The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
50
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sequence length |
149
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structure length |
149
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Chain Sequence |
GHMDGGAGAAVSRALQQCGQLQKLIDISIGSLRGLRTKCSVSNDLTQQEIRTLEAKLVKYICKQQQSKLSVTPSDRTAELNSYPRFSDWLYIFNVRPEVVQEIPQELTLDALLEMDEAKAKEMLRRWGASTEECSRLQQALTCLRKVTG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A CC-SAM, for Coiled Coil Sterile a Motif, Domain Targets the Scaffold KSR-1 to Specific Sites in the Plasma Membrane
rcsb |
| molecule keywords |
Kinase suppressor of Ras 1
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| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
50
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| structure length |
149
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| sequence length |
149
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-11 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF13543 | SAM_KSR1 | SAM like domain present in kinase suppressor RAS 1 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2D8C A; 2GLE A; 2FE9 A; 2DKZ A; 3KKA A; 3TAD C; 2QKQ A; 5JTI A; 2ESE A; 1PK3 A; 2LPE A; 2B6G A; 3SEI A; 1SV4 A; 3H8M A; 5JRT A; 1X9X A; 1WWV A; 2Y9U A; 4IS7 A; 2D3D A; 2QAR B; 2KSO A; 1SV0 C; 4NJ8 A; 2E8P A; 4PZN A; 2K4P A; 3BQ7 A; 2EAN A; 1V38 A; 1PK1 B; 1COK A; 1JI7 A; 5KNI A; 5J8Y A; 1RG6 A; 4PZO A; 5JU5 A; 2DL0 A; 3IDW A; 3KKA C; 2YTU A; 2EAO A; 2JV3 A; 1WWU A; 2KIV A; 4NL9 A; 1F0M A; 2E8O A; 1DXS A; 1LKY B; 3K1R B; 3BS7 A; 1OXJ A; 1B0X A; 2KE7 A; 5F3X B; 2EAM A; 2LMR A; 4MHV A; 3BS5 B; 2QB0 B; 1UCV A; 2KG5 A; 5J8Y C; 1SXD A; 2KMD A; 2F44 A; 2L5Y A; 1PK1 A; 2EAP A; 1SXE A; 2Y9T A; 3TAC B; 1UQV A; 2F3N A; 4RQM A; 2E8N A; 4RQN A; 4NL9 C; 1KW4 A; 1OW5 A; 3SEN A; 3HIL A; 3TAD A; 2F8K A; 1B4F A; 1X40 A; 2K60 A; 2DKX A; 1LKY A; 2KSO B; 5L1M A; 1V85 A; 2QAR A; 1Z1V A; 1SGG A; 1SV0 A; 2ES6 A; 2QB1 A; 2E8M A; 3BS5 A; 2QB0 A; 1X66 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5CR0 A; 3NAS A; 2RDI A; 1B22 A; 4I2D A; 5D46 A; 2Y1I A; 9ICN A; 2UVU A; 4EZ6 A; 2NRT A; 3H4B A; 4BDP A; 1FFU A; 4EX6 A; 1WWV A; 2YQE A; 3V6H A; 2E8P A; 3OHA A; 1KFT A; 3BQ7 A; 4F71 A; 3EPI A; 1CI4 A; 2ASD A; 1BGX T; 1TV9 A; 4O5C A; 2A3V A; 7ICF A; 4Y2S A; 2Y0S F; 2W8K A; 2J6T A; 2XIC A; 2HVH A; 3C1Y A; 5KFG A; 5J29 A; 3OJS A; 4FFD A; 4YMO A; 4ED2 A; 3NRZ A; 2W3R A; 2FPM A; 2YMP A; 4NV0 A; 3ZDC A; 3Q8Q B; 2P6R A; 1PUZ A; 5J0R A; 4IQV A; 1F5S A; 3ISC A; 2UVW A; 3RJK A; 3C28 A; 3RB6 A; 4F4X A; 5AI8 A; 5EE1 A; 2W9C B; 3VC8 A; 1ZQL A; 5ALP A; 3HIL A; 4P0P A; 3C1Z A; 2MRL A; 7ICS A; 4PHP A; 4P0Q B; 4FS2 A; 7ICG A; 2E5S A; 3NVZ A; 1JXL A; 4KMU A; 2IBK A; 4UAT A; 1D9F A; 3EW9 A; 4ED6 A; 5ALK A; 5J2A A; 4FE3 A; 3ISB A; 2QB0 A; 4LZG A; 5EWG A; 3D2S A; 1ZQZ A; 1U47 A; 2OYY A; 3HT3 A; 4F5Q A; 2P66 A; 4ZH4 A; 4Z6D A; 5ALD A; 3Q8P B; 2JH1 A; 3V72 A; 4QIW F; 3R9K A; 4I27 A; 3B0X A; 2W9A A; 1Z4N A; 4UB1 A; 3SEI A; 1P7D A; 4QZ9 A; 2BZF A; 2IHN A; 3C5F A; 1KFD A; 2HOI A; 2Y9U A; 1AQ6 A; 3TKA A; 3PML A; 3WK5 A; 1BPE A; 3FYH A; 4ECR A; 4RPY A; 3PR4 A; 3CNH A; 3UXN A; 1COK A; 4RU9 A; 3WKA A; 3RJH A; 2BCQ A; 3JPP A; 3GIM A; 5C0Y A; 2ZXH A; 3IDW A; 8ICN A; 1S9F A; 2HCF A; 1N60 A; 4M9H A; 1WWU A; 3BDP A; 2VIX A; 4KIT B; 5JUM A; 9ICU A; 4ED0 A; 1Z00 A; 4P4O A; 4TQR A; 2BHN A; 2EZY A; 3B0Y A; 2F1H A; 2VJ4 A; 3PV8 A; 4DQQ A; 4PHA A; 3BZK A; 3CP8 A; 1IXR A; 5AKG A; 3JPN A; 9ICG A; 4O3P A; 2I6X A; 2L5Y A; 4F5R A; 4QZG A; 4JK1 A; 3TAC B; 9ICR A; 5KFL A; 3H40 A; 1KSP A; 2BQU A; 3V6J A; 3AMZ A; 4RPX A; 4UB3 A; 1JUD A; 4DOA A; 7ICM A; 4DL3 A; 2HHX A; 4RQN A; 4F3O A; 2WTF A; 4KLU A; 4OJP A; 2F8K A; 4I2C A; 1K5O A; 5AI0 A; 3JPQ A; 1TE2 A; 2J6U A; 3EPG A; 4CGZ A; 2DGZ A; 1SL0 A; 2B21 A; 1Z19 A; 1ZQC A; 2MUT A; 5J2E A; 3PW7 A; 3WKB A; 2EZX A; 7ICP A; 3RB3 A; 1Q3U A; 3MR5 A; 9ICI A; 2LYB A; 3Q8M A; 5AKY A; 4B6J A; 4R65 A; 1UT8 A; 4FZL A; 1UPH A; 2H3Q A; 3KOO A; 4K4H A; 9ICQ A; 1DK2 A; 4C8L A; 5IIK A; 3F2D A; 3TI0 A; 1T4G A; 1NK7 A; 4B9M A; 3RTV A; 4RQ4 A; 1ZQV A; 1L7N A; 5KFK A; 4ELT A; 4EYH B; 3HKZ F; 1RQN A; 3K4G A; 1CEZ A; 3E0F A; 3NGD A; 4C80 A; 5KG4 A; 4RPZ A; 3SYZ A; 1WYG A; 3KKA C; 2HHU A; 2YTU A; 1L3S A; 1Q8K A; 4P0P B; 3LWM A; 5AI9 A; 5ALQ A; 1BPD A; 2FJ6 A; 4QZC A; 4O9M A; 4DSJ A; 2EAM A; 3PX0 A; 3RBE A; 3AUO A; 5KFZ A; 4MHV A; 3T5J A; 2QB0 B; 2K89 A; 3FAH A; 1S97 A; 4GC6 A; 1SXD A; 4QW9 A; 1BPZ A; 2F44 A; 5ALT A; 4O3O A; 4I2F A; 4ED7 A; 3PW0 A; 3TAN A; 5TIS U; 2H5X A; 3JPS A; 8ICI A; 3TFS A; 4LJX A; 1Z3E B; 5DGA A; 3V7L A; 3QUB A; 4I2J A; 4B9U A; 3N7S C; 2XC9 A; 3CYM A; 2KV2 A; 4IQT A; 1UHU A; 3OSP A; 1JRO A; 3EWA A; 2OCE A; 2BDU A; 5AI5 A; 3M9O B; 3RJF A; 5L1I A; 4RNO A; 4G3I A; 7ICI A; 4G9B A; 3WK8 A; 3PO5 A; 5KFU A; 5T14 A; 4UAR A; 1XO0 A; 3PW2 A; 5AI4 A; 2FE9 A; 4I2G A; 3GIJ A; 3IM1 A; 5KG1 A; 2G07 A; 1Z00 B; 3SV3 A; 1FEZ A; 5AM4 A; 4MEY A; 4UB4 A; 1A76 A; 3BQ1 A; 1S0V A; 4FS1 A; 1L6N A; 5DQH A; 5KFO A; 1X9X A; 1SKS A; 5HNK A; 4UAS A; 2QAR B; 1ZQD A; 1L8L A; 4DQP A; 4PZN A; 1T8E A; 4DOB A; 3LVW A; 4UB8 U; 1RG6 A; 1PVQ A; 2DBY A; 1U45 A; 4NLK A; 2AGQ A; 4RQ5 A; 1TK8 A; 2JHD A; 5D4B A; 2E8O A; 2HVI A; 2FI1 A; 5ALL A; 1IIP A; 5KAF U; 1SL1 A; 2I5H A; 2C28 A; 2MUT B; 2YMQ A; 9ICS A; 1MN8 A; 3PZP A; 3C2M A; 3A0B U; 4I28 A; 2ZTE A; 5AKJ A; 3MGH A; 3LYS A; 3GV8 B; 2BGW A; 5KFJ A; 8ICY A; 5DB9 A; 4QWB A; 2JMG A; 3SMV A; 3HPO A; 3RF9 A; 1XU4 A; 5KT6 A; 2G0A A; 3QUC A; 4J9L A; 2G06 A; 2RP5 A; 4QZI A; 2MAX A; 3VCB A; 3CRX A; 4QZA A; 2BR0 A; 4ECQ A; 1TKD A; 4DSF A; 3OTQ A; 4Q44 A; 5KFA A; 2BPF A; 2LYA A; 1RZT A; 2AU0 A; 3SAH A; 4P4M A; 5DBB A; 4EEL A; 3MGV A; 3UXP A; 5AHX A; 1ZQT A; 3UM9 A; 2KIC A; 2GLE A; 5HMM A; 1L3U A; 4Z6C A; 2XI9 A; 4XRH A; 4ECT A; 4IC9 A; 4CF3 A; 1QQ5 A; 5AK5 A; 8ICR A; 4KLG A; 3WK7 A; 1YZ6 A; 3WKE A; 4CF4 A; 5KFH A; 4DFD A; 3KTQ A; 1S0O A; 5ALH A; 3C2K A; 4ED1 A; 2FMP A; 1U49 A; 4KLE A; 1JI7 A; 3AL0 B; 1X9M A; 4RQ3 A; 1HUZ A; 1RDF A; 4IRK A; 1UA1 A; 1JRP A; 4QWE A; 4Q45 A; 3UMB A; 2VA3 A; 2JV3 A; 2KIV A; 1Q3V A; 1O08 A; 2CRX A; 2FMS A; 1JX4 A; 5KFI A; 1L3V A; 9ICE A; 3T3F A; 4UB6 U; 3ZD8 A; 8ICB A; 7ICH A; 3PSF A; 1B0X A; 2B0C A; 2P6U A; 4O3M A; 4NLB A; 4TUS A; 3H0M B; 4Y2Y A; 3LWL A; 4ELV A; 4Y2X A; 1L8O A; 4Z6F A; 3L4P A; 1PK1 A; 5DGB A; 2EAP A; 1SXE A; 2HBK A; 4DF4 A; 1XC9 A; 2F3N A; 2VJ5 A; 5KFX A; 4YMN A; 1X9W A; 1BPY A; 4UAZ A; 3NTU A; 3TAD A; 5DQG A; 1DGS A; 1QTM A; 1TK0 A; 3NVY A; 4KX3 A; 4NLG A; 2KZ3 A; 2K8A A; 3QU2 A; 4CDG A; 3HJE A; 3RAX A; 5DB8 A; 2K60 A; 1NK5 A; 5KT3 A; 3GIK A; 4DS5 A; 4TUR A; 1MSW D; 1KKX A; 2GO7 A; 1N5W A; 3IV6 A; 3KHR A; 3MBY A; 1SGG A; 2J6S A; 1DK3 A; 9ICV A; 1TAQ A; 2W03 A; 3ED5 A; 3G6V A; 2DWQ A; 1OUQ A; 4UAV A; 2W7P A; 2XCP A; 2AHO B; 2NO5 A; 2XY6 A; 9ICJ A; 4YD1 A; 5KL1 B; 4RT3 A; 3RH6 A; 5ALU A; 1KBU A; 1PVR A; 2FPL A; 4DQS A; 2RRD A; 2IMW P; 2YML A; 1TK5 A; 3H8S A; 1SIJ A; 4DL2 A; 4HYK A; 2HHQ A; 2WAQ C; 2Z7J A; 5ALV A; 4WJ3 B; 4FBU A; 3PSP A; 5IIM A; 3RB4 A; 2JH7 A; 4RZR A; 3PW4 A; 2G5H B; 5DG9 A; 2ZIU B; 3N97 B; 2NRZ A; 1WUD A; 1ZD2 P; 7ICE A; 5DQI A; 2KZZ A; 9ICW A; 5BOM A; 2HSZ A; 2H3Z A; 1NJZ A; 4GXJ A; 3BQT A; 3UMC A; 2DF4 B; 3PX4 A; 4I2B A; 2XY5 A; 7ICO A; 4MF8 A; 1D8Y A; 3ETR A; 4DLE A; 4JV2 A; 2LMR A; 4M0A A; 4KTQ A; 2KTQ A; 4PPX A; 3B9J A; 2ZXI A; 4IRD A; 3ZDB A; 1RQL A; 9ICK A; 3AQE A; 3PNC A; 3RH4 A; 5AIA A; 4M04 A; 4ECZ A; 3RJJ A; 1KTQ A; 1XSL A; 4NL9 C; 5KG7 A; 1QSS A; 1KW4 A; 5BPC A; 2ALZ A; 1OW5 A; 2W9B A; 4PGX A; 9ICP A; 2BPC A; 4ACO A; 4UW9 A; 1L5U A; 4UBC A; 3PSI A; 5CRX A; 2PFN A; 1LKY A; 4AYB F; 1V85 A; 4DSK A; 1TFR A; 4F4K A; 4KMO B; 1TAU A; 3MR2 A; 4EBE A; 3ISD A; 1SWV A; 2F1J A; 2BQ3 A; 4KLS A; 3AEV A; 4NLC A; 2WB1 F; 4CF5 A; 3I28 A; 1XSP A; 3PVX A; 5AKI A; 4GC7 A; 4YQW A; 2DKZ A; 2LHT A; 8ICL A; 2RDJ A; 4YCX A; 1ZQG A; 4PGY A; 3T79 A; 3UQ0 A; 2IA6 A; 2QKQ A; 4JMU A; 1PVP A; 5J0Y A; 2R8G A; 3PY8 A; 2PMZ C; 3AN1 A; 2ATL A; 1FFV A; 3M6K A; 1NKB A; 1NNL A; 4XUS A; 2G5I B; 2RHF A; 5ALM A; 1WG8 A; 1NK4 A; 7ICQ A; 1C20 A; 3C23 A; 1PK1 B; 2A1A A; 3M7D A; 5AM1 A; 4NXZ A; 2JXJ A; 2WHE A; 2Y1J A; 4Y2P A; 5KTQ A; 2WF7 A; 5AKE A; 1SL2 A; 4LZD A; 1B43 A; 2DL0 A; 5B5E U; 1NZP A; 2KN7 A; 3T5H A; 1ZQ1 C; 1L7P A; 1ZQR A; 5DB6 A; 1KL9 A; 5ALN A; 2JGA A; 3WK6 A; 2HOQ A; 5IIJ A; 9ICC A; 5H2F U; 4EEK A; 4IL6 U; 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