The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
84
|
structure length |
84
|
Chain Sequence |
GSSGSSGPWQPPADLSGLSIEEVSKSLRFIGLSEDVISFFVTEKIDGNLLVQLTEEILSEDFKLSKLQVKKIMQFINGSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SAM_PNT-domain of the hypothetical protein LOC64762
rcsb |
| molecule keywords |
hypothetical protein LOC64762
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
18
|
| structure length |
84
|
| sequence length |
84
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WWV A; 4IS7 A; 2QB0 A; 2KG5 A; 2L5Y A; 2K4P A; 3SEN A; 2K60 A; 4NL9 C; 2F44 A; 1SV0 C; 2QB0 B; 1PK1 A; 2LMR A; 3IDW A; 2YTU A; 2QB1 A; 5JRT A; 3TAD C; 2EAM A; 1PK3 A; 5KNI A; 1OXJ A; 1PK1 B; 1Z1V A; 2KIV A; 4NL9 A; 5J8Y C; 2E8N A; 1F0M A; 1UCV A; 2D8C A; 2DKX A; 4RQN A; 1SV0 A; 4PZO A; 2QAR A; 2Y9T A; 1SXD A; 1V85 A; 2QKQ A; 5JU5 A; 3H8M A; 1X66 A; 2QAR B; 2F3N A; 1SXE A; 1SGG A; 5JTI A; 2DL0 A; 3K1R B; 3KKA C; 2E8P A; 1JI7 A; 1UQV A; 1B4F A; 2KMD A; 1V38 A; 2EAN A; 2E8M A; 2D3D A; 2DKZ A; 1X9X A; 5L1M A; 2LPE A; 1DXS A; 1X40 A; 5F3X B; 2E8O A; 3TAD A; 2FE9 A; 3BS7 A; 2EAP A; 2KSO A; 4NJ8 A; 1LKY A; 1COK A; 1OW5 A; 2F8K A; 3HIL A; 1B0X A; 2Y9U A; 3BS5 A; 2JV3 A; 2KSO B; 5J8Y A; 1LKY B; 4RQM A; 4MHV A; 1WWU A; 3BS5 B; 2GLE A; 3SEI A; 2EAO A; 2KE7 A; 4PZN A; 1SV4 A; 3TAC B; 3BQ7 A; 2B6G A; 1KW4 A; 2ES6 A; 1RG6 A; 2ESE A; 3KKA A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VJ5 A; 3MDC A; 4EBD A; 2NRX A; 2BKE A; 4Y2T A; 2K4P A; 7ICI A; 7ICQ A; 5KL8 B; 3F53 A; 4ED1 A; 2W04 A; 2KKV A; 1Z19 A; 3V7K A; 4QW8 A; 2XC9 A; 4DQQ A; 2HHU A; 1Q3V A; 3ZI4 A; 3NUQ A; 4QIW F; 4J9N A; 2ZIW A; 5T14 A; 3LVW A; 1ZQP A; 1TE2 A; 3NRW A; 4RQ7 A; 2BZF A; 4BXO B; 5KFP A; 3TKA A; 5KG6 A; 4Y2Y A; 2KIV A; 5AKI A; 2HI0 A; 3GV8 B; 5CHG A; 4CF4 A; 4YN4 A; 4B6J A; 3RJG A; 3I76 A; 3CP8 A; 1HUO A; 1UA0 A; 4F2S A; 1BPE A; 1SL2 A; 3KZX A; 1JIH A; 4PL2 A; 1S0N A; 2BGW A; 2MA1 A; 3KKA C; 8ICF A; 4YP3 A; 3QUC A; 2KV2 A; 3B0Y A; 3MFH A; 5J29 A; 4ACO A; 1URJ A; 4F4X A; 1X9X A; 5L1M A; 3GIK A; 5DQI A; 2HVH A; 5AKL A; 4ECX A; 1KN5 A; 1ZXI A; 5DGA A; 1PVQ A; 2J6T A; 4KLE A; 2JMG A; 2FPK A; 4C0Z A; 4M9L A; 1SWV A; 3WK4 A; 4M9J A; 3G6X A; 1LKY B; 5KT6 A; 3QUQ A; 4Z6E A; 3ORY A; 4PGY A; 2ZG6 A; 5G5G A; 2HCF A; 2Y0S F; 3GIL A; 1BPY A; 4BUG A; 1Q46 A; 4ECU A; 5DBB A; 2W9A A; 4Y2P A; 1RG6 A; 3BQ0 A; 1HIW A; 3KBB A; 1TK8 A; 4NLK A; 3SV3 A; 3QU7 A; 1NJY A; 4JWN A; 3Q8S B; 1LV5 A; 2R8J A; 3ISC A; 2XY7 A; 3SR6 A; 3RJE A; 3TAD C; 5KG1 A; 4O3P A; 4JWM A; 3TAR A; 4CNQ A; 2ZUB A; 4NLB A; 4UB3 A; 5L1I A; 1L3T A; 4R8U A; 4RQ4 A; 2FLP A; 1C20 A; 4DL5 A; 2F1I A; 3MR6 A; 2G08 A; 4LZD A; 9ICL A; 2XY5 A; 5KFC A; 5AK6 A; 4OJO A; 2D8C A; 3C1Y A; 2ISP A; 3FYH A; 4ED8 A; 7ICU A; 2KJ8 A; 1RDF A; 1ZQC A; 3NVY A; 5ALP A; 5JU5 A; 3QU5 A; 4Z6D A; 3PW7 A; 1NJW A; 2H3Z A; 2QAR B; 2WF6 A; 2IOH A; 4EZ6 A; 5KFO A; 4QZ8 A; 2OH2 A; 2WB1 C; 3VC8 A; 1Z4O A; 2K4H A; 2BR0 A; 2D3D A; 3EPG A; 4JK1 A; 2R8K A; 5KFF A; 5HHH A; 2KTQ A; 5KFB A; 4HYK A; 5AIB A; 2CN1 A; 1S10 A; 8ICA A; 4TUR A; 1D9F A; 2EAP A; 1U49 A; 1ZQL A; 5KFG A; 1V9P A; 4I2B A; 3PX4 A; 3T5J A; 5J2E A; 4TUQ A; 3M8S A; 4KLM A; 5HP4 A; 4MFA A; 5ALJ A; 2KOB A; 7ICO A; 4DCC A; 4Q43 A; 1Z00 B; 3B0X A; 3M8R A; 2AH5 A; 4C8K A; 4F4Y A; 4EZ9 A; 2P35 A; 2ZIU A; 5AKZ A; 7ICH A; 2K4I A; 5F9N A; 2PKE A; 3F2B A; 8ICI A; 4IS7 A; 4QZA A; 2LHT A; 3RTV A; 2KG5 A; 2A1J B; 4K4G A; 3SEN A; 2K60 A; 2PI4 A; 1T4G A; 5EE3 A; 2QB0 B; 4M9G A; 3TAP A; 4BXO A; 3PW5 A; 2A19 A; 3HT3 A; 2FPM A; 4HAI A; 4FS1 A; 4RUA A; 1PK1 B; 5AKX A; 5IIN A; 1KBU A; 7ICE A; 4DQP A; 8ICK A; 1K1S A; 3RAX A; 2ATL A; 4ECQ A; 1HJP A; 3E2E A; 4Z6C A; 1V97 A; 8ICW A; 2P6R A; 8ICX A; 4CGZ A; 4IQV A; 3UXP A; 3PNC A; 4ZH4 A; 2GOL A; 3HPO A; 2DL0 A; 5KFN A; 3GV5 B; 4C8L A; 4QWE A; 1KFD A; 3SYZ A; 3U26 A; 2KMD A; 1BNO A; 5AK3 A; 2ZJ8 A; 4K4I A; 4JV2 A; 3V6H A; 4J9O A; 4KLT A; 5AKK A; 4BGD A; 2E8O A; 5AKJ A; 4UB1 A; 2EZX A; 1LB2 B; 5AM5 A; 5EE0 A; 3IP4 B; 1LKY A; 1ZD5 A; 1ZQI A; 4DWI A; 1A77 A; 4NLN A; 2HMX A; 2KSO B; 3BDP A; 1S76 D; 1ZQX A; 2VA3 A; 4MHV A; 3RFA A; 4EX6 A; 4DSE A; 2KZM A; 4RT3 A; 5J0S A; 5J0U A; 4IRC A; 4KLG A; 4DSL A; 2R8G A; 4DQS A; 2YB1 A; 4UAZ A; 3HKZ F; 3QU4 A; 2W8L A; 1NNL A; 2JXJ A; 4F8R A; 2RQ5 A; 3AU2 A; 4KN7 A; 2MSN A; 4NLG A; 4F5R A; 1N5X A; 5CA7 A; 7ICM A; 2ZXH A; 5DDY A; 1BGX T; 4M04 A; 4DSJ A; 2YQE A; 5JRT A; 4OD0 A; 4DQI A; 1ZYQ A; 3M1Y A; 2BDU A; 1QQ6 A; 3Q8L A; 4ECR A; 3V7L A; 5KFJ A; 5ALZ A; 1F0M A; 5KFX A; 1PZN A; 5CJ7 A; 5DB9 A; 2OHF A; 3SAH A; 2QAR A; 4U7C A; 2W54 A; 4RQ6 A; 2ISO A; 5KG2 A; 1RYR A; 4GFJ A; 3BQT A; 3KZI U; 4ECZ A; 4FZN A; 3TFS A; 1LVH A; 1TKD A; 1S5L U; 1TFR A; 3MGV A; 3RH6 A; 9ICI A; 2WF7 A; 3D2S A; 4KX3 A; 4NLZ A; 4C8O A; 2W9C B; 2R8H A; 9ICH A; 1P7D A; 1S0V A; 1NK9 A; 3AQF A; 3PW4 A; 1KL9 A; 2BQ3 A; 2DPI A; 3THV A; 5III A; 3RR8 A; 5J2C A; 5AI9 A; 5J0R A; 1FIQ A; 4KX5 A; 3A0H U; 4GXI A; 4DOB A; 4YXJ A; 2AGQ A; 2LI6 A; 4ZOH C; 1Z00 A; 2KIC A; 3H8W A; 3QX7 A; 2RLT A; 2DPJ A; 8ICY A; 2KKP A; 1SL1 A; 2BDP A; 4KLO A; 4CCH A; 1ZD4 A; 4RPY A; 3BZC A; 3HP6 A; 1ZJN A; 2W8K A; 2ESE A; 1JN3 A; 2QB0 A; 1NKB A; 9ICB A; 5AHX A; 1BVS A; 1L5U A; 2VJ5 A; 1QSS A; 1PK1 A; 3QEB Z; 2KVS A; 1ZQE A; 4B9T A; 4C4R A; 3ZDB A; 3ALR A; 1KEJ A; 5IIL A; 3M9N B; 5ALT A; 3MGH A; 4J9L A; 1ZET A; 4ECT A; 4AYB C; 4US8 A; 3NGD A; 4RUC A; 2G0A A; 2WTF A; 2E8N A; 4E0D A; 3C28 A; 2I1Q A; 2F1H A; 1XSP A; 2C28 A; 4C7Z A; 5J2K A; 1RXW A; 4RNO A; 3OSP A; 2VAN A; 5KFM A; 4UAW A; 4QW9 A; 3UQ2 A; 3N28 A; 1MQ3 A; 5AK5 A; 3WK8 A; 2ZIX B; 4CE6 A; 4FE3 A; 2JGA A; 5AKG A; 3IHQ B; 3KD3 A; 4RPX A; 2P66 A; 5KFV A; 2HHV A; 4XA5 A; 3TI0 A; 1QQ7 A; 4P0Q B; 1H38 A; 4DSI A; 2I5H A; 3MR2 A; 1KLN A; 2HBK A; 1QSY A; 4YCX A; 3PZP A; 3M6K A; 4FO6 A; 7ICT A; 9ICE A; 2KSO A; 4I2H A; 4OJP A; 4DS4 A; 2DGZ A; 5KG3 A; 4YFK A; 2EQY A; 4MF2 A; 8ICJ A; 5JUM A; 3PML A; 1NKE A; 1TK5 A; 3JPO A; 4US9 A; 4DL3 A; 2GLE A; 4DQR A; 9ICJ A; 3RJI A; 8ICU A; 4ECW A; 3DV9 A; 4CDG A; 3N97 B; 2XCP A; 5GTH U; 4QZG A; 5HHI A; 2LYB A; 4O3M A; 4UAR A; 3OPX A; 2E1E A; 1NJX A; 1ZQV A; 3RB4 A; 4K4H A; 5ALE A; 4R66 A; 1U9L A; 3GIM A; 4ED7 A; 3H0R B; 4JB3 A; 1ZQZ A; 2DF4 B; 2RRD A; 2PMZ C; 4I2G A; 2AGP A; 5J2J A; 3FC4 A; 3ISD A; 1U48 A; 2KN7 A; 5AI0 A; 2LYH A; 3RRH A; 5ALM A; 2KJ5 A; 1RZT A; 2HW3 A; 5J0Y A; 2FJ6 A; 5J0O A; 1KTQ A; 3LWM A; 2KEY A; 4MFC A; 4YR2 A; 2ZIU B; 5J8Y C; 1ZQH A; 5BOM A; 5EOZ A; 2BPC A; 2WB1 F; 4MFF A; 8ICB A; 1FEZ A; 2UVV A; 5DGB A; 4BWJ A; 4F92 B; 3V72 A; 3DEE A; 1K5O A; 1BPB A; 1JRO A; 2W9C A; 4EYI B; 5KT3 A; 3GDX A; 7ICG A; 1MN8 A; 5ALS A; 4JV1 A; 3EW9 A; 4ED3 A; 1DRG A; 5ALL A; 4TUS A; 1WCL A; 3EWA A; 2FLL A; 5B66 U; 3WK5 A; 4LVS A; 4IRK A; 2JH7 A; 3FDS A; 1B22 A; 4FFD A; 4DS5 A; 2HHQ A; 4ED2 A; 2D6F C; 3MGI A; 2Q0Z X; 1X40 A; 4IC9 A; 1BPD A; 3QUB A; 3SAF A; 8ICZ A; 1L7M A; 1UPH A; 3TQ1 A; 4DL2 A; 3TAQ A; 1JX4 A; 5ALI A; 1N62 A; 1B0X A; 2PFO A; 3GQC A; 4KLJ A; 3PSI A; 2HOQ A; 2LKY A; 3M9M B; 5DG9 A; 4FS2 A; 5KFU A; 3T5H A; 1ARO P; 1NK0 A; 2M9N A; 4IQT A; 1QTM A; 2LBO A; 4PZN A; 2XO7 A; 1SV4 A; 3TAC B; 2VIX A; 3BQ7 A; 4P0P B; 1ED1 A; 5AIC A; 4DO9 A; 4EEY A; 7ICR A; 3PO4 A; 5DQG A; 3ZDE A; 5AI4 A; 4IQW A; 2BCV A; 5L1J A; 8ICN A; 2DBY A; 1NKC A; 3I1Y A; 1NK7 A; 4QWA A; 4R64 A; 2NO5 A; 4PL1 A; 5CP2 A; 4C4T A; 4X5V A; 3WKA A; 4NL9 C; 5J2G A; 4ECV A; 1ZQJ A; 1D8B A; 1RPL A; 3NVZ A; 3H4B A; 4QZE A; 2MRL A; 4TQR A; 4RQ8 A; 4GLX A; 4MEX A; 5DLF A; 4FZL A; 3IRU A; 4I2D A; 4P4O A; 4NM2 A; 2EAM A; 5KNI A; 2OEH A; 1ZQ1 C; 2XVT A; 5J0Q A; 4EBE A; 4DL7 A; 2F77 X; 4R65 A; 1U45 A; 5D49 A; 5EE1 A; 4B9M A; 2NRZ A; 4F71 A; 2IMW P; 2Z7J A; 2BCR A; 1TAM A; 3PR5 B; 3IN5 A; 2C2D A; 5TZV A; 1RQN A; 5D46 A; 2ZIX A; 2WF8 A; 3R9K A; 2H3V A; 2C22 A; 3M7D A; 5KG5 A; 1GO3 F; 4P0Q A; 2RDJ A; 1TAQ A; 2JHD A; 4PH5 A; 2JEF A; 5KTQ A; 8ICL A; 4EEN A; 1S8O A; 2EAN A; 2E8M A; 3V6J A; 1DXS A; 2AU0 A; 1WYG A; 1NI3 A; 1KQQ A; 3RR7 A; 2FE9 A; 3RJK A; 3SQI A; 5AI5 A; 2NO4 A; 4P2H A; 3C23 A; 2WAQ C; 4RNN A; 4RQ3 A; 4NV0 A; 5AI6 A; 1NZP A; 2ZTD A; 4I27 A; 1NK5 A; 4RQM A; 2XCA A; 3JPR A; 4QZC A; 3KHR A; 3WK6 A; 1KSP A; 2F76 X; 3EPI A; 3NAS A; 1T8E A; 2LM4 A; 1MSW D; 3NVW A; 4KLU A; 3NS1 A; 3S6J A; 3KKA A; 4RQ2 A; 1L7O A; 3QU9 A; 9ICA A; 1ZRM A; 4QIW C; 3PX6 A; 4BDP A; 3KTQ A; 4PHA A; 2YTU A; 2LM1 A; 3FAH A; 1UT5 A; 1N61 A; 1Z1V A; 4DFM A; 8ICE A; 4ECY A; 1JUD A; 4Y2R A; 4Q8E A; 1U4B A; 2WHE A; 4BJQ A; 4NL9 A; 5DB7 A; 3QEA Z; 4O3R A; 5BOL A; 2W9M A; 4QWB A; 2W7O A; 1N63 A; 3RBE A; 4KLD A; 5AI8 A; 3LVV A; 5H2F U; 4DOC A; 2ZTE A; 5G5H A; 3F2C A; 2JRZ A; 3BZK A; 2YN4 A; 1SXE A; 4EX7 A; 4F4W A; 5TIS U; 4IRD A; 3T79 A; 2XID A; 4LJX A; 5KFR A; 4PHE A; 3Q8M A; 3TAD A; 3WKC A; 5HMM A; 3PX0 A; 2BQU A; 4NJ8 A; 5GTI U; 2E1F A; 1ZJM A; 1ZD2 P; 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3PY8 A; 2C2E A; 3K75 D; 3OHA A; 1UT8 A; 4KN4 A; 2PMZ F; 1XSL A; 3SEI A; 5KFZ A; 2WF9 A; 4C7Y A; 4G3I A; 4F4Z A; 2OXO A; 3MAB A; 5ALN A; 3H7I A; 1SIJ A; 3UXN A; 2NV3 A; 4XQ8 A; 2HHS A; 3WK9 A; 7ICF A; 1YZ6 A; 4CRX A; 4DL6 A; 4M0A A; 4NXZ A; 1X6J A; 3C5F A; 4RQ5 A; 3FM9 A; 2WF5 A; 2LMR A; 1KRP A; 5KG7 A; 3AMZ A; 9ICW A; 3CW2 C; 3VCB A; 1RQL A; 1Y88 A; 1PK3 A; 1OXJ A; 1ZQU A; 1A6S A; 2F2A B; 4UB6 U; 2ZJ5 A; 2MUT A; 3OJU A; 1ZQM A; 5KFQ A; 3H8S A; 9ICV A; 4DLE A; 3CRX A; 2GWS A; 2G5H B; 1IIP A; 3QYP A; 5HML A; 3OGU A; 4NLC A; 1A0P A; 4OJ6 A; 2HBJ A; 3L3F X; 4F72 A; 1HUZ A; 3H8M A; 1AQ6 A; 2F3N A; 3C2K A; 3QZ8 A; 1HEK A; 5J2F A; 2PFP A; 1JXL A; 4RQ0 A; 5AM1 A; 2E5S A; 4G9B A; 2KHV A; 2BHN A; 4EBC A; 2BPF A; 2DKZ A; 2H3Q A; 3RBD A; 4KMO B; 4KIT B; 3J81 j; 1PVP A; 2Q4T A; 3N7P D; 3PW2 A; 1TV9 A; 4J9P A; 4UB8 U; 5ALK A; 1KDH A; 5AK4 A; 4TUP A; 4JUZ A; 1COK A; 3RAQ A; 4QWC A; 1J2N A; 2P6U A; 3SMV A; 1OW5 A; 4EEK A; 1S77 D; 9ICT A; 3BJY A; 3B9J A; 4IR9 A; 2UVU A; 4KLI A; 4I2F A; 1WWU A; 3HKZ C; 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