD A; 4FZM A; 2AH5 A; 2GH1 A; 2I1Q A; 4J9R A; 3ZDB A; 5HP4 A; 1SL1 A; 4EX7 A; 3SV3 A; 3MGV A; 5A0L A; 2W8K A; 1TK8 A; 2ISO A; 3HKZ C; 5J2A A; 2K4H A; 2BDU A; 1XSL A; 2HHV A; 1O08 A; 4RQ1 A; 3SEN A; 3PW0 A; 2LM1 A; 4F71 A; 4CE6 A; 4QWE A; 2HCF A; 3RH6 A; 4I2C A; 4X5V A; 3LWM A; 4DS5 A; 4FBT A; 3D2S A; 4JWN A; 1K1Q A; 5J0T A; 1S10 A; 3GIL A; 2VJ5 A; 4F5R A; 1UHU A; 2KZ3 A; 4ECW A; 1A77 A; 4YR3 A; 4DQR A; 1JX4 A; 3N7S C; 2W11 A; 4Y2S A; 2D8C A; 3PML A; 2WB1 F; 2MRL A; 4BDP A; 7ICK A; 5AM1 A; 2PI5 A; 5KG6 A; 3FAH A; 4NM1 A; 4OJP A; 4OJ6 A; 4F2R A; 2IOF A; 9ICO A; 2ZIU B; 3V6J A; 1CRX A; 1ZD4 A; 2XID A; 3RH5 A; 8ICG A; 2A1J A; 2BQU A; 3BQ7 A; 3L3F X; 4RT2 A; 2F44 A; 4ED1 A; 2QAR A; 3NTU A; 4PGX A; 1FFU A; 2H3I A; 3MDC A; 4ECY A; 2KIC A; 4MF2 A; 5DB8 A; 2DKZ A; 1MN8 A; 3C21 A; 3AN1 A; 4UB4 A; 3F2C A; 3SAH A; 8ICI A; 4YVZ A; 4RU9 A; 4C8N A; 2KP7 A; 3NRW A; 3TI0 A; 5AI5 A; 2HHT A; 4P0P A; 2Y0S C; 1MSW D; 4KLO A; 2WF6 A; 3ZD9 A; 1XO0 A; 1JRO A; 1FFV A; 5DDM A; 1L3S A; 5DBC A; 4I2J A; 1ZQN A; 1JXE A; 3BDP A; 4NV0 A; 5KFA A; 1KEJ A; 2G08 A; 4NLB A; 2ZTC A; 2BCR A; 1O03 A; 5KG5 A; 5CR0 A; 2E8N A; 1SXD A; 4F3O A; 5III A; 1V9P A; 2QB0 A; 3ORY A; 4DL2 A; 2ZG6 A; 4LJX A; 2E1F A; 3GQC A; 5AKE A; 5AKG A; 3OJS A; 4ELU A; 4YP3 A; 3RH4 A; 5J8Y A; 3H4B A; 4O3Q A; 3UMB A; 4GXK A; 2VKQ A; 4MFA A; 5AKL A; 3AQE A; 4ELV A; 9ICM A; 9ICF A; 5EE3 A; 4C8M A; 3SAG A; 1JXL A; 2YY6 A; 5ALH A; 1ECW A; 2BZF A; 2XCA A; 2GLE A; 4XUS A; 1NKE A; 8ICC A; 2KN7 A; 7ICP A; 4ICA A; 5JRT A; 4Y2J A; 1L6N A; 1TAM A; 3M6Z A; 1IIP A; 3QUC A; 4DFP A; 4KLJ A; 1N61 A; 2NRX A; 1ZQY A; 4IQV A; 1NI3 A; 3UPQ A; 4MFC A; 1A0P A; 4IRC A; 2BPG A; 4I28 A; 1Y88 A; 4BXO B; 4R8U B; 2RQ5 A; 5AI9 A; 2W43 A; 4DO9 A; 3R9K A; 8ICU A; 3T5H A; 1PK1 B; 4M9N A; 2EAP A; 5ALZ A; 1XS9 D; 1X6J A; 1X42 A; 3JPS A; 3DEE A; 1B43 A; 2XGQ A; 7ICG A; 1UT5 A; 3JPO A; 5HHI A; 2G06 A; 4FS1 A; 3JPN A; 3AQF A; 4NL9 A; 3G6Y A; 4DLE A; 5EE9 A; 3MR5 A; 3BZC A; 2KD1 A; 5EE0 A; 4DCC A; 1A76 A; 5AM5 A; 2BPF A; 4IQW A; 4Z6E A; 4C4T A; 3TKA A; 3KBB A; 1RDF A; 3KOO A; 4YMO A; 4I2A A; 5ALO A; 1B22 A; 3JPP A; 2W9M A; 4KMO B; 4F93 B; 4QZE A; 3KHL A; 3WKB A; 1DRG A; 1DOQ A; 4RZR A; 2R8K A; 4DL5 A; 2UVW A; 2RRD A; 2KSO A; 4UB3 A; 4KLU A; 1IV8 A; 4O5C A; 3KHG A; 4DSK A; 7ICU A; 5AIC A; 4PHE A; 4EEK A; 3GIM A; 5KFP A; 1KTQ A; 3RFA A; 3PW4 A; 4NLK A; 1TV9 A; 3PSP A; 1S76 D; 2W9C B; 3QEB Z; 4RQN A; 2ZIU A; 4RT3 A; 7ICF A; 1N56 A; 4EYI B; 5L1M A; 3H7I A; 1N5W A; 3C5G A; 3MBY A; 1BNP A; 2YX8 A; 5AIA A; 3HP6 A; 3QZ8 A; 2YTU A; 2DF4 B; 2DWQ A; 2ZIV A; 5DBB A; 1ZQW A; 5DLG A; 4C7Z A; 3WK7 A; 2ODG A; 2BCU A; 4KMU A; 3UM9 A; 3A0B U; 4PJ0 U; 9ICQ A; 3KTQ A; 2ZTE A; 3BQT A; 2JV3 A; 1S5L U; 1SL2 A; 4UQG A; 2H5X A; 3D6J A; 2ZUC A; 4O3N A; 4F91 B; 3O0F A; 3M8R A; 1H38 A; 2ZJ8 A; 4C4R A; 2KFZ A; 4DFJ A; 1PZN A; 7ICV A; 2AGO A; 4KLL A; 3OTQ A; 1UA1 A; 2F8K A; 5KG0 A; 4GFJ A; 2GOL A; 4UBB A; 1XSN A; 2VA2 A; 2BCQ A; 5J2H A; 2KKP A; 4JV1 A; 4TUQ A; 3GDX A; 4CF3 A; 3M6K A; 4M6W A; 3UMG A; 1HEK A; 2ZUD A; 1DK3 A; 1B4F A; 4DFK A; 1QQ6 A; 4CNQ A; 4YR2 A; 4B9N A; 3T79 A; 3IDW A; 3KKA A; 4Q8E A; 1JI7 A; 2ES6 A; 2JR5 A; 3UXP A; 3HJE A; 4OJ5 A; 5ALQ A; 5KG4 A; 5KG2 A; 2R8H A; 3IG5 A; 4OD0 A; 2E3T A; 4NWI A; 1HIW A; 5J0Q A; 3ZD8 A; 4RUC A; 5AKJ A; 7ICL A; 4FZN A; 4QZD A; 2LYB A; 3MR3 A; 3G6X A; 4TUS A; 4J9S A; 5DQH A; 2WB1 C; 4ELT A; 3CW2 C; 2XVT A; 1NJZ A; 4R65 A; 3KFU F; 3EPG A; 1TAQ A; 3V7L A; 3T3F A; 3Q8L A; 5KFM A; 1SB3 C; 3DV9 A; 1NK4 A; 4Q43 A; 5KFN A; 5BOL A; 3ISC A; 1Q3U A; 9ICR A; 1LKY A; 4R8U A; 3CP8 A; 3WK4 A; 3Q8Q B; 3HW8 A; 5DKW A; 4F4W A; 1AQ6 A; 2IHN A; 1PK1 A; 4RPZ A; 1PVR A; 2YMM A; 3VC8 A; 1VLB A; 1ZQO A; 3RRG A; 3FDS A; 3UQ2 A; 5ALI A; 1EXN A; 5DLF A; 3NUQ A; 3GIK A; 4ED3 A; 3LDA A; 1S0M A; 5AKH A; 3OSP A; 2JHD A; 1XU4 A; 5DG9 A; 4DOC A; 3D2N A; 4NLC A; 2IMW P; 7ICN A; 2IHM A; 7ICQ A; 4KLI A; 1YZ6 A; 2DGZ A; 9ICH A; 1UT8 A; 5JTI A; 1NK5 A; 3IN5 A; 5ALD A; 1MQ2 A; 2OYY A; 4PHD A; 1RZT A; 2GO7 A; 4ED2 A; 4US9 A; 4UAU A; 1ZD2 P; 4QZG A; 5EWE A; 1ZQH A; 1KL9 A; 4DQQ A; 3Q8P B; 1ED1 A; 1GO3 F; 4I2I A; 3TFR A; 1WWU A; 2CPR A; 3F5E A; 2YB1 A; 4FE3 A; 2DPJ A; 2EQY A; 4UB6 U; 8ICR A; 1YT3 A; 2AJQ A; 2Z7J A; 8ICY A; 1NZP A; 1ZQL A; 3K75 D; 5HNK A; 1BPB A; 3PO5 A; 3SQI A; 5G5H A; 4GXJ A; 1S9F A; 2NRW A; 3SR6 A; 1L5U A; 1WCN A; 3OHA A; 1ZJM A; 3NGD A; 1B0X A; 4AYB C; 2EAO A; 3TAD A; 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3G6V A; 4PGQ A; 1D8Y A; 3GII A; 5CWR A; 5EWF A; 3PW2 A; 2W3R A; 1D9D A; 3GV7 B; 2D6F C; 3QU2 A; 3GFK B; 2R8J A; 4B9U A; 3SMV A; 3RJI A; 2HVI A; 5KFE A; 2OH2 A; 9ICN A; 5DGB A; 2HBJ A; 1WCL A; 3QU7 A; 5DG7 A; 8ICL A; 4B6J A; 4OO1 J; 1S0O A; 1S8O A; 5KFU A; 2EAN A; 4ECZ A; 2GWS A; 3IP4 B; 5DBA A; 4J9L A; 3L4P A; 3ETL A; 2FDR A; 2O6K A; 3ETR A; 4DF4 A; 1RYR A; 5KTQ A; 2P66 A; 5TIS U; 2KG5 A; 2Y9U A; 3WK5 A; 3H4D A; 1ZQX A; 2I6X A; 5AI0 A; 3PZP A; 5IIK A; 5HHH A; 4F5N A; 1U45 A; 2HBK A; 4O5K A; 1SKW A; 5J2K A; 2FMS A; 4USA A; 7ICT A; 2PI4 A; 3C2K A; 4EEN A; 5TZV A; 4M47 A; 3HX0 A; 4QW9 A; 4Q8F A; 3FYH A; 5AHX A; 3DDH A; 1SV4 A; 2LPE A; 4C8K A; 1RM6 C; 3C1Z A; 2J6S A; 2VA8 A; 4Y2R A; 4J9M A; 5G5G A; 2KK0 A; 5CRX A; 4B9S A; 1NKC A; 2LI6 A; 1U4B A; 3MFH A; 2DKX A; 1ZD5 A; 5CB1 A; 2K60 A; 5C0Y A; 1BVS A; 4J03 A; 2HVH A; 1SKS A; 3RR8 A; 3RB4 A; 1BPE A; 1NOM A; 1N5X A; 3ZDE A; 3K1R B; 2YB4 A; 1J2N A; 7ICS A; 2JXJ A; 5KFL A; 3T5K A; 1L7N A; 3E0F A; 5AKX A; 4US8 A; 2XY7 A; 5J8Y C; 4M9J A; 1QH9 A; 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