The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
|
sequence length |
77
|
structure length |
77
|
Chain Sequence |
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKDLLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILKQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Native interface of the SAM domain polymer of TEL.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
TRANSCRIPTION FACTOR ETV6
|
| molecule tags |
Transcription
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
24
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
|
| chains with identical sequence |
D, F
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-04-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4NJ8 A; 2E8P A; 1UQV A; 2Y9T A; 2JV3 A; 2KE7 A; 1WWU A; 2K60 A; 4PZO A; 2EAO A; 1F0M A; 3BQ7 A; 2QB0 B; 4IS7 A; 3BS5 A; 1UCV A; 1X66 A; 2EAM A; 2KSO A; 1LKY A; 5JU5 A; 1JI7 A; 2LMR A; 2QKQ A; 2F44 A; 3BS7 A; 5L1M A; 2GLE A; 3HIL A; 1X40 A; 2KG5 A; 2KIV A; 1SGG A; 3KKA C; 4PZN A; 1SV4 A; 3BS5 B; 3KKA A; 1X9X A; 2KMD A; 2Y9U A; 1OXJ A; 2KSO B; 1LKY B; 4NL9 C; 5J8Y C; 4NL9 A; 2ESE A; 5J8Y A; 1OW5 A; 2QAR A; 3IDW A; 4MHV A; 2DKX A; 1COK A; 1SV0 C; 1KW4 A; 1SV0 A; 5F3X B; 2E8N A; 2F3N A; 3SEI A; 2EAN A; 2YTU A; 1B0X A; 2F8K A; 1V38 A; 2QAR B; 1PK1 A; 2E8M A; 2FE9 A; 2K4P A; 2DL0 A; 2D8C A; 1V85 A; 1WWV A; 2DKZ A; 2EAP A; 4RQM A; 1DXS A; 1SXD A; 2QB1 A; 5JRT A; 2ES6 A; 1SXE A; 3K1R B; 3H8M A; 2L5Y A; 2LPE A; 1RG6 A; 1PK1 B; 2E8O A; 3TAC B; 2D3D A; 3TAD C; 4RQN A; 3TAD A; 1PK3 A; 2QB0 A; 5KNI A; 1B4F A; 1Z1V A; 3SEN A; 5JTI A; 2B6G A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2MU2 A; 2LYH A; 2CPR A; 4DQP A; 2KD1 A; 4KLL A; 2KNJ A; 4F8R A; 5KFB A; 4PHE A; 2FLN A; 1JXL A; 2YX8 A; 2EAO A; 2R8I A; 2G5H B; 2YMP A; 5TIS U; 2WTF A; 3MBY A; 3NVZ A; 1TK8 A; 5AKE A; 4F3O A; 1X66 A; 1XC9 A; 4YR0 A; 5JU5 A; 5DB7 A; 5KTQ A; 5DKW A; 3QU4 A; 4JWN A; 4BJQ A; 1D9D A; 5B5E U; 1SWW A; 5DB6 A; 4I2J A; 4KLT A; 3QUQ A; 5KG0 A; 2KSO B; 3GV8 B; 3UQ0 A; 1LV5 A; 2PI5 A; 1V9P A; 1D8Y A; 4E0D A; 2AXT U; 4KLJ A; 1RYU A; 1S77 D; 1S0M A; 8ICM A; 4BXO A; 4UB6 U; 3ZDB A; 4EEK A; 3M9N B; 3V6K A; 4RQ6 A; 3H40 A; 4ZOH C; 1X9W A; 9ICT A; 4DEZ A; 1WG8 A; 4DOA A; 1PVQ A; 4PHA A; 1MC8 A; 9ICF A; 3V6J A; 5J0U A; 2CN1 A; 4FS1 A; 3AUO A; 5J0R A; 2DL0 A; 5T14 A; 2IHM A; 4OD0 A; 1V85 A; 5DB9 A; 2A1A A; 5AKH A; 4MFC A; 4F5Q A; 1KFS A; 2ES6 A; 5DQH A; 1ZQD A; 1X9M A; 4YXJ A; 2DPI A; 2F1I A; 1KKX A; 2KP7 A; 1X6I A; 1PK1 B; 3HRD D; 4QNL A; 2R8J A; 1SWV A; 3J81 j; 2ZUD A; 9ICO A; 4M6W A; 2IMW P; 1N56 A; 5KT5 A; 1BNO A; 3N7S C; 2RP5 A; 3FDS A; 4JWM A; 4OJP A; 2ZUC A; 4QW9 A; 1UQV A; 2Y9T A; 2YN4 A; 4GXI A; 3AMZ A; 9ICE A; 5AI8 A; 2FMS A; 4Y2S A; 4MFA A; 5ALH A; 3RJH A; 2LI6 A; 3WK8 A; 3JPS A; 4YD2 A; 2LM4 A; 3WK6 A; 4F4X A; 3OHB A; 3T5J A; 3NTU A; 3BS7 A; 3QZ8 A; 2Y1I A; 7ICP A; 2JRZ A; 2KIW A; 2J6T A; 2BKE A; 1X40 A; 2KZM A; 4YD1 A; 5DGA A; 3KKA A; 9ICJ A; 1BPE A; 3OJU A; 2ZIX A; 4YVZ A; 5KFD A; 4YMN A; 4ECY A; 4GIB A; 5KFL A; 4QZI A; 9ICA A; 3PSI A; 5KFF A; 9ICC A; 8ICI A; 3ZDC A; 2DKX A; 1ZQM A; 5D46 A; 1NK0 A; 3H0R B; 4YR3 A; 2W11 A; 1JIH A; 1X42 A; 1QH9 A; 4O3P A; 2F3N A; 3F53 A; 5KFV A; 4B9S A; 4UQG A; 2BZF A; 5CJ7 A; 5AM0 A; 2HVH A; 1NOM A; 4DL7 A; 3WK5 A; 3QU9 A; 4M9H A; 5ALI A; 3FC4 A; 1NZB A; 4K4I A; 2WF5 A; 1Z1B A; 4I29 A; 3T5H A; 2G08 A; 2WF9 A; 3ZI4 A; 3RBE A; 2I9G A; 2EDU A; 4NY8 A; 4EBE A; 4O3O A; 5KG7 A; 1DOQ A; 3RBD A; 4NM2 A; 2J6U A; 5IIK A; 2J6S A; 2OYY A; 1TKD A; 2H3Z A; 2HDO A; 3ICX A; 4O9M A; 4IC9 A; 2A1J B; 2UVR A; 1L8L A; 3G6Y A; 2FPM A; 2YB1 A; 3SD7 A; 5JTI A; 4UB5 A; 2B6G A; 5DQG A; 4NM1 A; 2HBM A; 2DPJ A; 1A76 A; 3K75 D; 2BCQ A; 3UXO A; 2JV3 A; 1A77 A; 1NJY A; 2ZUB A; 2LHT A; 4GLX A; 4ICA A; 5BOM A; 4KLF A; 1J2M A; 2P66 A; 1UT8 A; 4ED7 A; 3RJJ A; 3GV5 B; 8ICB A; 1SL1 A; 4CF5 A; 1MSW D; 1V97 A; 2GLE A; 4R63 A; 4DL5 A; 2JEG A; 5KFT A; 4QWD A; 1T4G A; 1SV4 A; 4P0P B; 4X5V A; 2XCP A; 4ECW A; 1HEK A; 1JXE A; 5KFY A; 1A0P A; 2VJ4 A; 1BPZ A; 1ZD5 A; 4RQ0 A; 1ZQR A; 2ZXI A; 2HBK A; 5J2C A; 5ALV A; 2IA6 A; 9ICV A; 1TK0 A; 5HNK A; 1ZQK A; 1L3U A; 2IBK A; 2ZTC A; 4IQU A; 3RR7 A; 2E8N A; 5J0Q A; 4YXM A; 4QZ9 A; 3V7J A; 1BNP A; 3MR6 A; 1B0X A; 3O0F A; 1H38 A; 4MFF A; 1Z4N A; 3NAS A; 2FE9 A; 5EE9 A; 2Y1J A; 4UAY A; 2D8C A; 1NZP A; 3FYH A; 4LZG A; 1WCL A; 4O3Q A; 4F4W A; 3OGU A; 3C2L A; 4EX7 A; 5EE3 A; 1KRP A; 2YQE A; 5KG3 A; 3NGD A; 1Z00 B; 3ISB A; 1N5X A; 3ZDE A; 1K1S A; 1SZP A; 4PGX A; 1ZQX A; 5JUM A; 2GO7 A; 4O0I A; 2HHW A; 3ZD9 A; 3SV4 A; 3AU6 A; 2LM1 A; 4TQR A; 4KLH A; 3WKB A; 2H3F A; 1HJP A; 4UAS A; 4P4P A; 3CNH A; 1SL2 A; 4RQ1 A; 4JMU A; 4NJ8 A; 1KQQ A; 1N48 A; 8ICL A; 1ZQ1 C; 9ICS A; 1ZQS A; 3BDP A; 4PZO A; 5AM4 A; 2OH2 A; 4ECU A; 4NWI A; 2V4R A; 2KVS A; 5CWR A; 2C2D A; 3NRZ A; 2FI1 A; 2NRZ A; 3GV7 B; 9ICX A; 3EUB 2; 1LKY A; 2ZIW A; 2E5S A; 1ZXI A; 2LMR A; 2K89 A; 1CUK A; 1XS9 D; 2K8B B; 5KT4 A; 2C2E A; 4ECS A; 3HIL A; 2JR5 A; 2KIV A; 2G0A A; 1SGG A; 2G5I B; 2W3R A; 2XVT A; 7ICN A; 2OWO A; 1YT3 A; 2H3I A; 3A0H U; 4OJL A; 2A19 A; 2Y9U A; 1TVA A; 1Z4O A; 4PPX A; 1N61 A; 2DUY A; 3RF9 A; 4NL9 A; 5AI5 A; 4K4H A; 1QQ7 A; 3QXG A; 1SV0 C; 1N60 A; 2DBY A; 5F9N A; 5DDY A; 3IM1 A; 5H2F U; 4I2H A; 4KLI A; 1NK6 A; 2YTU A; 4P4M A; 2P6U A; 5KL1 B; 2ZIV A; 5DLF A; 4RQ2 A; 1JRO A; 4O3N A; 1Z19 A; 2F8K A; 4Q43 A; 2ZTE A; 4NLK A; 4NV0 A; 1ZQG A; 5DBA A; 3JPO A; 3F2C A; 5KT2 A; 5IIL A; 1RYR A; 3GDX A; 3KHR A; 3D2N A; 4RQ7 A; 2YML A; 1JRP A; 5KFP A; 2XCA A; 1ZQY A; 4RQ5 A; 4ECV A; 2HHV A; 5KG4 A; 1ZOL A; 7ICE A; 1KDH A; 1Q3U A; 4DSF A; 2V4Q A; 3BZK A; 4MEY A; 1HUZ A; 3Q8R B; 4B9N A; 5J0W A; 4M47 A; 2ASD A; 4DS5 A; 4AYB C; 4O5K A; 7ICT A; 5C0Y A; 3MGH A; 4ECT A; 4QZG A; 3H8J A; 1S5L U; 2XI9 A; 3RH6 A; 4O3R A; 1A6S A; 5KFQ A; 3WKA A; 4C8K A; 4KLM A; 3QEA Z; 4ED8 A; 2K60 A; 3PSP A; 5AM3 A; 1B22 A; 2ALZ A; 2XO7 A; 8ICR A; 3JPT A; 5J2H A; 5L1L A; 4KMU A; 2RLT A; 4DLE A; 3IG5 A; 2H5X A; 3LYS A; 2AH5 A; 4RT3 A; 1N2X A; 2MA1 A; 4BWM A; 2UVV A; 5AI4 A; 4F4K A; 2VA8 A; 5J2K A; 4F71 A; 5KFJ A; 3V6H A; 3RB3 A; 2WB1 C; 1FIQ A; 3ETL A; 4F91 B; 3N28 A; 3PX6 A; 3Q8P B; 3T3F A; 4Z6D A; 3M6Z A; 3PNC A; 5DDM A; 3DDH A; 1TAU A; 4JV0 A; 5DBC A; 1AQ6 A; 3LVW A; 4I2D A; 3ALR A; 4R66 A; 4DOB A; 3OSP A; 2HHS A; 3V72 A; 9ICL A; 1RYS A; 3E0F A; 5ALD A; 1COO A; 2XC9 A; 1T94 A; 2WB1 F; 3WU2 U; 1PVP A; 2HHQ A; 4UBB A; 5AI9 A; 1SXE A; 5HR6 A; 1L7M A; 4Q45 A; 2HI0 A; 3UXN A; 4GFJ A; 1L3V A; 1RG6 A; 3TAC B; 1N5W A; 2IHN A; 3UPQ A; 3H8W A; 4O5E A; 4PHP A; 3MFH A; 1RDF A; 2VA2 A; 4ACO A; 3THV A; 5L1J A; 1ZQF A; 1YZ7 A; 7ICR A; 3SEN A; 5ALT A; 5J2J A; 2I1Q A; 4RU9 A; 8ICV A; 2ASJ A; 8ICF A; 4DF4 A; 2F76 X; 4J9S A; 2KVC A; 3RH5 A; 4EEL A; 1CI4 A; 3TI0 A; 5GTH U; 5KG6 A; 4CF4 A; 1F44 A; 5CB1 A; 4J9O A; 1S9F A; 4Q8E A; 3TFS A; 3F5E A; 3UMC A; 3M6K A; 2JXJ A; 8ICX A; 4ECQ A; 9ICN A; 2AQ0 A; 3PML A; 3BQ1 A; 2BQR A; 1U45 A; 3MDC A; 2K4I A; 2WAQ F; 1Q46 A; 2AU0 A; 3RRH A; 5AIA A; 1ZRM A; 3AQE A; 3R9K A; 1Y88 A; 3BZC A; 1ZQI A; 4IR9 A; 5KFO A; 5KAF U; 3KHL A; 4JUZ A; 1NK9 A; 4Y2R A; 1N62 A; 4RZR A; 4TQS A; 3EPG A; 2C28 A; 1S0N A; 4PJ0 U; 3OPX A; 1ZQE A; 4R8U A; 3PW7 A; 4QWC A; 4NXZ A; 3SR6 A; 4UB1 A; 2OHF A; 5KFW A; 1UA1 A; 2NV3 A; 5HHI A; 3E58 A; 5HMM A; 4RQ3 A; 8ICH A; 2A3V A; 3QE9 Y; 4HYK A; 2QLT A; 2F1J A; 5KFC A; 5AKJ A; 4ED1 A; 2AHO B; 2EAP A; 4RQM A; 2AJQ A; 5ALP A; 2PFP A; 4Y2T A; 5TZV A; 1ZQQ A; 4USA A; 5ALE A; 4C0Z A; 2JMG A; 2BPF A; 8ICN A; 2ZJA A; 5J2A A; 2ZIU A; 3MR5 A; 1NNL A; 1OUQ A; 1PK3 A; 2I6X A; 9ICP A; 2QB0 A; 4M9J A; 8ICJ A; 1RQN A; 3ONN A; 2MUT A; 3TAN A; 4F92 B; 4GXK A; 3H7I A; 1QSS A; 4J9M A; 3D6J A; 4KLE A; 2W9C B; 2W3S A; 4BWJ A; 3TAQ A; 1WWU A; 4M04 A; 3B0Y A; 9ICM A; 3G6X A; 2M0N A; 2KJ5 A; 4I28 A; 4C8M A; 3EW9 A; 4EX6 A; 1IM4 A; 2FMP A; 4C8N A; 7ICM A; 8ICC A; 3KZI U; 1QQ6 A; 3QNM A; 4RUC A; 3Q8K A; 1IXR A; 5L1M A; 4NLC A; 3B9J A; 5L1K A; 2NRX A; 3RAQ A; 4TUS A; 1U48 A; 2R8H A; 1BPY A; 5A0L A; 2LBO A; 4PZN A; 3BS5 B; 4K4G A; 3M1Y A; 4GXJ A; 3DV9 A; 3G6V A; 2PMZ C; 4EYH B; 9ICU A; 2PFO A; 1BPB A; 2JZB B; 3JPN A; 1QSY A; 2F2A B; 5ALR A; 5ALX A; 5ALZ A; 1ZQO A; 4MHV A; 2VAN A; 1COK A; 5F3X B; 2ZXH A; 3C5F A; 5III A; 2ZIV B; 7ICL A; 5KG2 A; 4DO9 A; 5F9L A; 1D9F A; 1TAM A; 2BCU A; 2RRD A; 2BDU A; 2YMQ A; 2QAR B; 3NVW A; 1SL0 A; 5DBB A; 5AKK A; 5ALU A; 3C23 A; 7ICV A; 3KHH A; 4QWB A; 4YMM A; 3ISD A; 2FJ6 A; 4ECZ A; 2PMZ F; 2VA3 A; 5AKY A; 5BPC A; 2QB1 A; 2NO5 A; 1X2I A; 4M9L A; 2JGA A; 1KL9 A; 2LPE A; 2E8O A; 2YY6 A; 4DQR A; 4O3M A; 4LJX A; 4I2I A; 4YN4 A; 4IRK A; 5KAI U; 1L7N A; 3BQT A; 1JAL A; 4Q44 A; 2PFQ A; 4F5R A; 4I2E A; 5ALS A; 8ICE A; 2B0C A; 4DFD A; 1WUD A; 4UB8 U; 2AGP A; 4KLO A; 2GH1 A; 3HWT A; 2CRX A; 4KN4 A; 3H4D A; 9ICB A; 4IR1 A; 4P0Q A; 3SAH A; 1LB2 B; 4F2S A; 8ICS A; 5KG5 A; 4FZL A; 4IQW A; 5DG7 A; 4QIW C; 4TUP A; 1IV8 A; 1KLN A; 4RPX A; 5KT3 A; 2CXY A; 4YQW A; 2H3Q A; 1ARO P; 1JMS A; 2KK0 A; 2HCF A; 5HHH A; 1ZET A; 4YMO A; 2JEF A; 3C28 A; 5KT7 A; 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2AGQ A; 3IN5 A; 1ZQW A; 1PK1 A; 3NVV A; 5KFI A; 4BXO B; 5AK3 A; 3MFI A; 1WWV A; 1B43 A; 4OJ6 A; 4UB3 A; 3LVV A; 2P6R A; 2MRL A; 2W8L A; 1SB3 C; 4ELU A; 2XIC A; 2NRV A; 4UAW A; 4I2B A; 1FO4 A; 3TAD C; 4M2Y A; 5AK6 A; 1NK5 A; 5CR0 A; 1IIP A; 1KTQ A; 1QTM A; 1NJW A; 1B4F A; 1KFD A; 4MF2 A; 3I28 A; 3RJK A; 3ZD8 A; 3L5K A; 5EE1 A; 2DFL A; 4US8 A; 8ICW A; 3H0M B; 4I2C A; 3RB6 A; 4Y2P A; 4M6W B; 4C7Z A; 3K4G A; 3QUT A; 2IOF K; 5KFZ A; 4J9R A; 4DSI A; 4QW8 A; 2NO4 A; 1N63 A; 2R8K A; 4CE6 A; 2XY6 A; 1BVS A; 3D2Q A; 5KFS A; 2KG5 A; 2BQU A; 2JH1 A; 2K4H A; 5ALO A; 1CRX A; 4F5N A; 2RDI A; 7ICI A; 4J9K A; 4DQI A; 2G09 A; 1XSL A; 4EYI B; 2W9A A; 5J8Y C; 4JV1 A; 4FFD A; 3T79 A; 1OW5 A; 5KFG A; 1MQ3 A; 3IDW A; 1XNS A; 3EZ5 A; 2XID A; 3HX0 A; 3N4M B; 2B21 A; 2ZTD A; 8ICY A; 3IRU A; 2ZIX B; 3SEI A; 4AYB F; 2R8G A; 2C2R A; 4F4Z A; 2FMQ A; 3RFA A; 1V38 A; 4QWE A; 2HVI A; 4Y2Q A; 5KFX A; 5EE0 A; 2W9M A; 3PR5 B; 4IRC A; 7ICS A; 2A1J A; 4P2H A; 1SXD A; 3TAP A; 4QJF B; 3L3F X; 1YZ6 A; 1S8O A; 3PV8 A; 3MR2 A; 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