The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
98
|
structure length |
98
|
Chain Sequence |
GSSGSSGEKAEDCWELQISPELLAHGRQKILDLLNEGSARDLRSLQRIGPKKAQLIVGWRELHGPFSQVEDLERVEGITGKQMESFLKANILGLAAGQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-070, a C-terminal domain of kinesin-like protein KIF22 from human cDNA
rcsb |
| molecule keywords |
Kinesin-like protein KIF22
|
| molecule tags |
Transport protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
20
|
| structure length |
98
|
| sequence length |
98
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-02-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF12836 | HHH_3 | Helix-hairpin-helix motif |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | AF1531-like domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2I5H A; 2EDU A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3H8S A; 2EQY A; 2ZJA A; 4GXJ A; 2ES6 A; 3MFI A; 2XY5 A; 2BDP A; 4KLI A; 4BX9 C; 2AGP A; 1ED1 A; 1S76 D; 1TE2 A; 3ORY A; 5AM5 A; 3N97 B; 1ARO P; 1SV4 A; 4F5N A; 3C1Y A; 1FIQ A; 2F1H A; 2W55 A; 8ICH A; 4F93 B; 4UAZ A; 3QU2 A; 2LMR A; 4PZO A; 4U7C A; 2ZTC A; 2RDJ A; 3PSP A; 2F77 X; 2ZJ8 A; 1ZRM A; 3RF9 A; 1ZD4 A; 4ECR A; 2FPL A; 1T4G A; 3KZX A; 4M6W A; 4DQR A; 5L9X A; 3GIK A; 2C2D A; 3RJK A; 5AIA A; 3RRG A; 1WCN A; 2I9G A; 4Y2R A; 2E8M A; 1Q46 A; 2QLT A; 8ICG A; 2WB1 C; 1JIH A; 4B9V A; 4PGY A; 3TAC B; 3GII A; 4EEN A; 1NKC A; 4M47 A; 4F4X A; 2NRW A; 4OJO A; 8ICW A; 4IQU A; 3E0F A; 4O3R A; 5AIC A; 5G5H A; 1Z1V A; 2IMW P; 4FBT A; 2RRD A; 3GIL A; 1NK0 A; 4YCX A; 3RBE A; 2F44 A; 1ZXI A; 3EWA A; 2HBJ A; 3ED5 A; 4EZ6 A; 5AI6 A; 3LVV A; 5DB8 A; 1WYG A; 3PO5 A; 2IOF K; 1T3Q A; 3C1Z A; 1V38 A; 2LBO A; 4I2I A; 4GFJ A; 5DKW A; 2IOH A; 5ALS A; 2W7P A; 1BGX T; 3V6J A; 4KLL A; 4UB1 A; 4AYB F; 2LI6 A; 2E8P A; 3QEB Z; 1ZQV A; 2VA2 A; 3HW8 A; 1K1S A; 4RQ2 A; 1WWV A; 4C0Z A; 2H3I A; 1D8Y A; 2YX8 A; 3DEE A; 1JMS A; 5J0X A; 3PMN A; 3MGI A; 2GO7 A; 2PFQ A; 4I2B A; 4Q43 A; 4YMM A; 4JWN A; 4M6W B; 1JXE A; 1ZQA A; 3ZDA A; 3C5F A; 3UQ0 A; 2KTQ A; 5AKX A; 4EBD A; 4O3S A; 3BQT A; 2KZ3 A; 2EAM A; 5ALH A; 2MUT A; 3MDC A; 4ED2 A; 9ICV A; 1RYR A; 3CRX A; 5ALD A; 2HBL A; 2QB1 A; 2VJ4 A; 1JN3 A; 1AQ6 A; 3M7D A; 1DK2 A; 4RUA A; 3WK5 A; 5B66 U; 1T94 A; 9ICC A; 7ICR A; 2LKY A; 2Y9T A; 5L1J A; 3V6H A; 2XGQ A; 5E79 U; 5IIJ A; 1BPB A; 4KIT B; 3NUQ A; 1DGJ A; 3TAR A; 3R9K A; 4PHA A; 5DLF A; 4QZC A; 1UHU A; 4O3N A; 1ZQD A; 5TZV A; 5L1I A; 5DG8 A; 2XGP A; 4M9L A; 1UA1 A; 4FZM A; 1COK A; 4ECS A; 3D2N A; 4F4Z A; 1SZH A; 4Y2V A; 3M9M B; 5BPC A; 4Q44 A; 3RAQ A; 8ICC A; 4USA A; 4KLM A; 3Q8M A; 2W3R A; 1YT3 A; 2PKE A; 5F9L A; 4DSK A; 4F4Y A; 3PW0 A; 1U48 A; 1N62 A; 2CN1 A; 5HP4 A; 2ISO A; 4YMN A; 5AK3 A; 3RJJ A; 4BJQ A; 1N63 A; 3JPS A; 4Z6C A; 1JRO A; 5J0P A; 1N61 A; 5HML A; 4RQ0 A; 1Y88 A; 4RQ7 A; 4UB6 U; 8ICN A; 3RB3 A; 4F5P A; 5AM4 A; 4F5Q A; 3RJE A; 1QSL A; 3UXO A; 1SKW A; 1BNP A; 1Z4N A; 5KT5 A; 4UB2 A; 1OW5 A; 2KFZ A; 1RYU A; 3RJG A; 2YB1 A; 1RG6 A; 2LYA A; 2QKQ A; 4Q45 A; 4ECQ A; 8ICS A; 4ZH4 A; 2XCP A; 5FP0 A; 4DWI A; 5AKL A; 2ZG6 A; 1XC9 A; 9ICO A; 3RR7 A; 2FJ6 A; 2DBY A; 1PVP A; 5ALO A; 3GDX A; 5D4B A; 2VA3 A; 1QLN A; 2G07 A; 1SKS A; 2P35 A; 3TAQ A; 4I2E A; 2FMP A; 1F0M A; 4UAR A; 2K4I A; 4DSL A; 5KT3 A; 2LM1 A; 2WAQ C; 4P4P A; 3Q8P B; 3GV5 B; 3E58 A; 2RP5 A; 3WKE A; 4KLU A; 5G5G A; 3H0R B; 1KEJ A; 5EWE A; 2JRZ A; 5AM1 A; 5KFG A; 2ASJ A; 2FDR A; 3C28 A; 2W04 A; 3RJH A; 4US8 A; 1NKB A; 4TUP A; 3TAN A; 2K4H A; 3PW2 A; 5DG7 A; 3NVY A; 9ICT A; 3L5K A; 5KFN A; 4MFF A; 4UB3 A; 2KIC A; 4QWB A; 1CEZ A; 2JZB A; 5DLG A; 1ZD3 A; 1U47 A; 3CYM A; 4DSJ A; 2PFN A; 4DO9 A; 4EYI B; 2KNJ A; 3B0X A; 2IOF A; 4K4G A; 2MRL A; 1KW4 A; 5H2F U; 3SV3 A; 4DFP A; 3CW2 C; 1XO0 A; 3SZ2 A; 1T7P A; 1B22 A; 1B0X A; 2W9C A; 2XCA A; 3TFS A; 2QB0 B; 4US9 A; 1XS9 D; 1Z3E B; 4ACO A; 4DOA A; 1PVQ A; 3V7K A; 3GQC A; 2DKX A; 4FS2 A; 3MR6 A; 4DLG A; 5III A; 4OJ5 A; 3D2Q A; 2KEY A; 1JAL A; 2BPG A; 5CA7 A; 5KL8 B; 3ZDE A; 2Q0Z X; 3QU5 A; 1ZQX A; 1RZT A; 4BGD A; 4RUC A; 4RT3 A; 2WF7 A; 2DPI A; 4RPX A; 4CDG A; 5EWF A; 4GIB A; 2NRV A; 8ICA A; 3FYH A; 3ICX A; 4KLF A; 3TI0 A; 2AQ4 A; 1N48 A; 1SV0 A; 4IRK A; 5J2F A; 4QW9 A; 4QZH A; 3EPI A; 4NLK A; 5J2C A; 5J0U A; 9ICS A; 1NJY A; 3GIJ A; 1IV8 A; 5AKG A; 1ZQT A; 1Q3U A; 2FE9 A; 2JZB B; 4UQG A; 3QUQ A; 4KLJ A; 3ZDB A; 4YR0 A; 3AMZ A; 2Y0S F; 3AQF A; 1SV0 C; 1ZRN A; 4KMO B; 3BQ1 A; 4R64 A; 4JK1 A; 3ZDC A; 9ICE A; 1DGS A; 1BPD A; 2IHN A; 2HBM A; 2HHS A; 3C2M A; 1HUZ A; 5KFP A; 2W9C B; 4RNO A; 3JPQ A; 4I2H A; 5ALZ A; 1JI7 A; 1X9S A; 1NZP A; 3QUC A; 1H38 A; 2R8J A; 5KAF U; 5J0Q A; 2HVH A; 1QQ6 A; 1WCL A; 3QNM A; 7ICV A; 2ODG A; 8ICO A; 4DEZ A; 3I76 A; 3ALR A; 4KLT A; 1LKY A; 1MQ3 A; 2H5X A; 1BPX A; 1VDV A; 2WF9 A; 2ZXI A; 3PW7 A; 3MGV A; 3F2C A; 5AK4 A; 2HBK A; 3SAG A; 3UMC A; 4PHE A; 4C7Z A; 2MU2 A; 1N2X A; 3FDS A; 2YQE A; 5KFC A; 4DS4 A; 3F5E A; 2JEF A; 4KLE A; 4R8U A; 1Z00 B; 5ALY A; 4O3M A; 3MGH A; 1XNS A; 4QIW F; 4R65 A; 3MFH A; 2B21 A; 4Y2U A; 2F76 X; 2ISP A; 1KQQ A; 2ZJ5 A; 4Y2S A; 5J0Y A; 4NLC A; 2QAR A; 4TQR A; 3OPX A; 4F71 A; 2JH1 A; 1CI4 A; 4QZG A; 2C2E A; 1UPH A; 5D46 A; 1S9F A; 4KLD A; 3SI8 A; 2KN7 A; 4Z6E A; 4F50 A; 1QQ7 A; 4PZN A; 4FS1 A; 7ICK A; 2KJ8 A; 3PR4 A; 1C7Y A; 1BPY A; 1S8O A; 4CE6 A; 2M0N A; 2W9A A; 4Y2J A; 1NOM A; 3NVZ A; 4BXO A; 4J9O A; 2HHV A; 3M6Z A; 1LKY B; 4NWI A; 4I27 A; 2G0A A; 4O5C A; 4QZI A; 1NK9 A; 1UQV A; 2FPK A; 2KVC A; 2NRZ A; 4NJ8 A; 5AK6 A; 2GWS A; 3WKC A; 2N1R A; 3C2L A; 2MA1 A; 2Z7J A; 4DFK A; 1L8L A; 4YMO A; 1T8E A; 2RLT A; 2W03 A; 4ELV A; 1XSN A; 4QJF B; 1V85 A; 2J6S A; 3QU9 A; 1DRG A; 9ICP A; 1MC8 A; 2LYB A; 3KHH A; 4ZOH C; 4IC9 A; 5KFT A; 3JPN A; 1KSP A; 4ECV A; 1S77 D; 4O5K A; 3G6X A; 1SL1 A; 4ED1 A; 5J29 A; 2YML A; 2HOI A; 4I2D A; 2DQN B; 4JUZ A; 1NK5 A; 4RT2 A; 2F8L A; 2BQ3 A; 1L7M A; 2WB1 F; 1U45 A; 1ZQY A; 9ICX A; 1X42 A; 3T5J A; 2GOL A; 4O5E A; 8ICR A; 4PGQ A; 5KG1 A; 1X6J A; 9ICL A; 2P6U A; 2W54 A; 1ZQ1 C; 4BXO B; 2CXY A; 9ICJ A; 2KG5 A; 5D49 A; 2XIC A; 2Q4T A; 2YMM A; 3QU4 A; 4C4R A; 4B6J A; 4G9B A; 2ZIW A; 1NK6 A; 3TFR A; 2F3N A; 1S0V A; 5ALT A; 4MF8 A; 1LVH A; 1TK0 A; 3MBY A; 3N4M B; 3KKA A; 1COO A; 5KFU A; 2YN4 A; 3WK6 A; 2Y1I A; 2K4E A; 1QSS A; 2BZF A; 3IP4 B; 4NXZ A; 4TUQ A; 3N7R C; 4I28 A; 1PUZ A; 3V6K A; 8ICK A; 2JEI A; 4M9G A; 2EAN A; 5C5J A; 7ICF A; 5ALF A; 3KKA C; 9ICU A; 5KG3 A; 4GC6 A; 2KZM A; 7ICP A; 4E0D A; 3TAD A; 4NM1 A; 2OM6 A; 1X9W A; 5J0R A; 2WF5 A; 4KMU A; 4YVZ A; 4DCC A; 4LVS A; 3THV A; 3PO4 A; 3HX0 A; 3BQ0 A; 2ZTE A; 4QWE A; 1SZP A; 4QZE A; 2I1Q A; 3KZI U; 1A76 A; 3MC1 A; 4B9N A; 4KN7 A; 4KX3 A; 1F5S A; 5J0W A; 1N5W A; 4JB3 A; 5KG5 A; 3IN5 A; 4DSF A; 4ED0 A; 1KFS A; 9ICH A; 2MSN A; 4J9M A; 4JV1 A; 4TQS A; 9ICB A; 5K4L A; 2PMZ C; 1DK3 A; 3PW5 A; 2HI0 A; 2KK0 A; 2ZIW B; 5EE1 A; 5KFR A; 4C8K A; 2BQU A; 2B6G A; 3ETL A; 1TAU A; 4Z6D A; 5KFD A; 1UCV A; 4Y2P A; 4YN4 A; 4U6P A; 1KRP A; 5JRT A; 2C22 A; 2KV2 A; 2KSO A; 4NL9 A; 1GO3 F; 2GLE A; 3C29 A; 9ICQ A; 2KVS A; 2K89 A; 2KD1 A; 4RQM A; 5KFI A; 4DFJ A; 1TK8 A; 4WJ3 B; 2E8O A; 3NVW A; 2NV3 A; 5ALM A; 2FI1 A; 3RJI A; 2XY7 A; 3AU2 A; 5KFW A; 4GC7 A; 4DL7 A; 3SQI A; 1UT8 A; 5AI4 A; 1ZQE A; 2OYY A; 3WK8 A; 4PH5 A; 4YQW A; 4C4S A; 2Y9U A; 3I28 A; 2XO7 A; 3ZD8 A; 5AKY A; 9ICA A; 1ZQG A; 1NK4 A; 1FFV A; 5IIM A; 2MAX A; 1ZQJ A; 4F5O A; 4M9N A; 2JV3 A; 3EYZ A; 1ZQO A; 3EZ5 A; 2K8B B; 5IIO A; 2K8A A; 2P66 A; 1O08 A; 3E2E A; 2IBK A; 5DBA A; 1HJP A; 1HEK A; 3AN1 A; 2RQ5 A; 4XA5 A; 3D2S A; 1URJ A; 9ICN A; 4CCH A; 1J2N A; 3H8J A; 1D9F A; 1ZD5 A; 4ED6 A; 3WK4 A; 3CP8 A; 2XID A; 5DG9 A; 3H0L B; 2PI4 A; 2WAQ F; 2HOQ A; 4M04 A; 5DQI A; 1Q3V A; 1M6Y A; 1D8B A; 3TKA A; 4YR3 A; 9ICK A; 3UMB A; 2D6F C; 3D6J A; 5KNI A; 3JPR A; 1IIP A; 5JUM A; 2ZIX A; 1EXN A; 3C2K A; 3WU2 U; 2I5H A; 3NTU A; 2WFA A; 5EE9 A; 3QXG A; 2MUT B; 5KFV A; 5L1K A; 1O03 A; 3NGD A; 2KIW A; 7ICM A; 5CR0 A; 2BHN A; 3UQ2 A; 2HHQ A; 5ALI A; 5IIN A; 4G3I A; 1B4F A; 2BCS A; 4YD2 A; 1SL2 A; 2UVR A; 2JEJ A; 3KHR A; 4FE3 A; 4HAI A; 1X9X A; 4B9U A; 1A77 A; 1KL9 A; 4I2A A; 2FLN A; 5AKE A; 2L5Y A; 3TQ1 A; 1TVA A; 2JH7 A; 4J9K A; 3LDA A; 1ZQF A; 4KLQ A; 4LZD A; 5GTH U; 3T5K A; 3EW9 A; 2KFN A; 8ICL A; 3JPO A; 4OO1 J; 3SR6 A; 3BQ7 A; 4DQP A; 3F53 A; 4DOC A; 3Q8Q B; 3M1Y A; 5HNK A; 8ICY A; 5KAI U; 2NO5 A; 4M2Y A; 3K75 D; 5J2A A; 7ICU A; 4IL6 U; 2YTU A; 4MEX A; 1DOQ A; 1HIW A; 4ED8 A; 4RQ5 A; 2W8K A; 3H4D A; 2ESE A; 4JV2 A; 4EZ9 A; 2ZIX B; 1FFU A; 5DBC A; 4AP9 A; 2XVT A; 4UAS A; 3PX0 A; 4IRD A; 1ECW A; 5A0L A; 5HHI A; 4IS7 A; 4P2H A; 1KTQ A; 3MDA A; 4K4I A; 3HWT A; 8ICV A; 3WK9 A; 1UT5 A; 7ICG A; 3RH5 A; 1V97 A; 4QWD A; 1L7N A; 4KLO A; 4F92 B; 2I6X A; 1MSW D; 1D8L A; 8ICX A; 1ZQW A; 2BCV A; 4UW9 A; 4RZR A; 9ICR A; 4ECZ A; 8ICJ A; 5KFS A; 4ELU A; 3UXN A; 1XWL A; 1ZQS A; 4C8N A; 1SKR A; 3PZP A; 4YXM A; 1ZQP A; 2H3F A; 2VAN A; 2OXO A; 5KFJ A; 4UAT A; 2JMG A; 3HJE A; 1L8O A; 2HHU A; 2HHW A; 2F1I A; 5J2H A; 3Q8L A; 8ICE A; 1JUD A; 5AKJ A; 5TIS U; 2YMP A; 2IHM A; 3H8W A; 2FMS A; 1A6S A; 2W8L A; 2JR5 A; 4B9L A; 4CNQ A; 2E1E A; 3LVW A; 1ZYQ A; 5ALL A; 4HYK A; 9ICF A; 4KLS A; 3QUT A; 4BWJ A; 5DDM A; 4QZF A; 5KG6 A; 5KL1 B; 1XO1 A; 4ICA A; 3C21 A; 3IV6 A; 5KFL A; 2G06 A; 1ZQM A; 4F2R A; 2H3V A; 4JV0 A; 5J2I A; 5T14 A; 2OCE A; 4RNM A; 1PZN A; 3QE9 Y; 5KFQ A; 5AI0 A; 2R18 A; 4UAU A; 3H4B A; 2AQ0 A; 2BQR A; 2KZZ A; 1MN8 A; 7ICQ A; 3RRH A; 2EH9 A; 5CB1 A; 1BNO A; 8ICB A; 3QU7 A; 1KDH A; 4EEY A; 1L6N A; 1RXW A; 4A8E A; 2BCU A; 5GTI U; 3AUO A; 1HUO A; 2V4R A; 1UA0 A; 4QZD A; 4RU9 A; 4FFD A; 5DDY A; 3N7S C; 4Y2Y A; 3T3F A; 5CJ7 A; 1CUK A; 4CRX A; 2W7O A; 2OH2 A; 3BQ2 A; 2AH5 A; 1XU4 A; 1OXJ A; 4ECU A; 2DWQ A; 1QQ5 A; 3U26 A; 4RPZ A; 1LB2 B; 5L1L A; 2H3Q A; 3ONN A; 3MR5 A; 3GZF A; 1TV9 A; 4RNN A; 1FO4 A; 2M9N A; 9ICW A; 3KD3 A; 1PK1 A; 4UAV A; 1QCK A; 2A19 A; 2DUY A; 2KHV A; 1L7P A; 4DSI A; 3OGU A; 3RB4 A; 3AU6 A; 2CPR A; 4PL2 A; 1K1Q A; 1KN5 A; 3OHB A; 2HSZ A; 5ALU A; 2WF8 A; 3KOO A; 1Q8K A; 4F4K A; 1BPE A; 2EDU A; 4M9H A; 1SIJ A; 4QW8 A; 3EPG A; 2DKZ A; 3BZC A; 5ALK A; 3RJF A; 4PHD A; 2H3Z A; 2UVU A; 2R8I A; 5BOM A; 4CF5 A; 5KFK A; 3MR2 A; 5KFO A; 4DL6 A; 3FAH A; 5ALP A; 3O0F A; 4KLG A; 4MFA A; 2AU0 A; 1D9D A; 4YR2 A; 1S0N A; 3LK9 A; 4B9T A; 1ZET A; 5AKK A; 5ALE A; 1SGG A; 5ALQ A; 2ASD A; 3F2B A; 3NRZ A; 4EX7 A; 3C23 A; 4P4O A; 4EBC A; 2K60 A; 7ICT A; 5DQH A; 5CEH A; 1V9P A; 3ISB A; 3G6Y A; 4RPY A; 2AHO B; 3IG5 A; 2NYV A; 3WK7 A; 4R8U B; 8ICI A; 3ZI4 A; 3F5A A; 3TAP A; 4RQN A; 2KKP A; 4ED7 A; 1RQN A; 1KLN A; 1SXE A; 2DPJ A; 2ZUC A; 2FLP A; 3DDH A; 5J2J A; 3NAS A; 3RB0 A; 1KKX A; 4C7Y A; 3PV8 A; 4C4T A; 3V72 A; 4NY8 A; 3M9N B; 2OWO A; 3M8S A; 2G5I B; 1ZQL A; 2GH1 A; 4J9N A; 2KHQ A; 2ALZ A; 3IG8 A; 2LHT A; 1SWV A; 2QAR B; 5CP2 A; 4Z6F A; 2BCQ A; 4YXJ A; 8ICQ A; 2KMD A; 3VCB A; 1WWU A; 4JMU A; 3I1Y A; 1IXR A; 3OTQ A; 8ICP A; 4DFD A; 4XUS A; 3HKZ C; 3Q8K A; 2E1F A; 4ECX A; 2KKV A; 3M6K A; 3KFU F; 4OJ6 A; 4FZN A; 3GU3 A; 4QZ8 A; 4M0A A; 1QH9 A; 9ICI A; 3PSI A; 5KFH A; 3SMV A; 2XC9 A; 5IIK A; 5DQG A; 4RQ3 A; 2KP7 A; 4TUS A; 1J97 A; 1ZD2 P; 4DL5 A; 3MR3 A; 4PPX A; 2YB4 A; 5DB6 A; 1ZQU A; 1NZB A; 2WF6 A; 4J9P A; 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