The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
98
|
structure length |
98
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Chain Sequence |
GSSGSSGEKAEDCWELQISPELLAHGRQKILDLLNEGSARDLRSLQRIGPKKAQLIVGWRELHGPFSQVEDLERVEGITGKQMESFLKANILGLAAGQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-070, a C-terminal domain of kinesin-like protein KIF22 from human cDNA
rcsb |
| molecule keywords |
Kinesin-like protein KIF22
|
| molecule tags |
Transport protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
20
|
| structure length |
98
|
| sequence length |
98
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-02-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF12836 | HHH_3 | Helix-hairpin-helix motif |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | AF1531-like domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2I5H A; 2EDU A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1MC8 A; 2F1J A; 3KZX A; 1L3V A; 1ZQL A; 1U49 A; 2HHX A; 5C5J A; 4RT2 A; 3SEI A; 2G5I B; 4DWI A; 1L7O A; 5J2K A; 5J2B A; 4ELU A; 3KHG A; 2HHW A; 5ALS A; 3AQE A; 5D46 A; 5AIC A; 2HSZ A; 2VIX A; 4YQW A; 5AI6 A; 3D2N A; 1WYG A; 5DG9 A; 2K8A A; 5K4L A; 4DQP A; 5HHI A; 4B9V A; 2W54 A; 4YP3 A; 2IMW P; 2HHT A; 4O5C A; 7ICG A; 3TAD C; 1NK9 A; 3D6J A; 2XO7 A; 4OO1 J; 2IOF A; 3K1R B; 2BGW A; 2OCE A; 1A6S A; 1URJ A; 2OXO A; 3MDA A; 4M9H A; 5CR0 A; 4O3M A; 4MFF A; 5ALP A; 2CN1 A; 3N7S C; 3PW7 A; 1X9M A; 1SV0 A; 2XGP A; 2C2E A; 5KFT A; 4J9N A; 3RH5 A; 4M9G A; 4K4H A; 5HNK A; 1GO3 F; 4GXK A; 5KFG A; 1J2M A; 2HHU A; 3T5K A; 4DSF A; 2JV3 A; 4EBE A; 2CRX A; 3RJE A; 2KKP A; 1JAL A; 3UXN A; 1RXW A; 1J97 A; 1O03 A; 4J9L A; 3ZDD A; 4DSI A; 3H8M A; 5DBA A; 3C21 A; 1ZQM A; 1TAQ A; 3IDW A; 4IRD A; 4CGZ A; 1X2I A; 5JU5 A; 3RH6 A; 4QWE A; 3T5J A; 4A8E A; 4XQ8 A; 4I2J A; 1CUK A; 5DDY A; 2JH7 A; 2BQU A; 4ZOH C; 4RUA A; 5IIM A; 2AH5 A; 1NKC A; 4C8N A; 4U6P A; 1XSL A; 2BDP A; 4Y2R A; 2F8K A; 2HOI A; 5AKE A; 2QKQ A; 1Z3E B; 5KG2 A; 5KTQ A; 5E79 U; 2RDI A; 5AIA A; 4RNM A; 3SZ2 A; 3BS5 B; 4Z6F A; 4PL2 A; 1N56 A; 1S5L U; 4M9J A; 4RNO A; 1T4G A; 2EQY A; 4FO6 A; 4QJF B; 7ICV A; 2HW3 A; 9ICU A; 2WFA A; 2LI6 A; 4ECS A; 4DSE A; 1OUQ A; 1VJ5 A; 4RUC A; 3AQF A; 3IM1 A; 4UW9 A; 3HJE A; 1IIP A; 2BZF A; 4DLE A; 1XC9 A; 1U48 A; 2YX8 A; 1CI4 A; 3KD3 A; 3NVV A; 1WCN A; 1SB3 C; 2LMR A; 1ZQC A; 1RG6 A; 1AQ6 A; 3HKZ F; 4ECU A; 3KHR A; 2G0A A; 7ICN A; 9ICV A; 4I27 A; 2XIC A; 5G5H A; 3EZ5 A; 5KL8 B; 4BUG A; 2W9B B; 3EPI A; 2XID A; 2XCP A; 2I1Q A; 5EE1 A; 4C80 A; 4KLS A; 4QZF A; 1RYS A; 1SKS A; 2K8C B; 5J2C A; 3SV4 A; 4EEY A; 5AI5 A; 1COK A; 2RQ5 A; 3LK9 A; 1UA0 A; 4IR1 A; 3NUQ A; 4UAR A; 5J0Q A; 4CF5 A; 3H0M B; 4KMU A; 5D4B A; 3H0L B; 4PJ0 U; 5JRT A; 2QAR A; 1DGJ A; 2EAO A; 2I6X A; 2W3S A; 8ICN A; 1NJW A; 1QSS A; 8ICI A; 4C0Z A; 2YY6 A; 4IC9 A; 2KVS A; 1JI7 A; 3QYP A; 1WWU A; 1TVA A; 3SV3 A; 4OJ6 A; 3OHA A; 3WK7 A; 3RAX A; 2OWO A; 3SAH A; 4P4M A; 2W7O A; 9ICL A; 4M47 A; 5AKZ A; 3WK6 A; 4J9S A; 2ZUB A; 5KFH A; 3MBY A; 1SWV A; 2ES6 A; 1A0P A; 4BX9 C; 4B9L A; 2EH9 A; 5AKJ A; 3CRX A; 2A1A A; 5J2H A; 3PSP A; 2WF8 A; 2XI9 A; 2HBK A; 2ZTC A; 2YML A; 2KFZ A; 2EDU A; 2GH1 A; 9ICJ A; 1L6N A; 4DL5 A; 2KIV A; 2E1E A; 4TQR A; 4KLJ A; 4B9M A; 4EYI B; 5J0R A; 4TUR A; 3OJS A; 1DRG A; 1JRO A; 3AU6 A; 2RLT A; 5KG4 A; 2E8M A; 3J81 j; 4KX3 A; 5AM2 A; 2ZJA A; 1V97 A; 4DFJ A; 1KFT A; 4GXI A; 5KT2 A; 9ICR A; 1WG8 A; 1X6I A; 4OCZ A; 5ALU A; 4PHA A; 3GII A; 3SMV A; 4EBC A; 4RU9 A; 4IQV A; 4IR9 A; 5ALE A; 4ED3 A; 3K75 D; 1X42 A; 3GV7 B; 2F1H A; 5JTI A; 3TFR A; 4MF2 A; 5KFL A; 4YN4 A; 4TUS A; 3WK9 A; 9ICX A; 3PMN A; 2NRX A; 2F3N A; 4UBB A; 5HR7 A; 5KFN A; 5J2J A; 9ICP A; 2EZX A; 4KLE A; 2H3Z A; 7ICS A; 2Y0S F; 4MHV A; 4O0I A; 1NK4 A; 1S0O A; 3VC8 A; 1TK8 A; 3WKD A; 3WK8 A; 3LVW A; 4CRX A; 2KD1 A; 1DK2 A; 3TI0 A; 5BPC A; 2KZ3 A; 2DKZ A; 2WF5 A; 4I2D A; 4I2B A; 4DL3 A; 1L7N A; 3AEV A; 1K1Q A; 5EOZ A; 5KFK A; 4RQ0 A; 3PO5 A; 3VCB A; 5F9L A; 1TE2 A; 3NAS A; 5AKG A; 2LM4 A; 1BPY A; 2PMZ F; 1XO1 A; 3CNH A; 2W8L A; 4Z6C A; 2LYH A; 4NLC A; 1O08 A; 5ALK A; 1L3T A; 3N28 A; 3EYZ A; 2ATL A; 4NL9 A; 5KFM A; 1C7Y A; 2HI0 A; 1HUZ A; 1KBU A; 2GOL A; 4F71 A; 5L1I A; 4RPZ A; 4ECY A; 3PW4 A; 3C2K A; 1ZQT A; 1SXD A; 5AI9 A; 4Q43 A; 2JR5 A; 3QEA Z; 1XS9 D; 5TZV A; 2MUT A; 3MFI A; 2MRL A; 2ZJ5 A; 4UAY A; 3NTU A; 2ZIU B; 2L5Y A; 5AI4 A; 3TQ1 A; 4P2H A; 5ALO A; 4HAI A; 4RQ7 A; 4US9 A; 5DB6 A; 1ZD4 A; 3PW2 A; 2BQR A; 3UMB A; 2AQ0 A; 4OJ5 A; 4C4T A; 4NLB A; 2LKY A; 1KW4 A; 3BQ2 A; 9ICH A; 3QXG A; 3THV A; 4QZD A; 3AN1 A; 3AU2 A; 9ICB A; 3MAB A; 2DL0 A; 3RJH A; 5KFC A; 3ZD8 A; 5J0S A; 4NY8 A; 1QSL A; 4R64 A; 5J2E A; 8ICZ A; 2NV3 A; 2VA3 A; 5EWG A; 2I5H A; 2FDR A; 4XUS A; 3PW0 A; 5H2F U; 2R18 A; 5G5G A; 5CB1 A; 5ALQ A; 2WAQ C; 1X9S A; 1B4F A; 3T3F A; 9ICO A; 3SI8 A; 3RB3 A; 2NYV A; 4Y2U A; 3EW9 A; 2HBM A; 5JUM A; 5J2F A; 4QNL A; 1F5S A; 3QUT A; 4Z6E A; 3QU9 A; 3LWL A; 3Q8K A; 1ZQS A; 4M6W A; 5ALJ A; 4Z6D A; 5KG6 A; 2Y1I A; 4K4I A; 4GFJ A; 3OHB A; 3A0B U; 3JPS A; 1UT5 A; 4DL2 A; 4C8L A; 3KTQ A; 4DQR A; 4JV1 A; 1B43 A; 5HHH A; 4R66 A; 3PST A; 1Q3V A; 2I9G A; 3WK4 A; 1U4B A; 9ICF A; 3ISD A; 4F72 A; 2K8B B; 3RAQ A; 2JEF A; 4ECX A; 2XCA A; 2FLN A; 4KLG A; 4Q8E A; 1PK1 B; 5GTI U; 1KLN A; 1IV8 A; 4JMU A; 4DFK A; 4LJX A; 4J9R A; 3V7K A; 7ICE A; 2A19 A; 8ICM A; 5KFE A; 4ED2 A; 4YR0 A; 8ICY A; 2J6T A; 3B0Y A; 3HPO A; 1XNS A; 1QLN A; 8ICQ A; 1PVP A; 1N61 A; 5KFV A; 5AM1 A; 4M04 A; 4QZH A; 3BQ7 A; 2KIC A; 3UQ2 A; 1ED1 A; 3QUB A; 3RF9 A; 2ASJ A; 7ICH A; 1BPB A; 1OW5 A; 2M9N A; 7ICJ A; 3UMG A; 4NXZ A; 4Q44 A; 1HJP A; 3Q8P B; 1ZJM A; 2KJ9 A; 3MGI A; 1D9D A; 1L3S A; 4I29 A; 1DXS A; 4EEN A; 1RDF A; 5HMM A; 4FS2 A; 2DPI A; 4RQ4 A; 1HEK A; 2FLP A; 2K4I A; 2KEY A; 2G07 A; 4F5P A; 2KNJ A; 4Y2Y A; 3SYZ A; 4QZA A; 2F8L A; 1LV5 A; 2FPL A; 4FS1 A; 3H40 A; 2RP5 A; 1TV9 A; 2HDO A; 1TK5 A; 2ZIX B; 4JV2 A; 4QZC A; 1X40 A; 1L7P A; 1ZD5 A; 3AM9 A; 3IG8 A; 2D8C A; 3N7P D; 3OJU A; 2KHQ A; 3BDP A; 2QB1 A; 2A1J B; 3A0H U; 4YD2 A; 5HML A; 4OJO A; 2B0C A; 3C1Y A; 4M6W B; 2BCR A; 3ORY A; 4UB2 A; 2W9B A; 4F4X A; 4ECR A; 5KG5 A; 3MR3 A; 1PK3 A; 2PFN A; 2K4P A; 3QUC A; 2NRW A; 8ICH A; 3F2B A; 3DDH A; 5F9N A; 2D6F C; 1Q8K A; 4I28 A; 4TQS A; 3OPX A; 3PSF A; 3PX0 A; 4ECV A; 3N97 B; 3TKA A; 4PGX A; 4YMN A; 1S97 A; 1SKW A; 1RXV A; 5ALL A; 8ICE A; 2E8P A; 3GIJ A; 4O3O A; 3CP8 A; 4UAW A; 3JPO A; 4F5N A; 1ZQV A; 1M6Y A; 2O6K A; 4Y2X A; 2JGA A; 1N60 A; 3FDS A; 1B0X A; 2KK0 A; 1ZQF A; 3WKE A; 2KN7 A; 5CRX A; 5J2I A; 2R8H A; 3K4G A; 5KG7 A; 5DQI A; 2HHV A; 2JZB B; 5J0X A; 3F53 A; 3C29 A; 1Z1B A; 3M7D A; 1SIJ A; 4DOA A; 1NKB A; 3PR4 A; 3LWM A; 5ALM A; 3F5E A; 2AGP A; 4Y2S A; 2R8I A; 5KFR A; 5IIK A; 1CRX A; 2JRZ A; 3T79 A; 2GWS A; 4USA A; 2Y9T A; 4KLH A; 4F2S A; 1UA1 A; 5CEH A; 3NS1 A; 4NLK A; 2PFP A; 1OXJ A; 4M9N A; 4OJP A; 4IQT A; 5DBB A; 2B6G A; 3OGU A; 2NRT A; 4LVS A; 1UHU A; 8ICV A; 1TAM A; 2BHN A; 2ZUC A; 4J9M A; 1X9W A; 1QQ5 A; 1S10 A; 4ED6 A; 1S76 D; 1NJY A; 4K4G A; 4UB6 U; 1RYU A; 4MEY A; 2R8K A; 3GFK B; 1HUO A; 3IP4 B; 1NK6 A; 1SV4 A; 1KDH A; 4YD1 A; 9ICE A; 3PX4 A; 4GIB A; 4NL9 C; 2H5X A; 4XA5 A; 1NZP A; 2B21 A; 3EPG A; 1V85 A; 4OJL A; 2ESE A; 4BWM A; 3QZ7 A; 2OH2 A; 4O3S A; 2W9C B; 5EE9 A; 2F77 X; 3N7R C; 2VAN A; 4UAV A; 5ALI A; 3ZDA A; 4EX7 A; 1ZQD A; 1BPD A; 5KG3 A; 5T14 A; 5BOM A; 2HOF A; 2GO7 A; 3HKZ C; 3JPQ A; 2RDJ A; 1YZ6 A; 2ISO A; 3GIL A; 4DSK A; 3M9N B; 5KFQ A; 1KKX A; 1U45 A; 2LM1 A; 4PH5 A; 4RPX A; 1SKR A; 4KLL A; 2EAM A; 3C5G A; 5KFJ A; 3LYS A; 5J0W A; 4BDP A; 5EE0 A; 1TAU A; 2D3D A; 2DKX A; 3S6J A; 1KQQ A; 5L9X A; 2F76 X; 1N2X A; 5KL1 B; 3PZP A; 1L5U A; 5ALY A; 3UPQ A; 5DBC A; 3H8W A; 1ARO P; 3WKC A; 1MQ2 A; 1ZQR A; 1PZN A; 4YR3 A; 3QU2 A; 5DDM A; 4RNN A; 1XWL A; 1QCK A; 5AKI A; 1ZQY A; 2BCU A; 4KLQ A; 2ZXH A; 3H8S A; 4JK1 A; 1MQ3 A; 4KN7 A; 5KFA A; 5CWR A; 4YVZ A; 8ICG A; 4DS5 A; 2NO4 A; 2VA8 A; 4G9B A; 4F50 A; 3NVY A; 2ZIU A; 5KFO A; 5KFW A; 5DB9 A; 2HVI A; 5KT4 A; 1NK5 A; 4UBC A; 1LVH A; 2XGQ A; 4UB4 A; 4DL4 A; 3PML A; 4DSJ A; 4Y2V A; 5HP4 A; 2IHM A; 1XU4 A; 2K60 A; 1KFS A; 1RM6 C; 3HWT A; 4QZ9 A; 1Q46 A; 2UVR A; 2BPG A; 4P0P B; 3WK5 A; 2PI5 A; 1NZB A; 1NJX A; 4FBT A; 9ICA A; 3CW2 C; 3QU4 A; 5J29 A; 4U7C A; 1RQN A; 1ZQK A; 2OHF A; 1CEZ A; 5EE3 A; 1D8L A; 3GV8 B; 3GU3 A; 3MGH A; 1XSP A; 4MFC A; 5DB7 A; 2W9M A; 1ZQU A; 4Q45 A; 4XRH A; 2JHD A; 4YMO A; 4RQ2 A; 2ZIV B; 4I2E A; 3G6V A; 4FZN A; 4C4R A; 3KHH A; 3RBD A; 3AL0 B; 1KFD A; 4RQ8 A; 1JXE A; 5ALN A; 5ALF A; 5CA7 A; 2DPJ A; 1RZT A; 7ICM A; 5KG1 A; 1Z19 A; 2R8G A; 5KT3 A; 5J2G A; 3F2C A; 4Y2Q A; 5KFB A; 1SL0 A; 3IRU A; 3ISC A; 3V6H A; 3UM9 A; 2AGO A; 3ZDC A; 8ICS A; 2KZZ A; 7ICF A; 3G6X A; 3WU2 U; 3M8S A; 2LHT A; 1MA7 A; 5AKH A; 2OM6 A; 4P0Q A; 2W11 A; 2BPF A; 2PI4 A; 4MEX A; 1PK1 A; 1ZOL A; 1NKE A; 2BCS A; 5KFU A; 5AK5 A; 7ICI A; 8ICA A; 4O5K A; 2G08 A; 4TUP A; 2PFQ A; 1T8E A; 1N48 A; 4KLO A; 4CF4 A; 2YN4 A; 4ECQ A; 4ELV A; 4AYB C; 1NK7 A; 2AJQ A; 1C20 A; 2EZZ A; 3L4P A; 4JWN A; 1ZD3 A; 4YMM A; 2VKQ A; 4ED7 A; 4PHE A; 1N5X A; 3BJY A; 5AKX A; 4O9M A; 4OD0 A; 1JX4 A; 3L3F X; 4MF8 A; 5AI8 A; 4C7Y A; 1IG6 A; 5F3X B; 2W7P A; 1Q3U A; 2EZY A; 3C5F A; 1MN8 A; 5DKW A; 2ISP A; 3ED5 A; 3FM9 A; 3H7I A; 7ICQ A; 3QNM A; 4QW8 A; 1TKD A; 3R9K A; 1U47 A; 2QB0 B; 4QW9 A; 1T7P A; 1YZ7 A; 1PUZ A; 2BKE A; 1KN5 A; 4UB5 A; 4UAT A; 4HYK A; 4YG2 A; 4FFD A; 5AKK A; 9ICG A; 4FZL A; 2R8J A; 1JMS A; 2JEG A; 2VA2 A; 4KTQ A; 5ALD A; 2YB1 A; 9ICT A; 2EAP A; 5KG0 A; 3QEB Z; 4AP9 A; 2UVV A; 4PPX A; 4DEZ A; 1Z1V A; 2ZIX A; 3ZDE A; 2WAQ F; 2HVH A; 2GLE A; 4I2A A; 2V4Q A; 4PL1 A; 2LBO A; 4P4O A; 2E8O A; 1UPH A; 1COO A; 4UAS A; 1HIW A; 2YQE A; 3IV6 A; 1L8O A; 2A1J A; 3ZD9 A; 1KL9 A; 3TFS A; 2KE7 A; 5KFP A; 3HW8 A; 2E5S A; 3C1Z A; 3PSI A; 2FMQ A; 4KIT B; 3WKB A; 1ZRM A; 3C2L A; 3SEN A; 2ASL A; 4KLI A; 9ICW A; 3NRZ A; 5ALR A; 3M9O B; 5ALG A; 3BZK A; 2FE9 A; 5AM5 A; 3GV5 B; 5AIB A; 1P7D A; 5J0T A; 4F92 B; 3C2M A; 4QIW C; 1A77 A; 1IM4 A; 1T3N A; 4ECT A; 4C8O A; 1S0N A; 4P0Q B; 5KFX A; 4PHP A; 2KVC A; 2ZTE A; 3V7J A; 4PHD A; 1ZQP A; 2WTF A; 2CXY A; 1L7M A; 4B6J A; 2UVW A; 2FPM A; 4ACO A; 2IOF K; 5KFY A; 3MR5 A; 1K1S A; 2W43 A; 4YCX A; 3E58 A; 1DGS A; 2FMP A; 4IS7 A; 1ZRN A; 5J2D A; 2PFO A; 4IRK A; 3RJG A; 2W3R A; 4WJ3 B; 2JZB A; 4CNQ A; 1ZET A; 4KLF A; 3F2D A; 1BPE A; 4KN4 A; 3UXO A; 4B9S A; 2YMM A; 8ICO A; 1Z4O A; 2IA6 A; 8ICR A; 4J03 A; 4US8 A; 3QUQ A; 4RQ3 A; 3RR7 A; 2JXJ A; 5AKY A; 3RTV A; 1BNP A; 1ZXI A; 3ONN A; 1WWV A; 4RT3 A; 3SAF A; 2KP7 A; 1V38 A; 5L1M A; 3RB4 A; 1JRP A; 4R65 A; 3G6Y A; 5ALV A; 4J9K A; 2WB1 C; 4F8R A; 1UQV A; 4DF8 A; 4F93 B; 1NJZ A; 2UVU A; 4IQU A; 1ZQJ A; 2P6R A; 3RJJ A; 9ICN A; 2AXT U; 1A76 A; 4O3Q A; 2JEI A; 4R8U B; 2Q0Z X; 3PW5 A; 3MR6 A; 2LYA A; 4QWD A; 4F2R A; 4YR2 A; 4E0D A; 5A0L A; 2DWQ A; 3HT3 A; 3WKA A; 2P6U A; 2CPR A; 1UCV A; 5J8Y C; 2FI1 A; 4F5Q A; 2FPK A; 1QQ7 A; 5AK3 A; 2W04 A; 4QZ8 A; 8ICP A; 1RYR A; 2XY5 A; 1X9X A; 4EYH B; 1SGG A; 3RJF A; 3E2E A; 5J2A A; 2JEJ A; 4B9T A; 2YB4 A; 7ICP A; 2ZUD A; 4QWB A; 1ZQE A; 2DF4 B; 2KZM A; 3RFA A; 2ZJ8 A; 3GIM A; 3MR2 A; 3UMC A; 2IOH A; 1BPZ A; 3B0X A; 3I1Y A; 2HHQ A; 5J0U A; 4IQW A; 4GXJ A; 8ICB A; 2C2R A; 3FYH A; 2BCQ A; 4NM1 A; 2IHN A; 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