The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
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sequence length |
66
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structure length |
66
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Chain Sequence |
KYDWFEFFLNCGVDVSNCQRYTINFDREQLTEDMMPDINNSMLRTLGLREGDIVRVMKHLDKKFGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Regulation of clathrin adaptor function in endocytosis: novel role for the SAM domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Endocytosis
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| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| molecule keywords |
Actin cytoskeleton-regulatory complex protein SLA1
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| total genus |
27
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| structure length |
66
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| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-07-21 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3BQ7 A; 4IS7 A; 1SV0 C; 4PZN A; 2KG5 A; 5J8Y C; 5JTI A; 1SGG A; 2KMD A; 1OW5 A; 2QKQ A; 2ES6 A; 3K1R B; 4MHV A; 1PK1 A; 1X9X A; 1B0X A; 2QAR A; 1KW4 A; 1DXS A; 5KNI A; 2EAO A; 2KSO B; 2DKX A; 1Z1V A; 2DL0 A; 3HIL A; 1LKY B; 1V38 A; 2E8N A; 2L5Y A; 2D3D A; 4PZO A; 3TAD A; 2LMR A; 2GLE A; 2ESE A; 2LPE A; 2KIV A; 2E8P A; 3KKA A; 2EAM A; 5JRT A; 4NL9 A; 1OXJ A; 1V85 A; 3BS5 B; 2F44 A; 3SEN A; 1X66 A; 2QB0 B; 1SXE A; 5F3X B; 2E8O A; 2KE7 A; 2K60 A; 1WWU A; 1F0M A; 1SV0 A; 3H8M A; 1PK3 A; 1UQV A; 4NL9 C; 3TAC B; 2EAP A; 5J8Y A; 1UCV A; 1X40 A; 2D8C A; 4NJ8 A; 5JU5 A; 1B4F A; 2K4P A; 1RG6 A; 2JV3 A; 2Y9U A; 3SEI A; 2B6G A; 2FE9 A; 3BS5 A; 1JI7 A; 2YTU A; 2QB1 A; 2DKZ A; 5L1M A; 3TAD C; 2QB0 A; 2KSO A; 2F3N A; 3KKA C; 3IDW A; 2EAN A; 1SV4 A; 2F8K A; 1LKY A; 1PK1 B; 3BS7 A; 2QAR B; 1SXD A; 2Y9T A; 1COK A; 4RQM A; 1WWV A; 4RQN A; 2E8M A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2F76 X; 1X42 A; 1IXR A; 3RJF A; 3OSN A; 4JV2 A; 1RYU A; 4FE3 A; 2ES6 A; 4EBE A; 4DS5 A; 2IOH A; 2AGQ A; 2RDJ A; 3SAF A; 4RPY A; 1ZQC A; 1S77 D; 4Y2S A; 5C5J A; 1RXV A; 2KSO B; 3JPP A; 5J2B A; 4CDG A; 3AU6 A; 1ZQF A; 2NRZ A; 1Z1V A; 5AK4 A; 3HJE A; 5KFF A; 2DPJ A; 1T3Q A; 4YFK A; 2K4I A; 2KIV A; 9ICM A; 5JRT A; 5ALW A; 1ZD3 A; 2N1R A; 4DQI A; 5KG1 A; 1UA1 A; 3GV5 B; 1HUZ A; 3ED5 A; 1SB3 C; 3N7P D; 4PHD A; 4Q8F A; 3CW2 C; 3TAP A; 2ZIU A; 1Z3E B; 3RFA A; 4UB2 A; 5IIN A; 4RT3 A; 3D2Q A; 4J9L A; 2P6U A; 3IHQ B; 2FLN A; 5KFY A; 3RR8 A; 2KFZ A; 2ISO A; 2BDU A; 2OXO A; 1J2N A; 7ICH A; 3GU3 A; 2FDR A; 2K4P A; 3Q8L A; 2H3I A; 4C8K A; 4DSI A; 4FBU A; 3M8R A; 5AHX A; 1XSL A; 3C1Y A; 4QZG A; 1NK4 A; 4I2J A; 8ICB A; 3U26 A; 1IM4 A; 4NM1 A; 2IOF K; 1AQ6 A; 2LYA A; 4OJP A; 1HIW A; 1BPX A; 1VDV A; 4Z6D A; 2UVW A; 4CRX A; 2AGO A; 4CGZ A; 9ICH A; 2JH7 A; 4RQ7 A; 2MRL A; 5J0Q A; 4ECV A; 3RF9 A; 5DB7 A; 2JGA A; 5J8Y C; 1XSP A; 4M47 A; 4F93 B; 4PPX A; 5ALQ A; 1OW5 A; 2KKV A; 4F4K A; 3PW2 A; 4GFJ A; 2WAQ F; 5KG4 A; 1JRO A; 5J0T A; 3PZP A; 1DGS A; 4FZM A; 3GIM A; 3Q8S B; 3IRU A; 5AKZ A; 4QZ8 A; 1SIJ A; 1S0O A; 1QCK A; 5DGA A; 5KFU A; 1XS9 D; 5IIM A; 5HML A; 5DQI A; 2ZIU B; 4KLQ A; 2IOF A; 4EYH B; 4DFD A; 4KLD A; 3OJS A; 2LMR A; 4XUS A; 3MR2 A; 2MAX A; 4DOA A; 9ICW A; 2GO7 A; 4ED8 A; 3OGU A; 4IQT A; 1X66 A; 4JB3 A; 3D6J A; 4JWN A; 5AI8 A; 4NLG A; 5F3X B; 8ICN A; 2C2R A; 4R66 A; 4C4T A; 4KLG A; 4EBD A; 1NK0 A; 2V4R A; 3PW7 A; 5HR6 A; 4KLM A; 4DSJ A; 4KIT B; 2DGZ A; 4NJ8 A; 1S0V A; 4ZOH C; 3I1Y A; 1UPH A; 5TIS U; 5ALK A; 2ASL A; 1SZH A; 1ZQJ A; 3V6K A; 2C2E A; 1YZ6 A; 2QB1 A; 5KG2 A; 1NKC A; 4PGX A; 2CN1 A; 1TAU A; 3KFU F; 1UT5 A; 5ALI A; 4QWC A; 2D6F C; 4I2A A; 4PHE A; 3BZK A; 2Y9T A; 3C5G A; 3RBD A; 4RQM A; 1V97 A; 2E8M A; 2RDI A; 1NNL A; 3NVZ A; 5DB9 A; 4K4H A; 2H3F A; 1LV5 A; 2Y0S C; 5KFC A; 1SZP A; 3PST A; 3FM9 A; 8ICF A; 9ICL A; 4J9P A; 2NRW A; 2QKQ A; 5ALP A; 5ALM A; 5J0O A; 7ICQ A; 3RB4 A; 3I28 A; 1T94 A; 5AKI A; 1QQ5 A; 5GTI U; 1SWW A; 2OH2 A; 1PVR A; 2LHT A; 2PFN A; 1X9M A; 2HOI A; 2W54 A; 3RRG A; 4IR9 A; 5IIK A; 1JMS A; 4OJL A; 3PY8 A; 3FAH A; 2BDP A; 3ZDE A; 5L1K A; 2BCU A; 3PX4 A; 2HBM A; 1ZQS A; 4M6W A; 4F4W A; 4GXJ A; 1S5L U; 3T5H A; 2VA3 A; 1D8Y A; 5CHG A; 3TKA A; 1ARO P; 5EWE A; 2I1Q A; 5DBC A; 1QQ7 A; 3OPX A; 1N61 A; 3JPN A; 2PKE A; 5ALG A; 1SWV A; 3EPG A; 3H8W A; 2EAP A; 4F8R A; 3AUO A; 4UBC A; 1F5S A; 2G07 A; 1ZD2 P; 1SKR A; 2R8K A; 2KJ5 A; 3SD7 A; 2GOL A; 1URJ A; 4F4Y A; 5E79 U; 5J2D A; 3SV4 A; 2ZUB A; 5F9L A; 2DPI A; 2CRX A; 1KKX A; 3KBB A; 2NRT A; 5J2C A; 3A0B U; 4QZ9 A; 5D49 A; 4NLB A; 3B9J A; 4P4P A; 1ZQ1 C; 1ZD4 A; 3QZ7 A; 1JXE A; 4MFA A; 5AKY A; 2BQU A; 1Z19 A; 3AM9 A; 3GDX A; 4J9K A; 5BOM A; 3HRD D; 2JEG A; 2WF7 A; 3N7S C; 5J0X A; 2F77 X; 4OD0 A; 4QZI A; 3JPQ A; 1TE2 A; 2NO5 A; 3M9O B; 4BWJ A; 5KG0 A; 4I2I A; 5J2K A; 4M6W B; 1ZQL A; 5KTQ A; 1UT8 A; 3N7R C; 2HMX A; 3V7L A; 4KX5 A; 5AIC A; 4C7Z A; 3H0R B; 4I2E A; 4ECQ A; 3HT3 A; 1XNS A; 1SL0 A; 4FO6 A; 3QU9 A; 7ICK A; 3MGH A; 9ICU A; 1KLN A; 2Y1I A; 2HHT A; 1L3V A; 3ALR A; 3C1Z A; 4ACO A; 1BPY A; 1KQQ A; 2DF4 B; 2H3V A; 3V7K A; 4RNO A; 2V9W A; 3PML A; 1KDH A; 3SI8 A; 5KFX A; 3LVW A; 5EOZ A; 5DQG A; 1N62 A; 4NL9 C; 1NKE A; 3PO4 A; 3K4G A; 5ALD A; 9ICK A; 9ICG A; 2GWS A; 1BNP A; 2EZY A; 2DBY A; 4YXJ A; 2PI5 A; 3HPO A; 4ICA A; 3CYM A; 2JEJ A; 2E5S A; 4M9H A; 3AU2 A; 4UAW A; 3RH5 A; 2F1I A; 4RQ8 A; 4PHP A; 1P7D A; 4EX7 A; 2HDO A; 1LKY A; 2KFN A; 5AKE A; 4KLU A; 5CA7 A; 1ED1 A; 2YMM A; 1U48 A; 4DOC A; 4YMN A; 5KFW A; 4LVS A; 4MEY A; 2R8H A; 2FJ6 A; 2M0N A; 3RTV A; 4DS4 A; 1ZYQ A; 1N63 A; 2W03 A; 3ISC A; 5KAI U; 2EQY A; 5AKJ A; 2OEH A; 4NLK A; 3KOO A; 1BPE A; 2UVU A; 4F2R A; 2WF5 A; 1HEK A; 4J9N A; 3C5F A; 5J2A A; 3NVV A; 2BCR A; 2OM6 A; 4DEZ A; 2YML A; 1NK6 A; 4ED3 A; 1ZRM A; 4QNL A; 2KV2 A; 4F92 B; 1YZ7 A; 4O5C A; 3HIL A; 1FFV A; 5DDY A; 4F71 A; 3QU2 A; 5L1L A; 2VAN A; 1NK7 A; 3O0F A; 4AYB F; 4FZN A; 4C4R A; 4Y2Y A; 3SAH A; 2HHS A; 4USA A; 2K4H A; 1TAM A; 1ZQI A; 5AIB A; 4JUZ A; 2WTF A; 1F44 A; 9ICX A; 2KIC A; 1ZQO A; 3JPS A; 1K5O A; 1Z4O A; 4BGD A; 4IRD A; 1WCL A; 8ICT A; 4RQ4 A; 2R18 A; 5CEH A; 3N4M B; 2BPG A; 1Z00 B; 1F0M A; 2NRX A; 3ETL A; 1H38 A; 2W9B A; 3ONN A; 2M9N A; 5J0P A; 1QLN A; 2W8K A; 9ICT A; 1WCN A; 3QXG A; 2XC9 A; 3KD3 A; 1X2I A; 1T3N A; 4M9G A; 3LWM A; 4DSF A; 4G9B A; 1X40 A; 1ZQK A; 2IHN A; 3KHH A; 3M9N B; 4J9M A; 5ALL A; 1TAQ A; 2JV3 A; 3GZF A; 4PHA A; 4GXI A; 4FZL A; 4QZH A; 3MGV A; 2A19 A; 2YTU A; 4MEX A; 3HP6 A; 7ICV A; 2KSO A; 3AEV A; 1KL9 A; 3BJY A; 2HVI A; 3IDW A; 3EW9 A; 1MN8 A; 4DQQ A; 3G6Y A; 8ICQ A; 3V6H A; 1CUK A; 4I28 A; 2KZM A; 2OHF A; 9ICR A; 3KHL A; 1UA0 A; 2JH1 A; 3PSP A; 3PVX A; 4J03 A; 3ICX A; 3ZDD A; 4QZE A; 3H4D A; 5CJ7 A; 4M04 A; 2A1A A; 2DWQ A; 3EPI A; 1S8O A; 4UBB A; 2WAQ C; 5T14 A; 1KRP A; 1ZD5 A; 2BCQ A; 3K1R B; 4B9U A; 2V4Q A; 2WF6 A; 2JEF A; 7ICT A; 2KP7 A; 4JV1 A; 3PV8 A; 9ICA A; 2YMP A; 2BQR A; 2Q0Z X; 2KJ9 A; 4YVZ A; 5DGB A; 9ICB A; 4IQU A; 2W9B B; 1ZQD A; 3SYZ A; 4FS2 A; 2YB4 A; 4Y2X A; 3ZD9 A; 5CP2 A; 4J9S A; 5IIO A; 4UW9 A; 3HWT A; 1KN5 A; 4O3P A; 4KLT A; 2K8C B; 7ICS A; 4KLI A; 1PZN A; 5KFJ A; 5J2E A; 2ATL A; 5TZV A; 1V85 A; 4QJF B; 5J2J A; 7ICI A; 4EEY A; 3UMG A; 4QZC A; 2K4E A; 3T5K A; 4ECR A; 4WJ3 B; 3FDS A; 5F9N A; 1WWU A; 5KFE A; 4G3I A; 1DRG A; 4I2C A; 3TAC B; 3MR6 A; 4CNQ A; 2HVH A; 2JZB A; 4QWD A; 4MFF A; 1ZQV A; 5KFT A; 4O3M A; 1D8L A; 2PFP A; 3PSI A; 7ICU A; 3C2M A; 1ZQP A; 3HX0 A; 2QB0 A; 2RP5 A; 1BGX T; 4TUP A; 3PMN A; 2W7P A; 5J2H A; 4B9T A; 4CE6 A; 5KFZ A; 1ZQX A; 2PXI A; 3MDC A; 1ZQZ A; 1BVS A; 4Z6C A; 3JPO A; 5KFP A; 5G5G A; 4LZD A; 5ALH A; 9ICS A; 1A77 A; 4CF3 A; 3UXN A; 1L8O A; 2HW3 A; 2YX8 A; 1FIQ A; 4YP3 A; 5DQH A; 2HBL A; 5CB1 A; 5KAF U; 3R9K A; 3QEA Z; 3OHB A; 1DXS A; 1RYR A; 2XIC A; 2UVV A; 1WUD A; 4NV0 A; 3SR6 A; 2LKY A; 3ISB A; 4RU9 A; 2W7O A; 3IG8 A; 2P66 A; 5J29 A; 2R8G A; 2JZB B; 5HMM A; 3Q8Q B; 2AHO B; 1QQ6 A; 5ALE A; 4EYI B; 3T79 A; 4TUR A; 5KT5 A; 2EAM A; 1J97 A; 1KFD A; 5KT4 A; 2FI1 A; 4QWB A; 4B9V A; 7ICP A; 4NL9 A; 4Y2R A; 2R8J A; 2WHE A; 2QB0 B; 1A6S A; 4QZD A; 2CXY A; 2I9G A; 4F91 B; 3THV A; 2RQ5 A; 8ICA A; 1SV0 A; 1DGJ A; 4AP9 A; 3MBY A; 2UVR A; 2HHQ A; 4EEN A; 4EBC A; 1UQV A; 4YN4 A; 4O3O A; 1ZQW A; 8ICC A; 2D8C A; 2BKE A; 3F2D A; 2B21 A; 4J9Q A; 3PR5 B; 3WKE A; 8ICL A; 1ZQH A; 1JIH A; 2G5H B; 1PVP A; 4NXZ A; 5KFG A; 4LZG A; 5J2F A; 2KIW A; 1CRX A; 2ASJ A; 3PO5 A; 4I2D A; 1A0P A; 1JXL A; 4IRC A; 3BQ7 A; 1MSW D; 4OCZ A; 2KG5 A; 3SQI A; 2G0A A; 3QEB Z; 4Y2T A; 1SGG A; 4DLG A; 4XA5 A; 4F2S A; 1NK5 A; 5A0L A; 4RQ2 A; 1KSP A; 2KHQ A; 2AQ0 A; 2EDU A; 4JV0 A; 4DFM A; 4DO9 A; 3QX7 A; 2MA1 A; 2ZIV B; 4I27 A; 1UHU A; 2ISP A; 4MFC A; 3RH4 A; 2FPK A; 2DKX A; 5AM4 A; 5EWF A; 2MSN A; 4KN7 A; 4DWI A; 1NOM A; 4NM2 A; 1ZQN A; 3NVY A; 8ICI A; 2FMQ A; 4P0Q A; 3KZX A; 2XI9 A; 2HOQ A; 4O5K A; 2LYB A; 3L3F X; 5ALT A; 2HBJ A; 4F3O A; 3A0H U; 2HBK A; 5KFH A; 2WF8 A; 2E8O A; 8ICZ A; 1TV9 A; 4RQ1 A; 3OTQ A; 1L7N A; 3NS1 A; 9ICP A; 3JPT A; 1QSY A; 5JU5 A; 1U47 A; 4DFJ A; 3BS5 A; 4B9L A; 3WKD A; 5AM3 A; 4DQR A; 5L1M A; 3UQ0 A; 1GO3 F; 5AM1 A; 2W3R A; 2KOB A; 1X9S A; 4ECZ A; 4NLN A; 3K75 D; 3GII A; 2E3T A; 5KFA A; 4KX3 A; 4RUA A; 1T8E A; 3C2K A; 1WWV A; 3ZDB A; 3UXP A; 1SL2 A; 4IC9 A; 3T5L A; 2BR0 A; 5KT3 A; 3WKB A; 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2G08 A; 3BQT A; 2OWO A; 2ZTD A; 2L5Y A; 8ICY A; 4CCH A; 3G6X A; 3TAD A; 2ESE A; 1BNO A; 4ECU A; 4RQ0 A; 3LDA A; 1X9W A; 2ZUC A; 1SL1 A; 3RRH A; 3N28 A; 3PR4 A; 4UAR A; 3GIJ A; 3BQ1 A; 4M9N A; 3C29 A; 4F5Q A; 1L7O A; 3E0F A; 4UAY A; 1C7Y A; 4KLJ A; 1J2M A; 4QW8 A; 5DLF A; 1S9F A; 1ZQY A; 3UXO A; 4M9L A; 3H0L B; 2K8B B; 2KZ3 A; 5ALZ A; 3H4B A; 4ED6 A; 8ICJ A; 4DSK A; 2XCP A; 2VIX A; 2BQ3 A; 5KFI A; 4IQW A; 4I2B A; 4QWE A; 4EZ6 A; 4UB5 A; 5KG7 A; 4YMO A; 3UQ2 A; 4YG2 A; 2KD1 A; 3TAQ A; 1D8B A; 3QU5 A; 4I2G A; 2HHU A; 1VJ5 A; 2HCF A; 4UB8 U; 2YN4 A; 5AK6 A; 5CR0 A; 3SV3 A; 2EZZ A; 5L1I A; 3GFK B; 4O0I A; 7ICR A; 2C28 A; 4Q45 A; 3VC8 A; 1NI3 A; 3GQC A; 3M8S A; 3TFR A; 4P2H A; 5G5H A; 4UAT A; 5AIA A; 2IMW P; 2ZJ8 A; 3IV6 A; 4US9 A; 2XY5 A; 3AQE A; 2PFQ A; 1S0M A; 3KHR A; 1C20 A; 4DSL A; 7ICL A; 2JXJ A; 4Z6E A; 4MHV A; 3BDP A; 2LBO A; 2ZIW A; 7ICJ A; 1B0X A; 3H8S A; 2NYV A; 2QAR A; 5KFR A; 1O03 A; 2ZJ5 A; 2ZTC A; 5J0W A; 2FPL A; 2E1F A; 5GTH U; 4Q43 A; 5EE0 A; 4DL6 A; 4EEL A; 3PW5 A; 1A76 A; 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