The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
CQEANYGALLRELCLTQFQVDMEAVGETLWCDWGRTIRSYRELADCTWHMAEKLGCFWPNAEVDRFFLAVHGRYFRSCPIS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the human receptor activity-modifying protein 1 extracellular domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Receptor activity-modifying protein 1
|
| molecule tags |
Protein transport
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
29
|
| structure length |
81
|
| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YX8 A; 3AQE A; 3N7P D; 3N7S C; 2XVT A; 3AQF A; 3N7R C; #chains in the Genus database with same CATH topology 5HNK A; 3QU9 A; 1UCV A; 3TAC B; 4C4S A; 4U7C A; 3OHB A; 3NRW A; 2F44 A; 1L8L A; 3DEE A; 1D9F A; 4I2G A; 5KT6 A; 2W9B A; 4ECQ A; 2FLP A; 4EYH B; 3V7L A; 1ZYQ A; 1XSL A; 5KFY A; 4WJ3 B; 3RJE A; 3GU3 A; 2E8P A; 1NI3 A; 5EE0 A; 3GV5 B; 3GQC A; 4DS4 A; 4R66 A; 2XCA A; 2JR5 A; 5KT4 A; 1UA0 A; 3OTQ A; 2LYH A; 3F53 A; 2D8C A; 4PZO A; 3H4B A; 5J0Y A; 2HVH A; 3RAQ A; 5KFN A; 5KTQ A; 1X2I A; 5ALG A; 2F2A B; 3KOO A; 3KZI U; 5AI5 A; 2R18 A; 1TK8 A; 1SKW A; 5J2G A; 1SZP A; 4P4M A; 2JEG A; 3QEA Z; 2G09 A; 1QQ7 A; 3IRU A; 8ICM A; 2W3R A; 4YR3 A; 4E0D A; 3U26 A; 4JB3 A; 4EEY A; 1JN3 A; 5F9N A; 5L1K A; 2AQ4 A; 1T7P A; 2PXI A; 4F8R A; 4FZL A; 4FS2 A; 2W8L A; 2EAM A; 2AGP A; 4B9T A; 3OGU A; 4BJQ A; 5J2E A; 1L7N A; 4ZOH C; 7ICS A; 2FE9 A; 3K1R B; 4DF4 A; 3LK9 A; 3RAX A; 3T5J A; 4ED2 A; 3WU2 U; 5JRT A; 3G6Y A; 4TUR A; 1NZP A; 4I27 A; 5L1I A; 4QZB A; 4ECW A; 4IRK A; 2OWO A; 5AK5 A; 2A3V A; 4RQ7 A; 4AYB C; 5J0X A; 4DL5 A; 4DSJ A; 3F2B A; 4F2S A; 1WWU A; 2EZX A; 5DB7 A; 5III A; 1U9L A; 1ZXI A; 2KTQ A; 2KKP A; 4TUP A; 5KFO A; 2ZXI A; 3F5A A; 4M6W A; 1U49 A; 5L1J A; 2N1R A; 1PK1 A; 2DWQ A; 4F5P A; 4FBT A; 8ICO A; 1FEZ A; 2XIC A; 1F44 A; 4LVS A; 4DSK A; 5CHG A; 7ICE A; 5KG4 A; 2BCR A; 2NO4 A; 2B21 A; 1C7Y A; 4EYI B; 2ZIX A; 3BQ7 A; 5KFR A; 4F50 A; 2IOF A; 1N48 A; 1ZQH A; 3GDX A; 1SWV A; 1X6J A; 9ICR A; 4PJ0 U; 4EX7 A; 2K8B B; 2GWS A; 2Y0S C; 2AJQ A; 4BWJ A; 3UQ0 A; 8ICV A; 1D8B A; 3FC4 A; 3BQ1 A; 4P0Q A; 3TAD A; 2KJ9 A; 5K4L A; 2BR0 A; 3I1Y A; 3RJK A; 2DUY A; 2ASD A; 3PW5 A; 4UBB A; 2RLT A; 5J0Q A; 3M1Y A; 4DS5 A; 9ICB A; 1KFD A; 3N28 A; 4CRX A; 3C28 A; 4CGZ A; 3OSN A; 4B9U A; 2E8O A; 5AKE A; 3UMC A; 3UXP A; 4XUS A; 3WK5 A; 2DFL A; 9ICV A; 2BDU A; 2ZIV B; 4CCH A; 4ED6 A; 4AP9 A; 8ICJ A; 3ED5 A; 4QZC A; 9ICP A; 2F77 X; 2KHQ A; 4GXI A; 1XSP A; 4RPX A; 4GC7 A; 3H0R B; 5DB9 A; 3A0B U; 2FJ6 A; 2WB1 C; 3IP4 B; 4F91 B; 2R8J A; 1SZH A; 2ODG A; 2WFA A; 4PL2 A; 1QSS A; 2WAQ F; 1B0X A; 1NKC A; 4C8O A; 5AM1 A; 4EBC A; 1X6I A; 3RJG A; 5J2A A; 4RQ1 A; 1Z1B A; 8ICX A; 4JMU A; 7ICP A; 4KMO B; 1QQ5 A; 4YG2 A; 5AIA A; 1M6Y A; 4DSI A; 1Z1V A; 4DFP A; 4PGX A; 4M9L A; 3ETR A; 5AIC A; 3ISB A; 3KHG A; 2QKQ A; 3WKE A; 4IR1 A; 3PW2 A; 5KG5 A; 4KLG A; 2W04 A; 2E1E A; 4ELV A; 1ZOL A; 1Q3V A; 2PFN A; 3C2L A; 2HDO A; 3UMG A; 2YMP A; 3RJH A; 3LVV A; 5KFA A; 4ECS A; 4F5N A; 1XNS A; 2AQ0 A; 1BPX A; 1J2N A; 3CYM A; 2IBK A; 4KLT A; 5ALX A; 3K4G A; 4DL4 A; 5KT2 A; 4ECV A; 5L1M A; 2UVV A; 4P4P A; 5A0L A; 5AM3 A; 2OYY A; 4MEX A; 1ZQC A; 3RR7 A; 5AKZ A; 2LYB A; 3OPX A; 4PHA A; 1JIH A; 2MAX A; 1N63 A; 4JWN A; 1KKX A; 2HHT A; 1N56 A; 4QIW F; 4KMU A; 1XO1 A; 3RJI A; 3JPO A; 7ICO A; 1Z00 A; 2WF6 A; 4KLQ A; 9ICS A; 5J0U A; 2EZZ A; 5KFC A; 1SGG A; 5ALJ A; 4NM2 A; 1SXE A; 2HVI A; 3WKC A; 4YXJ A; 4I2C A; 3RB4 A; 2VAN A; 5AK6 A; 4DCC A; 5J29 A; 2KIV A; 3AM9 A; 2WHE A; 4J9N A; 4JUZ A; 2W54 A; 3D2Q A; 3RF9 A; 2WF8 A; 3QUQ A; 1T3Q A; 5DG8 A; 4Y2Y A; 5EE9 A; 5DLG A; 4ICA A; 4O3R A; 3RH4 A; 4I2H A; 2F8L A; 5D49 A; 2FLL A; 1XSN A; 1IV8 A; 3JPS A; 4KLI A; 5HR6 A; 4Y2R A; 2W3S A; 3ZD9 A; 2HI0 A; 2NO5 A; 3OJU A; 4KLE A; 5J8Y C; 1ZQN A; 3HKZ F; 3H7I A; 3D6J A; 5CEH A; 5KFF A; 1ZQP A; 1QSL A; 1VJ5 A; 2EZY A; 4PH5 A; 4Y2X A; 8ICS A; 1RXV A; 2VA8 A; 2GLE A; 9ICW A; 2V4R A; 4EZ9 A; 4UB8 U; 1WWV A; 2XO7 A; 4MEY A; 3K75 D; 5TIS U; 2OHF A; 4F5R A; 9ICL A; 4P0P A; 2RDJ A; 4QW9 A; 3PX0 A; 1LKY B; 2K8C B; 5B66 U; 1BPB A; 3EPI A; 2PMZ F; 1ZQI A; 5FP0 A; 4C8M A; 1KRP A; 3SAG A; 9ICE A; 3RTV A; 4U6P A; 1LB2 B; 9ICQ A; 2PI5 A; 5DQH A; 2JV3 A; 3SEI A; 2KFZ A; 7ICG A; 2Y9T A; 3RH6 A; 5ALT A; 2WF5 A; 3TI0 A; 4M0A A; 3HIL A; 5AIB A; 2FPK A; 1T4G A; 1S0V A; 4TUQ A; 2V4Q A; 2FDR A; 2F3N A; 5AI4 A; 2KP7 A; 3NAS A; 2NYV A; 1S10 A; 1L7P A; 3G6V A; 4MF2 A; 3HPO A; 1RYS A; 2WF7 A; 5KFL A; 1ED1 A; 3BDP A; 4FBU A; 1NK8 A; 3BQT A; 5ALW A; 1B4F A; 3HJE A; 8ICE A; 3Q8R B; 3KKA C; 1X66 A; 2LYA A; 1ZD2 P; 4F5Q A; 3GIJ A; 8ICP A; 4EEN A; 5KFX A; 1NOM A; 1Q8K A; 4K4G A; 2RQ5 A; 3H0L B; 2RRD A; 4CDG A; 4YQW A; 1NK6 A; 4NV0 A; 4ACO A; 3HX0 A; 5ALF A; 2A1J A; 4ED0 A; 4OJ6 A; 4ED8 A; 3Q8S B; 4J9K A; 4UAU A; 2ZUC A; 4NWI A; 4NLN A; 4EEK A; 8ICZ A; 2ZXH A; 1PVQ A; 4DFK A; 1ZQS A; 5J0T A; 1S0M A; 4G9B A; 2AXT U; 4RQM A; 2L5Y A; 4R8U B; 4F2R A; 1ZQU A; 5J8Y A; 4O5C A; 1Z3E B; 4UW9 A; 1K5O A; 5H2F U; 3GFK B; 4OO1 J; 2W03 A; 1RYR A; 2ZJ8 A; 3GV8 B; 2K60 A; 4TQS A; 3ALR A; 5KG6 A; 5KFE A; 4M47 A; 5IIL A; 2Y1I A; 3SD7 A; 1S76 D; 3T3F A; 2GOL A; 2JHD A; 2NRV A; 2OM6 A; 3V7J A; 2R8K A; 5KG3 A; 1GO3 F; 3NVZ A; 2JMG A; 5AK3 A; 3V72 A; 3HW8 A; 2B0C A; 1ZQQ A; 3RRG A; 1X9W A; 2H3Q A; 4M2Y A; 2FPM A; 5AKX A; 3LDA A; 4Q44 A; 1SIJ A; 4YP3 A; 1ZD3 A; 5AKL A; 1Z19 A; 1HJP A; 1Y88 A; 2KN7 A; 4F71 A; 1SL2 A; 3OHA A; 4KX3 A; 3ISC A; 8ICU A; 1KFS A; 4AYB F; 4FS1 A; 5KFU A; 2G5I B; 2I5H A; 4ED1 A; 2CRX A; 3QNM A; 1NK0 A; 2P6R A; 4KLL A; 2NRZ A; 4MFF A; 4TUS A; 5KFD A; 1IG6 A; 2MSN A; 4PHD A; 4Q43 A; 3VCB A; 2BHN A; 2LMR A; 2AH5 A; 4KLO A; 1DK2 A; 1HIW A; 5AM0 A; 2VJ4 A; 5ALQ A; 1TKD A; 2NRX A; 9ICF A; 4K4H A; 4IQW A; 3KKA A; 1O08 A; 2PMZ C; 4XRH A; 3NVY A; 3Q8Q B; 8ICT A; 1SKS A; 5G5G A; 2YB4 A; 3ZD8 A; 1QH9 A; 2LKY A; 3E0F A; 3GIK A; 5DB6 A; 1V9P A; 1S8O A; 2KVS A; 4HAI A; 1SL0 A; 5E79 U; 5ALU A; 1MSW D; 4XA5 A; 4NLK A; 3LVW A; 3NS1 A; 2KKV A; 2KNJ A; 3I28 A; 4YD2 A; 4GLX A; 1KW4 A; 3QU4 A; 1TAM A; 4DFD A; 1S9F A; 2XVT A; 5BOL A; 2VJ5 A; 3NTU A; 3N7P D; 4O9M A; 3UMB A; 4PGY A; 2G0A A; 5F3X B; 1SV0 C; 3QZ8 A; 1TE2 A; 2GH1 A; 4DL6 A; 4B6J A; 2BQ3 A; 4P2H A; 3RBD A; 4B9M A; 4KLU A; 3ZDA A; 4BXO B; 2ZIV A; 3Q8P B; 1TAQ A; 2BPG A; 1ZJM A; 3M6Z A; 3RB6 A; 2WB1 F; 1HUO A; 3QU5 A; 5ALD A; 3HWT A; 4UB4 A; 1BPZ A; 1NK7 A; 3OJS A; 4KLF A; 3F2C A; 1NKB A; 3ZI4 A; 4PHP A; 1RM6 C; 3PZP A; 3SYZ A; 1ZQY A; 4O3P A; 4CF5 A; 2ZUD A; 2BPC A; 4MFA A; 5BPC A; 4MHV A; 2W9C B; 3F5E A; 2KK0 A; 1K1S A; 5KAF U; 4O3S A; 4JWM A; 5L1L A; 5HML A; 2I6X A; 9ICI A; 3MR3 A; 5CWR A; 4K4I A; 2K89 A; 3SMV A; 2FMS A; 1A77 A; 2ZTD A; 3C5F A; 1UHU A; 1URJ A; 4B9S A; 3QUC A; 2K4I A; 4J03 A; 1TVA A; 1J97 A; 2M0N A; 2KJ8 A; 2DF4 B; 4DQI A; 1ZQT A; 1JI7 A; 4I2I A; 1NK5 A; 1CRX A; 4C8L A; 2BKE A; 2KJ5 A; 3NRZ A; 3HRD D; 5B5E U; 1RXW A; 1JRO A; 4DL3 A; 5EWE A; 3QZ7 A; 3BS5 B; 3C2K A; 3H8S A; 3AL0 B; 4BDP A; 4YR0 A; 2ESE A; 2OXO A; 4QJF B; 4Y2P A; 3T5H A; 4YMO A; 4DQS A; 1V38 A; 4O5K A; 2LI6 A; 3PW7 A; 3T5K A; 5AKG A; 3IDW A; 2KVC A; 1SKR A; 5HHI A; 2FI1 A; 4ECZ A; 1ZD5 A; 1ZQB A; 3C23 A; 4F4Y A; 4KTQ A; 2XCP A; 1SV0 A; 2HHV A; 3AU6 A; 1F0M A; 2BZF A; 1NJZ A; 9ICN A; 2E1F A; 4BGD A; 3N4M B; 3QU2 A; 2HHX A; 2JEI A; 3BZC A; 1RG6 A; 2KSO B; 3O0F A; 4DSE A; 2IHM A; 3TAP A; 2W9M A; 1MA7 A; 3PO5 A; 5J2B A; 2BQU A; 1U45 A; 2MRL A; 5J2F A; 5IIN A; 3AN1 A; 8ICY A; 1NJX A; 5F9L A; 1XS9 D; 1ZQX A; 3SZ2 A; 5ALO A; 2BCS A; 1ZQF A; 9ICK A; 9ICC A; 1UQV A; 5J0W A; 4DQQ A; 5DB8 A; 1ZQV A; 4I2D A; 3A0H U; 2IMW P; 3MR2 A; 1TK0 A; 1JAL A; 5ALR A; 3QYP A; 2KIC A; 5KT7 A; 2EAN A; 2W8K A; 2K4H A; 4C7Y A; 3QUT A; 2RP5 A; 4JV0 A; 5HR7 A; 1T8E A; 4KLS A; 5ALP A; 4FO6 A; 1ARO P; 5KAI U; 2XC9 A; 1PVR A; 2KHV A; 4KN4 A; 4PL1 A; 3TAR A; 3ZDB A; 2E8M A; 4EX6 A; 2XGQ A; 4Z6F A; 3M9N B; 4KLH A; 1LKY A; 1PUZ A; 4RNM A; 3NVV A; 3T5L A; 3NVW A; 7ICK A; 2AGQ A; 1K1Q A; 2E3T A; 5C0Y A; 4GC6 A; 3TQ1 A; 2H3V A; 1A6S A; 2BCV A; 5ALN A; 1J2M A; 1FIQ A; 5DGA A; 3IM1 A; 1Q3U A; 4C0Z A; 4FFD A; 3ICX A; 1RQL A; 1MN8 A; 3L3F X; 2D3D A; 2Q4T A; 2Z7J A; 3D2N A; 4Z6D A; 2ALZ A; 4OD0 A; 5AKJ A; 4EEL A; 5AKK A; 2QB0 B; 5L9X A; 1NZB A; 3CP8 A; 4DLG A; 2ZTE A; 3HP6 A; 4DFM A; 4DO9 A; 3C1Z A; 4ECU A; 4DOC A; 1L3S A; 3IV6 A; 2ASJ A; 7ICM A; 2JXJ A; 2YML A; 5CA7 A; 5KFT A; 1KEJ A; 4Y2T A; 2ZTC A; 1ZQR A; 9ICA A; 1S77 D; 3WK4 A; 2C2R A; 4NY8 A; 4QZ9 A; 3C29 A; 1H38 A; 2YMQ A; 1T94 A; 3QE9 Y; 5JTI A; 1KL9 A; 4UBC A; 3KD3 A; 2MUT B; 1N5W A; 3AQF A; 3C1Y A; 1SB3 C; 1ZD4 A; 3TFS A; 2ZIX B; 3S6J A; 4US8 A; 5G5H A; 3MGH A; 4C8K A; 5AKI A; 3M8S A; 4UB1 A; 2CXY A; 2FPL A; 2DKX A; 3PW0 A; 3PR5 B; 1BPY A; 5DBA A; 4IS7 A; 4R8U A; 8ICF A; 4QZH A; 3ONN A; 4IRC A; 4P0Q B; 4IR9 A; 5ALE A; 4Y2Q A; 4I2F A; 1OW5 A; 3LYS A; 5AI8 A; 5AI9 A; 2VA2 A; 1IXR A; 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2LM4 A; 1X9S A; 5IIO A; 3JPT A; 1PVP A; 2RDI A; 5KFB A; 4ECX A; 4UAT A; 1NK9 A; 1BPD A; 3H40 A; 1C20 A; 1L6N A; 1N2X A; 4R65 A; 3R9K A; 4RQ0 A; 4HYK A; 3GII A; 1X42 A; 4KIT B; 3E2E A; 5AKH A; 3JPP A; 3MBY A; 2HOI A; 4LZG A; 5J2D A; 1KDH A; 2HBL A; 5DG9 A; 2G5H B; 4DOA A; 4F3O A; 3PSP A; 2XY6 A; 1FFV A; 4OJP A; 2W9C A; 3J81 j; 2Y1J A; 1KFT A; 1Q46 A; 8ICN A; 5IIK A; 1A76 A; 4YVZ A; 5KFW A; 3M7D A; 5KFS A; 4DL2 A; 1ECW A; 2E5S A; 5J2H A; 1IIP A; 3QUB A; 5ALS A; 3V6K A; 3PO4 A; 2G07 A; 2EH9 A; 4R63 A; 1V97 A; 2HCF A; 4BWM A; 2VA3 A; 4ZH4 A; 4A8E A; 5ALV A; 7ICI A; 4FZM A; 2J6S A; 1S5L U; 3BZK A; 2M9N A; 5EWG A; 4UAR A; 4UB6 U; 4QWD A; 1CEZ A; 3CW2 C; 4QW8 A; 3EPG A; 3BS5 A; 3ZDC A; 5IIJ A; 2MU2 A; 4PZN A; 3PR4 A; 3G6X A; 4MFC A; 2F76 X; 5JUM A; 4R64 A; 5KT3 A; 1Z4O A; 4C7Z A; 2BQR A; 2YTU A; 2JEF A; 3V7K A; 2O6K A; 3V6H A; 2IA6 A; 5D4B A; 1L3V A; 5CB1 A; 2DQN B; 3FAH A; 3SV4 A; 5AM4 A; 3PY8 A; 1ZQL A; 1D9D A; 9ICO A; 4QZF A; 1IM4 A; 2MA1 A; 3UXO A; 2KZZ A; 3GV7 B; 5AHX A; 3HT3 A; 2HMX A; 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