The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
82
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structure length |
82
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Chain Sequence |
ACQEANYGALLRELCLTQFQVDMEAVGETLWCDWGRTIRSYRELADCTWHMAEKLGCFWPNAEVDRFFLAVHGRYFRSCPIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of the Ectodomain Complex of the CGRP Receptor, a Class-B GPCR, Reveals the Site of Drug Antagonism.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Membrane protein
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor
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| total genus |
29
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| structure length |
82
|
| sequence length |
82
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-05-27 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3N7R C; 3AQF A; 3N7S C; 2XVT A; 3AQE A; 2YX8 A; 3N7P D; #chains in the Genus database with same CATH topology 1PK3 A; 5DGA A; 5AI0 A; 3KHH A; 4RQ5 A; 4YD1 A; 2W54 A; 3RB4 A; 3JPS A; 1SGG A; 5G5G A; 2K60 A; 1XSP A; 5AKX A; 3PW7 A; 4MHV A; 5KAI U; 2ZG6 A; 2IOF A; 2MRL A; 2V4R A; 2DKZ A; 2IHN A; 4C8L A; 2C22 A; 4YFK A; 2ZIU B; 4K4I A; 4DFD A; 5KT2 A; 2I9G A; 3WK5 A; 5ALZ A; 5J0P A; 1NJX A; 2GLE A; 5ALQ A; 4YR3 A; 1ZOL A; 3L3F X; 2PMZ C; 5DBA A; 3SAG A; 2W8K A; 3DEE A; 3LVV A; 4YQW A; 2W7P A; 3MDA A; 1KSP A; 1A77 A; 4QW8 A; 4F93 B; 4I2B A; 4DLE A; 1X9S A; 1DOQ A; 4PHE A; 5KL8 B; 3UPQ A; 2HOF A; 2B21 A; 1UT5 A; 4DOC A; 5AKK A; 4YXJ A; 4BX9 C; 1COO A; 1S0V A; 1RG6 A; 3QUQ A; 5ALH A; 2NYV A; 3UQ2 A; 5ALU A; 5AKJ A; 5ALM A; 2EH9 A; 4DOA A; 2HHQ A; 4O3N A; 2PI4 A; 1DGS A; 3HKZ F; 1S8O A; 1U47 A; 3MGH A; 1U45 A; 2W55 A; 5ALO A; 3AEV A; 4O3P A; 2DL0 A; 1P7D A; 3KZI U; 2C2R A; 2HW3 A; 3OPX A; 2G06 A; 4DQP A; 1UA1 A; 7ICL A; 2E3T A; 2WF9 A; 3JPN A; 4F5R A; 4ZH4 A; 4Z6F A; 4Y2T A; 4ED2 A; 3AUO A; 1ZQZ A; 3ZDD A; 5KFO A; 3M6Z A; 3ZDC A; 4I2J A; 5TIS U; 5KTQ A; 4FZM A; 1XO0 A; 5AIC A; 5AIB A; 3QUT A; 2KJ8 A; 5J0Y A; 1N56 A; 3H4B A; 4KLH A; 5J0R A; 3PVX A; 1N48 A; 2BPF A; 1UT8 A; 3WKE A; 4YR0 A; 4DSJ A; 1PVQ A; 4ECY A; 4FBT A; 4I2G A; 4NLC A; 3NVY A; 3OHB A; 4KLO A; 1ZXI A; 1TKD A; 2W11 A; 3QNM A; 4J03 A; 1ZQP A; 2F8K A; 4OO1 J; 2ZUD A; 1N5X A; 4MFC A; 2BPG A; 2E8N A; 3V7L A; 1MC8 A; 5ALG A; 4DS5 A; 4O3R A; 4EEK A; 3RRG A; 5AHX A; 2HVI A; 3G6Y A; 9ICH A; 3BZK A; 5JU5 A; 1IXR A; 5C0Y A; 2A1J A; 4R64 A; 5EOZ A; 3MR6 A; 2BZF A; 1WG8 A; 3MFH A; 5KT5 A; 4EYI B; 3C2K A; 2E8O A; 1QH9 A; 1N2X A; 3FM9 A; 1SL1 A; 1SZH A; 5ALD A; 2BCU A; 4RUA A; 4J9N A; 1J2N A; 3L4P A; 2FLP A; 4NLG A; 1N63 A; 2HHT A; 4JK1 A; 4AP9 A; 5ALX A; 5HML A; 3SYZ A; 3HJE A; 1SL0 A; 4BXO A; 3PW4 A; 4I2F A; 4YMO A; 2JMG A; 1WYG A; 1SWW A; 1DK3 A; 2JHD A; 9ICX A; 5AM0 A; 3E2E A; 3UXO A; 2M0N A; 2ZXH A; 5J2G A; 5EE1 A; 2LMR A; 9ICC A; 5KFJ A; 5KFL A; 4M9N A; 5ALR A; 1QSL A; 5ALY A; 7ICE A; 1OW5 A; 9ICU A; 2A3V A; 1SXD A; 5J8Y A; 1NI3 A; 3BJY A; 5DG7 A; 4EYH B; 3M6K A; 5CWR A; 1KTQ A; 1KBU A; 2LM1 A; 5KFU A; 4ECW A; 9ICE A; 4QIW C; 3PNC A; 5KFN A; 3LWM A; 3NRW A; 4P4M A; 4DOB A; 2KEY A; 1D8Y A; 2LYB A; 7ICS A; 3WK9 A; 2BGW A; 8ICY A; 1L8O A; 5AKL A; 5AM1 A; 2KV2 A; 3M8S A; 3BQ1 A; 4Y2Y A; 2LBO A; 1BPB A; 2YMP A; 5DKW A; 1Z00 A; 2OCE A; 1FEZ A; 2BCQ A; 4ECQ A; 4ELT A; 3RJE A; 4A8E A; 3V7J A; 1NK4 A; 2FPK A; 4O3O A; 2FMQ A; 1PK1 A; 3C5F A; 4RQ7 A; 2HDO A; 4M2Y A; 2WHE A; 1ZQF A; 2A1J B; 4RQ1 A; 2W3R A; 9ICL A; 3PX6 A; 3ISD A; 4FS1 A; 8ICE A; 1VLB A; 4Y2S A; 1J97 A; 2YQE A; 1ZQY A; 4NV0 A; 3J81 j; 5FP0 A; 2IBK A; 4MF2 A; 3HPO A; 3SV4 A; 1S5L U; 4C8O A; 3PV8 A; 2ZTE A; 2G07 A; 1TV9 A; 9ICJ A; 4QWE A; 4RNN A; 4Z6D A; 4ED3 A; 1QSS A; 4NLB A; 3RJG A; 1EXN A; 4KLI A; 5KT4 A; 4BXO B; 2AGP A; 1S10 A; 2VA8 A; 2RDI A; 2H3V A; 4QNL A; 2UVV A; 2KJ5 A; 1SZP A; 4UB4 A; 1XSN A; 5BOL A; 4UAU A; 4USA A; 4ECX A; 2WF8 A; 2QAR A; 5J0W A; 4QWB A; 1KRP A; 8ICH A; 3KTQ A; 7ICN A; 3NTU A; 4B9N A; 2F1J A; 8ICK A; 4I2E A; 1V85 A; 4NM1 A; 5J0T A; 1T7P A; 4M47 A; 5J2F A; 1A76 A; 1T4G A; 5CR0 A; 1D9D A; 2J6U A; 5KFS A; 1N5W A; 2ISO A; 3H4D A; 5KT7 A; 5J2D A; 3IHQ B; 3WU2 U; 5ALW A; 2JGA A; 2Y1J A; 1L7N A; 1NOM A; 4OJP A; 9ICI A; 8ICR A; 1X9M A; 3GZF A; 3C2M A; 4DS4 A; 2P35 A; 4UBC A; 3CW2 C; 4ECR A; 9ICQ A; 2E8M A; 2BDP A; 3HWT A; 3F5A A; 2VKQ A; 3D2Q A; 3EW9 A; 1B22 A; 4J9S A; 5CJ7 A; 4DL5 A; 3L5K A; 3ZD8 A; 2LM4 A; 5KFB A; 5TZV A; 2AQ4 A; 3N7P D; 2A19 A; 1L5U A; 4RZR A; 5KFY A; 3ZDA A; 3MC1 A; 2HHS A; 4ECS A; 3T3F A; 2KOB A; 5AKE A; 3GV8 B; 3A0H U; 2RP5 A; 4U7C A; 1COK A; 2DFL A; 4DWI A; 1U49 A; 2YML A; 1MQ3 A; 2MSN A; 1B4F A; 5B66 U; 5KG1 A; 3TQ1 A; 1PK1 B; 2HBK A; 2JEG A; 9ICN A; 1ZQL A; 1JI7 A; 5DG8 A; 5HR6 A; 2XO7 A; 4KLS A; 2XY6 A; 3QU9 A; 4OJL A; 4RQ4 A; 4QJF B; 4C80 A; 4B9U A; 4Q8F A; 1M6Y A; 3IV6 A; 3RRH A; 2F1I A; 4EX6 A; 2Y1I A; 4HAI A; 2BDU A; 1T8E A; 1N62 A; 2CXY A; 1ZRN A; 5KFW A; 3HW8 A; 1YZ6 A; 4HYK A; 5CB1 A; 1LV5 A; 3WK8 A; 2G0A A; 5KAF U; 5J2K A; 1NNL A; 3GV5 B; 4QZA A; 4DQR A; 1ZQX A; 5E79 U; 1SV0 A; 1QQ6 A; 1HEK A; 2OEH A; 1AQ6 A; 4RQM A; 2HHX A; 1XO1 A; 4CF5 A; 5IIO A; 4I2H A; 8ICI A; 2A1A A; 2QAR B; 4QZH A; 1WWV A; 1KFD A; 3ISB A; 2Y9T A; 5D46 A; 2WTF A; 3MR2 A; 4EBD A; 1U48 A; 2KFZ A; 3O0F A; 2BQU A; 5KFZ A; 4XUS A; 1F44 A; 1T3Q A; 1FFU A; 2OYY A; 2ASD A; 1S0N A; 3N4M B; 2MUT A; 3SAF A; 2LPE A; 4DSK A; 1X42 A; 1TK5 A; 3FDS A; 1TK0 A; 5HNK A; 2PFQ A; 1S9F A; 5J2E A; 4RQ3 A; 2BPC A; 3I1Y A; 2O6K A; 3PY8 A; 2P66 A; 4LVS A; 4QZ8 A; 1WCN A; 4CE6 A; 4P0P A; 4FS2 A; 4Z6C A; 1FO4 A; 5KG2 A; 4I2D A; 5AI6 A; 5ALN A; 4DLG A; 4PHD A; 4Y2P A; 4KLF A; 4YD2 A; 3PZP A; 7ICI A; 3IG5 A; 2F8L A; 2K8A A; 4Y2U A; 2VJ4 A; 3C28 A; 2XGP A; 3H40 A; 4MF8 A; 2KN7 A; 4F5P A; 1BNP A; 4Q44 A; 4Z6E A; 2JEF A; 1F5S A; 2LI6 A; 2R8J A; 2W9C A; 2Y0S F; 1Z4N A; 4UW9 A; 2RQ5 A; 5AI8 A; 1KFS A; 3EPG A; 4YR2 A; 4O5C A; 3FYH A; 1ZQU A; 2R8I A; 3Q8P B; 2ZTC A; 4RT2 A; 5KFG A; 4M9H A; 4F8R A; 1ZQN A; 4Y2Q A; 3UM9 A; 5L1M A; 2ZJ5 A; 4CDG A; 3KFU F; 2F44 A; 3Q8R B; 2ZIV A; 3RJF A; 5AM2 A; 2OWO A; 2XVT A; 4F5O A; 3PSI A; 2J6T A; 5DQG A; 1S77 D; 1MSW D; 4QZG A; 4F92 B; 2OM6 A; 2PFO A; 4JMU A; 4MFA A; 4FZN A; 4ACO A; 5AKH A; 1Y88 A; 2FE9 A; 3UQ0 A; 3E58 A; 4F4Z A; 2NRV A; 5EE9 A; 2ZTD A; 2D6F C; 2ZJA A; 2AH5 A; 3JPQ A; 1JXL A; 1MA7 A; 2J6S A; 7ICF A; 4ED8 A; 5AM5 A; 1N61 A; 5KFH A; 3ORY A; 3THV A; 3QXG A; 4KN4 A; 4ECZ A; 2KKV A; 5CEH A; 1CUK A; 2DUY A; 2MUT B; 3KOO A; 2P6U A; 3T5J A; 4RPX A; 1URJ A; 2DQN B; 3E0F A; 3F5E A; 3GV7 B; 1N60 A; 2JEJ A; 4J9K A; 2F1H A; 2L5Y A; 5CP2 A; 5ALK A; 4R65 A; 4RQ0 A; 1SKS A; 2F2A B; 4P0P B; 2JV3 A; 3N28 A; 3RH6 A; 4O3Q A; 3KHR A; 3CRX A; 8ICB A; 2BCR A; 2V4Q A; 2C2D A; 7ICK A; 5DQH A; 2CRX A; 4RT3 A; 4M9G A; 1KEJ A; 3UXP A; 3NVZ A; 5D4B A; 5L1J A; 2WB1 F; 5J0S A; 2MAX A; 2B6G A; 4I28 A; 3G6X A; 2W9C B; 4KLE A; 2KE7 A; 2LYH A; 3HP6 A; 3UMG A; 8ICL A; 3HX0 A; 1TAM A; 4C7Z A; 3M1Y A; 1Z19 A; 4KIT B; 4P4P A; 1JXE A; 4KLD A; 2IHM A; 4FBU A; 5AI4 A; 2KK0 A; 3F2C A; 1X2I A; 1ZQE A; 4Q45 A; 1ZQQ A; 4FO6 A; 4KLG A; 4AYB C; 2AGO A; 3RR8 A; 4UAS A; 1NZB A; 9ICK A; 1NKC A; 5ALI A; 3TAD C; 4RNO A; 4XQ8 A; 2G08 A; 4JV1 A; 2ZIV B; 4PL2 A; 2K8B B; 1U9L A; 3QYP A; 4O5E A; 2W9B A; 5JRT A; 2NRX A; 1XS9 D; 9ICT A; 5J0Q A; 2RLT A; 4CNQ A; 2XY5 A; 3PW5 A; 2DPI A; 1OUQ A; 4IQW A; 1SKR A; 7ICU A; 3QU4 A; 4F4K A; 5DDY A; 4C8N A; 8ICF A; 1XNS A; 3H0R B; 3SD7 A; 9ICA A; 2D3D A; 2AQ0 A; 3NVV A; 3RB3 A; 4NY8 A; 4IS7 A; 2C2E A; 2FI1 A; 9ICR A; 3WKA A; 3C2L A; 1H38 A; 2PMZ F; 2N1R A; 3BZC A; 2PXI A; 2BQ3 A; 1RQN A; 5T14 A; 1D9F A; 4CF4 A; 2KIC A; 4J9M A; 2W3S A; 4RPY A; 2G5I B; 4GXK A; 4E0D A; 3V7K A; 7ICJ A; 1V97 A; 2QLT A; 1MN8 A; 4KN7 A; 1WWU A; 1HJP A; 3RBD A; 4US8 A; 5AK6 A; 4Y2V A; 3OTQ A; 1ZQJ A; 3MAB A; 4GFJ A; 4J9P A; 4KX5 A; 3LDA A; 3LYS A; 4I27 A; 2UVU A; 2GO7 A; 4QWD A; 2IOF K; 4FZL A; 4B9S A; 3SAH A; 5KFF A; 4XRH A; 2KKP A; 5KG5 A; 3GU3 A; 2KTQ A; 2KMD A; 2EAO A; 4NL9 A; 4F5Q A; 2FLN A; 4O5K A; 2YY6 A; 3B0X A; 5AKZ A; 1BPZ A; 3NS1 A; 1LB2 B; 3PO5 A; 2EAN A; 4M9J A; 5KFE A; 1KQQ A; 3ZI4 A; 2HSZ A; 2PFP A; 3OHA A; 4KMU A; 2JR5 A; 3U26 A; 4RQ6 A; 5AK5 A; 2JEI A; 2BKE A; 8ICV A; 1O08 A; 8ICM A; 3KKA A; 1D8L A; 5AKG A; 1ZQ1 C; 2ASJ A; 4C8K A; 4JB3 A; 3EYZ A; 3TAC B; 4DF4 A; 2W9B B; 3C21 A; 1X9W A; 4PGY A; 1A0P A; 5J29 A; 5IIL A; 3MFI A; 3PSF A; 4OD0 A; 1O03 A; 1ECW A; 3NUQ A; 2K4I A; 2H3Q A; 3FAH A; 5H2F U; 3EPI A; 4G3I A; 5CHG A; 2HBJ A; 2G5H B; 8ICG A; 5KT3 A; 1X9X A; 3TAN A; 3JPT A; 2AXT U; 4EEL A; 4DL7 A; 3H8J A; 4CGZ A; 2JZB A; 2LYA A; 1ZQT A; 1SWV A; 4M0A A; 4F91 B; 9ICG A; 5III A; 3M9N B; 3QUB A; 3IG8 A; 2ALZ A; 1ZQH A; 1HUZ A; 2YTU A; 4UAT A; 1IV8 A; 2V9W A; 5AI9 A; 3WKC A; 2ISP A; 1T3N A; 5ALV A; 2DPJ A; 5J0U A; 3RJJ A; 2WAQ C; 2HBL A; 4UB6 U; 4PHA A; 2W9A A; 3KHL A; 4FFD A; 2VJ5 A; 1FIQ A; 1SV4 A; 3QEB Z; 4UAY A; 1ZQO A; 4I2I A; 3QEA Z; 2KG5 A; 3FC4 A; 2I6X A; 4DCC A; 1BPY A; 7ICR A; 4RQ8 A; 2G09 A; 3D2S A; 2W7O A; 2GOL A; 2RDJ A; 4O3M A; 5KFX A; 1S97 A; 5AK4 A; 4O3S A; 4GC7 A; 3RF9 A; 4M6W A; 4TQR A; 3M7D A; 5L9X A; 4YXM A; 4UQG A; 5A0L A; 1L8L A; 4RQ2 A; 2YN4 A; 3QU5 A; 4XA5 A; 5K4L A; 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4YP3 A; 3GFK B; 3HKZ C; 4M6W B; 4C4T A; 2XC9 A; 1UQV A; 3I76 A; 4EEY A; 3QZ8 A; 4DFM A; 5J8Y C; 2NRZ A; 8ICN A; 3PW0 A; 7ICT A; 3DV9 A; 2EAM A; 2I5H A; 3RH4 A; 2XGQ A; 4CF3 A; 4PJ0 U; 3Q8L A; 1RYS A; 1JN3 A; 3K1Z A; 5KFR A; 2OXO A; 3C1Y A; 1KLN A; 2FJ6 A; 4NWI A; 1ZJM A; 3PO4 A; 4LZG A; 4B9L A; 3DDH A; 4TUS A; 2YMQ A; 4ED6 A; 4KLL A; 4TUR A; 3ETR A; 4KLJ A; 2AU0 A; 3H7I A; 2NV3 A; 4EBE A; 3RJI A; 4BJQ A; 4IR1 A; 2JRZ A; 5KG7 A; 1DXS A; 3JPP A; 2B0C A; 3GIK A; 4UB5 A; 2KFN A; 3N97 B; 3KD3 A; 4LZD A; 5KFK A; 1LKY B; 1VDV A; 2MA1 A; 2KSO B; 9ICO A; 4I2C A; 4QZD A; 1CRX A; 1QSY A; 3GQC A; 3PMN A; 9ICV A; 7ICO A; 5DDM A; 3NGD A; 5KFV A; 1V9P A; 3B9J A; 3KHG A; 3WK7 A; 1UCV A; 4Q8E A; 4R66 A; 4GXJ A; 2ZXI A; 1SIJ A; 3CNH A; 4PZN A; 3MDC A; 3H8S A; 4OJ6 A; 2YMM A; 3Q8Q B; 1L6N A; 4UAV A; 4J9O A; 3PW2 A; 8ICZ A; 5AKI A; 3Q8M A; 5KG6 A; 1SXE A; 1TVA A; 3ZD9 A; 5AM3 A; 1DRG A; 3TFS A; 4GLX A; 2Y9U A; 5F9N A; 5DG9 A; 4PZO A; 2W8L A; 1T94 A; 1L7P A; 2H3F A; 2FMP A; 4QZB A; 1UA0 A; 4C8M A; 4Y2J A; 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