The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
76
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structure length |
76
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Chain Sequence |
TKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Metal binding, rna binding protein
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Structural insights into RNA recognition by the alternative-splicing regulator muscleblind-like MBNL1.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Muscleblind-like protein 1
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| total genus |
19
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| structure length |
76
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| sequence length |
76
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-05-08 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3D2N A; 3D2Q A; 2E5S A; 3D2S A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1V38 A; 4DL5 A; 3RJJ A; 4GXJ A; 4DQQ A; 4RQ1 A; 4M9G A; 1D8L A; 3C28 A; 7ICS A; 5KFH A; 3LWM A; 2HHT A; 4OJO A; 1KN5 A; 2KG5 A; 5KFL A; 4M47 A; 3GIJ A; 4BWM A; 5J0O A; 3FC4 A; 5H2F U; 4PHP A; 2BCS A; 4YXM A; 3T79 A; 5KFS A; 2JHD A; 2I1Q A; 2OYY A; 3MDA A; 2HBM A; 4NWI A; 4J9L A; 3WKE A; 3EW9 A; 2Y1J A; 3L3F X; 5AK4 A; 1N48 A; 3MR3 A; 3DEE A; 2HBK A; 5HP4 A; 4JV1 A; 3D2Q A; 4R63 A; 3RB4 A; 4QZD A; 2BKE A; 4M0A A; 2UVW A; 3RH6 A; 3RFA A; 1U49 A; 1ZD5 A; 1RQL A; 4Y2R A; 8ICO A; 1BPE A; 1C7Y A; 2V4R A; 1Q3V A; 1D9D A; 3H8S A; 1ZD4 A; 9ICA A; 3N7R C; 9ICV A; 5AKJ A; 2J6S A; 4NLG A; 1B22 A; 3M9N B; 2IBK A; 3KHR A; 3H0M B; 2GH1 A; 2XY5 A; 3HPO A; 2QB0 A; 3G6X A; 1DRG A; 4F2S A; 1J97 A; 1ZQH A; 3PSP A; 4QZH A; 4IR1 A; 1UA1 A; 4PZO A; 4J9P A; 4JUZ A; 4PJ0 U; 2Q0Z X; 4ECR A; 2XY7 A; 3UQ0 A; 2A1J B; 4AYB C; 2ZTD A; 4PPX A; 5ALQ A; 2DPJ A; 2RDI A; 3TAD A; 1NK0 A; 3M8R A; 4QWB A; 5AM2 A; 5ALG A; 2GO7 A; 3H8M A; 3AEV A; 3JPR A; 5ALJ A; 1KRP A; 3E2E A; 1ZQO A; 2C22 A; 4PHE A; 4DO9 A; 7ICL A; 4RQ0 A; 1RM6 C; 2E8N A; 3MGV A; 4X5V A; 3TFR A; 2KE7 A; 5KFI A; 4M9H A; 4B9S A; 4KLL A; 3GIK A; 9ICT A; 4JMU A; 3LK9 A; 3PX6 A; 1ZQC A; 1YT3 A; 4I2C A; 2G07 A; 1S76 D; 5CJ7 A; 4KLI A; 1NJY A; 1L3S A; 1ED1 A; 8ICT A; 2PI4 A; 1SXE A; 4QZA A; 3QU5 A; 2RQ5 A; 3M9M B; 4EX6 A; 5KFR A; 3L5K A; 3D2N A; 5J0X A; 2J6U A; 3F2D A; 3C23 A; 4Y2T A; 1JRP A; 5AM5 A; 3NVZ A; 2JZB A; 1IXR A; 3M9O B; 2W03 A; 3EYZ A; 4YVZ A; 3E0F A; 4FZL A; 3B9J A; 2G5H B; 1D9F A; 5EWE A; 4M04 A; 1NZB A; 3KZX A; 5ALE A; 2KNJ A; 1JXE A; 2HDO A; 3KFU F; 1OW5 A; 2OWO A; 3N28 A; 2A1J A; 1X9X A; 4FO6 A; 1O03 A; 1ZRN A; 4Y2J A; 8ICP A; 2XID A; 3C2L A; 3KBB A; 4OJL A; 4O5K A; 2HOI A; 2IHN A; 4P4P A; 2HW3 A; 2ZIW B; 3G6V A; 3PST A; 2P35 A; 5J0Q A; 3JPS A; 1ZRM A; 2EH9 A; 4K4G A; 2KEY A; 4O3Q A; 1TK8 A; 4F92 B; 3PO4 A; 1NI3 A; 2BCU A; 2BDU A; 1TE2 A; 4C0Z A; 2PFQ A; 4KLD A; 2EAO A; 2R8H A; 3B0Y A; 8ICQ A; 2ISO A; 3JPO A; 2XVT A; 2RDJ A; 5KFT A; 7ICQ A; 2HI0 A; 3V7L A; 2NRT A; 3AQE A; 1JAL A; 4ECZ A; 2HSZ A; 1NKB A; 2XGP A; 3WK6 A; 5CP2 A; 1TKD A; 4UB5 A; 4YFK A; 3NVV A; 2A3V A; 1N2X A; 2G0A A; 2I5H A; 5AM0 A; 8ICI A; 1SL0 A; 1KL9 A; 3LWL A; 3H0R B; 4UB8 U; 4YR0 A; 2JEI A; 2NRW A; 3CYM A; 4UAT A; 2P6U A; 2MUT B; 4YCX A; 5AKE A; 3KKA C; 3T5H A; 4I2E A; 5IIM A; 2L5Y A; 1QSS A; 2IHM A; 2W9B A; 9ICB A; 9ICW A; 4O3N A; 2AH5 A; 2ZIW A; 2W11 A; 4LZD A; 1O08 A; 3KKA A; 3RB0 A; 5J0Y A; 3JPP A; 4I2B A; 1ZQF A; 4O5E A; 3PMN A; 4NLB A; 2VA3 A; 4UAU A; 2ATL A; 1C20 A; 1SXD A; 3SEN A; 4QZF A; 4ECY A; 1P7D A; 3ICX A; 4U7C A; 4AYB F; 3QZ8 A; 8ICB A; 4RQ3 A; 2LYA A; 1DXS A; 3D2S A; 1Z1B A; 4ED7 A; 4EEY A; 5HMM A; 5K4L A; 3GDX A; 1ZQR A; 4GFJ A; 7ICE A; 1LKY B; 2UVV A; 4HAI A; 3KTQ A; 3QYP A; 1LVH A; 4KLM A; 3QU4 A; 5KL8 B; 3HT3 A; 2KHQ A; 2NYV A; 3EPG A; 2E1F A; 5CWR A; 4QW9 A; 3SR6 A; 3RBE A; 3HW8 A; 3TAN A; 3EUB 2; 2H3V A; 1ZQP A; 2QAR B; 2BZF A; 4C8O A; 1WUD A; 7ICH A; 3OSP A; 2MUT A; 2HVI A; 2AQ0 A; 1RXW A; 4KMU A; 5AI8 A; 2YML A; 4UAR A; 3LDA A; 2WFA A; 1L7O A; 5EWF A; 4DSJ A; 4UAV A; 4EX7 A; 2M0N A; 4DQS A; 2VKQ A; 2FJ6 A; 5KG7 A; 1K1S A; 2H3Z A; 2FPL A; 4UB4 A; 4ECX A; 2W3S A; 3MR6 A; 2R8G A; 4KLT A; 1KLN A; 5KFW A; 1MQ2 A; 5KFE A; 5AI0 A; 1BNP A; 2HMX A; 3QXG A; 3F2C A; 2F2A B; 4DOC A; 1VDV A; 3B0X A; 5J2K A; 8ICC A; 4NY8 A; 4I2D A; 1TK5 A; 4RT2 A; 2ZTE A; 4I2I A; 2JV3 A; 3UXN A; 3QEB Z; 2HCF A; 3ETL A; 5KT3 A; 4ELT A; 4BUG A; 3WU2 U; 1ZQN A; 4NJ8 A; 8ICL A; 5J2I A; 3N97 B; 4YMO A; 4DFM A; 2QLT A; 3BQ2 A; 5EE0 A; 4IR9 A; 9ICX A; 7ICP A; 4J9S A; 5G5H A; 4DS5 A; 4DL3 A; 4RZR A; 5DLF A; 3GV5 B; 1LKY A; 3WKA A; 4PGX A; 2YB1 A; 5IIK A; 3HJE A; 3ISB A; 2AJQ A; 1COO A; 4F5R A; 4DWI A; 2E8M A; 5TZV A; 1ZQG A; 1ZQZ A; 3MGI A; 4F4X A; 2K4H A; 3TAR A; 1ZQY A; 4LZG A; 4FZM A; 4JWN A; 1JUD A; 5F9N A; 1S0O A; 5ALT A; 4C8N A; 4ECV A; 3RJE A; 3SAH A; 1JRO A; 5AI9 A; 5KAI U; 2QAR A; 4RNN A; 4R66 A; 3VCB A; 2DQN B; 5BOL A; 4F71 A; 1JN3 A; 2YMP A; 3EZ5 A; 1PUZ A; 4QJF B; 4IS7 A; 5DDY A; 2KZZ A; 8ICU A; 2LYH A; 1B4F A; 4DL6 A; 2W8L A; 1QSL A; 1XWL A; 3UPQ A; 8ICR A; 3T5L A; 1SIJ A; 2ZIV B; 3AMZ A; 1RZT A; 2MAX A; 4O3M A; 3SEI A; 5ALV A; 1PZN A; 3NVW A; 3TI0 A; 2E8P A; 2GOL A; 5KFF A; 7ICO A; 5AK3 A; 2XI9 A; 4IQV A; 4KTQ A; 2HHS A; 1FEZ A; 1ZQT A; 4MHV A; 4GC7 A; 1Q8K A; 1GO3 F; 4TQR A; 2KJ8 A; 4FZN A; 4UW9 A; 1H38 A; 4QNL A; 5DKW A; 5ALW A; 1XNS A; 2WF9 A; 2C2R A; 3JPQ A; 2W7P A; 3C21 A; 3Q8K A; 2VAN A; 4MEY A; 2NRX A; 4ECQ A; 4YP3 A; 2DGZ A; 7ICR A; 7ICN A; 2D8C A; 4DOB A; 3RJI A; 4DEZ A; 1K5O A; 2W9A A; 3KHG A; 1JXL A; 2ASJ A; 1ZQQ A; 2W3R A; 4TQS A; 4YD1 A; 2DBY A; 1S5L U; 2RRD A; 3RF9 A; 2KJ5 A; 5CHG A; 3IP4 B; 3PX0 A; 1HEK A; 5CRX A; 2LM1 A; 4Q45 A; 1SL2 A; 3SAF A; 4J9R A; 2CRX A; 2K60 A; 2EZZ A; 1XSN A; 1NKC A; 2ZIV A; 4Y2Y A; 5J0W A; 1IG6 A; 3MAB A; 2M9N A; 1SWV A; 3U26 A; 2EAM A; 2OEH A; 7ICF A; 4PZN A; 5DQH A; 4Z6F A; 4KN7 A; 3PW4 A; 5J2G A; 1NJZ A; 5KFC A; 1BPB A; 5A0L A; 3HRD D; 4C4T A; 4DL2 A; 3PY8 A; 1SL1 A; 1T7P A; 3BZK A; 5G5G A; 4BJQ A; 1SKW A; 1WCN A; 4C7Z A; 4KIT B; 2ESE A; 4F5O A; 7ICM A; 4XUS A; 1XC9 A; 1ZQU A; 1D8Y A; 1S0N A; 1NK7 A; 3QEA Z; 2BR0 A; 3H8J A; 2WF8 A; 3E58 A; 2G06 A; 5KFK A; 3CW2 C; 1KDH A; 2DKX A; 4UB3 A; 5AI5 A; 2C2E A; 2C2D A; 4O3O A; 2K8B B; 5F3X B; 4KMO B; 4ED3 A; 8ICH A; 1RG6 A; 4NLZ A; 1KKX A; 5HHH A; 5IIO A; 5J2J A; 4YXJ A; 5KT7 A; 3WKD A; 2B0C A; 4RUC A; 1CI4 A; 4HYK A; 1OXJ A; 4F4Y A; 9ICP A; 4PHD A; 4US8 A; 4EYH B; 1TAM A; 4RQM A; 5AI6 A; 3KZI U; 3Q8S B; 2JZB B; 4DFD A; 2E3T A; 5EWG A; 4BGD A; 5KFZ A; 4XA5 A; 2F1I A; 1TVA A; 3HWT A; 3TAD C; 1JMS A; 1UCV A; 3WK4 A; 2KFZ A; 7ICG A; 4UQG A; 5CB1 A; 4I2F A; 4Y2X A; 3KD3 A; 2WB1 C; 2BCQ A; 2ZUC A; 2OHF A; 4CE6 A; 4B9L A; 2HHU A; 1Z4N A; 3R9K A; 1N60 A; 1DOQ A; 4CF4 A; 2KJ9 A; 1ZQ1 C; 2MSN A; 4US9 A; 3AM9 A; 5DG7 A; 4GC6 A; 4M9L A; 4DL7 A; 1YZ6 A; 4KLE A; 4NL9 A; 3HKZ C; 1HUO A; 2RHF A; 2ES6 A; 3EWA A; 4Q44 A; 8ICW A; 2W43 A; 8ICY A; 5KT5 A; 5IIJ A; 2YN4 A; 4DFP A; 3ALR A; 3GII A; 2XY6 A; 4PHA A; 4KLG A; 1KTQ A; 5DG9 A; 2O6K A; 1SZH A; 4C4S A; 4XRH A; 1J2M A; 4JB3 A; 1X42 A; 4GIB A; 5DBB A; 8ICG A; 4F93 B; 2K89 A; 1Y88 A; 1FIQ A; 2AXT U; 3PW2 A; 1MC8 A; 1XO1 A; 4M9N A; 4I2J A; 2VJ4 A; 1N5X A; 3UM9 A; 2PFO A; 1V85 A; 4F4W A; 5AK6 A; 5ALH A; 1X40 A; 3RR8 A; 5ALP A; 1L7N A; 3F53 A; 1K1Q A; 3QUC A; 5AKH A; 4IC9 A; 4QW8 A; 3RH5 A; 3IM1 A; 4I27 A; 3CP8 A; 3NRZ A; 2W9B B; 4J03 A; 5DQG A; 2F1J A; 2KP7 A; 2UVU A; 3C2K A; 4QZC A; 3SAG A; 5ALX A; 1SKR A; 2A19 A; 4B6J A; 3C29 A; 4F5N A; 3H0L B; 5KG0 A; 5D4B A; 1V97 A; 4YMM A; 2JEF A; 1A0P A; 4K4H A; 3NS1 A; 4IRD A; 2K8C B; 2LKY A; 1NKE A; 1BPX A; 4M2Y A; 1FFV A; 5T14 A; 1S77 D; 3MDC A; 2LBO A; 4YMN A; 5JTI A; 4P0Q B; 1HUZ A; 3GQC A; 5EOZ A; 5ALY A; 1TK0 A; 4LJX A; 4CF3 A; 5F9L A; 3OSN A; 2NRV A; 5ALO A; 1XSP A; 1MN8 A; 4RNO A; 4NM2 A; 1Q3U A; 3GZF A; 3PR5 B; 1NK4 A; 1LB2 B; 3GV7 B; 1L3T A; 4TUS A; 1Z3E B; 4JWM A; 1ZQX A; 2VJ5 A; 1TAQ A; 5ALM A; 1WWV A; 4EZ6 A; 1UA0 A; 4IRK A; 3ZDD A; 5BPC A; 2IA6 A; 2D3D A; 9ICC A; 5AKK A; 3MBY A; 1ZQW A; 2H3I A; 3MC1 A; 3M6K A; 4J9O A; 4RQ6 A; 1U47 A; 5AIC A; 1N63 A; 5HR6 A; 1L6N A; 9ICM A; 2LPE A; 1SB3 C; 2H3F A; 4JV2 A; 4QZI A; 9ICF A; 7ICT A; 1N56 A; 3BQ7 A; 1YZ7 A; 2YX8 A; 1BPD A; 3V6H A; 1B0X A; 2OCE A; 3TFS A; 4OD0 A; 8ICV A; 1PK1 B; 3RR7 A; 1X6I A; 4PH5 A; 4QWA A; 3UMC A; 1ZJM A; 5KFO A; 2WF6 A; 3H8W A; 4F50 A; 2MA1 A; 5JUM A; 7ICV A; 2ZIU A; 3G6Y A; 1KBU A; 1BPZ A; 3ORY A; 4F8R A; 5J0U A; 3PR4 A; 2WB1 F; 3QNM A; 2ZXH A; 4QWD A; 2XO7 A; 2KN7 A; 2OXO A; 5L9X A; 4RQ7 A; 2KTQ A; 3TAC B; 4P0Q A; 1LV5 A; 4NXZ A; 2DUY A; 2XIC A; 4UB1 A; 1IM4 A; 4BWJ A; 2QKQ A; 2MRL A; 3BJY A; 5ALK A; 3HKZ F; 9ICR A; 4RUA A; 4PGQ A; 2FMS A; 4JV0 A; 5J0S A; 4EBD A; 4A8E A; 4O9M A; 3BQ1 A; 3RJG A; 1DK3 A; 4P0P B; 2HHW A; 3IV6 A; 2H5X A; 4O3R A; 1L7P A; 4MF8 A; 2A1A A; 5KFY A; 2DWQ A; 5DQI A; 5KAF U; 7ICK A; 2EAP A; 2FPK A; 4ZOH C; 4EEL A; 8ICK A; 2BQR A; 5J29 A; 5KT6 A; 1RYS A; 1X66 A; 1KQQ A; 1ZQI A; 5HNK A; 3Q8M A; 1PK1 A; 4NM1 A; 5C0Y A; 2ZJA A; 1BVS A; 1TAU A; 4OJ6 A; 4R64 A; 1PVQ A; 1ZYQ A; 1A6S A; 3QUB A; 4I2A A; 1IV8 A; 4KLH A; 3PO5 A; 5EE3 A; 3QX7 A; 2VA2 A; 1U4B A; 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5AKX A; 3QUQ A; 3F5A A; 3NVY A; 2JEJ A; 4Q8F A; 4CDG A; 2Y1I A; 3Q8Q B; 4YD2 A; 3ED5 A; 3NUQ A; 2ZXI A; 3PSI A; 2K4I A; 3D6J A; 2F76 X; 4ZH4 A; 3SV3 A; 3DV9 A; 1S0V A; 2EZY A; 4YR3 A; 3GU3 A; 4QZ9 A; 3V7J A; 3QZ7 A; 2DL0 A; 1SGG A; 3WKC A; 5AI4 A; 1UT5 A; 4O3P A; 4O0I A; 1L5U A; 4PGY A; 1Z1V A; 2P66 A; 4OJ5 A; 4DSK A; 2JEG A; 1A77 A; 2KFN A; 4ICA A; 5ALS A; 2IOF K; 3IN5 A; 3CNH A; 2HVH A; 1QQ7 A; 1BPY A; 2XGQ A; 2XC9 A; 5L1J A; 1NJW A; 2BHN A; 4DSI A; 1B43 A; 2W04 A; 2AGQ A; 5BOM A; 4GXK A; 4F4Z A; 4J9M A; 1DGS A; 4F5P A; 1UHU A; 4ECT A; 4QWC A; 8ICF A; 5KFV A; 2IOH A; 5KG3 A; 9ICG A; 3T5K A; 2FLN A; 4KLS A; 3K1R B; 1WG8 A; 1RQN A; 1KW4 A; 4F4K A; 3K75 D; 2BPG A; 4O5C A; 1X9W A; 1S97 A; 3RJK A; 1UPH A; 4DQP A; 5DBC A; 4RPY A; 1KSP A; 1SV4 A; 5J0R A; 1QQ6 A; 4UAZ A; 2K8A A; 5J2D A; 2Y9T A; 5KL1 B; 3IG8 A; 2EQY A; 3WK9 A; 3C2M A; 2HOF A; 5CR0 A; 2FE9 A; 2FLP A; 3AU6 A; 5KFG A; 1WCL A; 4DLE A; 4C8M A; 2OH2 A; 3TQ1 A; 1N61 A; 2MU2 A; 1RYU A; 1VLB A; 3LVV A; 4MEX A; 4AP9 A; 2AU0 A; 2WF5 A; 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