The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
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sequence length |
80
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structure length |
80
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Chain Sequence |
RPLPVCPNPLFVRWLTEWRDEAASRGRHTRFVFQKALRSLQRYPLPLRSGKEAKILQHFGDRLCRMLDEKLKQHLASGGD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase
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| source organism |
Mus musculus
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| publication title |
Solution NMR structure and DNA binding mode of the Mus81 n-terminal helix-hairpin-helix domain
rcsb |
| molecule keywords |
Crossover junction endonuclease MUS81
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| total genus |
25
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| structure length |
80
|
| sequence length |
80
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| ec nomenclature |
ec
3.1.22.-: |
| pdb deposition date | 2009-10-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase beta, N-terminal domain-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZQB A; 4R66 A; 4NLZ A; 4M9H A; 3ISD A; 2BPG A; 4KLU A; 7ICO A; 1ZQF A; 2PXI A; 1ZQA A; 4M9L A; 4MFF A; 3C2L A; 9ICB A; 1DK3 A; 4MF2 A; 5J0W A; 4RQ1 A; 3B0Y A; 1ZQG A; 8ICG A; 4I2G A; 4M9J A; 3C5G A; 4TUR A; 4Z6D A; 1KEJ A; 5DB9 A; 4PGX A; 2BCR A; 4RQ7 A; 5J2J A; 2PFO A; 4M9G A; 3JPT A; 4UB2 A; 4YMM A; 4YMO A; 8ICX A; 2BPF A; 4P2H A; 9ICJ A; 5J0U A; 1BPE A; 4Z6F A; 3HWT A; 1ZQK A; 8ICS A; 4KLF A; 4RT2 A; 5DDY A; 9ICG A; 8ICT A; 8ICA A; 4UAZ A; 7ICJ A; 5DB7 A; 5DKW A; 4RPZ A; 5J2G A; 8ICI A; 3C2M A; 4KLQ A; 4RQ6 A; 4MFA A; 1BNP A; 2IHM A; 5IIM A; 4RQ0 A; 4PHP A; 8ICB A; 3TFR A; 8ICY A; 4I2C A; 2BCU A; 4K4H A; 4JWN A; 4RT3 A; 4YD2 A; 1ZQN A; 5HHI A; 9ICR A; 9ICP A; 1MQ2 A; 3UQ2 A; 1KDH A; 4K4I A; 4KLT A; 3JPN A; 8ICW A; 7ICL A; 9ICW A; 1ZQJ A; 4KLG A; 4TUS A; 8ICM A; 3OGU A; 1BPZ A; 9ICI A; 1XSP A; 4I2A A; 8ICF A; 5J2H A; 4R65 A; 4TUP A; 4YMN A; 1HUZ A; 4NXZ A; 4IQW A; 3ISC A; 3RJH A; 9ICE A; 2ISO A; 8ICE A; 4GXJ A; 5J2A A; 5DBB A; 4RQ4 A; 7ICQ A; 7ICV A; 4IQU A; 5J0T A; 4NLK A; 1TVA A; 3RJE A; 9ICO A; 3HX0 A; 4F5P A; 4Z6C A; 5IIO A; 5EOZ A; 4O5E A; 4NM2 A; 4QZA A; 5J2E A; 4X5V A; 4QZF A; 1BPX A; 5CB1 A; 4I28 A; 3V7J A; 3B0X A; 3RJG A; 5IIJ A; 4RQ3 A; 3UXP A; 4O9M A; 9ICS A; 4MFC A; 4UB5 A; 4YCX A; 8ICR A; 4DO9 A; 4KLI A; 9ICQ A; 1ZQQ A; 5J2F A; 8ICU A; 5DB8 A; 3AUO A; 4O5K A; 4JWM A; 2P66 A; 2FMQ A; 5J0S A; 1ZQL A; 4I29 A; 3C2K A; 3V72 A; 3RH5 A; 4I2D A; 4LZD A; 3UXO A; 4M0A A; 4RQ5 A; 4F5Q A; 4RQ2 A; 3RJI A; 1ZJM A; 4I2E A; 3UXN A; 1RZT A; 8ICN A; 1ZQS A; 4UB3 A; 8ICQ A; 4UBB A; 2BCQ A; 3TFS A; 7ICK A; 2W9M A; 5TZV A; 5BOM A; 4UB4 A; 5DB6 A; 1XSN A; 8ICJ A; 3JPQ A; 4QZB A; 1ZJN A; 1ZQC A; 3JPP A; 4KLD A; 3LK9 A; 4RQ8 A; 4QZ9 A; 3PNC A; 5J29 A; 1BNO A; 4I2J A; 3GDX A; 5IIN A; 4F5N A; 1ZQE A; 4DOA A; 5J0O A; 5J0Y A; 2GWS A; 4LZG A; 3JPR A; 4KLE A; 4K4G A; 1ZQR A; 7ICN A; 4DOC A; 2PFN A; 5CWR A; 8ICO A; 4PGY A; 7ICM A; 3HW8 A; 3AU6 A; 9ICT A; 4PPX A; 3PMN A; 4M47 A; 8ICH A; 4QZI A; 7ICR A; 4FO6 A; 4QZD A; 9ICA A; 3AU2 A; 4KLH A; 3MBY A; 1BPY A; 2BCS A; 4RPY A; 8ICK A; 5J0Q A; 4UAW A; 4F5O A; 2BCV A; 4RPX A; 3MDC A; 2ISP A; 9ICC A; 5D4B A; 2KP7 A; 5III A; 5J0R A; 4PGQ A; 2FMP A; 5J2D A; 4QZC A; 4M9N A; 4PHE A; 4R63 A; 3JPO A; 3RJJ A; 3V7K A; 2PFQ A; 1NZP A; 9ICH A; 1XSL A; 9ICV A; 4YD1 A; 7ICG A; 4TUQ A; 9ICK A; 4KLO A; 3RJF A; 8ICP A; 4M2Y A; 3C5F A; 4UAY A; 4LVS A; 9ICN A; 4KLM A; 4Z6E A; 1JMS A; 9ICM A; 7ICF A; 3RJK A; 3V7L A; 4KLS A; 4I2B A; 5J2I A; 4YN4 A; 5BPC A; 1DK2 A; 4R64 A; 4GXI A; 3RH4 A; 5J2C A; 3UPQ A; 4I2H A; 7ICS A; 2PFP A; 5HHH A; 4DOB A; 7ICU A; 1ZQP A; 8ICV A; 3JPS A; 4GXK A; 4XA5 A; 3MDA A; 4KLJ A; 4I2F A; 1ZQD A; 5BOL A; 4UBC A; 5J0P A; 4O5C A; 4PHD A; 5J0X A; 2FMS A; 9ICF A; 4NM1 A; 5DBA A; 1HUO A; 1TV9 A; 8ICL A; 4QZ8 A; 4IQT A; 3ISB A; 8ICC A; 4F5R A; 3RH6 A; 5IIK A; 7ICH A; 3MGI A; 9ICL A; 1ZQH A; 1ZQT A; 5J2B A; 4NLN A; 9ICX A; 1MQ3 A; 4QZE A; 3UQ0 A; 4I27 A; 1ZQO A; 4MF8 A; 5IIL A; 5D49 A; 5D46 A; 4QZG A; 3MGH A; 4QZH A; 8ICZ A; 7ICI A; 4M04 A; 5J2K A; 5DBC A; 4PH5 A; 4IQV A; 4NY8 A; 7ICT A; 4I2I A; 1ZQM A; 4KLL A; 7ICP A; 3PML A; 7ICE A; 4XUS A; 9ICU A; 4PHA A; 1ZQI A; 2I9G A; 1BPD A; 4UB1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1Z3E B; 4M9H A; 3ISD A; 3C1Y A; 4BXO A; 1MN8 A; 1ZQA A; 2PXI A; 3R9K A; 4BWM A; 1L8L A; 2QB0 A; 4ED8 A; 2HCF A; 2M9N A; 3KHH A; 4J9O A; 5HR7 A; 4CF5 A; 3AEV A; 3UMC A; 3NUQ A; 3KBB A; 3C5G A; 2H5X A; 1X9S A; 2BGW A; 2MAX A; 3MR2 A; 2YB4 A; 4NL9 A; 2D3D A; 4UB2 A; 3JPT A; 4P0Q B; 4YMO A; 4JB3 A; 4B9M A; 3PY8 A; 5C5J A; 8ICX A; 2BPF A; 2BZF A; 3TAD A; 9ICJ A; 1X66 A; 3HWT A; 1ZQK A; 1RPL A; 4KLF A; 4RT2 A; 3QYP A; 3WKC A; 2GH1 A; 4YQW A; 1ZQ1 C; 8ICA A; 4Y2P A; 2H3V A; 3PSI A; 5DKW A; 1S97 A; 2CN1 A; 3M8R A; 5J2G A; 5A0L A; 1T4G A; 3C2M A; 4RQ6 A; 2FPM A; 1Z4N A; 3PSF A; 1IM4 A; 4MFA A; 2DUY A; 1L3T A; 1BNP A; 4DQS A; 3C29 A; 4JV2 A; 5AM3 A; 5IIM A; 5KFL A; 3AL0 B; 4FBT A; 2K4E A; 2QAR B; 4RU9 A; 4MHV A; 2HHW A; 2OH2 A; 2EQY A; 3TFR A; 4DL6 A; 4I2C A; 4C8M A; 1S0V A; 3PW4 A; 2ZTE A; 2AH5 A; 4FZM A; 2V4Q A; 1ZQN A; 3J81 j; 1MQ2 A; 3O0F A; 4Y2V A; 5KG3 A; 3H4B A; 3PSP A; 2H3I A; 7ICL A; 4FE3 A; 3OSP A; 5L1M A; 1T8E A; 3ZDE A; 4TUS A; 4DFJ A; 1QTM A; 1Z1B A; 2FJ6 A; 3LVW A; 3GII A; 2EAP A; 2W9A A; 3MC1 A; 1VDV A; 1HEK A; 4TUP A; 1HUZ A; 4NXZ A; 2K4P A; 2MUT A; 2NRX A; 4EZ6 A; 3QNM A; 2FE9 A; 4IQW A; 4KMU A; 5KFN A; 3BS7 A; 3M7D A; 5EWE A; 9ICE A; 2ES6 A; 1KFS A; 1SV0 C; 5JUM A; 5KFG A; 2NRW A; 2ZJ8 A; 4B9U A; 5J2A A; 5DBB A; 4IQU A; 2BQ3 A; 5ALE A; 4NLK A; 5AKE A; 3EWA A; 4CF4 A; 3PW5 A; 4BGD A; 4O5E A; 4F92 B; 2F1J A; 4AYB F; 4ECW A; 5KT3 A; 3M9O B; 1S0M A; 2WB1 C; 5T14 A; 3IRU A; 5IIJ A; 3BZC A; 1WG8 A; 2W03 A; 4DQQ A; 4B9V A; 1S10 A; 3PW0 A; 2E5S A; 1NK4 A; 2F76 X; 9ICS A; 4UB5 A; 3CNH A; 5FP0 A; 8ICU A; 2Y9T A; 3T5H A; 5L1L A; 3THV A; 1NK0 A; 4DSJ A; 4DL2 A; 2KHQ A; 5KFK A; 5ALU A; 1N5X A; 4RUA A; 3V72 A; 3RH5 A; 2HOF A; 3UXO A; 2JH7 A; 1QSY A; 4M0A A; 2ZXI A; 1YZ6 A; 1RDF A; 3CW2 C; 3MFI A; 1JRO A; 1RZT A; 1LB2 B; 8ICN A; 4F4X A; 3RBD A; 3WK9 A; 4O3M A; 2BCQ A; 7ICK A; 3FDS A; 3WU2 U; 2ZG6 A; 3PV8 A; 4CDG A; 3RR7 A; 1SKR A; 3JPQ A; 4ED6 A; 4TQS A; 2LHT A; 4C0Z A; 4YXM A; 5ALM A; 2HHX A; 4KMO B; 4F50 A; 1F44 A; 1J97 A; 4P0P A; 4DOA A; 3HP6 A; 1L8O A; 2KOB A; 5AIC A; 3K75 D; 4F93 B; 1TFR A; 1Q3U A; 2Q0Z X; 3RAQ A; 5HML A; 4G3I A; 3T3F A; 5AKX A; 4DFP A; 1T3N A; 3HW8 A; 9ICT A; 2O6K A; 2AGP A; 2IOF A; 4QZD A; 3MBY A; 2Q4T A; 4U6P A; 2OWO A; 1QH9 A; 4FBU A; 8ICK A; 4UAW A; 4O3N A; 3M1Y A; 2RDI A; 2ISP A; 2J6S A; 5KG4 A; 4DLE A; 2G5I B; 5D4B A; 5KG1 A; 1TK8 A; 4Y2T A; 2KP7 A; 5III A; 2BKE A; 5ALS A; 1T94 A; 1ZD3 A; 4GFJ A; 2N1R A; 2FMP A; 3GZF A; 1N56 A; 4KX5 A; 4F4Z A; 1PZN A; 4PHE A; 4R63 A; 1N5W A; 1NI3 A; 2P35 A; 4NWI A; 1D8B A; 1BPB A; 1U4B A; 4GIB A; 1WCL A; 3SYZ A; 2Z7J A; 2E8M A; 2KN7 A; 3ZDA A; 3K4G A; 5AM1 A; 2FPL A; 2E3T A; 3V6K A; 4RNN A; 2F2A B; 3QXG A; 3KKA A; 4DL7 A; 5AK4 A; 4DQI A; 1C20 A; 2QB1 A; 3MAB A; 4EEY A; 4DS4 A; 2M0N A; 9ICN A; 4KLM A; 4IRK A; 2KD1 A; 1JMS A; 3N97 B; 4YVZ A; 3RJK A; 3V7L A; 5AKL A; 2W9B B; 4YN4 A; 4CRX A; 4R64 A; 2BPC A; 3RH4 A; 2K4I A; 5J2C A; 2IHN A; 2UVW A; 4RQN A; 7ICS A; 4DF8 A; 2KSO B; 2PMZ C; 3G6V A; 3PVX A; 2Y1J A; 1SL0 A; 3D6J A; 5GTI U; 2MRL A; 4DFK A; 3KZX A; 5L1K A; 4RNM A; 4J9N A; 1ZQD A; 5BOL A; 2ESE A; 3WK8 A; 1DOQ A; 4C8N A; 1WYG A; 3UMB A; 3AM9 A; 3PZP A; 4B9L A; 2HBJ A; 2WF8 A; 4NL9 C; 9ICF A; 4QIW F; 2WF6 A; 4P4M A; 3RFA A; 1QQ7 A; 3M9N B; 1HUO A; 5KFX A; 8ICC A; 2V4R A; 5IIK A; 7ICH A; 3MGI A; 9ICL A; 1ZQT A; 2ASJ A; 3H4D A; 4UB6 U; 4US9 A; 1Q46 A; 3PX6 A; 2ZIW A; 2HBK A; 4IRD A; 5IIL A; 2PMZ F; 5D49 A; 2K4H A; 1XO1 A; 1ZET A; 1X9W A; 4QZH A; 8ICZ A; 2NRT A; 1SXD A; 4EYI B; 2VJ4 A; 5J2K A; 4ELT A; 4ZH4 A; 3NAS A; 3OTQ A; 5KAI U; 3H8J A; 2XCA A; 2G08 A; 3QUT A; 2MU2 A; 5EE3 A; 4EEN A; 4I2I A; 7ICP A; 4R8U B; 3PML A; 7ICE A; 2IOH A; 1RM6 C; 4EYH B; 5KFE A; 2NO5 A; 4OO1 J; 2ZUB A; 4XUS A; 3UMG A; 4DCC A; 1KLN A; 2I9G A; 2W3R A; 2W7P A; 3WK4 A; 4ECZ A; 1X42 A; 4IC9 A; 1SWV A; 4NLZ A; 2A1A A; 5EE9 A; 3C28 A; 1IV8 A; 3QUQ A; 5TIS U; 7ICO A; 4M9L A; 3C2L A; 2K8C B; 1NZB A; 3E58 A; 2WTF A; 1L7P A; 5KFP A; 3CYM A; 1F5S A; 4ED0 A; 4Z6D A; 1KEJ A; 4QW8 A; 4DWI A; 2KIC A; 2PFO A; 4M9G A; 2EZY A; 4EBD A; 3OJU A; 2GOL A; 3DV9 A; 5JRT A; 4QNL A; 5J0U A; 4Z6F A; 3N7S C; 1WCN A; 5DDY A; 3MR6 A; 2OCE A; 2LMR A; 4UAZ A; 4ECU A; 7ICJ A; 4RPZ A; 4KN7 A; 3EW9 A; 2IHM A; 5AKI A; 1M6Y A; 4RQ0 A; 2A19 A; 3SEN A; 1Q3V A; 3AQF A; 4MEY A; 1DGS A; 2AQ0 A; 8ICY A; 1O08 A; 2BCU A; 4K4H A; 2P6U A; 3F2B A; 4RT3 A; 9ICR A; 4BUG A; 1N61 A; 2I5H A; 3SEI A; 1KDH A; 2YMM A; 3A0B U; 3JPN A; 8ICW A; 4UAS A; 2J6T A; 1ZQJ A; 1WWU A; 1UCV A; 4KLG A; 8ICM A; 2FLL A; 4US8 A; 2HHT A; 4QW9 A; 1N63 A; 1XSP A; 2YMQ A; 2JZB B; 3IG8 A; 3WK6 A; 5J8Y A; 3BQ1 A; 1J2N A; 4F91 B; 2ZIV A; 8ICF A; 3SV3 A; 3RBE A; 5F3X B; 5AI6 A; 1Z4O A; 2LM1 A; 1CEZ A; 5AM2 A; 5KT5 A; 4JV0 A; 3BQ0 A; 2CPR A; 5ALW A; 2WAQ F; 1KSP A; 3SQI A; 1NKC A; 5KFZ A; 2C2E A; 1KQQ A; 2ISO A; 4GC7 A; 3Q8P B; 4RQ4 A; 3RB3 A; 2NRZ A; 5AM5 A; 4IS7 A; 1IG6 A; 9ICO A; 4Y2X A; 4Z6C A; 5ALJ A; 3D2N A; 1KRP A; 4O3O A; 5EOZ A; 4NM2 A; 4C7Y A; 2EAO A; 4QZA A; 5J2E A; 3RB6 A; 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4DOC A; 3SAF A; 1SZP A; 4PGY A; 1X6J A; 4PPX A; 4F8R A; 7ICR A; 2W04 A; 3SAH A; 2BCS A; 4RPY A; 5J0Q A; 2W9C A; 2JH1 A; 3E0F A; 4M6W A; 1KN5 A; 2R8K A; 3C23 A; 4QWA A; 2Y0S C; 4PGQ A; 5ALG A; 4J9S A; 4P4P A; 5J2D A; 1JRP A; 1JX4 A; 1RXW A; 2G07 A; 3HRD D; 3NVZ A; 3JPO A; 5ALR A; 3RJJ A; 3ZD8 A; 1PVP A; 3V7K A; 1URJ A; 1XSL A; 4Y2U A; 1V38 A; 2YMP A; 2KIV A; 4YD1 A; 3OJS A; 2KKP A; 7ICG A; 3BZK A; 3PST A; 3RRH A; 3H8W A; 1L3U A; 5AHX A; 3QZ8 A; 2EZX A; 4TQR A; 4YFK A; 4CNQ A; 4KLO A; 4PZN A; 3C5F A; 5F9N A; 1RYU A; 1ZD4 A; 1PK1 A; 5CR0 A; 3I28 A; 9ICM A; 3LWL A; 7ICF A; 4KLS A; 3RTV A; 5HR6 A; 5BPC A; 1DK2 A; 3Q8S B; 2WB1 F; 5KFS A; 1RYR A; 2KTQ A; 1X9X A; 3IN5 A; 2JEJ A; 4I2H A; 2KVC A; 5HP4 A; 4ED2 A; 3NVW A; 1NK5 A; 1L5U A; 4XA5 A; 3ZI4 A; 2HDO A; 4JMU A; 1A0P A; 1TK5 A; 3M9M B; 3LWM A; 1OXJ A; 3GV8 B; 2DPJ A; 4BXO B; 2KG5 A; 5DGA A; 4PHD A; 5J0X A; 2QB0 B; 1QQ5 A; 5G5H A; 4DF4 A; 1TV9 A; 4IQT A; 5ALY A; 1XNS A; 2ZJA A; 3H7I A; 1S77 D; 3TQ1 A; 4J03 A; 1EXN A; 1KFT A; 4J9R A; 4C8K A; 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