The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
76
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structure length |
76
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Chain Sequence |
TKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural insights into RNA recognition by the alternative-splicing regulator muscleblind-like MBNL1.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Metal binding, rna binding protein
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Muscleblind-like protein 1
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| total genus |
19
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| structure length |
76
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| sequence length |
76
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-05-08 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3D2N A; 3D2Q A; 2E5S A; 3D2S A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1J97 A; 2XVT A; 2J6S A; 2H3F A; 2RDJ A; 4DL3 A; 5ALY A; 1GO3 F; 5AK6 A; 4YVZ A; 5KFX A; 4QWA A; 1WUD A; 1KBU A; 1RM6 C; 1BPZ A; 4MFC A; 2GLE A; 3DDH A; 1NK7 A; 1IM4 A; 5J2J A; 4O0I A; 3ED5 A; 3ISB A; 2KIW A; 3TAQ A; 3MR2 A; 3GV8 B; 2W03 A; 2NRV A; 5CRX A; 3IM1 A; 3AQE A; 5KFA A; 3A0H U; 1F5S A; 5F9L A; 2MRL A; 2W8K A; 2PI4 A; 5ALG A; 1IIP A; 2F8K A; 2G08 A; 3ZDE A; 5DDY A; 4R8U A; 3BJY A; 1ECW A; 1T8E A; 1XO0 A; 3D2S A; 1H38 A; 4Q8E A; 2YMQ A; 7ICL A; 4P4M A; 4YXJ A; 4QZ9 A; 3FC4 A; 1RXV A; 4KTQ A; 3PW2 A; 2JV3 A; 5KFL A; 1ZQC A; 5FP0 A; 1WCL A; 4YR0 A; 1L7M A; 1QQ7 A; 5AKX A; 2NO5 A; 1L8L A; 1NNL A; 9ICE A; 1ZYQ A; 2V9W A; 1TE2 A; 7ICR A; 4Y2P A; 4P2H A; 2KVS A; 1ED1 A; 3ALR A; 3L4P A; 5AM3 A; 2FI1 A; 4M6W B; 2W9B B; 2VJ4 A; 4C4T A; 4JV0 A; 7ICF A; 3WK9 A; 2HHU A; 5J2I A; 1TK8 A; 2KSO B; 4ZH4 A; 2ALZ A; 3RB6 A; 4QZH A; 2Y0S C; 2ZTE A; 5CWR A; 3PST A; 4UB8 U; 3LWL A; 3ZD9 A; 1V85 A; 2NRZ A; 3C1Y A; 5HHH A; 1KN5 A; 1N63 A; 4F5N A; 3PY8 A; 4DLE A; 5HHI A; 4BGD A; 2NRX A; 4DS4 A; 1B4F A; 2BCS A; 5L1K A; 1ZQU A; 2FE9 A; 3WKB A; 1ZQR A; 1ZQQ A; 2A1A A; 5J0Q A; 4OJ5 A; 4F5P A; 4ECQ A; 2Q4T A; 4J9P A; 2E8N A; 2F76 X; 4I2I A; 1K1Q A; 4KN7 A; 1LKY B; 2K4P A; 1DOQ A; 5KG7 A; 8ICV A; 3AL0 B; 5AI4 A; 5JUM A; 4I2B A; 2EH9 A; 1SL2 A; 2ZIU B; 4ED3 A; 3IDW A; 5J0U A; 2YMP A; 3A0B U; 4KLT A; 2HDO A; 4F72 A; 4P0P B; 5DB6 A; 3Q8K A; 3ZDC A; 1HUZ A; 4TUQ A; 9ICQ A; 2K8C B; 2Z7J A; 1A6S A; 3HJE A; 3E0F A; 9ICT A; 1U9L A; 9ICW A; 4F4Z A; 2AGO A; 4XQ8 A; 4USA A; 4YG2 A; 5CEH A; 3Q8M A; 1S9F A; 1RQN A; 2HHV A; 1C20 A; 2XIC A; 1F0M A; 3MBY A; 3Q8P B; 4J9K A; 1URJ A; 4KLF A; 3T79 A; 4ELV A; 5CA7 A; 2F2A B; 2JZB A; 4DL7 A; 1YZ7 A; 4F5Q A; 1N2X A; 2KIC A; 3RH6 A; 8ICF A; 3ICX A; 3UM9 A; 1ZQG A; 7ICS A; 3T5L A; 1X9S A; 4O5K A; 9ICV A; 4KMO B; 5B66 U; 1RG6 A; 1SKR A; 1TAU A; 2ISP A; 4GC7 A; 3MDC A; 3TI0 A; 3I76 A; 2ZIV B; 4QIW C; 4DSK A; 4I28 A; 5EE3 A; 2FLP A; 3MFI A; 4DFD A; 5E79 U; 2HOQ A; 5DGA A; 4C8L A; 4M04 A; 8ICW A; 3C5F A; 1IV8 A; 2ESE A; 1XO1 A; 1VDV A; 2MUT B; 9ICU A; 3RJG A; 9ICK A; 5KFE A; 2LYA A; 2IOF K; 3HX0 A; 2UVV A; 2R8G A; 4J9R A; 1X6I A; 2H3V A; 2ZXH A; 4RQ6 A; 2KV2 A; 2ISO A; 3AUO A; 3M9M B; 5KT3 A; 3ORY A; 1V97 A; 1DXS A; 3CP8 A; 2QKQ A; 5IIN A; 1PK1 A; 2IOH A; 2P66 A; 1VLB A; 5CB1 A; 9ICF A; 5HNK A; 2NV3 A; 4DOA A; 2XY7 A; 5BOM A; 3ETR A; 2LI6 A; 4PHE A; 1QLN A; 4JUZ A; 2XCP A; 1NJW A; 4IL6 U; 1A77 A; 1P7D A; 2ZIX B; 5AK4 A; 8ICL A; 3PVX A; 2PXI A; 1V38 A; 5KG1 A; 8ICY A; 3HRD D; 2DQN B; 5TZV A; 3B0Y A; 4I2F A; 2W9C A; 3KZX A; 1ZQ1 C; 4I2H A; 5ALJ A; 1ZOL A; 1YZ6 A; 4DSL A; 5J2D A; 2E8M A; 3F5E A; 3QXG A; 4FZL A; 8ICQ A; 3UMG A; 3IHQ B; 3OSN A; 4R66 A; 2BCQ A; 4YXM A; 3M6Z A; 4QZE A; 4YD1 A; 4ECT A; 3WK4 A; 1NOM A; 4CCH A; 4UB1 A; 1QSS A; 4QZ8 A; 4RPZ A; 3H4D A; 3V7K A; 4ED8 A; 1B43 A; 4X5V A; 2EZZ A; 4UAU A; 1ARO P; 4LZG A; 4RUA A; 3THV A; 3NVW A; 1YT3 A; 4EX7 A; 2HHX A; 5ALR A; 4RQ2 A; 5HR7 A; 1TKD A; 1UA0 A; 2KJ8 A; 5AM5 A; 2CN1 A; 5AIB A; 4C0Z A; 3TFR A; 5KFK A; 4F91 B; 3RBE A; 2FLN A; 1ZQO A; 4RNO A; 2C2R A; 8ICK A; 1A76 A; 1NK5 A; 3OHB A; 5DB8 A; 5ALU A; 2VA8 A; 5ALE A; 4O5E A; 5KFO A; 2Y9T A; 1X9X A; 4O3O A; 4XRH A; 9ICX A; 4QWC A; 4ECX A; 4UAV A; 2K60 A; 3KD3 A; 7ICG A; 2EAN A; 2I1Q A; 3QU2 A; 7ICO A; 3NVZ A; 3IG5 A; 2H5X A; 4KLG A; 2H3I A; 3PSF A; 4EZ9 A; 4PHD A; 4C8K A; 1NJZ A; 1BPX A; 4KX3 A; 5KT4 A; 4QZF A; 2R8H A; 2ZJ8 A; 3BQ0 A; 5ALD A; 3H8M A; 2DFL A; 3E2E A; 5JTI A; 5DLG A; 2NRW A; 1ZQS A; 3QUT A; 1ZJN A; 1KTQ A; 1F44 A; 1SL0 A; 4NLG A; 2FJ6 A; 5CP2 A; 3CYM A; 4NLK A; 5J8Y A; 1V9P A; 4FE3 A; 2M0N A; 4EEN A; 2MU2 A; 5KFI A; 1TAQ A; 1PVQ A; 1XU4 A; 4UAW A; 4ICA A; 2CPR A; 1AQ6 A; 2RRD A; 5A0L A; 2W54 A; 2DBY A; 1NK6 A; 3GIJ A; 2IHM A; 3PO5 A; 3NRZ A; 4DF8 A; 4TQS A; 2BCU A; 4O3N A; 5KFZ A; 4NJ8 A; 3T3F A; 5ALI A; 4JV1 A; 1LV5 A; 4Y2R A; 2P6U A; 3F2D A; 3WKA A; 1KLN A; 5T14 A; 2AGP A; 5KG0 A; 5CJ7 A; 3RH4 A; 3MDA A; 1NKC A; 8ICP A; 3NVY A; 2WB1 C; 5J2A A; 4ELT A; 2C2E A; 1Y88 A; 5IIK A; 2VKQ A; 2KZM A; 1N56 A; 1Q3V A; 1ZQT A; 8ICT A; 3MR5 A; 5KFM A; 3H0L B; 1MSW D; 5KFQ A; 4EEY A; 3LVW A; 2YML A; 2LM1 A; 3QUC A; 3QU7 A; 3PW0 A; 8ICC A; 5KG5 A; 4DSE A; 4I2G A; 4RQM A; 2ZIW B; 2KN7 A; 3D2Q A; 3QE9 Y; 4KN4 A; 5KFJ A; 5BOL A; 1MQ2 A; 2E1E A; 5D49 A; 4EX6 A; 3QEA Z; 5AK5 A; 1JIH A; 1RZT A; 3WK7 A; 2EAM A; 5JU5 A; 3G6V A; 5K4L A; 4FBU A; 1DGJ A; 3RJJ A; 2R8I A; 3QUQ A; 4UBB A; 3PW7 A; 5HR6 A; 2KHV A; 4UBC A; 3RRH A; 2HOF A; 3QU5 A; 5DG7 A; 9ICH A; 3PNC A; 2YB1 A; 5KFV A; 3BS5 B; 2OH2 A; 2YMM A; 5KG3 A; 4U6P A; 3R9K A; 1WWU A; 4Q43 A; 3SAH A; 9ICM A; 4TQR A; 4MEY A; 1XNS A; 2OXO A; 4QZB A; 5HMM A; 4O3S A; 3OGU A; 1QTM A; 1HIW A; 1ZD2 P; 1Z1B A; 2PKE A; 3EW9 A; 2W3S A; 3ZD8 A; 3ISD A; 5KT7 A; 4RUC A; 5ALZ A; 4DLG A; 3CNH A; 3UQ0 A; 4RQN A; 3QZ7 A; 3MFH A; 2QAR A; 2AU0 A; 2DF4 B; 3B9J A; 4DF4 A; 4DS5 A; 4YN4 A; 4EZ6 A; 4BXO A; 3QX7 A; 2BDU A; 9ICC A; 1JRO A; 4DWI A; 4GXJ A; 2B6G A; 4YCX A; 2HBL A; 1D9F A; 2LYB A; 3WK5 A; 5EOZ A; 1ZQF A; 3RTV A; 2XY5 A; 1S76 D; 5AKH A; 4ELU A; 4OD0 A; 4QZG A; 5KNI A; 1SV4 A; 1PVR A; 3Q8R B; 1RYR A; 4F50 A; 3F53 A; 4JWM A; 4UW9 A; 4I2D A; 8ICO A; 4DSI A; 5KFF A; 4BX9 C; 5J8Y C; 1NI3 A; 2E8P A; 2WHE A; 3WKD A; 4ECZ A; 8ICZ A; 5J2B A; 9ICS A; 4BUG A; 2JEI A; 2D3D A; 2AJQ A; 2JR5 A; 4KLU A; 3AMZ A; 4UAY A; 3K1Z A; 1FEZ A; 2Q0Z X; 2JMG A; 2K89 A; 1U4B A; 3BDP A; 3PV8 A; 4PGX A; 4OO1 J; 8ICX A; 2C22 A; 5F9N A; 4PZN A; 3RB4 A; 4Y2V A; 5J2F A; 4EYI B; 2W7P A; 5AI6 A; 4QWB A; 4MHV A; 2WF9 A; 4DOC A; 4M9L A; 5L1J A; 4CDG A; 4RNM A; 1KRP A; 1ZXI A; 3BQT A; 5KFP A; 3PX0 A; 4PH5 A; 2KTQ A; 2GH1 A; 3KFU F; 4C8O A; 1ZQJ A; 5G5G A; 3NTU A; 5KL1 B; 1T3N A; 4QZC A; 3PX4 A; 1ZD3 A; 3HKZ F; 2Y1J A; 1BPY A; 1ZRM A; 1MQ3 A; 2G09 A; 2EDU A; 5ALN A; 4Z6E A; 1S0M A; 1XWL A; 1WWV A; 4UAZ A; 5KT2 A; 7ICQ A; 1N5X A; 2HSZ A; 5EE9 A; 3WKE A; 1UCV A; 4GLX A; 2IOF A; 2Y9U A; 4R65 A; 3RJK A; 4M9H A; 2R18 A; 2H3Z A; 1XSL A; 3LVV A; 2V4Q A; 3H4B A; 9ICB A; 2EZX A; 3KZI U; 5EWE A; 4F3O A; 4OCZ A; 3JPR A; 4M9N A; 4OJO A; 4KLJ A; 1BGX T; 2PI5 A; 4P0Q B; 3HIL A; 4RT3 A; 4CRX A; 3MGH A; 7ICP A; 3SR6 A; 5AKI A; 4I27 A; 4JB3 A; 3O0F A; 4M6W A; 2W9B A; 5CR0 A; 3V6J A; 1KL9 A; 3LK9 A; 1D8Y A; 1JUD A; 4O9M A; 2KSO A; 4KIT B; 1Z4N A; 2I9G A; 5AM0 A; 2HW3 A; 2EQY A; 3UXP A; 1CEZ A; 2AH5 A; 9ICP A; 4RQ5 A; 3C1Z A; 4DEZ A; 2BDP A; 3QU9 A; 5AM2 A; 1QQ6 A; 3ETL A; 4ACO A; 1C7Y A; 2W55 A; 3WK8 A; 3QZ8 A; 2F3N A; 4ECU A; 2HMX A; 2WF6 A; 2GWS A; 3MAB A; 1X6J A; 3GZF A; 4LVS A; 4O3M A; 2WFA A; 2WAQ C; 3WK6 A; 3WU2 U; 1LVH A; 1PVP A; 4FZM A; 4NM2 A; 2KNJ A; 2EAO A; 4ED7 A; 4C80 A; 4FFD A; 5J0X A; 5ALT A; 1WCN A; 1UQV A; 2A1J B; 3OSP A; 1N61 A; 2FPK A; 1RYS A; 2G0A A; 3K1R B; 4ED2 A; 5ALQ A; 4P4O A; 1LKY A; 4YD2 A; 3T5K A; 3M6K A; 4B6J A; 1T3Q A; 2JXJ A; 3UPQ A; 5DKW A; 1CRX A; 1PZN A; 1FFV A; 2BQ3 A; 4YR2 A; 2BKE A; 4UAT A; 4PZO A; 1S0O A; 1RPL A; 4M9J A; 2B21 A; 4IQV A; 1KFS A; 4Q8F A; 1CUK A; 4Z6C A; 4F4X A; 2BQR A; 2G07 A; 2ZIU A; 4EYH B; 1RDF A; 1SXD A; 4G3I A; 3KHH A; 4J9N A; 5GTH U; 2AHO B; 1MA7 A; 3M7D A; 5AIA A; 4P0P A; 3M8R A; 2BPC A; 1TVA A; 3SAG A; 3C29 A; 4DL5 A; 3JPO A; 3PW5 A; 8ICE A; 9ICI A; 4US9 A; 3GIM A; 4NLC A; 4NLN A; 3RB3 A; 4K4I A; 3RH5 A; 7ICH A; 1KDH A; 4B9S A; 5KFS A; 1SV0 A; 2KVC A; 3SI8 A; 4R64 A; 2PFP A; 2LBO A; 1VJ5 A; 2R8J A; 2W9A A; 2Y1I A; 1UHU A; 2YB4 A; 3T5H A; 1S8O A; 3KHG A; 5KTQ A; 1RYU A; 1DK3 A; 1ZQK A; 3H8S A; 3M1Y A; 2F1J A; 1FIQ A; 3L5K A; 1ZD4 A; 2FPL A; 3H8J A; 2NYV A; 3M9N B; 2AGQ A; 2ZUD A; 5L1M A; 5AK3 A; 2EAP A; 3C21 A; 5J2E A; 1JAL A; 2PMZ F; 3OJU A; 3RBD A; 4KLD A; 1COK A; 2ZIV A; 3SEN A; 4KLL A; 1J2N A; 3PW4 A; 4IRK A; 3U26 A; 2JEF A; 4GFJ A; 3DEE A; 3UMC A; 2AXT U; 1Q3U A; 4CF3 A; 2M9N A; 3ZI4 A; 1IG6 A; 1SZP A; 3RAQ A; 1ZQD A; 2OCE A; 4Y2Y A; 2XO7 A; 4KLS A; 5EE1 A; 5J0W A; 2YN4 A; 1L3T A; 1JXE A; 2W43 A; 1NKE A; 1Z00 B; 2DGZ A; 1NJX A; 5DQH A; 4JWN A; 4NY8 A; 1ZQX A; 4K4G A; 1SWW A; 5J0S A; 2DWQ A; 5J2C A; 3IN5 A; 2FDR A; 3LWM A; 3EPI A; 4F2R A; 5AKK A; 3I1Y A; 2D6F C; 3HKZ C; 4I2A A; 4ECS A; 2CRX A; 1OXJ A; 5J0P A; 2P6R A; 1ZQZ A; 3Q8L A; 1Z4O A; 3PSI A; 2IA6 A; 1DRG A; 3D6J A; 5ALH A; 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3TKA A; 5KFD A; 1SXE A; 3AM9 A; 4BWM A; 3H7I A; 4RQ8 A; 1JI7 A; 2DPJ A; 3ONN A; 3HT3 A; 2OHF A; 3E58 A; 2QAR B; 3N7R C; 3BZK A; 3GFK B; 1M6Y A; 4IQU A; 1L7P A; 5AKG A; 1MN8 A; 3OJS A; 2WF7 A; 3NUQ A; 2BPG A; 4DCC A; 2LMR A; 1B22 A; 3SZ2 A; 1L3V A; 4Q44 A; 4R8U B; 1KEJ A; 5KFB A; 4MF8 A; 1L7O A; 4C8M A; 5H2F U; 3V7J A; 4RU9 A; 1NKB A; 4QWD A; 4XUS A; 4KX5 A; 5DBA A; 3GIK A; 3KHR A; 1ZQM A; 1BNP A; 1X2I A; 3FDS A; 4DSF A; 2D8C A; 2GO7 A; 2ZTC A; 3EUB 2; 4NXZ A; 3D2N A; 1N60 A; 1T7P A; 1OW5 A; 5AKY A; 1ZET A; 3B0X A; 1HUO A; 1SKS A; 7ICT A; 3GQC A; 1JX4 A; 1ZQY A; 4F92 B; 3C2M A; 1K1S A; 4QJF B; 4O3P A; 1U49 A; 3EZ5 A; 1SL1 A; 3BS7 A; 5J0T A; 1B0X A; 2LM4 A; 1O03 A; 4O3Q A; 2BR0 A; 2BQU A; 3KBB A; 2XCA A; 4YMN A; 2PMZ C; 5DB7 A; 5ALX A; 2KP7 A; 1JRP A; 4I2J A; 5ALK A; 1L7N A; 3I28 A; 1BPB A; 4CF4 A; 4YQW A; 2RHF A; 4KLH A; 4QZD A; 4MEX A; 1U47 A; 4KLI A; 2VA2 A; 4IRC A; 3NS1 A; 3PX6 A; 3H0R B; 7ICI A; 3MR6 A; 4UAS A; 5AI9 A; 2DPI A; 2DKX A; 4F5R A; 4U7C A; 2KOB A; 3RJI A; 9ICR A; 3C23 A; 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