The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
76
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structure length |
76
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Chain Sequence |
TKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural insights into RNA recognition by the alternative-splicing regulator muscleblind-like MBNL1.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Metal binding, rna binding protein
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Muscleblind-like protein 1
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| total genus |
19
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| structure length |
76
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| sequence length |
76
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-05-08 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3D2N A; 3D2S A; 3D2Q A; 2E5S A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4R66 A; 1LVH A; 2C2D A; 3K1R B; 3M1Y A; 1WG8 A; 2G08 A; 2NRX A; 4UW9 A; 5L1M A; 3M7D A; 1UCV A; 4F91 B; 3NVZ A; 2GH1 A; 1TK5 A; 4ED7 A; 2KZ3 A; 4KLJ A; 2Y1I A; 4DL7 A; 4QW8 A; 3ZD9 A; 1ED1 A; 3F53 A; 5DBB A; 2H3Z A; 4KLU A; 4QNL A; 2KZZ A; 4DQP A; 4DSL A; 1EXN A; 4KN7 A; 1Q3V A; 3I76 A; 2LBO A; 3MR6 A; 4LVS A; 1MSW D; 3RRH A; 2ZIV B; 4TUQ A; 4DFK A; 3THV A; 5J0Y A; 3BQ1 A; 3GIM A; 4RQ1 A; 3CP8 A; 2C2E A; 5BOL A; 4FFD A; 3GDX A; 5J2B A; 3OTQ A; 4Y2J A; 1XSL A; 3RB4 A; 5AM3 A; 3PSP A; 8ICO A; 3S6J A; 2RP5 A; 4MFA A; 1HIW A; 2K8A A; 4KX5 A; 3KHH A; 2HCF A; 3GU3 A; 4BWJ A; 1CUK A; 3MR2 A; 4KLT A; 4YR0 A; 2GLE A; 2XY5 A; 3N7P D; 3C1Y A; 3C23 A; 3MDA A; 2W9C A; 4QZ8 A; 2BPG A; 2HHQ A; 1FFV A; 5KG1 A; 1ZQK A; 2N1R A; 5KFD A; 3V7L A; 4UBC A; 4C4T A; 3PY8 A; 3PW4 A; 5KFQ A; 1C7Y A; 4NV0 A; 4UB2 A; 5DG7 A; 3F2B A; 1SWV A; 4RQ3 A; 3QU7 A; 1DRG A; 2DL0 A; 2QAR A; 2W7O A; 2HHW A; 5KT4 A; 2PXI A; 5ALY A; 2BR0 A; 3PNC A; 4DWI A; 3V6J A; 5AI6 A; 4J9Q A; 2NRW A; 3SV4 A; 2YMQ A; 4Y2S A; 2HHS A; 2K4P A; 4F4K A; 1DK3 A; 2P6U A; 2XY6 A; 1SZP A; 3PX6 A; 2VA3 A; 7ICU A; 4B9U A; 2BHN A; 5ALE A; 4CE6 A; 4CCH A; 4F72 A; 1UT8 A; 4C8K A; 2HHU A; 4JV0 A; 2JH7 A; 3AM9 A; 7ICQ A; 4AYB C; 2PI4 A; 4PGX A; 3G6X A; 4RQN A; 3ISC A; 1TK8 A; 1X2I A; 2I6X A; 5HR6 A; 5GTH U; 2ZTC A; 4BDP A; 2CRX A; 3T5J A; 3NTU A; 5J0Q A; 4ELT A; 3NAS A; 1SWW A; 4MEY A; 5ALS A; 2FE9 A; 3PO5 A; 4C7Y A; 2W55 A; 5FP0 A; 1JRO A; 4UAZ A; 2HHV A; 1HEK A; 1RM6 C; 2BKE A; 3OSP A; 4DSE A; 1TFR A; 7ICN A; 2NV3 A; 5KT5 A; 5CA7 A; 4PL2 A; 4CF3 A; 5J8Y C; 4I2E A; 4QZG A; 2BDU A; 4NLZ A; 4Z6C A; 3SV3 A; 2E8O A; 1B4F A; 1WCL A; 5ALX A; 3AU6 A; 3QU4 A; 3PW0 A; 4EBD A; 2KP7 A; 4DQQ A; 2H3V A; 3MR3 A; 5TZV A; 1RDF A; 2EH9 A; 2AQ4 A; 4I2H A; 4IQU A; 2KK0 A; 9ICK A; 4F71 A; 3SAF A; 4O3M A; 1U9L A; 4UAY A; 5AI0 A; 4I27 A; 1F0M A; 2ASD A; 2I1Q A; 4DSI A; 2ES6 A; 4I2G A; 1IIP A; 2WB1 F; 2W3S A; 5ALW A; 4ECQ A; 3M8R A; 5KL1 B; 3IG8 A; 3RH5 A; 4IL6 U; 4B9N A; 3K4G A; 4B9T A; 2FI1 A; 5DLF A; 3JPP A; 3H4B A; 3CW2 C; 4BJQ A; 3Q8K A; 3NRZ A; 4YXJ A; 3IDW A; 4I2J A; 2YB4 A; 3MDC A; 1ZQS A; 1D9F A; 1Z00 A; 1NOM A; 3NVY A; 3K75 D; 4UB8 U; 2K4H A; 3FM9 A; 4OJ6 A; 1X9X A; 4KX3 A; 1NK6 A; 5J2I A; 4YMM A; 2MUT B; 4O3R A; 2PFN A; 5EOZ A; 3H4D A; 4EBE A; 3QX7 A; 5HHH A; 5KT3 A; 3AU2 A; 3H8W A; 4RNM A; 3GII A; 1ZD5 A; 3CYM A; 2HOI A; 5AI8 A; 4M0A A; 5KG2 A; 3V7K A; 1ZOL A; 3H8S A; 3RBE A; 4RZR A; 4NJ8 A; 1PVP A; 1RYR A; 3QUC A; 4AP9 A; 5AM2 A; 4DEZ A; 2E8N A; 3ZDC A; 3PR5 B; 9ICM A; 2DKX A; 4YMO A; 1ZQV A; 2KJ8 A; 9ICI A; 4I29 A; 1NZP A; 2PMZ F; 5AKG A; 1NJY A; 4TQR A; 3F5A A; 3ZD8 A; 3H7I A; 4U7C A; 4GLX A; 4MFC A; 1MQ3 A; 2KKV A; 3H8J A; 3SR6 A; 2AXT U; 1N63 A; 5AKK A; 2ZIX A; 5KFS A; 5KFG A; 3LVV A; 4KLM A; 1RZT A; 3HP6 A; 5KG6 A; 4DQI A; 2VAN A; 4C4S A; 1ZQU A; 4NLN A; 3ZDB A; 3PST A; 1ZQJ A; 1D8B A; 3T5L A; 2QB0 B; 1ZQQ A; 3RJK A; 4YXM A; 1LKY B; 2BCU A; 3PZP A; 4FS2 A; 4K4G A; 1S97 A; 5EWG A; 1S0N A; 3WK9 A; 4RU9 A; 4M47 A; 2ZTE A; 2Q0Z X; 2JEG A; 2OEH A; 2ALZ A; 1ZQY A; 2C28 A; 1XU4 A; 5HNK A; 2WAQ C; 5ALR A; 4DLE A; 2EAP A; 4B9L A; 2D6F C; 5IIN A; 4IRC A; 2G5I B; 1KFS A; 2JZB A; 4M6W A; 5J2K A; 3ONN A; 4MFF A; 3QEA Z; 2E8P A; 2RRD A; 2I5H A; 3OGU A; 4I2I A; 2DF4 B; 2KSO A; 3RB6 A; 2LMR A; 4NLG A; 4R8U A; 2Y9T A; 2ZG6 A; 5KFP A; 2FMS A; 7ICR A; 4BUG A; 1J2N A; 4EEN A; 4NWI A; 5DB6 A; 1QSY A; 2ZIU B; 2IHM A; 2XI9 A; 1HUZ A; 1BNO A; 1ZD3 A; 4ECW A; 4ED0 A; 2W11 A; 3C29 A; 2WF5 A; 2OXO A; 3MAB A; 4F5R A; 1J2M A; 2GO7 A; 2NRV A; 2JR5 A; 5J0S A; 1YZ7 A; 4C80 A; 8ICH A; 3CRX A; 2F8K A; 4ED6 A; 1RYS A; 1ARO P; 1J97 A; 2LPE A; 5KFY A; 4K4I A; 4CF4 A; 5J2G A; 2F3N A; 4PPX A; 4C0Z A; 9ICL A; 4QWA A; 1KL9 A; 4NXZ A; 4GXI A; 4FZM A; 5ALG A; 3JPS A; 1ZJN A; 3KBB A; 8ICF A; 2W9A A; 5AK6 A; 4DS4 A; 5F9L A; 1UA0 A; 2ZJ8 A; 8ICC A; 4Y2U A; 8ICS A; 3OHA A; 4F4W A; 4NLB A; 4RT3 A; 2KV2 A; 4EYH B; 3MBY A; 4DF8 A; 2V4R A; 4ICA A; 2XVT A; 9ICE A; 8ICU A; 3IN5 A; 1PUZ A; 1Z1B A; 2FLP A; 9ICG A; 2LM1 A; 3KHL A; 2KHV A; 2YTU A; 2K4I A; 1U48 A; 8ICB A; 2D3D A; 4UB6 U; 1N5X A; 3PX4 A; 3EPI A; 5AI5 A; 5EE9 A; 1QSL A; 4UAV A; 4PGY A; 3M6Z A; 2JGA A; 7ICK A; 7ICH A; 4PHE A; 3KTQ A; 4ECX A; 3ZI4 A; 5KFU A; 5KTQ A; 3GV8 B; 8ICL A; 2XO7 A; 1FFU A; 3Q8P B; 3RB0 A; 1A77 A; 2VJ4 A; 4J9M A; 5AM5 A; 3BQ7 A; 2C22 A; 1L7N A; 3C21 A; 3KKA A; 2A1J A; 4NL9 C; 3PX0 A; 1ZQZ A; 2FPM A; 4R64 A; 2W8L A; 3N7R C; 2W04 A; 4Z6F A; 3F5E A; 4YD2 A; 5J2D A; 4FBU A; 3HWT A; 1JXE A; 5AIB A; 3UQ0 A; 1D9D A; 4UBB A; 3E2E A; 2HOQ A; 5AKX A; 4NM2 A; 2B21 A; 4PZN A; 3SEI A; 3PW5 A; 1SB3 C; 5ALK A; 4M9J A; 2FPK A; 4HYK A; 1ZQO A; 2WF8 A; 2C2R A; 4P2H A; 5J0R A; 1PK1 B; 1Q8K A; 2HBK A; 3N7S C; 4OJO A; 4Z6D A; 8ICQ A; 2K4E A; 1MC8 A; 2XGP A; 7ICF A; 1L7P A; 4ZH4 A; 1Z19 A; 3TKA A; 2IMW P; 1DK2 A; 3A0H U; 3J81 j; 4QW9 A; 4ED3 A; 2ASL A; 2KIC A; 1S5L U; 4TUS A; 2L5Y A; 1OW5 A; 1A76 A; 4ELV A; 5IIM A; 1PK3 A; 1T94 A; 4OCZ A; 3LK9 A; 3UM9 A; 1KBU A; 4IRK A; 5DGA A; 4FS1 A; 1WWU A; 4BXO A; 1K1Q A; 3RJE A; 1RQN A; 1T7P A; 3BS7 A; 5KFC A; 4C8N A; 5DB7 A; 1ZYQ A; 3BQ2 A; 4DQR A; 2YY6 A; 3DV9 A; 5KNI A; 3JPO A; 5ALU A; 2QB1 A; 3EUB 2; 3RFA A; 1JXL A; 3OPX A; 2HMX A; 4DOB A; 1KLN A; 5J0W A; 8ICG A; 1ZD4 A; 2XC9 A; 3L5K A; 5TIS U; 3MR5 A; 4P4M A; 2VIX A; 4DL3 A; 1UQV A; 5ALJ A; 5KG4 A; 3Q8M A; 4Q43 A; 3M6K A; 3L4P A; 5HR7 A; 2BQU A; 1SKS A; 1WUD A; 5AK5 A; 2NO5 A; 1U45 A; 3BJY A; 3OJU A; 3T3F A; 2WTF A; 1ZQP A; 1X66 A; 4Y2T A; 5KFB A; 1T4G A; 5KFI A; 2JEI A; 2ZUC A; 3RAQ A; 5C0Y A; 4KN4 A; 1U4B A; 4ED2 A; 5CP2 A; 3C2M A; 4DL4 A; 5KFE A; 8ICY A; 5DBA A; 2R8H A; 5DB9 A; 3L3F X; 4C8L A; 5DQI A; 5AKY A; 1XO1 A; 3MFH A; 4PZO A; 2R18 A; 1KTQ A; 4M9G A; 3KHR A; 2G07 A; 4O3N A; 4F5N A; 1N5W A; 3QU9 A; 4XRH A; 1NJX A; 3EWA A; 2B0C A; 2W9B A; 3AQE A; 9ICF A; 5G5G A; 1ZQF A; 4GC6 A; 1ZQI A; 1VDV A; 3N4M B; 2BCV A; 2KZM A; 2H3Q A; 3PVX A; 5JU5 A; 3PSI A; 9ICX A; 4QIW C; 2UVV A; 4UAS A; 4KLI A; 1Z3E B; 1HJP A; 1N62 A; 2G0A A; 1NKE A; 5H2F U; 2PI5 A; 2KIV A; 4ECU A; 3PV8 A; 3WK7 A; 4J9N A; 1ZQG A; 1Z1V A; 4DL6 A; 1QTM A; 4JB3 A; 3PML A; 2QLT A; 2BCS A; 3ETL A; 3RAX A; 3HIL A; 4F2R A; 3BS5 A; 1L6N A; 4P0Q B; 4FO6 A; 1TKD A; 2HBJ A; 2AH5 A; 2DFL A; 5AHX A; 4TQS A; 3ED5 A; 3RF9 A; 3BQ0 A; 3WK8 A; 3PSF A; 4F92 B; 4NLC A; 2AJQ A; 1K5O A; 4M2Y A; 5EE0 A; 3UXO A; 4P4O A; 5IIL A; 3DEE A; 4RQ0 A; 4G3I A; 3ORY A; 1T3Q A; 4ECT A; 1OUQ A; 4IR1 A; 3LWL A; 2W3R A; 1WCN A; 1BPB A; 4F3O A; 3PW7 A; 2ZIW A; 3I1Y A; 2W9M A; 8ICR A; 4C8M A; 3A0B U; 4KLF A; 1NNL A; 3SYZ A; 3NUQ A; 3H0R B; 5KL8 B; 3MGV A; 4J9L A; 3QZ8 A; 4EX7 A; 1YT3 A; 4G9B A; 4NL9 A; 2AGQ A; 3OJS A; 3PMN A; 1UPH A; 3KFU F; 4FE3 A; 1ZRM A; 2XY7 A; 3RH6 A; 5ALO A; 1TAQ A; 2F2A B; 4EBC A; 2KVS A; 2VA8 A; 1KSP A; 4F50 A; 9ICT A; 3FAH A; 4QWB A; 2LM4 A; 2XID A; 5AK4 A; 4B9S A; 1QLN A; 2G09 A; 1KEJ A; 5KG0 A; 3GV5 B; 2FMQ A; 4PHP A; 5CEH A; 3TAD A; 4EYI B; 3M9M B; 3KHG A; 4JWN A; 4PJ0 U; 4YMN A; 3AMZ A; 5BPC A; 4YQW A; 3GZF A; 2EAM A; 1MN8 A; 2LHT A; 3TAC B; 1ZQC A; 4P0P A; 2W43 A; 4YR2 A; 3AUO A; 5ALD A; 4F8R A; 3RJH A; 2M0N A; 4IRD A; 4RUA A; 4BWM A; 2RHF A; 3KD3 A; 2ZTD A; 1L3V A; 2KFZ A; 4DSJ A; 4FZN A; 1S76 D; 4US9 A; 2J6S A; 2KVC A; 3KOO A; 3KKA C; 5AK3 A; 4RQ7 A; 4R65 A; 1WYG A; 2E3T A; 5KFW A; 3UXP A; 3GV7 B; 4ECZ A; 3H8M A; 8ICT A; 1X6J A; 2EAO A; 1X42 A; 2A1A A; 3NRW A; 1FIQ A; 5L1K A; 2HSZ A; 1BPZ A; 4IC9 A; 4MHV A; 2E1E A; 3UQ2 A; 2HBM A; 2KEY A; 1F44 A; 2YMP A; 1X6I A; 4UAU A; 3LDA A; 3ZDA A; 5KFF A; 8ICZ A; 4NY8 A; 1K1S A; 3IRU A; 3K1Z A; 3AN1 A; 5KFM A; 2BDP A; 1AQ6 A; 9ICW A; 4J9O A; 5KG7 A; 2ATL A; 1H38 A; 5J0T A; 3WKD A; 5J2A A; 2Y1J A; 3HPO A; 4UAT A; 2F1I A; 4Q44 A; 1PZN A; 3D2N A; 5J0U A; 2GOL A; 4F2S A; 2H3I A; 4Y2R A; 4I2F A; 2CPR A; 4USA A; 4M9H A; 3KZX A; 9ICU A; 2W9C B; 2EAN A; 1V38 A; 2ZUD A; 2LYH A; 1ZQL A; 3O0F A; 4JK1 A; 4UQG A; 4UB5 A; 2AU0 A; 2PMZ C; 4HAI A; 2KFN A; 4QWE A; 4KTQ A; 1Y88 A; 3RJJ A; 2QAR B; 5DG8 A; 2F1H A; 3ETR A; 4M9L A; 5A0L A; 3C5F A; 1KFD A; 1X9W A; 3BS5 B; 1SL1 A; 4KLS A; 2F8L A; 1MA7 A; 4CNQ A; 4DSK A; 8ICW A; 5DQG A; 5HP4 A; 9ICJ A; 7ICG A; 4PH5 A; 8ICE A; 1TVA A; 1SZH A; 1VLB A; 3QU5 A; 1S10 A; 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1SL0 A; 3AL0 B; 8ICX A; 1BPY A; 5J0P A; 3TFS A; 3HKZ F; 1T8E A; 4DO9 A; 2JV3 A; 2ASJ A; 2YX8 A; 3TAD C; 5ALQ A; 2Y0S C; 1SV0 A; 2HDO A; 5DG9 A; 1QH9 A; 1TV9 A; 1QQ7 A; 8ICA A; 2ZXI A; 5J2C A; 5KFV A; 8ICJ A; 1ZRN A; 3NVW A; 1KKX A; 1JN3 A; 2PFP A; 5J0O A; 1V97 A; 4O3O A; 5BOM A; 4I2B A; 3IG5 A; 3GIJ A; 2HI0 A; 3MC1 A; 1WWV A; 2ZIX B; 2E1F A; 4J9P A; 2YB1 A; 4QJF B; 2NO4 A; 1RPL A; 5CWR A; 2IOH A; 4ELU A; 1BGX T; 1CRX A; 2EZY A; 5ALZ A; 5KFL A; 5KFR A; 3RTV A; 3TAQ A; 5IIK A; 5KG3 A; 2K8B B; 4KLD A; 4KLO A; 4F5O A; 1B43 A; 1L8L A; 2P66 A; 2DPJ A; 4O3Q A; 5AI4 A; 3V6K A; 3SQI A; 2AQ0 A; 5GTI U; 4ACO A; 5DDY A; 5D46 A; 1BPE A; 1TK0 A; 3ALR A; 2MAX A; 3RJG A; 2JZB B; 3CNH A; 4M6W B; 2DGZ A; 2KG5 A; 5JUM A; 2RDI A; 2KIW A; 2IA6 A; 5D4B A; 2KJ9 A; 2Z7J A; 4ED1 A; 4QZA A; 2KSO B; 1ZQB A; 3HJE A; 1CEZ A; 2OM6 A; 4R8U B; 5D49 A; 2RLT A; 1L3T A; 4Y2V A; 3EYZ A; 1LB2 B; 3JPN A; 5DLG A; 3NS1 A; 9ICB A; 1KFT A; 3G6V A; 1KDH A; 2CXY A; 3WK4 A; 2KN7 A; 4QWC A; 1COK A; 4YR3 A; 2ZUB A; 3LWM A; 4Z6E A; 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