4OLLA

Camp-binding acyltransferase from mycobacterium smegmatis
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
333
structure length
316
Chain Sequence
VAELTEVRAADLAALEFFTGCRPSALEPLATQLRPLKAEPGQVLIRQGDPALTFMLIESGRVQVSHAVADGPPIVLDIELIIGEIALLRDAPRTATVVAAEPVIGWVGDRDAFDTILHLPGMFDRLVRIARQRLAAFITPIPVQVRTGEWFYLRPVLPGDVERTYRRFQSVRKPTRALLEYLFEVDYADHFVWVMTEGALGPVIADARFVREGHNATMAEVAFTVGDDYQGRGIGSFLMGALIVSANYVGVQRFNARVLTDNMAMRKIMDRLGAVWVREVVMTEVDVPPVDTVPFEPELIDQIRDATRKVIRAVSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Allostery and Conformational Dynamics in cAMP-binding Acyltransferases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acetyltransferase Pat
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium smegmatis
total genus 86
structure length 316
sequence length 333
ec nomenclature ec 2.3.1.-:
pdb deposition date 2014-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4ollA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4ollA02
1M4IA 3DR8A 2D5FA 1SQHA 2J8MA 1QXJA 3JUWA 1YFYA 4XFGA 1DGWA 1S7FA 3CLPA 4F7ZA 3ES4A 3CJXA 5I0UA 4D7SA 2BNOA 3NW4A 1M4DA 3R1KA 3OGJA 1XEBA 2CAUA 4IEZA 4QC6A 3FJSA 3L2HA 2VQYA 4CAWA 3IDCB 4KU7A 4XETA 4YRDA 3I7DA 3H9AA 1QY4A 2QIRA 1MK4A 3G3SA 3NE7A 3R9GA 3SHRA 4KOVA 2EVXA 3P2FA 1WGPA 3WW1A 4XF4A 2X7BA 3MGDA 4PSWA 5FLHA 5I0RA 3DDDA 4QM9A 3NL1A 1FXZA 4H7LA 5J7MA 2Q7BA 4GS4A 4KOYA 4R8HA 3R9EA 3CL1A 3FWEA 2DCTA 1YR0A 1Y9KA 4KWKA 1IB1E 3B02A 5F47A 4OLLA 5KTDA 1XMTA 4L8AA 3H3UA 3IWGA 4CS0B 5KTAA 1NE4A 1LRHA 2CY2A 2JLMA 3WR7A 4F6AA 1S5KA 4DNCA 1KUYA 5I8SA 3T90A 2REFA 2KXLA 2UY9A 1IICA 1O3RA 3EC4A 4KOTA 4LUAA 2P17A 2XGXA 4HN0A 5JR7B 2HJIA 3U10A 2WC2A 4AXOA 3H7JA 4XF3A 2FL4A 1M44A 3I59A 3NJZA 4I09A 2FIAA 2I00A 4EWAA 4U5YA 4HSLA 2ZW7A 4XEZA 3EQEA 3E6BA 4ORFA 5D1IA 4FAGA 2ATFA 3FFQA 5T3NA 2G3TA 4FD6A 4I01A 4WZCA 5I0TA 1IPJA 3RNSA 2PA7A 3RPQA 4AQ6A 4NF1A 1ZZ6A 4YYOA 1XE7A 1IYLA 2FXFA 2HQYA 2FSRA 1IPKA 4JTOA 3D2MA 3R6SA 1CM0A 2JDCA 2Q4VA 1O7FA 3BCWA 1BOBA 4Q0PA 2V09A 3FX3A 1ZREA 2FQPA 2K9ZA 4XFIA 2B4BA 5DWNA 1UIKA 1ZZ7A 1V70A 4CAVA 1Z4EA 3DV8A 4UWIA 4AVAA 4HBNA 1S7LA 1CAVA 2EA7A 4XPLA 1WA4A 2Q30A 1OFNA 3LWCA 4YGOA 2B4DB 1DZRA 4IUSA 1ZZ9A 1Y3TA 2Q1ZB 4MI4A 2K5TA 1U12A 3O14A 1J3QA 3LA3A 5CU1A 5IX3A 1V0CA 1Q3EA 1J59A 3E97A 1MJ9A 2E9QA 1XRUA 2BGCA 5I93A 1L0CA 2J8RA 2B5HA 3LOIA 1PU9A 5HH1A 1CAUB 4MUVA 5IB0A 2QVSB 1S3ZA 4IF5A 4Q0UA 3FZ3A 5JSRA 4RS2A 4Y49C 1FI2A 1OZPA 5C82A 1O3QA 4IERA 2G3AA 4F8AA 3SXWA 2MHFA 3DNSA 1XE4A 3OD0A 3F5BA 4MX3A 5C88A 1H1IA 2PAEA 4ZU4A 2P6GA 4PV6A 3SXOA 4D7TA 3SCFA 4XF9A 5FCCA 5BV6A 3FXTA 1N71A 1ZRFA 5CNPA 4PIZA 4HKFA 3ETQA 2BSWA 4YNIA 1B87A 4XPDB 4YARA 4EROA 1CGPA 3ROUA 1YWKA 1S7KA 3UY5A 4I0BA 3SCGA 3FIXA 4PJYA 1QSTA 4L89A 2Z69A 1UPIA 1Y9WA 1I12A 4QB9A 2OA2A 5I8YA 1Y7RA 1YFWA 4QM8A 1S7NA 3SMHA 3U11A 2ARHA 4FD4A 4B5PB 5JAXA 2PAKA 2ZPAA 3MYXA 3BJ8A 4H6UA 1ZZBA 4KVOE 5BUVA 4UA3A 4HZFA 4KOWA 2FE7A 2PYTA 4A2UA 2VBQA 4B29A 3FE5A 4XFBA 3K9UA 2I45A 2GH2A 3H7YA 3MZHA 4XPDC 2EVNA 3S6FA 4QGNA 4M3SA 3RYOA 3TE4A 4Q0VA 5BY5A 1YGHA 2Y0OA 2B9UA 2UY8A 2K0GA 1NE9A 2H0VA 3TNPB 2AE6A 2BEIA 3OCPA 2B4DA 1ZZ8A 1NXMA 2GC0A 2VXKA 3BLNA 2N7GA 4JVAA 4GULA 5EC4A 4XF0A 5I0CA 4E0AA 2GC2A 5KHKA 1CJWA 4ZU7A 1LRZA 3E5QA 2ZW6A 2GAUA 4UBHA 3OTFA 5E1RA 2VEZA 5H84A 2XL7A 2FMYA 3C3VA 5HMNA 3WW3A 2VZZA 3LODA 1CAUA 1O5UA 1QSOA 3PVBB 4HNYB 3R9FA 4F0YA 2B3UA 3EFAA 4JTNA 1NYWA 1YVKA 3OF1A 1J3PA 4KVME 3LA7A 2C0ZA 1BO4A 2ETEA 1WWZA 3H8UA 3JVNA 1FT9A 1CAWB 5FDBA 3EJKA 2R7HA 4QGLA 2Q04A 3FBUA 4H6ZA 3G8WA 3UKTA 3GYAA 1OI6A 2JDDA 3IGRA 4HSJA 3PGPA 2UYBA 2OB0A 4AG7A 2P6EA 4ONUA 3S6KA 3UKVA 4QXKA 5CADA 3USSA 1Q43A 1O3TA 2EUIA 2BL1A 1ZNPA 4JLYA 2IXHA 4O9GA 3S0MA 3N4MA 4NXYA 4AB7A 2Z2SB 1ZVFA 4XFAA 3SCHA 1SFNA 5LEJA 4B5OA 2WFPA 2CNSA 2Z10A 1MJBA 2D93A 1RL3A 3S6GA 4AQ2A 3ES1A 3D0SA 5FQ0B 5JSPA 3D0JA 3FHIB 4HVRA 3MPBA 4MH0E 4N9HA 5LRSA 4R9MA 3DN7A 4B5PA 4E2AA 4QVTA 3UKNA 3FNCA 1YUDA 2GU9A 5GCNA 3H1WA 3SHPA 2PHLA 2IXLA 4LEJA 5JSOA 1UFHA 2FT0A 2CAVA 1DGRA 3GBFA 3GY9A 3EBRA 4IEUA 5DWMA 2O8QA 1ZRCA 5K8SA 2IXIA 2PFWA 2IL4A 4MJ8A 5IV0A 4KLVA 4KWJA 2HUZA 1NE6A 2PDOA 4L2NA 4RD7A 2G0BA 2D4OA 4HN1A 4XF1A 3FB3A 4MY0A 3BPZA 4K8FA 4ZU5A 4Y49B 4I2OA 2P0WA 1X82A 3E6CC 2R98A 3N7ZA 2OZGA 3S7EA 3DR6A 2GIVA 4EWEA 4LA3A 3ZDSA 2XLFA 2D5HA 3CO2A 4JXQA 1O4TA 3RDIA 3W6SA 3RYKA 4PIXA 3B8GA 3ST7A 4HMZA 3P2HA 1G6NA 2B58A 1KUVA 4OADA 4Q0QA 2IXCA 1NSLA 5J8FA 5JQ4A 4QBJA 2Y0MA 4AVBA 1O3SA 2B5GB 1YREA 3EHKA 3ACLA 5I91A 2EAAA 4IETA 1CAWA 2VQAA 1ON0A 3FRMA 2O1QA 4E2GA 3KCCA 4Q0SA 2XKOA 3WW2A 2PRBA 4KZTA 1M4GA 2P6FA 4L11A 4YSFA 1VKCA 2ET1A 1P4NA 3GKRA 2QNKA 2BUEA 3HT2A 1X8MA 3E5UA 2D4PA 3TCVA 1GHEA 1VR3A 1CAXB 4HVQA 5JPHA 4NCZA 1ZRDA 1UW8A 2H6BA 3R95A 4MZUA 4PIYA 2XLAA 1NZCA 4KWLA 4XPKA 4X6RB 4ZBGA 3BU7A 3RZZA 4LULA 1YLLA 4R52A 5KHHA 4OFGA 3TOAA 1TQ5A 5FQ0A 1I1DA 3IDBB 5EBVA 4NEXA 3VHRA 1VHSA 3EO4A 1Q2CA 4PK3A 4P9GA 2BYVE 5LRRA 2GZWA 3W6XA 1KZFA 4LUMA 4RI1A 1RTVA 5KHJA 4DINB 1I21A 1K4JA 4K30A 2XLGA 3PNAA 1EY2A 2BEOA 4JD6A 3U0ZA 4I3PA 1EP0A 1VJ2A 4IEWA 3H3ZA 4YFJA 4WBBA 5FLIA 4KOSA 2KCWA 2ZW4A 2IC1A 1HW5A 2QMLA 4KUAA 4LA2A 2H5MA 1L3JA 1DZTA 4IEQA 5J8CA 3D3SA 2F5IA 1KUXA 2NMTA 5F49A 3TFYA 1RGSA 3IWZA 2BNNA 1Q5OA 3PZJA 5EFUA 4EV0A 3R96A 2XL9A 2Q0YA 3F8KA 2R1IA 4NSQA 3RYPA 3SXNA 5H86A 1J58A 5KHIA 1QSMA 4CRYB 5KHGA 4I0AA 3T9YA 4IEPA 4XNHB 2WPXA 3TT2A 1UD1A 2F4PA 4QMAA 2PC1A 3IIAA 1WK4A 3PLQA 5AVPA 1PM7A 1J4JA 3TOBA 4AVCA 2B5GA 2DXQA 4BIFA 2PR1A 1IYKA 3E5XA 4J1XA 2CV6A 4MV2A 2VECA 1CX4A 1I6XA 3ZZIA 4KVXA 3OWCA 5C6CA 3H4QA 4UXAA 4FT8A 1QXRA 1EYBA 5KTCA 3EY5A 4M85A 3W91A 4IEXA 3HT1A 3CXPA 1YHFA 2R8VA 3S7IA 3QOPA 5F46A 5CVRA 1CAXA 4XNHC 2Q4YA 3TO7A 4R57A 2VPVA 1Z9UA 4R87A 1NMTA 4QGMA 3D8PA 5EZWA 1J1LA 1Y9QA 2H6CA 4KOUA 2RC4A 2ZXVA 3KKWA 4BYYA 3HIFA 4II9A 1P0HA 1LKNA 5HI0A 1QSRA 1S60A 4HNXB 2Z11A 3BALA 2QECA 3KMHA 5C8WA 4BH9A 3LZZA 2I79A 2B8MA 4IEYA 4X6QB 2OZHA 2PHDA 3BJ7A 4E8OA 5I0SA 4XFHA 3NSTA 4Z82A 4IEOA 4WVZA 3I9SA 4JXRA 5F48A 1SQ4A 2FIWA 1B6BA 4BMHA 4E2SA 3H50A 1YVOA 2REEA 1EPZA 2MNGA 4JV4A 2GANA 4LX9A 4CRZB 4NVPA 1UCXA 3KGLA 3KSCA 1YLEA 4R3KA 3VWEA 4KOXA 1XF8A 4KU8A 3ZJ0A 1TIQA 2OH1A 2Q4SA 4MGZE 5FPZA 3LA2A 2CGPA 3D2PA 2C27A 2OZ6A 4J1WA 1PUAA 4TLFA 3VWDA 3DL3A 2VI7A 4R3LA 4EWDA 4BHPA 2D40A 4XFFA 5I8TA 1ZZCA 3GYDA 3E6DA 4JJXA 4E2QA 4UBGA 2ZKLA 2IXJA 2JEVA 3TNQA 2ATRA 4OAEA 5FLJA 2QDRA 2Q44A 3CXQA 3FYNA 3S6HA 1Z4RA 2CNTA 1XIXA 2IXKA 2FCKA 1PMIA 1IIDA 4IESA 3I3GA 3CEWA 4FAHA 2PR8A 4J3GA 4PK2A 3V8IA 4HVOA 4O9EA 3C26A 1ZRRA 3WW4A 4KLWA 2O28A 3QB8A 5J3UA 3EXNA 1R57A 1VP6A 4U9YA 4KORA 1X8EA 4LTAA 3QACA 3TTHA 2J8NA 3DKWA 1SEFA 4KUBA 1Q2DA 3H1MA 1RO5A 2ET7A 3JZVA 3DSBA 4META 3EO6A 4MHDA 3QAHA 1YK3A 3CXSA 4JWPA 5J48A 3TO9A 1YFXA 2HKXA 5LEKA 1JUHA 1I5ZA 3M3IA 5BPXA 4FBFA 1RUOA 3H1YA 5F1RA 1QSNA 5KBFA 5E96A 2QCSB 4LUKA 1ZX5A 2QJVA 2CNMA 1XE8A 2PTMA 3PP9A 4X5KA 4EVYA 2OPKA 4FD5A 3NKTA 2GE3A 1YX0A 2Z0ZA 1U6MA 2OZJA 3LAGA 5JCTA 3I54A 2PSWA 2GC3A 5E16A 4CYDA 1WLTA 4YRHA 1RC6A 3F0AA 1H1MA 4KL1A 3BB6A 3D82A 2OZUA 2AJ6A 4I02A 4AG9A 2XHKA 2ZCWA 4UBRA 1RUNA 2GC1A 1UIJA 4HLTA 1OD5A 2FS5A 3KGZA 4HNWB 4LLOA 4I49A 2BNMA 1QWRA 4XFCA 2OYZA 1MJAA 3E0KA 1Q2YA 4UWJA 1FY7A 1LR5A 4H89A 4U9ZA 4MGKE 3I59B 2OU2A 3NVCA 1GQGA 2PAMA 3M70A 1X7NA 2B3VA 3HQXA 4MGYE 2WPWA 3LD2A 2PQQA 1LB2A 2ZW5A 5FVJA 2MPFA 3MDPA 4PSXA 5BXXA 2XKPA 3CF6E 1OMIA 5FPXA 4MY3A 3ELNA 2PQ8A 3TO6A 3G7DA 3IBMA 4Z07A 1M1DA 4QUSA 1O5LA 2Q0AA 1RXTA 4Q29A 2A4NA 4QX5A 1GQHA 4IEVA 1YFUA 4N9IA 4FD7A 4MBUA 4CAXA 2VZYA 1J3RA 4MGIE 3RYRA 1CAVB 2HV2A 2UYAA 5ISVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GHMA 1DQ2A 3ZFFC 3WNOA 1C8M3 1XEBA 5DPNA 2P34A 5FO9B 3INAA 3R9GA 2DTWA 5A3LA 1W2TA 4AI2A 4QX8A 2A6VA 4GA9A 1GBGA 4WVMA 4Y5TA 1RHI2 2VBBA 1GFF2 2UY9A 2ZZJA 2ZW7A 4RR3C 3VHPA 4YW7A 5FYIA 2I07B 3RZHA 2CF4A 1XNKA 1BVVA 4QXHA 1O7FA 4XFIA 1QH7A 2PMWB 5T5LA 3NNGA 4D94A 4LQRA 1MZFA 1J3QA 3AMMA 3KLSA 4Y5SA 2XOMA 2VZRA 4MUVA 4AW7A 3WD5A 2WAOA 1BVP1 3SCFA 5K0UC 4LBJA 4LO4B 4JHTA 2RJLA 4P14A 3VD9A 4NIGA 1AXYA 4LKFA 3ZO0B 4I0BA 3AL6A 2B9VA 2VL4A 3ZX7A 3KCXA 5I8YA 1G8WA 4FD4A 3V65A 1JOPA 5FZ1A 4QHZA 4DXTA 3OJBA 4BQ2A 5L7OC 2WS91 3CHXA 2JIGA 3LCPA 3TNPB 3WG1A 4YVSC 4URTA 2ZZQA 5F5QA 2E7QA 2MEV1 4L9BA 4FWUA 3OTFA 5E1RA 1UZVA 1RUI3 3P1IA 5HMNA 2VZZA 3RSJA 4CP0A 4HONA 4MFPA 4CXYA 3H8UA 2YV8A 4I3GA 2VM9A 1ASJ1 3GYAA 1ST8A 4HSJA 4CAFA 3N36A 1D2SA 3NO8A 2F7VA 1BLLE 3D66A 1MS3A 5GZEA 3TOJA 1RUD1 5JSPA 2GP3A 3WCRA 1RINA 1QJX1 4KLVA 2HUZA 4Y49B 5H9QA 4XCAA 4CP2A 1CPSA 3DR6A 1DZQA 2D3SA 1KXGA 5FY4A 3FX6A 4IW3A 1MZ5A 4HMZA 3ST7A 1LOGA 3ENRA 4OADA 2FZ2A 2Y0MA 2ZS6B 5I91A 4DB5A 1FOD1 1YW6A 5AC92 1JYNA 4UT5A 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1RUH2
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1M4I A;  3DR8 A;  2D5F A;  1SQH A;  2J8M A;  1QXJ A;  3JUW A;  1YFY A;  4XFG A;  1DGW A;  1S7F A;  3CLP A;  4F7Z A;  3ES4 A;  3CJX A;  5I0U A;  4D7S A;  2BNO A;  3NW4 A;  1M4D A;  3R1K A;  3OGJ A;  1XEB A;  2CAU A;  4IEZ A;  4QC6 A;  3FJS A;  3L2H A;  2VQY A;  4CAW A;  3IDC B;  4KU7 A;  4XET A;  4YRD A;  3I7D A;  3H9A A;  1QY4 A;  2QIR A;  1MK4 A;  3G3S A;  3NE7 A;  3R9G A;  3SHR A;  4KOV A;  2EVX A;  3P2F A;  1WGP A;  3WW1 A;  4XF4 A;  2X7B A;  3MGD A;  4PSW A;  5FLH A;  5I0R A;  3DDD A;  4QM9 A;  3NL1 A;  1FXZ A;  4H7L A;  5J7M A;  2Q7B A;  4GS4 A;  4KOY A;  4R8H A;  3R9E A;  3CL1 A;  3FWE A;  2DCT A;  1YR0 A;  1Y9K A;  4KWK A;  1IB1 E;  3B02 A;  5F47 A;  4OLL A;  5KTD A;  1XMT A;  4L8A A;  3H3U A;  3IWG A;  4CS0 B;  5KTA A;  1NE4 A;  1LRH A;  2CY2 A;  2JLM A;  3WR7 A;  4F6A A;  1S5K A;  4DNC A;  1KUY A;  5I8S A;  3T90 A;  2REF A;  2KXL A;  2UY9 A;  1IIC A;  1O3R A;  3EC4 A;  4KOT A;  4LUA A;  2P17 A;  2XGX A;  4HN0 A;  5JR7 B;  2HJI A;  3U10 A;  2WC2 A;  4AXO A;  3H7J A;  4XF3 A;  2FL4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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