The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
86
|
structure length |
86
|
Chain Sequence |
ASIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLSPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDELYELLQHILKQRPGGGGST
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
E80-TELSAM domain
|
| molecule tags |
Hydrolase regulator
|
| source organism |
Escherichia coli
|
| total genus |
19
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| structure length |
86
|
| sequence length |
86
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3BS7 A; 4MHV A; 1SV0 C; 5KNI A; 2EAM A; 2D8C A; 2JV3 A; 4NJ8 A; 2QB1 A; 4NL9 C; 5J8Y C; 3K1R B; 1WWU A; 2E8N A; 4RQN A; 2KSO A; 3KKA C; 3SEI A; 1PK3 A; 2QKQ A; 2LPE A; 5JTI A; 2QB0 B; 2EAN A; 2EAP A; 1SXE A; 3H8M A; 2Y9U A; 5F3X B; 1X40 A; 1LKY B; 1Z1V A; 1DXS A; 2E8O A; 1F0M A; 5L1M A; 4PZN A; 2ES6 A; 3TAD A; 5JRT A; 1B4F A; 2QB0 A; 1PK1 B; 1KW4 A; 5JU5 A; 1JI7 A; 1B0X A; 1OXJ A; 2Y9T A; 1LKY A; 1V38 A; 4IS7 A; 1UCV A; 3BQ7 A; 3TAC B; 3HIL A; 1COK A; 2DKZ A; 3KKA A; 1SGG A; 1SXD A; 1X9X A; 1SV4 A; 2KG5 A; 2KMD A; 1PK1 A; 2LMR A; 4PZO A; 2K4P A; 2F8K A; 3BS5 B; 2ESE A; 2F3N A; 1SV0 A; 1V85 A; 2DL0 A; 2GLE A; 1X66 A; 2KIV A; 2E8P A; 2QAR B; 1OW5 A; 2EAO A; 3SEN A; 3IDW A; 4NL9 A; 5J8Y A; 2K60 A; 3TAD C; 2D3D A; 3BS5 A; 2B6G A; 2E8M A; 2QAR A; 2F44 A; 2L5Y A; 4RQM A; 1RG6 A; 2KE7 A; 1UQV A; 2YTU A; 1WWV A; 2FE9 A; 2KSO B; 2DKX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4J9M A; 3C28 A; 2BDP A; 4MHV A; 3BQ1 A; 1XU4 A; 1ZJM A; 4NM1 A; 3QX7 A; 4UB4 A; 1KL9 A; 9ICG A; 4M9J A; 1TAM A; 3MFI A; 2R8K A; 3RB3 A; 1J97 A; 4EEL A; 3JPO A; 3ISD A; 2WF9 A; 1DGS A; 4MF8 A; 1TK5 A; 4NLZ A; 2ZXH A; 3D6J A; 4YMM A; 1JMS A; 4FZM A; 2BCU A; 3ALR A; 1T3N A; 9ICC A; 3C2L A; 2K4E A; 3KD3 A; 2OYY A; 4JB3 A; 3CYM A; 1L3S A; 4MFC A; 4JMU A; 4O3O A; 4IRK A; 2J6U A; 4I27 A; 5KT5 A; 2MUT A; 1TVA A; 3F53 A; 3PST A; 4P4O A; 3GIM A; 4Y2J A; 5JU5 A; 4UQG A; 3GIJ A; 3PSF A; 2HHQ A; 1V38 A; 5ALV A; 2KKP A; 3HIL A; 3WKC A; 3D2S A; 1SZP A; 4J9R A; 3M9N B; 4TQS A; 4M6W B; 1X6J A; 2ZTC A; 5EOZ A; 2W9M A; 4J9O A; 1D9F A; 1L5U A; 4DF8 A; 1X66 A; 4TUS A; 2KIV A; 1N48 A; 4Z6C A; 2NV3 A; 3B0Y A; 3EZ5 A; 2BGW A; 1ZQE A; 3GIK A; 4JWN A; 5IIK A; 3AN1 A; 3M8S A; 3L3F X; 5KFK A; 1WG8 A; 2B6G A; 1NJX A; 5J0O A; 4F2S A; 2UVV A; 2KD1 A; 2H3Z A; 4QWD A; 1JN3 A; 2LYH A; 2HHW A; 2IBK A; 4FBT A; 1L3V A; 1B43 A; 3KHH A; 7ICL A; 4QW9 A; 2ZIV B; 2KTQ A; 1BPB A; 4FBU A; 1TE2 A; 4PHD A; 2IA6 A; 1ZD4 A; 4DF4 A; 2LYB A; 4DOA A; 1U45 A; 3QU5 A; 4J9Q A; 5J0W A; 2ZIX A; 4EX6 A; 2OCE A; 5AM0 A; 5DB9 A; 5CB1 A; 4QIW C; 1L8L A; 5ALU A; 2JH7 A; 5IIJ A; 7ICK A; 2WAQ C; 1PZN A; 1LV5 A; 5F3X B; 3K4G A; 4BWM A; 5DDY A; 4KIT B; 4QNL A; 2N1R A; 4BDP A; 1F0M A; 4PHE A; 5AKZ A; 1UA1 A; 5HHH A; 1KW4 A; 5AIA A; 5KFX A; 5J2I A; 1OXJ A; 2ISP A; 5ALY A; 4O3Q A; 1LB2 B; 4QWA A; 5EE1 A; 1YZ7 A; 1K1S A; 5J2A A; 7ICN A; 5KFA A; 4CRX A; 5GTI U; 4PGX A; 3TFR A; 4US8 A; 9ICN A; 5EWE A; 5KFE A; 4P0P B; 3GII A; 9ICI A; 2JR5 A; 4RQ5 A; 2XY5 A; 3HKZ C; 4KTQ A; 4JWM A; 1S77 D; 3RJJ A; 2ZJ5 A; 3AU6 A; 3RR7 A; 5ALQ A; 5BOM A; 3TAD C; 1KRP A; 1BPZ A; 2HOI A; 2BQR A; 3F2B A; 1FIQ A; 8ICQ A; 3TI0 A; 8ICN A; 3M6K A; 4NXZ A; 3C2M A; 5F9N A; 2DBY A; 5AKI A; 4RQ4 A; 1WWV A; 5CRX A; 8ICH A; 9ICH A; 4RU9 A; 4NLC A; 5ALH A; 2E5S A; 1ZRM A; 3RH6 A; 8ICL A; 3RH4 A; 3SD7 A; 1NJW A; 5IIO A; 5ALN A; 4DSL A; 3V72 A; 3WKA A; 4M9G A; 2UVU A; 4LVS A; 4F5N A; 4DL5 A; 2JV3 A; 4U6P A; 4NLB A; 5KG6 A; 4NLN A; 4IQU A; 3KKA C; 2F8L A; 2KJ9 A; 4GIB A; 2LPE A; 1C20 A; 3ORY A; 3WK8 A; 4YD1 A; 4K4I A; 3EWA A; 4C7Y A; 4U7C A; 2V9W A; 1ZQT A; 5AI4 A; 1DRG A; 4I2A A; 4DOB A; 7ICT A; 3H7I A; 4UAS A; 1XO1 A; 3JPT A; 8ICM A; 4PHA A; 4CF3 A; 4QW8 A; 3JPP A; 1B4F A; 2W9B B; 3RTV A; 4DWI A; 1TK8 A; 4UB8 U; 5KFL A; 4R8U B; 5EE0 A; 1QCK A; 1MSW D; 3C5G A; 2KJ5 A; 1SV4 A; 2KFZ A; 9ICF A; 2K4I A; 3CW2 C; 3PZP A; 2FPL A; 3I1Y A; 2E3T A; 1S0M A; 4DS4 A; 5KFB A; 1SWV A; 2PFQ A; 4NLG A; 3IRU A; 2FLL A; 2I9G A; 2RHF A; 5CJ7 A; 5KFM A; 4TQR A; 3QYP A; 2VA3 A; 1T94 A; 5K4L A; 3JPN A; 4F8R A; 1U48 A; 1TFR A; 2WB1 F; 2K89 A; 4TUP A; 1SKS A; 5J0U A; 9ICP A; 2BPG A; 1SWW A; 2YB4 A; 1FFV A; 5KT7 A; 4I2I A; 5DLF A; 2WF8 A; 8ICW A; 3EPI A; 3AM9 A; 1Q3V A; 1S0N A; 2KZZ A; 3MGI A; 4YD2 A; 4XQ8 A; 4MF2 A; 4UB5 A; 4F5O A; 3IM1 A; 4KMU A; 2XO7 A; 8ICB A; 4C8N A; 3RJI A; 1VJ5 A; 9ICA A; 5KAF U; 2AQ0 A; 3HX0 A; 7ICR A; 1IXR A; 4YMO A; 4O3R A; 1X2I A; 2HHV A; 2KVC A; 5JTI A; 4DFP A; 3IN5 A; 1LVH A; 2J6S A; 2DQN B; 3F2D A; 4JV2 A; 3HW8 A; 5HMM A; 1KBU A; 1X40 A; 1LKY B; 3PY8 A; 9ICS A; 1IM4 A; 3AUO A; 2PFN A; 5KT6 A; 4DFK A; 2Y1J A; 2H3F A; 5KFC A; 3OHB A; 2LBO A; 3NVY A; 1XSL A; 2W55 A; 1F44 A; 4DLG A; 5KG0 A; 3RF9 A; 5HR6 A; 5L1K A; 4FE3 A; 2HI0 A; 4KLJ A; 1COK A; 2R8I A; 1KKX A; 2Q0Z X; 1SXD A; 1KQQ A; 3TQ1 A; 3LYS A; 5EE3 A; 1Y88 A; 2YQE A; 2KMD A; 4C8O A; 5KFJ A; 2M9N A; 5GTH U; 1SV0 A; 3PW7 A; 3WK4 A; 4A8E A; 2BQU A; 2E8P A; 3C2K A; 3MGV A; 4CGZ A; 4EEK A; 3IDW A; 3H4D A; 2K60 A; 1GO3 F; 4B9V A; 5KAI U; 4J9P A; 4OJL A; 1K1Q A; 4QZ8 A; 4JK1 A; 2ZUB A; 2F44 A; 3NRW A; 2OXO A; 1ZQQ A; 4RQM A; 5ALT A; 5KT4 A; 2AH5 A; 1TK0 A; 3BJY A; 1MA7 A; 2FJ6 A; 5KG1 A; 7ICO A; 3RRH A; 4UAW A; 2XVT A; 1L8O A; 5J0R A; 2K8C B; 4J9K A; 2UVW A; 4KX5 A; 1L7O A; 3WK6 A; 1ZJN A; 3SYZ A; 1TKD A; 4BWJ A; 4ECR A; 2IMW P; 3GU3 A; 3N7R C; 4OJ5 A; 4F5Q A; 4F4X A; 1L6N A; 4EZ9 A; 4M47 A; 2JGA A; 2KSO A; 4WJ3 B; 3EW9 A; 4QZD A; 2ALZ A; 4PPX A; 5AK5 A; 3IG8 A; 1ZQO A; 3D2Q A; 2EAN A; 2LI6 A; 5DB6 A; 2H3V A; 2DPI A; 4M0A A; 9ICO A; 1SXE A; 5CEH A; 2HCF A; 5HHI A; 1BPD A; 2HHU A; 2KHV A; 4O5C A; 4FZL A; 5AM2 A; 4ECX A; 4IRC A; 1DGJ A; 4YMN A; 2PXI A; 3ZDE A; 1PK1 B; 2GO7 A; 4Y2S A; 3NAS A; 3B0X A; 2BPF A; 3EPG A; 4BX9 C; 2YN4 A; 7ICH A; 4X5V A; 2W11 A; 1UCV A; 4UAZ A; 2IOF A; 4QWE A; 1X9M A; 2DGZ A; 5AKJ A; 3JPQ A; 1SKW A; 2GWS A; 2JMG A; 3H8S A; 2W03 A; 4RQ8 A; 1AQ6 A; 8ICO A; 4Y2P A; 2F1H A; 4UBC A; 5DGA A; 4QZC A; 3QZ8 A; 5IIN A; 4M9L A; 5AI0 A; 2RDJ A; 3OJU A; 4HYK A; 1CUK A; 3T3F A; 2MRL A; 1D8B A; 2KHQ A; 3N97 B; 1S10 A; 9ICT A; 1S5L U; 5J2G A; 4RT3 A; 4BXO B; 5J2H A; 3BS5 A; 2H3I A; 5DB7 A; 2NRX A; 4F4W A; 1U9L A; 4C4R A; 2FPM A; 4IR9 A; 5DQH A; 4ECZ A; 5KFS A; 4E0D A; 1L7P A; 1TAQ A; 3T5K A; 1S9F A; 4Y2X A; 5KFG A; 2DKX A; 5KT3 A; 4DSF A; 1WUD A; 2LYA A; 3A0H U; 3DV9 A; 5KNI A; 1KEJ A; 4UAR A; 4DQI A; 3E0F A; 4R63 A; 3T79 A; 4I29 A; 3LVV A; 3RH5 A; 4I2G A; 3KBB A; 1SZH A; 4PGQ A; 3ISC A; 2KIC A; 5J0T A; 1PK3 A; 4UAV A; 8ICK A; 4DEZ A; 5HP4 A; 4OJO A; 3RRG A; 1X9S A; 3F5E A; 2K4H A; 4RPY A; 2RLT A; 4DL6 A; 1JIH A; 4GC7 A; 1QQ6 A; 4RQ2 A; 5L1M A; 1NK9 A; 3HPO A; 3PMN A; 4YR2 A; 1BPY A; 2PMZ F; 2FMS A; 2Y9T A; 1ZQJ A; 2KKV A; 4GFJ A; 5ALI A; 2ZJ8 A; 2OHF A; 1NZB A; 3H0R B; 1X9X A; 2AJQ A; 1NI3 A; 1MC8 A; 4PJ0 U; 2KG5 A; 1SKR A; 3CNH A; 3CRX A; 1D8Y A; 4EX7 A; 1V85 A; 1ZQW A; 3N4M B; 2F2A B; 2EZY A; 3G6X A; 1RXV A; 5CWR A; 5DBC A; 2OEH A; 2KN7 A; 1NZP A; 4NL9 A; 2DFL A; 4ECV A; 4M6W A; 1N5X A; 1NK7 A; 3H4B A; 2YML A; 4KLI A; 2XGP A; 2E8M A; 2G07 A; 8ICU A; 2K8B B; 3H0M B; 4GXI A; 3PR4 A; 7ICU A; 1PUZ A; 4YP3 A; 5HR7 A; 1UQV A; 1ZXI A; 4HAI A; 2YMM A; 5KG2 A; 1SL1 A; 5J2B A; 1ZQ1 C; 1SV0 C; 4FZN A; 1X42 A; 3GFK B; 2BCR A; 4KLS A; 3IP4 B; 2W04 A; 1N2X A; 2F76 X; 3HRD D; 4J9N A; 3Q8R B; 2HHS A; 3U26 A; 1ZQA A; 2YB1 A; 3KHG A; 2ZIV A; 5F9L A; 1T3Q A; 4ED1 A; 1VLB A; 3HWT A; 1QSY A; 3PNC A; 4RQ1 A; 1URJ A; 4YFK A; 4C8L A; 4M04 A; 1VDV A; 1UA0 A; 2FDR A; 2G06 A; 4KLU A; 3ZI4 A; 1D8L A; 9ICU A; 2PFP A; 3WU2 U; 4ECS A; 1MQ2 A; 1DXS A; 2E8O A; 2LM1 A; 3OJS A; 9ICM A; 3JPS A; 4KLH A; 2ES6 A; 3M7D A; 4MEY A; 4F92 B; 4IC9 A; 4USA A; 4DO9 A; 9ICJ A; 1ZET A; 1J2N A; 5KFP A; 7ICV A; 1JUD A; 2KIW A; 2A1A A; 4Q44 A; 4OO1 J; 5BOL A; 4DQP A; 5ALR A; 2BHN A; 2KV2 A; 2BPC A; 5ALK A; 5ALF A; 1XC9 A; 5DG7 A; 3RAQ A; 3WKD A; 2KEY A; 3SV4 A; 2GLE A; 3L5K A; 3NTU A; 4EBE A; 2CPR A; 4I2B A; 4RUC A; 2GOL A; 4DCC A; 3QE9 Y; 3MAB A; 7ICS A; 2E1E A; 4Y2T A; 3JPR A; 2W8L A; 3SI8 A; 2W3S A; 5DLG A; 3UXN A; 4FO6 A; 4ELT A; 4DFJ A; 2C2R A; 2L5Y A; 1BNO A; 4EZ6 A; 3RFA A; 5DG9 A; 4UBB A; 2WFA A; 1ZQR A; 2AGO A; 3WKB A; 3LDA A; 2FE9 A; 4B9N A; 1OUQ A; 4AYB C; 1N63 A; 1S0O A; 2ZIW B; 3HT3 A; 3Q8M A; 2AGP A; 5KFI A; 1Q46 A; 3MC1 A; 1YZ6 A; 2VIX A; 4ED7 A; 4Z6D A; 5DGB A; 2Q4T A; 4OCZ A; 4EYI B; 2MSN A; 2JEF A; 8ICS A; 4YN4 A; 3SEI A; 8ICR A; 3ZD8 A; 3V7J A; 3Q8L A; 4RT2 A; 2LHT A; 4OJP A; 2OWO A; 4B9L A; 3OTQ A; 2QB0 B; 3KZX A; 3TFS A; 4I2F A; 5AM5 A; 1BVS A; 2W43 A; 5AKY A; 5J2E A; 2FLP A; 4O3N A; 1ZQY A; 4K4H A; 4I2E A; 1RQL A; 4P4M A; 3F5A A; 3BZC A; 2ZUC A; 2NRV A; 4XUS A; 2BCS A; 2Y0S C; 3FM9 A; 3O0F A; 4B9M A; 5AI5 A; 3TAC B; 2KK0 A; 2HBK A; 4YR3 A; 5DG8 A; 3BZK A; 1N62 A; 3C5F A; 1Z4O A; 2E1F A; 4I2C A; 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2CN1 A; 2KNJ A; 2QAR B; 2HBL A; 2FLN A; 2PI4 A; 1HJP A; 3HKZ F; 2HOF A; 4I2D A; 4EEY A; 1TAU A; 7ICI A; 3PO5 A; 8ICF A; 5J8Y A; 3H8W A; 3J81 j; 5AK4 A; 1V97 A; 5JUM A; 5IIL A; 2CXY A; 3AMZ A; 3MFH A; 1L7M A; 1CEZ A; 2JZB B; 1UPH A; 2C28 A; 4ELV A; 4UAY A; 3PML A; 1RYS A; 5L9X A; 3QEA Z; 3V7K A; 5TZV A; 5KFY A; 3TAN A; 1QSS A; 8ICY A; 1WWU A; 3VCB A; 4Q43 A; 1XSN A; 1XWL A; 1PVQ A; 1WCL A; 3DEE A; 2VKQ A; 1F5S A; 1H38 A; 4F3O A; 3PSI A; 4M9N A; 1A77 A; 1V9P A; 5AKG A; 2JEJ A; 4O3P A; 2IOH A; 4PL2 A; 2EH9 A; 8ICA A; 5ALO A; 1Z1V A; 3UMC A; 2XGQ A; 3T5H A; 4KLL A; 3Q8P B; 1UT5 A; 4J9L A; 4EBC A; 9ICE A; 2HSZ A; 3SQI A; 3RBE A; 1QTM A; 3SR6 A; 3OHA A; 4RPZ A; 3R9K A; 2ZUD A; 1SL0 A; 1MQ3 A; 8ICC A; 1EXN A; 4QWB A; 1PK1 A; 3RJE A; 4C8M A; 4YXJ A; 2DL0 A; 4IQT A; 3EUB 2; 1OW5 A; 1Q3U A; 1HUZ A; 2CRX A; 5G5H A; 3NRZ A; 4OJ6 A; 4ELU A; 5ALM A; 5J2F A; 3KHL A; 2HMX A; 4C0Z A; 3WKE A; 1FO4 A; 1ZQN A; 2IHN A; 1NK5 A; 2B21 A; 3PW4 A; 1SL2 A; 2BQ3 A; 2KZM A; 5KFV A; 5KL8 B; 5KFQ A; 4DL2 A; 4QZI A; 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