The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
68
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structure length |
68
|
Chain Sequence |
YHADPSLVSFLTGLGCPNCIEYFTSQGLQSIYHLQNLTIEDLGALKIPEQYRMTIWRGLQDLKQGHDY
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of a conserved C-terminal domain of p73 with structural homology to the SAM domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PROTEIN (SECOND SPLICE VARIANT P73)
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| molecule tags |
Gene regulation
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
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| structure length |
68
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| sequence length |
68
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1999-05-28 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1F0M A; 1V38 A; 3BS5 A; 5JTI A; 4IS7 A; 2EAP A; 1V85 A; 2KIV A; 2GLE A; 1PK1 B; 2E8M A; 1UQV A; 2D3D A; 1LKY B; 4MHV A; 1WWV A; 3BS7 A; 3TAC B; 3TAD A; 2KSO A; 1SV0 C; 1PK3 A; 3BS5 B; 2EAM A; 2KG5 A; 5J8Y A; 2F8K A; 2LPE A; 4PZN A; 1KW4 A; 1OXJ A; 3SEN A; 2EAO A; 2ES6 A; 1X9X A; 1SXE A; 2FE9 A; 3IDW A; 2QB0 A; 2KSO B; 2Y9U A; 3BQ7 A; 2E8N A; 2KE7 A; 1SGG A; 4PZO A; 2JV3 A; 5L1M A; 4NL9 C; 1SV0 A; 2KMD A; 1X66 A; 2Y9T A; 3SEI A; 2F3N A; 1X40 A; 3KKA C; 5JRT A; 1SV4 A; 2EAN A; 1JI7 A; 2L5Y A; 2LMR A; 1OW5 A; 2QB0 B; 1DXS A; 2YTU A; 2ESE A; 1SXD A; 2QAR A; 1Z1V A; 5KNI A; 1B0X A; 5F3X B; 2DL0 A; 3H8M A; 4NL9 A; 5JU5 A; 3K1R B; 1WWU A; 2DKX A; 2QKQ A; 3KKA A; 3TAD C; 2E8O A; 2QAR B; 2D8C A; 2B6G A; 1COK A; 1PK1 A; 1RG6 A; 2QB1 A; 2F44 A; 4NJ8 A; 2K60 A; 1LKY A; 4RQM A; 5J8Y C; 1UCV A; 2E8P A; 2DKZ A; 2K4P A; 1B4F A; 3HIL A; 4RQN A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4M6W A; 2LM1 A; 4K4G A; 5J2H A; 8ICU A; 2MUT B; 3F5A A; 1ZQ1 C; 7ICT A; 2D3D A; 1S0V A; 5DBB A; 4EX6 A; 5HR7 A; 5DBC A; 3MR6 A; 5KG5 A; 1X9M A; 4LVS A; 3ALR A; 2KOB A; 2I6X A; 3HKZ F; 4MFF A; 2OM6 A; 1URJ A; 4AP9 A; 4IL6 U; 4AYB C; 2K4E A; 3ETL A; 1YZ7 A; 4ED0 A; 2F8K A; 3D2S A; 5H2F U; 3Q8S B; 2HHW A; 4Y2Y A; 2AXT U; 2EZX A; 5AM2 A; 2ES6 A; 1ZQJ A; 2FE9 A; 3BQT A; 3M8S A; 1LB2 B; 3Q8P B; 1TK0 A; 4PZO A; 1NJZ A; 3OGU A; 8ICI A; 3RB3 A; 2KIC A; 5IIO A; 4KLI A; 3ZDC A; 5L1I A; 2IHN A; 3F2D A; 1KRP A; 1H38 A; 4MF2 A; 5EE9 A; 3T5K A; 4O5K A; 2HMX A; 5DB9 A; 2HCF A; 1NJY A; 1Z1B A; 3M6Z A; 4KLH A; 2XCP A; 4J9M A; 5J0R A; 4C8N A; 3RH4 A; 5CHG A; 1PVR A; 3RJG A; 5ALF A; 3RBE A; 4ZOH C; 3PO4 A; 2GH1 A; 4UB3 A; 1Q3U A; 4QW9 A; 2ZIX A; 4CDG A; 4DS4 A; 4EEK A; 2ZXI A; 2I1Q A; 4I2C A; 2B6G A; 2BZF A; 2W43 A; 5DDM A; 4LJX A; 3FC4 A; 5AKL A; 4ED2 A; 4R8U B; 3NRZ A; 3SAH A; 3H8S A; 2ZXH A; 3H8J A; 4JK1 A; 3LWM A; 9ICJ A; 1GO3 F; 3ZDE A; 4DSJ A; 1BPX A; 4ED7 A; 3BZC A; 4IS7 A; 3QUQ A; 3HW8 A; 2K89 A; 9ICA A; 3LDA A; 4TUS A; 4RQ4 A; 7ICU A; 3I28 A; 2JEF A; 2VKQ A; 3WK8 A; 1BPB A; 4HAI A; 2ISP A; 9ICU A; 4O3N A; 9ICW A; 5KG1 A; 4RQ6 A; 1TAM A; 2MA1 A; 4DFP A; 4CCH A; 2E1E A; 3I1Y A; 1C7Y A; 5B66 U; 3D2Q A; 3SEN A; 2PXI A; 7ICV A; 5AI4 A; 3LK9 A; 2G08 A; 5IIN A; 5AM3 A; 3UPQ A; 2KP7 A; 3GV7 B; 1QSS A; 1KKX A; 2BHN A; 4RQ0 A; 3AM9 A; 4DCC A; 5L1M A; 9ICN A; 3N7S C; 1N60 A; 2RDJ A; 3SEI A; 5KFO A; 5ALL A; 4B9N A; 2QB0 B; 2W9C A; 4KLU A; 5KFL A; 2E3T A; 2BR0 A; 4PHP A; 3MDC A; 7ICP A; 4FZL A; 3IG5 A; 2PMZ C; 3V6K A; 4UBC A; 3WU2 U; 3CW2 C; 5AM0 A; 4U7C A; 5J2A A; 4YR2 A; 2FMP A; 2ASD A; 5J0Q A; 4DSE A; 3WKE A; 3C2K A; 4F5O A; 3GV5 B; 3MGI A; 2VJ5 A; 2WAQ F; 4F8R A; 3QEB Z; 1ZQH A; 9ICH A; 4O5C A; 4ECW A; 5KFP A; 2QB1 A; 5KFD A; 2M9N A; 2AQ0 A; 8ICN A; 8ICT A; 2G06 A; 3JPQ A; 2HHU A; 5AKI A; 1S5L U; 4P2H A; 4Z6D A; 1A6S A; 2P66 A; 1D9D A; 5ALO A; 3BQ0 A; 1V38 A; 2J6T A; 4DL3 A; 2ZTD A; 5D49 A; 2RLT A; 3QZ7 A; 5KG7 A; 3ZDB A; 1WWV A; 2GWS A; 2KZ3 A; 2HBJ A; 3T79 A; 4GFJ A; 1PK3 A; 1X6I A; 2F76 X; 8ICL A; 4J9N A; 1SKW A; 3PMN A; 2VA2 A; 5KFY A; 3SQI A; 4NM1 A; 2EH9 A; 3H40 A; 3OJU A; 4AYB F; 3N4M B; 4U6P A; 4F5R A; 4LZG A; 3PW5 A; 1HIW A; 3C23 A; 1TAU A; 8ICE A; 1J2N A; 4LZD A; 5AK3 A; 4TQR A; 1SV0 A; 4F93 B; 1CI4 A; 1L3V A; 5A0L A; 2G5I B; 2VJ4 A; 4C4R A; 5KG2 A; 1OW5 A; 5KAI U; 3OSN A; 3DEE A; 4HYK A; 2BCR A; 2W8K A; 5KFI A; 4I2H A; 2BCV A; 2KN7 A; 3PR4 A; 3MDA A; 4OCZ A; 2XO7 A; 5KFT A; 5J0U A; 5TIS U; 3Q8Q B; 1BPY A; 5GTH U; 1ZQP A; 3R9K A; 8ICQ A; 4RQ5 A; 3PSF A; 1JXL A; 3N97 B; 1YZ6 A; 2W9B B; 4JWN A; 2BQU A; 2IOF K; 5ALP A; 1QQ6 A; 4UAS A; 3BS5 A; 4BX9 C; 5AKY A; 1LV5 A; 1TVA A; 1PK1 B; 4Y2Q A; 1XSP A; 3H7I A; 5ALQ A; 4MHV A; 4I28 A; 2ZIV A; 3NUQ A; 1O08 A; 3TAD A; 2AQ4 A; 1WCL A; 2YMM A; 4IRC A; 4UAT A; 8ICH A; 2W3R A; 3AMZ A; 1N5X A; 4O3P A; 1DGJ A; 1NK5 A; 3WK4 A; 7ICI A; 2K4H A; 1CRX A; 3LWL A; 2DPJ A; 2JXJ A; 4P0P B; 2OCE A; 2LPE A; 4EZ9 A; 3FAH A; 2KIW A; 4F50 A; 3TQ1 A; 2NRV A; 4A8E A; 2AGQ A; 5K4L A; 5TZV A; 1UA1 A; 1UT8 A; 3IDW A; 5CR0 A; 2Y0S C; 3C21 A; 1BPE A; 1X6J A; 2F1J A; 2W04 A; 3E0F A; 5AI5 A; 3OHA A; 4DWI A; 4GXJ A; 3NAS A; 4JB3 A; 4IQV A; 8ICG A; 1U4B A; 4M9H A; 1XO1 A; 4C7Z A; 2WHE A; 1DXS A; 1SL1 A; 2KVS A; 3WKA A; 3TAQ A; 2KFN A; 4Q8E A; 3RR7 A; 4B9M A; 1M6Y A; 9ICL A; 1NK8 A; 3V6H A; 5J2F A; 3KZI U; 2C2R A; 3V7K A; 1D8B A; 1ZET A; 5ALW A; 2PFO A; 2NO5 A; 3WKD A; 4DF8 A; 3D6J A; 2KVC A; 1T3Q A; 3HT3 A; 3N7R C; 3AU6 A; 1Q3V A; 4ACO A; 4QZG A; 3K1R B; 1RDF A; 2MUT A; 3KKA A; 2PMZ F; 8ICK A; 5IIM A; 3UMB A; 2FPL A; 1S0N A; 5KFG A; 2HOI A; 1L7P A; 3FM9 A; 4KLJ A; 1SZP A; 1SIJ A; 1L7M A; 4M9J A; 4UQG A; 3JPS A; 4F4Z A; 9ICV A; 1QSY A; 4F2R A; 1L8O A; 1SL2 A; 2OEH A; 5J0P A; 1O03 A; 2I9G A; 2GLE A; 1JUD A; 2XCA A; 4F4K A; 1EXN A; 1ZRN A; 4M47 A; 3BS7 A; 4ICA A; 2HSZ A; 4CRX A; 2XGP A; 2GO7 A; 4DL4 A; 4CGZ A; 1KDH A; 1B43 A; 4B9L A; 2YX8 A; 1DGS A; 4RZR A; 5AI8 A; 3RB4 A; 4PGY A; 3M7D A; 3EPI A; 3EZ5 A; 3F2B A; 4DSF A; 1ZQO A; 1A76 A; 5J2D A; 1S76 D; 3B0Y A; 2OXO A; 3HRD D; 4O3O A; 3MR5 A; 5KFH A; 8ICC A; 8ICA A; 1RQL A; 2IOH A; 4UW9 A; 5KFX A; 4KX3 A; 2R8J A; 9ICK A; 5CP2 A; 4KMO B; 4QZC A; 5IIL A; 5KL8 B; 5J2B A; 2JH1 A; 5ALE A; 2HHQ A; 4RUA A; 4NLC A; 3SV4 A; 3QU9 A; 3C2M A; 2CXY A; 1NJW A; 4QJF B; 4P4M A; 1N5W A; 4R8U A; 3PR5 B; 1D8L A; 4F4X A; 2E5S A; 4BWJ A; 2BPG A; 4QZB A; 2YB1 A; 2PKE A; 2JGA A; 4RQ3 A; 4KMU A; 2FJ6 A; 4K4I A; 5E79 U; 2ODG A; 4JV2 A; 4KLO A; 4ECY A; 2OYY A; 8ICS A; 2E8O A; 2QLT A; 5HP4 A; 4I2J A; 2Z7J A; 2WF6 A; 4ECU A; 1D8Y A; 2Q4T A; 5AKE A; 5J8Y C; 3ZD8 A; 1QSL A; 1N62 A; 5DG7 A; 3PX4 A; 2DQN B; 4RQN A; 9ICG A; 4I2G A; 2LI6 A; 4CE6 A; 5EWF A; 3V7L A; 4JWM A; 5IIJ A; 1ZQN A; 4UB4 A; 2FI1 A; 4OJP A; 3MGH A; 4RQ2 A; 4QZH A; 4EBC A; 5ALT A; 1T3N A; 1BNP A; 4CF5 A; 1DOQ A; 2XGQ A; 1KFS A; 1U47 A; 7ICR A; 3RAQ A; 3NVW A; 3RAX A; 4UAY A; 5AKG A; 5AK6 A; 1BPZ A; 2HOQ A; 2QB0 A; 2KJ8 A; 1TKD A; 4KLS A; 1ARO P; 3C1Z A; 2BCQ A; 4QZA A; 3T5H A; 4ECV A; 2WF8 A; 4IC9 A; 1L6N A; 2FPK A; 7ICO A; 1KFD A; 5F9L A; 2HBK A; 3RTV A; 2ISO A; 2Y0S F; 5JRT A; 5J29 A; 4DFD A; 3QU7 A; 3ICX A; 2LMR A; 4DLE A; 4KLL A; 1MQ2 A; 3PSI A; 3PW7 A; 1ZQL A; 2ASJ A; 3AQF A; 1XWL A; 5AK5 A; 2H3I A; 7ICE A; 3SV3 A; 3T3F A; 3DDH A; 4GIB A; 2EZZ A; 4PHA A; 2JZB B; 4F4Y A; 3KFU F; 3L4P A; 3IHQ B; 3TAR A; 4CNQ A; 2M0N A; 1WWU A; 1QTM A; 1QH9 A; 2R8G A; 8ICP A; 5KG4 A; 3PW0 A; 5J0Y A; 1S0O A; 4QWB A; 4FBU A; 5AI6 A; 4PL2 A; 5BPC A; 1UCV A; 3JPT A; 2J6S A; 2K4P A; 4DOB A; 5ALS A; 3WK7 A; 4UB1 A; 2R8I A; 4F5Q A; 2LYH A; 4YXM A; 4J9P A; 3HPO A; 3F2C A; 3T5J A; 1XSL A; 4O3S A; 4R66 A; 3PX0 A; 1FFV A; 5KFN A; 1IG6 A; 4C8K A; 3GV8 B; 9ICB A; 5KFW A; 4C80 A; 3RH6 A; 1PVQ A; 1PUZ A; 3RJH A; 3ZDA A; 3L3F X; 2AHO B; 3NGD A; 2XC9 A; 2JH7 A; 4BJQ A; 2DFL A; 4DFK A; 2K8C B; 5ALJ A; 5KG3 A; 4EYI B; 3HP6 A; 4US9 A; 4BWM A; 5DQG A; 4DL7 A; 4NL9 C; 3PX6 A; 2R8K A; 4DSK A; 4BUG A; 3ZI4 A; 2Y1I A; 2C2E A; 4C8M A; 2F3N A; 8ICW A; 4OJ5 A; 1SV4 A; 1KSP A; 5HNK A; 1ZQC A; 2ESE A; 3G6V A; 3UQ0 A; 4OD0 A; 1Q46 A; 1S10 A; 4IRK A; 2NO4 A; 1VJ5 A; 4I2A A; 3KTQ A; 4F92 B; 5DKW A; 4FZN A; 4YMM A; 2W9B A; 1ZOL A; 8ICJ A; 4YG2 A; 2ASL A; 3M9O B; 1UT5 A; 4OJO A; 5DDY A; 5EE0 A; 4QZD A; 4I2E A; 5KTQ A; 2AH5 A; 3A0H U; 1PK1 A; 3RJI A; 5KFK A; 2PI5 A; 4NJ8 A; 3QEA Z; 1D9F A; 4RQM A; 3RJE A; 2AU0 A; 4KLD A; 4EZ6 A; 3QX7 A; 3PW2 A; 3NS1 A; 3ISB A; 2AGO A; 2KFZ A; 2H3Q A; 3BDP A; 1RQN A; 1KFT A; 4P0P A; 1V85 A; 1HJP A; 1UQV A; 4CF4 A; 1OUQ A; 3C29 A; 2IA6 A; 1F44 A; 1WYG A; 2FPM A; 4RNO A; 2P35 A; 3UQ2 A; 2KKV A; 9ICR A; 2BCU A; 4ECR A; 2NRT A; 2BGW A; 5CB1 A; 3GQC A; 2KJ9 A; 2D6F C; 3RR8 A; 4KLM A; 4RPY A; 9ICI A; 2F8L A; 2HDO A; 1RPL A; 3TKA A; 4DO9 A; 1MC8 A; 5DGA A; 3BQ7 A; 4YMO A; 3F5E A; 4QZF A; 4XRH A; 1NK9 A; 2WB1 F; 1T4G A; 1ZQR A; 1KL9 A; 4TUR A; 2RHF A; 3FDS A; 3C28 A; 2IBK A; 2IOF A; 1X40 A; 4J9S A; 2XID A; 1UHU A; 5KFF A; 5KT2 A; 4MEY A; 5KFA A; 3UM9 A; 4TUP A; 1DK2 A; 8ICB A; 4RT2 A; 1SL0 A; 4O3R A; 1IV8 A; 4RNM A; 2DUY A; 4ELU A; 4M2Y A; 4PH5 A; 2W11 A; 4DFJ A; 5F3X B; 1ZRM A; 1IXR A; 7ICF A; 2W54 A; 4ED8 A; 3V72 A; 3CRX A; 2QAR B; 4C7Y A; 1XS9 D; 4UBB A; 3S6J A; 4M04 A; 4KLE A; 1N61 A; 1ZXI A; 3IN5 A; 2FMS A; 8ICZ A; 1JRP A; 1MQ3 A; 3E2E A; 5HR6 A; 2ZIW B; 4G3I A; 1V9P A; 5ALV A; 1KTQ A; 1S9F A; 2KHV A; 5AM5 A; 3TI0 A; 1DRG A; 4GC7 A; 3QUT A; 5DLF A; 2E8M A; 1ZQF A; 3ISD A; 4QZE A; 5J2K A; 3TAC B; 1N2X A; 4B9U A; 5ALX A; 2V9W A; 5CRX A; 7ICS A; 2F77 X; 5AIA A; 4YD1 A; 4F2S A; 4B9T A; 5KG6 A; 5ALN A; 5DB6 A; 5KAF U; 1UPH A; 1TAQ A; 5KT6 A; 1ZD3 A; 1OXJ A; 3OTQ A; 1RYR A; 4ECZ A; 3IRU A; 2DF4 B; 4ECT A; 3PV8 A; 1SXE A; 3H4B A; 3MC1 A; 4QIW C; 2BQR A; 4DQQ A; 4GLX A; 2UVV A; 2KKP A; 4UAW A; 1PZN A; 4NLZ A; 5HMM A; 2JEJ A; 5B5E U; 5J0W A; 4DLG A; 2XI9 A; 2W7P A; 3M9N B; 3SI8 A; 1ZYQ A; 1X66 A; 4YVZ A; 4F91 B; 2XY6 A; 1V97 A; 1AQ6 A; 2A1J B; 3I76 A; 1ZQK A; 2EDU A; 3QU4 A; 3KOO A; 1X9S A; 5L1J A; 3OHB A; 9ICM A; 1RM6 C; 2KJ5 A; 1Z3E B; 2LKY A; 5DG9 A; 2ZJA A; 4US8 A; 2HHV A; 2UVR A; 4UAU A; 5AKX A; 1BVS A; 2DKX A; 5ALK A; 5ALR A; 1JIH A; 1ZQU A; 5AK4 A; 4K4H A; 4I2B A; 2P6R A; 3WKB A; 5AKH A; 2ATL A; 3JPP A; 1S0M A; 3ETR A; 3TAP A; 1CUK A; 1FIQ A; 4ED6 A; 4DL2 A; 1FEZ A; 7ICK A; 4OJ6 A; 5JTI A; 2CN1 A; 4JV0 A; 4PL1 A; 2AJQ A; 3N7P D; 4XQ8 A; 1RYU A; 1LKY B; 1T7P A; 5AKZ A; 2KV2 A; 3MR3 A; 1CEZ A; 4C0Z A; 1XSN A; 1JAL A; 1A0P A; 3RJK A; 1Z00 B; 4YR0 A; 1NK6 A; 2BPF A; 4O0I A; 3LYS A; 2ZUC A; 2NRW A; 5G5G A; 2VA8 A; 1Z4O A; 5ALH A; 2EZY A; 2B21 A; 1ZD4 A; 4Y2R A; 4PJ0 U; 4F4W A; 3G6Y A; 2CPR A; 3N28 A; 3O0F A; 4DL5 A; 2RP5 A; 3OJS A; 1PVP A; 4QZI A; 2EAO A; 1X9X A; 3WK6 A; 3HWT A; 2C2D A; 3BQ1 A; 4J9L A; 1WUD A; 4EEY A; 7ICJ A; 1NNL A; 4IQW A; 1K1Q A; 4FE3 A; 3GZF A; 1N48 A; 2LHT A; 1KEJ A; 4Y2S A; 2JZB A; 3RRG A; 3EW9 A; 4O5E A; 1Z19 A; 1NJX A; 3JPO A; 3PML A; 1K5O A; 3KHH A; 4QZ9 A; 1XU4 A; 5KNI A; 2ALZ A; 4NLN A; 5KFR A; 2Q0Z X; 2GOL A; 3WK5 A; 4KTQ A; 2FDR A; 2ZJ5 A; 3AUO A; 1X42 A; 3H0R B; 5L1L A; 5ALZ A; 3AL0 B; 2EQY A; 5JUM A; 2NRZ A; 3NVZ A; 1SB3 C; 1T8E A; 3AU2 A; 3UXO A; 3ONN A; 2F44 A; 3EWA A; 4YP3 A; 3UMC A; 4RPX A; 3JPN A; 4UB6 U; 5AIC A; 2E8P A; 3GFK B; 2YMQ A; 2WF9 A; 4NLK A; 4C4S A; 2C22 A; 1BNO A; 5G5H A; 1COO A; 2FLL A; 4RQ7 A; 4I2D A; 5KFJ A; 3H8W A; 1NKC A; 2JEI A; 4B6J A; 3DV9 A; 1ZQQ A; 4Q43 A; 1S97 A; 3D2N A; 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