The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
78
|
structure length |
78
|
Chain Sequence |
SIALPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILAQA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase regulator
|
| source organism |
Escherichia coli
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| publication title |
Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
E80-TELSAM domain
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| total genus |
19
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| structure length |
78
|
| sequence length |
78
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KMD A; 2F8K A; 2Y9U A; 4MHV A; 1F0M A; 3SEN A; 1SXE A; 1OW5 A; 2B6G A; 1PK1 A; 1Z1V A; 1V38 A; 1PK1 B; 4RQN A; 2F44 A; 2K4P A; 2Y9T A; 3BS7 A; 1LKY B; 5JTI A; 4NJ8 A; 2E8P A; 1SGG A; 2QB0 A; 2QB0 B; 2L5Y A; 3BQ7 A; 2JV3 A; 4PZN A; 2KSO B; 2E8O A; 1SXD A; 2ES6 A; 3TAD A; 2YTU A; 1X40 A; 2QB1 A; 2DKX A; 1PK3 A; 3H8M A; 3TAC B; 3TAD C; 5F3X B; 5L1M A; 3HIL A; 1V85 A; 1UQV A; 1KW4 A; 3SEI A; 1JI7 A; 2DKZ A; 2E8M A; 2EAO A; 2K60 A; 1OXJ A; 5JU5 A; 5KNI A; 4NL9 A; 2EAN A; 1B0X A; 2D3D A; 4NL9 C; 1DXS A; 3BS5 A; 2EAP A; 3BS5 B; 3K1R B; 2E8N A; 4PZO A; 1UCV A; 2LPE A; 5JRT A; 3IDW A; 2QAR A; 2QAR B; 2D8C A; 3KKA A; 1SV4 A; 2LMR A; 2DL0 A; 3KKA C; 2KG5 A; 1WWU A; 2QKQ A; 1X66 A; 2KE7 A; 2KIV A; 4IS7 A; 2ESE A; 2EAM A; 1COK A; 2F3N A; 4RQM A; 2FE9 A; 1LKY A; 1B4F A; 1WWV A; 1RG6 A; 1SV0 A; 5J8Y A; 1X9X A; 2KSO A; 2GLE A; 1SV0 C; 5J8Y C; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DPJ A; 4PL1 A; 4Y2Q A; 5ALG A; 4P0Q A; 4EEN A; 3AU2 A; 4F4X A; 5J0Y A; 5AKH A; 2HOF A; 1ZQH A; 5DG7 A; 4IRD A; 3PW4 A; 1WUD A; 2KJ9 A; 5J2C A; 2VA2 A; 3MFI A; 4BWJ A; 1D8Y A; 2QB0 B; 1ZQA A; 3BQ7 A; 1ZQY A; 3H40 A; 3RJH A; 4DOA A; 4KLF A; 1P7D A; 1B43 A; 2KIW A; 5KTQ A; 3JPR A; 4RNO A; 2QB1 A; 4RU9 A; 1COO A; 5HNK A; 9ICX A; 1L7P A; 2HBL A; 5AK3 A; 4J9O A; 4X5V A; 2NO5 A; 1TK8 A; 3EW9 A; 1XSN A; 5ALZ A; 4ED2 A; 1ZJN A; 4RQ6 A; 3UM9 A; 1ZQP A; 3ZDB A; 2ZTC A; 1QTM A; 2HVH A; 2MA1 A; 1T3N A; 5CP2 A; 1KTQ A; 4B9N A; 3AQE A; 2H3V A; 3PO5 A; 2ZIX A; 4BUG A; 3GIJ A; 4P4M A; 5AK6 A; 1QSS A; 4G3I A; 5KFP A; 8ICU A; 1SKS A; 5KT2 A; 3BQ0 A; 2XI9 A; 4DFK A; 3MR2 A; 1S0V A; 1YT3 A; 3V7J A; 4QZG A; 2CXY A; 4FZM A; 4ELV A; 5KG0 A; 2LYA A; 3C5G A; 5AK4 A; 4GXJ A; 3B0Y A; 4I2C A; 4DFP A; 1ZQC A; 1JIH A; 2RHF A; 2ZJA A; 4Z6E A; 3IG5 A; 4CDG A; 4FS2 A; 5KFQ A; 2KHV A; 2PI5 A; 4QIW C; 2ZIU A; 5K4L A; 2G5I B; 3HPO A; 5L9X A; 1KEJ A; 3MAB A; 4YG2 A; 3PSI A; 4B9T A; 4Y2Y A; 3PX4 A; 3B0X A; 4HAI A; 1V38 A; 1S9F A; 2PI4 A; 3QUT A; 4NLB A; 2UVU A; 1BPE A; 3D6J A; 8ICV A; 5KFC A; 4PL2 A; 3MBY A; 8ICO A; 4F71 A; 2AQ4 A; 2LYH A; 3HW8 A; 7ICO A; 3QU4 A; 2ISO A; 2E1E A; 1O03 A; 4QWD A; 5KFI A; 1X40 A; 1BNP A; 3B9J A; 3UPQ A; 3HIL A; 4QZE A; 5DB8 A; 5J2J A; 2DWQ A; 3QXG A; 3N7R C; 4KLT A; 2HW3 A; 4Y2P A; 4ED7 A; 1ZQJ A; 1NJZ A; 5J0S A; 4ED8 A; 2K60 A; 1EXN A; 4QZA A; 1KQQ A; 7ICP A; 1S77 D; 3PW7 A; 5ALT A; 3WK4 A; 2E8N A; 4ED0 A; 4I28 A; 3BQT A; 8ICQ A; 2YQE A; 2JEF A; 2ZIX B; 4DF8 A; 4FO6 A; 1DRG A; 3C2K A; 3E2E A; 5J0X A; 4TUQ A; 4GXI A; 4NLZ A; 5DBA A; 5EWF A; 3PX6 A; 3C28 A; 3G6X A; 4ECU A; 4F5R A; 2EAM A; 1SIJ A; 1JX4 A; 4Q8E A; 7ICF A; 3UXP A; 2KFZ A; 1WWV A; 3KFU F; 1AQ6 A; 1A77 A; 4PHA A; 4EBE A; 2ODG A; 4OO1 J; 2ZIU B; 4RQ7 A; 3FM9 A; 3U26 A; 5ALJ A; 3O0F A; 5KT6 A; 1BPZ A; 2KP7 A; 3AU6 A; 1QH9 A; 2K4P A; 2NRT A; 3M6K A; 4UBB A; 2P35 A; 3QZ7 A; 4DO9 A; 4OJ6 A; 4NWI A; 1SWW A; 4O3Q A; 4DOC A; 4UAS A; 2KSO B; 4JK1 A; 1WG8 A; 4M04 A; 3H7I A; 3HWT A; 2NRW A; 1GO3 F; 4C7Z A; 4ED3 A; 2HBJ A; 3N7P D; 5L1L A; 5J0Q A; 5KFO A; 4EEY A; 9ICT A; 1MC8 A; 2CRX A; 5KT4 A; 4CGZ A; 1QSL A; 3PVX A; 1KSP A; 3PR4 A; 1V97 A; 1V9P A; 2V4R A; 3M6Z A; 2W04 A; 1TE2 A; 2JEJ A; 2EAP A; 2BPF A; 4RQ3 A; 3K1R B; 4I2H A; 3H0R B; 1UCV A; 2XY6 A; 1X2I A; 4BX9 C; 3HP6 A; 5AI9 A; 1Z1B A; 3GV5 B; 4DS4 A; 2QAR A; 2GWS A; 1KKX A; 1L7O A; 3SI8 A; 3PW5 A; 1NJY A; 4XQ8 A; 7ICG A; 4KX5 A; 5EE3 A; 1ZQL A; 7ICV A; 1NNL A; 1PVR A; 1NKC A; 4PPX A; 1ZET A; 4I2D A; 1MQ3 A; 4QZ9 A; 4R65 A; 2EZX A; 2ESE A; 4A8E A; 1KLN A; 1WCL A; 1B4F A; 3AMZ A; 2P6U A; 1J97 A; 2ASJ A; 2MSN A; 2ZJ5 A; 4KLE A; 4RUA A; 5IIO A; 1HUZ A; 1L6N A; 4F5O A; 4RPY A; 5IIN A; 1HEK A; 3BZC A; 3BDP A; 2AGQ A; 4PJ0 U; 1JRO A; 3PNC A; 1VDV A; 5KFN A; 1NOM A; 4M0A A; 1T3Q A; 1S5L U; 4RQN A; 1ZQX A; 5D46 A; 1NK9 A; 3LDA A; 1NK6 A; 2HBM A; 5KG4 A; 4BGD A; 9ICU A; 2JV3 A; 2FPK A; 3KHH A; 1ZQO A; 2WF8 A; 2ZUD A; 4OJO A; 8ICM A; 5ALL A; 3KD3 A; 3TAD A; 1LV5 A; 3GV7 B; 4JWM A; 3HT3 A; 4US9 A; 1MN8 A; 1NJX A; 5J0R A; 4DQS A; 2YMM A; 3RTV A; 4UBC A; 3SEI A; 2F8L A; 4UB2 A; 2VIX A; 2E8M A; 3PML A; 2IHM A; 4GLX A; 1N2X A; 4DQQ A; 3M1Y A; 2Q4T A; 3BS5 A; 1DK3 A; 2ZTD A; 4IQW A; 3ZDC A; 2FLN A; 4B9U A; 4DFJ A; 3RJI A; 5KFD A; 4ELT A; 2F77 X; 4KLD A; 5ALH A; 3SD7 A; 1LB2 B; 5J0U A; 3RB3 A; 1L8L A; 2QAR B; 2ZXI A; 4DSE A; 3NVY A; 3NUQ A; 2XCP A; 1QQ6 A; 4DFM A; 2OCE A; 5AIB A; 2YN4 A; 1NK8 A; 4F5P A; 3LK9 A; 1OUQ A; 2NV3 A; 4E0D A; 1S0M A; 3IHQ B; 4F4Z A; 4EX7 A; 1T7P A; 7ICS A; 4JUZ A; 3JPQ A; 2W7P A; 1N63 A; 3SYZ A; 1TVA A; 1H38 A; 4ECS A; 4B9M A; 1SXE A; 2K4I A; 5KAI U; 3M9O B; 5EE0 A; 4NM1 A; 3V72 A; 1A6S A; 2FPM A; 4LVS A; 2GH1 A; 3QU5 A; 5ALO A; 1BPB A; 4USA A; 7ICQ A; 5KG1 A; 2RDI A; 2C2D A; 1XO0 A; 4RUC A; 4DS5 A; 2C2E A; 1MA7 A; 4NLC A; 1WYG A; 1Q3U A; 4DF4 A; 3ETR A; 5DLG A; 4C8O A; 2ZUB A; 9ICF A; 3QU2 A; 1ZQZ A; 1TAU A; 1J2M A; 5AM1 A; 5L1M A; 3FAH A; 8ICG A; 4DSK A; 4NLK A; 4PGY A; 3RBD A; 4RQ0 A; 5J2E A; 3T79 A; 1JMS A; 2EAO A; 1ZRN A; 5G5H A; 5F9N A; 2A1J B; 1Z00 A; 2IOH A; 1NZP A; 2YML A; 3M8R A; 4YR2 A; 3BS5 B; 3NVW A; 4UQG A; 4RQ1 A; 2VKQ A; 4YVZ A; 4UAZ A; 3RR7 A; 3A0H U; 3ZDE A; 1IV8 A; 2HHT A; 1C20 A; 2FI1 A; 4O3N A; 4G9B A; 3N4M B; 4QWE A; 2QKQ A; 3WKA A; 4KLU A; 1A76 A; 2W9B A; 2YMP A; 8ICW A; 5CJ7 A; 4CF5 A; 5ALW A; 1IIP A; 1L3S A; 4F2R A; 1VLB A; 2VJ4 A; 4RT3 A; 2W7O A; 4KLG A; 4QWA A; 2MU2 A; 5DDY A; 4DEZ A; 2OYY A; 4KLL A; 2GLE A; 4DL5 A; 3GV8 B; 4R66 A; 3C2M A; 2KFN A; 2KMD A; 2F8K A; 4EBD A; 4F91 B; 5HP4 A; 3NGD A; 3CW2 C; 1ZQT A; 5AKK A; 4UB1 A; 2JZB A; 2N1R A; 3TQ1 A; 5AI0 A; 2VA3 A; 2W8L A; 4J9P A; 2F44 A; 2WHE A; 3BS7 A; 2RP5 A; 4NJ8 A; 5BOL A; 5KAF U; 3DEE A; 3SR6 A; 2XY7 A; 3WK9 A; 7ICL A; 4M9N A; 3PV8 A; 4PZN A; 3GIL A; 7ICU A; 3C29 A; 1ZD4 A; 2PFP A; 4I2A A; 2EQY A; 3AL0 B; 4YMO A; 4HYK A; 3IRU A; 1XSL A; 3KBB A; 3RH5 A; 3TAD C; 4J9N A; 2HOI A; 4DWI A; 4Y2R A; 5F3X B; 1KFS A; 8ICI A; 2HDO A; 2FPL A; 2H3I A; 2NYV A; 1ZQN A; 2OH2 A; 3T3F A; 2Y1J A; 2J6U A; 2FMQ A; 5KNI A; 3TAP A; 1Z00 B; 4C4T A; 2ASL A; 2LM4 A; 4QZC A; 1X42 A; 1X9W A; 4KIT B; 3E58 A; 5L1I A; 4OCZ A; 2CPR A; 1RM6 C; 5AM0 A; 2D6F C; 5JRT A; 3EPI A; 4OD0 A; 5GTI U; 4UW9 A; 4K4H A; 5L1K A; 1PVP A; 1JXL A; 5HML A; 2EDU A; 3L4P A; 5KFF A; 1S97 A; 5KFW A; 3IV6 A; 4EZ9 A; 2KG5 A; 5KFE A; 4YFK A; 8ICT A; 1HJP A; 2KE7 A; 3RH4 A; 2W9B B; 3WU2 U; 4DSJ A; 5CEH A; 3H0L B; 3RB6 A; 3F2B A; 3RFA A; 2BR0 A; 2YMQ A; 2J6T A; 3SV4 A; 2OHF A; 1RYS A; 2F1I A; 3BZK A; 2P66 A; 4GXK A; 3ORY A; 4M6W B; 5KFU A; 1SB3 C; 2AGP A; 2HHS A; 3RJE A; 4M9G A; 2I5H A; 5J2B A; 2JEI A; 4MFF A; 1N5W A; 1TAM A; 2OXO A; 5B5E U; 5ALS A; 2UVW A; 3GIK A; 3SMV A; 5DG9 A; 2JZB B; 3WK6 A; 2KKV A; 1NJW A; 2Y9T A; 2G0A A; 1ZQF A; 1ZQV A; 4Q44 A; 1ZXI A; 2GO7 A; 4F5N A; 1HUO A; 2VAN A; 4IL6 U; 3QX7 A; 5A0L A; 1NKE A; 3Q8S B; 3OTQ A; 1MQ2 A; 1XWL A; 3I28 A; 2ES6 A; 4ED1 A; 4Q8F A; 1JUD A; 4O3M A; 4U7C A; 1SKW A; 4ECT A; 4P0Q B; 1UT8 A; 2IBK A; 1RXW A; 2K4H A; 8ICL A; 3T5K A; 2FMS A; 2AGO A; 2ATL A; 1JAL A; 3OJS A; 5J0T A; 3LWM A; 4O0I A; 1OXJ A; 3KOO A; 8ICZ A; 1U45 A; 5CHG A; 4QJF B; 4JV0 A; 1RXV A; 5J29 A; 1CUK A; 1F44 A; 5AK5 A; 4K4I A; 4PZO A; 4RZR A; 3RJF A; 1Y88 A; 4ECX A; 3RRG A; 3PY8 A; 2V9W A; 1N5X A; 4YMM A; 4GIB A; 2IA6 A; 2R8G A; 3KKA A; 1SV4 A; 3D2S A; 4J03 A; 1KBU A; 4IRK A; 3OSP A; 3RRH A; 2BPC A; 3QYP A; 1QQ5 A; 1ZYQ A; 3EPG A; 1ZRM A; 4DL6 A; 3D2N A; 4IS7 A; 4YP3 A; 4F92 B; 4AP9 A; 4DL2 A; 3C21 A; 4F4Y A; 5DDM A; 4JB3 A; 2W43 A; 2M0N A; 2R18 A; 2V4Q A; 4RQ4 A; 3MFH A; 9ICJ A; 4DOB A; 4ED6 A; 4UAT A; 5ALF A; 5C5J A; 1ZQU A; 4ECV A; 2Y9U A; 4QZH A; 3NVZ A; 3T5H A; 1U49 A; 1X6J A; 1L3V A; 4RNM A; 2YB4 A; 4C8L A; 2H5X A; 8ICP A; 5AKI A; 1TK5 A; 4TUP A; 1U48 A; 1DOQ A; 2XY5 A; 4O5E A; 2VA8 A; 3R9K A; 3QUB A; 1NI3 A; 1QQ7 A; 2ZTE A; 2Y0S F; 2AXT U; 3WK8 A; 8ICN A; 2EH9 A; 1L8O A; 2B0C A; 1KW4 A; 4IQT A; 4O5K A; 3KHL A; 3FC4 A; 3TFS A; 2E1F A; 1FFV A; 3V6K A; 1ZD2 P; 2JHD A; 4PGX A; 5BPC A; 5AI5 A; 1ZQ1 C; 2NO4 A; 3RAQ A; 3EWA A; 4P0P A; 2DGZ A; 1ZQK A; 3LWL A; 5KFH A; 4UAV A; 5DKW A; 8ICY A; 4UB8 U; 1N60 A; 1Z19 A; 2LMR A; 8ICF A; 5C0Y A; 2BQR A; 3Q8Q B; 2WAQ F; 4DQP A; 2JXJ A; 1DGJ A; 3TAN A; 4RQ2 A; 5AI6 A; 3TAQ A; 1TKD A; 2K8B B; 3Q8R B; 1RDF A; 5TIS U; 3ISC A; 3UQ2 A; 3SZ2 A; 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4KLS A; 2RRD A; 3QNM A; 1WCN A; 3N28 A; 2BGW A; 4BDP A; 2WF6 A; 2JGA A; 2C28 A; 2H3Q A; 2ZIW A; 5E79 U; 4F4W A; 1L7M A; 1ZQR A; 1Q3V A; 3NAS A; 8ICX A; 3DDH A; 4FZN A; 2XC9 A; 5CA7 A; 4Y2T A; 9ICE A; 4BXO B; 4M9L A; 3MR3 A; 2A19 A; 2BCQ A; 4AYB F; 3L5K A; 2W8K A; 4PGQ A; 8ICB A; 3PX0 A; 3KTQ A; 4IC9 A; 1VJ5 A; 3RJK A; 5KFS A; 2JEG A; 9ICG A; 2K8A A; 3IP4 B; 4ECY A; 4PHP A; 9ICC A; 3C1Z A; 3Q8P B; 2BKE A; 3V7L A; 2BQ3 A; 4J9K A; 4P4O A; 4IR9 A; 1KFT A; 1SZH A; 3KZI U; 3ZD8 A; 2D8C A; 4IR1 A; 2KNJ A; 3BQ2 A; 1ZJM A; 1N56 A; 3GFK B; 4CCH A; 4DL7 A; 4FFD A; 1XC9 A; 1PVQ A; 2W55 A; 1X66 A; 3CYM A; 3K1Z A; 2HOQ A; 4YD1 A; 5DQG A; 2DFL A; 4I27 A; 3MR5 A; 3RH6 A; 4MFC A; 2BCU A; 5KG3 A; 5EWG A; 7ICK A; 5KFL A; 2W3R A; 1Z3E B; 4B6J A; 1X9S A; 2IMW P; 3N97 B; 3CP8 A; 1FO4 A; 4R64 A; 2YB1 A; 4Y2U A; 5D49 A; 2KZM A; 4XUS A; 3MC1 A; 1RQN A; 2G09 A; 4KTQ A; 2BPG A; 5EOZ A; 2BZF A; 2UVR A; 2HHV A; 2B6G A; 4TQS A; 3MDC A; 8ICR A; 5HHH A; 4QZ8 A; 5JTI A; 4F72 A; 3T5J A; 3ISD A; 5AKG A; 2ZIW B; 2AQ0 A; 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