The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
98
|
structure length |
98
|
Chain Sequence |
GSSGSSGEKAEDCWELQISPELLAHGRQKILDLLNEGSARDLRSLQRIGPKKAQLIVGWRELHGPFSQVEDLERVEGITGKQMESFLKANILGLAAGQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-070, a C-terminal domain of kinesin-like protein KIF22 from human cDNA
rcsb |
| molecule keywords |
Kinesin-like protein KIF22
|
| molecule tags |
Transport protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
20
|
| structure length |
98
|
| sequence length |
98
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-02-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF12836 | HHH_3 | Helix-hairpin-helix motif |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | AF1531-like domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2I5H A; 2EDU A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3MFH A; 5KL1 B; 1L3S A; 2W11 A; 3ZDC A; 1SV0 C; 1A76 A; 2Y1J A; 1ZQA A; 1NI3 A; 4PH5 A; 4ED2 A; 3HP6 A; 2QAR B; 5K4L A; 5J2B A; 1ZQR A; 3RH4 A; 1KSP A; 1UA1 A; 1D9D A; 3HJE A; 5AI6 A; 4FFD A; 5KFE A; 4TQR A; 5AM2 A; 3IP4 B; 4BXO A; 3IN5 A; 4R66 A; 1KKX A; 9ICF A; 3Q8L A; 4QW9 A; 3C29 A; 2NYV A; 4EBC A; 5EOZ A; 3H4D A; 5KT4 A; 1DGS A; 3WK4 A; 1KBU A; 3IG5 A; 2VAN A; 4XQ8 A; 4ECQ A; 4M9L A; 1TAM A; 1KW4 A; 1Q8K A; 1P7D A; 9ICS A; 2FMP A; 2P35 A; 1ZQN A; 1KTQ A; 1ZQZ A; 2KIC A; 3GDX A; 4NLC A; 3LWL A; 4R63 A; 2KD1 A; 2NV3 A; 4RNN A; 1XWL A; 1O03 A; 1SWV A; 4O9M A; 2KJ5 A; 4X5V A; 3RTV A; 4YR0 A; 3UQ0 A; 3IRU A; 2QB0 A; 1SL2 A; 3KBB A; 1SXD A; 3D2Q A; 5J0Q A; 4DF8 A; 4KLF A; 1SGG A; 2LHT A; 5AM1 A; 5DQH A; 3LVV A; 3EW9 A; 9ICO A; 1SV4 A; 2UVV A; 4YVZ A; 2XGP A; 1C7Y A; 2MRL A; 4UAU A; 1U49 A; 3C5G A; 3M8S A; 2OEH A; 4C4T A; 3MDC A; 4KLT A; 4CE6 A; 4GXK A; 2G09 A; 1NJX A; 3DDH A; 4J9P A; 4UAY A; 1JN3 A; 1Y88 A; 3GU3 A; 5IIN A; 4QIW F; 5KFT A; 2HBL A; 4KLD A; 1RPL A; 2ATL A; 3JPN A; 4MFA A; 4GC7 A; 5L9X A; 3KOO A; 2DWQ A; 2HI0 A; 3ZD9 A; 3HX0 A; 1ZQI A; 7ICR A; 3I28 A; 1S97 A; 1L3U A; 1WWU A; 4Y2P A; 4CDG A; 2RQ5 A; 4KLH A; 1L8O A; 3OSN A; 8ICP A; 8ICA A; 4IC9 A; 5FP0 A; 5KT5 A; 5AI8 A; 3V7L A; 5B66 U; 2JMG A; 2GWS A; 3DEE A; 1L6N A; 5KFS A; 3I1Y A; 1WUD A; 4UB1 A; 2Q4T A; 2P6R A; 2KSO A; 2NRT A; 4DFM A; 4DS5 A; 4FS2 A; 3N7P D; 2WF7 A; 4UB4 A; 2W9C A; 2KJ8 A; 4RZR A; 3N97 B; 3NVW A; 2ESE A; 1D9F A; 3PW4 A; 1S9F A; 4QJF B; 3TFR A; 3ZDE A; 1PVQ A; 5KFU A; 1ZQH A; 4IS7 A; 3THV A; 3K75 D; 1XU4 A; 4YXJ A; 3T5J A; 2PKE A; 3K1R B; 4FS1 A; 4O3P A; 4DSK A; 7ICN A; 1NK5 A; 3EPG A; 5KG7 A; 4YR2 A; 4AYB F; 1TAU A; 3PO4 A; 4AP9 A; 3D6J A; 1C20 A; 3RJJ A; 1KRP A; 3NGD A; 2A3V A; 2ZJA A; 4CF4 A; 5AKI A; 2K4E A; 3SD7 A; 2KZM A; 3JPT A; 5C0Y A; 4K4G A; 2WF9 A; 2BKE A; 1KDH A; 3RR8 A; 5AI9 A; 1KQQ A; 2HOQ A; 3QEA Z; 1DK2 A; 3T3F A; 4KLQ A; 3RFA A; 1QSS A; 1Q46 A; 1OXJ A; 7ICM A; 8ICW A; 1GO3 F; 1JAL A; 2HBJ A; 3HRD D; 2NRX A; 5EWG A; 3RF9 A; 1ZQM A; 4PPX A; 3QX7 A; 5DBA A; 2P6U A; 3AEV A; 4DL7 A; 1MN8 A; 4RT2 A; 2JEG A; 3C23 A; 2RP5 A; 3KFU F; 1SWW A; 3KZI U; 3N28 A; 2FMQ A; 5ALG A; 3RBD A; 2AGO A; 3NAS A; 5ALY A; 4R65 A; 4TUR A; 3EUB 2; 4NY8 A; 5DLG A; 2M0N A; 1UPH A; 4NLZ A; 5KFY A; 1N5W A; 3OTQ A; 1V9P A; 1TFR A; 2KIW A; 2BZF A; 5DB6 A; 4UAR A; 3RJG A; 1N62 A; 2N1R A; 2KE7 A; 4KTQ A; 1NKB A; 3D2N A; 1SZH A; 9ICA A; 2P66 A; 1BPB A; 4QZE A; 2IOF A; 4O3O A; 5KFD A; 5KFX A; 3C2M A; 8ICB A; 5ALW A; 4EEN A; 1JUD A; 2HOI A; 1T7P A; 4DWI A; 1BVS A; 4RPY A; 1ZRM A; 3SAG A; 2MUT B; 2BCV A; 5ALF A; 3UM9 A; 3QU7 A; 1BGX T; 3PO5 A; 4DL3 A; 4YR3 A; 1IG6 A; 4DS4 A; 3F2B A; 2KTQ A; 1TAQ A; 2W3S A; 1UT5 A; 4EYH B; 3H0L B; 2VKQ A; 4J9L A; 3B9J A; 5JU5 A; 2ZIX B; 2XVT A; 4NWI A; 1ZQW A; 2Y0S F; 2IOH A; 3KKA A; 5DGB A; 2HVH A; 3V6K A; 1XSN A; 4KLL A; 2Y9T A; 3H0M B; 4DLG A; 1ZQF A; 4I2D A; 1NK7 A; 4B6J A; 3WK9 A; 2UVU A; 1BPY A; 3U26 A; 5ALT A; 3RJH A; 1T3Q A; 4PL1 A; 5KNI A; 4P0P A; 1SV0 A; 2OCE A; 1J97 A; 3QUB A; 3ZDA A; 5CWR A; 1L3V A; 3UMB A; 5AM5 A; 3JPS A; 3RH5 A; 5ALI A; 2PI5 A; 2FI1 A; 5ALK A; 2B21 A; 5J29 A; 2YMQ A; 1NK6 A; 7ICV A; 1TE2 A; 2EDU A; 3F5A A; 2K8A A; 5CA7 A; 3RJI A; 4KX3 A; 1NKC A; 1ED1 A; 3B0Y A; 3PX0 A; 1RZT A; 4GLX A; 1CI4 A; 3T5L A; 5KFK A; 1ZYQ A; 2D3D A; 4C8K A; 4PZO A; 4FZM A; 4I2F A; 2LM1 A; 4YCX A; 4Q45 A; 3GFK B; 5J0Y A; 3V6H A; 4F5R A; 3M7D A; 2ZJ5 A; 1Q3V A; 5D49 A; 2FPM A; 2RLT A; 1JXL A; 9ICM A; 5L1K A; 1IXR A; 7ICE A; 2ZIV A; 2L5Y A; 4TUQ A; 5AKJ A; 1PK3 A; 4I2H A; 7ICP A; 4KN4 A; 5HR7 A; 4MFF A; 5DG7 A; 3WKC A; 4JMU A; 4YMO A; 1QSY A; 3SAF A; 4O5E A; 5F9N A; 2JH1 A; 8ICI A; 3OHA A; 4C8M A; 1T8E A; 3QUT A; 4OCZ A; 4FZN A; 1WCN A; 1NK4 A; 1NKE A; 4CF3 A; 4F2S A; 2XGQ A; 3M8R A; 2JGA A; 2KZ3 A; 4MEY A; 2AJQ A; 2FLN A; 3G6V A; 5JUM A; 3RB6 A; 2H3I A; 2FJ6 A; 2F44 A; 5DG9 A; 5KFL A; 1NJW A; 4KLS A; 2DFL A; 5AK4 A; 3TAR A; 3E2E A; 4NL9 C; 5J2D A; 5CJ7 A; 5KG6 A; 5ALO A; 5J2G A; 5KG5 A; 1N5X A; 2W54 A; 1OUQ A; 4I29 A; 2KNJ A; 5ALS A; 5AK5 A; 2W03 A; 4Y2R A; 2QKQ A; 3QEB Z; 4TQS A; 2IHM A; 8ICL A; 4BUG A; 1S76 D; 4O5K A; 4NXZ A; 3RBE A; 4DF4 A; 2EAM A; 3EZ5 A; 5KFO A; 1MSW D; 1RM6 C; 3J81 j; 2W9B A; 1JXE A; 4KMU A; 4UAZ A; 1X9S A; 2BCU A; 3C1Z A; 2YQE A; 3ISB A; 4UW9 A; 2B0C A; 1LKY A; 1F0M A; 1N2X A; 1FO4 A; 4R8U B; 4NM2 A; 2HHX A; 4Q8E A; 1BNO A; 8ICU A; 2YY6 A; 2Z7J A; 5ALU A; 4F5N A; 5AIC A; 4B9N A; 1D8B A; 3SI8 A; 5HML A; 3PR5 B; 5J0S A; 3PMN A; 4DSE A; 1A77 A; 4P0Q A; 2FDR A; 2ZIU A; 2A19 A; 4KX5 A; 5G5G A; 2XID A; 2HOF A; 5L1J A; 3ZDB A; 2YMP A; 4DSF A; 4G3I A; 4IRK A; 3AU2 A; 2AGQ A; 4ELV A; 2H5X A; 3IG8 A; 4DQS A; 1ZQJ A; 4OJL A; 2KMD A; 4UB6 U; 4RQ1 A; 1N61 A; 2MA1 A; 1ZQP A; 1D8Y A; 2J6U A; 4GIB A; 1U48 A; 3C1Y A; 4U6P A; 4K4I A; 5AK3 A; 2OWO A; 1UHU A; 4CGZ A; 5CRX A; 1U47 A; 2G0A A; 3BQ7 A; 4PHP A; 4DL5 A; 2V4Q A; 2AQ0 A; 5CHG A; 4I28 A; 2MAX A; 3PX6 A; 4YFK A; 3C5F A; 2W43 A; 4IRC A; 1Z4O A; 4UAW A; 1LB2 B; 4F3O A; 3ETL A; 4F4X A; 1L7P A; 2NO4 A; 1RYU A; 4UB8 U; 1ZOL A; 2EQY A; 5B5E U; 2FE9 A; 1QQ5 A; 5T14 A; 2K60 A; 2RDI A; 1RDF A; 3PV8 A; 4YG2 A; 4BDP A; 2BCS A; 2CRX A; 5ALL A; 4B9V A; 2HHT A; 2BPC A; 3OPX A; 4PZN A; 5IIJ A; 1U45 A; 4UB5 A; 4ECX A; 1PK1 A; 5BOM A; 2Y9U A; 7ICO A; 5HHH A; 4IR1 A; 5KFW A; 4BGD A; 4EX7 A; 2PFO A; 1AQ6 A; 3EYZ A; 1B0X A; 2KG5 A; 4J9K A; 3NVY A; 4RQ3 A; 5ALR A; 1TK0 A; 4J9S A; 5GTI U; 4RUA A; 5F9L A; 4ED6 A; 3H8W A; 2NRW A; 3HIL A; 4C8N A; 2BR0 A; 2YB1 A; 3H4B A; 4ECY A; 4RQ6 A; 5AIA A; 2QAR A; 2CPR A; 3VC8 A; 3RRG A; 3CYM A; 4R64 A; 1K5O A; 4I2C A; 1F44 A; 1S8O A; 2PMZ C; 4M04 A; 2W55 A; 4NLN A; 1L7O A; 2DGZ A; 5L1M A; 4DEZ A; 8ICC A; 1YT3 A; 4TUP A; 5KT6 A; 7ICF A; 4QZI A; 4BJQ A; 4EEY A; 1N56 A; 7ICI A; 5DKW A; 3GIL A; 1ZQV A; 2JEI A; 4ICA A; 4DL6 A; 2E8N A; 8ICN A; 3O0F A; 2M9N A; 3NTU A; 2OXO A; 2ZXH A; 5AKL A; 2LMR A; 3D2S A; 2Y1I A; 2GH1 A; 7ICK A; 1ZQX A; 5J0W A; 4J9R A; 1ZD2 P; 5CEH A; 3SEI A; 5JRT A; 5KFQ A; 2BCR A; 1S0V A; 1CUK A; 1DXS A; 4C7Z A; 4C4R A; 4DOB A; 4O5C A; 2A1J B; 8ICY A; 3ISC A; 1Z1B A; 4J03 A; 2F76 X; 3PST A; 3WK8 A; 3WKD A; 2AQ4 A; 5J2C A; 3QYP A; 1KN5 A; 4F4Z A; 4CCH A; 3V7K A; 4UB2 A; 3BS5 B; 3SR6 A; 5DB8 A; 5EE0 A; 4M2Y A; 1M6Y A; 1ZD4 A; 1Z00 B; 2LBO A; 4OJO A; 5HMM A; 4F72 A; 2KHQ A; 2E8P A; 3PW7 A; 1RQL A; 3QUQ A; 1X6J A; 1TK8 A; 2C22 A; 4Z6C A; 2DQN B; 4DOA A; 5DB9 A; 4RT3 A; 4QZB A; 2PFQ A; 7ICT A; 7ICS A; 1SZP A; 2WAQ C; 5KFA A; 2PXI A; 4YD2 A; 1JMS A; 3Q8Q B; 8ICH A; 3MGI A; 2LYH A; 3QXG A; 2XO7 A; 1Z19 A; 2RRD A; 3H40 A; 3WK5 A; 3A0B U; 3IM1 A; 3OHB A; 4RUC A; 4RQN A; 5J2A A; 5KFV A; 3MGV A; 4OJP A; 9ICI A; 3KHR A; 2BDP A; 3SQI A; 3JPP A; 1NZB A; 2ZJ8 A; 4QW8 A; 5BOL A; 1OW5 A; 4KIT B; 2Q0Z X; 3OGU A; 4QNL A; 1T3N A; 3AQE A; 1KEJ A; 4B9U A; 2I5H A; 4P2H A; 1H38 A; 1NNL A; 4M0A A; 3N4M B; 5J2K A; 4JV0 A; 2ASJ A; 1SXE A; 5EE3 A; 2V9W A; 5D4B A; 4B9L A; 9ICX A; 2F3N A; 1BPE A; 5KT3 A; 4QWA A; 3OJS A; 9ICQ A; 7ICG A; 5EWE A; 9ICU A; 4UAV A; 1SKW A; 2DKX A; 3Q8K A; 4NLK A; 5AKG A; 3H7I A; 1KFD A; 3TAQ A; 1ZQY A; 4M9H A; 4NL9 A; 1BNP A; 1JIH A; 2HHW A; 3RRH A; 5AKX A; 3NRZ A; 2G5H B; 5EE1 A; 5CR0 A; 1BPD A; 3GQC A; 3VCB A; 2R8I A; 2KK0 A; 3FAH A; 4M47 A; 3T5K A; 3RR7 A; 3MGH A; 4KLE A; 1S0O A; 4QZ9 A; 3C2L A; 2ZUC A; 5DQG A; 1UT8 A; 4GXI A; 4ELU A; 3QZ8 A; 2JZB B; 3PY8 A; 3L5K A; 1K1Q A; 5J0P A; 4JB3 A; 4C8O A; 5KL8 B; 2RDJ A; 5IIO A; 4I2J A; 1ZQD A; 3KHG A; 5KG3 A; 4ED8 A; 1RYS A; 3Q8R B; 3M6K A; 2C2E A; 4NJ8 A; 1QCK A; 4F2R A; 4WJ3 B; 3V6J A; 4ELT A; 2KHV A; 3GIJ A; 2F1J A; 1JX4 A; 1ARO P; 2BCQ A; 2KV2 A; 1S5L U; 4KLU A; 9ICW A; 2KEY A; 3RJF A; 4K4H A; 4I2E A; 2W7P A; 2DKZ A; 2RHF A; 2KVC A; 2HDO A; 2HSZ A; 5DDY A; 2F2A B; 4HAI A; 4EBD A; 2WTF A; 2KKV A; 4Q8F A; 2C28 A; 3ORY A; 4O3M A; 1FFV A; 5DB7 A; 2W9A A; 1BPX A; 4Y2Q A; 5ALH A; 5AM0 A; 4P4M A; 2DPI A; 3ZI4 A; 2XIC A; 1X2I A; 1Q3U A; 2BHN A; 2JRZ A; 3KHL A; 4U7C A; 5J2J A; 7ICQ A; 3QU5 A; 1L7N A; 1S0M A; 2ZTC A; 4QWC A; 5BPC A; 7ICU A; 5KFP A; 5AKZ A; 2EZY A; 3Q8M A; 3FDS A; 2W7O A; 4O3N A; 1ZQG A; 2WFA A; 3MFI A; 1QQ7 A; 1HIW A; 3JPO A; 2KIV A; 4RQ8 A; 4TUS A; 3HKZ C; 3NVV A; 4EBE A; 4F71 A; 3M6Z A; 1JRO A; 2K8B B; 1L8L A; 3GZF A; 3OJU A; 4JV1 A; 2KFN A; 3F53 A; 4KLJ A; 4JWN A; 1KFS A; 4IQW A; 4DCC A; 5KG2 A; 2MUT A; 2VA8 A; 3LWM A; 3UQ2 A; 4MFC A; 3ONN A; 1ZQO A; 1FIQ A; 2IOF K; 3TFS A; 1ZQC A; 4DLE A; 3DV9 A; 2JR5 A; 2YML A; 3UXP A; 3V72 A; 4Y2T A; 4QZ8 A; 2ZIX A; 1FFU A; 3UXO A; 3AM9 A; 2ZIW B; 4I27 A; 5J8Y C; 1MQ2 A; 4F4K A; 9ICE A; 3TAD A; 1RXV A; 1ZD5 A; 2ZXI A; 3HT3 A; 5HP4 A; 4O3S A; 3M9M B; 3FC4 A; 2WF6 A; 4M6W B; 5KFZ A; 4B9T A; 3PSF A; 1B43 A; 5AKE A; 3HWT A; 4QZH A; 4DFP A; 4PHA A; 2XCP A; 4J9N A; 3M1Y A; 4NM1 A; 9ICP A; 3QU2 A; 1NZP A; 5DDM A; 4IQU A; 2KKP A; 4B9M A; 1KL9 A; 1SL1 A; 3CW2 C; 2YTU A; 2IBK A; 1NJZ A; 4ECR A; 3NUQ A; 4JV2 A; 4RQM A; 4ED3 A; 4ECU A; 4EX6 A; 1PZN A; 1ZXI A; 3PX4 A; 1X40 A; 3NVZ A; 1ZET A; 4NLB A; 8ICG A; 2UVR A; 3PML A; 5KTQ A; 3IDW A; 3UMG A; 4J9Q A; 2I1Q A; 4ZOH C; 4QZA A; 3Q8P B; 3ISD A; 4KLM A; 1DK3 A; 2PI4 A; 3K4G A; 5J2F A; 3KHH A; 9ICV A; 3RB3 A; 4I2G A; 4KMO B; 5TZV A; 4IRD A; 5HNK A; 1COK A; 3FYH A; 3AN1 A; 3WKB A; 2LPE A; 2DPJ A; 3SEN A; 4CF5 A; 4C8L A; 5ALP A; 1UCV A; 4ECS A; 4PGY A; 3PR4 A; 4GFJ A; 3MR6 A; 5KG1 A; 3SAH A; 4A8E A; 2OYY A; 4F50 A; 2PFP A; 4BXO B; 4US8 A; 4O3Q A; 3BQ1 A; 4IQV A; 4UB3 A; 2G07 A; 4EEK A; 2HHS A; 5ALQ A; 1YZ7 A; 5IIL A; 2VA2 A; 2F8K A; 2FPK A; 1XSP A; 2GOL A; 1X9M A; 2CN1 A; 3F2C A; 1PVP A; 1MA7 A; 3UPQ A; 2F1I A; 1EXN A; 8ICR A; 3S6J A; 3KZX A; 5KAF U; 2GLE A; 4P4P A; 9ICG A; 3GIK A; 4MHV A; 1SKS A; 1NK9 A; 5HHI A; 4RU9 A; 3QE9 Y; 2KZZ A; 5AK6 A; 1KFT A; 4LVS A; 4PGX A; 1XS9 D; 4Q43 A; 5KG4 A; 4RQ4 A; 2F1H A; 4RPZ A; 1S10 A; 4ED0 A; 1CRX A; 3KTQ A; 2QLT A; 2IHN A; 3IHQ B; 2HVI A; 3Q8S B; 2YMM A; 5J2E A; 4IR9 A; 4I2A A; 3BQ2 A; 2QB0 B; 2ZUB A; 3G6Y A; 4ECW A; 2ZTD A; 3PSI A; 1RYR A; 3GV5 B; 3PNC A; 1X42 A; 5KFF A; 2C2D A; 3CRX A; 4USA A; 3T5H A; 5F3X B; 2BDU A; 3OSP A; 1N63 A; 1NK0 A; 2UVW A; 2NRV A; 4P4O A; 4XA5 A; 1U4B A; 2WB1 C; 7ICH A; 1HUZ A; 2ES6 A; 1V97 A; 3AU6 A; 3ZDD A; 4R8U A; 4UBC A; 4QWD A; 4YD1 A; 1DOQ A; 1ZJN A; 3ETR A; 2KVS A; 4LZG A; 1NJY A; 1LV5 A; 1ZQL A; 2DL0 A; 2XCA A; 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