The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
26
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sequence length |
122
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structure length |
122
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Chain Sequence |
ADVFDPPTQYGYDGKPLDASFCRTAGSREKDCRKDVQACDKKYDDQGRETACAKGIREKYKPAVVYGYDGKPLDLGFCTLAGIREVDCRKDAQTCDKKYESDKCLNAIKEKYKPVVDPNPPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure, dynamics and domain organization of the repeat protein Cin1 from the apple scab fungus.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Cellophane-induced protein 1
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| molecule tags |
Cell adhesion
|
| source organism |
Venturia inaequalis
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| total genus |
26
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| structure length |
122
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| sequence length |
122
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-08-16 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 | ||
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LHT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4ECY A; 3H4D A; 3MR6 A; 1S0N A; 5BOL A; 4DO9 A; 3ISD A; 4B9L A; 7ICP A; 2BZF A; 4R63 A; 4YR0 A; 2ZIU A; 1LB2 B; 5E79 U; 2ZTE A; 1WYG A; 1X40 A; 2KIW A; 2XI9 A; 4MF2 A; 4RNM A; 2HW3 A; 2VAN A; 1U4B A; 4O3O A; 1ZQR A; 1ZQN A; 2W9B B; 1XNS A; 3QNM A; 2CPR A; 2E3T A; 5ALR A; 2H3F A; 4ED7 A; 1DK2 A; 2ZIV B; 5DGB A; 2VA2 A; 3PST A; 1YZ6 A; 4EYH B; 3OSP A; 1L7O A; 2BPC A; 3Q8M A; 3M7D A; 2OWO A; 4QWA A; 4LZG A; 5KFL A; 3RR8 A; 5KG0 A; 5GTH U; 2CXY A; 5J2K A; 5FP0 A; 1N60 A; 2AQ0 A; 1ZQA A; 1QSL A; 1SXE A; 3MR2 A; 4YN4 A; 4CRX A; 2WF9 A; 3ED5 A; 2QB0 B; 5HMM A; 4XQ8 A; 4R8U B; 5KFZ A; 1X66 A; 4NXZ A; 1XSN A; 4DSK A; 2DQN B; 4UAV A; 4RT2 A; 2FPL A; 4ED2 A; 2HHQ A; 2DGZ A; 1N63 A; 4I2A A; 7ICE A; 4I2J A; 9ICO A; 5DLF A; 3TAC B; 4HYK A; 5HHH A; 1Z4O A; 4MFF A; 2HHS A; 2ZTD A; 4DS4 A; 1HIW A; 1DGJ A; 1TE2 A; 2F1J A; 3V6K A; 1HJP A; 5DQG A; 2R18 A; 3M1Y A; 4KX3 A; 4QZC A; 4M9G A; 4M9N A; 3ZD9 A; 4UAW A; 1NJX A; 2JZB A; 4OO1 J; 4YFK A; 3SAH A; 5BOM A; 1NK6 A; 5KFE A; 9ICS A; 4RUC A; 4MFA A; 3M8R A; 3SYZ A; 4M47 A; 3ZDA A; 4QZA A; 4GXJ A; 4J9M A; 2E8N A; 3GZF A; 4DL5 A; 5J0X A; 1C7Y A; 5IIO A; 3SI8 A; 1KQQ A; 2I6X A; 3G6X A; 2PFO A; 1VLB A; 3IP4 B; 4MHV A; 2BDP A; 3G6V A; 2DL0 A; 4K4I A; 5ALM A; 1T8E A; 4QZH A; 2H5X A; 4UAZ A; 4IRC A; 8ICS A; 3C5G A; 4CF3 A; 2ES6 A; 1SKW A; 3E0F A; 4Q43 A; 3EW9 A; 2JXJ A; 3WKA A; 4DL2 A; 1NKB A; 5KFO A; 3PMN A; 2WAQ C; 3RJH A; 2JHD A; 2LI6 A; 1URJ A; 5DG7 A; 9ICB A; 5ALT A; 1D8B A; 2KMD A; 2K89 A; 4MFC A; 2EH9 A; 1IXR A; 3MGV A; 1ZQE A; 4RPY A; 2KZZ A; 4BXO B; 4QWD A; 4ELT A; 3TAP A; 4NWI A; 1X6I A; 4C4T A; 1K1S A; 3UXP A; 2ZIW A; 2E8O A; 2IOH A; 3OPX A; 4RQ8 A; 5AM1 A; 2ZIX B; 3OJS A; 1ZQI A; 5J8Y C; 2G5H B; 4UAY A; 2ATL A; 2IHM A; 3SZ2 A; 2MUT B; 4IRK A; 1Z00 A; 5AKH A; 5F9N A; 4RT3 A; 2AHO B; 1V38 A; 5AIC A; 5JTI A; 4JV0 A; 3EYZ A; 4J9K A; 2BR0 A; 1TAM A; 4KLH A; 3UXN A; 4O5E A; 2K4E A; 7ICS A; 3ISB A; 2JEJ A; 8ICP A; 1T7P A; 2KKP A; 2E1F A; 3UMC A; 4DF4 A; 2BQR A; 4G3I A; 4OCZ A; 1KFD A; 4QWC A; 2ZJ5 A; 1BPZ A; 3G6Y A; 4B9M A; 4UW9 A; 3V6J A; 4M9J A; 3H0M B; 3OJU A; 2OEH A; 1A77 A; 3WKC A; 1HUO A; 1KN5 A; 3PSP A; 3HJE A; 4QZF A; 8ICM A; 1ZD4 A; 4Z6E A; 1SV4 A; 4DFJ A; 3F2C A; 2KKV A; 4UB4 A; 4C0Z A; 2F76 X; 1WUD A; 4YMO A; 5AK6 A; 3FM9 A; 4Y2V A; 4Y2R A; 1XSP A; 2KSO B; 2OXO A; 4YR2 A; 3RBE A; 2HBL A; 4Y2Q A; 2K8C B; 2NO4 A; 4US9 A; 2KNJ A; 4KMO B; 5J0O A; 2NRW A; 4IS7 A; 3PW4 A; 3JPO A; 1IV8 A; 5DBB A; 4JUZ A; 1MC8 A; 2NRV A; 3WK6 A; 4KMU A; 4DOB A; 1WG8 A; 1XO0 A; 3RH5 A; 2NYV A; 3V72 A; 9ICT A; 5ALO A; 2KD1 A; 4F2S A; 2MAX A; 2XCA A; 1UA0 A; 1BGX T; 1S10 A; 3QZ8 A; 4EBD A; 2DBY A; 3KD3 A; 3GFK B; 2OHF A; 1UHU A; 1FIQ A; 5EWG A; 4ECV A; 3ZDC A; 2DF4 B; 5J2H A; 1JMS A; 5CRX A; 1ZQP A; 7ICV A; 5ALL A; 4PL2 A; 4NJ8 A; 4F4Y A; 3KKA A; 3A0H U; 1X9S A; 2KK0 A; 4XUS A; 3WK9 A; 2NO5 A; 4P4O A; 1C20 A; 3ORY A; 2ZJA A; 5A0L A; 2GH1 A; 1EXN A; 8ICJ A; 1XS9 D; 2Y9U A; 5KNI A; 1ZQU A; 2KJ5 A; 3PW7 A; 5J2J A; 1N62 A; 3N97 B; 3BZK A; 1ZQ1 C; 5DB9 A; 2KFZ A; 2R8J A; 4ICA A; 1ZQB A; 2YQE A; 4M6W B; 8ICF A; 4TUR A; 3IN5 A; 2W9B A; 1O08 A; 3SAG A; 4GLX A; 3T5K A; 9ICV A; 2D3D A; 2F44 A; 9ICX A; 1QQ5 A; 5KFR A; 5ALW A; 3I1Y A; 2ZIV A; 3I28 A; 1UQV A; 4TUS A; 2AJQ A; 4JK1 A; 3VC8 A; 4ED3 A; 1UT8 A; 1T3N A; 4UB1 A; 4DL3 A; 1DRG A; 1S0M A; 4I2H A; 2DWQ A; 3QEB Z; 4TQR A; 5AKZ A; 3NVY A; 5AKJ A; 3ZDE A; 4RQ4 A; 3HKZ F; 4PH5 A; 1CI4 A; 1L6N A; 3QU2 A; 2QB0 A; 4PZO A; 2K4P A; 4DFD A; 4ACO A; 3BQ1 A; 4F72 A; 1JRO A; 1MQ3 A; 1D9F A; 4IC9 A; 4C7Y A; 2EAO A; 1OXJ A; 3UQ2 A; 4NLN A; 3L4P A; 4DQQ A; 8ICO A; 4NL9 A; 2DFL A; 5G5G A; 5EE3 A; 1Z00 B; 4RNN A; 2XGQ A; 5AK3 A; 4J9S A; 5CB1 A; 1KKX A; 5T14 A; 2J6S A; 4Q8E A; 4EEY A; 2F8K A; 1PK1 A; 5KG2 A; 2BCR A; 5DGA A; 2FMS A; 3RJI A; 4J9N A; 1ZOL A; 1F5S A; 4F5P A; 3JPP A; 4UAT A; 2G06 A; 2XID A; 4O5C A; 4UAU A; 4F5R A; 4A8E A; 4I2F A; 2PI5 A; 5J0Q A; 3V7K A; 4F93 B; 3ZDB A; 3SQI A; 4IQV A; 3PO4 A; 4F3O A; 4NLZ A; 3PX0 A; 2LKY A; 4M2Y A; 4TQS A; 5J0S A; 5AI4 A; 2BPF A; 7ICT A; 1L8O A; 4YG2 A; 1LKY B; 5AM5 A; 5F3X B; 3M9O B; 1J97 A; 2HBJ A; 4ELV A; 2K8A A; 2EZY A; 4IR9 A; 2KG5 A; 4QZG A; 4UQG A; 4IR1 A; 4K4G A; 5DLG A; 4M9L A; 3SR6 A; 2XIC A; 3BQ7 A; 4J9Q A; 1NZP A; 4BXO A; 3JPN A; 5KFV A; 4KLO A; 1TVA A; 8ICT A; 4PL1 A; 2MA1 A; 1KW4 A; 5DBA A; 3U26 A; 4YD2 A; 1Z1V A; 4RU9 A; 4RQ2 A; 3C2M A; 4I2C A; 1L3T A; 1MSW D; 3Q8R B; 5L1J A; 5KG4 A; 4RQM A; 4KLQ A; 5IIJ A; 1VDV A; 4DS5 A; 2ZIX A; 1NKE A; 4YVZ A; 4U6P A; 2RHF A; 3NTU A; 2PMZ C; 4JMU A; 4RQ0 A; 4YP3 A; 1PVP A; 4MEY A; 7ICL A; 5HR7 A; 1BPX A; 2Y0S C; 5L1L A; 1XSL A; 5CWR A; 2B21 A; 4UB2 A; 5ALJ A; 3Q8Q B; 4KLG A; 4RNO A; 2LBO A; 3ONN A; 4Y2U A; 3BDP A; 3TAQ A; 4USA A; 5EWF A; 1JXE A; 1S97 A; 2G07 A; 2GWS A; 3KZX A; 3TKA A; 4TUQ A; 4PJ0 U; 3C1Y A; 1ZQQ A; 3F5A A; 2LM4 A; 4ECQ A; 1PUZ A; 4UB8 U; 2R8H A; 4DQR A; 3PR5 B; 2IHN A; 4PZN A; 5ALK A; 5J0U A; 2KZM A; 4M04 A; 1QTM A; 4Q8F A; 2WB1 C; 2XCP A; 2KIC A; 2JMG A; 1RYR A; 1ZQJ A; 2W43 A; 3TAD A; 5KFP A; 1N2X A; 5DKW A; 3JPS A; 1A76 A; 4NY8 A; 2W8L A; 1CUK A; 3RAX A; 3D2Q A; 1NI3 A; 1ZQX A; 3RR7 A; 2H3I A; 1QLN A; 1PVR A; 4ECR A; 1ZQY A; 2JV3 A; 3BS5 B; 2KSO A; 3THV A; 4EEN A; 4YQW A; 4E0D A; 5DB6 A; 3D2S A; 3HRD D; 9ICQ A; 4I2B A; 1SKR A; 2JH1 A; 1KL9 A; 4B9N A; 2OM6 A; 5ALP A; 4QJF B; 7ICR A; 5AKI A; 4KLF A; 4AYB C; 2HBM A; 2F3N A; 4F71 A; 2ZTC A; 1HEK A; 1L7M A; 4FBT A; 1V97 A; 1S8O A; 3RAQ A; 4F4W A; 4I28 A; 1ZD2 P; 5DG8 A; 1RPL A; 3QX7 A; 2L5Y A; 2BCU A; 5CEH A; 3T5L A; 1L3U A; 2HHT A; 3RTV A; 3N4M B; 4J9L A; 5KG3 A; 2LYB A; 2MRL A; 5IIM A; 3RB6 A; 4CNQ A; 1ED1 A; 2QKQ A; 4NM2 A; 3UXO A; 4DEZ A; 5L9X A; 4Y2Y A; 5AK4 A; 5ALG A; 1PK1 B; 2ISP A; 3MFH A; 1T4G A; 7ICQ A; 3AL0 B; 4KLD A; 1B4F A; 3NUQ A; 3N28 A; 1XC9 A; 4NLB A; 4G9B A; 2WHE A; 1TK8 A; 2J6U A; 5ALZ A; 3GV8 B; 4YCX A; 3BQ2 A; 1XWL A; 1RDF A; 4MF8 A; 1NK7 A; 1PZN A; 3E2E A; 4M6W A; 3QE9 Y; 3T5J A; 1KSP A; 4R64 A; 2KIV A; 1KFS A; 9ICL A; 3AQF A; 4QZD A; 4B9U A; 5BPC A; 3PO5 A; 4XRH A; 5KFQ A; 3ZDD A; 1FEZ A; 2LM1 A; 3UPQ A; 3N7R C; 4ED8 A; 3AM9 A; 1PVQ A; 4C8O A; 3SEI A; 4Q44 A; 3I76 A; 2FLL A; 2Z7J A; 4DSJ A; 1KFT A; 2IMW P; 5ALQ A; 5J0R A; 2BKE A; 2JEI A; 8ICX A; 2XY7 A; 3H8S A; 3M6Z A; 4C80 A; 4KLJ A; 2BDU A; 2K4I A; 4YD1 A; 2VA3 A; 5HP4 A; 3DV9 A; 3NVV A; 1F0M A; 5JUM A; 5ALV A; 1ZQT A; 1B0X A; 2ZXH A; 5KT7 A; 1U45 A; 1Q46 A; 4NM1 A; 4FZL A; 4QW9 A; 4BGD A; 3KHH A; 3RRG A; 3C23 A; 2JH7 A; 8ICV A; 3WKD A; 4IQU A; 9ICF A; 2ASJ A; 3EPG A; 3SEN A; 1BPE A; 2W11 A; 1DXS A; 5CP2 A; 4KX5 A; 1YT3 A; 2FI1 A; 3GDX A; 4M0A A; 1KTQ A; 2EZX A; 3RJE A; 1LVH A; 4FO6 A; 3WKE A; 1A6S A; 1BPB A; 4RQ3 A; 1ZD5 A; 5TZV A; 5IIK A; 2DPJ A; 1N5X A; 1X2I A; 3NGD A; 1SV0 A; 1NJZ A; 4JWN A; 4DQI A; 3SMV A; 1WWU A; 2KJ9 A; 3JPT A; 2HMX A; 4U7C A; 4YXJ A; 1ZQD A; 3V7L A; 2KEY A; 4RPX A; 2EQY A; 5KFB A; 4I2G A; 2EAM A; 1NKC A; 4Y2P A; 4J9O A; 4PHE A; 5AI0 A; 4QZB A; 1IG6 A; 4OD0 A; 2ASD A; 3PSF A; 1ZJN A; 8ICG A; 3R9K A; 4KTQ A; 1T3Q A; 1LKY A; 3LVW A; 4RQN A; 3T5H A; 3GIK A; 2A19 A; 2ZUD A; 4KN4 A; 1ZQK A; 4FS1 A; 4HAI A; 2AQ4 A; 1RQN A; 7ICH A; 3T3F A; 3F2B A; 3AUO A; 3QU7 A; 2M9N A; 3JPR A; 1Q3U A; 8ICW A; 4C4S A; 2O6K A; 4UB6 U; 2N1R A; 4QIW F; 4ECZ A; 5EWE A; 4F8R A; 4AP9 A; 2ZUC A; 3SD7 A; 5DG9 A; 4QZI A; 2DKX A; 3BZC A; 1JAL A; 1ZRN A; 4O3N A; 3MC1 A; 3JPQ A; 2KJ8 A; 3N7S C; 2M0N A; 5AK5 A; 1D8Y A; 1KEJ A; 5J2E A; 4DL6 A; 2GLE A; 3PV8 A; 4B9T A; 3MGI A; 5J0W A; 4ZOH C; 4O3P A; 5JRT A; 2H3Q A; 4OJ5 A; 4DFM A; 4K4H A; 2PFN A; 3SV4 A; 1SGG A; 2A1J A; 8ICQ A; 4KLL A; 1B43 A; 1J2N A; 5HR6 A; 1SWV A; 2BCQ A; 5AKY A; 1ZQF A; 5KAF U; 5DB8 A; 5ALY A; 5DDM A; 4C8L A; 1M6Y A; 5J0P A; 4EYI B; 1IM4 A; 5KFT A; 3GU3 A; 1Z3E B; 2IBK A; 2EAN A; 3B0X A; 4ECU A; 3Q8K A; 5HNK A; 3GQC A; 1Z19 A; 4BWM A; 4UBC A; 4OJP A; 3LDA A; 2W54 A; 4DFK A; 4QZ9 A; 4GC7 A; 2YX8 A; 2NV3 A; 4QW8 A; 4PHP A; 3C29 A; 5KG6 A; 3CRX A; 3QUQ A; 3N7P D; 3OHB A; 4EZ6 A; 5AI9 A; 4F4K A; 2C22 A; 3QUT A; 3SV3 A; 1UCV A; 3KOO A; 3S6J A; 4RQ1 A; 4J03 A; 2I1Q A; 3D2N A; 5ALH A; 2AXT U; 3QEA Z; 1U9L A; 1QH9 A; 2JGA A; 2ZUB A; 1BPY A; 5KFM A; 3H8W A; 7ICJ A; 5EOZ A; 3TAR A; 1DGS A; 4DFP A; 5AKE A; 2QB1 A; 3ISC A; 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2XY6 A; 4US8 A; 2RQ5 A; 4OJ6 A; 4YMM A; 4GXI A; 1V9P A; 2F1I A; 1K5O A; 4I27 A; 4OJL A; 3GV5 B; 4DF8 A; 2RLT A; 2W9A A; 1OW5 A; 2MSN A; 3TQ1 A; 3QUB A; 3PZP A; 3EZ5 A; 4FFD A; 2BQ3 A; 5AI5 A; 4O3S A; 4I2D A; 4LZD A; 1JRP A; 2G08 A; 3F2D A; 4B9V A; 2ODG A; 1SWW A; 1ZQZ A; 1N56 A; 4JWM A; 2JR5 A; 1DOQ A; 5J8Y A; 2V9W A; 4UB3 A; 4KLT A; 4PHA A; 3QUC A; 3HPO A; 4IRD A; 3UM9 A; 1RXW A; 5AI8 A; 3RB3 A; 2DUY A; 4DSF A; 1GO3 F; 8ICR A; 4NLC A; 2A1J B; 2BHN A; 2IOF A; 9ICM A; 3SAF A; 4KLM A; 4C7Z A; 3H8J A; 5CJ7 A; 1SL0 A; 1OUQ A; 1MA7 A; 9ICJ A; 2Q4T A; 7ICI A; 1H38 A; 3KKA C; 2WAQ F; 2Y9T A; 1ZRM A; 5KFA A; 2JEF A; 1NK9 A; 1ZXI A; 4O3R A; 2K60 A; 2WF6 A; 2W04 A; 1QSY A; 2VJ5 A; 3D6J A; 2C28 A; 1RM6 C; 2H3Z A; 1FFV A; 2R8G A; 4KLS A; 2FPM A; 2IOF K; 1X6J A; 3Q8L A; 3IHQ B; 2F8L A; 9ICU A; 4GFJ A; 2C2R A; 5KG7 A; 3TFR A; 4RZR A; 1ZJM A; 3PSI A; 3K75 D; 3E58 A; 5CHG A; 1RQL A; 2A1A A; 1Q8K A; 3C28 A; 1ZQO A; 5L1I A; 3MDA A; 5KFU A; 4PGY A; 2B6G A; 4C8K A; 3GV7 B; 8ICY A; 4UAS A; 2BGW A; 4F91 B; 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