The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
40
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
SIIATVKIGPDEISAMRAVLDLFGKEFEDIPTYSDRQPTNEYLANLLHSETFIALAAFDRGTAIGGLAAYVLPKFEQARSEIYIYDLAVASSHRRLGVATALISHLKRVAVELGAYVIYVQADYGDDPAVALYTKLGVREDVMHFDIDPRTAT
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Aminoglycoside 3'-N-acetyltransferase
|
| publication title |
Crystal structure of aminoglycoside acetyltransferase AAC(3)-Ib
rcsb |
| source organism |
Pseudomonas aeruginosa
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| molecule tags |
Transferase
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| total genus |
40
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-02-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00583 | Acetyltransf_1 | Acetyltransferase (GNAT) family |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Aminopeptidase | Aminopeptidase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3FB3 A; 2PC1 A; 2EVN A; 3C26 A; 4PSW A; 1MJA A; 3G8W A; 4R3K A; 4CRY B; 1B87 A; 4H6U A; 4CRZ B; 2PR1 A; 5F47 A; 2FIA A; 2JLM A; 3S6G A; 4F0Y A; 4L89 A; 4HNW B; 4KUA A; 1MK4 A; 3SHP A; 3TOA A; 3EFA A; 3TTH A; 2Q7B A; 1Y7R A; 3RYO A; 4HNY B; 4IF5 A; 2VBQ A; 4KVM E; 4ZBG A; 2Q04 A; 2VZY A; 4UWI A; 4ONU A; 3TOB A; 1MJB A; 3UY5 A; 4AVB A; 1NE9 A; 2FS5 A; 3FNC A; 2K5T A; 1IID A; 1M4I A; 1S7F A; 1BOB A; 1TIQ A; 1IYK A; 1VHS A; 2RC4 A; 1YX0 A; 1U6M A; 2I79 A; 4XPD C; 2GIV A; 4XNH B; 4GS4 A; 3P2H A; 4L8A A; 3W6X A; 3DSB A; 1N71 A; 5EBV A; 2AJ6 A; 4FD4 A; 1MJ9 A; 1IIC A; 4FD5 A; 3D8P A; 2FXF A; 3R95 A; 3LD2 A; 3TO6 A; 5DWN A; 2J8R A; 2JDC A; 1YRE A; 2G3A A; 2KCW A; 2P6G A; 3D2P A; 5IV0 A; 4JXQ A; 1BO4 A; 4NEX A; 3R9E A; 4JWP A; 1QSO A; 2P6F A; 2FIW A; 4F6A A; 1YK3 A; 2CNM A; 1QSR A; 1KUY A; 1S60 A; 4CS0 B; 2PRB A; 4HNX B; 4LUA A; 1S7K A; 4U9Z A; 1S7N A; 1VKC A; 3R9F A; 3GY9 A; 2REE A; 4H6Z A; 3SXO A; 2CNS A; 5F48 A; 4JXR A; 3B8G A; 1Z4E A; 4JLY A; 4KVX A; 4XPL A; 3DDD A; 1XEB A; 3TFY A; 1Q2C A; 2R98 A; 4R3L A; 3LOD A; 1L0C A; 4NXY A; 3R9G A; 3TO9 A; 4KVO E; 1XE4 A; 3EXN A; 5F46 A; 3CXP A; 1YLE A; 1YR0 A; 1I1D A; 2Z10 A; 1Z9U A; 2A4N A; 4CAW A; 1K4J A; 4AG7 A; 2D4O A; 4I49 A; 3DR6 A; 4MHD A; 3I3G A; 3W6S A; 2FT0 A; 4E8O A; 4MY0 A; 2R8V A; 3VWD A; 4OAD A; 3K9U A; 4QBJ A; 4QVT A; 4M85 A; 4LX9 A; 4OAE A; 1UFH A; 4KZT A; 2ZW5 A; 2B4D A; 2R7H A; 3TT2 A; 3PP9 A; 1Z4R A; 1Q2D A; 2NMT A; 5J8F A; 2ARH A; 4B5O A; 4RI1 A; 4QC6 A; 4AG9 A; 2FCK A; 3G3S A; 2B3U A; 2FL4 A; 1I21 A; 5KTA A; 4QUS A; 4KOR A; 2QIR A; 3BJ7 A; 1M1D A; 2O28 A; 4E0A A; 4B5P A; 2I00 A; 3FYN A; 3D3S A; 1LRZ A; 1IB1 E; 5H86 A; 4R9M A; 4UA3 A; 2R1I A; 2Y0M A; 2DXQ A; 2GAN A; 4MJ8 A; 4II9 A; 3IWG A; 1YVK A; 2P0W A; 3CXS A; 5E96 A; 2BSW A; 3TCV A; 2AE6 A; 1XIX A; 4PK2 A; 2X7B A; 4HKF A; 5DWM A; 3BLN A; 4NCZ A; 3V8I A; 2ZPA A; 1XMT A; 2ZW6 A; 3EO4 A; 2VI7 A; 3R1K A; 4NF1 A; 2B5G A; 2B4D B; 2OZH A; 4KOY A; 4YFJ A; 5JPH A; 4Y49 B; 4IUS A; 3TE4 A; 4KOT A; 3T9Y A; 2G3T A; 3ZJ0 A; 3PZJ A; 1NMT A; 4K30 A; 3D2M A; 2G0B A; 1P4N A; 2B4B A; 2VZZ A; 2ZXV A; 3PGP A; 2BL1 A; 2Z11 A; 1WWZ A; 4B5P B; 2FSR A; 4MI4 A; 5EC4 A; 4RS2 A; 1FY7 A; 3MGD A; 3TO7 A; 1V0C A; 2C27 A; 2FE7 A; 4OLL A; 2CY2 A; 2B3V A; 2WPW A; 5C82 A; 5HMN A; 1S7L A; 4CAX A; 2OH1 A; 1P0H A; 2VEZ A; 4E2A A; 2OB0 A; 2ZW4 A; 3ZZI A; 2REF A; 3JUW A; 4DNC A; 1KZF A; 4UWJ A; 3QAH A; 4KLW A; 1YGH A; 3E0K A; 1M44 A; 2Z0Z A; 2OZU A; 1S5K A; 4FD7 A; 2GE3 A; 2Q4Y A; 2OU2 A; 2D4P A; 2VQY A; 1QSM A; 3VWE A; 3FXT A; 4J3G A; 3S6K A; 3GYA A; 3F5B A; 3EY5 A; 5GCN A; 5KTD A; 1RXT A; 2CNT A; 4Y49 C; 2B5G B; 4FD6 A; 3IGR A; 1PUA A; 5J8C A; 3JVN A; 5JQ4 A; 3W91 A; 1PU9 A; 1SQH A; 1NSL A; 4JJX A; 1CM0 A; 1QSN A; 2F5I A; 3OWC A; 4KOU A; 3FIX A; 4BMH A; 5ISV A; 2EUI A; 4QB9 A; 2QML A; 4R57 A; 4KOV A; 2Q4V A; 3F8K A; 3DR8 A; 4AVC A; 4H89 A; 4YGO A; 5HH1 A; 3EC4 A; 1OZP A; 4R87 A; 1Y9K A; 4YRH A; 4MBU A; 2OZG A; 5CNP A; 1QST A; 3FBU A; 1M4G A; 4KOS A; 3N7Z A; 2ZW7 A; 4KOX A; 1Q2Y A; 4PK3 A; 5C88 A; 2BEI A; 1RO5 A; 1XF8 A; 1WK4 A; 3WR7 A; 1KUV A; 3F0A A; 3GKR A; 4M3S A; 2PDO A; 2HQY A; 2QEC A; 1J4J A; 1ON0 A; 4U5Y A; 4AVA A; 4EVY A; 2HV2 A; 3QB8 A; 2PQ8 A; 2B58 A; 4CAV A; 3BJ8 A; 3S6F A; 3S6H A; 5F49 A; 4XPK A; 3T90 A; 4AB7 A; 4U9Y A; 4X5K A; 3P2F A; 2J8M A; 4NSQ A; 1KUX A; 1S3Z A; 4KLV A; 2H5M A; 4JD6 A; 1CJW A; 4UBR A; 1B6B A; 2IL4 A; 4MY3 A; 2Q44 A; 1YVO A; 5H84 A; 4PSX A; 1I12 A; 2PR8 A; 2JEV A; 5FVJ A; 5I0C A; 1M4D A; 2VXK A; 2HUZ A; 1GHE A; 3DNS A; 3NE7 A; 1IYL A; 5KTC A; 1R57 A; 2ATR A; 5IB0 A; 4KUB A; 4PV6 A; 2Q0Y A; 1Y9W A; 3I9S A; 4XNH C; 3FRM A; 2J8N A; 5IX3 A; 3KKW A; 4XPD B; 2BUE A; 4ORF A; 3R96 A; 2PSW A; 3SXN A; 2P6E A; 3H4Q A; 2JDD A; 4KOW A; 3CXQ A; 2WPX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2Q7S A; 3WT4 A; 2WYR A; 1RTQ A; 2PC1 A; 3FB3 A; 2QJ8 A; 2NSM A; 4YU9 A; 3B3T A; 2AFO A; 3S9L A; 2EVN A; 3C26 A; 4PSW A; 1MJA A; 3FEC A; 2Q51 A; 3G8W A; 4R3K A; 2JBJ A; 2XEF A; 4CAF A; 4CRY B; 1B87 A; 4H6U A; 4CRZ B; 2PR1 A; 5F47 A; 5HXD A; 2FIA A; 2JLM A; 2ZEL A; 1OBR A; 1Y7E A; 2DPS A; 3RBU A; 3S6G A; 4F0Y A; 3PB4 X; 4C2X A; 4L89 A; 1ZG7 A; 4HNW B; 2V8G A; 5LRK A; 4KUA A; 1MK4 A; 1ZO0 A; 2XEJ A; 3SHP A; 2PJ4 A; 3KAS A; 3TOA A; 3L2N A; 2CXA A; 4P10 A; 4OC3 A; 2ZED A; 5AG6 A; 5LYD A; 4B6Z A; 2F8H A; 4OME A; 5A28 A; 4UFX A; 3PB9 X; 2POK A; 3EFA A; 3D7H A; 3TTH A; 1CP6 A; 2Q7B A; 1Y7R A; 4Q7A A; 1XRY A; 4HNY B; 3RYO A; 4IF5 A; 3QNV A; 5LRG A; 4IK2 A; 1CBX A; 2VBQ A; 4KVM E; 2PJA A; 3B2Y A; 1F2P A; 4ZBG A; 4Z65 A; 2Q04 A; 2VZY A; 4NGN A; 4UWI A; 1VGY A; 3D68 A; 1H8L A; 2PJ2 A; 4ONU A; 3TOB A; 1MJB A; 3UY5 A; 4MCQ A; 2PRQ A; 4AVB A; 4P4F A; 1NE9 A; 2FS5 A; 3FNC A; 2Z3P A; 2K5T A; 3D66 A; 3LMS A; 1IID A; 1M4I A; 1S7F A; 2GLJ A; 2EBJ A; 3IC1 A; 4NGS A; 3WAB A; 1BOB A; 2PJB A; 3NE8 A; 5BWA B; 2PIZ A; 3IFE A; 2AFU A; 2CIJ A; 4OC0 A; 1VHE A; 1TIQ A; 4PXC A; 3GB0 A; 5AG5 A; 1IYK A; 1VHS A; 1XBU A; 1TXR A; 2RC4 A; 1YX0 A; 1U6M A; 2I79 A; 4MCR A; 4XPD C; 2GIV A; 4JYW A; 4XNH B; 2EO8 A; 4GS4 A; 4M6G A; 3P2H A; 4MFL A; 4L8A A; 3W6X A; 3DSB A; 2G9D A; 1N71 A; 4C2Z A; 3FVL A; 5EBV A; 1YW6 A; 2AJ6 A; 4FD4 A; 1MJ9 A; 1IIC A; 2YNC C; 2YNC A; 1VHO A; 4FD5 A; 3D8P A; 4CPA A; 3KR5 A; 4FAI A; 2ZEM A; 5HVH A; 5JH9 A; 2FXF A; 1YLO A; 3V7Z A; 3R95 A; 5LRJ A; 4ZY1 A; 3LD2 A; 3TO6 A; 5G20 A; 5DWN A; 3LWU A; 5JM6 A; 4P4E A; 2GRE A; 2J8R A; 3S9M A; 1ZLH A; 2JDC A; 2V8H A; 1X10 A; 1YRE A; 2G3A A; 2Q4Z A; 1F2O A; 4P4D A; 2KCW A; 2P6G A; 4A33 A; 3D2P A; 5IV0 A; 4JXQ A; 1BO4 A; 4NEX A; 3FX6 A; 3R9E A; 4JWP A; 1QSO A; 2P6F A; 2FIW A; 1IOI A; 2AFZ A; 4F6A A; 5I4M A; 1YK3 A; 2HC9 A; 2IMO A; 3KHZ A; 3A9L A; 2FVG A; 1PCA A; 2CNM A; 4ZX9 A; 1QSR A; 1KUY A; 1EE3 P; 1S60 A; 2ABZ A; 4MHN A; 4CS0 B; 4M6I A; 2PRB A; 3CDX A; 3MRU A; 2OR4 A; 4HNX B; 1ELM P; 4KOW A; 4OC4 A; 4LUA A; 1S7K A; 3CPX A; 3V38 A; 4MRI A; 4U9Z A; 1S7N A; 3VH9 A; 4GXH A; 1VKC A; 2RB7 A; 3R9F A; 5HVF A; 5CBM A; 4AXV A; 3GY9 A; 2REE A; 3H5Z A; 4OID A; 2IQ6 A; 1CX8 A; 4H6Z A; 3SXO A; 2CNS A; 2PE3 A; 1LAN A; 3BHX A; 4JXR A; 5F48 A; 4CAE A; 3KR4 A; 3BI0 A; 3B8G A; 1M4L A; 1Z4E A; 4JLY A; 4KVX A; 2DF5 A; 4EFD A; 4LQ6 A; 4ZGY B; 2ZEN A; 4XPL A; 5LYF A; 3DDD A; 4NGM A; 1XEB A; 2BO9 A; 3KQX A; 3TFY A; 2WUU A; 1Q2C A; 2R98 A; 1Z8X A; 4R3L A; 1R43 A; 4UCP A; 4IHM A; 5CPA A; 5K8M A; 4PQA A; 3CT9 A; 5IB9 A; 3WC6 A; 4MFK A; 3LOD A; 2XEG A; 1L0C A; 4NXY A; 4DUK A; 3R9G A; 3TO9 A; 4KVO E; 1IOF A; 1XE4 A; 3EXN A; 3FMC A; 2NYQ A; 4NJQ A; 4PXE A; 5F46 A; 3CXP A; 1YLE A; 1YR0 A; 3BXM A; 1I1D A; 4MFZ A; 2Z10 A; 1Z9U A; 2ODF A; 2PCU A; 4C7I A; 2A4N A; 4GM5 A; 4DJL A; 2EK9 A; 5G22 A; 4HPS A; 4CAW A; 2XEI A; 1K4J A; 4AG7 A; 1BAV A; 2D4O A; 4I49 A; 1JWQ A; 3DR6 A; 1YQE A; 4MHD A; 1LAP A; 3B35 A; 3I3G A; 4FWU A; 3W6S A; 4BD9 A; 3FF3 A; 2AFM A; 2FT0 A; 2I3C A; 2ZOG A; 4NFR A; 4E8O A; 3B3V A; 4MY0 A; 2R8V A; 2ANP A; 3VWD A; 4OAD A; 4P44 A; 4MCS A; 3H8G A; 3K9U A; 4QVT A; 2OOT A; 4QBJ A; 2ZEH A; 4MHY A; 2J9A A; 4M85 A; 2HB6 A; 4LX9 A; 4OAE A; 3RO0 A; 4CGM A; 1UFH A; 4KZT A; 5AG4 A; 4DYO A; 2PJ3 A; 3GIU A; 2ZW5 A; 4MMO A; 2B4D A; 2R7H A; 3TT2 A; 4C2Y A; 3PP9 A; 1Z4R A; 1Q2D A; 2NMT A; 5J8F A; 2ARH A; 4B5O A; 4RI1 A; 4QC6 A; 2O4H A; 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1XFO A; 3V8I A; 3D7F A; 3PB7 X; 4UCM A; 2ZPA A; 8CPA A; 1XMT A; 2ZW6 A; 1XMB A; 3EO4 A; 2VI7 A; 4R6T A; 4BIN A; 2WZN A; 2PJ1 A; 3R1K A; 4NF1 A; 3MN8 A; 2B5G A; 2B4D B; 2OZH A; 3KI9 A; 4ZYQ A; 2C6P A; 4KOY A; 4CGO A; 4UFV A; 3I1U A; 4CGL A; 4YFJ A; 1ZG9 A; 5JPH A; 4Y49 B; 4IUS A; 3TE4 A; 4KOT A; 1NSA A; 3T9Y A; 2G3T A; 4WWV A; 3ZJ0 A; 3BI1 A; 3PZJ A; 7CPA A; 1NMT A; 4K30 A; 3S9N A; 3D2M A; 4A95 A; 2G0B A; 1P4N A; 2PJ6 A; 2B4B A; 2VZZ A; 2ZXV A; 2C6C A; 4K3N A; 1TF9 A; 1ELL P; 5EMI A; 3PGP A; 3SI0 A; 3NH5 A; 2BL1 A; 2C6G A; 2YGW A; 2Z11 A; 3RZA A; 1QQ9 A; 1YME A; 1WWZ A; 3PFE A; 4B5P B; 3D7G A; 2FSR A; 4MI4 A; 5EC4 A; 3SJG A; 2V77 A; 4RS2 A; 1LFW A; 5K8O A; 3IJ3 A; 1FY7 A; 2WSA A; 3MGD A; 4NGQ A; 4W9Y A; 1V0C A; 3NA6 A; 2C27 A; 2FE7 A; 3TO7 A; 2QYV A; 4OLL A; 2CY2 A; 2B3V A; 2WPW A; 3N5F A; 3TX8 A; 5C82 A; 4A30 A; 5HMN A; 1S7L A; 4CAX A; 2OH1 A; 1P0H A; 2VEZ A; 1Y0R A; 4E2A A; 3IWW A; 2OB0 A; 4CYO A; 2ZW4 A; 3SJE A; 2REF A; 3JUW A; 3KQZ A; 4P45 A; 2V8D A; 3ZZI A; 3SJX A; 4DNC A; 1KZF A; 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