The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
86
|
structure length |
86
|
Chain Sequence |
ASIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLSPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDELYELLQHILKQRPGGGGST
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
E80-TELSAM domain
|
| molecule tags |
Hydrolase regulator
|
| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
19
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| structure length |
86
|
| sequence length |
86
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3BQ7 A; 3KKA A; 2Y9T A; 5JTI A; 2D3D A; 3TAD A; 2DL0 A; 3BS5 A; 1SV0 C; 2QAR B; 1DXS A; 1X40 A; 1SXD A; 2EAM A; 2Y9U A; 1Z1V A; 2LMR A; 1B0X A; 2EAP A; 2F8K A; 4IS7 A; 2KMD A; 3KKA C; 1PK1 A; 2F3N A; 3TAD C; 2E8O A; 2E8N A; 2EAO A; 5J8Y A; 3BS5 B; 1SV4 A; 2F44 A; 2ES6 A; 1JI7 A; 4NJ8 A; 5JU5 A; 2KG5 A; 1OW5 A; 1WWU A; 2D8C A; 1LKY A; 2QKQ A; 1OXJ A; 1WWV A; 1PK1 B; 2K60 A; 1COK A; 2E8M A; 1SXE A; 2KSO A; 2B6G A; 2QB0 A; 3TAC B; 2JV3 A; 5KNI A; 1V85 A; 1F0M A; 1V38 A; 5JRT A; 2E8P A; 4PZN A; 3SEN A; 1RG6 A; 4MHV A; 2KIV A; 1SV0 A; 2ESE A; 1LKY B; 1PK3 A; 1X9X A; 3H8M A; 2KE7 A; 3SEI A; 1UQV A; 1KW4 A; 4PZO A; 3BS7 A; 5J8Y C; 2KSO B; 1X66 A; 2QB0 B; 1B4F A; 2EAN A; 5L1M A; 2DKZ A; 2FE9 A; 4NL9 A; 2LPE A; 4RQN A; 3IDW A; 2QAR A; 3K1R B; 1UCV A; 2DKX A; 2QB1 A; 5F3X B; 2YTU A; 2GLE A; 1SGG A; 2L5Y A; 3HIL A; 4NL9 C; 4RQM A; 2K4P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5D4B A; 2AXT U; 1MQ2 A; 1ECW A; 4M9H A; 4YMO A; 3BZK A; 5ALW A; 2W54 A; 2B21 A; 3MBY A; 1ZQ1 C; 3NVZ A; 4NY8 A; 3WK7 A; 4O3M A; 2DGZ A; 5KT5 A; 2ZUB A; 9ICF A; 2KN7 A; 5A0L A; 2JH1 A; 5DLF A; 2YMP A; 3H8J A; 3F5A A; 5EE9 A; 2HCF A; 4BX9 C; 4C4S A; 2F8L A; 2KIC A; 1X2I A; 4US9 A; 4QNL A; 4EX6 A; 2FLL A; 5AIB A; 8ICG A; 5JU5 A; 3OJS A; 3JPP A; 1WWU A; 2P6U A; 5L1I A; 1MQ3 A; 3OGU A; 5AKL A; 3T79 A; 5T14 A; 3L3F X; 4QZD A; 3C2L A; 4C4R A; 2VAN A; 5TZV A; 1RYU A; 3G6V A; 3KFU F; 2RRD A; 4KTQ A; 3WKD A; 5AKX A; 5J0Y A; 5DBB A; 1DK3 A; 2XGQ A; 5ALK A; 2BPF A; 4Y2Y A; 1VDV A; 4KN4 A; 4JWN A; 3LWM A; 8ICK A; 3V7L A; 4ED3 A; 5J0U A; 5DGA A; 1IM4 A; 4G9B A; 4I2I A; 4TUR A; 3SZ2 A; 2BCS A; 3NVY A; 1JUD A; 3OTQ A; 4U7C A; 2G08 A; 2MAX A; 2BCQ A; 2ZIU A; 2OYY A; 4TQR A; 4NL9 A; 2P6R A; 5DBA A; 1L7M A; 3RFA A; 3DV9 A; 4I2E A; 3MDC A; 3SR6 A; 4F91 B; 4OJ6 A; 4CF3 A; 4O9M A; 3MGI A; 8ICY A; 1CUK A; 2G5I B; 4RQ1 A; 2AGP A; 2KHV A; 3C5F A; 3Q8L A; 2PXI A; 4EEK A; 1KSP A; 2BHN A; 4OCZ A; 1S76 D; 2QAR B; 1NJW A; 2KJ9 A; 4Q8F A; 1S0M A; 3PMN A; 4C80 A; 2LMR A; 5IIL A; 2EAP A; 4M0A A; 4M47 A; 3SAG A; 2JZB A; 3PW4 A; 3BJY A; 4OJO A; 4KMO B; 4IR1 A; 5AI4 A; 3RF9 A; 3AU6 A; 1L7O A; 2KEY A; 1D8L A; 2VJ4 A; 5DGB A; 3RJE A; 3KHH A; 4KIT B; 5ALN A; 5J0R A; 1QSL A; 1O08 A; 2AQ0 A; 4R66 A; 2RLT A; 2HBJ A; 4NJ8 A; 1JN3 A; 3FAH A; 2YB4 A; 5KFG A; 5AIA A; 4DQS A; 2VA3 A; 1K5O A; 8ICL A; 4R65 A; 1OXJ A; 4BJQ A; 4EBC A; 5KT4 A; 2JRZ A; 2ISO A; 4DSI A; 1S8O A; 2FPL A; 3TAC B; 2KKP A; 1ZQB A; 3HWT A; 5KNI A; 1V85 A; 1NKC A; 3JPO A; 4ED7 A; 1QSS A; 4DEZ A; 4RQ8 A; 5CRX A; 5AKK A; 4ECS A; 1NJY A; 3BQ2 A; 1PVR A; 2A3V A; 2KV2 A; 2WTF A; 8ICP A; 5KFP A; 3B0Y A; 1FIQ A; 1VJ5 A; 2ASL A; 3IM1 A; 4KN7 A; 5AKE A; 9ICP A; 3H4B A; 2I9G A; 2KOB A; 4NLC A; 2JH7 A; 2QB0 B; 4BXO B; 1ZQC A; 3ISB A; 3WK4 A; 3JPT A; 5J29 A; 3MDA A; 5L1J A; 3GIJ A; 2BKE A; 4M9L A; 3Q8Q B; 2NRV A; 1SL2 A; 4KLS A; 4KLL A; 3KD3 A; 2R8J A; 8ICN A; 4ECY A; 2LYH A; 4KLE A; 3JPS A; 4Y2S A; 2WFA A; 4RPY A; 1S10 A; 2WF8 A; 1L3U A; 5E79 U; 2K8A A; 8ICW A; 4YFK A; 4FS2 A; 2K4E A; 3TI0 A; 2F2A B; 4QZA A; 1ZQO A; 3ORY A; 3ZI4 A; 3IN5 A; 2BPG A; 2K4I A; 2KKV A; 2JR5 A; 4DO9 A; 3RB0 A; 3VC8 A; 3RB4 A; 4GFJ A; 5KT2 A; 2IA6 A; 1JXE A; 5AKZ A; 5DB6 A; 3L4P A; 1KFS A; 4ELT A; 1L8O A; 7ICK A; 3T5H A; 3UM9 A; 2OHF A; 5ALM A; 1TKD A; 1JI7 A; 3MFI A; 1BPY A; 5KFU A; 1HUO A; 1A0P A; 3GII A; 4TUQ A; 1S0O A; 1MN8 A; 4ECU A; 2PFO A; 8ICS A; 2WF9 A; 3H8W A; 5ALQ A; 5ALU A; 3QYP A; 5BPC A; 1TVA A; 2ZUC A; 3WK8 A; 2LM4 A; 3NVV A; 5F9L A; 5JRT A; 3JPQ A; 1NK6 A; 4LJX A; 4MEX A; 1NI3 A; 2KIV A; 2HHU A; 4XQ8 A; 9ICL A; 1UA0 A; 4I2D A; 4YP3 A; 3SEI A; 1UQV A; 4IQW A; 3NGD A; 1ZQG A; 5GTH U; 4J9Q A; 2DUY A; 1JIH A; 5KFI A; 1U45 A; 3K1R B; 4IRK A; 3E2E A; 2GH1 A; 4KLI A; 5EOZ A; 1U9L A; 2HHW A; 4RQM A; 1J97 A; 2A1J B; 3ALR A; 3Q8S B; 5KFR A; 1ZQY A; 5J2F A; 2D3D A; 5AM0 A; 4LZG A; 9ICT A; 2K8B B; 5J2G A; 2XGP A; 3UMB A; 2Y9U A; 4DFK A; 3PX0 A; 2W9C A; 1ZQH A; 3RRG A; 5KFH A; 3H8S A; 3C1Z A; 5DB9 A; 4NLZ A; 9ICS A; 7ICU A; 2BZF A; 1YT3 A; 3TAD C; 7ICM A; 4JV0 A; 5ALG A; 7ICN A; 5ALH A; 4EEY A; 2OH2 A; 1UT5 A; 3C28 A; 1XU4 A; 5C0Y A; 4YCX A; 4C7Y A; 4TUP A; 4DL7 A; 1D8B A; 3PO5 A; 4QWB A; 1YZ6 A; 3QU9 A; 3WKB A; 1RXV A; 2G09 A; 1S77 D; 1KRP A; 3AQF A; 4PL2 A; 1XWL A; 3HT3 A; 2UVR A; 3D2Q A; 4F2R A; 5J0P A; 5KFB A; 4ECV A; 3MAB A; 2XC9 A; 1ZQU A; 5ALP A; 4KLU A; 4F93 B; 4JV2 A; 1PZN A; 9ICR A; 2ZUD A; 3M7D A; 3LK9 A; 1ZQL A; 2VA8 A; 2ZXI A; 4M9J A; 4Q8E A; 3PO4 A; 4ED8 A; 4MFF A; 3QEA Z; 3EW9 A; 3QE9 Y; 2ZIV B; 4AP9 A; 3NAS A; 3THV A; 1BNO A; 1BPD A; 7ICO A; 4YXJ A; 4C7Z A; 2KJ5 A; 4DQQ A; 4CRX A; 4K4H A; 4UQG A; 3GQC A; 1FEZ A; 4ECT A; 4M04 A; 4DL4 A; 5J2C A; 4JB3 A; 4I2A A; 1T4G A; 3QU2 A; 2FMS A; 1DOQ A; 3KKA A; 4F50 A; 4UAW A; 4GLX A; 1ZQZ A; 3M8S A; 1ZQJ A; 1TAM A; 1Z1V A; 2C2R A; 4UAY A; 5KFY A; 4O5E A; 2YMQ A; 2KMD A; 8ICO A; 7ICQ A; 4EYH B; 2F3N A; 5ALR A; 5J0Q A; 2ZIW A; 3WK9 A; 1WUD A; 2E8O A; 3NVW A; 1PVP A; 1X42 A; 2HHS A; 2AQ4 A; 3ZD9 A; 1J2N A; 5G5G A; 4X5V A; 4FBT A; 3I28 A; 4B9U A; 2HHT A; 2BR0 A; 3VCB A; 2V4Q A; 4PHA A; 1L8L A; 3GV5 B; 3RR8 A; 4KLJ A; 1QQ5 A; 5KL8 B; 1TK8 A; 2W7O A; 2ODG A; 1N2X A; 4DFM A; 1T3Q A; 3T3F A; 4Q44 A; 5DG7 A; 2LM1 A; 7ICS A; 4CDG A; 1L7P A; 4C8M A; 2E8P A; 4FE3 A; 4P4O A; 2BCR A; 2XCP A; 4O3R A; 1SZH A; 3QUC A; 1QLN A; 4TUS A; 3UMG A; 4DOB A; 5AM3 A; 1PK3 A; 2ASD A; 2YX8 A; 4KLD A; 2VJ5 A; 2I1Q A; 2H5X A; 4NV0 A; 2C28 A; 1X6I A; 3BZC A; 4O3N A; 2YB1 A; 1ZXI A; 4DQI A; 2AGO A; 1N5W A; 4J9O A; 1DGJ A; 4DWI A; 4P4M A; 2M0N A; 4MF2 A; 5KFJ A; 4ECX A; 4YD2 A; 2ZTE A; 5KT3 A; 1C7Y A; 4Y2R A; 2PFP A; 4PHP A; 2R18 A; 3V6K A; 1RZT A; 4IL6 U; 2ZIU B; 8ICB A; 3SQI A; 3PSP A; 5J0T A; 2RQ5 A; 3F2D A; 1L3T A; 2DL0 A; 2ISP A; 2G0A A; 3ZDE A; 4C8N A; 1SXD A; 5ALF A; 3WK5 A; 4UB1 A; 4Y2V A; 3PR4 A; 4Z6E A; 1O03 A; 9ICG A; 5KFL A; 4Y2X A; 2EZY A; 2ZXH A; 2H3F A; 5HML A; 3MR2 A; 2E1E A; 2HI0 A; 5AKY A; 2JHD A; 1CI4 A; 2FLN A; 1NK4 A; 5J2E A; 1V97 A; 4HYK A; 5JUM A; 1SKW A; 2KG5 A; 1ZQE A; 2JZB B; 4IQT A; 1X9S A; 5KFD A; 4O5C A; 3FC4 A; 2HBL A; 3EPG A; 2AHO B; 2R8K A; 3RTV A; 1JRO A; 1KEJ A; 4R8U A; 2IHN A; 1M6Y A; 3V6H A; 3GIK A; 1KKX A; 2DWQ A; 1S0V A; 1ZQD A; 2KZZ A; 3RB3 A; 3BQT A; 5KL1 B; 3J81 j; 3SEN A; 2HHV A; 1ZQI A; 1RG6 A; 1QTM A; 3ETR A; 3EUB 2; 2DQN B; 5D49 A; 4UB8 U; 2BQ3 A; 1IG6 A; 2ZJ5 A; 5J2I A; 1Q46 A; 3E0F A; 2ALZ A; 3H4D A; 3BS7 A; 4F5Q A; 4A8E A; 2G06 A; 3KTQ A; 5C5J A; 2OM6 A; 4P4P A; 3IG5 A; 9ICE A; 3FDS A; 2DKZ A; 1KL9 A; 1NK9 A; 4OJP A; 4RQN A; 3RH5 A; 4C8O A; 3M9O B; 4F2S A; 8ICQ A; 1ZQW A; 4UAR A; 3AEV A; 2DKX A; 3SMV A; 3PR5 B; 1KQQ A; 2ZJA A; 3EYZ A; 4B9M A; 7ICP A; 2LYA A; 4PJ0 U; 4KMU A; 4I2B A; 5EWE A; 3QXG A; 2PKE A; 1Z1B A; 5AM5 A; 4GXJ A; 1TK5 A; 2VA2 A; 1K1Q A; 4B9S A; 4UB5 A; 2R8G A; 2G5H B; 1ZQF A; 4DLE A; 4O3O A; 4GXK A; 1B0X A; 1WYG A; 3GV7 B; 3UXN A; 4B9V A; 2O6K A; 3QU5 A; 1KBU A; 2FPM A; 2NRX A; 3QUT A; 4NWI A; 2GOL A; 1SV4 A; 3B0X A; 4F3O A; 3CRX A; 4J03 A; 2ZJ8 A; 3K75 D; 2JXJ A; 2HBM A; 1WCN A; 1ZQR A; 1RYR A; 2QKQ A; 1BVS A; 2H3I A; 5AI5 A; 2IHM A; 3V72 A; 2IMW P; 2D6F C; 1NZP A; 9ICO A; 5KT6 A; 4YVZ A; 2KVS A; 4YXM A; 1N61 A; 4ECR A; 2CN1 A; 3G6X A; 3AU2 A; 2UVU A; 5DQI A; 3Q8P B; 8ICU A; 4OO1 J; 2XI9 A; 4IRC A; 4EBE A; 2UVW A; 3ICX A; 2KZM A; 1QH9 A; 5AK4 A; 4F4Z A; 4NLB A; 4O3P A; 2JMG A; 4FZN A; 4UB4 A; 1WCL A; 4DOA A; 2LPE A; 2IOH A; 2EZX A; 2W9M A; 4OD0 A; 3JPR A; 3DEE A; 2YMM A; 7ICT A; 4F5N A; 4RNM A; 3R9K A; 2XO7 A; 4YMM A; 1S9F A; 2HHQ A; 1XC9 A; 8ICZ A; 1ZQX A; 4NXZ A; 4QZB A; 3JPN A; 4FZM A; 3QU4 A; 2KD1 A; 5B5E U; 3NS1 A; 3RH6 A; 1IXR A; 5J2H A; 2ATL A; 8ICC A; 4RT3 A; 3RBD A; 2PI5 A; 5G5H A; 1KN5 A; 1RXW A; 3UXP A; 1N48 A; 1NK7 A; 5GTI U; 3OJU A; 1Z00 A; 1FFU A; 4B6J A; 2OEH A; 3PX4 A; 4IRD A; 4QWA A; 2GWS A; 2Z7J A; 2W9C B; 2V4R A; 5KFZ A; 5AKH A; 3NRW A; 3PNC A; 2WB1 F; 3D6J A; 5D46 A; 2WB1 C; 4NLG A; 2K60 A; 3HRD D; 4DLG A; 1SWV A; 2AH5 A; 4M9N A; 3M1Y A; 2NRW A; 5AIC A; 3QEB Z; 1KTQ A; 5KFT A; 2KJ8 A; 1F0M A; 2DBY A; 2E1F A; 4IQV A; 3Q8R B; 5KG1 A; 5CR0 A; 1SZP A; 2KFZ A; 3MFH A; 4MHV A; 3WK6 A; 4C8L A; 3RJK A; 5KFF A; 2HOQ A; 3IV6 A; 4M6W A; 5AK6 A; 1ZYQ A; 2A19 A; 5KFE A; 2C2E A; 2KE7 A; 2XY6 A; 2XY7 A; 1N56 A; 1B4F A; 5J0O A; 1C20 A; 4K4G A; 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3C23 A; 2BDP A; 3UQ0 A; 4RQ6 A; 9ICU A; 4YD1 A; 3QX7 A; 4ECQ A; 5KT7 A; 4DSK A; 4Z6D A; 3PW7 A; 5ALE A; 3QZ7 A; 7ICH A; 4I2H A; 1SKR A; 2W8K A; 4QWD A; 3TAD A; 3BS5 A; 3LWL A; 2F77 X; 2LBO A; 2MRL A; 1KFT A; 4Q43 A; 4DF4 A; 5IIM A; 2IBK A; 4ZOH C; 7ICG A; 7ICR A; 1Z3E B; 3ISC A; 3SYZ A; 2ZIX A; 8ICM A; 4J9L A; 2K89 A; 4QWC A; 5DDM A; 3ZDC A; 4YR3 A; 5EWF A; 2W04 A; 5DG8 A; 3SAF A; 1QCK A; 2EQY A; 3QNM A; 2EAO A; 4QIW F; 2H3Q A; 4YG2 A; 2F1I A; 3RJG A; 4QIW C; 2F44 A; 2ES6 A; 4ZH4 A; 5F9N A; 4UBB A; 1D9F A; 9ICM A; 1ZQQ A; 4ACO A; 8ICJ A; 5HP4 A; 1DRG A; 1F5S A; 3UQ2 A; 5KFO A; 2OWO A; 3OPX A; 5TIS U; 1NOM A; 2NO4 A; 1V38 A; 1CEZ A; 1N5X A; 3SV4 A; 3TAN A; 4DSE A; 8ICV A; 4I28 A; 2XID A; 1V9P A; 2R8I A; 2EH9 A; 1X9X A; 4QZC A; 1ARO P; 1B43 A; 3CNH A; 4R8U B; 2E3T A; 3H7I A; 4RU9 A; 2EAN A; 3MC1 A; 2F1H A; 3A0B U; 4RPX A; 3V7K A; 4EZ6 A; 4PGX A; 5DB8 A; 2CPR A; 4UBC A; 2KP7 A; 5KTQ A; 5EWG A; 4PPX A; 2YTU A; 1L6N A; 1ZJM A; 4EEL A; 2FJ6 A; 4KLT A; 3PV8 A; 4P0Q A; 4UAV A; 4JK1 A; 2BGW A; 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