The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
72
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structure length |
72
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Chain Sequence |
MDRIFMTRTEALEFLLKAHQTAVDKIGHPSHKQTPADHAAIEALDRLLLDVRARRVDQFQINASAAQIIVTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR structure for potential drug target from Burkholderia thailandensis E264
rcsb |
| molecule keywords |
Uncharacterized protein BTH I2711
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| molecule tags |
Unknown function
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| source organism |
Burkholderia thailandensis e264
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| total genus |
15
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| structure length |
72
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| sequence length |
72
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-07-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2MRL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2C2D A; 2HDO A; 3F5E A; 5EE3 A; 3RBE A; 1C20 A; 3GU3 A; 5EE0 A; 3L4P A; 1UT5 A; 4K4I A; 1NJX A; 7ICT A; 1COK A; 5ALS A; 3TAR A; 4BWM A; 4MF8 A; 4ECR A; 2VJ4 A; 4UW9 A; 4ECT A; 4I27 A; 1KL9 A; 1SKS A; 7ICU A; 1RQL A; 1Q46 A; 3QU9 A; 1D8L A; 2KJ8 A; 3TAC B; 4PPX A; 2K60 A; 3B0Y A; 1ZQA A; 3Q8Q B; 4RUC A; 4UBB A; 3ZDE A; 4QZE A; 1ZJN A; 2V9W A; 1Z19 A; 3ONN A; 3WU2 U; 2PXI A; 4RQM A; 2QKQ A; 4R8U B; 3RRH A; 1ZET A; 2QLT A; 4NJ8 A; 3BDP A; 2KP7 A; 3NAS A; 5G5H A; 1ZQF A; 1JUD A; 5EWF A; 1UHU A; 3HRD D; 3UQ0 A; 3AUO A; 3V7K A; 4KLE A; 3WK9 A; 4DCC A; 4QZG A; 4DL2 A; 1PVP A; 1SL2 A; 5AI8 A; 1N5W A; 3C5F A; 4PL1 A; 2KKV A; 3N28 A; 4M6W B; 3M1Y A; 3OJU A; 5A0L A; 2HVI A; 1V38 A; 1S0O A; 1RDF A; 5AKX A; 3PW0 A; 5AKJ A; 2HBJ A; 1JMS A; 2VJ5 A; 2FPL A; 2FLL A; 4I2D A; 4P0Q B; 5J2H A; 2Q0Z X; 1ZQL A; 7ICP A; 3AN1 A; 5J2J A; 3QNM A; 1ZQB A; 4I2F A; 2CN1 A; 3U26 A; 9ICI A; 5IIM A; 2P6U A; 5L1I A; 2AXT U; 3T5K A; 1SKR A; 2K8C B; 4O3R A; 5FP0 A; 4EEN A; 1N63 A; 3ZDD A; 2WF9 A; 1LKY B; 1FFU A; 4RQ6 A; 4R64 A; 4I2H A; 4I2E A; 2W8K A; 3EPG A; 2BQ3 A; 1DXS A; 4UAW A; 2E5S A; 2HI0 A; 4RQ1 A; 8ICN A; 4USA A; 3H8J A; 3I76 A; 1X9S A; 4Q8F A; 3AU2 A; 3IV6 A; 2BDP A; 7ICE A; 3ORY A; 2H3I A; 3Q8P B; 4RNN A; 1RPL A; 4GXJ A; 3J81 j; 4XQ8 A; 3K75 D; 2HHS A; 4C8M A; 2MRL A; 2KTQ A; 2A3V A; 1WCL A; 3BQ7 A; 4JB3 A; 4BUG A; 4EBE A; 2K8B B; 4M9N A; 3N7P D; 3NVY A; 9ICX A; 3JPQ A; 2OYY A; 4DQP A; 4YMO A; 2QAR A; 4NLG A; 4ED0 A; 1N48 A; 5AHX A; 8ICB A; 1MQ3 A; 3AQF A; 4PL2 A; 1IV8 A; 5D49 A; 4LZD A; 2DGZ A; 3SAG A; 4UB3 A; 3RAQ A; 3DV9 A; 3EPI A; 1JX4 A; 3IG5 A; 3RR8 A; 2R8K A; 2KEY A; 4C80 A; 2XY5 A; 4X5V A; 2W54 A; 2ZTD A; 4I2I A; 4NLN A; 1ZXI A; 2EH9 A; 7ICR A; 5DG7 A; 4YMN A; 2YB1 A; 4J9R A; 2W7P A; 5J8Y C; 9ICS A; 8ICU A; 2XID A; 2UVR A; 4FO6 A; 1DK3 A; 3PW4 A; 2A1J B; 2ESE A; 2W9A A; 1BNO A; 5KFP A; 1U45 A; 2KKP A; 4UB1 A; 1KKX A; 1NKE A; 8ICV A; 4B9U A; 2BCQ A; 5AK4 A; 4EBC A; 1ZQK A; 2D6F C; 4F5Q A; 3KKA C; 2BZF A; 2KHV A; 4FE3 A; 3PNC A; 2W9B A; 4M9H A; 2P6R A; 3UMB A; 3SV3 A; 4G9B A; 3S6J A; 4XA5 A; 1PZN A; 1ZRM A; 1K1S A; 2WAQ C; 3VC8 A; 4ECU A; 4EX6 A; 4PGY A; 4Z6F A; 4M04 A; 2LMR A; 2WFA A; 1YZ7 A; 1MSW D; 4J9Q A; 5J2D A; 1SV4 A; 9ICU A; 2AH5 A; 3I28 A; 3F2D A; 1NJY A; 2EAN A; 4QWB A; 2IOF K; 5AM0 A; 3M7D A; 5B66 U; 9ICE A; 1Q3U A; 5KG0 A; 4KLH A; 2BGW A; 3BQ0 A; 4F92 B; 1X9M A; 4LVS A; 1SIJ A; 1ZD2 P; 2W8L A; 5AK3 A; 1T94 A; 2EZZ A; 1VDV A; 4IQU A; 1NJW A; 2B21 A; 4Q45 A; 2OM6 A; 1ZQT A; 5J2A A; 3HPO A; 8ICW A; 2XGQ A; 2XC9 A; 1KFD A; 2L5Y A; 3SEI A; 5KFF A; 2J6S A; 2KZ3 A; 4YG2 A; 5AIB A; 5ALW A; 8ICE A; 8ICG A; 1NOM A; 2GOL A; 4OO1 J; 1QCK A; 4F50 A; 3L5K A; 4FZL A; 3LWL A; 3M9N B; 3FAH A; 5AIC A; 2IA6 A; 2HCF A; 2HBL A; 2K8A A; 3M8S A; 4B9S A; 4FZM A; 2G06 A; 2FLN A; 5CA7 A; 4BXO B; 1CEZ A; 3EWA A; 1BPB A; 4QZH A; 8ICS A; 3H0L B; 5J0Q A; 4P0P A; 4US9 A; 1RZT A; 2FDR A; 3NUQ A; 5AKL A; 3G6Y A; 4DQS A; 2BQR A; 1SL1 A; 1QQ6 A; 3LVV A; 3UMG A; 2IHM A; 4CF3 A; 4M47 A; 1A0P A; 1WCN A; 2F1J A; 2LI6 A; 1PK1 A; 3T5H A; 3GV5 B; 4GXK A; 1NK0 A; 4F8R A; 4BX9 C; 3NRZ A; 8ICJ A; 4NM1 A; 4C7Y A; 2VAN A; 5T14 A; 3ZI4 A; 4DFM A; 2WF7 A; 5DB9 A; 2W3S A; 9ICG A; 1ARO P; 2H3Z A; 3KHH A; 4YD2 A; 5HP4 A; 2WF6 A; 3GIL A; 1IM4 A; 4IC9 A; 2LM1 A; 3AL0 B; 1L3T A; 3DEE A; 4WJ3 B; 4KLD A; 2DFL A; 1NI3 A; 2W9C A; 1NZB A; 4FBU A; 3TFS A; 4ELU A; 3V72 A; 4B9L A; 1FEZ A; 2J6T A; 2XGP A; 3FYH A; 1BVS A; 3M8R A; 5ALO A; 2OWO A; 3PML A; 4XUS A; 2QB0 B; 3JPN A; 1S0V A; 5AKY A; 1QSY A; 7ICH A; 1QLN A; 5DDM A; 2XO7 A; 5CB1 A; 2KIW A; 3UXP A; 8ICH A; 1RM6 C; 3GV7 B; 4O5E A; 5KL8 B; 1X6I A; 2H3F A; 2KOB A; 2WTF A; 4DFD A; 5KFH A; 4AP9 A; 3MGH A; 4DSE A; 3O0F A; 2ZIU B; 5DBB A; 4RT2 A; 5KG3 A; 3JPO A; 1TKD A; 5ALG A; 4O3S A; 3PW7 A; 9ICO A; 3WKB A; 2FMS A; 1ZQ1 C; 4F5R A; 5AM4 A; 4JWM A; 4BGD A; 1NK7 A; 2DBY A; 1C7Y A; 2C2E A; 1BPE A; 2C28 A; 5KTQ A; 2ALZ A; 4F2R A; 4F4K A; 1ZQE A; 1V85 A; 5ALY A; 2KMD A; 2E8O A; 3H4B A; 3SYZ A; 3MBY A; 5KFL A; 5BOL A; 2LBO A; 3N4M B; 4PJ0 U; 1XSN A; 1NNL A; 5J29 A; 4F2S A; 1WWV A; 1JI7 A; 5JUM A; 5J2G A; 3IN5 A; 2VA8 A; 2ZIW A; 9ICH A; 4B9V A; 4OD0 A; 2WF5 A; 2BCS A; 2AGO A; 2OEH A; 4CRX A; 3HJE A; 2J6U A; 2KFZ A; 3GFK B; 5AIA A; 2DL0 A; 2DPJ A; 1L5U A; 4DOC A; 1L8L A; 2YMM A; 4KLQ A; 2JZB A; 4Y2Y A; 4JV0 A; 4FS2 A; 5CP2 A; 2W7O A; 2XI9 A; 7ICQ A; 1VJ5 A; 2FMQ A; 1Z4O A; 4RZR A; 4YQW A; 2I1Q A; 5KFM A; 4QZC A; 3TAN A; 2AQ4 A; 1L8O A; 9ICW A; 1FO4 A; 4QW8 A; 4PHP A; 2KV2 A; 4J9O A; 1ZQQ A; 4I2B A; 2IHN A; 4RQ3 A; 5DDY A; 4DLE A; 4QWE A; 3RJF A; 3V6K A; 1KFS A; 2JHD A; 3NRW A; 2HHX A; 4I28 A; 2Q4T A; 8ICL A; 1WUD A; 3RB0 A; 2R8G A; 5KNI A; 3PMN A; 3C23 A; 2ZJ8 A; 1URJ A; 1S8O A; 2BKE A; 3SR6 A; 2JH7 A; 5ALT A; 5KAI U; 3L3F X; 4DLG A; 2C2R A; 5DG8 A; 4C0Z A; 3H0M B; 2XY7 A; 4C4S A; 4B9N A; 3UPQ A; 3HWT A; 4Q8E A; 2XY6 A; 1ZQP A; 1DGS A; 1OXJ A; 1WG8 A; 2EQY A; 4ECY A; 5KFY A; 3QZ8 A; 4ED6 A; 4B9T A; 2FPK A; 5ALV A; 4C8L A; 1L3V A; 2BCU A; 1ZQS A; 4BJQ A; 4F93 B; 3GIJ A; 3V6J A; 4EEK A; 3C5G A; 1ZJM A; 5ALN A; 4MFC A; 5J2F A; 4KLF A; 4PGQ A; 4R63 A; 3A0B U; 2A19 A; 2CPR A; 5J2I A; 1ZQZ A; 4Q44 A; 3RRG A; 1Z4N A; 2RDJ A; 3OPX A; 1X2I A; 3TAD C; 4A8E A; 4DL3 A; 2CXY A; 5KT6 A; 1XNS A; 3RJI A; 2FLP A; 1SGG A; 5KG1 A; 5KT3 A; 3SAF A; 1S0M A; 4DOB A; 8ICQ A; 4NM2 A; 3T5L A; 2KVC A; 4ICA A; 4RQ7 A; 2RRD A; 2VIX A; 1B43 A; 1ZQV A; 4B6J A; 5BPC A; 4YMM A; 1TAM A; 2KHQ A; 4C8N A; 4KMO B; 2G08 A; 4UAV A; 2RP5 A; 1LB2 B; 5DLG A; 1IG6 A; 3M9M B; 9ICJ A; 2R8H A; 3PR4 A; 3F53 A; 4DF8 A; 9ICN A; 2BPC A; 4TUR A; 5E79 U; 2AGQ A; 3HKZ C; 2K4E A; 3B9J A; 3HKZ F; 3KD3 A; 4F3O A; 5KFI A; 5KG4 A; 5EWG A; 4CF5 A; 3G6X A; 4F5P A; 5KFV A; 3AM9 A; 4Y2Q A; 3T3F A; 3F2B A; 1EXN A; 1S9F A; 3RB6 A; 4US8 A; 4ECW A; 4JMU A; 2RHF A; 4CNQ A; 4QZ9 A; 2V4Q A; 4QZD A; 3BS5 A; 1BPY A; 1O03 A; 3N7R C; 5HMM A; 4EZ9 A; 1TK0 A; 5AKI A; 2GWS A; 2FJ6 A; 2JXJ A; 4OJP A; 2Y0S F; 3FDS A; 4P4P A; 5KFU A; 8ICO A; 1D9F A; 5CWR A; 4KLM A; 2ZJA A; 2LHT A; 4IRK A; 4RNO A; 2H5X A; 1T7P A; 9ICC A; 4UB2 A; 3BQ1 A; 5J2B A; 2KSO A; 2KVS A; 1TK5 A; 4M0A A; 4M6W A; 9ICR A; 4U6P A; 1N61 A; 4FZN A; 3KHL A; 7ICO A; 1ECW A; 2ZTC A; 1UCV A; 1FFV A; 2H3Q A; 3E2E A; 2EAO A; 4F5N A; 5AKH A; 1RXW A; 4P0Q A; 3WK4 A; 3MC1 A; 3FM9 A; 2JEG A; 3PO5 A; 2ZXH A; 5ALF A; 3D2N A; 4M2Y A; 4Y2X A; 2ZXI A; 7ICM A; 2ZJ5 A; 1X9X A; 1P7D A; 2HSZ A; 4F4X A; 5DB7 A; 3ZDA A; 3C28 A; 4HAI A; 3OJS A; 2ASJ A; 4YD1 A; 4Y2R A; 3TFR A; 3UXO A; 1SWW A; 4Y2T A; 2XIC A; 2R18 A; 4CDG A; 3E0F A; 2EZX A; 2ASL A; 1L3S A; 1IXR A; 4Y2J A; 2KJ9 A; 4IRD A; 2EZY A; 2DF4 B; 1T3N A; 5CRX A; 2DUY A; 4I2C A; 1QQ5 A; 3R9K A; 1NK6 A; 1F5S A; 4KLL A; 5DB8 A; 1XSL A; 5CR0 A; 2KFN A; 2W9B B; 2XVT A; 5KT7 A; 4PZO A; 3PY8 A; 1SV0 A; 2K4P A; 1A6S A; 1JXL A; 4KLJ A; 5F3X B; 3ALR A; 3RB4 A; 1U4B A; 2ZIV A; 5KFT A; 5CHG A; 4KX5 A; 4G3I A; 1SXE A; 3IRU A; 4DL6 A; 2NRZ A; 3PX4 A; 3H8W A; 4GFJ A; 2ZUB A; 4FFD A; 1CI4 A; 3PSP A; 4LJX A; 2IBK A; 3H40 A; 2ISO A; 3V7J A; 1ZQG A; 2ES6 A; 4DSJ A; 3OTQ A; 3LK9 A; 3CNH A; 2LYH A; 4UB5 A; 3KZI U; 4YR3 A; 2VA2 A; 7ICN A; 1S10 A; 1XO0 A; 2KIV A; 2YQE A; 3HP6 A; 3QU2 A; 4O5C A; 3F5A A; 5JTI A; 1RYR A; 1X9W A; 4J9L A; 3RBD A; 4ELT A; 5III A; 2PKE A; 3Q8S B; 1IIP A; 1GO3 F; 4IL6 U; 4PHA A; 3I1Y A; 4ED3 A; 2HHU A; 4P4O A; 4J9P A; 2UVV A; 5DQH A; 4DS5 A; 3RH4 A; 3MR2 A; 4IRC A; 5C5J A; 2BHN A; 4RQ4 A; 2PI5 A; 3H7I A; 2EAM A; 3C2K A; 1X6J A; 4O3P A; 4OCZ A; 4QWC A; 4DQR A; 3SAH A; 1MQ2 A; 5IIO A; 5J0P A; 3PO4 A; 1ZQU A; 7ICI A; 4JK1 A; 4EBD A; 4ACO A; 4J9S A; 5ALD A; 3QUQ A; 8ICA A; 1D8B A; 5KT5 A; 4P0P B; 1KDH A; 2JV3 A; 9ICM A; 4MF2 A; 1UQV A; 4PGX A; 3WKA A; 3GIM A; 4UBC A; 1KBU A; 5CJ7 A; 3RF9 A; 4O5K A; 3RJK A; 2MUT A; 3HX0 A; 2HMX A; 1PK1 B; 2XCP A; 3OSP A; 5DG9 A; 2KNJ A; 3BZC A; 9ICL A; 2C22 A; 2KG5 A; 2W3R A; 2MA1 A; 2R8J A; 2F3N A; 3NS1 A; 5B5E U; 1DK2 A; 4QZF A; 3BS7 A; 3HW8 A; 1X66 A; 3UM9 A; 1NJZ A; 1ED1 A; 5AM5 A; 1T4G A; 3QXG A; 2E1F A; 2W9C B; 5IIL A; 1KTQ A; 3MAB A; 5ALU A; 3AU6 A; 1ZYQ A; 4YN4 A; 4NWI A; 3RFA A; 3CRX A; 2W03 A; 4KX3 A; 3OHB A; 5L1M A; 3MFI A; 2OH2 A; 1BPX A; 5KFW A; 2FI1 A; 2KIC A; 2BR0 A; 1CRX A; 4OJ6 A; 4RPZ A; 5HR6 A; 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3QUT A; 7ICL A; 8ICR A; 2YX8 A; 5JRT A; 4DSF A; 1JIH A; 2YY6 A; 4GLX A; 1PK3 A; 2F2A B; 4YCX A; 4F4Z A; 3WKD A; 4QZA A; 4DQQ A; 2HHQ A; 1COO A; 3EUB 2; 3SZ2 A; 4TUP A; 1ZD4 A; 4ECV A; 4C8O A; 3ED5 A; 1RG6 A; 2K4I A; 2M9N A; 4KMU A; 3NTU A; 4Z6D A; 1ZQM A; 5G5G A; 2E3T A; 3NVW A; 5F9N A; 4BWJ A; 3FC4 A; 3VCB A; 1WYG A; 4O9M A; 4QZ8 A; 7ICF A; 1RYS A; 3PV8 A; 3TAP A; 3GDX A; 1NKB A; 1TAQ A; 3C29 A; 1JAL A; 3Q8K A; 2G5I B; 1N56 A; 4PHE A; 1U49 A; 1TK8 A; 4GXI A; 4IQV A; 2YMP A; 1Q8K A; 2E1E A; 5AI4 A; 3SMV A; 8ICC A; 3UMC A; 1ZQH A; 1HUZ A; 1SKW A; 3IP4 B; 1ZQR A; 4YXJ A; 3UQ2 A; 1UT8 A; 4ED2 A; 5TZV A; 2PMZ F; 5HR7 A; 2PFO A; 1L3U A; 3A0H U; 1ZQW A; 1L7M A; 4UB8 U; 3KTQ A; 2WHE A; 1S97 A; 4KLT A; 4KLG A; 2F8L A; 1NK5 A; 2K89 A; 1BNP A; 3ETR A; 5L9X A; 1NK4 A; 5AM1 A; 1SZH A; 1Q3V A; 4TUQ A; 1JN3 A; 4TQR A; 1SL0 A; 1F0M A; 2GLE A; 5AKG A; 3M9O B; 4UB4 A; 3RTV A; 9ICV A; 4TUS A; 3ZD8 A; 4DQI A; 4K4G A; 5CEH A; 1ZQN A; 2KZZ A; 3PR5 B; 5AK6 A; 1ZRN A; 3Q8M A; 2KD1 A; 4Y2V A; 3K4G A; 4R66 A; 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