The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
77
|
structure length |
77
|
Chain Sequence |
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDELYELLQHILKQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
E80-TELSAM domain
|
| molecule tags |
Hydrolase regulator
|
| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
19
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
|
| chains with identical sequence |
C
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WWV A; 4NL9 C; 2D8C A; 3SEN A; 2KMD A; 2KE7 A; 1LKY A; 2FE9 A; 2DKX A; 2LPE A; 5J8Y A; 3TAD A; 1COK A; 1V85 A; 5JTI A; 2ES6 A; 4RQN A; 5L1M A; 2QB0 A; 1KW4 A; 3TAC B; 3HIL A; 3BS7 A; 3KKA C; 2KSO B; 2K4P A; 2KIV A; 3IDW A; 1X40 A; 2EAM A; 1B0X A; 4RQM A; 3H8M A; 1SV4 A; 2F3N A; 1JI7 A; 1UQV A; 2L5Y A; 2QB1 A; 3BQ7 A; 2F44 A; 2DKZ A; 2Y9U A; 1X9X A; 1SXD A; 2YTU A; 4IS7 A; 2ESE A; 1SV0 C; 1SXE A; 3KKA A; 2E8N A; 2K60 A; 4PZN A; 2EAO A; 4MHV A; 3BS5 B; 2KSO A; 3K1R B; 1PK1 B; 1F0M A; 2JV3 A; 2DL0 A; 2E8M A; 2EAN A; 2KG5 A; 5JRT A; 4NJ8 A; 5KNI A; 2LMR A; 2QAR B; 2Y9T A; 1SV0 A; 1DXS A; 2QKQ A; 1OXJ A; 4PZO A; 1UCV A; 1OW5 A; 1RG6 A; 1B4F A; 1LKY B; 2EAP A; 1X66 A; 2F8K A; 1SGG A; 3BS5 A; 1Z1V A; 1PK3 A; 2E8O A; 2D3D A; 1PK1 A; 1WWU A; 2B6G A; 5J8Y C; 5F3X B; 3TAD C; 5JU5 A; 2QAR A; 4NL9 A; 1V38 A; 2E8P A; 3SEI A; 2QB0 B; 2GLE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2Y1J A; 4GLX A; 3OSP A; 1TK8 A; 3HKZ C; 4NLB A; 3QU9 A; 1ZQD A; 3CW2 C; 1SB3 C; 3TFR A; 1NOM A; 2F77 X; 4J9P A; 1HJP A; 3MAB A; 1QH9 A; 3H0M B; 2I6X A; 3EW9 A; 1JRP A; 5BOM A; 3M8S A; 1TKD A; 4PGX A; 4RQ0 A; 3I28 A; 4HAI A; 1BPY A; 4RQN A; 1NK5 A; 1L6N A; 2QB0 A; 2FLL A; 4IQW A; 3HP6 A; 4MEY A; 3TAC B; 1ZQM A; 4DQI A; 4B9S A; 3M9O B; 4DF4 A; 3IDW A; 2FI1 A; 4ECW A; 2I1Q A; 2G08 A; 3H8M A; 4CRX A; 4UAT A; 5EWF A; 5DQH A; 3PR5 B; 4Y2X A; 3RB3 A; 3N28 A; 1ZQZ A; 3MFI A; 2E8N A; 4ELV A; 1TAQ A; 4PZN A; 3QU7 A; 3R9K A; 2YN4 A; 8ICN A; 2JGA A; 1Z19 A; 2DL0 A; 4BUG A; 1GO3 F; 3HRD D; 4JB3 A; 4RPY A; 5KT6 A; 2KHQ A; 3KOO A; 5KFY A; 2XY6 A; 5KG5 A; 2BGW A; 1PVR A; 4BXO A; 3C21 A; 4USA A; 3Q8M A; 3JPN A; 2J6S A; 4PZO A; 4P2H A; 2YX8 A; 3ORY A; 1X66 A; 1Z00 A; 5DBC A; 3SV4 A; 4I2H A; 4F2S A; 2D3D A; 2KIC A; 1IM4 A; 9ICG A; 5EWE A; 3ZDE A; 1XU4 A; 2LI6 A; 3BQT A; 4F5R A; 1ZQG A; 1U47 A; 2JH7 A; 1SXE A; 3UQ2 A; 1ZQX A; 4TUS A; 5TZV A; 1KN5 A; 1B43 A; 3KFU F; 1ZQV A; 5KL1 B; 5J2D A; 1LKY A; 4AYB C; 4G9B A; 3LVW A; 1ZD5 A; 2HVH A; 2ZIV B; 5J2F A; 4DFJ A; 1ZQA A; 3C23 A; 4AP9 A; 3RRH A; 4UB2 A; 1RQN A; 2IBK A; 4O9M A; 5G5G A; 4UB6 U; 4TUR A; 2FPK A; 4F8R A; 2H3Z A; 1X9M A; 4RQ7 A; 1X40 A; 4UAU A; 4EBE A; 4QIW C; 4C80 A; 1NK8 A; 3UM9 A; 3IG5 A; 4CCH A; 3N7R C; 4DO9 A; 1NJX A; 4IS7 A; 4KLJ A; 3AEV A; 3MGH A; 5G5H A; 3HW8 A; 4J9Q A; 2ALZ A; 1EXN A; 5AM5 A; 1ED1 A; 3RB6 A; 3GZF A; 4P0P A; 2E8M A; 4B9U A; 3H0R B; 4DSI A; 4YMO A; 4A8E A; 2LMR A; 4ECZ A; 2Q4T A; 2XCA A; 2H5X A; 5CP2 A; 3VC8 A; 3RJH A; 4M6W A; 4BWJ A; 5KG6 A; 5ALE A; 1ARO P; 5CA7 A; 4OJL A; 7ICQ A; 4BDP A; 2EAP A; 1ZQQ A; 2OHF A; 4PGQ A; 4JK1 A; 2AQ4 A; 4XA5 A; 2W9C A; 3H40 A; 5F9L A; 2KK0 A; 4KLH A; 2H3V A; 2PXI A; 5L1I A; 3TQ1 A; 4LZG A; 1F5S A; 2HHS A; 4Q8F A; 2ZTD A; 1U4B A; 1XC9 A; 2W8L A; 4FBU A; 5J0P A; 1WWV A; 3SEN A; 5C5J A; 9ICL A; 1X9W A; 2G07 A; 2H3F A; 2DQN B; 3PR4 A; 2YMP A; 3C1Y A; 3PZP A; 2ZUD A; 5JTI A; 2M0N A; 2HBK A; 1J2M A; 3AU6 A; 3NRW A; 5J0S A; 3TFS A; 4F4Y A; 4DSL A; 1KW4 A; 3AMZ A; 5HP4 A; 3PW5 A; 5L1K A; 4F92 B; 4UW9 A; 5IIM A; 2KSO B; 4B9N A; 2LM4 A; 2P35 A; 4IQU A; 3WK4 A; 3GIM A; 5III A; 1TK0 A; 3HKZ F; 1XO1 A; 2RQ5 A; 2DF4 B; 1Q46 A; 4J9M A; 2J6T A; 1UQV A; 1VJ5 A; 4TQS A; 2DKZ A; 3PW4 A; 9ICK A; 2BQR A; 1X42 A; 1ZQR A; 4DFD A; 2EAO A; 4KMU A; 3H4B A; 3ALR A; 3AQE A; 1PK1 B; 4U7C A; 5JRT A; 3AU2 A; 5T14 A; 1ZQP A; 1S0O A; 5J2J A; 3WKD A; 1L7N A; 1UHU A; 5AIA A; 5AM4 A; 5EOZ A; 2JEG A; 5KFX A; 2KVC A; 4G3I A; 1CEZ A; 3CYM A; 5DQG A; 1ZQY A; 2XIC A; 5ALM A; 3RF9 A; 3CNH A; 4UB8 U; 3BZK A; 4PJ0 U; 2NV3 A; 3OHA A; 2I5H A; 2EDU A; 1ZQS A; 3QYP A; 2JH1 A; 7ICF A; 4QWB A; 1V38 A; 3PX6 A; 4M9L A; 4ELT A; 3CP8 A; 2NRZ A; 1LVH A; 5ALW A; 3LWM A; 4IQT A; 3NTU A; 3SAF A; 1P7D A; 2ZIV A; 5KFZ A; 1D8B A; 5AI5 A; 8ICJ A; 5ALN A; 3PNC A; 1MQ3 A; 2BDP A; 3GDX A; 2C2E A; 5ALK A; 1S76 D; 8ICO A; 1A77 A; 1T94 A; 4TUQ A; 4ECV A; 2FMS A; 4JWN A; 5ALG A; 1ZQN A; 1YT3 A; 4F5Q A; 2KZ3 A; 1UT5 A; 2FLN A; 4O3O A; 4Z6D A; 3HWT A; 2L5Y A; 4AYB F; 2EZY A; 3QUT A; 1Q8K A; 1NNL A; 1VDV A; 3V6H A; 1KLN A; 4I2E A; 4DSF A; 4PL1 A; 2PI4 A; 4I2I A; 5KT3 A; 5J0O A; 9ICA A; 5DDY A; 1F0M A; 3H8J A; 1PZN A; 1T7P A; 3BQ0 A; 3NUQ A; 3ED5 A; 2EAN A; 3AQF A; 2IOF A; 4PHE A; 1S0V A; 4DOB A; 2K8C B; 4FBT A; 3UXO A; 2BQ3 A; 4R8U B; 9ICS A; 2NO5 A; 4EEL A; 2JEI A; 4O3M A; 3A0B U; 5F9N A; 1L8L A; 2HMX A; 5CJ7 A; 1H38 A; 2B6G A; 3V7K A; 2HBM A; 2W11 A; 1N60 A; 3CRX A; 4QZ9 A; 4I2D A; 4IR1 A; 1SZP A; 4IR9 A; 3OJU A; 1L3V A; 5ALR A; 1URJ A; 1RXW A; 4EX6 A; 3QNM A; 5AM0 A; 2WF6 A; 2ASD A; 2MRL A; 4ZOH C; 5KFR A; 8ICI A; 5EE9 A; 4UAR A; 4I2A A; 4B9M A; 9ICR A; 4PGY A; 5CR0 A; 3UMG A; 2GH1 A; 1KL9 A; 3GIJ A; 1S0N A; 1IG6 A; 5D4B A; 1ZRM A; 3BQ1 A; 1HEK A; 2DBY A; 1ZQK A; 3ETR A; 1RZT A; 3RJE A; 1BGX T; 2B0C A; 4Y2Y A; 1SWW A; 4EYI B; 1ZQE A; 4ED6 A; 1L7O A; 4C4R A; 3LVV A; 3N7S C; 3QU4 A; 4C0Z A; 3BJY A; 3KZX A; 1DK3 A; 3F2C A; 4EEY A; 4UAS A; 4Y2S A; 4BX9 C; 4O5K A; 2C28 A; 5AKY A; 3T5H A; 1XSP A; 2CRX A; 3D2Q A; 4KLD A; 5ALI A; 2KG5 A; 4F4X A; 2YMQ A; 2CPR A; 3GV7 B; 1JX4 A; 4M47 A; 3KHR A; 5ALV A; 8ICL A; 2XCP A; 9ICT A; 4ED1 A; 5ALF A; 4M04 A; 2F1J A; 5AK4 A; 7ICV A; 1B4F A; 1NZP A; 4ECT A; 1A6S A; 1SGG A; 4C8N A; 1RPL A; 3NVW A; 1KBU A; 2ZJ5 A; 1D8L A; 4ECQ A; 3IV6 A; 4CGZ A; 3LK9 A; 4Y2R A; 4DL5 A; 5J2H A; 2IHM A; 4P0Q B; 2I9G A; 2HHX A; 5J0X A; 1ZQL A; 1XNS A; 1WCN A; 2KHV A; 2EH9 A; 4EX7 A; 5ALJ A; 5J0Y A; 4P4M A; 4NM1 A; 2LYH A; 4RQ6 A; 1FEZ A; 5ALP A; 1NK0 A; 3K75 D; 3SAG A; 4QZD A; 5AKI A; 2K4E A; 2LHT A; 5DKW A; 5DBB A; 4QNL A; 2W3S A; 4O3Q A; 1RYS A; 3DEE A; 1QQ5 A; 1KTQ A; 4Y2Q A; 5BOL A; 3SV3 A; 1A0P A; 1CRX A; 2R8J A; 3V6K A; 5DB9 A; 1KFT A; 2UVR A; 1XSL A; 5KG0 A; 1RDF A; 2KIV A; 3PY8 A; 4NLK A; 1L7M A; 4F5N A; 2GWS A; 1CUK A; 5TIS U; 2ISO A; 2F3N A; 1C20 A; 2CXY A; 4C4T A; 3V7L A; 1CI4 A; 4RNM A; 7ICE A; 5ALU A; 2O6K A; 4R63 A; 4F3O A; 3VCB A; 3PV8 A; 2YTU A; 5CEH A; 3O0F A; 4X5V A; 7ICP A; 3QU5 A; 3BS5 B; 5ALT A; 2W04 A; 4I29 A; 2RP5 A; 1JAL A; 4NLN A; 3AUO A; 4WJ3 B; 2GOL A; 1TFR A; 1T3N A; 3UXN A; 4KN4 A; 3TKA A; 2IMW P; 2MSN A; 4I2C A; 1DXS A; 2KTQ A; 3PMN A; 1MQ2 A; 2KZM A; 4O5E A; 4NV0 A; 4EEN A; 3J81 j; 2HOF A; 2WB1 F; 2AH5 A; 2BPG A; 1UT8 A; 1NZB A; 2E8O A; 3RR7 A; 3RAX A; 2ZIX B; 5DB7 A; 3QXG A; 3Q8P B; 2BCR A; 3RJI A; 3JPP A; 4KX5 A; 1ZQC A; 1KFD A; 4F50 A; 3GII A; 1IV8 A; 4M0A A; 3BQ2 A; 5AIB A; 1QQ7 A; 5KL8 B; 3IP4 B; 3QZ8 A; 3L4P A; 3HJE A; 1ZD3 A; 3OTQ A; 1MN8 A; 4NY8 A; 8ICY A; 1ZQU A; 2ODG A; 4DLE A; 5AM3 A; 3PX0 A; 1ECW A; 4F2R A; 4ECR A; 2BQU A; 1BNO A; 3C1Z A; 3RAQ A; 1KKX A; 5EE1 A; 5KFE A; 1KEJ A; 2BHN A; 2KN7 A; 4I2B A; 5CWR A; 4ICA A; 3WKC A; 4TUP A; 1BPB A; 2HDO A; 1NK6 A; 2G09 A; 8ICQ A; 5A0L A; 4QZB A; 4Y2J A; 1COO A; 2R8K A; 1B0X A; 4OJ6 A; 1M6Y A; 1IXR A; 2HBJ A; 2WTF A; 2BCU A; 3B9J A; 3HT3 A; 5AKG A; 5H2F U; 3WKB A; 2R8I A; 4QWD A; 2HOI A; 3ISB A; 4MFF A; 4EBC A; 1FO4 A; 2EQY A; 2LM1 A; 4O0I A; 4M9H A; 4C8L A; 8ICB A; 4CF5 A; 3GIL A; 2LKY A; 4JV0 A; 4PPX A; 3H8S A; 8ICK A; 3KHH A; 4OD0 A; 4ECX A; 4Q44 A; 3SD7 A; 1ZET A; 1SV0 A; 1RXV A; 1LV5 A; 1X6I A; 2XI9 A; 4O3R A; 1ZD2 P; 4QZF A; 1Q3U A; 4OCZ A; 2ISP A; 2DFL A; 1ZQI A; 3G6V A; 2FMP A; 3OPX A; 3QUB A; 3ZD8 A; 8ICW A; 2AJQ A; 1WWU A; 4RNO A; 3FC4 A; 1WG8 A; 2F1I A; 2KFZ A; 2YMM A; 4B6J A; 5KG2 A; 5JU5 A; 1WYG A; 3H0L B; 1SIJ A; 3HX0 A; 1S0M A; 2HBL A; 5IIO A; 5AKJ A; 4J9S A; 1ZQO A; 2JZB B; 1K1Q A; 2EZX A; 2OH2 A; 1JXE A; 3AN1 A; 2D6F C; 3OJS A; 4GXJ A; 5KG4 A; 5AK3 A; 1ZD4 A; 4KLG A; 5KFA A; 3L3F X; 2A1J B; 4QZC A; 1NK9 A; 1RQL A; 4QZE A; 7ICK A; 3TAQ A; 3N4M B; 3UMB A; 1NKB A; 7ICL A; 2F1H A; 2HOQ A; 4Y2T A; 5DB6 A; 5ALQ A; 1TAU A; 5IIJ A; 4JWM A; 1BPD A; 5AM1 A; 4QZH A; 2ZG6 A; 4YD1 A; 3EUB 2; 4NLC A; 3BQ7 A; 2FJ6 A; 4DEZ A; 2NRT A; 4ELU A; 5E79 U; 1SV0 C; 2KD1 A; 4K4I A; 2C2R A; 1JXL A; 2IOF K; 3MFH A; 1N5W A; 3N97 B; 2AHO B; 2UVV A; 2ASL A; 3D6J A; 3ISC A; 2JV3 A; 1BVS A; 2KJ9 A; 4JV1 A; 2KJ8 A; 5KNI A; 2ZTE A; 5KG7 A; 2QAR B; 3DV9 A; 9ICW A; 2KIW A; 3F5E A; 5J2I A; 2KKP A; 5DG9 A; 4F4Z A; 4UQG A; 5ALL A; 2V4R A; 5EWG A; 2WAQ C; 4KLI A; 5KFG A; 2ZIX A; 3ZI4 A; 5J2E A; 9ICH A; 3M6K A; 1JIH A; 1ZJM A; 4US8 A; 5F3X B; 2E3T A; 1QQ6 A; 5HR7 A; 1DRG A; 4UAZ A; 2RDI A; 3MBY A; 4DL6 A; 2W7O A; 2AGQ A; 2K8A A; 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2JR5 A; 3RJG A; 2PMZ C; 5KAF U; 1ZQJ A; 2OEH A; 3C2K A; 1SV4 A; 2W03 A; 2ASJ A; 1JI7 A; 4C8K A; 8ICR A; 3K4G A; 4F4K A; 4QWE A; 4J03 A; 2ZIW B; 5ALX A; 1L5U A; 4BXO B; 1ZQT A; 5EE3 A; 1PUZ A; 3RJK A; 1L3S A; 3GFK B; 1KDH A; 2KSO A; 2PFN A; 4JUZ A; 3U26 A; 3NVZ A; 5J0T A; 5DGB A; 1K1S A; 4GC6 A; 2C22 A; 1J2N A; 2LYA A; 4DOA A; 5KFK A; 3JPR A; 3V6J A; 1X9S A; 1TE2 A; 2XY5 A; 3MGV A; 5KAI U; 2BPF A; 2HCF A; 4DQS A; 7ICJ A; 5AI6 A; 3NS1 A; 1S9F A; 4Y2V A; 4F93 B; 3M7D A; 7ICT A; 4IL6 U; 2R18 A; 1LKY B; 3WK7 A; 5HML A; 4PHA A; 3GQC A; 4C4S A; 1ZQH A; 1PK1 A; 3NVV A; 2XVT A; 3RB4 A; 1RYU A; 4J9O A; 2NRX A; 4Y2P A; 5J0U A; 4KTQ A; 4EZ6 A; 4RQ1 A; 3Q8R B; 5KFV A; 1K5O A; 9ICJ A; 4DF8 A; 3T5K A; 4YFK A; 4R66 A; 3M9N B; 4DQR A; 4MF8 A; 3T5J A; 1PVQ A; 4F5P A; 4YR0 A; 4KLU A; 3PW0 A; 1NI3 A; 5KFD A; 1ZQF A; 2Z7J A; 1N2X A; 3M1Y A; 5J8Y A; 3SYZ A; 2JMG A; 2HSZ A; 3FAH A; 1FIQ A; 4BJQ A; 4YXJ A; 3TAN A; 4M9N A; 4I28 A; 2R8G A; 2WAQ F; 2G5I B; 8ICT A; 1DGS A; 9ICU A; 5HHH A; 3Q8L A; 5L1M A; 2HHQ A; 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