The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
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sequence length |
70
|
structure length |
70
|
Chain Sequence |
SQWSVDDVITWCISTLEVEETDPLCQRLRENDIVGDLLPELCLQDCQDLCDGDLNKAIKFKILINKMRDS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Cell cycle
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| publication title |
Saccharomyces cerevisiae Ste50 binds the MAPKKK Ste11 through a head-to-tail SAM domain interaction.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
STE50 protein
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| total genus |
25
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| structure length |
70
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| sequence length |
70
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-03-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3BS5 A; 2QKQ A; 1LKY A; 4NL9 C; 2QAR B; 2F44 A; 2LMR A; 3BS5 B; 2JV3 A; 3IDW A; 4PZO A; 1SXE A; 2ES6 A; 2GLE A; 2KE7 A; 3TAC B; 2FE9 A; 1B4F A; 4MHV A; 1SV4 A; 1Z1V A; 2DKZ A; 2K60 A; 1OW5 A; 1V38 A; 2D8C A; 2LPE A; 1RG6 A; 1B0X A; 2K4P A; 2KSO A; 2E8N A; 1JI7 A; 2YTU A; 2B6G A; 1PK3 A; 1WWV A; 3HIL A; 2KSO B; 2EAM A; 2KIV A; 2L5Y A; 2ESE A; 3SEI A; 2KG5 A; 1SGG A; 4NJ8 A; 1DXS A; 1OXJ A; 2Y9T A; 4IS7 A; 1COK A; 3BS7 A; 2DKX A; 2Y9U A; 4RQM A; 1UQV A; 5JU5 A; 3KKA A; 3KKA C; 2EAP A; 2D3D A; 1SV0 A; 1SV0 C; 1V85 A; 2QB1 A; 2EAO A; 1UCV A; 4PZN A; 1X66 A; 5JRT A; 1X40 A; 3BQ7 A; 1KW4 A; 2QB0 A; 1PK1 A; 2DL0 A; 2E8M A; 4NL9 A; 2E8P A; 5J8Y A; 5J8Y C; 2QB0 B; 1PK1 B; 1WWU A; 3K1R B; 2E8O A; 4RQN A; 5L1M A; 2F3N A; 1LKY B; 3SEN A; 5KNI A; 2KMD A; 5JTI A; 2F8K A; 3H8M A; 1SXD A; 1F0M A; 3TAD A; 3TAD C; 1X9X A; 2EAN A; 2QAR A; 5F3X B; #chains in the Genus database with same CATH topology 7ICE A; 2ALZ A; 4CNQ A; 1Z3E B; 4DFP A; 5HR7 A; 4J9N A; 1L8L A; 5T14 A; 2FLL A; 8ICQ A; 2HHS A; 2NRZ A; 9ICP A; 1HEK A; 4DFD A; 2ES6 A; 2RRD A; 5J0X A; 1JMS A; 3L4P A; 2NO4 A; 1ZRM A; 3PST A; 1NJW A; 4RQ0 A; 2NYV A; 3ZDB A; 3NVV A; 2W54 A; 4AYB F; 2IOH A; 2KHV A; 4M9G A; 3I28 A; 1TE2 A; 2J6S A; 3WK8 A; 2JH7 A; 1B0X A; 2YMM A; 4QJF B; 1QSS A; 2FPM A; 5L1K A; 1XSL A; 3PSP A; 5KG6 A; 2C2D A; 3SEI A; 1SWV A; 2F1J A; 1L3V A; 4ED7 A; 1JAL A; 3H0L B; 3KZX A; 3SMV A; 2JZB B; 1K1S A; 4YP3 A; 3RTV A; 1TK5 A; 2JR5 A; 3QU2 A; 2EAO A; 3K4G A; 4ECS A; 4I2I A; 2ZG6 A; 5K4L A; 5AI5 A; 2DL0 A; 4E0D A; 1TV9 A; 2Y1J A; 4NL9 A; 2WHE A; 8ICB A; 4PHD A; 3ZDC A; 2JZB A; 3WK6 A; 4P0Q B; 1LKY B; 4NXZ A; 4DS4 A; 1NKC A; 8ICX A; 2JMG A; 2K8C B; 4F5P A; 2MUT A; 1U4B A; 1SB3 C; 3M8R A; 1ZD3 A; 3TAP A; 3Q8S B; 4GXI A; 5GTI U; 1QSL A; 3G6X A; 1T7P A; 5BOL A; 1SL2 A; 3T5K A; 3B9J A; 1LKY A; 5B66 U; 4B9L A; 2FLN A; 4RNM A; 5J2G A; 2OH2 A; 1NJZ A; 4FZL A; 4GFJ A; 1QCK A; 3BQ1 A; 3F53 A; 3RH4 A; 2ASJ A; 3NRW A; 4F3O A; 4Q43 A; 1VLB A; 1ZQD A; 2HHT A; 2RDI A; 3D2S A; 4B9T A; 1NKB A; 2BCS A; 3MR3 A; 4NWI A; 4EEK A; 3D6J A; 2MSN A; 4QZD A; 3LWM A; 2LPE A; 3ICX A; 1ZQH A; 1FIQ A; 3CYM A; 3I1Y A; 1ZQP A; 2PXI A; 2NRV A; 5F9N A; 1VJ5 A; 3PNC A; 4RNN A; 4DL7 A; 2OHF A; 5AK3 A; 4TQS A; 1PK3 A; 2BCV A; 3MGV A; 1ZJN A; 3O0F A; 1VDV A; 2V4Q A; 1ZQV A; 5D49 A; 5KG2 A; 2VA2 A; 5TZV A; 3RAX A; 4JV1 A; 1CUK A; 1ZQL A; 4M04 A; 4G3I A; 4O0I A; 2OYY A; 2EZY A; 2YB1 A; 4US8 A; 3H8S A; 4YMO A; 3PO4 A; 2W8L A; 2A3V A; 2HSZ A; 3AMZ A; 5ALW A; 4C4S A; 4KLE A; 1D8L A; 3IG5 A; 2J6T A; 3ORY A; 9ICX A; 2G09 A; 2IA6 A; 1RPL A; 2DWQ A; 2HBK A; 2QB0 B; 1ZQY A; 2PI4 A; 4RUA A; 4MF2 A; 3Q8R B; 3QXG A; 3GIJ A; 5JTI A; 4U6P A; 5J0Y A; 3UPQ A; 2K8B B; 2QAR A; 3RAQ A; 1SKW A; 7ICU A; 3TFS A; 3HJE A; 5KFK A; 4UAU A; 4R66 A; 4QNL A; 1ZET A; 1HJP A; 3KHH A; 2A1J B; 3RJF A; 4DQI A; 2H3Z A; 3QE9 Y; 4R65 A; 5ALL A; 4C8N A; 4NM1 A; 2KFZ A; 2AU0 A; 2JEF A; 5KFT A; 5KFQ A; 3E0F A; 2GLE A; 4PGX A; 5KFM A; 1Q8K A; 3C29 A; 2A1J A; 4O3N A; 4IRD A; 4RQ7 A; 3JPQ A; 4FFD A; 4ECQ A; 3WKD A; 3G6V A; 7ICF A; 3AQE A; 1S0N A; 4RQ3 A; 3ALR A; 4RQ8 A; 2WF6 A; 1ZD4 A; 3KBB A; 4KLO A; 3HIL A; 1MA7 A; 2EAM A; 1M6Y A; 5ALT A; 3NUQ A; 5IIM A; 4ZOH C; 2KG5 A; 2A19 A; 2H3I A; 9ICQ A; 3SV3 A; 2Y9T A; 1NKE A; 5E79 U; 3C5G A; 2ZJ8 A; 4Z6E A; 4ED1 A; 4ECT A; 7ICT A; 1JRP A; 1L7O A; 2KHQ A; 3MAB A; 5ALX A; 4CF3 A; 4UBC A; 2V9W A; 1SL1 A; 3DV9 A; 4AP9 A; 5CP2 A; 1PK1 A; 2JH1 A; 3UM9 A; 2M9N A; 2AHO B; 3Q8Q B; 4DF4 A; 1BPB A; 1S8O A; 3PW0 A; 3WU2 U; 3BQT A; 2Y0S F; 2UVU A; 1ZQX A; 2NRX A; 3EUB 2; 1TAQ A; 2MU2 A; 1ZQQ A; 2W55 A; 3OJS A; 1RM6 C; 3ZD8 A; 2GOL A; 1DK3 A; 1UT8 A; 7ICH A; 2PI5 A; 4IRC A; 2AJQ A; 1QTM A; 1Z00 B; 3M1Y A; 4NL9 C; 2HHU A; 4KLJ A; 4Y2S A; 3RB3 A; 2JXJ A; 2R8K A; 3M9O B; 3M9M B; 2IBK A; 4M9N A; 1WUD A; 1C20 A; 3IG8 A; 4Z6F A; 2WF5 A; 2YMQ A; 2F1I A; 5AKH A; 4UAZ A; 5DB6 A; 5CJ7 A; 2FE9 A; 4FBU A; 3C1Y A; 4QZA A; 4ELU A; 2YML A; 3QU9 A; 1ZQW A; 1ZQA A; 3RJI A; 4ED0 A; 5CHG A; 4ECV A; 4TUP A; 2C2E A; 4MFF A; 3PW2 A; 2YMP A; 3AL0 B; 1NI3 A; 3F5A A; 2ZIU B; 2HW3 A; 1QLN A; 4DF8 A; 2KSO B; 4C8K A; 1BVS A; 4QZG A; 5AM1 A; 1N60 A; 2M0N A; 5J2B A; 2NV3 A; 8ICI A; 2KIC A; 4QWD A; 4MEY A; 1MN8 A; 3Q8K A; 1OXJ A; 2OCE A; 4PHA A; 4DLE A; 3RJJ A; 2G08 A; 4P4M A; 4J9O A; 3T5J A; 1KLN A; 1N61 A; 2PMZ C; 4QZH A; 3C2K A; 2G07 A; 1TK0 A; 2EAP A; 4B9U A; 1CI4 A; 2EH9 A; 1IIP A; 1V85 A; 1WCL A; 1XS9 D; 3SQI A; 1KDH A; 3GQC A; 1Q3U A; 1KTQ A; 4LZG A; 2ATL A; 2HBJ A; 3TAN A; 3D2N A; 2YB4 A; 5AIB A; 5AK5 A; 4I2B A; 4O3S A; 3ZI4 A; 5III A; 2W11 A; 4LZD A; 2EZZ A; 5IIO A; 5KT2 A; 4IQW A; 3HP6 A; 4C7Y A; 3RH5 A; 4DSL A; 5KG1 A; 5AKK A; 1X9X A; 2DPI A; 3M9N B; 3DEE A; 3E58 A; 4ELV A; 1IG6 A; 2PFO A; 3QEA Z; 1KSP A; 4I2F A; 9ICF A; 4QZF A; 3PY8 A; 1NK5 A; 4UAV A; 3OPX A; 2WTF A; 3KHG A; 4EX6 A; 3AU2 A; 3RRH A; 2H3F A; 1LB2 B; 2WF9 A; 3ETL A; 3GIM A; 4RNO A; 3PMN A; 4K4G A; 5AI9 A; 2AQ4 A; 8ICA A; 4NLC A; 5AM5 A; 1X6I A; 5CWR A; 5KT4 A; 2P35 A; 3V6H A; 1XNS A; 4UB2 A; 2BHN A; 1BPX A; 4OCZ A; 2E1F A; 3M6K A; 3BZK A; 3JPO A; 7ICO A; 4JUZ A; 4C7Z A; 5KTQ A; 4F71 A; 2R8J A; 4UB3 A; 3ISC A; 1J2M A; 2F8L A; 4IR9 A; 4DSK A; 4YXM A; 9ICJ A; 4F4X A; 2HHW A; 4OD0 A; 4KLQ A; 1ZQB A; 1JIH A; 5ALS A; 1WWV A; 5KFD A; 3H4D A; 4GXK A; 2F77 X; 2JEG A; 2W7O A; 1RQN A; 4OJP A; 1CEZ A; 8ICU A; 5BPC A; 3UQ0 A; 1JN3 A; 4PL2 A; 4O5C A; 4RT2 A; 2UVV A; 2I6X A; 2HVI A; 4RQM A; 4ZH4 A; 2KK0 A; 4R64 A; 4QW8 A; 4JK1 A; 3RBE A; 1D8B A; 1L6N A; 5KFC A; 4J9S A; 1N48 A; 3MR5 A; 1X40 A; 2JGA A; 2E8M A; 2R18 A; 3RB6 A; 1SKR A; 3CW2 C; 4Y2J A; 3QZ8 A; 2JEJ A; 8ICV A; 2BPC A; 9ICS A; 1K5O A; 2FJ6 A; 4RQN A; 5HHH A; 2IMW P; 3LYS A; 4QIW F; 4CRX A; 1NZB A; 4KIT B; 2UVR A; 1L7N A; 3TAD C; 1P7D A; 2WFA A; 5KL1 B; 4YR0 A; 8ICH A; 9ICE A; 1XO1 A; 2KJ5 A; 7ICI A; 3T3F A; 4M6W A; 5DDM A; 1GO3 F; 4ICA A; 3C2L A; 2B0C A; 2ZIX A; 5EWE A; 2OEH A; 5A0L A; 4DCC A; 3T79 A; 8ICW A; 5AK6 A; 2PFP A; 4B9V A; 5KFN A; 3SZ2 A; 3BJY A; 3VCB A; 4OJ5 A; 4NM2 A; 1L3S A; 4QWE A; 2C2R A; 5AKZ A; 5ALK A; 1RYU A; 2BR0 A; 3NVZ A; 1KQQ A; 8ICO A; 1FFV A; 1ZD2 P; 4F8R A; 4LVS A; 3GU3 A; 5DB9 A; 1ZQI A; 1SWW A; 4KLI A; 3RR7 A; 2W9B A; 4F91 B; 3A0B U; 3L3F X; 4MFC A; 4KLF A; 5J0R A; 5CA7 A; 1OUQ A; 2CN1 A; 3JPT A; 4OJO A; 4RQ1 A; 1NK6 A; 4NV0 A; 1U9L A; 1TAU A; 2W9A A; 2KKV A; 2ZUC A; 4KX3 A; 4PJ0 U; 4JB3 A; 4RPY A; 3MBY A; 3KD3 A; 2F2A B; 1NJX A; 4UB8 U; 5JRT A; 2CXY A; 4Y2Q A; 1KFD A; 1RYS A; 3GV5 B; 5KFH A; 2DUY A; 4Y2T A; 4QWA A; 2XGP A; 2Y1I A; 5J2D A; 5AM3 A; 2LYB A; 5ALP A; 1A76 A; 1FEZ A; 4UAY A; 4R8U A; 1BNP A; 4BDP A; 5KNI A; 3HKZ F; 3FM9 A; 5ALU A; 4EEY A; 2KFN A; 1MSW D; 2EAN A; 9ICW A; 7ICG A; 5F3X B; 2KZ3 A; 5AI0 A; 5KT6 A; 3AQF A; 4JV0 A; 2MUT B; 5L1J A; 4YVZ A; 4F5Q A; 2JRZ A; 3HWT A; 2I9G A; 3HT3 A; 2J6U A; 3MGH A; 2FDR A; 2LKY A; 5J2H A; 9ICB A; 5AM0 A; 2KIW A; 2IOF K; 2ZXI A; 4PZO A; 3GDX A; 2B21 A; 3LVW A; 2DPJ A; 2KE7 A; 2LBO A; 1Z19 A; 4IR1 A; 3NTU A; 4MF8 A; 5KT5 A; 4DL6 A; 1FO4 A; 5F9L A; 1PZN A; 7ICM A; 4OO1 J; 5DG7 A; 2MAX A; 1JI7 A; 3AEV A; 1SIJ A; 2BGW A; 2I1Q A; 3WK4 A; 5ALD A; 5DQH A; 3MFH A; 1F44 A; 1TKD A; 2ZTC A; 3C2M A; 4UAR A; 3JPP A; 2ZTE A; 3A0H U; 3M8S A; 3SR6 A; 2K4I A; 5HHI A; 5DKW A; 3PW7 A; 3WK7 A; 4NLG A; 2AGQ A; 4TUQ A; 4KLH A; 2LM1 A; 2DKX A; 4DS5 A; 2VKQ A; 8ICN A; 4PPX A; 4M9J A; 4UBB A; 4J9L A; 5HP4 A; 3CNH A; 4DOA A; 2K4H A; 3DDH A; 5EE0 A; 1C7Y A; 2IOF A; 2ZIV B; 2VJ4 A; 1LVH A; 4C4T A; 4U7C A; 3EW9 A; 5ALY A; 2E3T A; 8ICF A; 2F3N A; 4I27 A; 4UW9 A; 3OGU A; 5HNK A; 1ZQJ A; 5HR6 A; 3SV4 A; 2ZIV A; 1JUD A; 5AKI A; 1L8O A; 2GWS A; 5EOZ A; 4WJ3 B; 2NRW A; 2XIC A; 3S6J A; 2KJ8 A; 3EPI A; 5AKX A; 2QAR B; 3H8J A; 3V72 A; 4MFA A; 3ETR A; 1Z4O A; 4DQR A; 4TUR A; 3QU7 A; 2ZTD A; 3UMB A; 4BXO B; 4I2D A; 2BCR A; 4MHV A; 1DK2 A; 5J0S A; 1Q3V A; 2WB1 C; 1UPH A; 3PX4 A; 1ZQE A; 1BNO A; 1JRO A; 3ZDE A; 4BXO A; 1L3U A; 2ZJA A; 2BCU A; 1BPZ A; 2W3S A; 4O3O A; 4GIB A; 2XVT A; 3PR5 B; 2KZZ A; 2W9C A; 4OJL A; 3PW4 A; 5CB1 A; 3SYZ A; 3BS7 A; 3NAS A; 5KFS A; 5KFI A; 4Q45 A; 3LDA A; 4IQV A; 3WK5 A; 1PVP A; 5G5H A; 5J2A A; 3U26 A; 4PGQ A; 4X5V A; 4EYI B; 2DBY A; 3QUQ A; 4Y2P A; 4P0P A; 8ICP A; 1PUZ A; 1BPD A; 1XC9 A; 1IM4 A; 5AKL A; 4QZ9 A; 1U47 A; 9ICO A; 1H38 A; 2G5H B; 2G0A A; 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5EE9 A; 2EQY A; 3K1R B; 2HMX A; 1AQ6 A; 2JHD A; 3GIK A; 3SAG A; 3SI8 A; 1SXD A; 1NK9 A; 1J97 A; 1ZRN A; 3TFR A; 3PML A; 3PSF A; 2XGQ A; 2HOF A; 1L7M A; 3NS1 A; 4ED3 A; 2KOB A; 2NRT A; 2FMP A; 3BQ0 A; 2UVW A; 4EEN A; 5ALZ A; 4KLG A; 4EZ9 A; 4AYB C; 5DBA A; 5J2E A; 1RZT A; 1N5W A; 4O3P A; 4I2C A; 2Q4T A; 3KTQ A; 1SXE A; 1TAM A; 4HAI A; 1KL9 A; 8ICZ A; 7ICV A; 3QZ7 A; 2BDP A; 4IRK A; 5CEH A; 4DL5 A; 5DG8 A; 2EZX A; 2RLT A; 2PKE A; 3N4M B; 4JMU A; 4JWN A; 3MC1 A; 3SD7 A; 3RB0 A; 1DGJ A; 2WF7 A; 5HML A; 4Z6C A; 3C21 A; 7ICQ A; 4C0Z A; 1SKS A; 1Z1B A; 2FMS A; 4J9Q A; 1X6J A; 4Q44 A; 2R8H A; 3IRU A; 3H8W A; 3MR2 A; 3V7J A; 2DGZ A; 1S0M A; 1ZQC A; 4MEX A; 4ELT A; 4USA A; 1ZQG A; 2ESE A; 5KAF U; 1N2X A; 4FS1 A; 4YFK A; 4XUS A; 3K75 D; 4YN4 A; 2ISP A; 2A1A A; 4TUS A; 3FDS A; 4KN4 A; 4PHP A; 5KFZ A; 3B0Y A; 5DBC A; 3KKA C; 5AI8 A; 4F92 B; 3ZDA A; 1KW4 A; 4CGZ A; 5ALR A; 1N63 A; 2V4R A; 3EPG A; 3PX6 A; 5KL8 B; 5J8Y C; 5H2F U; 5ALF A; 4KLM A; 3IV6 A; 1ZQF A; 4YR3 A; 3C1Z A; 5ALQ A; 1SZP A; 3PV8 A; 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