The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
32
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sequence length |
123
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structure length |
123
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Chain Sequence |
APTLQEALDRKCAQFGKESCNSGLASYCGAAIYARYDKGNSSQQTKEWRCYIEKELDFSKSGDGCVDDCGSMTSCRGSVSGPSTSHLTRPSELQAVIDSDKSNYCTDKSEQQPSQATPPPEIP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The Role of Sialyl Glycan Recognition in Host Tissue Tropism of the Avian Parasite Eimeria tenella
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Microneme protein 3
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| molecule tags |
Cell adhesion
|
| source organism |
Eimeria tenella
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| total genus |
32
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| structure length |
123
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| sequence length |
123
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-04-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF10564 | MAR_sialic_bdg | Sialic-acid binding micronemal adhesive repeat |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3F53 A; 2JH1 A; 3F5A A; 3F5E A; 2JH7 A; 2LBO A; 2JHD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1NI3 A; 4IRC A; 4DSJ A; 2W7O A; 2Y1J A; 3QEA Z; 4J9L A; 7ICM A; 1XO0 A; 1RXW A; 4KX5 A; 1KSP A; 3RTV A; 4Y2U A; 4Z6C A; 2XO7 A; 4QZC A; 2XCP A; 1ZD3 A; 5J8Y A; 4RQ4 A; 1ZQB A; 3M8R A; 2GH1 A; 1RM6 C; 1Q8K A; 3KKA C; 1WUD A; 3V7L A; 1NK4 A; 3DDH A; 3KHG A; 7ICF A; 2WF8 A; 3C2M A; 4G3I A; 4DSE A; 5T14 A; 4PGY A; 1JXE A; 1NKC A; 5AKI A; 2BQ3 A; 2AQ4 A; 5DGB A; 2FLN A; 4AYB C; 1BNO A; 4O3S A; 1N2X A; 3QUB A; 4BJQ A; 2BR0 A; 1QLN A; 2MUT B; 4UB6 U; 2HSZ A; 3PX0 A; 3HJE A; 2F2A B; 3QU9 A; 1S97 A; 2KVC A; 2D6F C; 3BQT A; 5KFI A; 5KT5 A; 3EPG A; 3TAN A; 8ICB A; 3M7D A; 3C23 A; 3T5K A; 2XID A; 2EH9 A; 2E1F A; 3RR8 A; 2XCA A; 3MFI A; 1S0V A; 2XY6 A; 2IA6 A; 3QX7 A; 2ZXH A; 4QJF B; 4EBE A; 2AHO B; 1BPD A; 2E3T A; 1ZQU A; 2W03 A; 3RJH A; 8ICQ A; 4ECS A; 5DB6 A; 2GO7 A; 5KG2 A; 1WYG A; 3IN5 A; 1L7O A; 4GXK A; 5ALU A; 9ICX A; 4DFD A; 5JTI A; 3PX6 A; 4K4G A; 3ONN A; 1NZP A; 3V7K A; 4BWJ A; 2HHW A; 5J0Y A; 8ICC A; 4R8U A; 3S6J A; 2A1J B; 4YXM A; 5KT3 A; 1ZQW A; 2GWS A; 3SZ2 A; 4NLZ A; 3PSF A; 1COO A; 2W9B B; 3QYP A; 3WK9 A; 4FFD A; 3IG8 A; 3BQ2 A; 1LVH A; 2HHT A; 1ED1 A; 2KSO B; 5ALO A; 2ASJ A; 2HMX A; 3I28 A; 1SIJ A; 3GIJ A; 3TAD C; 1KN5 A; 3SR6 A; 1SZH A; 3QU2 A; 9ICQ A; 1V97 A; 1BPB A; 1PK1 A; 3RJI A; 4MF2 A; 4MFF A; 7ICP A; 3RB6 A; 3PML A; 1ZQT A; 4KMO B; 4PL1 A; 2EZY A; 3UMB A; 1VJ5 A; 4FZM A; 1J97 A; 4YVZ A; 4KLO A; 5J2F A; 3NS1 A; 3H40 A; 2W11 A; 1SV0 C; 2BPC A; 2RLT A; 2HBK A; 4I29 A; 2K4I A; 5CP2 A; 1N5X A; 5HHI A; 4QW8 A; 1NK0 A; 2BCV A; 2ZTE A; 7ICI A; 4EEL A; 1XNS A; 4B9T A; 2HHV A; 2ZIU A; 4QZI A; 9ICL A; 5AM3 A; 4FE3 A; 2B6G A; 4NLN A; 5AIC A; 4O5C A; 2BKE A; 2QLT A; 2VJ5 A; 2W9M A; 4RPZ A; 3D2N A; 4F5Q A; 2PFN A; 3UQ0 A; 2LPE A; 5KG3 A; 2YB1 A; 1SXD A; 4K4H A; 2LYB A; 8ICG A; 1U4B A; 2ESE A; 4M9H A; 4Y2V A; 4USA A; 4U6P A; 1TAU A; 2K8B B; 1KEJ A; 5EE9 A; 4X5V A; 2OM6 A; 2RRD A; 2PFP A; 2I1Q A; 2HOQ A; 9ICT A; 2XVT A; 5CR0 A; 3OHA A; 5J2D A; 4RQM A; 5AKY A; 4F5N A; 4QWC A; 3RJJ A; 1SZP A; 4M6W B; 2KN7 A; 2BCU A; 5HR6 A; 4IQV A; 4QZD A; 3TAQ A; 2DFL A; 4NLB A; 1B0X A; 3GIM A; 1QSS A; 2CRX A; 3ETL A; 3T5H A; 5ALP A; 3QZ8 A; 1NJY A; 4UAR A; 2J6U A; 1RYR A; 3MGI A; 3C21 A; 4NL9 C; 4DS4 A; 3THV A; 2CXY A; 3C2K A; 1RZT A; 4Q8F A; 1DK2 A; 2AQ0 A; 4NJ8 A; 4QZB A; 5B5E U; 4M9N A; 2DKZ A; 3K1R B; 4F50 A; 1UT8 A; 1ZQL A; 5ALT A; 2KZM A; 4NV0 A; 3MR2 A; 3KKA A; 5KFJ A; 1RG6 A; 1L3T A; 2F1J A; 2XC9 A; 3MGV A; 1JXL A; 4YR2 A; 7ICL A; 3OTQ A; 2ZIX B; 2R8H A; 1ZJN A; 5AM0 A; 4M47 A; 1KFS A; 5KFT A; 3KOO A; 3UMG A; 4DO9 A; 1QSY A; 5KFA A; 1QSL A; 2YY6 A; 5DG9 A; 2V9W A; 1KQQ A; 2A1A A; 5ALV A; 2FDR A; 3LWL A; 5ALD A; 3PNC A; 3AUO A; 2OXO A; 3V72 A; 1Y88 A; 4ECY A; 5GTI U; 4QZ9 A; 3PR5 B; 3N4M B; 3ETR A; 3HKZ F; 4I2G A; 5KG7 A; 2NYV A; 1N62 A; 3RJF A; 5J0T A; 1ECW A; 5DKW A; 4OD0 A; 1ZQV A; 1PZN A; 3HX0 A; 2R18 A; 4O3N A; 2KFN A; 1CI4 A; 1S77 D; 3K4G A; 4YMO A; 7ICO A; 2W43 A; 5KFB A; 3GV7 B; 4JMU A; 4YN4 A; 2I5H A; 1S0N A; 5AKK A; 2MSN A; 5L1J A; 1RQL A; 2LKY A; 3QU4 A; 2HHX A; 2EAM A; 3M8S A; 5KAI U; 1BPX A; 2ZJ8 A; 5A0L A; 2KIV A; 5J8Y C; 3PVX A; 5L1L A; 2YQE A; 4QWA A; 4IR1 A; 4QIW F; 4Z6E A; 3WKD A; 2AGQ A; 5KFC A; 4QWD A; 4YFK A; 1FFV A; 4DQQ A; 4KIT B; 1S10 A; 1U45 A; 2C22 A; 4Q8E A; 4O3R A; 3KTQ A; 2EAO A; 2MU2 A; 9ICO A; 4YQW A; 3ISD A; 2M9N A; 4B9N A; 4BX9 C; 3TAP A; 4LZG A; 2E8P A; 2AGO A; 2H5X A; 5BOL A; 3F5A A; 3TAD A; 2OHF A; 2WF6 A; 1JI7 A; 4WJ3 B; 5ALZ A; 2ZJ5 A; 4B6J A; 1WCL A; 2HHQ A; 1JAL A; 4KLE A; 2G09 A; 4F2S A; 1TKD A; 4P0P A; 2XI9 A; 1SV0 A; 1ZD5 A; 5KFQ A; 2O6K A; 2BCS A; 1ZQX A; 2LM1 A; 1ZYQ A; 3ZDD A; 5KFN A; 3C1Z A; 7ICN A; 5AM2 A; 4JV1 A; 1KTQ A; 2E8N A; 3SV4 A; 3IV6 A; 4NLK A; 2YMP A; 5ALK A; 8ICS A; 4TUS A; 4M04 A; 3WK4 A; 1D9D A; 4R63 A; 2ODG A; 1Z3E B; 3HKZ C; 5KFP A; 4R8U B; 2BPF A; 1LKY A; 3PX4 A; 5J2K A; 3MFH A; 3BJY A; 3AL0 B; 3EZ5 A; 4DL5 A; 5AK5 A; 5KT6 A; 3CRX A; 5ALJ A; 3QU7 A; 5ALR A; 2KOB A; 2OYY A; 1A76 A; 1ZQK A; 4C8N A; 3JPO A; 4OJ5 A; 3QUQ A; 1PK1 B; 5H2F U; 4OJ6 A; 5KT2 A; 4JB3 A; 4NL9 A; 3T79 A; 3L5K A; 2HVH A; 4P4O A; 4ECW A; 3GII A; 4R65 A; 1X9X A; 2HBL A; 3E2E A; 5ALS A; 1U49 A; 5CJ7 A; 3U26 A; 2ZIU B; 4BWM A; 3G6X A; 2FMS A; 3E0F A; 8ICP A; 3BQ7 A; 4KX3 A; 1C20 A; 1OUQ A; 3Q8K A; 1JRO A; 2W7P A; 4GC7 A; 5DLF A; 4DFK A; 2PKE A; 3HW8 A; 4RNM A; 2KKV A; 2QKQ A; 4NXZ A; 9ICP A; 3IHQ B; 2VJ4 A; 5HNK A; 3PW4 A; 1RDF A; 4DL7 A; 1JX4 A; 4PPX A; 5IIM A; 4F92 B; 1TK5 A; 2BPG A; 3HPO A; 4Y2S A; 3M9M B; 4ECZ A; 1A6S A; 3O0F A; 5L9X A; 9ICM A; 2Z7J A; 3PY8 A; 3SEI A; 1BPZ A; 3CP8 A; 4CRX A; 4C8K A; 4Z6F A; 4PHD A; 1WWV A; 3I1Y A; 4C80 A; 1S9F A; 1IV8 A; 3GFK B; 2LM4 A; 4UAY A; 4MFC A; 8ICV A; 1ARO P; 4IQW A; 3GV5 B; 2NO5 A; 1L7N A; 1X2I A; 2KHV A; 3FDS A; 3PR4 A; 1MQ2 A; 3JPP A; 3N97 B; 1KFT A; 4DLE A; 4B9M A; 2LI6 A; 4F5P A; 2IMW P; 3IM1 A; 4RPY A; 2EDU A; 2W8K A; 3SMV A; 4ED0 A; 2YN4 A; 3H7I A; 4JV2 A; 4KLS A; 2PI5 A; 3PW5 A; 2I6X A; 2H3Z A; 1MQ3 A; 1NJZ A; 4YXJ A; 3QUC A; 3FC4 A; 5C0Y A; 2DPJ A; 1TV9 A; 5BPC A; 2H3I A; 3G6Y A; 2MA1 A; 4P4M A; 2VIX A; 3C1Y A; 2KE7 A; 5ALY A; 1NK5 A; 5KFH A; 5L1K A; 4GC6 A; 4DSF A; 1CEZ A; 5HHH A; 1L3S A; 1ZQO A; 3GDX A; 2QB1 A; 4YG2 A; 4ECU A; 3GZF A; 2FJ6 A; 4YMM A; 4DL3 A; 1TVA A; 1MN8 A; 3TFR A; 2E8M A; 4M9G A; 4US9 A; 4F8R A; 5AK6 A; 5J2B A; 5DB8 A; 4CNQ A; 1PUZ A; 1PVR A; 4CF3 A; 4MEX A; 4DQR A; 4XA5 A; 1KLN A; 4Q44 A; 4DFJ A; 8ICT A; 4FS2 A; 2KJ8 A; 2Q0Z X; 5KFD A; 2KJ9 A; 4KLU A; 4OJL A; 5F9L A; 1CRX A; 1JUD A; 1VLB A; 4DQP A; 5L1M A; 2C2E A; 4K4I A; 5KFO A; 9ICJ A; 4P4P A; 4Y2J A; 2P6R A; 3TKA A; 1H38 A; 5CA7 A; 5J0Q A; 3BS7 A; 3AQF A; 4KLF A; 3JPR A; 5DBC A; 3PW2 A; 3Q8L A; 1T3N A; 5B66 U; 3SAH A; 1WCN A; 5KL8 B; 3CW2 C; 1RXV A; 1S0O A; 5KNI A; 1TAM A; 3OHB A; 3UMC A; 3A0B U; 3SD7 A; 2EAP A; 2DF4 B; 1PK3 A; 4DFM A; 2JR5 A; 2YX8 A; 4DEZ A; 3KHR A; 5J0W A; 1L8O A; 3PMN A; 3LDA A; 2G08 A; 3SEN A; 5KFR A; 4BDP A; 4Y2Y A; 2F8L A; 4G9B A; 2JMG A; 3F5E A; 5J0X A; 4EYI B; 1Z4N A; 2ZG6 A; 3K75 D; 4PZN A; 1ZJM A; 4DSI A; 4ICA A; 4NLC A; 1BNP A; 1DXS A; 2K4E A; 4MHV A; 1QH9 A; 3V6K A; 1XS9 D; 2HHU A; 4O3O A; 3T5L A; 1ZQG A; 2PFO A; 4DQS A; 3IDW A; 4QZH A; 2HDO A; 3WKB A; 3C29 A; 4P0P B; 4RQN A; 4TUP A; 2ZJA A; 4UB3 A; 4UB5 A; 3GIK A; 3GU3 A; 4DCC A; 3B0Y A; 3FYH A; 3RFA A; 4UB4 A; 5EWG A; 1UA1 A; 3FM9 A; 3T5J A; 4KLL A; 1ZQJ A; 1Z4O A; 2IOF K; 3AQE A; 3H8S A; 2BQR A; 1HJP A; 4EX7 A; 2Y1I A; 1F44 A; 2L5Y A; 2V4R A; 1PVQ A; 3HIL A; 4ED1 A; 3D6J A; 4KMU A; 4EX6 A; 4E0D A; 1QQ5 A; 3V7J A; 3IG5 A; 2IOF A; 3ZD9 A; 2ISO A; 5CRX A; 1LKY B; 3TFS A; 3MR5 A; 3Q8Q B; 1SWV A; 1XU4 A; 3I76 A; 3HRD D; 4MFA A; 4DQI A; 3NAS A; 4NM1 A; 8ICR A; 4QWE A; 4RUA A; 4F5R A; 3MDA A; 4IQU A; 1ZQS A; 8ICA A; 4I28 A; 1U48 A; 5AI8 A; 1L8L A; 4KTQ A; 2QB0 B; 5EOZ A; 2F1H A; 1BGX T; 4KLT A; 3MC1 A; 4DWI A; 2ZUD A; 1UHU A; 4CF5 A; 2XGP A; 4PZO A; 4QZA A; 3TI0 A; 4Y2R A; 8ICE A; 4O5E A; 3N7R C; 3A0H U; 4F4X A; 1RYU A; 4DOA A; 2C2R A; 2HVI A; 3UPQ A; 1Q3U A; 7ICH A; 4YD1 A; 4KN7 A; 3M9N B; 4LZD A; 1ZQC A; 2G5I B; 4M9L A; 5J2J A; 3M9O B; 2IHM A; 4JWN A; 4FZL A; 4UW9 A; 4IC9 A; 4QWB A; 2H3Q A; 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