The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
80
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structure length |
80
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Chain Sequence |
MAGDPMTFYNFIMGFQNDNTPFGILAEHVSEDKAFPRLEERHQVIRAYVMSNYTDHQLIETTNRAISLYMANLEHHHHHH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR Solution Structure of Q7A1E8 protein from Staphylococcus aureus: Northeast Structural Genomics Consortium target: ZR215
rcsb |
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Staphylococcus aureus
|
| molecule keywords |
Uncharacterized protein MW0776
|
| total genus |
21
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| structure length |
80
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| sequence length |
80
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-03-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF06855 | YozE_SAM_like | YozE SAM-like fold |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | YozE SAM-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2FJ6 A; 2KVS A; 2O6K A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3KBB A; 1WCL A; 1CRX A; 5J8Y A; 2YB1 A; 3QU4 A; 4UB3 A; 4MF8 A; 4DS4 A; 3H8W A; 4PHD A; 4UQG A; 3U26 A; 4UBC A; 4EBC A; 1U9L A; 3M7D A; 2KHV A; 1DK2 A; 4J9N A; 3KZX A; 5KFG A; 2F1J A; 1B22 A; 7ICV A; 2NRV A; 1XU4 A; 4F92 B; 5KL8 B; 3M9M B; 3HP6 A; 4ECR A; 1UT5 A; 1JRP A; 3M1Y A; 2OYY A; 4KMO B; 2E8N A; 2NYV A; 4UAR A; 2A1J B; 2BCR A; 1NKB A; 2AJQ A; 1T4G A; 2VIX A; 4NLN A; 2LMR A; 3ZD9 A; 2H3I A; 5HNK A; 3PMN A; 4IRD A; 1Z4N A; 1U49 A; 5KFT A; 4DFD A; 3G6X A; 2I6X A; 3TQ1 A; 4TUP A; 1F5S A; 2WAQ C; 3QXG A; 3TI0 A; 4OO1 J; 2KTQ A; 2JEJ A; 5KFU A; 3MFH A; 4CF5 A; 3MR6 A; 4NJ8 A; 3H4B A; 1TAM A; 2JZB B; 3RRH A; 5AHX A; 3RB3 A; 5AIB A; 2EAP A; 1IG6 A; 2MA1 A; 2F8L A; 3V6J A; 1Y88 A; 4ED2 A; 4QIW F; 5AKE A; 3BS5 B; 1FO4 A; 4J9K A; 7ICN A; 2H5X A; 9ICL A; 4CCH A; 4F2R A; 4C8N A; 3NS1 A; 5J2C A; 4NWI A; 4F4K A; 2YY6 A; 2ZXH A; 4BWM A; 2IOF A; 5KFO A; 5DBB A; 3SAH A; 2KFZ A; 2PFP A; 2JEG A; 4MEX A; 4J9M A; 1MC8 A; 1SGG A; 1BPY A; 9ICF A; 2YMP A; 1CI4 A; 4DQI A; 5DBA A; 1F44 A; 5J29 A; 5D49 A; 4RPY A; 5AK6 A; 8ICF A; 1NJW A; 7ICH A; 2CRX A; 3PST A; 4I2C A; 1COK A; 1Z1V A; 5J0X A; 5ALZ A; 4I2D A; 3IV6 A; 9ICO A; 2KJ8 A; 1KTQ A; 4RQ3 A; 5F3X B; 1MA7 A; 4MFF A; 3OSP A; 5T14 A; 1C7Y A; 3IG8 A; 3PO4 A; 4DSJ A; 2VA8 A; 4RQN A; 2XCA A; 5JTI A; 5DLG A; 1XC9 A; 3FYH A; 5EE9 A; 2AGP A; 9ICI A; 4ACO A; 4B6J A; 1S0O A; 5J2E A; 3N4M B; 4KLJ A; 8ICP A; 4LZD A; 3WK6 A; 2IOH A; 3KFU F; 1LKY A; 1UT8 A; 5DGB A; 4IL6 U; 2ZIV B; 1JUD A; 4M9G A; 9ICB A; 5CR0 A; 1QCK A; 3V72 A; 4UB8 U; 5KG0 A; 2JV3 A; 3FDS A; 1UQV A; 4G3I A; 3V7J A; 5KG1 A; 3F2B A; 4P4M A; 4NM1 A; 3SI8 A; 2KEY A; 4OCZ A; 2P35 A; 1L3S A; 3PSF A; 4IQT A; 3PW4 A; 4RZR A; 3PSP A; 3TAC B; 5ALQ A; 5ALM A; 4I2J A; 3UM9 A; 9ICA A; 3NRW A; 3H4D A; 4BGD A; 1T3Q A; 2Q0Z X; 4Q43 A; 3T5L A; 3QUT A; 4NL9 C; 2W54 A; 2OXO A; 4F5P A; 3H40 A; 4WJ3 B; 2W03 A; 3QE9 Y; 4NXZ A; 1PVQ A; 3KKA C; 4QZE A; 1TK5 A; 2G0A A; 1JXE A; 2HBL A; 2XVT A; 2PMZ C; 5AI4 A; 3SD7 A; 4DFK A; 2HSZ A; 1N61 A; 4BWJ A; 3N7R C; 4PHE A; 2EH9 A; 1HEK A; 4M47 A; 1SV0 C; 4US8 A; 5KFR A; 1Q3U A; 3RH6 A; 4I2A A; 2PFN A; 4O5E A; 2NO4 A; 3BJY A; 3EPI A; 1L7M A; 3Q8M A; 4NLK A; 2FI1 A; 1NZB A; 3TAD C; 1S77 D; 5C5J A; 2W9C A; 1S76 D; 2PFQ A; 4DFP A; 1SV0 A; 2R8G A; 1FIQ A; 5ALW A; 2BCS A; 3SR6 A; 4Q44 A; 4CE6 A; 5DB6 A; 5KFJ A; 5C0Y A; 2XY6 A; 5HHH A; 1J2N A; 2FPK A; 2A1A A; 1FFV A; 2QB1 A; 8ICH A; 4KLH A; 4UAY A; 4DQP A; 2J6S A; 3HWT A; 2F77 X; 5CHG A; 1N2X A; 1TAQ A; 4RQM A; 2KZM A; 4C8M A; 5KG2 A; 1ZQW A; 1JMS A; 2DFL A; 5ALJ A; 4ECS A; 1MQ2 A; 1Z00 A; 8ICA A; 2WB1 F; 3PV8 A; 9ICU A; 2ZG6 A; 4TUR A; 1MN8 A; 3E2E A; 3SAG A; 4KLG A; 1PZN A; 1PK3 A; 3CP8 A; 1NK6 A; 1LKY B; 1N60 A; 1YZ7 A; 2YMQ A; 1PK1 A; 4C8L A; 3THV A; 4EEY A; 5KG7 A; 4OJP A; 2ZIX A; 3QUC A; 5AM4 A; 5JU5 A; 4RNM A; 2FDR A; 9ICM A; 4DOB A; 5ALR A; 1TE2 A; 4PHA A; 4P0Q A; 1OW5 A; 2FLP A; 3RTV A; 2LM1 A; 8ICL A; 8ICG A; 2HHX A; 7ICL A; 3MR2 A; 4IR9 A; 1QQ6 A; 3Q8R B; 1HIW A; 5EE1 A; 3NTU A; 4QIW C; 2ZTE A; 4Y2T A; 3JPN A; 2DL0 A; 1D8L A; 1UA0 A; 5AM3 A; 2WF8 A; 3GV5 B; 3GV8 B; 2CPR A; 4YMO A; 2CN1 A; 1X9X A; 5KG3 A; 9ICH A; 2G09 A; 2RP5 A; 2AH5 A; 1L7P A; 5AKX A; 3HKZ F; 2PXI A; 4BX9 C; 2LYB A; 3FC4 A; 4P4P A; 1S0N A; 3NRZ A; 1ZQB A; 5J0O A; 1A0P A; 1P7D A; 1DRG A; 4B9V A; 5KFW A; 1L3T A; 3ZDB A; 7ICF A; 8ICY A; 3AEV A; 3E0F A; 3AN1 A; 5K4L A; 2WF7 A; 4CGZ A; 2E5S A; 1BPD A; 3LDA A; 2HVH A; 3WKB A; 2XY5 A; 4YVZ A; 2EQY A; 4YQW A; 4PGX A; 4C8K A; 2W8L A; 2XC9 A; 4R63 A; 4DOA A; 4KLF A; 4FS1 A; 3V7K A; 4RUC A; 2WTF A; 3H0M B; 3N7P D; 3QUB A; 1TK0 A; 3IDW A; 2K4P A; 3WKE A; 4DSF A; 1WWV A; 4QZC A; 2ZJ8 A; 4KLL A; 5AM1 A; 2M9N A; 2KJ9 A; 2ZXI A; 2QAR B; 4C8O A; 4NLB A; 3D2S A; 4JV0 A; 3ZDE A; 4C0Z A; 3O0F A; 2BQR A; 3UMG A; 4I2B A; 3N97 B; 1V85 A; 1SV4 A; 2BR0 A; 4KMU A; 4CF4 A; 4IR1 A; 4Q45 A; 1SXE A; 2A1J A; 3LK9 A; 1JX4 A; 4QW9 A; 1NK7 A; 5EE0 A; 2KV2 A; 4F5R A; 4DFJ A; 5KFP A; 4O3O A; 2FJ6 A; 4C80 A; 4KX3 A; 4F4Z A; 2ATL A; 1PK1 B; 3MAB A; 4NLZ A; 3LWL A; 5CJ7 A; 3QYP A; 1ZJN A; 1MSW D; 2D3D A; 2ZIX B; 4PZO A; 4QZ8 A; 5AI0 A; 5ALH A; 4F8R A; 4DL7 A; 3F53 A; 4QZG A; 5DG8 A; 4RQ1 A; 2W3R A; 3TKA A; 2HHQ A; 1S0V A; 3TFS A; 1ZQ1 C; 4YG2 A; 4QW8 A; 4DOC A; 4YP3 A; 5ALD A; 2DPI A; 5TIS U; 5DDM A; 2KZ3 A; 4B9S A; 5DB7 A; 2I5H A; 3RJE A; 2DGZ A; 2R8K A; 2IOF K; 3QU5 A; 1D8Y A; 5DQG A; 2YQE A; 5B66 U; 4GXJ A; 4Z6F A; 5TZV A; 3H0L B; 9ICK A; 5IIJ A; 2ZUB A; 2NRT A; 3TAQ A; 4UAW A; 4KLO A; 3F5A A; 3UQ0 A; 7ICO A; 4I29 A; 1ECW A; 2F2A B; 5JRT A; 4FO6 A; 4F5O A; 1U47 A; 2RDI A; 2A19 A; 3R9K A; 7ICJ A; 2O6K A; 3SYZ A; 4RPZ A; 1T7P A; 2QKQ A; 4O3P A; 4F5Q A; 4QWE A; 1XSP A; 1TKD A; 4GLX A; 7ICT A; 1PUZ A; 3SMV A; 1NJY A; 5EWG A; 4FE3 A; 1ZQC A; 4QJF B; 9ICP A; 2HI0 A; 4NLG A; 4YD1 A; 3IG5 A; 3RJG A; 2FLL A; 9ICR A; 1ZQI A; 4CNQ A; 5FP0 A; 1V38 A; 3ZI4 A; 3BDP A; 2NRX A; 4EBD A; 1KN5 A; 1U45 A; 4QZF A; 1X9S A; 1NOM A; 1Z19 A; 5HP4 A; 2JXJ A; 3B9J A; 5J2A A; 1ZD5 A; 2RHF A; 2C2E A; 2Y0S F; 1KW4 A; 5G5G A; 3M8S A; 2WB1 C; 8ICO A; 3QU2 A; 1ZQM A; 1A6S A; 1XSL A; 1QSS A; 2HHW A; 1DOQ A; 2JR5 A; 3GIL A; 2V9W A; 2GOL A; 5IIO A; 5B5E U; 3KHR A; 2ZIV A; 4EEL A; 1BPE A; 3HIL A; 1DXS A; 4DWI A; 1KEJ A; 3ZDC A; 3MDC A; 1Q3V A; 1X6I A; 4P2H A; 3GDX A; 4AYB C; 5AKK A; 1X42 A; 1HJP A; 3RB4 A; 2EAM A; 4DL4 A; 5J2G A; 1KFD A; 2UVW A; 5L1K A; 3ORY A; 1BGX T; 2XCP A; 3D6J A; 1SWV A; 3BQ1 A; 5KAI U; 5DQI A; 1ZQP A; 3H7I A; 3H8M A; 1X9W A; 1M6Y A; 3NVV A; 2ZJ5 A; 3GZF A; 1D9D A; 8ICJ A; 1JRO A; 1SZH A; 1WG8 A; 4ECX A; 9ICW A; 5G5H A; 1BNP A; 2LYH A; 2GLE A; 4I27 A; 1XS9 D; 4KN4 A; 3UXN A; 2UVR A; 4ELV A; 4J9O A; 4UW9 A; 9ICT A; 3OHA A; 2LPE A; 2ZJA A; 1SKS A; 2C2D A; 3PX6 A; 2HOI A; 2E3T A; 1MQ3 A; 1ZQU A; 5L1M A; 3RB0 A; 2KFN A; 3RJI A; 4YXJ A; 5DG7 A; 1OUQ A; 3DDH A; 4QWD A; 1SKW A; 2ALZ A; 3AQE A; 5HR6 A; 3SV3 A; 4KLD A; 4GXI A; 2BPF A; 4YR0 A; 1JXL A; 2JH7 A; 4RT2 A; 5J0Y A; 4Q8E A; 2HBJ A; 4B9L A; 4KLI A; 1QQ7 A; 1TK8 A; 2Y9U A; 1ZQK A; 5AKH A; 4ECY A; 4PJ0 U; 5D46 A; 3UMC A; 5J0S A; 2OH2 A; 4CRX A; 1OXJ A; 1RXW A; 2E1E A; 3RR8 A; 5J0W A; 4QZB A; 4O0I A; 2DPJ A; 1ZQF A; 4CDG A; 2G08 A; 1IM4 A; 4ED3 A; 7ICI A; 1K5O A; 5D4B A; 3PR5 B; 2E8O A; 5DG9 A; 2F3N A; 4DL2 A; 5A0L A; 5J2B A; 4OJL A; 1ZQH A; 3SEI A; 3EPG A; 4I2G A; 1T94 A; 3PO5 A; 3T79 A; 4IRC A; 2V4R A; 5DBC A; 2KOB A; 1XSN A; 4I2E A; 2Y1I A; 1ZET A; 1JI7 A; 1V97 A; 4Y2U A; 5GTI U; 3LWM A; 5EWF A; 2FPM A; 4JMU A; 4RQ4 A; 1L3V A; 2YML A; 5KFN A; 2XO7 A; 4EEK A; 1GO3 F; 2EZY A; 1TV9 A; 5AK4 A; 2J6U A; 4ELT A; 8ICX A; 1NZP A; 4F93 B; 3ISD A; 3MC1 A; 2W04 A; 3ZDA A; 2N1R A; 4MFA A; 3RJF A; 4Y2V A; 1C20 A; 4I28 A; 1BNO A; 1DGJ A; 1L8O A; 2YB4 A; 2BGW A; 4ED8 A; 1N56 A; 7ICK A; 2K8C B; 2B0C A; 1UPH A; 4O3M A; 1H38 A; 2HVI A; 4JWM A; 2ZUD A; 3ALR A; 5CP2 A; 4ECV A; 2BKE A; 2K8B B; 3IN5 A; 4O3S A; 4RQ8 A; 3IM1 A; 4NL9 A; 5AI5 A; 1X40 A; 3T5J A; 5CB1 A; 2K89 A; 3EUB 2; 3GU3 A; 4JV2 A; 3PX0 A; 5KFD A; 3L4P A; 3LVV A; 3RF9 A; 4YMN A; 1EXN A; 3KKA A; 1XO0 A; 8ICW A; 3RAQ A; 1RZT A; 5KFF A; 4DQR A; 2ISP A; 4U7C A; 3MR3 A; 1ZQY A; 5KFY A; 5J2H A; 4YR2 A; 3C5F A; 2W7P A; 1U4B A; 4FBT A; 1ZQZ A; 5ALK A; 2F1I A; 5AK3 A; 1QQ5 A; 2YN4 A; 5KTQ A; 2D8C A; 3CNH A; 3HX0 A; 4M04 A; 3TAD A; 4R8U B; 1VLB A; 1L7N A; 5AK5 A; 3M9O B; 1AQ6 A; 8ICT A; 3T3F A; 2DQN B; 5L9X A; 1ZOL A; 4FZM A; 2Y0S C; 4B9U A; 4I2I A; 2QAR A; 3NVY A; 1KSP A; 5KFL A; 4AP9 A; 2YMM A; 3ISB A; 3WK9 A; 1BPX A; 2MUT A; 4MFC A; 3V6K A; 2EDU A; 3K75 D; 2IBK A; 4KLU A; 4KLS A; 2HW3 A; 4RPX A; 2YTU A; 3B0Y A; 5KFQ A; 4KLM A; 3LYS A; 5J2K A; 2WF5 A; 3PW0 A; 4NM2 A; 1VDV A; 5KAF U; 4DLE A; 2R8H A; 1FFU A; 4KN7 A; 3Q8P B; 4UB5 A; 1ZQQ A; 3JPO A; 3QEB Z; 4MEY A; 1CEZ A; 3OHB A; 2F1H A; 2LYA A; 3ICX A; 4KTQ A; 5AIA A; 5IIK A; 2JMG A; 1ZQA A; 1ZQX A; 2KKV A; 4HYK A; 2CXY A; 2OHF A; 2G07 A; 3A0H U; 3N7S C; 3BQT A; 1SKR A; 4R64 A; 4O9M A; 2XID A; 1BPB A; 1L5U A; 2EZZ A; 2ZIU B; 8ICN A; 5KG6 A; 2RQ5 A; 5AM0 A; 4BJQ A; 3A0B U; 4Z6C A; 2AQ0 A; 4IRK A; 1JIH A; 2E8M A; 9ICX A; 2LBO A; 2IHN A; 5J2J A; 2VA3 A; 4O5C A; 3F5E A; 3WK5 A; 3KZI U; 2ESE A; 1ZQS A; 2IHM A; 4LJX A; 4YN4 A; 3OSN A; 2R8J A; 3GII A; 2IA6 A; 3SV4 A; 2KN7 A; 1FEZ A; 4Y2R A; 1RM6 C; 3KHG A; 4F4W A; 1ED1 A; 2JGA A; 1U48 A; 2KSO B; 8ICS A; 1L6N A; 4M9H A; 3IRU A; 4YCX A; 2W9B B; 4C4T A; 3BZC A; 2JEF A; 4IC9 A; 5ALE A; 4B9M A; 2WHE A; 3AL0 B; 2BCQ A; 3RBD A; 2Y9T A; 4QZ9 A; 1SL0 A; 2LKY A; 2D6F C; 2UVV A; 3ISC A; 3J81 j; 2GO7 A; 1KBU A; 4GFJ A; 2L5Y A; 5KG4 A; 4P4O A; 4RQ7 A; 2I1Q A; 1Z1B A; 3HJE A; 5KT5 A; 5KFI A; 2BQ3 A; 4Y2S A; 5KNI A; 2W3S A; 4DEZ A; 3MGI A; 3M6Z A; 3PSI A; 3I76 A; 4KLQ A; 5KT6 A; 2F76 X; 3Q8Q B; 3MGV A; 3QZ8 A; 1ZQR A; 2XI9 A; 3Q8K A; 2VA2 A; 4TQS A; 3H8S A; 8ICQ A; 2MUT B; 8ICR A; 1KFS A; 5AKJ A; 5KFB A; 4O3Q A; 1B4F A; 3T5H A; 4RQ5 A; 3PW7 A; 4EZ6 A; 5ALI A; 5KFC A; 1NK9 A; 2RRD A; 2HBM A; 4KLT A; 3BQ0 A; 3T5K A; 5AI8 A; 1N5X A; 4DSK A; 2B21 A; 1WWU A; 5CRX A; 4MHV A; 5CEH A; 3MGH A; 2E1F A; 3MBY A; 3QUQ A; 2AU0 A; 4C7Z A; 3C21 A; 3KTQ A; 4M6W B; 5ALV A; 2FMQ A; 1QTM A; 1ZQJ A; 8ICC A; 1SB3 C; 3RBE A; 9ICQ A; 1Z4O A; 2W8K A; 2HDO A; 4B9N A; 4HAI A; 1SL2 A; 4BXO B; 1RYU A; 1NJX A; 1ZD4 A; 4DO9 A; 4RQ2 A; 1ZJM A; 5HML A; 4IS7 A; 3GFK B; 1RYS A; 1XO1 A; 3WKC A; 5BOM A; 1QH9 A; 3K1Z A; 3GIK A; 3RJJ A; 3PNC A; 2C22 A; 1RPL A; 3JPQ A; 3QU7 A; 5KT3 A; 1NK4 A; 1YZ6 A; 3RH4 A; 2KVS A; 2MU2 A; 2K4E A; 3CW2 C; 4G9B A; 4J9L A; 5IIM A; 4UAV A; 1ZQN A; 3BQ7 A; 3IHQ B; 2RDJ A; 4ECW A; 1L7O A; 5DQH A; 2HCF A; 3E58 A; 8ICV A; 2P6U A; 5ALY A; 4K4I A; 2VJ4 A; 1NKE A; 4IQW A; 1WCN A; 2EZX A; 1T3N A; 1VJ5 A; 3RR7 A; 4QZI A; 5ALG A; 5HR7 A; 2PFO A; 4Y2P A; 4JWN A; 3SAF A; 1NK0 A; 2LHT A; 4EYH B; 2LI6 A; 2NRW A; 2KIV A; 4J9R A; 5AM2 A; 4EZ9 A; 5J8Y C; 7ICM A; 1X6J A; 2DUY A; 4RNN A; 8ICU A; 4O5K A; 9ICN A; 3VCB A; 3NVW A; 3PVX A; 5KL1 B; 3F2D A; 2JH1 A; 2BZF A; 3UXP A; 1TVA A; 3RFA A; 4OJ6 A; 9ICG A; 1ARO P; 5AKL A; 4UBB A; 3GIJ A; 4I2H A; 4X5V A; 7ICS A; 3UPQ A; 2JEI A; 3OJS A; 2OM6 A; 2ASL A; 2AQ4 A; 4UAU A; 3KD3 A; 2ES6 A; 4NLC A; 4KIT B; 4CF3 A; 2BDP A; 3RH5 A; 3D2N A; 3F2C A; 5KFH A; 4DL6 A; 2P66 A; 5AI9 A; 1KLN A; 4FBU A; 2UVU A; 3MDA A; 2G06 A; 4XA5 A; 5ALF A; 1XWL A; 4YXM A; 4R65 A; 3EW9 A; 1QSY A; 7ICR A; 3NAS A; 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