The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
|
sequence length |
77
|
structure length |
77
|
Chain Sequence |
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKDLLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILKQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Native interface of the SAM domain polymer of TEL.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
TRANSCRIPTION FACTOR ETV6
|
| molecule tags |
Transcription
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
24
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
|
| chains with identical sequence |
D, F
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-04-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QB0 A; 1LKY A; 3K1R B; 1OW5 A; 2E8O A; 2FE9 A; 2DKZ A; 4MHV A; 5JU5 A; 2E8P A; 2Y9T A; 1Z1V A; 5L1M A; 1V38 A; 3KKA A; 2ESE A; 3IDW A; 3TAC B; 1UCV A; 3KKA C; 2E8M A; 1SV0 A; 2F8K A; 2ES6 A; 3TAD A; 5F3X B; 1KW4 A; 2LPE A; 2D3D A; 4PZO A; 2K60 A; 1PK1 B; 1WWU A; 2L5Y A; 3TAD C; 1SXD A; 2QKQ A; 2F3N A; 1PK1 A; 2YTU A; 1SGG A; 2QB1 A; 1WWV A; 2QAR B; 2D8C A; 1JI7 A; 2EAM A; 2KG5 A; 2QAR A; 4PZN A; 2LMR A; 2KMD A; 1UQV A; 1X9X A; 2DKX A; 1OXJ A; 5KNI A; 5J8Y A; 1SV0 C; 4NL9 A; 5JTI A; 3BS5 B; 1SV4 A; 1SXE A; 2JV3 A; 2K4P A; 1RG6 A; 3BS7 A; 4NL9 C; 3BS5 A; 1V85 A; 4NJ8 A; 3HIL A; 4RQM A; 1DXS A; 2B6G A; 1X40 A; 1X66 A; 2KE7 A; 2F44 A; 1COK A; 2Y9U A; 2E8N A; 1B4F A; 2DL0 A; 2KIV A; 2EAN A; 1B0X A; 1PK3 A; 1F0M A; 5JRT A; 5J8Y C; 2KSO B; 2GLE A; 3SEN A; 4RQN A; 3SEI A; 2EAP A; 2KSO A; 3BQ7 A; 2QB0 B; 1LKY B; 4IS7 A; 3H8M A; 2EAO A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2ISP A; 2MUT A; 1NK0 A; 1NK7 A; 3WKB A; 4IC9 A; 2KIC A; 3CW2 C; 3M6K A; 3RJK A; 1L3T A; 2FMS A; 1RXV A; 5JUM A; 4F50 A; 1DGS A; 1MQ2 A; 5B5E U; 3PML A; 9ICR A; 4HYK A; 2BPG A; 1WWU A; 4PPX A; 2L5Y A; 3HW8 A; 3RH5 A; 1ZQ1 C; 4I2D A; 1D8B A; 5ALW A; 3SQI A; 2W9C A; 4DQP A; 1N2X A; 4KLI A; 3QU2 A; 5CWR A; 4KMU A; 3Q8K A; 7ICM A; 2OM6 A; 5CA7 A; 2HHT A; 2YMP A; 2PMZ F; 2YY6 A; 3WU2 U; 2JH7 A; 5J2A A; 1K1Q A; 3E0F A; 2BQU A; 2KKP A; 5T14 A; 2A3V A; 4ED7 A; 5ALY A; 2W03 A; 5KAI U; 7ICN A; 4IRD A; 3QU4 A; 4QZ8 A; 1ZQV A; 3M9O B; 2KK0 A; 4UAW A; 3RAX A; 4TUS A; 4QW8 A; 5J0W A; 2D6F C; 3Q8R B; 5AM4 A; 4NLB A; 2KV2 A; 8ICE A; 1TFR A; 7ICI A; 4RT2 A; 2Y9U A; 4YMM A; 4RPZ A; 2KFZ A; 2JHD A; 1X6J A; 1Z1B A; 1KFS A; 4PHP A; 5DQG A; 1B0X A; 2R18 A; 5D4B A; 2KSO B; 2RHF A; 2PKE A; 1NK9 A; 4Q45 A; 4B6J A; 5J2C A; 3LK9 A; 1B22 A; 3QX7 A; 3PNC A; 3CP8 A; 3KHR A; 3H7I A; 2QB0 A; 4DS4 A; 4DFJ A; 2O6K A; 1A0P A; 1OW5 A; 5AKK A; 4QWA A; 1Q8K A; 5AKL A; 4F5P A; 4IQW A; 5AKX A; 5KFD A; 4JWN A; 4C8O A; 3JPR A; 5DLG A; 1WG8 A; 3C5F A; 5L1M A; 4O3M A; 1COO A; 5KFJ A; 3O0F A; 5C5J A; 4P0P A; 3TAC B; 1JX4 A; 4XQ8 A; 2A1A A; 4DL6 A; 2AGP A; 2HW3 A; 8ICB A; 1PK1 B; 5KFV A; 5G5G A; 3QNM A; 3LWL A; 3NUQ A; 3EPG A; 4CF5 A; 3PR5 B; 3RR8 A; 1D8Y A; 2HBM A; 5ALD A; 5IIK A; 3AU2 A; 4LJX A; 1NKC A; 2ZTC A; 5HR7 A; 4KLT A; 2FPM A; 1GO3 F; 3TAP A; 2DKX A; 2Y0S F; 1L3V A; 1KSP A; 4Y2T A; 4PGX A; 1KL9 A; 4O0I A; 4PHD A; 2WB1 F; 3C2L A; 3F5A A; 4UB1 A; 9ICW A; 2LM4 A; 4DFP A; 2UVU A; 9ICB A; 2WAQ F; 4R66 A; 1SKW A; 1QSS A; 1U47 A; 2EZZ A; 2ZIX A; 1QQ5 A; 4BXO A; 7ICE A; 9ICS A; 1KTQ A; 1UT5 A; 2KE7 A; 2F44 A; 2WTF A; 3HJE A; 4NM2 A; 3Q8L A; 5KG4 A; 1ZQJ A; 4YCX A; 4NV0 A; 3MGH A; 2KIV A; 1PZN A; 2ODG A; 1S5L U; 8ICT A; 1F0M A; 4CF4 A; 4G9B A; 4M9L A; 1ZYQ A; 9ICQ A; 2ISO A; 1BPE A; 5KFT A; 5AM0 A; 4EYI B; 4R64 A; 4ELV A; 2C2R A; 2CRX A; 2MUT B; 4A8E A; 4Z6E A; 4JB3 A; 3ISC A; 5ALT A; 2E8O A; 4X5V A; 4J03 A; 3H0R B; 4P4O A; 2PFO A; 4NM1 A; 2G07 A; 3D6J A; 4Q43 A; 4QZE A; 1ZQE A; 4UBB A; 2PMZ C; 2VJ4 A; 3V7L A; 1SWV A; 2KN7 A; 4RPX A; 1MSW D; 5J29 A; 4UQG A; 4UAS A; 1T94 A; 4R63 A; 4ECQ A; 1XO0 A; 4YXJ A; 5ALG A; 5GTI U; 1JUD A; 4R8U A; 1WWV A; 3MR3 A; 4ED8 A; 3D2N A; 4ZH4 A; 1Q46 A; 1FFU A; 4RUA A; 3C21 A; 4QNL A; 5J2F A; 2LBO A; 1ZQX A; 1U4B A; 4YQW A; 3HPO A; 3RB4 A; 5G5H A; 3BQ0 A; 1SIJ A; 2VA2 A; 4IR1 A; 4F72 A; 3I76 A; 1CI4 A; 1ZQW A; 2DUY A; 2YMM A; 8ICO A; 2AXT U; 4UBC A; 2OEH A; 1N5X A; 3BS5 A; 4KX3 A; 4BWJ A; 4BJQ A; 1L7P A; 2BCR A; 3ZI4 A; 1MC8 A; 2F1J A; 3ZDE A; 8ICJ A; 2JRZ A; 1S97 A; 4M6W A; 5KG2 A; 2KP7 A; 4DO9 A; 2F76 X; 3UXN A; 5AM3 A; 5AK4 A; 4QZI A; 4F5O A; 4ED6 A; 2AJQ A; 4DSE A; 3WK5 A; 1XSN A; 5C0Y A; 5L1K A; 3M7D A; 4DL7 A; 1KKX A; 3TQ1 A; 2QB0 B; 3GU3 A; 2W43 A; 2KZZ A; 4F3O A; 5KT4 A; 2WF5 A; 2FLN A; 4K4I A; 4KIT B; 4YD2 A; 4QZD A; 2KKV A; 2CPR A; 4JV1 A; 3E58 A; 5KG1 A; 5DDM A; 3LYS A; 1DRG A; 1V9P A; 4DQQ A; 5F9N A; 3UMG A; 2BDP A; 4P0P B; 2W9A A; 5DBC A; 3IN5 A; 5ALE A; 2Y0S C; 4F92 B; 4PHA A; 2WB1 C; 2GO7 A; 4I2J A; 4F2R A; 2GH1 A; 5CEH A; 3FAH A; 1ZQL A; 5IIL A; 3M8S A; 2I5H A; 5KFU A; 4YMO A; 1BPY A; 2WAQ C; 4DL4 A; 5EWF A; 2J6T A; 2HVH A; 2KZ3 A; 2DPI A; 2W3R A; 2P35 A; 1JIH A; 4RZR A; 5DGA A; 2B0C A; 1RXW A; 2IMW P; 8ICS A; 2GWS A; 1TKD A; 5KG0 A; 5DB6 A; 1NNL A; 2LYA A; 2WF8 A; 3QYP A; 5DDY A; 4F5R A; 9ICV A; 1JRP A; 2XID A; 2ZIV A; 4EEY A; 1SKR A; 1VDV A; 4KLU A; 2DGZ A; 8ICP A; 3RH4 A; 4M2Y A; 2ZIX B; 4FZN A; 4PGY A; 2ASJ A; 8ICG A; 5KG7 A; 4RQM A; 4RT3 A; 3JPT A; 5BOM A; 3RRH A; 1RQL A; 5AK6 A; 3V7K A; 5AKY A; 2P6R A; 2BGW A; 1MQ3 A; 4ELU A; 5IIN A; 2WHE A; 3JPQ A; 1XSL A; 1QQ7 A; 4GFJ A; 4FS1 A; 4DL3 A; 4C8K A; 3T5J A; 5DG7 A; 1Z4N A; 3H8W A; 8ICK A; 1HIW A; 3HKZ F; 1IIP A; 4RQN A; 2C22 A; 3WKC A; 5KFY A; 3UPQ A; 2KVC A; 2XI9 A; 3NS1 A; 1N48 A; 3OSN A; 1U49 A; 3OPX A; 1BPX A; 4TQS A; 2KEY A; 8ICM A; 3GQC A; 2E3T A; 5KFB A; 1J2N A; 1Z4O A; 5EE0 A; 3PV8 A; 5J2I A; 4F8R A; 1FFV A; 1ZQB A; 1Z00 A; 3D2Q A; 5DKW A; 4GXK A; 1UCV A; 3PX4 A; 3N28 A; 4YXM A; 4F71 A; 4DOA A; 3I1Y A; 1D9F A; 4R8U B; 3KFU F; 3H40 A; 2QB1 A; 5AI4 A; 3PO4 A; 1ZQT A; 2PFP A; 4UAU A; 5ALK A; 1IG6 A; 4DSK A; 5KT6 A; 2H3Q A; 4OCZ A; 4YG2 A; 3A0H U; 5AKJ A; 5KG5 A; 8ICZ A; 3N97 B; 5EE9 A; 4Y2X A; 4UAT A; 5J8Y A; 4MEX A; 3BS5 B; 3F2B A; 1N60 A; 4B9V A; 1M6Y A; 1UT8 A; 1XS9 D; 4UB5 A; 2JV3 A; 5EWE A; 9ICG A; 2K4P A; 3H4B A; 5KFS A; 5IIJ A; 5HHI A; 2XY7 A; 4JWM A; 3QUQ A; 2DWQ A; 2W11 A; 2KJ5 A; 9ICO A; 5FP0 A; 3G6X A; 4M6W B; 2LI6 A; 1JMS A; 1X66 A; 4DF8 A; 2M9N A; 2W54 A; 2AU0 A; 1X2I A; 3HWT A; 1S0M A; 3K4G A; 3PVX A; 1WYG A; 1F44 A; 1SL1 A; 3QU5 A; 3RJI A; 4EZ6 A; 2BHN A; 2HCF A; 2E1E A; 1BNP A; 5AKG A; 1URJ A; 5AM5 A; 3TAN A; 1QH9 A; 3SEN A; 5ALJ A; 3SAG A; 4O5E A; 2I6X A; 4M9N A; 2JGA A; 3R9K A; 2KHQ A; 3ZDD A; 1X6I A; 5DLF A; 3IG5 A; 4IS7 A; 4GC7 A; 5KFP A; 1O08 A; 3ICX A; 7ICH A; 5ALO A; 4C4R A; 4MFA A; 4MHV A; 3H4D A; 4DEZ A; 3RF9 A; 4CGZ A; 4FE3 A; 8ICN A; 2E8M A; 4QZH A; 3PW5 A; 2ES6 A; 1X9S A; 1J2M A; 3T5K A; 4ECU A; 5AK3 A; 1AQ6 A; 1FO4 A; 1J97 A; 1SXD A; 2R8G A; 1L8O A; 1NJY A; 1KFD A; 4IQV A; 4QZC A; 4QJF B; 5J2J A; 2W9B A; 5AIA A; 3GV5 B; 3QZ7 A; 4RQ0 A; 1N5W A; 4MF2 A; 2IOF A; 2ZIV B; 5ALI A; 3J81 j; 3WK6 A; 3WKD A; 3PY8 A; 4I2F A; 3HKZ C; 5DB8 A; 4DSL A; 1SXE A; 2HHV A; 4UB3 A; 2NYV A; 3TFR A; 3D2S A; 2JEI A; 4B9T A; 3TI0 A; 4MFC A; 4KLS A; 4KLL A; 5KFO A; 3KHL A; 5CR0 A; 1LVH A; 1HEK A; 4J9Q A; 5HML A; 2FLL A; 5DGB A; 1ZRN A; 4JV0 A; 4J9L A; 4RQ1 A; 2OXO A; 4HAI A; 2G09 A; 4K4G A; 2ZIU A; 3M6Z A; 3AUO A; 1ZQD A; 2DQN B; 9ICL A; 2RLT A; 4YD1 A; 4KLM A; 9ICU A; 1A77 A; 2ZUC A; 3V7J A; 1Z00 B; 3MDA A; 3AN1 A; 2B21 A; 1ZJM A; 5AKH A; 2C28 A; 3CRX A; 3QU9 A; 3Q8P B; 1DOQ A; 3UXO A; 1NJW A; 2UVR A; 5ALV A; 1ZD3 A; 2W9M A; 1B43 A; 3TAD C; 1SKS A; 5CHG A; 4G3I A; 2HDO A; 3ZD9 A; 1S9F A; 4JV2 A; 7ICK A; 2D8C A; 9ICI A; 5AIB A; 2YB4 A; 5DB7 A; 2G5I B; 2BKE A; 2QAR A; 2YML A; 3N7P D; 3L4P A; 4DSI A; 4OJ6 A; 5CB1 A; 4RQ6 A; 7ICV A; 2BR0 A; 5KG6 A; 5AHX A; 4ED2 A; 4Z6F A; 3F2D A; 1QSY A; 3MR2 A; 2NV3 A; 3PZP A; 3PR4 A; 1ZQF A; 1L6N A; 1RG6 A; 5ALU A; 3IRU A; 4WJ3 B; 3NRZ A; 4RNN A; 4Q44 A; 3V72 A; 3RB3 A; 5HMM A; 3ZDC A; 2E5S A; 4F2S A; 4F93 B; 1JN3 A; 2ATL A; 1COK A; 2G08 A; 4OO1 J; 3TAQ A; 1U9L A; 2EAN A; 4J9M A; 1ARO P; 2FLP A; 5KT5 A; 3OHA A; 7ICQ A; 4ECX A; 2JZB A; 8ICF A; 2EAP A; 4Y2U A; 4DLG A; 3BQ7 A; 2ZXH A; 2EDU A; 4BGD A; 1ZQG A; 1NJX A; 2EAO A; 4RQ7 A; 2MSN A; 4DCC A; 3V6H A; 3SV4 A; 1RM6 C; 4IL6 U; 2OHF A; 3DDH A; 2NRW A; 3BJY A; 3QXG A; 3B0X A; 4EEK A; 2AQ0 A; 5JU5 A; 5ALX A; 1NKB A; 1NJZ A; 4Y2J A; 4GXI A; 5DB9 A; 3RH6 A; 1T8E A; 3OJS A; 2F8K A; 3C1Z A; 1RYR A; 4UAV A; 3HT3 A; 1PVQ A; 2LPE A; 4FO6 A; 2K60 A; 2HOF A; 1HUZ A; 4NWI A; 2AQ4 A; 3QEA Z; 1X9M A; 2W9B B; 2IOH A; 1TAQ A; 1SGG A; 3THV A; 2IOF K; 2KG5 A; 2V4R A; 1JI7 A; 5F9L A; 1ZD4 A; 5KFC A; 4FFD A; 4UB8 U; 4DFK A; 2DF4 B; 1YT3 A; 4EX6 A; 2RP5 A; 5KFZ A; 4J9R A; 3HX0 A; 4LVS A; 3QUC A; 4RUC A; 3EW9 A; 1WCN A; 2HOQ A; 5D49 A; 4C80 A; 1XNS A; 2W9C B; 3M1Y A; 4MF8 A; 2JH1 A; 1SV4 A; 5KT7 A; 3MGV A; 2BQR A; 4FZM A; 4O3Q A; 3BS7 A; 3RB6 A; 4RPY A; 2E1F A; 4IRC A; 2DPJ A; 2RRD A; 4QWC A; 2B6G A; 3PX6 A; 4JK1 A; 3C28 A; 2VIX A; 4CDG A; 4M9H A; 3AQF A; 3PSF A; 1X42 A; 3H8S A; 3Q8M A; 4UB4 A; 3MDC A; 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1O03 A; 4C0Z A; 3EPI A; 5AI5 A; 3OTQ A; 4JUZ A; 5AM1 A; 1ZQZ A; 3KKA C; 1KRP A; 4FS2 A; 1S0O A; 4I2E A; 2HHX A; 2RQ5 A; 3JPO A; 5E79 U; 4IQT A; 4I2A A; 3CYM A; 4Y2V A; 5TIS U; 3V6J A; 2EH9 A; 3ISB A; 9ICE A; 3QUT A; 9ICP A; 1NK4 A; 4ZOH C; 3DEE A; 1ZQY A; 2F77 X; 5HNK A; 2YTU A; 4KLO A; 5ALP A; 5ALM A; 3C2K A; 3KZX A; 1ZQM A; 2AGO A; 2J6S A; 2OH2 A; 2F2A B; 2QLT A; 2KMD A; 5J2G A; 2XIC A; 3TFS A; 5A0L A; 4QZ9 A; 2CN1 A; 2KJ9 A; 4F4Z A; 3IHQ B; 3FC4 A; 3PSI A; 4O9M A; 4RQ3 A; 1RZT A; 2MU2 A; 3FM9 A; 1CEZ A; 2VJ5 A; 8ICR A; 4XUS A; 3B0Y A; 4Y2R A; 4C8M A; 4J9N A; 2FI1 A; 1ZQR A; 5ALN A; 1DK2 A; 2ASL A; 1DXS A; 3WKA A; 3PW4 A; 1PVR A; 4OJ5 A; 4ACO A; 3RJJ A; 4O3S A; 4KLG A; 1BPD A; 3KZI U; 9ICT A; 2DFL A; 4DL5 A; 5DG9 A; 3IM1 A; 4YR0 A; 4GC6 A; 3T79 A; 4EBC A; 4DSF A; 3WK7 A; 8ICY A; 4Y2Q A; 2Q4T A; 4J9K A; 3H8J A; 3QEB Z; 1PUZ A; 4NY8 A; 1TE2 A; 2ZTE A; 4O3N A; 4B9M A; 7ICS A; 3SI8 A; 4EYH B; 2HSZ A; 2M0N A; 4QIW C; 2KTQ A; 2VA3 A; 5AKE A; 1D9D A; 4RU9 A; 2G5H B; 1JAL A; 4R65 A; 1L7N A; 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