The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
78
|
structure length |
78
|
Chain Sequence |
SIALPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILAQA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase regulator
|
| source organism |
Escherichia coli
|
| publication title |
Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
E80-TELSAM domain
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| total genus |
19
|
| structure length |
78
|
| sequence length |
78
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5L1M A; 2GLE A; 2E8M A; 3BS5 B; 3K1R B; 2EAO A; 2KE7 A; 4PZN A; 2QAR B; 2QB0 B; 4NL9 A; 2EAP A; 5J8Y A; 5F3X B; 3TAD A; 1LKY A; 2JV3 A; 2LMR A; 2QB1 A; 1RG6 A; 3BQ7 A; 2Y9T A; 2F3N A; 2YTU A; 1V38 A; 5KNI A; 1SV4 A; 3KKA A; 2QKQ A; 2F8K A; 2Y9U A; 1UQV A; 4RQN A; 1B4F A; 2B6G A; 2FE9 A; 2DL0 A; 2KSO B; 3BS7 A; 4NL9 C; 2E8N A; 2K60 A; 1PK1 A; 3SEI A; 1LKY B; 5J8Y C; 2DKX A; 2E8O A; 3TAD C; 1WWU A; 1SV0 A; 2D8C A; 3TAC B; 2D3D A; 1X66 A; 1SGG A; 3KKA C; 1X9X A; 5JU5 A; 2ES6 A; 1PK1 B; 1JI7 A; 1COK A; 3BS5 A; 2LPE A; 4RQM A; 2KG5 A; 4IS7 A; 3HIL A; 4PZO A; 4MHV A; 1DXS A; 1SV0 C; 2QAR A; 2QB0 A; 1F0M A; 2L5Y A; 3IDW A; 4NJ8 A; 3H8M A; 1WWV A; 1SXD A; 2DKZ A; 2K4P A; 2KIV A; 5JRT A; 5JTI A; 2E8P A; 2ESE A; 1SXE A; 1B0X A; 2F44 A; 1KW4 A; 2KMD A; 1X40 A; 3SEN A; 2KSO A; 1UCV A; 1Z1V A; 1V85 A; 1OXJ A; 2EAN A; 1OW5 A; 1PK3 A; 2EAM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2ZTC A; 4P0Q A; 2GLE A; 3H4B A; 1ZQF A; 4KLT A; 1QQ7 A; 2ZIU A; 2F77 X; 1ZQL A; 1UT5 A; 1BPD A; 8ICH A; 1NK6 A; 4C8N A; 4J9O A; 9ICL A; 2FMQ A; 1LKY A; 5J0T A; 3PV8 A; 2YN4 A; 1LB2 B; 2HOI A; 3BZC A; 3C23 A; 3F5A A; 4YN4 A; 4FS2 A; 4F91 B; 5ALL A; 3QUB A; 3TAR A; 1N56 A; 5CWR A; 1U48 A; 1HUO A; 5AKH A; 5AKK A; 2HI0 A; 1S9F A; 8ICK A; 9ICH A; 3LVW A; 3KTQ A; 1B43 A; 1V9P A; 4ECR A; 2G09 A; 4IL6 U; 2W11 A; 3QNM A; 4DFJ A; 1Y88 A; 3ED5 A; 8ICS A; 2CPR A; 1NJW A; 2DPI A; 2YX8 A; 1SIJ A; 2PFQ A; 2MRL A; 2YB1 A; 2KG5 A; 5AKX A; 1JIH A; 4LVS A; 1QQ5 A; 3QXG A; 4Q8F A; 4CNQ A; 4WJ3 B; 4EEN A; 3ZDD A; 3GIK A; 4I2F A; 4Q8E A; 5TZV A; 2JHD A; 3SAF A; 5ALH A; 1DGS A; 4Q43 A; 4ED7 A; 1L3S A; 1MN8 A; 2W04 A; 2VA3 A; 5KFR A; 4UBB A; 1UPH A; 1JRP A; 4KTQ A; 4Q44 A; 1BPB A; 1B0X A; 5AKE A; 1KLN A; 3MDC A; 1Z00 B; 1UCV A; 4J9P A; 3SMV A; 8ICW A; 3HWT A; 4ED0 A; 5KFK A; 8ICR A; 2IA6 A; 3TFS A; 4Y2Y A; 2XO7 A; 2WAQ F; 2CRX A; 4KX5 A; 5E79 U; 4Y2P A; 2BPC A; 2ZUD A; 3K1R B; 1S97 A; 2KOB A; 4U7C A; 5KFP A; 4IRC A; 9ICE A; 5KFM A; 1HEK A; 2BCR A; 2C22 A; 2AGP A; 5CR0 A; 4NWI A; 4XQ8 A; 7ICM A; 1WG8 A; 1Z4O A; 1CUK A; 2DWQ A; 3MGV A; 2F3N A; 2AQ4 A; 4O0I A; 2YMM A; 5ALP A; 2JMG A; 5ALM A; 4C8M A; 3JPS A; 4LJX A; 2PFP A; 4DS5 A; 3H0R B; 4USA A; 5DG7 A; 2VA2 A; 4KLE A; 1MSW D; 3ZD8 A; 1CEZ A; 5KT7 A; 2MU2 A; 2ODG A; 1YZ7 A; 3TAC B; 3MR2 A; 1RQL A; 2AHO B; 1NK9 A; 2BKE A; 2K8B B; 8ICX A; 8ICV A; 4UQG A; 3GQC A; 3Q8R B; 2E5S A; 2OXO A; 5AK5 A; 3GV7 B; 1D9F A; 8ICN A; 1A6S A; 4UB3 A; 2KJ5 A; 3BS5 A; 4RNN A; 4KMO B; 1TAQ A; 2PI5 A; 3M9O B; 4QW9 A; 2FMS A; 3RRG A; 2Q0Z X; 5L1K A; 2ZXI A; 5HR6 A; 5KFA A; 5BPC A; 1RZT A; 1ZQS A; 3BQ0 A; 1IXR A; 1ZQR A; 1BPY A; 3OGU A; 5CJ7 A; 3OJS A; 9ICX A; 1X40 A; 2F1I A; 1VLB A; 4EBC A; 5L1J A; 5HHH A; 4UB2 A; 2HHT A; 2KSO A; 4PL1 A; 2G5H B; 8ICC A; 1L8L A; 1ZD2 P; 2EZZ A; 2JH1 A; 4MF2 A; 4M9G A; 2EAN A; 3KHL A; 7ICO A; 4DQP A; 4KLS A; 3OTQ A; 5AI4 A; 2JZB A; 2EAO A; 1S0N A; 5J2E A; 2QAR B; 1X6I A; 3SV4 A; 5G5H A; 8ICP A; 2KZM A; 5HHI A; 2ZIV B; 5KFC A; 2IOF A; 3ISD A; 3ICX A; 2W55 A; 1DOQ A; 4CF5 A; 3SD7 A; 2B6G A; 4KX3 A; 1U4B A; 3H7I A; 1S5L U; 2G06 A; 2BQ3 A; 4UB8 U; 2K4H A; 2ZJ5 A; 2VJ5 A; 4CCH A; 2HBL A; 2VJ4 A; 1S0O A; 8ICY A; 2KZZ A; 4YFK A; 4O3R A; 3S6J A; 4PGY A; 4R63 A; 1Q3V A; 4KLO A; 1ZQB A; 2ZUC A; 3TAN A; 4F4K A; 1BNO A; 4M9L A; 2ES6 A; 2BZF A; 1PK1 B; 5AI5 A; 4FO6 A; 4RQM A; 3QZ7 A; 1DK3 A; 1DGJ A; 1T3N A; 1N5W A; 2K8A A; 2OH2 A; 4J9M A; 2QB0 A; 4B9U A; 1ZQQ A; 1N2X A; 4YR2 A; 3C1Z A; 2K4P A; 4F93 B; 2E1F A; 2E8P A; 2ATL A; 2XI9 A; 5DGA A; 2WFA A; 1L3V A; 3HT3 A; 2D6F C; 5KFB A; 2KK0 A; 4GLX A; 3ZDA A; 5EWF A; 4Z6E A; 2ZIW B; 4ED8 A; 5KL8 B; 1V85 A; 2ZUB A; 2H3Z A; 4DSJ A; 4KN7 A; 5HNK A; 2I6X A; 4UBC A; 4P4P A; 5L1M A; 4NY8 A; 3QU4 A; 4I2I A; 4F5Q A; 5KL1 B; 4M6W B; 4DQI A; 5AKL A; 4RUA A; 3GV5 B; 2J6T A; 7ICN A; 4QWD A; 4F4X A; 1L8O A; 3QU9 A; 1KL9 A; 4GIB A; 5C5J A; 2QB1 A; 4P0Q B; 5ALQ A; 2VIX A; 3ZD9 A; 4RQN A; 2NO4 A; 2O6K A; 3WKB A; 1IG6 A; 2CXY A; 2C2E A; 3C2K A; 1LKY B; 3EUB 2; 3TFR A; 4JMU A; 1WWU A; 1TV9 A; 7ICH A; 8ICE A; 3QUC A; 5ALG A; 1ZXI A; 1F5S A; 1L7O A; 4NXZ A; 5ALE A; 4I27 A; 3FM9 A; 3UMG A; 7ICI A; 8ICI A; 4YR0 A; 3N4M B; 3IV6 A; 3EZ5 A; 2DUY A; 9ICO A; 3G6Y A; 2XID A; 2XVT A; 2FDR A; 2G5I B; 5CHG A; 2UVR A; 2ZTD A; 2EDU A; 3A0H U; 3OSP A; 2P66 A; 4C8K A; 3H8M A; 4DL7 A; 4UW9 A; 5DLF A; 5KG4 A; 4YQW A; 3M8S A; 2E1E A; 5JRT A; 4TUP A; 3C28 A; 8ICO A; 5KFO A; 3MR5 A; 2F76 X; 1SKW A; 2MUT A; 3SEN A; 5KFU A; 5J2H A; 3CP8 A; 4EEL A; 1IM4 A; 4DSE A; 4F72 A; 2HOQ A; 1KBU A; 1S8O A; 4X5V A; 3I76 A; 4AYB C; 2NRW A; 2B0C A; 4R65 A; 3RR7 A; 3UXN A; 4PJ0 U; 5AM0 A; 3M6Z A; 9ICU A; 2XGP A; 4QZA A; 3T5H A; 4CDG A; 4NLZ A; 3RR8 A; 4FBT A; 4RQ1 A; 3CW2 C; 5J0O A; 3MGH A; 4PHA A; 3QU7 A; 5J2C A; 3EWA A; 2KFZ A; 5DBB A; 2BPG A; 4QJF B; 1NK5 A; 4F4W A; 1X9W A; 7ICU A; 5KT6 A; 2F8K A; 3QU5 A; 3WKD A; 1B4F A; 5AI6 A; 8ICG A; 1ZQA A; 9ICB A; 7ICJ A; 4DLE A; 4I2E A; 4BWJ A; 5L1I A; 2PMZ F; 4NL9 C; 4NLB A; 5KFV A; 5CP2 A; 3RTV A; 3JPT A; 4KLH A; 3H0M B; 3LDA A; 1M6Y A; 3QUQ A; 5HR7 A; 4PHE A; 3N7R C; 3PX0 A; 2HHX A; 1KKX A; 4CRX A; 3THV A; 1JAL A; 1ZYQ A; 2I1Q A; 3T5K A; 2JEI A; 4QZE A; 3M8R A; 2JH7 A; 2FLN A; 1A0P A; 1FFV A; 4F4Y A; 1J97 A; 1NJY A; 9ICC A; 5EE3 A; 1P7D A; 2PKE A; 4RQ7 A; 9ICM A; 3OSN A; 2W7O A; 1ZQY A; 2KV2 A; 2A19 A; 1NZP A; 2BPF A; 3WK4 A; 5CRX A; 2LKY A; 4DOC A; 5TIS U; 3OJU A; 7ICQ A; 3GIJ A; 3RJK A; 2JR5 A; 5AI0 A; 3OHA A; 3NS1 A; 1TK8 A; 2IOF K; 3PR4 A; 3IM1 A; 4JB3 A; 2Y1I A; 4DSF A; 2H3I A; 3JPN A; 3ETL A; 3SV3 A; 1SL0 A; 2PI4 A; 4OO1 J; 1ZRN A; 4UAR A; 2M0N A; 4F2S A; 2G0A A; 3RH6 A; 3M1Y A; 2NO5 A; 2IOH A; 1ECW A; 1J2M A; 4KLI A; 8ICB A; 2Y1J A; 3PVX A; 4EYH B; 2ZJA A; 4JWN A; 4TQR A; 4DQR A; 1RM6 C; 2LBO A; 1SV4 A; 4KLU A; 2JZB B; 4BXO B; 2VA8 A; 2Y9U A; 1UQV A; 5DDY A; 2KJ9 A; 4YXM A; 3PO4 A; 5ALI A; 3H8J A; 4RT2 A; 3MR6 A; 1XSP A; 4CF3 A; 2ZG6 A; 4YR3 A; 2ISO A; 5DQI A; 5J0R A; 2LM4 A; 3QE9 Y; 3V7J A; 1X66 A; 1SGG A; 9ICA A; 3QEA Z; 4O3M A; 4IR9 A; 4NLN A; 3NAS A; 5CB1 A; 2AGQ A; 3K1Z A; 8ICA A; 2WF5 A; 2MAX A; 3UQ2 A; 2OCE A; 5AK3 A; 2NV3 A; 5AKG A; 1A76 A; 5DLG A; 4ED3 A; 4PZO A; 3HX0 A; 2RLT A; 3PSI A; 1MC8 A; 4EBD A; 3AUO A; 3NUQ A; 5AKI A; 3RAX A; 3ZDE A; 2W9B A; 4DL4 A; 2FJ6 A; 3AN1 A; 1TFR A; 3NRW A; 5JTI A; 4U6P A; 2KFN A; 4RQ2 A; 4Y2T A; 2W9C A; 4QWB A; 3QX7 A; 2R8J A; 4IR1 A; 3LK9 A; 2WF6 A; 5J0S A; 4PGQ A; 2K8C B; 1RYR A; 2IMW P; 1L7N A; 4DL2 A; 2A1J A; 4R8U B; 1OXJ A; 4OJ5 A; 4RQ0 A; 1SKS A; 5AHX A; 1KRP A; 2H3V A; 3Q8L A; 5ALF A; 2BCS A; 3C2L A; 1N62 A; 3TQ1 A; 1X9S A; 4OJO A; 4XUS A; 1NJX A; 4NL9 A; 4F5O A; 4O3N A; 2HHS A; 2HSZ A; 5DG9 A; 1BPE A; 2HVH A; 9ICW A; 5KT5 A; 5IIJ A; 1HJP A; 4YMN A; 9ICR A; 5KG0 A; 5KTQ A; 3H4D A; 1NKE A; 5IIK A; 5G5G A; 1FFU A; 3JPR A; 2DL0 A; 3V7L A; 3PMN A; 4B9S A; 3EPG A; 4NLC A; 2GOL A; 4M0A A; 4P0P A; 4DEZ A; 1RDF A; 5DKW A; 3C29 A; 1X6J A; 1ED1 A; 2HHV A; 3WKE A; 3ZDB A; 3QU2 A; 5CA7 A; 5ALZ A; 5KFJ A; 4RQ3 A; 2EZX A; 1SWW A; 3KOO A; 2BQU A; 3MFH A; 2KIC A; 3WK8 A; 1JI7 A; 4I2J A; 1ZQN A; 1IIP A; 3IN5 A; 7ICT A; 4JK1 A; 4B6J A; 1XC9 A; 5ALS A; 1ZQ1 C; 2XIC A; 4MFF A; 4QZC A; 3ISB A; 3TAQ A; 4IRD A; 2W3S A; 3Q8M A; 4FZN A; 4FFD A; 4O5C A; 4MFA A; 1BPZ A; 4EZ6 A; 4YD1 A; 4RPZ A; 2KIV A; 3RJE A; 2K4E A; 5ALX A; 5KFF A; 3WU2 U; 2WB1 C; 3RF9 A; 3L4P A; 3GFK B; 9ICF A; 1CI4 A; 2AJQ A; 1D8Y A; 2IBK A; 3NVY A; 2JEF A; 5DBA A; 3WK7 A; 4MF8 A; 4TUR A; 1PK3 A; 2RQ5 A; 1TK5 A; 1CRX A; 2DPJ A; 2I5H A; 4AYB F; 3H8W A; 5JUM A; 2MUT B; 3PX4 A; 1JXE A; 2LM1 A; 1ZD4 A; 4Y2U A; 5KFG A; 1Z1B A; 4OJ6 A; 8ICF A; 4QWC A; 5AK6 A; 2ZIX A; 4RNM A; 1UT8 A; 2H3Q A; 3PW4 A; 2N1R A; 2Y9T A; 3WK5 A; 4YMM A; 4DF4 A; 2HOF A; 1L7M A; 3AMZ A; 4P4M A; 2FI1 A; 5C0Y A; 4KIT B; 5J0X A; 4G3I A; 2W9A A; 4DFM A; 4DOB A; 5J0Q A; 1ZJN A; 1S76 D; 4YCX A; 4KN4 A; 5KFL A; 3GDX A; 4XRH A; 4Y2R A; 2DQN B; 1D8L A; 4ED1 A; 4ECZ A; 3TAP A; 2A3V A; 3L5K A; 3V7K A; 3H40 A; 2Y0S C; 3T3F A; 1HIW A; 3JPO A; 4EYI B; 2P35 A; 1ZQH A; 3MDA A; 5B66 U; 1XSN A; 1ZRM A; 3F5E A; 4BWM A; 3F2B A; 3RBD A; 4MEY A; 1XS9 D; 3QEB Z; 4NJ8 A; 4FZM A; 3BJY A; 9ICP A; 2FLL A; 5BOM A; 2A1A A; 3IG8 A; 3GIL A; 3SQI A; 1NK7 A; 1NKC A; 4FZL A; 3VCB A; 4EX6 A; 2GWS A; 1ZQJ A; 1KQQ A; 4RT3 A; 1K5O A; 4ECU A; 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4O3S A; 3WKC A; 3ONN A; 3KD3 A; 3AU2 A; 2AQ0 A; 4K4I A; 2BCU A; 1N61 A; 2E8M A; 5KG1 A; 3TKA A; 4I2A A; 5J2J A; 1BNP A; 1NK8 A; 4YP3 A; 9ICJ A; 4E0D A; 1N60 A; 1BVS A; 4QZ8 A; 8ICU A; 2A1J B; 4QNL A; 4Y2J A; 3QZ8 A; 5J2D A; 1T4G A; 5F3X B; 4HYK A; 5AM5 A; 3RRH A; 5AI8 A; 5ALO A; 4MEX A; 1NI3 A; 2ASD A; 5KFT A; 4PPX A; 1VDV A; 5KT2 A; 5EWE A; 4DOA A; 2RRD A; 1COO A; 3G6X A; 3RJH A; 1RYS A; 2WHE A; 3CYM A; 3BQ2 A; 3D2S A; 4IQW A; 4RQ5 A; 4Z6F A; 5J8Y C; 5KFY A; 4DFP A; 2RDI A; 1X2I A; 4K4H A; 1QTM A; 5AIA A; 4MFC A; 4RPX A; 5JU5 A; 2XC9 A; 2P6U A; 1NK4 A; 4NM1 A; 4ELU A; 2G07 A; 3RJI A; 1XU4 A; 3MBY A; 2HBK A; 4P0P B; 1MQ2 A; 1NZB A; 4MHV A; 2QAR A; 3IRU A; 5IIM A; 2OEH A; 4Y2Q A; 4RQ4 A; 1SXD A; 4UAV A; 4QZD A; 3MFI A; 2R8K A; 1PUZ A; 2RHF A; 4JV2 A; 2ZIV A; 1D8B A; 3PST A; 1NKB A; 3AM9 A; 3ISC A; 2KMD A; 4DQQ A; 4J9K A; 4UAZ A; 1N63 A; 3FAH A; 2R8I A; 4ECS A; 3WKA A; 2CN1 A; 5ALU A; 1K1Q A; 4QZB A; 4GXJ A; 3F2D A; 1ZQM A; 3SR6 A; 3SYZ A; 3BS5 B; 3E58 A; 4QIW C; 4NV0 A; 1U49 A; 5AK4 A; 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