The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
CQEANYGALLRELCLTQFQVDMEAVGETLWCDWGRTIRSYRELADCTWHMAEKLGCFWPNAEVDRFFLAVHGRYFRSCPIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the human receptor activity-modifying protein 1 extracellular domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Receptor activity-modifying protein 1
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| molecule tags |
Protein transport
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
29
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3AQE A; 3N7P D; 2YX8 A; 3N7R C; 2XVT A; 3N7S C; 3AQF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5AKE A; 1BVS A; 4BDP A; 5AIC A; 1OXJ A; 7ICJ A; 4O5E A; 3BS5 B; 5IIM A; 2WTF A; 1JRP A; 3BZC A; 2DQN B; 3V72 A; 4OO1 J; 2Z7J A; 1QLN A; 4DL5 A; 2Y1J A; 1L5U A; 5DBA A; 3JPN A; 2BQR A; 1QQ7 A; 3I76 A; 1NKB A; 4QZ8 A; 3AL0 B; 5JU5 A; 3OSN A; 4RQN A; 2LM1 A; 4Q45 A; 2ZJ8 A; 5KG4 A; 1ZET A; 1RPL A; 3UXN A; 2BR0 A; 4U6P A; 5J0U A; 8ICZ A; 2W9C A; 3F2C A; 2ZTD A; 1SGG A; 5HR7 A; 2JV3 A; 1B22 A; 2QKQ A; 4I29 A; 1PK1 B; 2KEY A; 2CN1 A; 2QB0 A; 1IG6 A; 5KAI U; 3M9N B; 3JPO A; 4UB1 A; 8ICN A; 3PR5 B; 5DBC A; 2XY7 A; 3PW2 A; 3WK7 A; 4B6J A; 4RUA A; 2HI0 A; 3LYS A; 5F3X B; 4ELT A; 4ED1 A; 5AKG A; 3NTU A; 2EAO A; 5EWF A; 4B9N A; 2B21 A; 2BPG A; 1NK7 A; 8ICY A; 4F4X A; 1RYS A; 4LZG A; 2P6R A; 1NK9 A; 1JUD A; 2E3T A; 2YN4 A; 1N61 A; 2ISO A; 2O6K A; 2YTU A; 4MEY A; 3H4D A; 1ZQA A; 3M8R A; 4FZL A; 2W55 A; 3DDH A; 2WF8 A; 3PSP A; 4O0I A; 3NRW A; 3QU2 A; 4IL6 U; 4KTQ A; 2NYV A; 1MN8 A; 1ZQV A; 4M6W A; 3JPT A; 5AKJ A; 3ETL A; 1S10 A; 3Q8Q B; 5GTI U; 4ECW A; 4BX9 C; 3QE9 Y; 3ORY A; 2HOQ A; 2YMP A; 3BJY A; 3PSF A; 1B0X A; 4NM1 A; 4QZI A; 4ECZ A; 3ZDE A; 4KLJ A; 3IN5 A; 1ZQP A; 5KG5 A; 4KMO B; 1HUZ A; 4F50 A; 5KT4 A; 2AU0 A; 5HHH A; 5KFP A; 2HHW A; 2PI5 A; 2KJ8 A; 3QUB A; 2I6X A; 1NJX A; 4NV0 A; 5KG3 A; 4F5O A; 3SYZ A; 1U47 A; 1YZ7 A; 2PFP A; 2JH1 A; 2V4R A; 1L7O A; 3PX6 A; 3TKA A; 3WKB A; 2WHE A; 5B66 U; 4OJ6 A; 4DSK A; 5AI0 A; 1FFV A; 2E1F A; 3M9O B; 3OJU A; 4EZ6 A; 2WB1 C; 3GDX A; 2HHU A; 5HML A; 3M6K A; 1A6S A; 1RDF A; 4QIW C; 2W3S A; 4I2G A; 5AK4 A; 3RH4 A; 2OM6 A; 4QIW F; 4UB4 A; 2R18 A; 5ALK A; 3KFU F; 2A1J A; 3KD3 A; 2LBO A; 4MF8 A; 2YQE A; 3JPQ A; 3H4B A; 2FDR A; 5DG8 A; 4OJL A; 4TQR A; 2W43 A; 4EBC A; 1ZRN A; 4DFM A; 4K4I A; 3SV3 A; 1S0V A; 2ZUB A; 3TQ1 A; 4KLI A; 4BJQ A; 4F93 B; 3LVW A; 1SIJ A; 3GU3 A; 1COO A; 4MFA A; 2HHS A; 1KN5 A; 3PX0 A; 2M0N A; 2I1Q A; 4ECT A; 4TUQ A; 4Z6D A; 2XID A; 2ZTC A; 4IQV A; 2KIC A; 3K1R B; 1ZJM A; 4DOC A; 4JWM A; 2G07 A; 1D8Y A; 2BZF A; 1BGX T; 3PY8 A; 2ZIW B; 1B4F A; 3F2D A; 4J9P A; 5DLF A; 4Z6C A; 7ICO A; 1RM6 C; 3PW7 A; 1BNO A; 1U4B A; 8ICU A; 1ZQZ A; 3KKA C; 5J2B A; 7ICS A; 3OTQ A; 1XC9 A; 4O5C A; 3AM9 A; 3NUQ A; 3RR7 A; 2F44 A; 4NWI A; 5CP2 A; 4DO9 A; 3Q8S B; 3KHR A; 4IR1 A; 2W9A A; 2MAX A; 4KLL A; 1BNP A; 4EEY A; 4RPX A; 2EAN A; 3SMV A; 4CDG A; 4RQ2 A; 5DGA A; 8ICC A; 2DUY A; 2YB1 A; 2MUT B; 4AP9 A; 4J9R A; 5L1K A; 2IOH A; 4TUR A; 3PW4 A; 1L3T A; 2DWQ A; 4B9S A; 2G08 A; 4QZE A; 3E0F A; 2LI6 A; 5KG6 A; 1D8B A; 3KHL A; 3PW0 A; 2W9B B; 1KLN A; 3T5L A; 9ICO A; 2KZZ A; 2BPF A; 4DQQ A; 8ICB A; 1IM4 A; 3K75 D; 1ZQD A; 4US9 A; 4B9V A; 1V85 A; 3S6J A; 4KLE A; 1NK4 A; 1N5X A; 1Z4O A; 2HBM A; 3WK9 A; 2RQ5 A; 2W04 A; 4OD0 A; 5ALZ A; 1WWV A; 2PI4 A; 5J2F A; 3GV5 B; 2WF7 A; 2KFN A; 8ICI A; 4KLQ A; 1SZH A; 1IIP A; 3MFH A; 1U49 A; 5ALO A; 5AI4 A; 3QEB Z; 4KLM A; 5KFS A; 2LYH A; 2JR5 A; 2YY6 A; 5J2C A; 8ICW A; 2IOF A; 5KFL A; 5KFF A; 5G5H A; 4DQI A; 5AIB A; 9ICW A; 4RQ0 A; 4O3N A; 3SAG A; 3H8W A; 3DV9 A; 3TI0 A; 4I2E A; 2JZB A; 1ZD5 A; 4U7C A; 4GXI A; 3ED5 A; 3THV A; 3C2K A; 3Q8R B; 2A3V A; 2DL0 A; 7ICI A; 1F0M A; 1ZD4 A; 3QNM A; 1IV8 A; 1QSS A; 4O9M A; 4RT2 A; 2H3I A; 2HBK A; 4Q8F A; 3NVZ A; 3WKC A; 3UMB A; 4KX5 A; 5AK3 A; 7ICF A; 2BCU A; 3C21 A; 1ZQX A; 4DFK A; 2XCP A; 1UPH A; 4F3O A; 5KFB A; 4DFP A; 4KLH A; 1S0N A; 3RJF A; 7ICL A; 3MBY A; 3EWA A; 3V6J A; 2ZIX A; 4XUS A; 4YXM A; 4FBT A; 3BQ0 A; 7ICT A; 2E8P A; 3T5K A; 5CA7 A; 4J9L A; 3KZX A; 2JEI A; 3OJS A; 3TAD C; 3PML A; 3HP6 A; 4YP3 A; 2UVU A; 2XO7 A; 8ICM A; 1TVA A; 4HAI A; 1CRX A; 2QAR A; 2LMR A; 3RBE A; 8ICF A; 1RXV A; 3ZDC A; 1TV9 A; 2ES6 A; 4QNL A; 4ECS A; 4UB6 U; 4QJF B; 1S77 D; 1OW5 A; 3HW8 A; 2JEF A; 3A0H U; 2J6S A; 3C5F A; 3BS5 A; 4JV1 A; 5T14 A; 3ZD8 A; 1X9W A; 1N48 A; 4LJX A; 2FI1 A; 2ZIV B; 2KMD A; 2LHT A; 3D2N A; 1BPD A; 2ZXI A; 5KG7 A; 4PHE A; 1M6Y A; 1O08 A; 3TFR A; 4XQ8 A; 5BPC A; 3SR6 A; 5AI6 A; 3WKA A; 4R66 A; 3UQ0 A; 4UAS A; 1NKE A; 5KFG A; 3RRH A; 4YD2 A; 2P35 A; 2YX8 A; 2NRZ A; 4QZG A; 5AKY A; 2FMQ A; 1ZQI A; 2W03 A; 1PK1 A; 4QZB A; 3MR5 A; 4PL1 A; 4MFF A; 4DLE A; 4GFJ A; 4I2C A; 4YG2 A; 5J2A A; 8ICP A; 4UB3 A; 4RQ7 A; 2UVW A; 5KFQ A; 2IBK A; 3LK9 A; 8ICX A; 2NRV A; 2EAM A; 8ICE A; 4EEL A; 4R64 A; 4ECR A; 1S8O A; 5KG1 A; 2V9W A; 1JX4 A; 5AKX A; 4DL6 A; 1RZT A; 5ALF A; 3RH5 A; 4PPX A; 3Q8M A; 4PL2 A; 4BUG A; 1PZN A; 3CW2 C; 4YR0 A; 4PGQ A; 4ED3 A; 4BXO B; 5D49 A; 4CF5 A; 2KHQ A; 3O0F A; 8ICK A; 5B5E U; 3RAQ A; 4EBE A; 2VA3 A; 3HT3 A; 4C4S A; 3ALR A; 5KFR A; 1KRP A; 5KT2 A; 9ICI A; 3QU9 A; 2E8M A; 3D6J A; 1TK0 A; 3D2S A; 2JGA A; 4JMU A; 5L1L A; 1Z3E B; 2RDI A; 4CE6 A; 4CCH A; 1Z1V A; 8ICR A; 3WU2 U; 3I1Y A; 1X6J A; 2NO5 A; 1O03 A; 1XO0 A; 4M2Y A; 2C2E A; 1L7M A; 2KG5 A; 2RRD A; 2D3D A; 2KHV A; 2E8O A; 5KNI A; 5J8Y C; 3NRZ A; 5ALU A; 5DB9 A; 4NJ8 A; 2J6U A; 3PST A; 1A76 A; 4K4G A; 3B0X A; 4DF4 A; 1ZD3 A; 1L8L A; 1XSN A; 1FO4 A; 2Y1I A; 3EUB 2; 4C4T A; 4IR9 A; 5L1M A; 3NAS A; 1ZQH A; 3GQC A; 5KT7 A; 3HX0 A; 3SEI A; 1ZQN A; 5ALL A; 3C29 A; 3RAX A; 2DBY A; 2NO4 A; 9ICG A; 4Z6F A; 2HHV A; 4RNN A; 1UT5 A; 1WG8 A; 3EZ5 A; 2VJ4 A; 4RUC A; 4Z6E A; 2ESE A; 2EH9 A; 2OHF A; 2GOL A; 3WK8 A; 5EE1 A; 1CI4 A; 3J81 j; 1K5O A; 2KZ3 A; 1KW4 A; 4B9T A; 5J2K A; 2KV2 A; 2JH7 A; 1ZQR A; 3SI8 A; 2JXJ A; 2AJQ A; 1Z00 B; 3RH6 A; 2W8K A; 2C2D A; 3KOO A; 1RQL A; 9ICS A; 1XNS A; 3PX4 A; 1QH9 A; 1NK5 A; 1N56 A; 4PZO A; 4YR2 A; 5DB8 A; 4Y2U A; 4F5R A; 2RHF A; 2YMM A; 1ED1 A; 4R65 A; 3KZI U; 5J0P A; 1V97 A; 3K1Z A; 2PFQ A; 3AQF A; 3CNH A; 4E0D A; 4A8E A; 1S9F A; 1JXL A; 3M9M B; 2RP5 A; 3AN1 A; 4F4K A; 2Y9T A; 4J9N A; 2G5I B; 4GIB A; 2BDU A; 2LYB A; 4NLB A; 1YZ6 A; 2DPI A; 5H2F U; 2F1H A; 7ICR A; 2F76 X; 2AQ0 A; 2R8I A; 2E1E A; 3GV7 B; 1WUD A; 4ELU A; 2F77 X; 3TAD A; 2W7O A; 1LB2 B; 1N63 A; 3NVW A; 4B9L A; 5A0L A; 2V4Q A; 5JUM A; 1BPX A; 1QQ6 A; 2NRX A; 2PFN A; 2HMX A; 3NS1 A; 1SV0 A; 3RB3 A; 4IQU A; 4QW8 A; 3Q8P B; 1ZQG A; 3C1Z A; 1X42 A; 3QZ7 A; 2HW3 A; 2KJ9 A; 1UT8 A; 3WK5 A; 5AKI A; 1N5W A; 5KFT A; 4F4Z A; 4JV0 A; 4ZOH C; 4C8L A; 1U9L A; 3Q8L A; 9ICU A; 2WF5 A; 1BPB A; 5BOL A; 3MR2 A; 4ZH4 A; 1TFR A; 3C5G A; 1MQ2 A; 4M04 A; 2UVR A; 4R8U A; 2MUT A; 1D9F A; 2AH5 A; 3PNC A; 4DQS A; 4C0Z A; 1XWL A; 4NXZ A; 3HPO A; 3EW9 A; 5J2H A; 4UB2 A; 8ICH A; 2W9B A; 5KG0 A; 2ZTE A; 4WJ3 B; 3MFI A; 1WYG A; 3MGV A; 5DB7 A; 4MF2 A; 4YCX A; 5JTI A; 4KLU A; 3JPS A; 4IQW A; 2F1I A; 2CRX A; 3DEE A; 3K4G A; 5ALP A; 1MA7 A; 5HHI A; 4M0A A; 2K8A A; 5EOZ A; 3WKE A; 2VKQ A; 2LPE A; 1ZRM A; 4NLN A; 4M47 A; 4G9B A; 4QWE A; 3QEA Z; 5KFI A; 2WB1 F; 3PMN A; 3MGH A; 2F2A B; 2XY5 A; 2K4E A; 2UVV A; 2BGW A; 4QWB A; 1ZYQ A; 5F9L A; 1JMS A; 4O3O A; 5KFZ A; 3AU6 A; 2FLP A; 4US8 A; 3AEV A; 4ECQ A; 4KLG A; 9ICV A; 2NV3 A; 3I28 A; 3QUQ A; 5HMM A; 5J0S A; 5D46 A; 3WK4 A; 2WF6 A; 3IP4 B; 4IRD A; 2W9C B; 3CYM A; 4CF4 A; 1JRO A; 3QU5 A; 5KFU A; 1MSW D; 3Q8K A; 2HHT A; 2K89 A; 1ECW A; 2CXY A; 4KN4 A; 3V6H A; 2AGQ A; 1DK2 A; 1LKY B; 3F53 A; 2BCV A; 4EEN A; 1SXE A; 4O3M A; 1ZD2 P; 4LZD A; 2XIC A; 3RJI A; 1B43 A; 4M9G A; 5DBB A; 3LVV A; 4P0P B; 2KD1 A; 1X9M A; 2K8B B; 2KVS A; 1ZJN A; 2J6T A; 2HBL A; 3VC8 A; 4C4R A; 4O3Q A; 1TK5 A; 8ICS A; 1KKX A; 4KIT B; 2LKY A; 5J8Y A; 7ICG A; 1HEK A; 2OH2 A; 1PVP A; 2FE9 A; 1RG6 A; 1SXD A; 1ZXI A; 1P7D A; 5E79 U; 1ZQQ A; 2G5H B; 2DFL A; 4P0Q B; 4Y2X A; 2NRW A; 2KP7 A; 4UW9 A; 3FYH A; 4ECV A; 5CHG A; 1EXN A; 4F91 B; 4KLS A; 4TUP A; 4DWI A; 4DEZ A; 4DL7 A; 2KE7 A; 1L3U A; 2FJ6 A; 4Q44 A; 4TUS A; 9ICC A; 2VA2 A; 3IV6 A; 5AM1 A; 1UCV A; 4GC6 A; 3OSP A; 4MHV A; 5CB1 A; 2W11 A; 4NY8 A; 3F5E A; 3KTQ A; 3TAN A; 1QCK A; 3ZDD A; 2KVC A; 3C28 A; 1N62 A; 1KSP A; 5J2D A; 1XO1 A; 5L1J A; 5KT5 A; 3N4M B; 2BCQ A; 5AM5 A; 4IC9 A; 3B9J A; 4UAR A; 2I9G A; 1JIH A; 4UAU A; 1UQV A; 5J2E A; 1NNL A; 4UB5 A; 3PO5 A; 5ALV A; 2K4H A; 1KL9 A; 4UB8 U; 1DXS A; 4FS1 A; 1DGS A; 2DPJ A; 1L6N A; 1SL0 A; 3N97 B; 3MDA A; 4PJ0 U; 1NK6 A; 1L7P A; 2AGP A; 4C7Y A; 3BQ1 A; 3H8S A; 1KFD A; 5CWR A; 9ICJ A; 8ICJ A; 3AUO A; 4QZ9 A; 1RQN A; 4P4P A; 3GFK B; 4GXK A; 2Q0Z X; 5AHX A; 1FFU A; 5BOM A; 4DCC A; 3LWM A; 1SWW A; 9ICT A; 2DGZ A; 4QWA A; 5ALR A; 2KN7 A; 2OEH A; 5L1I A; 4EBD A; 3GIM A; 8ICQ A; 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2BQ3 A; 4I2F A; 2ZG6 A; 5CEH A; 4C80 A; 2W9M A; 3FC4 A; 4RQM A; 3MR3 A; 4PH5 A; 5DKW A; 4EX7 A; 3HRD D; 4ED7 A; 4KLT A; 3KKA A; 2XCA A; 4X5V A; 1DOQ A; 2W3R A; 2ODG A; 4QWD A; 3GIK A; 7ICH A; 4DS4 A; 1K1Q A; 3QU4 A; 1ARO P; 3AQE A; 5C0Y A; 4JK1 A; 1S5L U; 3AMZ A; 7ICQ A; 3HKZ C; 3HWT A; 4DSJ A; 4DOB A; 4G3I A; 3HKZ F; 2JZB B; 1SWV A; 3GV8 B; 4F4Y A; 4DSE A; 4YQW A; 2DF4 B; 3RFA A; 2EZY A; 3OHB A; 5KL8 B; 2ALZ A; 2WAQ C; 2GLE A; 2YB4 A; 3SV4 A; 3KHG A; 2VJ5 A; 4J9S A; 3ZDB A; 1Q8K A; 4UBC A; 5KFE A; 1ZQO A; 4DL2 A; 5ALW A; 9ICK A; 1C7Y A; 4KX3 A; 4UAZ A; 5G5G A; 1UA1 A; 2EZZ A; 2OXO A; 2ASJ A; 1NK0 A; 1ZQL A; 3BDP A; 1ZQW A; 4RQ6 A; 5CR0 A; 2KSO B; 2HHX A; 5L9X A; 4FBU A; 4MEX A; 2B0C A; 4RU9 A; 3PSI A; 7ICV A; 1ZQF A; 3RJK A; 1S76 D; 4Y2Y A; 1IXR A; 1KEJ A; 4DL4 A; 1T3Q A; 2H3V A; 2HDO A; 2EDU A; 3FDS A; 3IM1 A; 3M7D A; 5KFY A; 5TZV A; 5ALY A; 1NJY A; 3SD7 A; 1TAU A; 4PGY A; 5III A; 5KFM A; 5ALT A; 4RPY A; 4Y2V A; 3QUT A; 5J2I A; 3ETR A; 3NVV A; 2BPC A; 1ZQK A; 5ALM A; 3RB0 A; 3VCB A; 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