The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
65
|
structure length |
65
|
Chain Sequence |
TVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure and function of the EphA2:SHIP2 SAM domain heterodimer
rcsb |
| molecule keywords |
Ephrin type-A receptor 2
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
20
|
| structure length |
65
|
| sequence length |
65
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2010-01-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K4P A; 3H8M A; 2KSO B; 2F44 A; 5JTI A; 2JV3 A; 1WWU A; 2KG5 A; 2FE9 A; 3TAD A; 2KSO A; 1UQV A; 3BS7 A; 1JI7 A; 3TAC B; 1SV4 A; 2EAM A; 3HIL A; 1SXD A; 2EAO A; 2E8O A; 1SV0 C; 2LPE A; 5JRT A; 2B6G A; 3BS5 B; 1KW4 A; 1SV0 A; 1Z1V A; 1DXS A; 1RG6 A; 1X9X A; 1SGG A; 1OXJ A; 3IDW A; 2DKX A; 5JU5 A; 2QB1 A; 2QB0 B; 3SEN A; 2KMD A; 2E8M A; 4RQM A; 3SEI A; 1B0X A; 2KE7 A; 2K60 A; 2QAR B; 2DKZ A; 1OW5 A; 2E8P A; 3KKA C; 1X40 A; 1V38 A; 4IS7 A; 2QKQ A; 2QAR A; 5L1M A; 2D3D A; 3BS5 A; 4NL9 C; 1X66 A; 1PK3 A; 2F3N A; 1V85 A; 4NL9 A; 2Y9U A; 5F3X B; 1LKY B; 1UCV A; 4NJ8 A; 4RQN A; 2QB0 A; 2E8N A; 4PZO A; 1WWV A; 1LKY A; 2LMR A; 5KNI A; 2DL0 A; 4MHV A; 3TAD C; 2KIV A; 5J8Y C; 2Y9T A; 1B4F A; 2EAP A; 5J8Y A; 2F8K A; 4PZN A; 1COK A; 3KKA A; 3K1R B; 1PK1 B; 2ESE A; 2L5Y A; 3BQ7 A; 2GLE A; 1SXE A; 1F0M A; 2D8C A; 2YTU A; 1PK1 A; 2EAN A; 2ES6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1NK5 A; 3RJK A; 1ZQA A; 1MA7 A; 1J97 A; 4YCX A; 3UQ0 A; 5E79 U; 2KP7 A; 1UHU A; 3LVV A; 2PXI A; 2KSO A; 3JPQ A; 1CUK A; 5J0R A; 4B9V A; 3TAC B; 3VC8 A; 4FBU A; 1URJ A; 4DFP A; 4C4T A; 2KN7 A; 4CNQ A; 2EAO A; 3Q8S B; 2W9A A; 4EEN A; 5ALZ A; 4RQ7 A; 3M6Z A; 3BDP A; 2XO7 A; 5KFL A; 5ALI A; 4KX5 A; 3PR5 B; 1KW4 A; 2WB1 F; 3QYP A; 3QU7 A; 1YZ7 A; 4IQU A; 4EEL A; 3TAP A; 3QUQ A; 2G06 A; 4UB1 A; 4QJF B; 2BPF A; 8ICS A; 3IG5 A; 1PVQ A; 8ICW A; 3OTQ A; 4JWM A; 3M9M B; 1XSL A; 5J2J A; 4O3M A; 1JIH A; 1U4B A; 3KHR A; 2QAR B; 2K4E A; 5KFH A; 2ASD A; 4RNM A; 3KD3 A; 3PNC A; 4IQV A; 1EXN A; 3IP4 B; 2ZTE A; 3QEB Z; 5EWE A; 4F5N A; 3UPQ A; 4M04 A; 4UB6 U; 3AU2 A; 3ONN A; 4NLK A; 4Z6C A; 1NK6 A; 3KBB A; 1UCV A; 1KDH A; 5CRX A; 4P0Q A; 3QU9 A; 2XY7 A; 4PPX A; 3PSI A; 4F72 A; 4GFJ A; 1WYG A; 5ALF A; 1U49 A; 1A77 A; 4AYB C; 1S10 A; 3WKC A; 2DL0 A; 2WF9 A; 2H3I A; 1ZD5 A; 3WK4 A; 2ISO A; 2ZJA A; 4JMU A; 2JXJ A; 5ALS A; 5ALL A; 2L5Y A; 5J2A A; 3JPO A; 1F44 A; 1TK8 A; 4B9T A; 3CP8 A; 3NRZ A; 2UVW A; 4IR1 A; 2R8H A; 4RPY A; 1DGJ A; 4UBB A; 2I6X A; 4Z6F A; 2BGW A; 5HML A; 5KG7 A; 3HJE A; 4KLE A; 4C7Y A; 3BZC A; 2KFN A; 3K75 D; 5J0S A; 3QUC A; 1RDF A; 2CN1 A; 5J0P A; 4QZD A; 3V7J A; 3OJU A; 5GTH U; 2MUT B; 2LM1 A; 4LZD A; 1T7P A; 2NRZ A; 2KTQ A; 2H5X A; 4UAT A; 2AU0 A; 4QWA A; 1Z1V A; 1TVA A; 4DOA A; 3AN1 A; 4ELV A; 1L7P A; 4CF5 A; 4DF4 A; 1J2N A; 3I28 A; 2QB1 A; 4M6W B; 2Y1I A; 4M9L A; 4ECZ A; 3C2M A; 1J2M A; 5A0L A; 3HT3 A; 4ELT A; 4B9N A; 3CNH A; 5CB1 A; 3H0M B; 4YMN A; 1NK0 A; 1Z3E B; 3QXG A; 1PVR A; 5D46 A; 2WAQ F; 1BPZ A; 2XI9 A; 4LVS A; 2HCF A; 2M9N A; 1HUZ A; 1SB3 C; 1FFV A; 3QU4 A; 1XU4 A; 1N62 A; 3ISB A; 2V4Q A; 3TFS A; 1XO1 A; 2Y1J A; 3R9K A; 1QQ6 A; 1COO A; 2IOF K; 4EX6 A; 1F5S A; 2I1Q A; 3L3F X; 4XA5 A; 1QTM A; 3PR4 A; 1QQ7 A; 5HHH A; 5J0T A; 3UQ2 A; 4PL2 A; 5KFG A; 2ZUC A; 4B9L A; 4ECU A; 4KX3 A; 5AKX A; 5KT2 A; 3MR3 A; 3M1Y A; 1WG8 A; 3Q8P B; 4I2H A; 4YMO A; 3JPN A; 2YML A; 5JTI A; 5AI8 A; 4F50 A; 2DF4 B; 5DG9 A; 2FE9 A; 1S0O A; 2B21 A; 4J9P A; 1UQV A; 5KG6 A; 1N63 A; 8ICE A; 2ZIX A; 3SD7 A; 2QLT A; 1FEZ A; 3BZK A; 1KBU A; 4P4O A; 2E1F A; 2FI1 A; 3EW9 A; 2LBO A; 5AM0 A; 3C23 A; 4FZN A; 4Y2T A; 9ICB A; 4M0A A; 3T5K A; 1KQQ A; 3RR7 A; 3BQ1 A; 3QNM A; 5J2D A; 2JR5 A; 1RXW A; 3N7R C; 1HIW A; 1NK8 A; 1SKS A; 2C22 A; 3I1Y A; 4U7C A; 5AKY A; 3V7K A; 3T5H A; 2HHS A; 3C21 A; 2BCR A; 3MGV A; 1ZQY A; 5KFA A; 4IS7 A; 1ZQG A; 2ASL A; 3F5A A; 4EBD A; 4I29 A; 1VLB A; 2ZTD A; 4UAZ A; 2QB0 A; 2RHF A; 4BGD A; 3RRH A; 5AK4 A; 3IM1 A; 3WU2 U; 1XO0 A; 2HHV A; 5KG3 A; 1ZET A; 2ZIX B; 1Z00 B; 4Y2V A; 1S76 D; 2G08 A; 2XID A; 4I2I A; 1LB2 B; 3AUO A; 1U9L A; 3OHB A; 1SXE A; 2KJ9 A; 4KLJ A; 3U26 A; 2ASJ A; 4O3S A; 1LVH A; 3EUB 2; 1KFS A; 1C7Y A; 4YVZ A; 2F44 A; 3RBD A; 3THV A; 2WB1 C; 3V72 A; 3WK5 A; 1NK9 A; 1S77 D; 4F8R A; 8ICH A; 3SYZ A; 4C80 A; 3N28 A; 1V97 A; 4Q43 A; 4UB4 A; 1SV4 A; 1ZYQ A; 5J0O A; 1RQN A; 2W11 A; 3BQT A; 5DLG A; 4QZE A; 1SWV A; 2RRD A; 1ZQN A; 2FJ6 A; 4AP9 A; 4KMU A; 5AK5 A; 2JEJ A; 4B9S A; 2RQ5 A; 4RQ4 A; 2QB0 B; 1ZD4 A; 4F91 B; 2E5S A; 4YR2 A; 5HHI A; 3GQC A; 4KLD A; 2W3R A; 3QUT A; 5EOZ A; 4CDG A; 1NKC A; 4FE3 A; 2MU2 A; 5DQH A; 2KEY A; 2DWQ A; 4DL4 A; 5DBB A; 4PGY A; 4DF8 A; 2DKZ A; 2EH9 A; 1CEZ A; 3T5J A; 8ICG A; 9ICO A; 2E8P A; 1ZQJ A; 2ZIW A; 4YR3 A; 4CCH A; 5L1M A; 3G6X A; 4TUP A; 5KFN A; 4F5Q A; 1IXR A; 4YQW A; 1DK2 A; 4PHE A; 4XUS A; 2Y9U A; 2UVR A; 1PUZ A; 3QE9 Y; 3NVZ A; 4KIT B; 3ICX A; 8ICF A; 1S0M A; 3EZ5 A; 2JHD A; 5L1L A; 4Y2R A; 2EAP A; 4ECV A; 2OH2 A; 2KKP A; 4F4K A; 3RAX A; 3ZDC A; 1UT5 A; 4PHA A; 2IHM A; 1TKD A; 4ECW A; 5ALU A; 4JWN A; 4ECR A; 2P6R A; 3KZI U; 4ZOH C; 3QU5 A; 2ES6 A; 4DSE A; 4Y2U A; 2VJ4 A; 3WKE A; 2Q4T A; 1SZP A; 2W9B A; 1L7O A; 2LYH A; 5IIN A; 3T79 A; 5IIK A; 1RXV A; 1KLN A; 4Z6D A; 4F2S A; 4RPX A; 9ICI A; 3HP6 A; 1KFT A; 3PO5 A; 2AHO B; 4EBE A; 1S9F A; 7ICE A; 3SI8 A; 4YD2 A; 1X9X A; 2ZIV A; 5DDM A; 2YB4 A; 3PW4 A; 3RJJ A; 3D6J A; 4FFD A; 5DG7 A; 5KFU A; 2WAQ C; 4R63 A; 4ED0 A; 5AI5 A; 3IN5 A; 2CXY A; 5KFJ A; 4RQ6 A; 4RQ8 A; 4DFM A; 2PFO A; 2KHQ A; 3KKA C; 4GXJ A; 5AM4 A; 5KFC A; 3H0R B; 5ALX A; 4YXJ A; 1XSN A; 1L3V A; 2JEI A; 2NYV A; 8ICX A; 2OWO A; 4MFA A; 4GXI A; 3KHG A; 5DBA A; 2CRX A; 4NWI A; 2W9B B; 1S97 A; 1QSL A; 4OJL A; 3F2B A; 5AM2 A; 2VA2 A; 4R66 A; 4NY8 A; 1MQ3 A; 4FS1 A; 5KFP A; 2PFN A; 3NUQ A; 2N1R A; 2OHF A; 2DQN B; 5DB6 A; 3AU6 A; 4IRD A; 3RJF A; 3HKZ F; 2XY6 A; 1ZQC A; 2DPJ A; 3WKA A; 5ALM A; 2F1I A; 1ZQ1 C; 4F2R A; 2HBK A; 4PJ0 U; 3EPI A; 1CRX A; 2R8I A; 2HBM A; 3F2C A; 1RQL A; 2ZIV B; 1Z4N A; 8ICO A; 1X2I A; 3C2L A; 4GXK A; 3TAR A; 5HMM A; 3L5K A; 4US8 A; 4ICA A; 1VDV A; 2G0A A; 4RNO A; 3MBY A; 1NKE A; 3MFH A; 2G07 A; 3MGI A; 4B9M A; 5ALP A; 1ECW A; 5KFB A; 1MSW D; 2ATL A; 1ZRM A; 2BQR A; 5ALT A; 2HHT A; 4KLU A; 4O0I A; 1RYU A; 4JV0 A; 5D49 A; 1GO3 F; 4R64 A; 4IR9 A; 3H0L B; 1T8E A; 4EZ9 A; 1RG6 A; 7ICM A; 1XS9 D; 4TUQ A; 4O3Q A; 1JN3 A; 3M9O B; 1RZT A; 4PHP A; 3M6K A; 3H8W A; 2XGP A; 4BWJ A; 4FO6 A; 1ED1 A; 4M9J A; 4I2A A; 5BOL A; 5DKW A; 4IQW A; 2KK0 A; 4UAV A; 1SWW A; 2WF7 A; 4C8M A; 3C5G A; 4TQS A; 4O3N A; 3BQ2 A; 2E1E A; 4PGX A; 4DWI A; 2JRZ A; 5AKE A; 2FDR A; 1X6I A; 3ETR A; 4DSJ A; 1FIQ A; 8ICT A; 2H3V A; 2DUY A; 3JPP A; 2RLT A; 1LKY A; 3ZDE A; 5J0Q A; 5KG1 A; 3FC4 A; 2YMM A; 4C8L A; 2J6T A; 1B4F A; 1BPD A; 4RNN A; 3MFI A; 3TAN A; 3DEE A; 2ISP A; 4IC9 A; 1PK1 B; 2W8L A; 2GLE A; 2HBL A; 4I2B A; 3RB6 A; 3EYZ A; 2ZTC A; 3C1Z A; 3A0H U; 1WCL A; 2P66 A; 2K4P A; 2KVC A; 2KSO B; 2KHV A; 1NK4 A; 1L5U A; 4R8U A; 1UPH A; 5AHX A; 2HVI A; 1Q46 A; 5KFS A; 2AGQ A; 2MAX A; 1NJZ A; 3H40 A; 3GDX A; 4TQR A; 4EYH B; 1JI7 A; 7ICR A; 4KLF A; 3LWM A; 4DLE A; 1NJY A; 4J9L A; 1BVS A; 1SKW A; 1MQ2 A; 3E2E A; 2EQY A; 5L1J A; 4QIW F; 2YY6 A; 5AI0 A; 8ICC A; 2WTF A; 3GIK A; 2JEF A; 4NV0 A; 9ICJ A; 7ICQ A; 5ALW A; 3NVY A; 3H8S A; 2PMZ C; 9ICR A; 2KKV A; 3RTV A; 9ICW A; 4C8O A; 4NM1 A; 2G5I B; 2GO7 A; 3SEN A; 1Q8K A; 1X9M A; 2JMG A; 3JPR A; 2OXO A; 2F76 X; 1ZQD A; 3SQI A; 4ED3 A; 2K8A A; 1B0X A; 4QZ8 A; 1K1Q A; 2BCQ A; 5KFY A; 3NGD A; 2NRX A; 5KAF U; 2WF8 A; 4QZF A; 1ZOL A; 2XGQ A; 4KLL A; 1MN8 A; 2HOQ A; 4P0Q B; 1L3U A; 2R18 A; 1L8O A; 1ZRN A; 3SR6 A; 2J6U A; 2C28 A; 4R8U B; 1ZQK A; 4LJX A; 8ICZ A; 4UB3 A; 2D6F C; 2GWS A; 5KG4 A; 3O0F A; 1KL9 A; 1C20 A; 4OCZ A; 3SZ2 A; 5KNI A; 3TAD C; 2C2R A; 4NLC A; 2MA1 A; 2YMP A; 4KTQ A; 2XIC A; 5HR7 A; 2VIX A; 4NLG A; 1IG6 A; 5KT6 A; 3F53 A; 4RPZ A; 2JGA A; 3D2N A; 2G5H B; 1N60 A; 3WK9 A; 4DSL A; 5L1I A; 2M0N A; 4ED2 A; 2GOL A; 2JH7 A; 4G9B A; 1PZN A; 1CI4 A; 5EE0 A; 4QZB A; 4DSF A; 4ECX A; 1Y88 A; 2WF5 A; 3FM9 A; 1A6S A; 3PO4 A; 1JRO A; 2E8O A; 8ICY A; 2B6G A; 5TZV A; 3RAQ A; 2P35 A; 1IIP A; 8ICB A; 2Y0S F; 3QX7 A; 3UXO A; 3T5L A; 2KZM A; 2BPC A; 2BDP A; 3IDW A; 3C2K A; 4J9K A; 1XC9 A; 2NRT A; 1N61 A; 3MDA A; 1P7D A; 3NRW A; 2ZUB A; 2NRW A; 5IIO A; 3RH4 A; 4QZH A; 1OUQ A; 4ECQ A; 3OSP A; 2KNJ A; 2VJ5 A; 4UBC A; 1ZQH A; 8ICV A; 1XWL A; 1L7M A; 8ICI A; 4J9S A; 4DL7 A; 2D3D A; 3JPS A; 2XVT A; 5AKZ A; 1M6Y A; 1KTQ A; 4OO1 J; 1V85 A; 4PL1 A; 8ICR A; 4BX9 C; 4OJ5 A; 1UT8 A; 2YQE A; 3Q8R B; 1ZQO A; 1JAL A; 2HW3 A; 7ICN A; 2LYB A; 2IOF A; 4I2F A; 4RT2 A; 5H2F U; 9ICK A; 1A0P A; 4YFK A; 3SV3 A; 2KZZ A; 4HAI A; 5EE1 A; 1TE2 A; 3RF9 A; 2JH1 A; 4OJ6 A; 4O5K A; 4PZN A; 9ICE A; 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2EZX A; 3H8J A; 9ICG A; 4KLO A; 4UB5 A; 1ZQM A; 3PX6 A; 4P0P B; 3PX4 A; 3AQF A; 8ICA A; 4QZG A; 1RM6 C; 3ZI4 A; 5IIL A; 1UA1 A; 3RJH A; 4G3I A; 1ZQS A; 2W3S A; 4RUA A; 3TKA A; 4C4R A; 3MDC A; 7ICH A; 1JXE A; 1SV0 C; 5HR6 A; 4CF3 A; 3RH5 A; 5KG2 A; 1NKB A; 1BGX T; 4ECY A; 4ED7 A; 4XRH A; 5AKI A; 3K4G A; 2UVV A; 4ECT A; 1OXJ A; 3L4P A; 2KMD A; 4MFC A; 2FMP A; 3TAQ A; 7ICK A; 2FLN A; 5J2E A; 1ZJN A; 1HJP A; 2ZIW B; 4F3O A; 1D8L A; 1O08 A; 4BXO A; 2BCS A; 5KG5 A; 1ZQP A; 4UB2 A; 4YMM A; 4JV1 A; 5KT3 A; 3HW8 A; 1U48 A; 3WK7 A; 3LDA A; 3NTU A; 3SV4 A; 1QCK A; 5HNK A; 1SL0 A; 4JV2 A; 3V6J A; 5F3X B; 3IG8 A; 2LM4 A; 2R8G A; 4RQN A; 1SIJ A; 5AM1 A; 3KHH A; 2KOB A; 2BPG A; 5ALK A; 3DV9 A; 2LKY A; 3Q8Q B; 5KT7 A; 2OEH A; 2F2A B; 3KFU F; 3NS1 A; 1QH9 A; 3KTQ A; 1D9F A; 1QSY A; 2ZXH A; 3J81 j; 1K1S A; 4ED6 A; 4NLN A; 3VCB A; 3ALR A; 4UB8 U; 1Z4O A; 3SMV A; 3ZD9 A; 4MF8 A; 3RFA A; 2EAN A; 1N5W A; 2F8L A; 3MAB A; 2KZ3 A; 4RQ2 A; 4DQI A; 4QWB A; 5AM5 A; 3HPO A; 5FP0 A; 1L3T A; 4QW9 A; 2ZUD A; 1ZQF A; 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