The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
78
|
structure length |
78
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Chain Sequence |
VKNYETAVQFCWNHYKDQMDPIEKDWCDWAMISRPYSTLRDCLEHFAELFDLGFPNPLAERIIFETHQIHFANCSLVQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of the Extracellular Domain of Human Ramp2
rcsb |
| molecule keywords |
RECEPTOR ACTIVITY-MODIFYING PROTEIN 2
|
| molecule tags |
Membrane protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
28
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| structure length |
78
|
| sequence length |
78
|
| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-10-31 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2XVT A; 2YX8 A; 3AQE A; 3N7P D; 3N7R C; 3N7S C; 3AQF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3QEA Z; 4YP3 A; 3MGH A; 1CRX A; 2K4P A; 2PFP A; 3N7S C; 9ICK A; 2FMP A; 4FBU A; 1D9D A; 3CP8 A; 4TQR A; 1S9F A; 4PGX A; 2GLE A; 2KZ3 A; 4JV0 A; 3HKZ F; 1UT8 A; 2IOH A; 1UQV A; 2W9C A; 1XU4 A; 9ICE A; 2NO5 A; 4F72 A; 3IG8 A; 5D49 A; 3N97 B; 5KNI A; 3Q8L A; 5GTH U; 2JH7 A; 2ZJ5 A; 1VJ5 A; 2FPK A; 1SV0 C; 7ICU A; 2PMZ C; 5AI6 A; 9ICT A; 2GOL A; 5KFB A; 3H0M B; 2MSN A; 5BOM A; 4RQ8 A; 5T14 A; 7ICN A; 1EXN A; 1S0N A; 4P0P B; 1WUD A; 2YN4 A; 1ZQR A; 1WG8 A; 4I27 A; 4KN4 A; 4YN4 A; 2KSO B; 2P6R A; 4RUA A; 3KZX A; 4Y2Y A; 5JTI A; 1SIJ A; 3MDC A; 2J6S A; 5J2J A; 1PUZ A; 5B5E U; 2IA6 A; 5F9N A; 2BKE A; 2CPR A; 4DLG A; 2BR0 A; 1ZQS A; 5AM5 A; 4QWA A; 8ICR A; 4RUC A; 3KFU F; 2ZIX B; 1N5X A; 2BPG A; 4YFK A; 5AKZ A; 1Z00 B; 4IQW A; 2YML A; 4O5C A; 4IRC A; 2KKV A; 1RYS A; 4ZH4 A; 5DB8 A; 2VA2 A; 5KG2 A; 3KZI U; 1Z4O A; 3I1Y A; 2ISO A; 2ISP A; 4IRD A; 3SD7 A; 8ICM A; 4PH5 A; 4RPZ A; 2Y1J A; 2UVR A; 1BPY A; 3U26 A; 1H38 A; 4QZI A; 4M9N A; 1WYG A; 1XSN A; 1ZQA A; 2HOQ A; 4GXK A; 1OXJ A; 1ZQJ A; 1YT3 A; 3MC1 A; 2QKQ A; 5KFS A; 1SZP A; 8ICZ A; 4I2H A; 3AEV A; 4F91 B; 5DQH A; 4BWJ A; 4FFD A; 4QZF A; 2ATL A; 1URJ A; 5EE3 A; 3WK6 A; 4DCC A; 4UAW A; 1DXS A; 1BNP A; 2DKZ A; 8ICX A; 1L7M A; 2QLT A; 4O9M A; 4UB8 U; 5KTQ A; 2YB4 A; 4RNN A; 4BXO B; 2JGA A; 1JXE A; 1F44 A; 4ECS A; 4P4O A; 2LM1 A; 3B9J A; 1NJZ A; 3PMN A; 2J6T A; 4QZB A; 4NLK A; 7ICJ A; 1S76 D; 4GXJ A; 4C0Z A; 3JPS A; 3C2K A; 2ZJ8 A; 5IIO A; 5AKX A; 4P4M A; 3KTQ A; 4BJQ A; 1ZQH A; 5DLF A; 5J2B A; 4J9P A; 7ICM A; 4DSF A; 2V4R A; 4EZ6 A; 5CR0 A; 3RB4 A; 3HPO A; 2LPE A; 2EZX A; 3HIL A; 3K4G A; 5KFP A; 1ZJM A; 2PFO A; 1D9F A; 4CE6 A; 2VA8 A; 3H8M A; 2DUY A; 4UBB A; 2MUT B; 1U49 A; 9ICP A; 5ALS A; 4WJ3 B; 2PMZ F; 5EWF A; 4B9S A; 3F5A A; 3C1Z A; 2MRL A; 8ICI A; 2RDJ A; 1ZQP A; 5JU5 A; 4J9K A; 5AKJ A; 3NUQ A; 4A8E A; 2F77 X; 4BUG A; 5J2F A; 4ECQ A; 4USA A; 5AM0 A; 4RQ4 A; 4MFF A; 2E8M A; 5D4B A; 1NNL A; 3T5L A; 4XUS A; 2PI4 A; 4J9R A; 4Y2P A; 3Q8M A; 1ZQN A; 3BZK A; 1ED1 A; 4QZE A; 3OSN A; 2ASD A; 3SYZ A; 1TAQ A; 2DFL A; 1JRO A; 1SV0 A; 1LKY A; 2NRT A; 3RJJ A; 4QW8 A; 2XO7 A; 4ECU A; 5DDM A; 3PSP A; 4CGZ A; 3LVW A; 2H3F A; 2WHE A; 4BDP A; 1Q46 A; 3C5G A; 4F4W A; 2NYV A; 4FO6 A; 3TAQ A; 1L6N A; 5ALK A; 2YTU A; 2KNJ A; 2ZIV B; 3H0L B; 7ICQ A; 3UXO A; 3ZDC A; 9ICB A; 4GC6 A; 2I1Q A; 4O3O A; 3TI0 A; 4MF8 A; 5HR7 A; 1HUZ A; 2FLP A; 3PX4 A; 1RG6 A; 4Y2R A; 4C7Y A; 4PZN A; 1LV5 A; 1F0M A; 2GH1 A; 3F2C A; 4NM1 A; 1NJX A; 3WKB A; 3M7D A; 4ICA A; 3MDA A; 1S10 A; 2YMP A; 2XY5 A; 5AI8 A; 4I2E A; 1X66 A; 2W43 A; 5ALY A; 4QZA A; 5KT7 A; 3PSI A; 2FMQ A; 1PVR A; 4DFD A; 5ALG A; 2W7O A; 3KKA A; 5CP2 A; 4XRH A; 2WF8 A; 2JEI A; 4PGY A; 1MN8 A; 1SZH A; 1Z4N A; 4P0Q A; 4C8O A; 4MF2 A; 1Q3U A; 2KHQ A; 3QU9 A; 4QW9 A; 5DGB A; 3IV6 A; 1A6S A; 3SMV A; 2R8G A; 3GIJ A; 1TAU A; 4US8 A; 9ICM A; 5C0Y A; 3KHL A; 3PML A; 4DOC A; 4OJL A; 1RXW A; 1N63 A; 1X42 A; 3RRG A; 2KG5 A; 4QZH A; 1IV8 A; 2ZIW A; 1BPE A; 5ALL A; 5J0S A; 3PV8 A; 5KFN A; 2B6G A; 3G6X A; 1ZQZ A; 1PVP A; 4UAR A; 3ZDB A; 7ICG A; 2JZB B; 1F5S A; 2EZZ A; 4TUS A; 4K4G A; 4AP9 A; 2LMR A; 2XCP A; 2K8A A; 2BPF A; 4QZG A; 1K1Q A; 3PNC A; 3WKC A; 3M8R A; 2Y1I A; 1KBU A; 2ZJA A; 3RFA A; 8ICV A; 5KFK A; 2HCF A; 5JUM A; 2BGW A; 1MQ2 A; 2A1J B; 2VKQ A; 2J6U A; 2H3Z A; 5KFR A; 3A0H U; 3IM1 A; 5ALF A; 1KQQ A; 4IR1 A; 5AK6 A; 1ZRN A; 3F2B A; 4M0A A; 3RH4 A; 1NJW A; 2EZY A; 3RH5 A; 4KLU A; 3KBB A; 2KN7 A; 1ZQC A; 1WCN A; 5J29 A; 5G5G A; 3D2N A; 4EX6 A; 2KFN A; 2G5H B; 2I6X A; 3B0X A; 3HJE A; 3TFR A; 5HML A; 2C2R A; 3V7L A; 2K8C B; 3JPN A; 4B9T A; 4NY8 A; 3AMZ A; 2WF5 A; 4RPY A; 4KTQ A; 4MEY A; 4RQ2 A; 5J2C A; 4YMN A; 1ZD5 A; 9ICG A; 3KOO A; 9ICL A; 1JN3 A; 3JPO A; 3QUC A; 1XSL A; 5KFF A; 1JIH A; 1NKE A; 5KFQ A; 2Z7J A; 1T4G A; 5HHI A; 4O3R A; 1MQ3 A; 2XY6 A; 3SEI A; 2KZM A; 1OW5 A; 3HT3 A; 3LK9 A; 2AU0 A; 4EEY A; 5ALI A; 1ZQW A; 2RQ5 A; 2C28 A; 3HKZ C; 3SZ2 A; 4HYK A; 2LBO A; 5J0X A; 1U48 A; 4JWN A; 3RJE A; 5GTI U; 9ICH A; 1BPX A; 2ZIU A; 3JPP A; 2BPC A; 4QWC A; 2W3S A; 5AIB A; 2ZXH A; 4YCX A; 3ETL A; 2MA1 A; 2XGP A; 5DKW A; 2G06 A; 4F4X A; 2QB1 A; 3RTV A; 2HHX A; 3ZD8 A; 3E0F A; 1L7N A; 1L3S A; 4M6W B; 2AJQ A; 3WK4 A; 4R63 A; 8ICG A; 2DGZ A; 5AKH A; 2PXI A; 5KG5 A; 4F5R A; 1DK3 A; 3MGV A; 2WB1 F; 1KRP A; 2AQ4 A; 4UB6 U; 4RPX A; 4ELV A; 1SV4 A; 4U7C A; 2CXY A; 1Y88 A; 5AM2 A; 4UAY A; 5JRT A; 1JUD A; 1K5O A; 3AQF A; 4I2J A; 5AIA A; 4ED6 A; 2E1E A; 4BGD A; 2VA3 A; 3EZ5 A; 3THV A; 9ICI A; 3BZC A; 8ICJ A; 3GV5 B; 3SAH A; 5ALU A; 5ALV A; 1YZ6 A; 2R8I A; 3FYH A; 1V97 A; 4MHV A; 2W9B A; 3TAD A; 3N28 A; 1U47 A; 2KEY A; 5HNK A; 2D3D A; 3C28 A; 1L3T A; 4EZ9 A; 1BPD A; 3MBY A; 2LYB A; 4QZ9 A; 2JV3 A; 3N4M B; 4F4Y A; 2M0N A; 2LM4 A; 4EBD A; 2FLN A; 2RP5 A; 1C20 A; 1QH9 A; 1ZD3 A; 4QWD A; 4DL5 A; 2L5Y A; 2BCR A; 2WF9 A; 1XWL A; 4KLG A; 1NK7 A; 1SXE A; 3H4B A; 5EOZ A; 2IHM A; 2A19 A; 1IXR A; 2E8O A; 2LI6 A; 3JPT A; 1NZP A; 1ZQT A; 4I2B A; 3MFI A; 5KL1 B; 3ONN A; 3D2Q A; 2F3N A; 2QAR B; 2BQ3 A; 3VC8 A; 5J0T A; 5J0O A; 4I2G A; 1Z3E B; 3UMB A; 4XQ8 A; 2BDP A; 5KFZ A; 4DL3 A; 3CNH A; 3OTQ A; 9ICS A; 4ACO A; 3MFH A; 1U4B A; 3NVZ A; 2LYA A; 3PST A; 1UA1 A; 1N62 A; 3NGD A; 1WCL A; 1NK0 A; 3BQ7 A; 1RXV A; 2BCV A; 2F8L A; 4KIT B; 1D8Y A; 4KLF A; 7ICH A; 3H40 A; 1B43 A; 5ALJ A; 3UMG A; 8ICF A; 2HI0 A; 3IDW A; 1ZQO A; 4PHP A; 5DB9 A; 3PO4 A; 4M2Y A; 4IS7 A; 3WK8 A; 2DQN B; 5AI4 A; 2D6F C; 1A77 A; 2B21 A; 5KFT A; 4Q8F A; 1PZN A; 1KL9 A; 9ICU A; 4F5O A; 2NRV A; 3G6V A; 1TAM A; 2K4E A; 2IOF K; 1ZQU A; 4NLB A; 4FZL A; 3NVY A; 3PVX A; 2K4I A; 2P35 A; 5B66 U; 3QU5 A; 4HAI A; 4LVS A; 2ES6 A; 1TKD A; 5KL8 B; 1DK2 A; 2OM6 A; 5L1L A; 3PO5 A; 7ICP A; 3CRX A; 5ALE A; 5ALX A; 3RAQ A; 3V72 A; 2R8J A; 4F92 B; 4Z6F A; 1QTM A; 4K4I A; 3JPQ A; 1ZQY A; 3QYP A; 5CJ7 A; 3GDX A; 4OJ6 A; 1ZD4 A; 1ZQG A; 1V85 A; 4KLJ A; 3QU4 A; 4KN7 A; 3PW0 A; 1KFT A; 2ZIX A; 4I29 A; 2XID A; 5J0P A; 2DL0 A; 4C8N A; 1QLN A; 3TQ1 A; 3LYS A; 8ICE A; 3E2E A; 5KFA A; 2HDO A; 4KLE A; 7ICV A; 3HX0 A; 1A76 A; 4NLC A; 4YR2 A; 5DG9 A; 2EAM A; 5CWR A; 5DQI A; 1JX4 A; 3EPI A; 3OHA A; 3KKA C; 4F5Q A; 3ISC A; 3TAP A; 4LZD A; 2HHT A; 1J2N A; 4B9M A; 1BNO A; 3AU6 A; 2HHV A; 3EYZ A; 3RB6 A; 2F1I A; 2W3R A; 5KFV A; 5ALH A; 3Q8R B; 1ZXI A; 1HUO A; 8ICC A; 3SR6 A; 4KX5 A; 5CB1 A; 4UAS A; 3J81 j; 3MR5 A; 4DQQ A; 4F3O A; 1J2M A; 3N7P D; 8ICT A; 4OJ5 A; 3FM9 A; 1DGS A; 2KKP A; 2Y0S F; 3K1Z A; 4BX9 C; 1X9W A; 4UW9 A; 1COO A; 2C2D A; 1XS9 D; 4DWI A; 1QQ7 A; 4BXO A; 1RPL A; 3H8S A; 4O3M A; 3QZ7 A; 2DPI A; 5KFG A; 2K89 A; 2FJ6 A; 5KFX A; 4ECY A; 3WK5 A; 5HR6 A; 4I2C A; 2Q0Z X; 7ICF A; 2WF6 A; 3LVV A; 4RZR A; 2YMQ A; 3HWT A; 7ICI A; 7ICT A; 4ECX A; 1XO1 A; 1L7O A; 2NRW A; 4ECT A; 2FI1 A; 4UAV A; 2EAO A; 1LB2 B; 2KVC A; 3SAF A; 3ETR A; 3G6Y A; 2ALZ A; 3SQI A; 4C80 A; 2KJ8 A; 3EW9 A; 1NK5 A; 2MAX A; 3PW5 A; 2OHF A; 2VJ5 A; 4IRK A; 4U6P A; 4B9V A; 3GV7 B; 1FO4 A; 3GV8 B; 4DF8 A; 2OEH A; 4ED1 A; 2DPJ A; 4I28 A; 2KHV A; 5C5J A; 2KD1 A; 3A0B U; 4RU9 A; 4I2I A; 4R8U B; 2HHW A; 1TK8 A; 5J2E A; 5F3X B; 4I2D A; 2C22 A; 5J2A A; 1KLN A; 1UPH A; 4QWE A; 3M9N B; 4XA5 A; 2PFN A; 1Q8K A; 5AK5 A; 3EPG A; 4DFJ A; 2OWO A; 2MU2 A; 1K1S A; 4KLL A; 5AKE A; 4TQS A; 4NJ8 A; 1KFS A; 4ELU A; 3ORY A; 3KHH A; 4F50 A; 2R8H A; 3QE9 Y; 3V6K A; 1JAL A; 3DDH A; 2UVU A; 1KKX A; 3BS7 A; 5DLG A; 4DL7 A; 4GXI A; 5J0W A; 4ECW A; 4DQP A; 1ZQQ A; 2IBK A; 1SL1 A; 2NV3 A; 2ZUC A; 3KD3 A; 4DL2 A; 1LKY B; 2ZTD A; 1HJP A; 3OGU A; 4C4T A; 5DG7 A; 3PR5 B; 3PX6 A; 4AYB F; 4I2F A; 1X2I A; 1T7P A; 1QSL A; 4DFP A; 3C2L A; 4DSK A; 4DQS A; 2KV2 A; 3C2M A; 3VCB A; 2AQ0 A; 1O08 A; 2W7P A; 4PGQ A; 4EYI B; 1VDV A; 4EBC A; 1V38 A; 3TKA A; 5CHG A; 1ZYQ A; 2ESE A; 8ICN A; 2JMG A; 4RNO A; 3ISB A; 2LKY A; 4RQ3 A; 4JB3 A; 2JR5 A; 8ICS A; 2W8K A; 2F8K A; 5AI5 A; 1B22 A; 4DOA A; 2HSZ A; 2GO7 A; 2KMD A; 4YXM A; 4Y2T A; 4TUR A; 4DSI A; 4C4R A; 4J9L A; 2H3I A; 4FBT A; 5III A; 2BZF A; 4F4K A; 3V6H A; 4MFA A; 4LZG A; 3RAX A; 4CF4 A; 2JEG A; 1SXD A; 5DGA A; 1SKS A; 4YQW A; 4GLX A; 3RBE A; 2WB1 C; 2E1F A; 2H5X A; 5KFC A; 1DGJ A; 5FP0 A; 5KG0 A; 2F2A B; 2ODG A; 3TAD C; 5KT2 A; 1X9M A; 2RRD A; 1KW4 A; 5ALT A; 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1ZJN A; 3PZP A; 5AI0 A; 2R8K A; 2B0C A; 2ZIU B; 5L1M A; 4M6W A; 2AGP A; 3RH6 A; 4PHA A; 4DSE A; 4Y2U A; 1T94 A; 5KG3 A; 4Y2X A; 4DL6 A; 2W8L A; 4F2S A; 3UXP A; 1FIQ A; 2KIC A; 1KDH A; 4EEN A; 4FS1 A; 5BPC A; 2WAQ F; 2AH5 A; 2W55 A; 3SAG A; 8ICK A; 7ICL A; 1ZQM A; 1RQL A; 5EE1 A; 3GQC A; 2E5S A; 4UB5 A; 3T5J A; 1C7Y A; 1L3U A; 8ICL A; 4O0I A; 3AN1 A; 1Z19 A; 3I28 A; 1ZET A; 4B6J A; 1V9P A; 1PK1 A; 3BJY A; 2HBM A; 2XGQ A; 1JXL A; 2FMS A; 9ICV A; 3AM9 A; 3QU7 A; 1QQ5 A; 4KLH A; 3MGI A; 4J9M A; 2XI9 A; 4Z6D A; 7ICK A; 1NJY A; 2W04 A; 2BCU A; 4M47 A; 3UQ2 A; 5KG6 A; 2Y9U A; 5AKI A; 1KEJ A; 1X6I A; 4O3N A; 4IL6 U; 2XCA A; 1HEK A; 3V7J A; 2W9B B; 1WWU A; 4R66 A; 2FE9 A; 1QSY A; 4NLZ A; 2K8B B; 3S6J A; 2KIW A; 1N48 A; 1RZT A; 1TVA A; 2KTQ A; 4ECZ A; 2EQY A; 1UCV A; 3MR6 A; 3QXG A; 3C29 A; 1COK A; 3DV9 A; 4KLO A; 2Y0S C; 4QIW C; 1TE2 A; 4O3S A; 1SWV A; 3RB3 A; 3BS5 A; 4G9B A; 1B4F A; 4K4H A; 3AL0 B; 2KVS A; 2ZTC A; 2UVW A; 3I76 A; 1NK8 A; 5AKL A; 1XSP A; 4NLN A; 5J0Y A; 4C8M A; 1NKB A; 4C8K A; 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