The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
67
|
structure length |
67
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Chain Sequence |
PTDCSIVSFLARLGCSSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKGILDHRQLHEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Gene regulation
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Solution structure of the C-terminal domain of p63
rcsb |
| molecule keywords |
second splice variant p63
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| total genus |
13
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| structure length |
67
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| sequence length |
67
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-11-11 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07647 | SAM_2 | SAM domain (Sterile alpha motif) |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5JTI A; 2Y9U A; 2KIV A; 4RQM A; 3KKA C; 2EAN A; 1SXD A; 4IS7 A; 2JV3 A; 3BS5 B; 1UCV A; 1SV0 C; 2EAM A; 2FE9 A; 5J8Y C; 2K4P A; 2ESE A; 3IDW A; 1X9X A; 1LKY B; 5KNI A; 2KSO B; 4MHV A; 1X40 A; 1F0M A; 5L1M A; 1PK3 A; 5F3X B; 3BS5 A; 2YTU A; 3H8M A; 2DKZ A; 4RQN A; 1OW5 A; 2L5Y A; 2EAO A; 3K1R B; 2F44 A; 2QAR B; 1LKY A; 1PK1 B; 5JRT A; 1COK A; 1RG6 A; 2D8C A; 4NL9 A; 2KMD A; 2Y9T A; 1JI7 A; 1UQV A; 2QAR A; 1PK1 A; 3BQ7 A; 2LMR A; 2QB0 B; 1Z1V A; 2QKQ A; 4NL9 C; 1V38 A; 2DKX A; 2E8O A; 1SV4 A; 3SEN A; 1X66 A; 3SEI A; 2KSO A; 2E8M A; 3BS7 A; 2K60 A; 2QB0 A; 1V85 A; 2KG5 A; 3TAD A; 1B4F A; 2E8N A; 1DXS A; 1WWU A; 2D3D A; 1KW4 A; 1SGG A; 2F8K A; 5JU5 A; 4PZN A; 1B0X A; 3TAD C; 1SXE A; 2GLE A; 2E8P A; 1OXJ A; 3HIL A; 3KKA A; 4NJ8 A; 1WWV A; 2EAP A; 2F3N A; 2LPE A; 2KE7 A; 1SV0 A; 2B6G A; 4PZO A; 2ES6 A; 3TAC B; 5J8Y A; 2QB1 A; 2DL0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5ALE A; 3RH6 A; 1ZJM A; 1UCV A; 2G5H B; 5DGB A; 5G5H A; 4O3P A; 1MSW D; 1Z4O A; 2BDP A; 4GXK A; 1LKY B; 3HPO A; 5AIB A; 4P4P A; 5KTQ A; 2VA3 A; 2XI9 A; 3FAH A; 4RQ0 A; 2PFN A; 4ELT A; 3ZD8 A; 4DQR A; 3K1R B; 5DB9 A; 3B0X A; 4NLC A; 2BPG A; 5KFX A; 2NV3 A; 4NWI A; 4I2G A; 4KLJ A; 1B43 A; 1ZQY A; 2ZJ8 A; 4ECY A; 3K4G A; 2ZIW A; 2LYB A; 4F4W A; 3HWT A; 2AJQ A; 3IG8 A; 4ED3 A; 1PK1 A; 2ISP A; 1N5X A; 4YP3 A; 1N62 A; 4YN4 A; 1Z1V A; 2YB4 A; 3L5K A; 2GWS A; 4KLH A; 3PW0 A; 2F76 X; 2MSN A; 2FPK A; 4EX7 A; 5IIO A; 2HHT A; 1ZD2 P; 4J9K A; 3UPQ A; 4P4O A; 2ZUB A; 4KMO B; 4B9L A; 4QZE A; 5JU5 A; 4G9B A; 3THV A; 5DB7 A; 2FI1 A; 2YY6 A; 1ZJN A; 2Q4T A; 3M6Z A; 2OM6 A; 3VC8 A; 2DWQ A; 2FPL A; 2HOI A; 2R8H A; 8ICO A; 1ZYQ A; 3SAH A; 2ZXH A; 3RFA A; 4UAW A; 3AU6 A; 5KFR A; 3BQ0 A; 2FDR A; 4UAT A; 2LBO A; 2OWO A; 4KLG A; 8ICL A; 2JV3 A; 9ICN A; 1JRP A; 4M04 A; 4AYB F; 4I28 A; 3NVV A; 2K4P A; 2YMM A; 5ALD A; 4CRX A; 3VCB A; 5IIL A; 3WU2 U; 2WF9 A; 3MGI A; 1NKB A; 9ICC A; 1NK7 A; 5F3X B; 2UVR A; 1SKS A; 5J2H A; 3CW2 C; 2L5Y A; 1KFD A; 2BZF A; 4AYB C; 2H3Z A; 1QQ7 A; 5KL1 B; 2A19 A; 4IRK A; 3SZ2 A; 4K4G A; 2NRT A; 4FZM A; 4O3R A; 3TFR A; 3AQE A; 3OSP A; 5KG0 A; 2OEH A; 4Z6D A; 2P6R A; 5DG9 A; 3M9M B; 4DOA A; 3TQ1 A; 5DB8 A; 2KN7 A; 3OTQ A; 5DGA A; 3ALR A; 3N7S C; 2XC9 A; 4TUP A; 3D2N A; 3BDP A; 4KLQ A; 2KHQ A; 1BGX T; 3GV8 B; 3Q8M A; 4NY8 A; 4C8L A; 2OHF A; 3SEN A; 5KG1 A; 3C2K A; 3DEE A; 3SYZ A; 1X66 A; 5KG2 A; 2JEG A; 3HW8 A; 3BJY A; 4PGX A; 1V85 A; 4KLS A; 4F8R A; 2IHN A; 2KKP A; 3LDA A; 3SR6 A; 4MEX A; 1FFV A; 4RQ4 A; 1RZT A; 4BUG A; 1U4B A; 3BQ1 A; 1N56 A; 2ZJA A; 1GO3 F; 2BKE A; 3RB4 A; 2JH7 A; 1RYS A; 1JXE A; 3RJH A; 2HHU A; 4C4T A; 2PFP A; 1SIJ A; 2DPI A; 4LZG A; 4PZO A; 2KVS A; 3PML A; 4RT2 A; 8ICN A; 1P7D A; 4F3O A; 2JXJ A; 1UPH A; 1VJ5 A; 5AKL A; 2XCA A; 1D9D A; 4I2I A; 5AK4 A; 5J8Y C; 3GIL A; 4YR2 A; 9ICJ A; 3ETL A; 3K75 D; 7ICQ A; 5ALT A; 5KFZ A; 4NLZ A; 4ZOH C; 1A6S A; 5L1M A; 4YD2 A; 4J9L A; 2KP7 A; 2W9A A; 8ICB A; 3IG5 A; 4UAS A; 2BPC A; 5KFK A; 4A8E A; 7ICE A; 4JV1 A; 3RJE A; 2FLL A; 4FS2 A; 2Z7J A; 3ZDB A; 3AEV A; 2J6T A; 2IOF A; 3T5L A; 1JI7 A; 1U48 A; 2VAN A; 5B5E U; 1UQV A; 3QUB A; 7ICJ A; 4F92 B; 3WK8 A; 1C7Y A; 2XO7 A; 1XC9 A; 1FFU A; 5EE9 A; 2XY6 A; 2E3T A; 1ZQN A; 3C5F A; 4RQ8 A; 4GXJ A; 4NLN A; 3UXN A; 2ZTD A; 4DEZ A; 4YXJ A; 2QB0 A; 5CB1 A; 2LM4 A; 4BDP A; 3HP6 A; 2JH1 A; 2AGQ A; 4I2B A; 9ICO A; 5GTH U; 3MAB A; 2W9B A; 3Q8P B; 2K4E A; 1KEJ A; 3KBB A; 2DPJ A; 3GIJ A; 1ZQL A; 4F2R A; 4QZD A; 4F5N A; 8ICV A; 2KZM A; 5EE3 A; 3C1Y A; 4DOB A; 5K4L A; 1ZQE A; 2HVI A; 1HIW A; 2AH5 A; 4O3Q A; 2BQU A; 1NK8 A; 5KFO A; 1QLN A; 4IS7 A; 2JEI A; 5TIS U; 1TAM A; 1L3U A; 4DOC A; 1ZQJ A; 4C7Y A; 3T5K A; 1PZN A; 5CRX A; 4KN4 A; 5J0W A; 2MUT B; 2GOL A; 1ZQO A; 2Y0S F; 2G5I B; 2AHO B; 5KFF A; 3PSF A; 4RT3 A; 2EAO A; 3AQF A; 1DOQ A; 4YMM A; 1IV8 A; 1K5O A; 1JRO A; 2I6X A; 4USA A; 3IP4 B; 1FIQ A; 2AXT U; 2W3S A; 4F5P A; 3V7J A; 3AMZ A; 4TUS A; 4NL9 A; 4DL2 A; 2Y0S C; 4PH5 A; 4NLK A; 7ICV A; 1U49 A; 1ZQC A; 4OJO A; 5DQH A; 8ICQ A; 7ICI A; 5J0X A; 2HHW A; 3H0R B; 7ICU A; 1SZH A; 2J6S A; 1NJW A; 4C80 A; 1D8L A; 3NRZ A; 1BVS A; 3PV8 A; 1Z1B A; 3NVZ A; 3ZDE A; 8ICF A; 1ZQK A; 8ICW A; 4KLU A; 5ALU A; 2XGQ A; 3SD7 A; 4YR3 A; 2HOQ A; 1S76 D; 4OCZ A; 4IR9 A; 2ZUD A; 2LHT A; 1H38 A; 2BCU A; 4RU9 A; 5AKJ A; 2GLE A; 2ZTE A; 2E8P A; 1OXJ A; 5J2K A; 4B9U A; 5BOL A; 3RRG A; 4JMU A; 1CI4 A; 2E1E A; 2F3N A; 1SZP A; 3SV4 A; 3JPP A; 2M0N A; 5KL8 B; 1MQ2 A; 3EPG A; 4YG2 A; 4KMU A; 1ZQT A; 4O5E A; 3GDX A; 1JXL A; 2ZIW B; 1N63 A; 2HBM A; 2ZTC A; 3MGV A; 5E79 U; 2WFA A; 1NOM A; 2NRZ A; 1NK0 A; 7ICG A; 3NS1 A; 1KFT A; 3TAN A; 5DBB A; 3RR7 A; 2EZX A; 5KNI A; 5KG7 A; 2A3V A; 2AQ4 A; 1X40 A; 1KSP A; 4CDG A; 3TAR A; 3RBD A; 4NXZ A; 5CJ7 A; 5L1I A; 2BDU A; 5DDM A; 4ECX A; 3C1Z A; 4I29 A; 1ZQI A; 4KN7 A; 4M2Y A; 3ZDD A; 5KT2 A; 2XIC A; 9ICI A; 1RG6 A; 2JEJ A; 3SI8 A; 4DQI A; 2KVC A; 2KKV A; 4YR0 A; 2LI6 A; 3KFU F; 3F5E A; 2QAR A; 3MBY A; 5HML A; 5KFA A; 4RNO A; 1EXN A; 8ICA A; 5ALF A; 3JPS A; 1KN5 A; 1LVH A; 2YML A; 1XO1 A; 3V6H A; 2WF5 A; 1YT3 A; 1Z4N A; 1FO4 A; 3PSP A; 5ALO A; 4F5Q A; 5AIA A; 3U26 A; 4GC7 A; 4BXO B; 4R65 A; 1ZQW A; 2M9N A; 4QWC A; 2AGO A; 4RPX A; 2KNJ A; 5FP0 A; 4I2J A; 3PX4 A; 1JAL A; 5DQG A; 3NUQ A; 1XO0 A; 2XID A; 2VJ4 A; 1J2M A; 1U45 A; 3T5H A; 1HUZ A; 1L8L A; 5J2I A; 2HBL A; 2IOH A; 1TKD A; 9ICK A; 8ICX A; 5D4B A; 3PZP A; 5DG7 A; 3UMC A; 4JK1 A; 1BPD A; 3LWM A; 4PGQ A; 3RH5 A; 2CN1 A; 2BHN A; 3GV5 B; 2DGZ A; 3Q8L A; 1RQL A; 2P66 A; 4QZG A; 4RQM A; 4B9V A; 2WF8 A; 2DQN B; 4ELU A; 2PI4 A; 1ECW A; 3QNM A; 4Y2Q A; 2F1I A; 4Y2P A; 5KFL A; 4US8 A; 5EWG A; 4ECS A; 2ESE A; 3E58 A; 1NJX A; 3BS5 A; 1IG6 A; 1Q46 A; 9ICL A; 4Y2T A; 2NRX A; 4DQS A; 3BQ2 A; 3PO4 A; 5AI4 A; 3UXP A; 4QZ9 A; 3M9O B; 3I1Y A; 4M6W A; 4KLO A; 2UVV A; 5T14 A; 3TI0 A; 4P0Q B; 4OO1 J; 8ICI A; 1X6I A; 2C2E A; 1L7O A; 2FJ6 A; 4DLE A; 2PMZ F; 5KFQ A; 4M9H A; 2V9W A; 3GQC A; 2XCP A; 4FBU A; 4B9M A; 1RXV A; 1SV4 A; 3QUT A; 4F5O A; 2ATL A; 4X5V A; 2WHE A; 4J03 A; 1J97 A; 2MA1 A; 3CP8 A; 4UQG A; 4I2F A; 1NK6 A; 2JR5 A; 2PMZ C; 2V4Q A; 4QIW F; 1S10 A; 3HJE A; 4KLD A; 2VA2 A; 1WWU A; 3OHA A; 3AM9 A; 1CEZ A; 2MAX A; 2KTQ A; 4DF8 A; 1RPL A; 1SGG A; 9ICU A; 3QX7 A; 2K8C B; 4BX9 C; 3D2S A; 4QZ8 A; 4EZ6 A; 1SB3 C; 4QIW C; 3IV6 A; 5HP4 A; 2Q0Z X; 2B21 A; 1L3S A; 4J9Q A; 1OUQ A; 3H8S A; 5J8Y A; 4ECU A; 8ICT A; 2DL0 A; 4EEN A; 2JMG A; 2EAN A; 1S8O A; 2KJ9 A; 1TAQ A; 2PFQ A; 3HRD D; 4PJ0 U; 3T5J A; 1ZET A; 1BNO A; 1A77 A; 3RH4 A; 5IIN A; 2ZIU B; 5J0T A; 2BQR A; 4MHV A; 1PK3 A; 3H8M A; 4EBC A; 3B0Y A; 4R8U B; 3FDS A; 3H8W A; 1TK8 A; 2F44 A; 1ZQX A; 1MC8 A; 2F2A B; 3OSN A; 4O0I A; 1ZOL A; 4F71 A; 1PVQ A; 5G5G A; 5AK6 A; 1WG8 A; 5KFW A; 1PVP A; 9ICP A; 5KT6 A; 5IIK A; 5L1K A; 4CNQ A; 5ALG A; 3JPR A; 3EYZ A; 2KFN A; 3DV9 A; 5KFD A; 5AKY A; 1AQ6 A; 5F9L A; 2I5H A; 4IRC A; 2HHX A; 2ASL A; 5J2G A; 4BWJ A; 2F1H A; 1V38 A; 1ZXI A; 2IA6 A; 4EYI B; 3B9J A; 4C8K A; 4IQV A; 4C4S A; 5GTI U; 3V6J A; 4P2H A; 1U47 A; 5J0Y A; 4Y2Y A; 4ELV A; 5C5J A; 2KD1 A; 4QWA A; 4C8M A; 1NK4 A; 3Q8S B; 2RDJ A; 4UB4 A; 4E0D A; 4R66 A; 1L3V A; 3F2B A; 4O3M A; 3V6K A; 3WK6 A; 3RB3 A; 3QEB Z; 1M6Y A; 2HBK A; 4F72 A; 5KFP A; 3MR6 A; 4ECT A; 1ZQA A; 4DFK A; 2KZZ A; 2O6K A; 2DUY A; 2HW3 A; 2KE7 A; 1TV9 A; 5EWE A; 1ZQF A; 1S77 D; 4KX5 A; 4RZR A; 2ES6 A; 1XU4 A; 3TAC B; 3ZDA A; 2K4I A; 5EE0 A; 2AQ0 A; 5J2D A; 3RJG A; 1IIP A; 1X42 A; 2G08 A; 5C0Y A; 2NO4 A; 3I76 A; 5AKK A; 3NVW A; 4J9M A; 4B9S A; 2HHQ A; 2IHM A; 4XQ8 A; 2XVT A; 1TK5 A; 2W9C A; 9ICE A; 1COO A; 3QZ7 A; 2UVU A; 2P6U A; 4NV0 A; 2ZIV A; 3EZ5 A; 1ZQS A; 3EUB 2; 3KHL A; 3M8R A; 2ZIX B; 4DL3 A; 2RDI A; 2ZUC A; 4YXM A; 1LKY A; 1FEZ A; 4KLL A; 4BJQ A; 2HDO A; 2W04 A; 8ICM A; 1COK A; 4I2H A; 1ZRM A; 5DB6 A; 2ZXI A; 4P0P A; 5J0U A; 4UB5 A; 4ACO A; 4J9P A; 5KFN A; 4PHD A; 1NK9 A; 4DCC A; 2N1R A; 2R8J A; 4DSI A; 2KIC A; 5AHX A; 4DL6 A; 2ZG6 A; 2ASD A; 1HEK A; 5ALK A; 3KOO A; 4KLE A; 3N7P D; 3ZDC A; 2LYH A; 2DF4 B; 2I1Q A; 2H3Q A; 3WK7 A; 3AN1 A; 5CP2 A; 2VKQ A; 2OXO A; 1BPZ A; 3RTV A; 2HI0 A; 5ALW A; 5J29 A; 4F93 B; 4QZA A; 3WKA A; 5ALZ A; 2H3F A; 4IQT A; 3CNH A; 4UBB A; 1L6N A; 2YQE A; 2B6G A; 3ED5 A; 1ZQR A; 4KLT A; 5F9N A; 3FC4 A; 4Q45 A; 3H0M B; 3RBE A; 2W11 A; 3QYP A; 1ZQB A; 5HHI A; 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3KHH A; 4F50 A; 1SV0 C; 4DF4 A; 4I27 A; 4HAI A; 2C22 A; 4ED2 A; 1TK0 A; 1PUZ A; 4RNM A; 3PR4 A; 1NI3 A; 2AGP A; 4Z6F A; 4YFK A; 3ORY A; 4O3S A; 2HVH A; 2WB1 F; 1OW5 A; 3PW7 A; 4DO9 A; 8ICE A; 3QZ8 A; 2R8G A; 1PK1 B; 4YD1 A; 7ICT A; 3N97 B; 2MRL A; 3MC1 A; 2H3I A; 1YZ7 A; 5AK3 A; 4CF4 A; 4UB8 U; 3C29 A; 3QUQ A; 4MF8 A; 2KOB A; 3J81 j; 2GH1 A; 2WB1 C; 2YB1 A; 3D6J A; 5AIC A; 3N28 A; 1ZQH A; 2LMR A; 1QSS A; 4Y2S A; 9ICX A; 2QKQ A; 3RF9 A; 4O9M A; 3QEA Z; 5KFI A; 2KSO A; 4XA5 A; 3MFI A; 3ISD A; 3OJS A; 1D8B A; 4YCX A; 4UB3 A; 4F4Z A; 1SL0 A; 4UAV A; 7ICN A; 1QSL A; 4ECZ A; 4DFM A; 4MFA A; 5ALS A; 5J0P A; 3Q8K A; 2K8B B; 4DQQ A; 1JX4 A; 1TE2 A; 2D3D A; 2PKE A; 9ICB A; 3KHR A; 4FS1 A; 4PHP A; 1ZD5 A; 2DBY A; 1B0X A; 7ICP A; 1SXE A; 5HHH A; 5ALM A; 5AI5 A; 4JUZ A; 1UT5 A; 1S0N A; 3HIL A; 1LB2 B; 2EAP A; 4ED8 A; 3ONN A; 3C5G A; 2HMX A; 3EWA A; 4DL7 A; 3GIK A; 3LVW A; 4TUQ A; 1VDV A; 3UMB A; 2KZ3 A; 4DL5 A; 2D6F C; 1IM4 A; 3KKA C; 2W8L A; 5J2A A; 5L1J A; 5KFM A; 4NM2 A; 4US9 A; 4KIT B; 3IDW A; 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