The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
77
|
structure length |
77
|
Chain Sequence |
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDELYELLQHILKQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
E80-TELSAM domain
|
| molecule tags |
Hydrolase regulator
|
| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
19
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
|
| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3BS7 A; 3TAD A; 2YTU A; 1OXJ A; 2E8P A; 1SV4 A; 3IDW A; 2EAM A; 4IS7 A; 2EAN A; 2KE7 A; 4NL9 A; 2ESE A; 3SEI A; 1X9X A; 2JV3 A; 2EAP A; 1Z1V A; 1V38 A; 5F3X B; 2ES6 A; 2EAO A; 1COK A; 3K1R B; 1SV0 A; 1SGG A; 1B0X A; 2DKX A; 2D8C A; 2F44 A; 2FE9 A; 1B4F A; 1JI7 A; 1WWU A; 3BS5 B; 1LKY B; 1SXE A; 2K60 A; 2KG5 A; 3HIL A; 3KKA C; 5JU5 A; 3KKA A; 2F8K A; 3BS5 A; 2QB1 A; 1LKY A; 1PK3 A; 2GLE A; 2Y9U A; 2Y9T A; 1F0M A; 1UQV A; 2KMD A; 2LMR A; 1SXD A; 3SEN A; 3BQ7 A; 2K4P A; 5J8Y C; 2E8M A; 5J8Y A; 4NJ8 A; 1X40 A; 4PZN A; 1DXS A; 2E8N A; 1RG6 A; 4MHV A; 2KSO B; 2F3N A; 1OW5 A; 5KNI A; 3TAD C; 2D3D A; 2KSO A; 2KIV A; 1X66 A; 1KW4 A; 4NL9 C; 2QAR B; 2B6G A; 1UCV A; 5JRT A; 3TAC B; 5L1M A; 1V85 A; 2E8O A; 4RQM A; 3H8M A; 1PK1 B; 2QB0 B; 4PZO A; 5JTI A; 2DL0 A; 1WWV A; 2QAR A; 2DKZ A; 2LPE A; 4RQN A; 2QKQ A; 1SV0 C; 1PK1 A; 2QB0 A; 2L5Y A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1N2X A; 1SL1 A; 1A76 A; 3H0R B; 2R8K A; 2XCA A; 9ICW A; 8ICU A; 9ICR A; 9ICI A; 4M9H A; 1A0P A; 2Q4T A; 4J03 A; 2HCF A; 3AU2 A; 1ZQF A; 4ICA A; 1ZQJ A; 4KLI A; 4F5N A; 2Q0Z X; 3OJU A; 2F44 A; 2W9C B; 2WTF A; 7ICQ A; 4ELU A; 3SQI A; 2NO4 A; 3C2L A; 3FAH A; 4TUQ A; 1S5L U; 3JPS A; 2WF7 A; 3BJY A; 1J2M A; 4YMN A; 4F92 B; 3SD7 A; 2JEI A; 2WF5 A; 3BS5 A; 5AKG A; 4AP9 A; 5J2C A; 7ICG A; 9ICF A; 5ALV A; 2PFO A; 3B0X A; 2ZG6 A; 1DK3 A; 1N5X A; 3NVW A; 4YR3 A; 2YQE A; 1FFV A; 3V7J A; 2ZIW A; 4KLU A; 3PSP A; 2ASL A; 5KFW A; 4F5P A; 4DFP A; 4EBD A; 5ALD A; 3QUB A; 2RRD A; 2GOL A; 1S0M A; 4O3M A; 5BPC A; 2DGZ A; 3E2E A; 4YQW A; 5KG2 A; 4NL9 C; 4J9K A; 2HHX A; 2HBM A; 4EEK A; 5AK6 A; 4TUP A; 2F77 X; 1U48 A; 8ICW A; 4QJF B; 4DQR A; 4GFJ A; 5KFQ A; 2QAR A; 4YR2 A; 4U7C A; 3JPQ A; 2LPE A; 1NOM A; 5DKW A; 4O3O A; 1NJY A; 5ALW A; 3NUQ A; 2IA6 A; 2BDU A; 2VA2 A; 2ZTC A; 3H40 A; 1KL9 A; 2HSZ A; 3OSP A; 3ISB A; 1D9D A; 7ICN A; 3RBE A; 3BZC A; 3GIL A; 4XRH A; 5DB6 A; 2KTQ A; 8ICY A; 3UQ2 A; 4C8N A; 1QCK A; 4OJ6 A; 4DFJ A; 3KZI U; 3BQ0 A; 1F44 A; 1SGG A; 4O9M A; 3MGV A; 2D8C A; 3I76 A; 1WUD A; 5KG0 A; 4GC6 A; 5J2F A; 1U9L A; 5KFO A; 3H8J A; 4YVZ A; 4BX9 C; 3AQF A; 4LJX A; 2Y9T A; 9ICM A; 1F0M A; 2EZX A; 4QZA A; 2ZIX B; 1XSN A; 1ZQE A; 2HDO A; 5HNK A; 3MBY A; 2VKQ A; 1ZQD A; 4JMU A; 2A1A A; 2E8M A; 5KFT A; 5TZV A; 1TAM A; 1L7P A; 1BPZ A; 3PO5 A; 4M6W B; 8ICL A; 5AIB A; 2H3F A; 4ECU A; 5KAI U; 3QNM A; 2VJ4 A; 4KLM A; 2W3R A; 2HHT A; 1V9P A; 3H4D A; 4M04 A; 1BNO A; 1ZQ1 C; 1KW4 A; 4I28 A; 4M9J A; 3RJF A; 2XGP A; 5H2F U; 5L1M A; 4Y2T A; 3WK5 A; 5DBA A; 1XC9 A; 3WK8 A; 3RB3 A; 1TK8 A; 3TAQ A; 8ICI A; 2LYB A; 3RRH A; 2NRV A; 4Q45 A; 3HJE A; 4RNM A; 7ICE A; 5KFD A; 4FZL A; 2NYV A; 4C8M A; 1VDV A; 2C2R A; 4ZOH C; 3ORY A; 1N61 A; 2HVI A; 1PZN A; 8ICZ A; 4Q43 A; 5IIK A; 1OUQ A; 5KFB A; 5AI9 A; 5CR0 A; 4NL9 A; 1KQQ A; 4EBC A; 2JH1 A; 2PFN A; 2WF6 A; 4AYB C; 5AM1 A; 4UAW A; 2XCP A; 4JUZ A; 4R66 A; 3HRD D; 4IRD A; 3H8S A; 3Q8P B; 1K5O A; 4FFD A; 5ALR A; 1GO3 F; 2I5H A; 4IC9 A; 2E1F A; 4KX5 A; 2ZTD A; 1N60 A; 2FE9 A; 3NS1 A; 4OD0 A; 4IRC A; 9ICU A; 4GIB A; 2R8J A; 3ONN A; 4DFK A; 3SAH A; 3UMC A; 5HP4 A; 2KZZ A; 2MRL A; 1S97 A; 3KKA C; 4UB6 U; 2KZM A; 1K1S A; 5III A; 3KZX A; 4I2F A; 3PVX A; 3PW2 A; 3ZDE A; 8ICA A; 4NLB A; 1JUD A; 2ZXI A; 2DPJ A; 3CP8 A; 3GZF A; 2KK0 A; 3UXP A; 5HHH A; 3ETL A; 8ICO A; 5KFR A; 5IIN A; 2VA3 A; 2NO5 A; 1FO4 A; 2C22 A; 2O6K A; 5C0Y A; 1L8L A; 2Y1J A; 1LB2 B; 2KIV A; 1QSY A; 2BGW A; 4F71 A; 4M9G A; 4ED7 A; 3ICX A; 3QZ7 A; 3RR8 A; 3IV6 A; 1S9F A; 5T14 A; 4R8U A; 4EZ9 A; 4PZO A; 1P7D A; 8ICC A; 5L9X A; 4IQT A; 1L7O A; 4RPZ A; 8ICV A; 3MAB A; 3N7P D; 1FIQ A; 2M9N A; 7ICR A; 2RP5 A; 3G6V A; 4HYK A; 3FC4 A; 5ALM A; 2K4I A; 2ESE A; 2JV3 A; 2WAQ C; 2HVH A; 2IOH A; 2YMM A; 1J2N A; 2JMG A; 2ZUC A; 4RQ7 A; 1COK A; 2C28 A; 4QZE A; 1B0X A; 5KFG A; 1JI7 A; 5BOM A; 2CRX A; 5AKZ A; 8ICE A; 3T5K A; 2HI0 A; 4EX6 A; 4F5Q A; 2FPK A; 1RZT A; 5CA7 A; 3QEA Z; 3HIL A; 5HR6 A; 2A1J B; 1NK4 A; 4J9O A; 1Q3V A; 1XWL A; 5JU5 A; 2KN7 A; 3F5A A; 4J9P A; 2WFA A; 3QZ8 A; 1ZQX A; 2RDJ A; 2KHQ A; 2V9W A; 2JGA A; 1ZQH A; 5IIM A; 4DQQ A; 2JEJ A; 2F8L A; 1QSS A; 9ICL A; 2ZIU A; 2J6T A; 2YB4 A; 5KFU A; 5L1K A; 1DGJ A; 1UPH A; 3IM1 A; 2PI5 A; 3SAF A; 1DOQ A; 5AK4 A; 1YT3 A; 3RR7 A; 5DLG A; 5ALP A; 5KT5 A; 5J2J A; 4C0Z A; 1IM4 A; 5AK5 A; 1U49 A; 3JPO A; 4RQ5 A; 1S10 A; 3MR5 A; 2BCU A; 4JWM A; 2XY7 A; 1XU4 A; 3KOO A; 1ZQS A; 2D3D A; 3V6K A; 4IR1 A; 2G07 A; 5EWG A; 5DBC A; 4EYH B; 4AYB F; 2K4E A; 5DG7 A; 4QZG A; 4EEL A; 1T8E A; 4G9B A; 5AKL A; 3QU4 A; 3JPT A; 1ZQR A; 1Z00 A; 1QQ5 A; 4PPX A; 2MUT A; 4CNQ A; 4MFF A; 8ICG A; 2WHE A; 3QE9 Y; 1CI4 A; 1ZXI A; 4CF3 A; 4YD1 A; 3T79 A; 2EAM A; 2IOF A; 2KJ8 A; 2NRT A; 1BNP A; 3M6K A; 5DQG A; 4YN4 A; 2K8C B; 3OHB A; 5F9N A; 8ICF A; 1NKE A; 4JK1 A; 4IR9 A; 4TUR A; 2NRX A; 2DQN B; 4UAT A; 2ZJ5 A; 4P0P A; 2BCR A; 1M6Y A; 4F5O A; 4EYI B; 8ICK A; 5KT7 A; 3HX0 A; 2VIX A; 4DS4 A; 3H7I A; 1ZOL A; 4UAV A; 2DF4 B; 2RLT A; 1UQV A; 1BPY A; 2OCE A; 4UAR A; 7ICK A; 2B0C A; 1NK7 A; 1ZQM A; 5ALU A; 2BCQ A; 3M9N B; 1JIH A; 1ZRN A; 5ALF A; 2P6U A; 2Y1I A; 3WK9 A; 4NJ8 A; 8ICB A; 3NVZ A; 1Z1B A; 1QQ6 A; 5J2E A; 3NTU A; 3BQ1 A; 3NVY A; 3OTQ A; 1ED1 A; 3UXN A; 4UB2 A; 2AGO A; 4KIT B; 4QZ8 A; 4DSI A; 1X42 A; 4USA A; 4DCC A; 4DWI A; 1NJZ A; 1L7M A; 2I6X A; 2W9B B; 1NK0 A; 3ZD8 A; 4YMM A; 2MU2 A; 2WAQ F; 1SWW A; 4O5C A; 1T4G A; 4A8E A; 4ACO A; 5EE0 A; 4O0I A; 4BXO B; 2BQ3 A; 4FS1 A; 2G06 A; 4QWA A; 3H8W A; 3EWA A; 4TQR A; 4X5V A; 5J2K A; 2KJ5 A; 2HBL A; 4PHD A; 4IS7 A; 4MF2 A; 2W9C A; 2OWO A; 3C21 A; 1Z3E B; 2OYY A; 5J0Y A; 1JAL A; 3BQT A; 3GU3 A; 1BPE A; 2W8K A; 2ZJA A; 1NK6 A; 4UAY A; 2H5X A; 5J0R A; 3KD3 A; 3CW2 C; 1PVR A; 5ALY A; 1FEZ A; 2PI4 A; 8ICH A; 1ZQL A; 2ODG A; 4PL2 A; 4F2S A; 3UQ0 A; 2V4R A; 1S0N A; 2QLT A; 1QQ7 A; 1Y88 A; 2YML A; 4Y2R A; 4QWD A; 4R65 A; 2KD1 A; 2FDR A; 1WCL A; 2QB1 A; 2HOI A; 2JZB B; 4P0Q B; 3T5J A; 2P35 A; 5ALT A; 3AN1 A; 4YR0 A; 3BQ7 A; 5AKJ A; 1X6I A; 3G6X A; 4RPX A; 2YMQ A; 1QLN A; 2M0N A; 5KFA A; 1RDF A; 1X40 A; 1X2I A; 4Q8E A; 5DBB A; 4FZM A; 2YY6 A; 2LYA A; 2F2A B; 5EWE A; 5KG4 A; 3PX4 A; 2WB1 C; 1KKX A; 2LHT A; 4M2Y A; 4MFA A; 3SMV A; 4Z6C A; 2W55 A; 3ISD A; 1SIJ A; 4NLZ A; 2W43 A; 4NLN A; 5KFS A; 1T3Q A; 5CEH A; 7ICM A; 4DOC A; 3B0Y A; 5DDM A; 4CDG A; 5J0W A; 7ICF A; 2DL0 A; 4QZ9 A; 1PVQ A; 1WWV A; 1XO1 A; 3SZ2 A; 2R18 A; 4NLK A; 4QZI A; 2JXJ A; 1Q46 A; 5J0P A; 3QUC A; 2QB0 A; 5AK3 A; 1SWV A; 3HPO A; 3BS7 A; 4EEN A; 3QEB Z; 2YTU A; 4F72 A; 4UB4 A; 2I1Q A; 3IDW A; 4PGQ A; 4B9T A; 2BQR A; 3BQ2 A; 4GXI A; 1X9X A; 4C4S A; 1NK8 A; 3C29 A; 5KFE A; 4QIW C; 5KFN A; 2ES6 A; 5AM0 A; 1ZD5 A; 4CE6 A; 3ISC A; 4O5K A; 5KFZ A; 4RQ3 A; 5F9L A; 3BS5 B; 2CXY A; 2ZIX A; 4YMO A; 4UAS A; 1V97 A; 3MGH A; 2E3T A; 2V4Q A; 9ICT A; 1LKY A; 5KFJ A; 4PGX A; 1MC8 A; 4ECT A; 4B9U A; 4UQG A; 5BOL A; 2LM4 A; 5AI8 A; 3H0L B; 7ICT A; 4PH5 A; 4C4R A; 1ZQY A; 3K1Z A; 4DL2 A; 3ZD9 A; 4R64 A; 5D49 A; 2OM6 A; 1JX4 A; 5J2D A; 2W9M A; 9ICB A; 2ISO A; 1L3U A; 3HW8 A; 5ALI A; 5J2A A; 3NAS A; 5B5E U; 3GQC A; 2HOF A; 2QAR B; 5DG9 A; 5JRT A; 5D46 A; 1N62 A; 5KFP A; 3NGD A; 3M9M B; 3QYP A; 3UXO A; 5AI4 A; 4KLO A; 2J6U A; 5KFC A; 1XO0 A; 2UVU A; 8ICQ A; 2XO7 A; 4KLG A; 1HJP A; 3N7R C; 4DLE A; 4FBU A; 1SV0 A; 3LDA A; 3Q8S B; 5ALG A; 4I2I A; 3LVV A; 5AHX A; 3I28 A; 1U4B A; 4CF4 A; 3ALR A; 3TKA A; 4RUC A; 2ALZ A; 1MN8 A; 4KMU A; 2IBK A; 3LWM A; 2FMS A; 1KN5 A; 5ALH A; 5EWF A; 2BPG A; 4KN4 A; 4ELV A; 2AQ4 A; 2BZF A; 3AL0 B; 2F76 X; 1UHU A; 4CF5 A; 2Y0S C; 1T94 A; 3B9J A; 4RQ2 A; 2WB1 F; 2C2D A; 3JPN A; 4DF4 A; 3G6Y A; 4YXM A; 4PHA A; 3DEE A; 4OJO A; 3EW9 A; 3M9O B; 4ED0 A; 2DUY A; 1ZD4 A; 3TAR A; 1A6S A; 3C28 A; 2JR5 A; 4IQV A; 5AKE A; 2YMP A; 3KTQ A; 5ALN A; 1WYG A; 1DXS A; 1RXV A; 3M8R A; 4K4I A; 4DSF A; 9ICK A; 3AU6 A; 4F8R A; 4BWM A; 1OW5 A; 2F1I A; 3PO4 A; 4QZB A; 5CB1 A; 5IIO A; 5ALE A; 2C2E A; 5KG5 A; 4GXK A; 3UMB A; 1ZJM A; 2FMQ A; 1QSL A; 4RQ0 A; 4DL5 A; 3VCB A; 4DL7 A; 3GIM A; 2H3V A; 4QIW F; 4F2R A; 2ISP A; 4B9N A; 3C5F A; 2H3Z A; 2HBJ A; 3D2N A; 4Z6F A; 2FI1 A; 2FLL A; 3MC1 A; 1PK1 A; 2G5I B; 5J0X A; 2XGQ A; 9ICN A; 1KEJ A; 4YD2 A; 8ICX A; 1KBU A; 3AQE A; 3NRW A; 2DWQ A; 2BCV A; 5KG1 A; 3TQ1 A; 4CCH A; 4P2H A; 2PFQ A; 2KIW A; 4ECR A; 1ZJN A; 2BCS A; 1Z1V A; 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4QWB A; 3E58 A; 3M6Z A; 2JEG A; 2HHV A; 1RQL A; 3AMZ A; 1IXR A; 1ZQI A; 2ZIU B; 3PW7 A; 3E0F A; 2BPC A; 5KG7 A; 2EDU A; 4RNN A; 3WKE A; 3PNC A; 4XUS A; 4DSL A; 2G08 A; 1BPB A; 5J8Y A; 4M9N A; 2RQ5 A; 5AKK A; 2G0A A; 3LK9 A; 4QZF A; 3THV A; 3SAG A; 5CP2 A; 2E8N A; 2A3V A; 5IIJ A; 5KL8 B; 1L3V A; 2RHF A; 4FS2 A; 4MFC A; 4FZN A; 7ICH A; 1S0V A; 2KSO A; 1NK5 A; 5DB8 A; 4DEZ A; 1Z00 B; 1L7N A; 1UCV A; 2KHV A; 9ICP A; 1ZQO A; 3SR6 A; 3M1Y A; 3GIJ A; 1KLN A; 3Q8M A; 4DL6 A; 3C5G A; 2GO7 A; 3Q8L A; 4P4M A; 1JRP A; 3KHL A; 4J9N A; 4C4T A; 4C8K A; 1JRO A; 4KLL A; 3EPG A; 3KHR A; 3HP6 A; 4JV1 A; 1RYU A; 1QTM A; 4QNL A; 8ICP A; 3N4M B; 4I2D A; 3CNH A; 3EUB 2; 4NWI A; 4LZD A; 1D8B A; 5CJ7 A; 1COO A; 2Z7J A; 3SEI A; 2ZUB A; 4OJL A; 3RH5 A; 1VJ5 A; 3RH4 A; 2IOF K; 3RB6 A; 3V7K A; 1ZD2 P; 2K4H A; 5F3X B; 4KLQ A; 1NK9 A; 5KT4 A; 4DL3 A; 3GII A; 1DGS A; 1B4F A; 4RQ4 A; 3RH6 A; 4OJP A; 3UPQ A; 4M47 A; 1TVA A; 5J2H A; 3SI8 A; 2W04 A; 2KG5 A; 2NRZ A; 1L5U A; 5J0S A; 1JXL A; 4O3N A; 2ASJ A; 1U45 A; 2ASD A; 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