The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
78
|
structure length |
78
|
Chain Sequence |
SIALPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILAQA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
E80-TELSAM domain
|
| molecule tags |
Hydrolase regulator
|
| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
19
|
| structure length |
78
|
| sequence length |
78
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SXD A; 2LPE A; 3BQ7 A; 5F3X B; 1WWV A; 1B0X A; 3HIL A; 1V38 A; 1DXS A; 3KKA C; 4NL9 A; 5L1M A; 1PK3 A; 1KW4 A; 4NJ8 A; 5J8Y A; 1SV0 C; 2QB1 A; 1F0M A; 1RG6 A; 2F44 A; 2KSO A; 1Z1V A; 1JI7 A; 1X66 A; 2JV3 A; 2K60 A; 2D3D A; 1SXE A; 1UCV A; 3H8M A; 2K4P A; 2EAM A; 2L5Y A; 1OW5 A; 3BS5 A; 1LKY A; 2EAN A; 3SEI A; 1V85 A; 4NL9 C; 2KSO B; 2KE7 A; 1COK A; 5J8Y C; 2D8C A; 5JRT A; 4PZN A; 1PK1 A; 2GLE A; 4PZO A; 2DKZ A; 2KMD A; 2KG5 A; 4MHV A; 1UQV A; 1WWU A; 2DKX A; 2FE9 A; 1LKY B; 3BS5 B; 3TAD A; 1SV0 A; 3K1R B; 3TAC B; 2F8K A; 1OXJ A; 2E8P A; 2QKQ A; 2QB0 A; 1PK1 B; 2F3N A; 1SGG A; 5KNI A; 4IS7 A; 1B4F A; 2QAR A; 2ES6 A; 2LMR A; 3KKA A; 2ESE A; 3TAD C; 3BS7 A; 2EAO A; 2B6G A; 1X40 A; 2KIV A; 2QB0 B; 2YTU A; 2E8O A; 1SV4 A; 5JU5 A; 2EAP A; 3IDW A; 2Y9U A; 5JTI A; 4RQN A; 2E8M A; 2E8N A; 3SEN A; 2Y9T A; 1X9X A; 2DL0 A; 2QAR B; 4RQM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1SXD A; 9ICU A; 3BQ7 A; 2PKE A; 1ZRN A; 4US8 A; 8ICU A; 3WKA A; 4NL9 A; 3C2L A; 1ZQU A; 2J6U A; 1B43 A; 3D2S A; 5G5G A; 4XUS A; 2IOF K; 2KKP A; 2KSO A; 1Y88 A; 4BJQ A; 5J0Y A; 8ICX A; 4TQR A; 4UAR A; 7ICI A; 2EAN A; 2MU2 A; 3PR5 B; 5KT7 A; 4UB5 A; 3HWT A; 3OSN A; 2YMM A; 1V97 A; 2OM6 A; 3V72 A; 1UA1 A; 4EZ6 A; 3RH4 A; 1TAQ A; 3B0X A; 4PZN A; 4YQW A; 4ACO A; 9ICF A; 1K1S A; 5KT4 A; 2DUY A; 4I2E A; 1NK6 A; 5CJ7 A; 3RBD A; 1LKY B; 4B9L A; 4ELU A; 4Z6C A; 3T5H A; 9ICQ A; 1XU4 A; 1ZQN A; 2G06 A; 1X42 A; 2JEF A; 1U9L A; 3RAQ A; 9ICA A; 2IBK A; 1ZRM A; 2IOH A; 4Y2S A; 5KFK A; 1KDH A; 2AJQ A; 2ZIV B; 8ICA A; 5KT5 A; 4QWB A; 5L1J A; 2W43 A; 5J0U A; 3N7P D; 1ZXI A; 5J0Q A; 1L7M A; 3TAN A; 3QUB A; 2XCA A; 3M6K A; 4ECR A; 2RQ5 A; 2P66 A; 1XO0 A; 4MF8 A; 4RQ7 A; 1DK2 A; 2UVV A; 1V9P A; 1K1Q A; 4F4W A; 4B6J A; 3SEN A; 3ED5 A; 4YVZ A; 5J2K A; 3QU5 A; 5KFL A; 4FBT A; 1NK4 A; 4C4T A; 2I5H A; 5AIB A; 2KIW A; 2P35 A; 1QQ6 A; 4ECU A; 2EZX A; 2H3V A; 4O5E A; 3Q8S B; 1Z00 A; 4GXK A; 9ICB A; 5J2E A; 5J8Y A; 2F2A B; 1ZQG A; 2HCF A; 2DPJ A; 2BCS A; 4RQ1 A; 5AM5 A; 2G0A A; 4M9N A; 8ICR A; 5KFO A; 2MUT B; 4YR2 A; 1TE2 A; 5ALG A; 3QUT A; 1PUZ A; 5AI0 A; 3OJU A; 1PZN A; 5CB1 A; 5AKK A; 3MGV A; 2JEI A; 4NV0 A; 3ICX A; 4Y2Y A; 1JN3 A; 4UB8 U; 1ZQJ A; 3QZ7 A; 4NWI A; 1ZQH A; 3B0Y A; 2VAN A; 4KLI A; 5ALF A; 3I1Y A; 8ICH A; 3TAD A; 4P4O A; 2ZG6 A; 8ICO A; 4B9S A; 3QXG A; 4UAY A; 4NM1 A; 1JUD A; 1SV0 A; 3PX4 A; 2ASD A; 5KG6 A; 2JEG A; 4KN4 A; 4U6P A; 4DSE A; 1KFD A; 3WK9 A; 4ECQ A; 3C2K A; 1SWW A; 4DLE A; 2FLP A; 3QX7 A; 3IRU A; 4YFK A; 4J9O A; 3Q8R B; 3TAP A; 5J0P A; 2RRD A; 1ZQX A; 1YZ6 A; 3SI8 A; 4J9M A; 3QYP A; 3UXP A; 5DQI A; 1HUO A; 3TQ1 A; 1MSW D; 3PO4 A; 4KIT B; 1C20 A; 3G6X A; 2C2E A; 4ELT A; 4I2H A; 5CP2 A; 1CRX A; 5KG7 A; 9ICO A; 4CCH A; 1S8O A; 2EDU A; 8ICL A; 5KFH A; 3Q8P B; 4EYH B; 2C2D A; 1A0P A; 4OJO A; 1L6N A; 1WYG A; 4PJ0 U; 5KG2 A; 4ED1 A; 4DQP A; 2AH5 A; 2YN4 A; 1FFU A; 3V7J A; 4DL5 A; 5ALT A; 1TAU A; 3Q8M A; 2D3D A; 3JPS A; 8ICC A; 2K4P A; 2GH1 A; 2HSZ A; 4P4P A; 4KN7 A; 1ZQE A; 4PH5 A; 3LVV A; 1LV5 A; 3C29 A; 4GFJ A; 3RAX A; 5D4B A; 4O5K A; 4PHA A; 2F1J A; 2XVT A; 3KD3 A; 2N1R A; 1CEZ A; 4OJL A; 1ZQD A; 2IHM A; 1KTQ A; 2Y1I A; 5KFX A; 1T4G A; 2M9N A; 5CRX A; 4M9J A; 3C23 A; 3H8W A; 4EX6 A; 3GII A; 3RBE A; 1B22 A; 1X2I A; 4FFD A; 2VA3 A; 1WUD A; 1ZQL A; 1T3Q A; 3M9M B; 2FPK A; 2FMP A; 1U47 A; 1ZQP A; 2G5H B; 1O03 A; 3PO5 A; 2LI6 A; 3AQE A; 1ZD3 A; 4DFD A; 2ZTE A; 1NJX A; 3BZK A; 4ECW A; 3NS1 A; 1XWL A; 5B66 U; 5KFE A; 4KLS A; 2K8A A; 3BS7 A; 5AKG A; 3JPN A; 2BGW A; 4JK1 A; 2BPF A; 5JU5 A; 3IDW A; 2HOQ A; 1SL2 A; 3UXO A; 1QH9 A; 1Z1B A; 3SR6 A; 4IL6 U; 5AI8 A; 5HHH A; 9ICP A; 7ICJ A; 4J9R A; 5BOL A; 8ICQ A; 5AIA A; 2F77 X; 2ZUC A; 5AK6 A; 2HOI A; 2Q4T A; 3M9O B; 5J2H A; 1HUZ A; 4GXJ A; 4QIW F; 2RLT A; 5C0Y A; 5AKZ A; 4F2S A; 4M9G A; 5L1I A; 2PI4 A; 5HNK A; 3RB3 A; 7ICS A; 2UVR A; 1D8B A; 2XC9 A; 3EWA A; 4YXJ A; 3ISD A; 3G6Y A; 1ZQB A; 1ZQV A; 2C22 A; 4ECV A; 2G07 A; 3KOO A; 2HOF A; 2KOB A; 1QTM A; 3DV9 A; 2W9C B; 2RHF A; 2LYA A; 5AK3 A; 4DCC A; 8ICV A; 9ICR A; 3PW7 A; 1PVQ A; 2BR0 A; 5IIO A; 3LDA A; 4FZN A; 2I9G A; 1ZQY A; 2AXT U; 4I2C A; 4IQT A; 2W7P A; 2FE9 A; 2DGZ A; 3QU2 A; 9ICL A; 2WF6 A; 3T79 A; 3F2C A; 1KBU A; 1KL9 A; 3TAC B; 3N4M B; 2EZZ A; 3WKD A; 1ZQC A; 1KQQ A; 2F3N A; 2W54 A; 3QE9 Y; 3WK5 A; 5HHI A; 2ZIW B; 4IS7 A; 3K75 D; 3RJG A; 1F5S A; 2DBY A; 1D9D A; 3QU9 A; 5KG0 A; 4KLG A; 4PGY A; 4DWI A; 5KG3 A; 3H7I A; 2XIC A; 3MR5 A; 2YTU A; 2KJ8 A; 2AGO A; 2ZIU B; 3N7S C; 4KTQ A; 5JTI A; 1NKE A; 4F71 A; 4R65 A; 3GFK B; 1X9X A; 4OJ5 A; 4KLF A; 3RJH A; 3A0B U; 3GU3 A; 4M04 A; 9ICV A; 4Z6F A; 3F2D A; 5DLG A; 4QZA A; 4DSI A; 5HR7 A; 3UPQ A; 1S97 A; 4O3R A; 3NVY A; 4HYK A; 5L1L A; 1MQ2 A; 2EQY A; 1IIP A; 4M0A A; 8ICG A; 1RPL A; 2BKE A; 5KFQ A; 1A6S A; 5DBB A; 5KFI A; 1UT8 A; 2H5X A; 4J9P A; 2F44 A; 4RUC A; 4KX3 A; 4US9 A; 4AYB C; 1ZYQ A; 2K60 A; 3ONN A; 1OUQ A; 1P7D A; 3VC8 A; 2AHO B; 4RQ0 A; 3MGI A; 4M6W B; 1LKY A; 1X9S A; 5KT2 A; 5KFV A; 2OH2 A; 9ICK A; 3H0L B; 2ZUD A; 2W04 A; 5ALM A; 2W3R A; 2B21 A; 4PGX A; 2ZIV A; 5AK4 A; 1N60 A; 1UQV A; 2DKX A; 2BCQ A; 1SKS A; 4EX7 A; 2KKV A; 3ZDA A; 4YCX A; 5HP4 A; 1J2M A; 2VA8 A; 5AKI A; 2W9A A; 2WB1 F; 1RYR A; 1ZQ1 C; 5AKJ A; 5EOZ A; 5AM2 A; 4EEY A; 4NXZ A; 5J0X A; 2HHT A; 5ALH A; 4QJF B; 3QU7 A; 1X9W A; 2DFL A; 4U7C A; 1QCK A; 2FI1 A; 4CF3 A; 4I2D A; 5ALZ A; 2VJ5 A; 4BGD A; 2EAO A; 2BDU A; 4UQG A; 5J0T A; 2WF7 A; 5DB7 A; 1NI3 A; 4RNN A; 3FM9 A; 2LBO A; 2WAQ C; 3EYZ A; 3UMG A; 1T3N A; 9ICX A; 3RB6 A; 4YD2 A; 2BZF A; 4F4Y A; 3NTU A; 2ZJA A; 4QWC A; 1O08 A; 1T94 A; 5IIM A; 3RH5 A; 3KHR A; 7ICQ A; 1S0N A; 2KZZ A; 2MUT A; 3KKA C; 4QZG A; 3GQC A; 5L1M A; 3M8S A; 4IC9 A; 1SV0 C; 2R18 A; 3SQI A; 2PI5 A; 2ZIX B; 3UQ0 A; 3KZI U; 2W8K A; 2B0C A; 3PSP A; 1MQ3 A; 1RQN A; 2PFQ A; 4R8U B; 3T3F A; 4YG2 A; 1KSP A; 4F8R A; 2C28 A; 3E2E A; 4UB1 A; 1CUK A; 3R9K A; 4JUZ A; 1XNS A; 1IG6 A; 3L5K A; 1ZQZ A; 3UXN A; 3OHB A; 9ICT A; 4MEY A; 2HVH A; 4O9M A; 5CEH A; 3RR8 A; 2W11 A; 2WF5 A; 4TQS A; 2XY5 A; 4DL6 A; 1X9M A; 4Z6E A; 1Q3V A; 1T7P A; 1FIQ A; 1L8L A; 3K1R B; 3WKC A; 8ICT A; 2E8P A; 3CP8 A; 1ZQQ A; 1UHU A; 3C5F A; 4J03 A; 4RU9 A; 2MA1 A; 1Z3E B; 5KFU A; 4IRK A; 4XRH A; 8ICY A; 1SIJ A; 5EE1 A; 5ALO A; 3UMB A; 1ZQS A; 4Q43 A; 2R8I A; 4K4H A; 5DKW A; 2B6G A; 1BVS A; 3PW4 A; 5J2B A; 1KRP A; 3QUQ A; 5AKE A; 4M47 A; 3WK6 A; 3RRG A; 3QU4 A; 2QAR B; 3PSF A; 1XSN A; 1N56 A; 1L7P A; 4ED8 A; 3ISB A; 2LM1 A; 5KL1 B; 4UB3 A; 1NK0 A; 5GTH U; 2FLN A; 4K4I A; 1BPX A; 4JWM A; 4G3I A; 4NJ8 A; 4GC6 A; 1K5O A; 2C2R A; 3D2Q A; 4F5O A; 2AQ0 A; 3AUO A; 1TV9 A; 1BNO A; 4MF2 A; 4KLJ A; 1MC8 A; 2NYV A; 2R8J A; 4KLU A; 1SXE A; 3JPO A; 4LJX A; 4C8N A; 1Z4N A; 3F2B A; 2NRZ A; 5HR6 A; 4YR0 A; 1RXW A; 3ORY A; 1N2X A; 2K4I A; 1SL0 A; 5E79 U; 5KFP A; 4QZB A; 1S0O A; 4XQ8 A; 5J0S A; 3FYH A; 3V7K A; 3ETL A; 2LYB A; 5ALX A; 4ED7 A; 4OCZ A; 2JXJ A; 2WHE A; 3AMZ A; 4UAT A; 5DB6 A; 4JV2 A; 7ICG A; 5AI5 A; 1S9F A; 3H0R B; 2YML A; 3MDC A; 3PNC A; 5EE0 A; 2CPR A; 4CE6 A; 2F8K A; 2K4H A; 4ED0 A; 4JB3 A; 1BPZ A; 2V4Q A; 4UAS A; 3GV7 B; 4NY8 A; 4DFP A; 3DEE A; 5EWE A; 2ASJ A; 2ES6 A; 3ISC A; 3TI0 A; 2KJ5 A; 5DLF A; 4YMM A; 3TFS A; 2LMR A; 3KKA A; 5KFR A; 1KN5 A; 3BQ0 A; 4DS4 A; 4I2I A; 1NZP A; 2WF9 A; 1X40 A; 1ZQT A; 3GIJ A; 3NRW A; 5K4L A; 2HHX A; 2E8M A; 3PW5 A; 4DSK A; 5DGA A; 5J0O A; 4MEX A; 4RQM A; 3F53 A; 2KZ3 A; 3RR7 A; 3IHQ B; 3HIL A; 5KL8 B; 1V38 A; 4C4R A; 3HRD D; 5D49 A; 2H3I A; 2QLT A; 5KFT A; 1PK3 A; 2BPG A; 2W9C A; 3KHG A; 1GO3 F; 4Y2Q A; 5IIL A; 3IV6 A; 3Q8Q B; 4B9V A; 1S77 D; 2KHV A; 4EBC A; 1RQL A; 4NLN A; 4DEZ A; 4USA A; 2EAM A; 1OW5 A; 2WF8 A; 3NRZ A; 1S0M A; 1BPD A; 5D46 A; 3VCB A; 2KN7 A; 1MA7 A; 3AEV A; 3RJF A; 9ICM A; 4F91 B; 3WKE A; 4DOB A; 3BZC A; 5EE3 A; 4RQ8 A; 2YY6 A; 3MR6 A; 4YMO A; 1ZD2 P; 4QZ9 A; 3KBB A; 4BXO B; 4QW8 A; 2F8L A; 5ALV A; 2DKZ A; 5KFG A; 4EEN A; 3CYM A; 2ZIW A; 4FZL A; 4IQW A; 1ZQI A; 2LKY A; 5L1K A; 1XS9 D; 3ZD9 A; 2PMZ F; 7ICN A; 4Y2X A; 1N63 A; 4QIW C; 2NRV A; 1N5X A; 2NRX A; 3GV5 B; 3WK7 A; 2ZIU A; 4I27 A; 3KZX A; 7ICP A; 1JRO A; 5IIN A; 2P6R A; 2CRX A; 4LZG A; 1YT3 A; 3PR4 A; 5KFN A; 3PV8 A; 1J97 A; 1NK5 A; 4Y2R A; 1HJP A; 4P0P B; 1NKB A; 2HDO A; 9ICH A; 1RDF A; 2Y0S F; 1RZT A; 1RYS A; 2EAP A; 2K4E A; 2ZTD A; 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4R8U A; 2BQU A; 4M9L A; 3RRH A; 1N62 A; 3GIL A; 4RPX A; 2YB1 A; 4RQ5 A; 4F50 A; 2WB1 C; 4UB2 A; 5KT6 A; 3QEB Z; 3AU2 A; 3NVW A; 2ZTC A; 1JI7 A; 2PFN A; 3PST A; 2YQE A; 5J2C A; 4EBD A; 5C5J A; 2I6X A; 5ALK A; 4KLT A; 2L5Y A; 2BCV A; 1L3V A; 3IP4 B; 4BDP A; 3KHL A; 4QWD A; 7ICE A; 2JMG A; 5KFZ A; 4IQV A; 4JWN A; 4KLM A; 1JIH A; 3D6J A; 3H40 A; 1KKX A; 8ICE A; 5JRT A; 2W7O A; 1SWV A; 4PL1 A; 5H2F U; 2YX8 A; 3L4P A; 5ALR A; 3PY8 A; 3HT3 A; 5AKY A; 3RH6 A; 1TK8 A; 4MHV A; 2OEH A; 3LVW A; 2HW3 A; 3PZP A; 5TIS U; 3M6Z A; 3EZ5 A; 4F5P A; 3SD7 A; 1M6Y A; 3IG5 A; 1PK1 B; 2A3V A; 4F3O A; 5KTQ A; 3HKZ C; 3V7L A; 1B4F A; 2W03 A; 4O3O A; 4UBC A; 5AIC A; 5AKL A; 2ISO A; 2VJ4 A; 5ALY A; 2QAR A; 4LVS A; 3GV8 B; 1RYU A; 2HBL A; 2H3Z A; 3RTV A; 5JUM A; 7ICV A; 4QZ8 A; 1WG8 A; 3ZDD A; 4TUP A; 3LWL A; 2GWS A; 5AM3 A; 5KFW A; 3T5K A; 2KVC A; 2DL0 A; 1QSL A; 4I2B A; 5KFF A; 4DF4 A; 3MR2 A; 3HW8 A; 7ICU A; 3QNM A; 4I2G A; 4JV0 A; 4EEK A; 1KW4 A; 2KFZ A; 4ZOH C; 2BCU A; 4ECT A; 1F0M A; 4EBE A; 3N28 A; 2XGP A; 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