The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
117
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structure length |
117
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Chain Sequence |
TNYSFRTLTLSTAEYTKVVEFLAREAKVPRYTWVPTQVVSHILPTEGLERFLTAIKAGHDSVLFNANGIYTMGDMIREFEKHNDIFERIGIDSSKLSKYYEAFLSFYRIQEAMKLPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural evolution of C-terminal domains in the p53 family
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Putative uncharacterized protein cep-1
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| molecule tags |
Transcription
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| source organism |
Caenorhabditis elegans
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| total genus |
31
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| structure length |
117
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| sequence length |
117
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-05-01 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RP5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2CPR A; 3K75 D; 2V4Q A; 3WKA A; 2JHD A; 4ACO A; 2KFN A; 3QUQ A; 4QNL A; 8ICK A; 5KG0 A; 5C0Y A; 2W9C A; 3JPT A; 3Q8K A; 8ICQ A; 2CN1 A; 3AL0 B; 4YG2 A; 1ZQP A; 2J6S A; 1RQL A; 1Z00 B; 3BS5 A; 3FM9 A; 2HHS A; 2I5H A; 4ZH4 A; 4IS7 A; 4OD0 A; 4YCX A; 5HP4 A; 1ED1 A; 2JEI A; 1IG6 A; 4RQN A; 2EZX A; 2C2R A; 4P0P B; 5KFN A; 8ICH A; 1Z3E B; 2XID A; 2ZIU B; 5KT3 A; 3DEE A; 4GXK A; 5KFZ A; 3HIL A; 4J9K A; 5KT4 A; 3VC8 A; 4DQS A; 5KFQ A; 4LJX A; 3BDP A; 2FPK A; 5ALM A; 4C8N A; 3PY8 A; 2YN4 A; 5KT6 A; 1MQ3 A; 4RT3 A; 4Y2Q A; 2BZF A; 1URJ A; 3U26 A; 2DPJ A; 1UT5 A; 1T3N A; 5F9L A; 1U9L A; 5EOZ A; 4IQW A; 4KN4 A; 4O3Q A; 1Q46 A; 5IIJ A; 2I6X A; 4C80 A; 4RUA A; 4DQP A; 4IR9 A; 3Q8M A; 4F4K A; 1KEJ A; 3GU3 A; 5ALL A; 4TUP A; 2P35 A; 5J0X A; 8ICM A; 2B21 A; 4IQU A; 3PW7 A; 1JMS A; 3UQ0 A; 4GFJ A; 2A3V A; 5KFB A; 1UT8 A; 2FJ6 A; 1QLN A; 3UPQ A; 2KTQ A; 4QZ9 A; 1RYS A; 3TAQ A; 1B4F A; 2HHV A; 5KG1 A; 5DBA A; 2BHN A; 1PK1 B; 4RNO A; 1TV9 A; 4P4O A; 2NRV A; 2KK0 A; 4P2H A; 1NK7 A; 2ZIX B; 1PZN A; 3KD3 A; 4EBD A; 1KBU A; 2DKX A; 5J0R A; 1TK5 A; 5AKY A; 5J2K A; 4BXO A; 4DLG A; 2WF7 A; 2Y0S F; 1TK8 A; 4NJ8 A; 4NLZ A; 3T5K A; 4QIW F; 2PKE A; 3PZP A; 2WB1 F; 5CR0 A; 2QAR B; 3JPQ A; 3QU7 A; 2K4H A; 2ZXI A; 1JAL A; 1T8E A; 1KL9 A; 9ICV A; 1SXD A; 3TAD C; 5KFP A; 1DK3 A; 2XVT A; 2NRW A; 3JPR A; 3BQ0 A; 3JPP A; 3ZDD A; 3H8M A; 1NKC A; 4OJ5 A; 4QZG A; 4PPX A; 1LKY B; 1VDV A; 4CF4 A; 3MFH A; 1Z1V A; 2WFA A; 2B6G A; 1S0M A; 3MDA A; 1EXN A; 4EYI B; 4FO6 A; 3ISB A; 5KFK A; 2KKP A; 2GWS A; 2JEG A; 1ZQO A; 5CHG A; 1TKD A; 5HHH A; 3OJS A; 2NRT A; 2JZB A; 5JTI A; 2W9B A; 4MFF A; 1KFT A; 4RU9 A; 4FFD A; 3PSF A; 2OYY A; 2HHQ A; 3OJU A; 5B66 U; 4MHV A; 1IIP A; 5D4B A; 2KD1 A; 2JH1 A; 4CF3 A; 2LKY A; 5KT5 A; 2FMQ A; 2KIC A; 3L5K A; 3GFK B; 5ALX A; 5L1M A; 4RQ5 A; 2A1A A; 3L4P A; 3NRW A; 2KIV A; 1J2M A; 5ALR A; 5L9X A; 7ICO A; 7ICP A; 4IR1 A; 3D6J A; 7ICN A; 2OXO A; 2UVR A; 1TAM A; 1PVR A; 3UMB A; 5ALH A; 8ICJ A; 1UCV A; 1UQV A; 3L3F X; 3OTQ A; 2KV2 A; 2R18 A; 2KG5 A; 1ZQR A; 2XY7 A; 4J9L A; 1ZD4 A; 3AU2 A; 1A76 A; 1UHU A; 3RH4 A; 2LHT A; 5AKX A; 2JGA A; 5J0T A; 2R8G A; 1Z1B A; 4DSE A; 4GIB A; 4Z6C A; 1V85 A; 5DGB A; 3G6Y A; 4R8U B; 1KSP A; 4KLE A; 9ICF A; 4PGQ A; 2KOB A; 4YMM A; 3TAN A; 4JUZ A; 4YR3 A; 1Z19 A; 3VCB A; 3V7J A; 4CE6 A; 4RNN A; 4DEZ A; 1F5S A; 4GXI A; 1FEZ A; 2HHW A; 4Q8E A; 4J9M A; 3JPO A; 4JV0 A; 3ETL A; 5KFC A; 4I2E A; 4JK1 A; 1HJP A; 2WTF A; 1VJ5 A; 2DQN B; 2ZIV A; 4RUC A; 1NK5 A; 4JWM A; 5KAF U; 4RQ8 A; 4EEN A; 2VA3 A; 2K8B B; 4K4I A; 1WWV A; 1CRX A; 5KFI A; 4NLN A; 4M04 A; 1KFS A; 2VAN A; 4PHP A; 2W43 A; 4DOA A; 3NRZ A; 4US9 A; 2H3Z A; 3EUB 2; 4DOC A; 1ECW A; 5DLG A; 1Q3U A; 5AKJ A; 4KLO A; 1MN8 A; 3N7R C; 2PI4 A; 3D2N A; 4J9N A; 3B0Y A; 1X40 A; 3SEI A; 3RH5 A; 2BQR A; 5F3X B; 5D49 A; 2JV3 A; 2IOF K; 2QLT A; 1PVQ A; 5J8Y C; 1X6I A; 3K4G A; 4UAS A; 5J0Q A; 3V7K A; 4DFK A; 2J6T A; 4USA A; 1V38 A; 5DG8 A; 2WAQ C; 3T5J A; 4DLE A; 2YX8 A; 1Z00 A; 4OJ6 A; 5DG9 A; 4F4Z A; 5BOL A; 1DRG A; 4DF8 A; 1DGS A; 8ICY A; 7ICU A; 4P0P A; 5AIC A; 2ZIU A; 4ED0 A; 4U6P A; 1U49 A; 2GOL A; 2FE9 A; 2HOI A; 7ICT A; 2NRX A; 4RQM A; 4C0Z A; 4FS2 A; 2LI6 A; 8ICT A; 2IA6 A; 3KHH A; 2W54 A; 1ZQH A; 4EZ6 A; 4KLG A; 4DS4 A; 1RQN A; 1IM4 A; 5EWE A; 3Q8L A; 2IMW P; 3HKZ F; 4ECZ A; 5ALN A; 8ICS A; 1QSY A; 1O08 A; 4UB8 U; 5G5H A; 2K89 A; 4QZB A; 2EAO A; 3C2L A; 1LB2 B; 3PO4 A; 4TUQ A; 1SL2 A; 4I2F A; 1S77 D; 3N28 A; 3NVZ A; 2KVC A; 4NLC A; 4M9G A; 4XRH A; 2HHX A; 3MAB A; 4DSJ A; 3KHR A; 5AHX A; 5ALQ A; 2Y9U A; 3KHG A; 5J2I A; 4UAZ A; 2YMP A; 3QX7 A; 4YD1 A; 5H2F U; 1RXW A; 2Y0S C; 4EBC A; 4TQR A; 4QIW C; 4IL6 U; 1K1Q A; 3V6H A; 4RQ1 A; 5KT2 A; 7ICI A; 2Q0Z X; 1TFR A; 3SI8 A; 1V97 A; 2ZUB A; 1BPY A; 4B9M A; 3B0X A; 1IXR A; 8ICC A; 2HBJ A; 1KTQ A; 5AK3 A; 3RB6 A; 1RYU A; 2XCA A; 5AKI A; 2LBO A; 7ICS A; 2QAR A; 4C8O A; 2BPC A; 3OGU A; 3M8S A; 2E8M A; 2FLN A; 8ICB A; 3BQT A; 5KFH A; 1Q8K A; 2BCQ A; 1SIJ A; 2LMR A; 2VJ5 A; 4FZN A; 1X6J A; 2KNJ A; 5HHI A; 1ZQK A; 4BJQ A; 1NKE A; 3WK4 A; 4LZG A; 3R9K A; 1LKY A; 3UMC A; 1DXS A; 3SZ2 A; 3T5H A; 4CF5 A; 1SV0 C; 3H40 A; 4NM1 A; 4PGY A; 1PK3 A; 5DB9 A; 2DL0 A; 2W9A A; 4DSF A; 4UB1 A; 1MQ2 A; 3N7S C; 4F8R A; 4DSK A; 4BUG A; 1BVS A; 2YB4 A; 4KTQ A; 2MSN A; 5GTI U; 1RDF A; 4DL5 A; 1ZRM A; 5CRX A; 2J6U A; 2EH9 A; 5CP2 A; 1L8O A; 2KZ3 A; 2PI5 A; 3QUT A; 3QZ7 A; 5EE9 A; 3FAH A; 4C8L A; 3PW2 A; 4C8K A; 5J2D A; 1ZD3 A; 2HSZ A; 1QCK A; 2W3R A; 3K1R B; 2BPG A; 4FBT A; 2HVI A; 2A19 A; 5CWR A; 5DB8 A; 1F44 A; 2F1H A; 3Q8P B; 5J2F A; 3LWM A; 5L1I A; 4EZ9 A; 2PMZ C; 3SV3 A; 2FLP A; 3D2Q A; 4P0Q B; 1A77 A; 3IM1 A; 1P7D A; 4RQ0 A; 3AQF A; 4OCZ A; 4G3I A; 5KT7 A; 4F3O A; 2K4P A; 4YMO A; 2H5X A; 1KW4 A; 4O3R A; 2R8I A; 1MC8 A; 4R8U A; 4CCH A; 3RBE A; 2JMG A; 2ZTC A; 1BPE A; 5L1L A; 5T14 A; 5EE1 A; 3LVW A; 4ECS A; 2R8J A; 1SZP A; 3TKA A; 4KLI A; 3F2D A; 9ICP A; 2O6K A; 5KFV A; 2E3T A; 3LDA A; 1D8L A; 4I2B A; 3QU5 A; 1IV8 A; 2F8K A; 3WKE A; 4XA5 A; 4YVZ A; 5DQI A; 4YQW A; 1O03 A; 4F5O A; 4B9U A; 3RR8 A; 1NJX A; 4QZ8 A; 2XC9 A; 3H4B A; 1NJW A; 3EPI A; 4MF8 A; 1UA1 A; 3SYZ A; 1ZQ1 C; 3SV4 A; 2AU0 A; 2L5Y A; 3KBB A; 3WK6 A; 2YB1 A; 1ZQW A; 2BKE A; 4YFK A; 4F93 B; 2MRL A; 1U48 A; 2KJ9 A; 4J9S A; 3TQ1 A; 2MA1 A; 5ALF A; 2ATL A; 9ICX A; 5KFM A; 2KSO B; 2Y9T A; 5G5G A; 4OJO A; 1TVA A; 1QQ7 A; 3TI0 A; 2ES6 A; 4QZH A; 2HHT A; 5JRT A; 5KFF A; 2ALZ A; 2RQ5 A; 4Q8F A; 5HR7 A; 4ED3 A; 4O5E A; 1S0V A; 1NK9 A; 1ZQG A; 3H7I A; 4ZOH C; 1HUZ A; 2VIX A; 5E79 U; 3AU6 A; 1XC9 A; 2PFQ A; 4DCC A; 4QZF A; 1ZQL A; 4M9H A; 3A0B U; 1KQQ A; 4ECX A; 2EAN A; 1KFD A; 2K4I A; 4RQ4 A; 4KLQ A; 2MAX A; 4MF2 A; 1MA7 A; 5J2J A; 2AQ4 A; 3PO5 A; 2UVU A; 4O5K A; 3A0H U; 3ICX A; 1ZQU A; 5IIK A; 5HMM A; 1SKW A; 2UVV A; 1FFU A; 1S8O A; 3JPS A; 4O3O A; 3SMV A; 3MR6 A; 9ICS A; 2KKV A; 1RPL A; 1JIH A; 5J0S A; 4J03 A; 3HKZ C; 3SEN A; 1HEK A; 1L7N A; 3ORY A; 4Q44 A; 3G6V A; 1JI7 A; 4TQS A; 7ICH A; 1ZQF A; 2NO5 A; 4F4W A; 2R8K A; 1N60 A; 4Z6D A; 1X66 A; 4GC6 A; 4BGD A; 1WUD A; 4I28 A; 4RQ7 A; 1FFV A; 3ETR A; 2F8L A; 2CXY A; 1N61 A; 5DDY A; 2G0A A; 4NM2 A; 5TIS U; 1KDH A; 4P4P A; 1ZJN A; 1NKB A; 3HP6 A; 1ZQB A; 2R8H A; 3BQ2 A; 4BDP A; 1SV0 A; 3QUC A; 2KEY A; 2OM6 A; 2H3F A; 9ICM A; 1N63 A; 3OSP A; 2DUY A; 5KFX A; 4M6W B; 1Q3V A; 3KZX A; 4UBC A; 3Q8Q B; 2DWQ A; 3AM9 A; 4RQ3 A; 2JEF A; 2A1J B; 1ZQN A; 5DKW A; 5BOM A; 4GXJ A; 3RF9 A; 3RB4 A; 5AM5 A; 7ICK A; 3RAQ A; 5KG6 A; 3HX0 A; 5AI6 A; 3QE9 Y; 3M6K A; 3PMN A; 4R64 A; 4KMO B; 4C4T A; 4Y2U A; 4O3P A; 2ESE A; 2W7O A; 4K4H A; 4EX7 A; 1L3T A; 4KLF A; 4J9R A; 4OJP A; 5J0P A; 2HW3 A; 1SGG A; 1AQ6 A; 1TAU A; 1SV4 A; 4ECW A; 7ICM A; 5KNI A; 5J2G A; 1N48 A; 2GLE A; 2IOH A; 3M8R A; 3NUQ A; 3V72 A; 3SD7 A; 4B9T A; 5KFY A; 5CB1 A; 1RM6 C; 5ALO A; 4O3S A; 1XWL A; 3DV9 A; 3AUO A; 3E0F A; 3RJE A; 2QB0 A; 4C7Z A; 2ZUD A; 1BGX T; 3NVW A; 4UAV A; 4IQT A; 3E2E A; 5III A; 3OPX A; 1NZP A; 3RFA A; 9ICL A; 3ZD9 A; 2YMM A; 4Q45 A; 4Y2V A; 3EZ5 A; 1U47 A; 2HMX A; 3PW4 A; 4DQR A; 3QU2 A; 4FZL A; 3KHL A; 2UVW A; 5J0W A; 3V7L A; 9ICR A; 5J2H A; 1WYG A; 4Y2P A; 4UW9 A; 3IP4 B; 5DG7 A; 1L7P A; 3S6J A; 1ZQY A; 4QZI A; 4FZM A; 3H8W A; 3ALR A; 5AKE A; 4ECR A; 3IDW A; 4EYH B; 3ZI4 A; 3NTU A; 8ICN A; 3BS5 B; 1ZQS A; 5JU5 A; 2F2A B; 5CJ7 A; 1ZQC A; 3RJJ A; 1J2N A; 2WF9 A; 3M9O B; 2KFZ A; 4J9P A; 1NK8 A; 3MC1 A; 3JPN A; 1D8Y A; 3ISC A; 3RJG A; 1YT3 A; 5ALP A; 4IQV A; 3WK7 A; 1XSL A; 3I76 A; 3C28 A; 2ZTE A; 4B9V A; 3H4D A; 1TK0 A; 4P0Q A; 2LYH A; 3HRD D; 2YY6 A; 4ELU A; 9ICE A; 4DL4 A; 2FPM A; 4E0D A; 3WKD A; 2ISO A; 4DF4 A; 1YZ6 A; 2F1J A; 4F5N A; 5IIL A; 3IHQ B; 3ZDA A; 3UXP A; 5A0L A; 5DBC A; 2H3I A; 4QWA A; 3C29 A; 4PHD A; 2DF4 B; 3GIL A; 3RRH A; 3RRG A; 4I2J A; 2FMS A; 2KN7 A; 3NVY A; 4HAI A; 1QTM A; 4M47 A; 3I28 A; 4DQQ A; 2ODG A; 3BJY A; 1X9W A; 1L5U A; 3GV5 B; 4JMU A; 4I27 A; 3FC4 A; 5KFW A; 2AHO B; 4I2H A; 5ALI A; 4XUS A; 2HOF A; 5F9N A; 2W03 A; 5L1J A; 3RAX A; 4DFP A; 4LVS A; 1ZQD A; 2HOQ A; 1COK A; 4M9J A; 8ICF A; 2E8O A; 3N4M B; 1N62 A; 3QU9 A; 1L7O A; 4RPY A; 3QZ8 A; 3RJF A; 4DSI A; 2DBY A; 2YML A; 1NZB A; 1ZQA A; 1X2I A; 2PFN A; 3MBY A; 4Z6E A; 4Y2J A; 4UAY A; 4TUR A; 3TAD A; 8ICV A; 3RJI A; 5KFU A; 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5J0O A; 1ZD5 A; 3QEA Z; 4M6W A; 1D9D A; 4CRX A; 2BDU A; 1PUZ A; 1NJY A; 2HHU A; 2VKQ A; 1CEZ A; 2D6F C; 2ZJ8 A; 4QWB A; 2A1J A; 5ALY A; 5J2C A; 4C8M A; 2AGO A; 4KLM A; 3PX0 A; 5CA7 A; 4ECU A; 4IRC A; 4XQ8 A; 3H0L B; 5KFD A; 7ICG A; 5EWF A; 2IBK A; 2LYB A; 1VLB A; 2XY6 A; 4QJF B; 5HNK A; 3C5G A; 4EX6 A; 3EPG A; 2ASD A; 4F71 A; 1ZYQ A; 4IC9 A; 5KAI U; 1B43 A; 4NLG A; 1T94 A; 2NV3 A; 5J0U A; 8ICI A; 4B9S A; 2F76 X; 1X9X A; 4DL7 A; 3GIJ A; 2W3S A; 2EDU A; 4OJL A; 3TAR A; 2DFL A; 4I2G A; 4UAR A; 3NS1 A; 5KFL A; 3OHA A; 2AJQ A; 2Y1J A; 1T3Q A; 2W11 A; 3RJH A; 8ICO A; 4I2A A; 3M6Z A; 3SR6 A; 4KX3 A; 5ALT A; 5J8Y A; 1DGJ A; 4FBU A; 2D8C A; 1OXJ A; 3C1Z A; 2G08 A; 5DQH A; 1N5X A; 4YXJ A; 2WF5 A; 3M9N B; 2HBK A; 9ICT A; 1SZH A; 1ZJM A; 1K5O A; 5AKG A; 3WKB A; 2RP5 A; 2G07 A; 3KTQ A; 4DL6 A; 3HW8 A; 1SXE A; 3SAH A; 4UB2 A; 1N2X A; 3HJE A; 3BS7 A; 5KFA A; 2JEJ A; 1A0P A; 2MUT B; 4F72 A; 4YD2 A; 3TAP A; 8ICP A; 3HPO A; 7ICV A; 8ICU A; 3IG8 A; 4YR2 A; 3MR5 A; 5IIN A; 1U4B A; 3AEV A; 4DL2 A; 1COO A; 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