The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
65
|
structure length |
65
|
Chain Sequence |
TVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Structure and function of the EphA2:SHIP2 SAM domain heterodimer
rcsb |
| molecule keywords |
Ephrin type-A receptor 2
|
| total genus |
20
|
| structure length |
65
|
| sequence length |
65
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2010-01-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YTU A; 1LKY A; 2KMD A; 3TAD C; 1WWV A; 1COK A; 1Z1V A; 1WWU A; 1SGG A; 1SXE A; 1JI7 A; 2K60 A; 2QAR A; 4RQM A; 4IS7 A; 2Y9T A; 2ES6 A; 3K1R B; 1DXS A; 2KSO A; 3BS5 A; 2DKZ A; 1PK1 A; 1LKY B; 1V85 A; 4PZO A; 2QB0 A; 3SEN A; 2JV3 A; 5J8Y A; 2KE7 A; 3IDW A; 4PZN A; 1OW5 A; 1F0M A; 1SV0 C; 2KG5 A; 2EAM A; 1UCV A; 4NL9 A; 3BQ7 A; 2QAR B; 4MHV A; 5JTI A; 2Y9U A; 1UQV A; 2E8M A; 1SV4 A; 3BS5 B; 2EAP A; 1PK1 B; 3KKA C; 3SEI A; 2GLE A; 2QB0 B; 2E8N A; 1SXD A; 2FE9 A; 2D8C A; 1PK3 A; 2F44 A; 2QKQ A; 4RQN A; 2LPE A; 3H8M A; 2EAO A; 3HIL A; 5J8Y C; 3BS7 A; 1X9X A; 5JU5 A; 1B0X A; 5F3X B; 2EAN A; 2E8O A; 5KNI A; 2KSO B; 4NJ8 A; 5JRT A; 2K4P A; 1RG6 A; 3TAD A; 2F3N A; 2B6G A; 1SV0 A; 1X66 A; 2LMR A; 1X40 A; 2D3D A; 1OXJ A; 1KW4 A; 2ESE A; 3TAC B; 3KKA A; 2F8K A; 5L1M A; 1V38 A; 2DKX A; 1B4F A; 2DL0 A; 2L5Y A; 4NL9 C; 2QB1 A; 2KIV A; 2E8P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1BNP A; 1JXE A; 1NKE A; 1L3S A; 5CEH A; 4XUS A; 3QU7 A; 3ONN A; 2GWS A; 4FFD A; 4EYI B; 1T3Q A; 4QZF A; 3TAP A; 1WWU A; 2BCQ A; 2O6K A; 5KFS A; 3BQ0 A; 1CEZ A; 4QZC A; 4IL6 U; 9ICM A; 1BGX T; 1SZH A; 1WG8 A; 2NYV A; 5B66 U; 3CNH A; 1BPB A; 1DXS A; 2FLN A; 2HBM A; 3KBB A; 2Y1J A; 3KZX A; 5AI5 A; 4KLH A; 4UBB A; 3SV3 A; 3S6J A; 1DRG A; 2A1A A; 5AKY A; 1RM6 C; 2MAX A; 4RNM A; 4KLU A; 4YXJ A; 3PV8 A; 2AJQ A; 5AI9 A; 2WB1 F; 4QZG A; 2BHN A; 2WF8 A; 5KFY A; 2C28 A; 4OJP A; 5AKL A; 2JHD A; 2JR5 A; 3RAQ A; 1ED1 A; 4YXM A; 4J9N A; 1NKB A; 4M9L A; 5KAF U; 1XSP A; 1GO3 F; 2FLL A; 3F2D A; 3PW0 A; 2KJ8 A; 1ZQJ A; 1TK0 A; 1YZ7 A; 4M2Y A; 2I1Q A; 3L4P A; 2KKV A; 3T5J A; 2Q4T A; 3PY8 A; 4F8R A; 3MC1 A; 3E2E A; 2J6U A; 5F3X B; 2EAN A; 3AN1 A; 5DB7 A; 2NO4 A; 4KLL A; 4QZD A; 5HR7 A; 3GDX A; 4OO1 J; 1RG6 A; 2BQU A; 2NRT A; 5KL8 B; 1SV0 A; 1X66 A; 2D3D A; 4B9V A; 4EX7 A; 3V7K A; 4KLG A; 4F5O A; 3WKB A; 1S0V A; 3WK6 A; 5AKK A; 4JWM A; 3V72 A; 5IIJ A; 4J9K A; 4NL9 C; 2XGP A; 1ZQQ A; 2GH1 A; 4GFJ A; 2F8L A; 1N5X A; 4J9P A; 3C1Z A; 2HHV A; 1L6N A; 4TQS A; 5ALW A; 5KFK A; 3GIJ A; 3AMZ A; 4KX5 A; 2HHX A; 1FEZ A; 3PR5 B; 1SXE A; 5AKE A; 2ZUC A; 5J0W A; 2VJ4 A; 1S5L U; 2BCS A; 5L1I A; 4ED7 A; 4DLG A; 4M9J A; 1N5W A; 4F5R A; 1ZXI A; 4QZB A; 3RJE A; 1JXL A; 2PFN A; 4FE3 A; 1F0M A; 3GIK A; 2ZIU A; 9ICL A; 3KHG A; 1KDH A; 5J2F A; 4KLD A; 5J2B A; 5KT4 A; 4PGQ A; 1U47 A; 2OM6 A; 3ZDD A; 3H8S A; 5KFL A; 4ED2 A; 4NLZ A; 3MGI A; 5KFW A; 3OPX A; 1BNO A; 1LB2 B; 1QQ6 A; 5AKH A; 2ODG A; 5J2E A; 3F2C A; 2XY6 A; 1HUO A; 2D8C A; 5J0R A; 3JPO A; 4YN4 A; 3GIM A; 2RHF A; 5CJ7 A; 3TAN A; 3M1Y A; 4Q8E A; 4I2D A; 3HWT A; 4P0P A; 2KFZ A; 2AH5 A; 2E1E A; 5ALG A; 4P4P A; 1X6J A; 5J2J A; 1U48 A; 4G9B A; 3H0M B; 4Z6C A; 1DK2 A; 4F5Q A; 4KN7 A; 3RR8 A; 3PML A; 2OCE A; 4UAR A; 7ICP A; 1NK4 A; 2NRV A; 3K4G A; 4KIT B; 4IRC A; 5ALT A; 3TFS A; 3C23 A; 3AQF A; 2H3Z A; 2DKX A; 5AK4 A; 4QZ8 A; 5DG9 A; 1WYG A; 2E8P A; 8ICT A; 3KOO A; 3UQ2 A; 1U9L A; 2F1J A; 4IQU A; 1BVS A; 2EQY A; 4KMU A; 3F2B A; 3F5A A; 1COK A; 2R18 A; 4EBC A; 2YN4 A; 4EYH B; 4RPY A; 4PL2 A; 2FMQ A; 4MF2 A; 2Y9T A; 2KN7 A; 2ASJ A; 4CRX A; 4IQV A; 2ASD A; 1ZQU A; 1ZJN A; 3I76 A; 1V85 A; 1PVP A; 3RFA A; 3IM1 A; 5KT5 A; 4DL4 A; 5AM5 A; 1PZN A; 4PH5 A; 3JPQ A; 4LZG A; 2ZUD A; 2KE7 A; 4C0Z A; 5J2D A; 1KN5 A; 4BX9 C; 2V4Q A; 2OHF A; 5JTI A; 2XO7 A; 4J9S A; 1NK0 A; 4MEX A; 1TAM A; 5CA7 A; 2PFQ A; 5GTI U; 4UB4 A; 2JEF A; 4J03 A; 5KFT A; 1KEJ A; 2I9G A; 1KKX A; 8ICO A; 2C2R A; 2BCU A; 1T3N A; 1T94 A; 1Q8K A; 2JH1 A; 2HCF A; 2IMW P; 4X5V A; 2ZIU B; 5ALY A; 5E79 U; 2HBL A; 1N63 A; 4OJ5 A; 1ZQA A; 3LVW A; 4O3M A; 4TUP A; 4TUR A; 2ZTC A; 2KEY A; 1MN8 A; 2VA3 A; 2KD1 A; 2R8K A; 2C2D A; 2B6G A; 2R8I A; 1NZB A; 4USA A; 1FFV A; 3HJE A; 3NRW A; 4B9U A; 4WJ3 B; 1MQ2 A; 3I1Y A; 4NM1 A; 2ESE A; 3HPO A; 2PI4 A; 3PW5 A; 4QZA A; 4P0P B; 4CDG A; 1X9S A; 2V4R A; 5F9N A; 1B4F A; 8ICH A; 3A0B U; 5EWG A; 4UW9 A; 4KLJ A; 5ALD A; 2VAN A; 1NK6 A; 5KG4 A; 2YMQ A; 3HKZ C; 3PVX A; 3Q8Q B; 4ECW A; 3K75 D; 1QCK A; 2FPK A; 4F5P A; 1L3T A; 2JGA A; 4XQ8 A; 1F5S A; 2XIC A; 5ALL A; 3PSP A; 4M9N A; 2H5X A; 9ICS A; 1N62 A; 2QAR A; 2HVI A; 4KX3 A; 2C22 A; 4B9S A; 4I2H A; 1UPH A; 1Q46 A; 7ICE A; 1ZQH A; 2HHT A; 3TFR A; 3IDW A; 1ZQB A; 3EPI A; 5AK3 A; 1QQ7 A; 1A76 A; 4O3O A; 4PHD A; 1RXV A; 3O0F A; 4U6P A; 2P6U A; 4YVZ A; 3LWL A; 4DFJ A; 2V9W A; 3T5H A; 1URJ A; 2KKP A; 3B0X A; 4NXZ A; 8ICY A; 1SKR A; 4EEK A; 1D8Y A; 3U26 A; 1XC9 A; 2FMS A; 4EBD A; 2MUT A; 4ZOH C; 4B9N A; 3SI8 A; 2FE9 A; 2HDO A; 2LYA A; 5DQI A; 1Z3E B; 1ZET A; 3H8M A; 4ELT A; 3OJU A; 3BS7 A; 5JU5 A; 2ASL A; 2PFO A; 4NJ8 A; 5ALH A; 1U45 A; 4EBE A; 5KFC A; 1ZQN A; 2LMR A; 3OTQ A; 5DLG A; 1PVQ A; 1D8L A; 3RTV A; 1H38 A; 4HYK A; 3N97 B; 2KNJ A; 4RQ0 A; 9ICQ A; 5ALI A; 1D8B A; 1S0M A; 4DSF A; 3T3F A; 5L1J A; 4RQ1 A; 3IRU A; 7ICG A; 1WCL A; 5KFV A; 4KN4 A; 2FPL A; 1FIQ A; 5KT2 A; 2ZTD A; 4RQ8 A; 3HT3 A; 3HP6 A; 4I2I A; 3MAB A; 2VA2 A; 3PW7 A; 3AU2 A; 5HHH A; 2G06 A; 5DDM A; 4ECQ A; 4M9G A; 3IV6 A; 1ZQX A; 3H4D A; 1QLN A; 4IS7 A; 1RDF A; 2ZXI A; 4QW9 A; 1NK7 A; 1MQ3 A; 5AK5 A; 5BOL A; 4ED3 A; 4YCX A; 4TUQ A; 1ARO P; 1ECW A; 3SEN A; 3C21 A; 4RQ3 A; 3ICX A; 3LVV A; 1KTQ A; 5KG2 A; 1IXR A; 1HJP A; 3WK4 A; 7ICV A; 1C7Y A; 2AGP A; 2QAR B; 4MHV A; 1X9M A; 2DQN B; 2DFL A; 5CRX A; 4Q43 A; 1KBU A; 3LDA A; 5KFB A; 4UAV A; 1D9D A; 2G09 A; 3ZDC A; 1JMS A; 3SD7 A; 1ZQI A; 1NI3 A; 3V7J A; 3TQ1 A; 4I2E A; 1ZD4 A; 4KLO A; 2UVW A; 4UB5 A; 3SMV A; 1V9P A; 4BJQ A; 1XSN A; 1S0O A; 5H2F U; 5HML A; 3KFU F; 3L3F X; 4YMO A; 1KFS A; 3OHA A; 1XO1 A; 5DGB A; 4C7Z A; 1Q3V A; 3GIL A; 2WF6 A; 3KHH A; 1X2I A; 1RPL A; 5L1L A; 2OYY A; 4UAT A; 1V38 A; 4IR1 A; 5KG0 A; 3UMC A; 5J0P A; 3WU2 U; 1L7P A; 4OD0 A; 4F50 A; 1BPE A; 2OEH A; 4O3S A; 2VIX A; 1LKY A; 2YQE A; 3RB3 A; 1ZRN A; 4EX6 A; 4DSE A; 4YR0 A; 3M8S A; 4M6W A; 1ZQC A; 1NK9 A; 2HMX A; 2W7O A; 5ALQ A; 3Q8K A; 5ALS A; 2BQR A; 2JEJ A; 1SIJ A; 4YD1 A; 4F2R A; 3WKC A; 2KSO A; 3CP8 A; 5KFO A; 1QSY A; 2NRZ A; 1Y88 A; 2NV3 A; 2QB0 A; 3WKD A; 2W3S A; 3R9K A; 4NLG A; 1OW5 A; 3D2S A; 4O3R A; 1SV0 C; 9ICH A; 2W3R A; 2LKY A; 1NJW A; 1UCV A; 3IG8 A; 3NVW A; 8ICS A; 3PNC A; 5J2C A; 4P2H A; 4CF3 A; 5III A; 4F4X A; 1N61 A; 2FPM A; 2E8N A; 3RB0 A; 1VDV A; 5AI6 A; 2VA8 A; 3WK8 A; 4AYB C; 4G3I A; 3NRZ A; 3F53 A; 2DGZ A; 3UMG A; 8ICM A; 4YP3 A; 2XY7 A; 1HEK A; 3M6Z A; 2IOF K; 2E8O A; 1VLB A; 3EW9 A; 2PMZ F; 3G6Y A; 1HIW A; 2ZJ5 A; 3RJG A; 3QEB Z; 1SL1 A; 1J97 A; 5KG1 A; 4A8E A; 1RYS A; 3RB6 A; 2LYB A; 3ZD9 A; 1U49 A; 4QWB A; 1TVA A; 3MDC A; 1L8O A; 4BWJ A; 3SAH A; 1K1Q A; 4BGD A; 1CRX A; 4RZR A; 5KFD A; 3NVV A; 5CR0 A; 1ZQK A; 3QXG A; 2DPI A; 3HX0 A; 4QNL A; 2R8H A; 2HHW A; 4RQ6 A; 4U7C A; 1O03 A; 2I5H A; 4ICA A; 3PX6 A; 2K8A A; 9ICI A; 5KFM A; 1RYR A; 2HBJ A; 4DEZ A; 7ICU A; 2W54 A; 2W7P A; 1Q3U A; 3GII A; 3GQC A; 1K1S A; 4RQM A; 5KFE A; 4O3P A; 2ES6 A; 4RT2 A; 1ZRM A; 1RXW A; 4I2C A; 2JZB A; 2W8L A; 5DB8 A; 3MFI A; 4DOA A; 4KLE A; 5J2K A; 2WFA A; 4DCC A; 1LKY B; 2K4H A; 2KK0 A; 1ZQP A; 2RDI A; 4M6W B; 4QWD A; 8ICI A; 4FS2 A; 2HVH A; 2LI6 A; 2RLT A; 3MGH A; 4QZ9 A; 1QSS A; 4YQW A; 4F71 A; 4Q44 A; 4DOB A; 2A1J B; 4MFF A; 2FMP A; 5DB9 A; 1TKD A; 4YG2 A; 2WF5 A; 2B0C A; 4RQ2 A; 4F2S A; 9ICG A; 1NZP A; 1A77 A; 3AQE A; 2BCR A; 1SKW A; 8ICA A; 3H0R B; 2CXY A; 2QB0 B; 1PK3 A; 4NLK A; 4C8O A; 2QKQ A; 3ZI4 A; 2HW3 A; 1SWW A; 5J8Y C; 3QU2 A; 3M7D A; 4KLT A; 2W11 A; 5KG5 A; 4DF4 A; 3FYH A; 3PX4 A; 1KFD A; 4ECX A; 4F4W A; 2KHV A; 2H3F A; 3LK9 A; 2AGQ A; 2BZF A; 4IC9 A; 5AKX A; 5ALU A; 1BPY A; 1LVH A; 5DGA A; 2P35 A; 3RR7 A; 3KKA A; 4QWC A; 1DGS A; 2RRD A; 4GXK A; 4KTQ A; 3NS1 A; 2K4E A; 5KG3 A; 2RQ5 A; 3BQ2 A; 2KMD A; 1WWV A; 1KSP A; 4DSI A; 2J6T A; 2CN1 A; 2ALZ A; 2HI0 A; 2EZY A; 9ICJ A; 1SKS A; 2K60 A; 3ISD A; 5KFJ A; 5CP2 A; 1ZQT A; 3C2L A; 2F76 X; 3B9J A; 5AKZ A; 5CWR A; 7ICM A; 2CRX A; 3HW8 A; 7ICQ A; 2XI9 A; 2G5I B; 1DK3 A; 4C4R A; 3UXN A; 4F5N A; 3NVY A; 5J8Y A; 4Y2S A; 1V97 A; 1L8L A; 4DFD A; 1TAU A; 3AU6 A; 2F1H A; 5AI4 A; 1J2N A; 5IIO A; 3H40 A; 3M8R A; 2JRZ A; 3BQT A; 3QU4 A; 1XS9 D; 2E8M A; 7ICS A; 3RBD A; 2R8G A; 2J6S A; 1DOQ A; 2HOQ A; 3JPT A; 4J9M A; 3OGU A; 5D4B A; 2WAQ C; 2CPR A; 4CNQ A; 1T7P A; 8ICE A; 5AI8 A; 3H7I A; 4KLI A; 1HUZ A; 3NTU A; 1X9X A; 5GTH U; 3MR2 A; 3N7S C; 3IG5 A; 4O9M A; 5J0U A; 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1L7O A; 3SYZ A; 4QIW C; 3MGV A; 4KLQ A; 3QX7 A; 3THV A; 2FJ6 A; 3RJI A; 3ALR A; 1ZD2 P; 4O0I A; 5IIL A; 2B21 A; 2VJ5 A; 1ZQW A; 9ICA A; 4M9H A; 4BXO A; 2BDP A; 2IHN A; 3VC8 A; 1TE2 A; 3RRH A; 3OSP A; 4ED0 A; 5AKI A; 3M9M B; 4FZM A; 4JUZ A; 5J0T A; 2H3Q A; 4C4T A; 4IRD A; 4DFM A; 1T4G A; 4CF5 A; 4DSJ A; 4O3N A; 4RNN A; 1N2X A; 3BS5 A; 3ISC A; 5BPC A; 4RUA A; 3C29 A; 4DWI A; 7ICH A; 2AHO B; 5HR6 A; 4CGZ A; 4AP9 A; 2JV3 A; 1OUQ A; 9ICB A; 3M9N B; 2IA6 A; 5TZV A; 4EZ9 A; 3PO5 A; 4C80 A; 4EEY A; 1WUD A; 9ICP A; 4I29 A; 4J9O A; 4JB3 A; 2XC9 A; 5KFX A; 3QUC A; 2VKQ A; 2ZUB A; 2HBK A; 1Z00 B; 4CE6 A; 3SEI A; 4GC6 A; 5L1K A; 4MF8 A; 3WK7 A; 2AGO A; 1NKC A; 5DKW A; 2ZIX A; 5EE9 A; 2HHU A; 4QW8 A; 3SAG A; 1L7M A; 2K89 A; 5IIK A; 4BDP A; 1BPZ A; 1BPD A; 3SR6 A; 2G5H B; 2UVU A; 2K8B B; 2NRX A; 4ECT A; 3H8W A; 1JIH A; 1NJY A; 4XRH A; 1NOM A; 4Z6E A; 1RQN A; 4QZI A; 4QWA A; 4PGX A; 4LZD A; 3KHR A; 3RF9 A; 1N48 A; 4Y2J A; 4R63 A; 2E5S A; 3JPS A; 5J29 A; 2BPG A; 1NJZ A; 3QUQ A; 2KVC A; 2KV2 A; 2W9C A; 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