The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
76
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structure length |
76
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Chain Sequence |
TKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural insights into RNA recognition by the alternative-splicing regulator muscleblind-like MBNL1.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Muscleblind-like protein 1
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| molecule tags |
Metal binding, rna binding protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
19
|
| structure length |
76
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| sequence length |
76
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-05-08 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3D2S A; 3D2Q A; 3D2N A; 2E5S A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1IM4 A; 2HBM A; 3MFH A; 1ZQD A; 5AM0 A; 4M0A A; 3GIL A; 5KFS A; 4TUR A; 4IS7 A; 4Y2P A; 1ZQJ A; 2ES6 A; 9ICM A; 1ZYQ A; 1BVS A; 3VC8 A; 1S0V A; 2ZTD A; 5D49 A; 5E79 U; 2ASJ A; 5DG8 A; 3IG5 A; 4RPY A; 2NYV A; 3KHH A; 5BPC A; 4J9P A; 2BCU A; 4R8U B; 5KFJ A; 4B9M A; 4F91 B; 3T5L A; 1LKY B; 2PI5 A; 5J0Q A; 4DL6 A; 2ASD A; 3K75 D; 3UMG A; 8ICA A; 4DFJ A; 3QUB A; 2BQR A; 1KN5 A; 5AK5 A; 1Z19 A; 1S5L U; 1MQ3 A; 4B9N A; 2LBO A; 4R8U A; 1ZQB A; 3NUQ A; 3QU2 A; 3H4B A; 3RR8 A; 4B9L A; 9ICV A; 1SKS A; 1LKY A; 2W7O A; 1F5S A; 5AI9 A; 4QWB A; 4QWD A; 9ICX A; 1OW5 A; 1ZQN A; 1RYU A; 2ZTC A; 2IHN A; 4HYK A; 4EZ9 A; 1D8L A; 2RHF A; 4ECT A; 3RB4 A; 3HJE A; 3Q8K A; 4NM1 A; 3PR5 B; 2C2D A; 1BPD A; 5CB1 A; 2JH1 A; 3Q8M A; 4J9R A; 4MFA A; 1KFD A; 3C5F A; 4FZN A; 4DO9 A; 9ICG A; 4BX9 C; 4YR3 A; 1ZJM A; 2BCQ A; 4ECZ A; 8ICV A; 4OJ5 A; 5KT5 A; 4DSF A; 1ZQR A; 1KRP A; 4J9S A; 1ZET A; 4DSJ A; 5DB7 A; 3GZF A; 2NO4 A; 4OO1 J; 4XQ8 A; 4RQ2 A; 2W8K A; 5HHI A; 5J2K A; 3THV A; 2D8C A; 3PW2 A; 2D6F C; 1WCN A; 5DBA A; 4KLE A; 2ZIU B; 2WF7 A; 1ZXI A; 4ELU A; 5HNK A; 2ZUD A; 1L7O A; 4RPX A; 5DLG A; 4CGZ A; 3MR2 A; 5J2E A; 1C7Y A; 1TE2 A; 2VA2 A; 2LPE A; 2DQN B; 4RQ5 A; 1TFR A; 2H3Z A; 4O3O A; 4C8K A; 5AM1 A; 8ICE A; 3HKZ F; 3KBB A; 3C21 A; 2F8L A; 3RFA A; 1AQ6 A; 4LVS A; 4O3S A; 3BDP A; 4EBD A; 3ZDC A; 9ICT A; 2YY6 A; 2K4E A; 1D8Y A; 3WU2 U; 3C23 A; 1P7D A; 2KZM A; 2RP5 A; 5AIC A; 2C28 A; 4IRK A; 2HOQ A; 2UVW A; 5CEH A; 2KE7 A; 5L1L A; 5EOZ A; 4PZN A; 3QE9 Y; 4M9G A; 3RJH A; 2N1R A; 2FLN A; 1UT5 A; 4Y2U A; 8ICM A; 1T8E A; 2PFN A; 4YXJ A; 4F92 B; 2BKE A; 3H4D A; 2DPJ A; 2AJQ A; 2UVR A; 2R8J A; 1FFU A; 2MUT B; 5C0Y A; 1CI4 A; 4ED2 A; 1L8L A; 2FPM A; 3E58 A; 7ICG A; 5D46 A; 3SI8 A; 3QNM A; 2HHV A; 2MRL A; 2XY7 A; 1MQ2 A; 3PO5 A; 4I2H A; 1S10 A; 3FAH A; 1LB2 B; 4Q43 A; 1LV5 A; 4O3Q A; 3AQF A; 5AM5 A; 5DB6 A; 5F9L A; 2BHN A; 2W8L A; 2ZJA A; 2BPG A; 4O5K A; 2B6G A; 3M9O B; 1RDF A; 2DF4 B; 4CF3 A; 2XC9 A; 1X9S A; 4IR9 A; 4DS4 A; 5AI4 A; 4OD0 A; 2YX8 A; 4RUA A; 2LYB A; 2J6U A; 5AI8 A; 1IXR A; 2NRX A; 4YD1 A; 1XS9 D; 1ZQP A; 2K4H A; 2QB1 A; 2HCF A; 2WF8 A; 5J0W A; 7ICE A; 1BPY A; 3ZDD A; 4DCC A; 3QYP A; 5CWR A; 2MSN A; 2BDP A; 2XCA A; 1TVA A; 5ALY A; 4QZB A; 4FBU A; 8ICS A; 4UAR A; 5J2G A; 2HHX A; 3GDX A; 9ICJ A; 9ICF A; 4JV1 A; 1TK0 A; 8ICQ A; 3N7R C; 2LMR A; 1XSP A; 2AU0 A; 1KQQ A; 5AKI A; 8ICB A; 4PGQ A; 1S0N A; 2RDI A; 4P2H A; 2KTQ A; 4J9O A; 2ZXI A; 2LM1 A; 4ACO A; 4R65 A; 4RT3 A; 1L3S A; 4UQG A; 3LK9 A; 5EWE A; 4RU9 A; 1PVQ A; 3Q8S B; 4IQT A; 5ALM A; 2XGQ A; 4O3R A; 2AXT U; 3BQ0 A; 2OM6 A; 5KT4 A; 2JXJ A; 1B4F A; 4PHD A; 1CUK A; 1IV8 A; 4GC7 A; 1QTM A; 4EEY A; 5ALO A; 1JXL A; 5AI6 A; 5AKL A; 3SV4 A; 4ECV A; 1X42 A; 2A3V A; 3TAD A; 3H8J A; 3IDW A; 3OHB A; 5AKZ A; 1KW4 A; 2WF5 A; 2LI6 A; 2XVT A; 3PST A; 2XY6 A; 1NJZ A; 2QLT A; 2VJ5 A; 2HVH A; 5L1K A; 3SQI A; 4PJ0 U; 3KKA C; 2GH1 A; 4PHE A; 3KHR A; 3DV9 A; 1PUZ A; 4BGD A; 1PZN A; 4NJ8 A; 4KMO B; 4DL7 A; 1BNO A; 2P6U A; 4FZL A; 1KL9 A; 3D2S A; 4DSL A; 4IRC A; 3N97 B; 4IRD A; 5ALV A; 8ICI A; 2HHQ A; 4Y2J A; 9ICH A; 4B9V A; 1N5W A; 1SZP A; 4QWE A; 5KAF U; 3CNH A; 3DDH A; 2OCE A; 3QU7 A; 2XO7 A; 4K4H A; 4O3P A; 2A1J B; 3AQE A; 3HPO A; 4B9U A; 1JXE A; 3H8W A; 1U49 A; 4ECR A; 5DQG A; 2HOI A; 1B43 A; 2KKV A; 4KLO A; 4A8E A; 1K1Q A; 2G5I B; 2YN4 A; 4F50 A; 2HDO A; 3FDS A; 4M9H A; 5CP2 A; 7ICM A; 4Y2T A; 4M2Y A; 3C1Y A; 2E8M A; 4TQS A; 1XSL A; 2KJ5 A; 2EDU A; 3SEI A; 5KFY A; 4Y2Y A; 4NL9 A; 2H3V A; 2OYY A; 1ZQL A; 4J9Q A; 2IOF K; 4JK1 A; 1U47 A; 1QSL A; 3GV7 B; 4I2D A; 2UVV A; 1O03 A; 2VAN A; 3LWL A; 4NLB A; 4F5R A; 2VA8 A; 2H3F A; 4NLG A; 4Y2V A; 5J0O A; 1SZH A; 3GIK A; 4DL4 A; 3EUB 2; 3N7S C; 2KIW A; 2YTU A; 5H2F U; 2FMQ A; 5ALI A; 2JEG A; 5KFK A; 9ICS A; 4ED8 A; 5J0P A; 4P4M A; 5K4L A; 3M8S A; 3GV8 B; 2I9G A; 2BCV A; 4Y2X A; 2Z7J A; 4C7Y A; 4TUS A; 4KX3 A; 4RQN A; 1XNS A; 3MR6 A; 3RJG A; 4Z6F A; 3GII A; 5HR7 A; 2RRD A; 1ZQY A; 3WK4 A; 3TQ1 A; 3TAP A; 1D9D A; 5TZV A; 3V6H A; 7ICS A; 7ICP A; 2KOB A; 3PSI A; 4KN4 A; 4DF4 A; 9ICK A; 3WKC A; 1ZQX A; 3V7K A; 1SV0 C; 9ICI A; 3SAG A; 4KMU A; 4KLS A; 2EZZ A; 2IMW P; 2CXY A; 2AHO B; 3WK5 A; 1KDH A; 4Q44 A; 2E1E A; 2ZIW B; 1WYG A; 5J0X A; 3JPT A; 1BPZ A; 1ZQO A; 3AL0 B; 3RH5 A; 5J2C A; 4NWI A; 3EPI A; 3PX6 A; 5FP0 A; 3M9N B; 4QJF B; 3NAS A; 4RQ3 A; 2BQ3 A; 4I2J A; 1SKW A; 4UB1 A; 2ODG A; 3WKE A; 3JPR A; 2WFA A; 3AM9 A; 1JX4 A; 2KN7 A; 4JV0 A; 4P0Q B; 9ICC A; 1HIW A; 5BOL A; 9ICQ A; 4FZM A; 4Z6E A; 4ED3 A; 4Z6C A; 7ICU A; 4TQR A; 4M47 A; 2W9B B; 5AKY A; 3RRG A; 4KLT A; 4P0Q A; 4KLM A; 1IIP A; 2A19 A; 3H8M A; 2W7P A; 2FPL A; 2O6K A; 1DOQ A; 4EX7 A; 4BWJ A; 7ICT A; 5KFO A; 1X2I A; 2W9B A; 1QLN A; 5G5G A; 2WB1 C; 3MFI A; 3BZC A; 4KLF A; 4J9K A; 2DBY A; 2BQU A; 2G09 A; 3QX7 A; 4IQW A; 4YD2 A; 3RJE A; 3MGV A; 2ISO A; 2HBK A; 5B66 U; 1Z1B A; 1SIJ A; 5KG3 A; 1FEZ A; 5J8Y A; 1V85 A; 3MR5 A; 4C4R A; 3M9M B; 2K89 A; 4F4Z A; 7ICF A; 4Z6D A; 1SXE A; 2ZJ8 A; 4FS2 A; 3OSN A; 4QWA A; 4R66 A; 7ICL A; 3IM1 A; 5ALL A; 3PW4 A; 5GTI U; 4DQS A; 1BPE A; 3QZ7 A; 1ZD3 A; 3B0Y A; 7ICV A; 1Y88 A; 1L7M A; 2KIC A; 2OXO A; 3OSP A; 3T5K A; 2W9C B; 4QIW F; 2EAP A; 5DB9 A; 4NLK A; 5KNI A; 2RQ5 A; 7ICI A; 2DPI A; 2NRV A; 3QUT A; 4QZD A; 4J9L A; 5D4B A; 3KZI U; 5KL8 B; 2Y9T A; 3WKD A; 2HBJ A; 5KFD A; 2W9C A; 5KFQ A; 4ED0 A; 3T3F A; 1S76 D; 4Q45 A; 2LYA A; 1NJX A; 5DLF A; 2HI0 A; 5KFU A; 4PH5 A; 4DQR A; 2OWO A; 3RJK A; 4U7C A; 2J6S A; 1JUD A; 2WTF A; 5ALS A; 4NV0 A; 1SWV A; 4EYH B; 2YML A; 4BWM A; 4DS5 A; 4UB3 A; 2KIV A; 1WWV A; 4CE6 A; 2RLT A; 2C2E A; 2QB0 B; 3PW7 A; 4EEN A; 5JRT A; 2Y0S C; 1Z4N A; 1L7N A; 2K60 A; 2KHQ A; 2KVS A; 1QSS A; 4KLI A; 1UA0 A; 5ALW A; 4BXO B; 1A76 A; 3FYH A; 1SV4 A; 2H3I A; 2QB0 A; 1J2N A; 1U9L A; 3WKA A; 4YN4 A; 4C80 A; 3V6J A; 1LVH A; 5DDY A; 2IBK A; 4EEL A; 5CHG A; 1BGX T; 1ZQU A; 5ALT A; 1X9M A; 3RB3 A; 2K8C B; 3BS7 A; 1NK7 A; 4UB5 A; 4O5E A; 2WF6 A; 3G6X A; 2KG5 A; 1UCV A; 5AM3 A; 4GXI A; 4F3O A; 3VCB A; 4C8M A; 5AIB A; 1ZRN A; 3C1Z A; 4C8O A; 1S8O A; 5AIA A; 5AKG A; 2WAQ C; 1ZQT A; 3KD3 A; 5KG6 A; 4EEK A; 2DGZ A; 2PFP A; 2B0C A; 5DKW A; 5KFC A; 1N60 A; 5J2J A; 4K4I A; 1SB3 C; 2ZIU A; 1N5X A; 2C22 A; 3H0L B; 8ICR A; 4QZG A; 4F4Y A; 1CRX A; 3L5K A; 1RXV A; 5A0L A; 3ALR A; 3GIJ A; 1ZJN A; 1S77 D; 4RZR A; 4O0I A; 5CJ7 A; 1N56 A; 1KLN A; 5DBB A; 1HUO A; 1C20 A; 1MC8 A; 1Q46 A; 8ICP A; 1O08 A; 7ICR A; 3L4P A; 4PGX A; 3UXO A; 1SGG A; 3PMN A; 4AP9 A; 2G0A A; 5TIS U; 4ED7 A; 1Q3V A; 1BPB A; 8ICZ A; 4NM2 A; 1RPL A; 4QZF A; 4F2S A; 2R8H A; 3BJY A; 1JIH A; 2W3R A; 1A77 A; 5CA7 A; 1H38 A; 5HHH A; 2F44 A; 2MUT A; 1PK3 A; 2AQ4 A; 1A0P A; 1RG6 A; 4GFJ A; 8ICT A; 4QWC A; 5AM4 A; 1TK8 A; 1RZT A; 3A0B U; 2I6X A; 4OJP A; 5DGB A; 2KEY A; 3CRX A; 4C4T A; 1Z4O A; 5IIJ A; 3ZD8 A; 2KFZ A; 4KLU A; 3MC1 A; 3H0R B; 5KFE A; 4ECS A; 4KLJ A; 2FI1 A; 3ZDA A; 5KFL A; 3SAH A; 3GQC A; 2HW3 A; 3ETL A; 3TFR A; 4I2A A; 2F77 X; 4Y2Q A; 4JWM A; 2JMG A; 3JPQ A; 1NOM A; 2WF9 A; 3KFU F; 3KHG A; 1QH9 A; 4EX6 A; 2C2R A; 4BDP A; 4YMN A; 5J2F A; 3SZ2 A; 2F76 X; 1U4B A; 3M7D A; 3V7J A; 3SV3 A; 3KTQ A; 2XY5 A; 3MAB A; 1X40 A; 4UAW A; 8ICU A; 3QUQ A; 2OHF A; 1V97 A; 4DSI A; 4KLH A; 4U6P A; 4I2B A; 2KVC A; 1WCL A; 2RDJ A; 5KFG A; 2F1I A; 1ZQI A; 2JEI A; 5ALD A; 5KFX A; 3TI0 A; 2HVI A; 9ICR A; 4F72 A; 2DWQ A; 1KBU A; 3OPX A; 5KFM A; 2BCR A; 3IRU A; 4DQI A; 2AQ0 A; 5T14 A; 5EE3 A; 2VA3 A; 1COK A; 3PML A; 3PW5 A; 2WHE A; 5GTH U; 5AK3 A; 4YXM A; 5J0S A; 2F1H A; 1ZD4 A; 5CRX A; 1N61 A; 1ZQE A; 2HHT A; 9ICO A; 4RQM A; 2V4Q A; 4GLX A; 1T3N A; 4WJ3 B; 4F8R A; 9ICU A; 5DQI A; 4MF8 A; 2ASL A; 1NK6 A; 4F5O A; 3KZX A; 4DOC A; 4FO6 A; 3RBD A; 4JV2 A; 1ZQF A; 3PY8 A; 5KT2 A; 3BZK A; 1XSN A; 1SKR A; 3RJF A; 8ICY A; 3TAR A; 2UVU A; 1T4G A; 5AK4 A; 4QW9 A; 2HHS A; 2FMS A; 5IIO A; 1GO3 F; 3I28 A; 4KLL A; 2EAN A; 4GXJ A; 3OGU A; 1QQ5 A; 5B5E U; 4CF4 A; 3R9K A; 5HML A; 1SL2 A; 2EQY A; 3PV8 A; 2ZTE A; 2A1J A; 5III A; 3HKZ C; 5G5H A; 1PK1 B; 4GXK A; 5AKH A; 5IIN A; 1N48 A; 4YMO A; 3NTU A; 2PI4 A; 3PO4 A; 1XWL A; 4C8N A; 1KKX A; 3TAN A; 2K8A A; 4ECY A; 4B9T A; 4B6J A; 3G6V A; 3FC4 A; 1JRO A; 4ECX A; 4ED1 A; 5EWF A; 4QZ9 A; 4KLD A; 2W3S A; 4RPZ A; 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3BS5 A; 2ZIW A; 3F5E A; 1ZD5 A; 5EE9 A; 1L8O A; 5KG4 A; 4DFK A; 4RQ4 A; 4DQP A; 3LVV A; 3UQ2 A; 2ZXH A; 8ICO A; 1S0M A; 4EBC A; 2CN1 A; 5J29 A; 7ICJ A; 2KJ8 A; 2J6T A; 3UMC A; 2E1F A; 8ICW A; 2ESE A; 3C2M A; 3RB6 A; 3TAQ A; 2ZJ5 A; 3MDA A; 3DEE A; 3UQ0 A; 1JRP A; 3HP6 A; 4RNO A; 2YB4 A; 2F2A B; 1JI7 A; 3F2C A; 5HR6 A; 2W54 A; 1RYR A; 5KFP A; 2YMM A; 1ZQC A; 1WWU A; 3M6K A; 3ZI4 A; 5KG1 A; 5ALU A; 4NL9 C; 3RR7 A; 2R8K A; 2JEF A; 2LYH A; 1NK4 A; 5ALQ A; 5ALE A; 1WG8 A; 2HBL A; 4YMM A; 5F3X B; 5IIK A; 2JEJ A; 1ZQW A; 5J0T A; 4Q8F A; 4DFM A; 1ZD2 P; 3RF9 A; 3NVZ A; 5KT7 A; 1L3V A; 2MAX A; 1SL0 A; 3GU3 A; 1CEZ A; 2ISP A; 4Y2R A; 3F2D A; 5KAI U; 7ICK A; 2JR5 A; 2QKQ A; 4EZ6 A; 3RAQ A; 4P4O A; 4KIT B; 4I2G A; 4FBT A; 3QUC A; 3ISB A; 5DGA A; 2FPK A; 2EZX A; 2KNJ A; 3AU6 A; 1JMS A; 2R8I A; 1KEJ A; 4UB8 U; 3QEB Z; 1EXN A; 2F3N A; 4DOA A; 4JMU A; 5AKE A; 3OHA A; 4NXZ A; 1F0M A; 1Z00 B; 4OJ6 A; 1ZQA A; 5J0R A; 3D2Q A; 3AUO A; 2KSO B; 4RNM A; 9ICN A; 3RH4 A; 2P6R A; 5ALF A; 3V6K A; 3MGI A; 3JPN A; 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